Name: functionalized spirocyclic heterocycle synthesis and cytotoxicity assay
Uploaded: 2021-02-09T13:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Functionalized Spirocyclic Heterocycle Synthesis and Cytotoxicity Assay at JoVE.com

Bu çalışma, Fakülte Araştırma Konseyi'nden K.S.H.'ye (Araştırma ve Hibeler Ofisi, Azusa Pacific University-ABD) verilen bir hibe ile finanse edilmiştir. A.N.G. ve J.F.M., Akademik Lisans Araştırma Deneyimi (SURE) Bursu'nun alıcılarıdır. S.K.M. ve B.M.R., STEM Araştırma Bursu Hibelerinin (Bilim Araştırma Merkezi, Azusa Pacific University-ABD) alıcılarıdır. Biyotahliller konusunda rehberlik için Dr. Matthew Berezuk ve Dr. Philip Cox'a minnettarız.

NOT: Bu protokolde kullanılan çeşitli kimyasallar ve biyolojik reaktifler toksik ve kanserojendir. Kullanmadan önce ilgili malzeme güvenlik bilgi formlarına (MSDS) başvurun. Deneye başlamadan önce uygun kişisel koruyucu donanımları (İş Güvenliği ve Sağlığı İdaresi onaylı güvenlik gözlükleri, uygun eldivenler, laboratuvar önlükleri, tam boy pantolonlar ve kapalı ayak ayakkabıları) kullanın. Ek olarak, sentez yaparken ve toksik kimyasalları ve reaktifleri (duman davlumbazı) kullanırken uyg...

<ol>
	<li>Shangary, S., Wang, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Small-molecule+inhibitors+of+the+MDM2-p53+protein-protein+interaction+to+reactivate+p53+function:+a+novel+approach+for+cancer+therapy.">Small-molecule inhibitors of the MDM2-p53 protein-protein interaction to reactivate p53 function: a novel approach for cancer therapy.</a> Annual Review of Pharmacology and Toxicology. 49, 223-241 (2009).</li><li>Zhao, Y., Aguilar, A., Bernard, D., Wang, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Small-molecule+inhibitors+of+the+MDM2-p53+protein-protein+interaction+(MDM2+inhibitors)+in+clinical+trials+for+cancer+treatment.">Small-molecule inhibitors of the MDM2-p53 protein-protein interaction (MDM2 inhibitors) in clinical trials for cancer treatment.</a> Journal of Medicinal Chemistry. 58 (3), 1038-1052 (2015).</li><li>Paolo, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+effective+virtual+screening+protocol+to+identify+promising+p53-MDM2+inhibitors.">An effective virtual screening protocol to identify promising p53-MDM2 inhibitors.</a> Journal of Chemical Information and Modeling. 56 (6), 1216-1227 (2016).</li><li>Shieh, S. Y., Ikeda, M., Taya, Y., Prives, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=DNA+damage-induced+phosphorylation+of+p53+alleviates+inhibition+by+MDM2.">DNA damage-induced phosphorylation of p53 alleviates inhibition by MDM2.</a> Cell. 91 (3), 325-334 (1997).</li><li>Hwang, B. J., Ford, J. M., Hanawalt, P. C., Chu, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Expression+of+the+p48+xeroderma+pigmentosum+gene+is+p53+dependent+and+is+involved+in+global+genomic+repair.">Expression of the p48 xeroderma pigmentosum gene is p53 dependent and is involved in global genomic repair.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96 (2), 424-428 (1999).</li><li>Oliner, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Oncoprotein+MDM2+conceals+the+activation+domain+of+tumor+suppressor+p53.">Oncoprotein MDM2 conceals the activation domain of tumor suppressor p53.</a> Nature. 362, 857-860 (1993).</li><li>Nag, S., Qin, J., Srivenugopal, K. S., Wang, M., Zhang, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+MDM2-p53+pathway+revisited.">The MDM2-p53 pathway revisited.</a> Journal of Biomedical Research. 27 (4), 254-271 (2013).</li><li>Bond, G. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+single+nucleotide+polymorphism+in+the+MDM2+promoter+attenuates+the+p53+tumor+suppressor+pathway+and+accelerates+tumor+formation+in+humans.">A single nucleotide polymorphism in the MDM2 promoter attenuates the p53 tumor suppressor pathway and accelerates tumor formation in humans.</a> Cell. 119 (5), 591-602 (2004).</li><li>Isobe, M., Emanuel, B. S., Givol, D., Oren, M., Croce, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Localization+of+gene+for+human+p53+tumor+antigen+to+band+17p13.">Localization of gene for human p53 tumor antigen to band 17p13.</a> Nature. 320 (6057), 84-85 (1986).</li><li>Gupta, A. K., Bharadwaj, M., Kumar, A., Mehrotra, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spiro-oxindoles+as+a+promising+class+of+small+molecules+inhibitors+of+p53-MDM2+interaction+useful+in+targeted+cancer+therapy.">Spiro-oxindoles as a promising class of small molecules inhibitors of p53-MDM2 interaction useful in targeted cancer therapy.</a> Topics in Current Chemistry. 375 (1), 1-25 (2017).</li><li>Griffin, S. A., Drisko, C. R., Huang, K. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tricyclic+heterocycles+as+precursors+to+functionalized+spirocyclic+oximes.">Tricyclic heterocycles as precursors to functionalized spirocyclic oximes.</a> Tetrahedron Letters. 58, 4551-4553 (2017).</li><li>Drisko, C. R., Griffin, S. A., Huang, K. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Solid-phase+synthesis+of+[4.4]spirocyclic+oximes.">Solid-phase synthesis of [4.4]spirocyclic oximes.</a> Journal of Visualized Experiments. (144), e58508 (2019).</li><li>Lawrence, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Linked+parallel+synthesis+and+MTT+bioassay+screening+of+substituted+chalcones.">Linked parallel synthesis and MTT bioassay screening of substituted chalcones.</a> Journal of Combinatorial Chemistry. 3 (5), 421-426 (2001).</li><li>. MTT assay protocol Available from: <a target="_blank" href="https://www.abcam.com/kits/mtt-assay-protocol">https://www.abcam.com/kits/mtt-assay-protocol</a> (2020)</li></ol>

