Name: dry root rot disease assays in chickpea: a detailed methodology
Uploaded: 2021-01-17T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Dry Root Rot Disease Assays in Chickpea: a Detailed Methodology at JoVE.com

Projecten in het M.S.K lab worden ondersteund door het National Institute of Plant Genome Research kernfinanciering. VI erkent DBT- JRF (DBT/2015/NIPGR/430). Wij danken studenten in opleiding, Miss Rishika, de heer Jayachendrayan, en Miss Durgadevi voor technische hulp tijdens video-opnamen en de heer Sandeep Dixit, Miss Anjali en Dr. Avanish Rai voor het kritisch beoordelen van ruwe gegevens en de manuscriptbestanden. We danken Mr Rahim H Tarafdar en Mr. Sunder Solanki voor hun hulp in het laboratorium. Wij erkennen DBT-eLibrary Consortium (DeLCON) en NIPGR Library voor het verstrekken van toegang tot e-resources en NIPGR Plant Growth Facility voor de groei van planten ondersteuning / ruimte.

1. Isolatie van R. bataticola en opslag
<ol><li>Details van de kikkererwtengenype en DRR symptomen<ol>
<li>Gebruik kikkererwtenplanten (genotype, JG 62) die over het algemeen typische DRR-symptomen vertonen, zoals droge, broze primaire wortel zonder laterale wortels en microsclerotie onder de schors en in de pith1,3.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Inzameling en wassen<ol>
<li>Ontwortel planten met symptomen zoals droog strokleurig blad en broze primaire wortel...

<ol>
	<li>Sharma, M., Ghosh, R., Pande, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dry+root+rot+(Rhizoctonia+bataticola+(Taub.)+Butler):+an+emerging+disease+of+chickpea+-+where+do+we+stand.">Dry root rot (Rhizoctonia bataticola (Taub.) Butler): an emerging disease of chickpea - where do we stand.</a> Archives of Phytopathology and Plant Protection. 48 (13-16), 797-812 (2015).</li><li>Sinha, R., Irulappan, V., Mohan-Raju, B., Suganthi, A., Senthil-Kumar, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+drought+stress+on+simultaneously+occurring+pathogen+infection+in+field-grown+chickpea.">Impact of drought stress on simultaneously occurring pathogen infection in field-grown chickpea.</a> Scientific Reports. 9 (1), (2019).</li><li>Nene, Y., Haware, M., Reddy, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chickpea+diseases:+resistance+screening+techniques,+information+bulletins+No.+10.+Patancheru.">Chickpea diseases: resistance screening techniques, information bulletins No. 10. Patancheru.</a> Information Bulletin No. 10. Patancheru, A.P., India: International CroDS Research Institute for the Semi-Arid Tropics. , 1-10 (1981).</li><li>Pande, S., Krishna Kishore, G., Upadhyaya, H. D., Narayana Rao, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+sources+of+multiple+disease+resistance+in+mini-core+collection+of+chickpea.">Identification of sources of multiple disease resistance in mini-core collection of chickpea.</a> Plant Disease. , (2006).</li><li>Pandey, P., Irulappan, V., Bagavathiannan, M. V., Senthil-Kumar, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Impact+of+combined+abiotic+and+biotic+stresses+on+plant+growth+and+avenues+for+crop+improvement+by+exploiting+physio-morphological+traits.">Impact of combined abiotic and biotic stresses on plant growth and avenues for crop improvement by exploiting physio-morphological traits.</a> Frontiers in Plant Science. 8, (2017).</li><li>Irulappan, V., Senthil-Kumar, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Morpho-physiological+traits+and+molecular+intricacies+associated+with+tolerance+to+combined+drought+and+pathogen+stress+in+plants.">Morpho-physiological traits and molecular intricacies associated with tolerance to combined drought and pathogen stress in plants.</a> Biotechnologies of Crop Improvement, Volume 3: Genomic Approaches. , (2018).</li><li>Jensen, A. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standard+methods+for+fungal+brood+disease+research.">Standard methods for fungal brood disease research.</a> Journal of Apicultural Research. 52 (1), 1-39 (2013).</li><li>Agrios, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Plant Pathology: Fifth Edition. , 9780080473 (2004).</li><li>Coley-Smith, J. R., Cooke, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Survival+and+germination+of+fungal+sclerotia.">Survival and germination of fungal sclerotia.</a> Annual Review of Phytopathology. , (1971).</li><li>Nagamma, G., Saifulla, M., Sab, J., Pavitra, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Screening of chickpea genotypes against dry root rot caused by Macrophomina phaseolina (tassi) goid. 10 (4), 1795-1800 (2015).</li><li>Infantino, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Screening+techniques+and+sources+of+resistance+to+root+diseases+in+cool+season+food+legumes.">Screening techniques and sources of resistance to root diseases in cool season food legumes.</a> Euphytica. 147 (1-2), 201-221 (2006).</li><li>Khaliq, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Integrated+control+of+dry+root+rot+of+chickpea+caused+by+Rhizoctonia+bataticola+under+the+natural+field+condition.">Integrated control of dry root rot of chickpea caused by Rhizoctonia bataticola under the natural field condition.</a> Biotechnology Reports. 25, 00423 (2020).</li></ol>