Spirosiklik bileşiklerin sentezi, bu laboratuvar tarafından yürütülen önceki araştırmalara dayanıyordu, ancak bazı modifikasyonlarla (Şekil 1)11,12. Her reaksiyon adımının ilerlemesi IR spektroskopisi ile izlendi. Rem bağlayıcı 1'in furfurilamin ile Michael ilavesi, polimere bağlı 2'yi (IR 1722 cm-1 → 1731 cm-1) sağladı. Ö...

E3 ubikitin-ligaz faresinin çift dakika 2 homologunun (MDM2) p53 ile etkileşiminin küçük moleküllü inhibisyonu 1,2,3 tümör hücresi apoptozunun p53 aracılı indüksiyonunu geri kazandırdığı bilinmektedir. MDM2, p53 yolunun negatif bir düzenleyicisidir ve genellikle 4,5,6,7,8,9 kanser hücrelerinde aşırı eksprese edilir. Son kristalografik ve biyokimyasal çalışmalar, spirosiklik bir çerçeve içeren küçük moleküllerin MDM2-p53 etkileşimlerini etkili bir şekilde inhibe edebileceğini ortaya koymuştur10. Spirosiklik çerçeve (Şekil 1, mavi gölgeli), bu sert ortogonal halka sisteminin türevleştirilmesi yeni terapötik ilaçların keşfine yol açtığı için ayrıcalıklı bir motif olarak kabul edilir. Bu ilginç mimariye erişmek, geleneksel organik sentez tekniklerini kullanırken bir zorluk teşkil eder. Spirosiklik moleküllerin biyolojik sistemlerdeki terapötik etkileri araştırılmış olmasına rağmen, bu moleküllerin sentezi hala hantal bir süreçtir. İstenmeyen yan ürünler, zorlu koşullar ve tehlikeli geçiş metalleri genellikle sorunludur.
Spirosiklik motifin ilaç geliştirmede potansiyel kullanımı, diğer değiştirilebilir fonksiyonel gruplara ek olarak motifle birlikte bir molekül kütüphanesi oluşturmak için katı faz sentezini kullanan bir protokolün geliştirilmesine yol açmıştır11,12. Ürünlerin ve reaktanların adımlar arasında ayrılması, bir reçine boncuğuna bağlı bir REM bağlayıcı ve katı fazlı bir filtre kabı kullanılarak sağlanabilir. Bu, adımları azaltacak ve potansiyel olarak verimi artıracaktır. Bu sentetik yaklaşım, çok çeşitli potansiyel ilaç adayları üretebilir. Bununla birlikte, bu moleküllerin biyolojik bir sistemdeki etkinliği daha fazla araştırma gerektirecektir.
Bu spirosiklik bileşiklerin sitotoksisitesini belirlemek için, MTT testi13,14 kullanılmıştır. Bu yöntem hücre canlılığını ölçer ve dolaylı olarak hücre sitotoksisitesini belirlemek için kullanılabilir. 96 delikli bir plakadaki kültürlenmiş hücrelere inhibitörlerin farklı konsantrasyonları eklendi ve canlı hücrelerin oranı, sarı MTT'nin mitokondriyal dehidrogenazlar tarafından mor formazan bileşiğine indirgenme derecesinin kolorimetrik analizi ile ölçüldü (Şekil 2). Aktivite çoğunlukla bir IC 50 değeri olarak rapor edilir - hücre büyümesinin tedavi edilmemiş bir kontrole göre%50 oranında inhibe edildiği konsantrasyon. Bu yazıda MTT testinin protokolü ve bu yeni spirosiklik moleküllerin ön sonuçları açıklanmaktadır.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>CELLS</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>COS-7 cells (ATCC CRL-1651)</td>
			<td>ATCC</td>
			<td>CRL-1651</td>
			<td>African green monkey kidney cells</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CHEMICALS</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>1-Bromooctane</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>152951</td>
			<td>Alkyl-halide</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Allylbromide</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>337528</td>
			<td>Alkyl-halide</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Benzylbromide</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>B17905</td>
			<td>Alkyl-halide</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cisplatin</td>
			<td>Cayman Chemical</td>
			<td>13119</td>
			<td>Cytotoxicity control</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dichloromethane (DCM)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>270997</td>
			<td>Solvent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dimethylformamide (DMF)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>227056</td>
			<td>Solvent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dimethylsulfoxide (DMSO)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>276855</td>
			<td>Solvent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DMEM, high glucose, with L-glutamine</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>25-500</td>
			<td>Cell culture media</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FBS (Fetal bovine serum)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>F4135</td>
			<td>Cell culture media</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Furfurylamine</td>
			<td>Acros Organics</td>
			<td>119800050</td>
			<td>reagent&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Iodomethane</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>289566</td>
			<td>Alkyl-halide</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>34860</td>
			<td>Solvent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MTT ((3-(4,5-Dimethylthiazol-2-yl)-2,5-Diphenyltetrazolium Bromide)</td>
			<td>EMD Millipore</td>
			<td>Calbiochem 475989-1GM</td>
			<td>Reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphate-buffered Saline (PBS)</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>25-507</td>
			<td>Cell culture media</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>REM Resin</td>
			<td>Nova Biochem</td>
			<td>8551010005</td>
			<td>Polymer support; 0.500 mmol/g loading</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>trans-&#946;-nitrostyrene</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>N26806</td>
			<td>Nitro-olefin reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Toluene</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>244511</td>
			<td>Solvent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triethylamine (TEA)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>T0886</td>
			<td>Reagent for beta-elimination</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trimethylsilyl chloride (TMSCl)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>386529</td>
			<td>Reagent; CAUTION - highly volatile; creates HCl gas</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GLASSWARE/INSTRUMENTATION</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>25 mL solid-phase reaction vessel</td>
			<td>Chemglass</td>
			<td>CG-1861-02</td>
			<td>Glassware with filter</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>96 Well plate reader</td>
			<td>Promega (Turner Biosystems)</td>
			<td>9310-011</td>
			<td>Instrument</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AVANCE III NMR Spectrometer</td>
			<td>Bruker</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Instrument; 300 MHz; Solvents: CDCl3 and CD3OH</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermo Scientific Nicole iS5</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>IQLAADGAAGFAHDMAZA</td>
			<td>Instrument</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Wrist-Action Shaker</td>
			<td>Burrell Scientific</td>
			<td>757950819</td>
			<td>Instrument</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