De blotting papier techniek biedt een eenvoudige aanpak voor het scherm kikkererwten genotypen onder laboratoriumomstandigheden. Dip-inenting maakt het onderzoeken van interactie op tijdelijke basis mogelijk met eenvoudige controle over entmateriaalbelasting(aanvullende figuur 1)en vergemakkelijkt in vitro screening. Bovendien kunnen zelfs jonge zaailingen worden gebruikt. Vijf dagen oude schimmelcultuur (Figuur 1B) kan voldoende inentmateriaal opleveren om de planten te inf...

Droge wortelrot (DRR) is een van de economisch belangrijke ziekten bij kikkererwten1,2. Het is een wortel-specifieke ziekte veroorzaakt door Rhizoctonia bataticola (teleomorf, Macrophomina phaseolina). Geïnfecteerde planten missen laterale wortels en bezitten broze taproots en geel gebladerte1,3. DRR onder droogte stress is gemeld als een opkomende bedreiging voor kikkererwten teelt1,2,3. Bovendien wordt gemeld dat de drr-incidentie onder droogtestress onder veldomstandigheden1,2,3wordt verergerd . DRR komt vaker voor in regengebieden dan in geïrrigeerde velden4. Het gebruik van resistente rassen is de manier om de ziekte te overwinnen en fungicide gebruik te omzeilen1,13. Omdat kikkererwtenkiem kiemplasma beschikbaar over de hele wereld herbergt genetische variatie voor de eigenschap5, de screening en identificatie van resistente / vatbare genotypes zijn van cruciaal belang voor moleculaire veredeling voor gewas verbetering.
Robuuste, eenvoudige en kosteneffectieve ziektetesten zijn essentieel om r. bataticola-infectiepatronen in kikkererwten te onderzoeken. De primaire ziektetest die wordt gebruikt om de reactie van kikkererwtengenypes op R. bataticola-infectie waar te nemen, is de blotting papiertechniek1,4. Het is een eenvoudige techniek en kan worden uitgevoerd met behulp van vloeibare schimmel inoculum, zaailingen met wortels, en steriele blotting papier. Deze techniek is echter niet maximaal gebruikt omdat er geen stap-voor-stap-protocol beschikbaar is in de literatuur.
Ondertussen, de zieke pot techniek omvat de voorbereiding van een potentiële zieke cultuur en het opleggen van droogte stress. Aangezien droogtestress drr-ziekteincidentie3verergert , is het van essentieel belang om de interactie tussen plant en ziekteverwekker onder droogtestress te bestuderen6,7. De zieke pot techniek biedt het platform voor een dergelijke gelijktijdige studie, het bevorderen van betere mogelijkheden voor kiemplasma screening en het begrijpen van de mechanistische basis van de interactie. Pathomorfologische veranderingen, zoals een toename van de wortellengte en vermindering van het laterale wortelaantal — inherent aan de DRR-ziekte — kunnen worden aangepakt met behulp van de zieke pottechniek1,3,7.
Hierin wordt een gedetailleerd protocol gepresenteerd voor blotting papier en zieke pottechnieken, die kunnen worden gebruikt om de interactie tussen kikkererwten en R. bataticola en het scherm van kikkererwtenkiemen te bestuderen. De details van de in de studie gebruikte materialen zijn vermeld in de tabel met materialen.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Fungus- Rhizoctonia bataticola</td>
			<td>Pathogen inoculum</td>
			<td>Indian Type Culture Collection No. 8365</td>
			<td>GenBank: MH509971.1, ITCC 8635 (https://www.iari.res.in/index.php?option=com_content&#38;view=article&#38; id=1251&#38;Itemid=1370)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Soilrite mix</td>
			<td>Soil medium in the lab</td>
			<td>Keltech Energies Limited, Bangalore, India</td>
			<td>http://www.keltechenergies.com/</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Filter paper</td>
			<td>Blotting paper to support the plant growth</td>
			<td>Himedia</td>
			<td>http://himedialabs.com/catalogue/chemical2017/index.html#374</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pot</td>
			<td>Growing plants</td>
			<td>10 and 30 cm size pots</td>
			<td>Routinely used nursery pots, for example, https://dir.indiamart.com/impcat/nursery-pots.html</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Potato dextrose agar/broth</td>
			<td>Culture and maintain the fungus</td>
			<td>Cat# 213400, DifcoTM, MD, USA</td>
			<td>https://www.fishersci.com/shop/products/bd-difco-dehydrated-culture-media-potato-dextrose-agar-3/p-4901946</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Incubator</td>
			<td>Culture the fungus</td>
			<td>LOM-150-2, S/N AI13082601-38, MRC, incubator, and shaker</td>
			<td>http://www.mrclab.com/productDetails.aspx?pid=91131</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Growth chamber</td>
			<td>Growing plants in controlled condition</td>
			<td>Model No. A1000, Conviron, Canada</td>
			<td>https://www.conviron.com/products/gen1000-reach-in-plant-growth-chamber</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Laminar airflow</td>
			<td>Carrying out aseptic exercises</td>
			<td>Telstar, Bio II advance, Class II cabinet, EN-12469-2000</td>
			<td>https://www.telstar.com/lab-hospitals-equipment/biological-safety-cabinets/bio-ii-advance-plus/, http://www.atlantisindia.co.in/laminar-air-flow.html</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Mesh</td>
			<td>Filtering the fungal mycelia</td>
			<td>Nylon mosquito net</td>
			<td>Mesh with 0.6-1 mm diameter pore size</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Autoclave</td>
			<td>Autoclaving media and chickpea seeds</td>
			<td>Autoclave</td>
			<td>http://www.scientificsystems.in/autoclave</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microscopes</td>
			<td>Visualizing the infection ang fungal mycelia</td>
			<td>SMZ25 / SMZ18, Research Stereomicroscopes, Leica EZ4 educational stereomicroscope</td>
			<td>https://www.microscope.healthcare.nikon.com/products/stereomicroscopes-macroscopes/smz25-smz18 
			https://www.leica-microsystems.com/products/stereo-microscopes-macroscopes/p/leica-ez4/ 
			https://www.microscopyu.com/museum/eclipse-80i</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Weighing balance</td>
			<td>Weighing fungus and chemicals</td>
			<td>Sartorius Electronic Weighing Balance, BSA 4202S-CW</td>
			<td>https://www.sartorius.com/en/products/weighing/laboratory-balances</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>WGA-FITC</td>
			<td>Fungus staining</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>https://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/l4895?lang=en&#38;region=IN</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Aniline blue</td>
			<td>Fungus staining</td>
			<td>Himedia</td>
			<td>http://www.himedialabs.com/intl/en/products/Chemicals/Dyes-Indicators-and-Stains/Aniline-blue-Water-soluble-Practical-grade-GRM901</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