functionalized spirocyclic heterocycle synthesis and cytotoxicity assay

Spirosiklik heterosiklusların son zamanlarda literatürde kanser tedavisi için potansiyel ilaçlar olduğu bildirilmiştir. Bu yeni ortogonal halka sistemlerinin sentezi zordur. Bu bileşikleri sentezlemek için yakın zamanda, katı faz sentezini daha önce bildirilen beş adım yerine dört adımda tanımlayan etkili bir metodoloji yayınlandı. Bu kısa sentezin avantajı, toksik reaktiflerin kullanımının ortadan kaldırılmasıdır. Düşük yüklemeli Rejenere Michael (REM) bağlayıcı bazlı reçinenin sentezde çok önemli olduğu bulunmuştur, çünkü yüksek yüklemeli versiyonlar hacimli fenil ve aromatik yan zincirler içeren reaktiflerin eklenmesini önlemiştir. Kolorimetrik 3-(4′,5′-dimetiltiazol-2′-il)-2,5- difeniltetrazolyum bromür (MTT) testi, bu yeni spirosiklik moleküllerin mikromolar konsantrasyonlarının in vitro sitotoksisitesini incelemek için kullanıldı. MTT ticari olarak kolayca temin edilebilir ve nispeten hızlı, güvenilir sonuçlar üretir, bu da bu testi bu spirosiklik heterosikluslar için ideal kılar. Ortogonal halka yapılarının yanı sıra furfurilamin (benzer 5 üyeli halka motifi içeren sentez yönteminde bir öncül) test edildi.

Spirosiklik oksim 6 ve 7, modifiye edilmiş bir protokol kullanılarak sentezlendi (Şekil 1). Michael'ın bir REM bağlayıcı 1b'ye furfurilamin ilavesi, polimere bağlı reçine 2'yi sağladı. Reaksiyonun ilerlemesi, α.β doymamış esterin 1722 cm-1'de kaybolduğunu tespit ederek kızılötesi (IR) spektroskopi ile izlendi (Şekil 3). Spirosiklik bağlı reçine 4, 2'den geçici bir ara 3 ile oluşturulmuştur. 4'ün metanolik hidrolizi 3-[(3E<e...

Watch this Scientific Journal Video about Functionalized Spirocyclic Heterocycle Synthesis and Cytotoxicity Assay at JoVE.com

Functionalized Spirocyclic Heterocycle Synthesis and Cytotoxicity Assay

Burada, daha önce sentezlenmiş spirosiklik oksimleri test etmek için 3-(4′,5′-dimetiltiazol-2′-il)-2,5- difeniltetrazolyum bromür (MTT) kullanan bir biyotahlil tarif ediyoruz.

İşlevselleştirilmiş spirrosiklik heterosiklus sentezi ve sitotoksisite testi

Spirocyclic heterocycles have recently been reported in literature to be potential drugs for cancer therapy. The synthesis of these novel orthogonal ring ...