dry root rot disease assays in chickpea: a detailed methodology

Droge wortelrot (DRR) ziekte is een opkomende biotische stress bedreiging voor kikkererwten teelt over de hele wereld. Het wordt veroorzaakt door een door de bodem overgedragen schimmelpathogene ziekteverwekker Rhizoctonia bataticola. In de literatuur zijn uitgebreide en gedetailleerde stapsgewijze protocollen over ziektetesten schaars. Dit artikel bevat volledige details over de stappen die betrokken zijn bij het opzetten van een blotting papier techniek voor het snel screenen genotypen voor weerstand tegen DRR. De blotting papier techniek is eenvoudig en minder duur. Een andere methode, gebaseerd op de zieke pot benadering, is een nabootsing van natuurlijke infectie en kan worden toegepast op de interactie componenten-plant, ziekteverwekker, en omgeving-betrokken bij de ziekte driehoek te bestuderen.
Bovendien komt DRR in de natuur vooral voor in geregen kikkererwtenteeltgebieden, waar bodemvocht afneemt naarmate de gewasgroei vordert. Droogte stress is bekend dat kikkererwten planten predisponeren om drr ziekte. Pathomorfologische en moleculaire kennis van de interactie tussen plant en ziekteverwekker bij droogtestress kan de weg vrijmaken voor de identificatie van elite DRR-resistente rassen uit de kikkererwtenkiempool. Dit artikel biedt een stapsgewijze methodologie voor de bereiding van een zieke pot en de daaropvolgende ziektetest. Over het algemeen zal de hierin gepresenteerde informatie onderzoekers helpen bij het voorbereiden van R. bataticola schimmelinoculum, het handhaven van deze ziekteverwekker, het opzetten van de blotting papiertechniek, het voorbereiden van zieke cultuur en zieke pot, en het beoordelen van ziekteverwekkerinfectie in kikkererwtenplanten.

Deze studie was gericht op het aantonen van technieken zoals blotting papier en zieke pot technieken om pathomorfologische en moleculaire begrip van plant-pathogen interactie onder droogte stress te vergemakkelijken. Om dit te bereiken, planten vertonen DRR symptomen1,3,4 werden verzameld uit een kikkererwten veld, en de schimmel werd geïsoleerd met behulp van de hyphal tip methode8. R. bataticola</e...

Watch this Scientific Journal Video about Dry Root Rot Disease Assays in Chickpea: a Detailed Methodology at JoVE.com

Dry Root Rot Disease Assays in Chickpea: a Detailed Methodology

Deze studie presenteert methodologieën om de pathomorfologische en moleculaire mechanismen te bestuderen die ten grondslag liggen aan kikkererwten:Rhizoctonia bataticola-interactie. De blotting papier methode is nuttig om snel te bestuderen kikkererwten genotype reacties, terwijl de zieke pot-gebaseerde methode kan worden gebruikt om tegelijkertijd droogte en R. bataticola infectie en scherm voor tolerante genotypen op te leggen.

Dry Root Rot Disease Assays in Chickpea: een gedetailleerde methodologie

Dry root rot (DRR) disease is an emerging biotic stress threat to chickpea cultivation around the world. It is caused by a soil-borne fungal pathogen, ...

Het belangrijkste doel van deze studie is om een gedetailleerde methodologie van droge wortelrot ziekte testen aan te tonen, zoals blotting papier techniek en zieke pot techniek. Deze technieken zullen nuttig zijn om de interactie tussen kikkererwten plant en Rhizoctonia bataticola te bestuderen. Inzicht in de chickweed plant interactie met de schimmelpathogene Rhizoctonia bataticola is in de landbouw belangrijk.Hiervoor zijn veelzijdige en zeer reproduceerbare testen nodig. Hier worden twee testen gedemonstreerd die op grote schaal worden gebruikt in ons lab. Een van hen is blotting papier-based, en de andere is zieke pot-based test.Om de blotting papiertest uit te voeren, bereid Rhizoctonia bataticola schimmel inoculum door opschalen van schuine cultuur naar petri plaat en vervolgens vloeibare cultuur. Bereid kikkererwtenkwekerij door, zaaien zaden in een grote pot. Ontwortel ze en leg ze in het vloeibare entmateriaal en leg ze op blotting papier.Let op ziektesymptomen, namelijk necrose op de wortel, wortelrot en bladverkleuring acht dagen na inenting. Hier getoond is een notendop, de stappen in blotting papier techniek. Om de zieke pot test uit te voeren, inenting kikkererwten maaltijd met schimmel.Na incubatie bij 30 graden Celsius gedurende 15 dagen, zieke cultuur wordt verkregen. Poeder ze vervolgens en meng met potmix. Zaai zaden op controlepot en zieke pot.Let op de volgende dagen op symptomen, namelijk necrose op de wortel, wortelrot en bladverkleuring op de geïnfecteerde planten, 10 dagen na het zaaien. Zieke wiet kan worden opgeschaald en kan worden gebruikt voor grootschalige screenings. Hier getoond is een notendop van stappen in zieke pot techniek.Rhizoctonia bataticola is een zich ontwikkelende ziekteverwekker. Deze schimmel produceert hyphae en microsclerotie, die fungeren als primaire inuclum tijdens de plant infectie. De zuivere cultuur die door de isolative methode wordt toegepast wordt gebruikt voor de tests.Het belangrijkste punt voor deze succesvolle testen is een optimale inoculumbelasting. Demonstratie van de blotting papier techniek begint hier. Ter voorbereiding van vloeibare Rhizoctonia bataticola inoculum, Inentuleren de 500 ml bouillon met de schimmel agar plug uit drie dagen oude verse plaat cultuur en incubeer de kolf in een incubator op 28 graden Celsius gedurende vijf dagen.Filter de donkergrijze schimmelsycecelia uit met microsclerotie. Hang in autoclaved water en verwijder de media. Nogmaals, filter de mycelia en verwijder vocht door de mycelia een paar minuten te drogen.Hang 100 gram schimmelintmateriaal op in 200 ml autoclaved water in een jamfles en meng het goed. Ontwikkelen kikkererwten kwekerij door het zaaien van oppervlakte gesteriliseerde zaden in solerant. Ontwortel de planten acht dagen na het zaaien, was ze en spoel ze af met autoclaved RO. Neem een blotting papier en vouw het een keer en plaats de helft van het op de lade.Maak het nat met autoclaved water. Neem planten en duik in het entmateriaal gedurende 30 seconden met intermitterende op en neer beweging. Plaats de planten op een zodanige wijze dat wortels zijn bedekt in het blad en folia blijft uit.Vouw de andere helft en buig het papier. Voor controle, dip de planten in autoclaved water, houd de trays in een groeikamer voor acht dagen. Resultaten. Let op de symptomen zoals bladvernel, wortelrot, necrose in de wortel en vermindering van het laterale wortelgetal.Demonstratie van de zieke pot techniek begint hier. Neem een kilo commerciële kikkererwtenzaden. Was de zaden met kraanwater en was opnieuw met het RO-water.Week de zaden voor vijf uur. Nogmaals, was de zaden met RO water voeg 300 gram in een jam fles. Autoclave ze op 121 LVS voor 15 minuten twee keer continu.Breng de fles na het afkoelen door de laminaire stroom. Inenting van de flessen met drie schimmel agar stekkers ongeveer vier millimeter vierkante maten en schud het goed om goed te mengen. Wikkel de flessen en broed ze in een couveuse op 30 graden Celsius gedurende 15 dagen.Let op de flessen met donkere myceliale groei rond de kikkererwtenzaden en verwijder de zaden. Droog ze op kamertemperatuur en poeder ze. Meng Rhizoctonia bataticola poeder met solorite en houd ze op kamertemperatuur gedurende vijf dagen.Het oppervlak steriliseert de GT62-zaden en zaai ze op twee centimeter diepte. Resultaten. Let op de 90%-sterfte in zieke wiet. 10 dagen na het zaaien, let op de symptomen zoals necrose bij wortels en vermindering van lateraal wortelgetal en bladverkleuring in de volgende dagen.Zieke pot kan worden bereid in veldgrond ook. Droogte en Rhizoctonia bataticola infectie. Leg droogtestress op in de zieke pot door het water achter te houden.Hier worden de planten blootgesteld aan controle, droogte, ziekteverwekker, en gelijktijdige droogte en ziekteverwekker stress. Let op de symptomen, namelijk meer necrose, wortelrot en vermindering van het laterale wortelaantal, en wortellengte in gecombineerde stressbehandeling in vergelijking met de behandeling met alleen ziekteverwekkers. Conclusies. Blotting papier techniek kan worden uitgevoerd In Vitro voorwaarden.Zieke pottechniek kan worden uitgevoerd in In Vivo-omstandigheden. In zieke haven, abiotische stress, namelijk, droogte stress, kan worden opgelegd samen met de ziekteverwekker infectie. Met behulp van deze technieken kan men het ziekteverwekkerinfectiepatroon bestuderen.De meeste fysiologische veranderingen treden op tijdens de kikkererwt-Rhizoctonia bataticola-interactie en screenen ook de kikkererwtengenypes op weerstand. De blotting papiertest is zeer nuttig om kwaliteitsmonsters te genereren voor microscopie en moleculaire biologie studies. De zieke pottest, die de natuurlijke infectieomstandigheden nabootst, is van toepassing voor het screenen van kikkererwtenkiemen.

Research

JoVE Journal

Biology

Protocol for RNAi Assays in Adult Mosquitoes (A. gambiae)

Protocol for RNAi Assays in Adult Mosquitoes A. gambiae

Protocol voor RNAi Testen in volwassen muggen (A. gambiae)

Reverse genetic approaches have proven extremely useful for determining  which genes underly resistance to vector pathogens in mosquitoes.  This video ...

Preparation and Maintenance of Dorsal Root Ganglia Neurons in Compartmented Cultures

Voorbereiding en onderhoud van achterwortelganglia Neuronen in Gecompartimenteerde culturen

Neurons extend axonal processes that are far removed from the cell body to innervate target tissues, where target-derived growth factors are required for ...

Neurocircuit Assays for Seizures in Epilepsy Mutants of Drosophila

Neurocircuit Assays for Seizures in Epilepsy Mutants of Drosophila

Neurocircuit Testen voor epileptische aanvallen mutanten van Drosophila</em

Drosophila melanogaster is a useful tool for studying seizure like activity. A variety of mutants in which seizures can be induced through either physical ...

Isolation of Ribosome Bound Nascent Polypeptides in vitro to Identify Translational Pause Sites Along mRNA

Isolation of Ribosome Bound Nascent Polypeptides in vitro to Identify Translational Pause Sites Along mRNA

Isolatie van Ribosoom Bound Nascent Polypeptiden<em&gt; In vitro</em&gt; Om Translationeel Pauze plaatsen langs mRNA identificeren

The rate of translational elongation is non-uniform. mRNA secondary structure, codon usage and mRNA associated proteins may alter ribosome movement on the ...

Using SecM Arrest Sequence as a Tool to Isolate Ribosome Bound Polypeptides

Met behulp van SecM Arrestatie sequentie als een Tool om Ribosoom Bound Polypeptiden Isoleer

Extensive research has provided ample evidences suggesting that protein folding in the cell is a co-translational process1-5. However, the exact pathway ...

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

Gekoppeld Testen voor Monitoring Protein Refolding in<em&gt; Saccharomyces cerevisiae</em

Proteostasis, defined as the combined processes of protein folding/biogenesis, refolding/repair, and degradation, is a delicate cellular balance that must ...

Analysis of Skeletal Muscle Defects in Larval Zebrafish by Birefringence and Touch-evoke Escape Response Assays

Zebrafish (Danio rerio) have become a particularly effective tool for modeling human diseases affecting skeletal muscle, including muscular ...

A Fast Air-dry Dropping Chromosome Preparation Method Suitable for FISH in Plants

Een Fast Air-droge Dropping Chromosome Bereidingswijze Geschikt voor vissen in planten

Preparation of chromosome spreads is a prerequisite for the successful performance of fluorescence in situ hybridization (FISH). Preparation of high ...

Lateral Root Inducible System in Arabidopsis and Maize

Lateral Root Inducible System in Arabidopsis and Maize

Laterale Root Induceerbare System in<em&gt; Arabidopsis</em&gt; En maïs

Lateral root development contributes significantly to the root system, and hence is crucial for plant growth. The study of lateral root initiation is ...

Divergence of Root Microbiota in Different Habitats based on Weighted Correlation Networks

Divergentie van wortelmicrobiota in verschillende habitats op basis van gewogen correlatienetwerken

The root microbiome plays an important role in plant growth and environmental adaptation. Network analysis is an important tool for studying communities, ...