Bu protokol, spirosiklik bileşiklerin üretiminde geri dönüştürülebilir ve modifiye edilmiş bir yöntem kullanır. MTT testi, bu yeni moleküllerin sitotoksisitesi ile ilgili soruyu cevaplamaya yardımcı olur. Bu teknik, yenileyici bir başlangıç malzemesi kullanarak yeni değiştirilebilir moleküller üretir.MTT testi, biyolojik sonuçları analiz etmek için nispeten hızlı ve kolay sağlar Daha önce gösterildiği gibi, spirosiklik hetero döngülerin altı ve yedisinin katı faz sentezini gerçekleştirerek başlayın. Seyreltici olarak steril PBS kullanarak mililitre başına beş miligramlık bir MTT çözeltisinin 20 mililitresini hazırlayın. Çözeltiyi eksi 20 santigrat derecede filtreleyin ve saklayın.Ardından, DMEM'deki MTT çözeltisinin bire bir seyreltilmesini hazırlayın. DMSO'daki test bileşiklerinin 1,5 mililitrelik mikro santrifüj tüplerinde stok çözeltilerinin her biri bir mililitre hazırlayın. Onları eksi 20 santigrat derecede saklayın.Stok konsantrasyonlarını seyrelterek test bileşiklerinin çalışma çözeltilerinin dozu başına 200 mikrolitre hazırlayın. Serum içermeyen ortamda bir ila 1000. Doku kültürü tohumlarında, COS yedi hücresi, düz taban doku kültürü üzerine tam bir ortamda, kuyu başına 200 mikrolitre başına 4.000 hücre konsantrasyonunda 96 kuyu plakasını işlemden geçirdi.Çok kanallı pipet kullanma. Hücreleri% 5 karbondioksit içeren bir atmosferde 37 santigrat derecede 24 saat boyunca inkübe edin. Ertesi gün, bir vakum pompasına bağlı bir cam mera pipeti kullanarak süpernatantı kuyulardan aspire edin.Daha önce hazırlanmış çalışma çözeltilerini kullanarak hücreleri test bileşikleri ile üçlü olarak dozlayın. Ardından hücreleri inkübatöre geri döndürün. 24 saat sonra, süpernatantı kuyulardan aspire edin ve her bir kuyucuğa 200 mikrolitre MTT çözeltisi ekleyin.Plakayı dört saat boyunca inkübe edin. Mor formazan kristallerini rahatsız etmeden süpernatantı kuyucuklardan nazikçe aspire edin. Kristalleri çözmek için her bir oyuğa 200 mikrolitre DMSO ekleyin.Daha sonra plakayı oda sıcaklığında 15 dakika inkübe edin. 96 kuyu plakası okuyucu kullanarak her kuyu için emiciliği 590 veya 600 nanometrede ölçün. Arka plan olarak hücresiz kuyular kullanın ve absorbans değerinin ortalamasını alın.Spirosiklik gox dikişleri altı ve yedi, modifiye edilmiş bir protokol kullanılarak sentezlendi. Reaksiyonun ilerlemesi, kızılötesi spektroskopi kullanılarak alfa beta doymamış Ester'in kaybolması tespit edilerek izlendi. MTT testi, hücre canlılığını belirlemek için kullanıldı.Yüksek konsantrasyonlarda hücre ölümünü indüklediği bilinen Cisplatin, pozitif bir kontrol görevi gördü. Beklendiği gibi, sisplatin konsantrasyonu ne kadar yüksek olursa, hücre canlılığı o kadar düşüktür. MTT testi daha sonra spirosiklik bileşikler altı ve yedi ve furfurilamin'i test etmek için kullanıldı.Furfurilamin ve spirosiklik gox dikiş altı benzer sitotoksisite gösterdi. Bununla birlikte, spirosiklik bileşik yedi'nin toksisitesi, furfurilamin ve altıdan belirgin şekilde daha büyüktü. Bu protokolü denerken, hacimli açil halojenürler kullanılarak gerçekleştirilen N-alkilasyonun, beta eliminasyon oranını azalttığı ve böylece ürün verimini düşürdüğü tespit edildi.

Research

JoVE Journal

Biology

Optimization of the Ugi Reaction Using Parallel Synthesis and Automated Liquid Handling

Paralel Sentezi ve Otomatik Liquid Handling kullanma Ugi Reaksiyon optimizasyonu

The optimization of a Ugi reaction involving the mixing of furfurylamine, benzaldehyde, boc-glycine and t-butylisocyanide is described.  Triplicate runs ...

RNA Isolation from Embryonic Zebrafish and cDNA Synthesis for Gene Expression Analysis

Gen İfadesi Analizi Embriyonik Zebra balığı ve cDNA Sentezi RNA İzolasyon

Many important and complex laboratory procedures require an input of high quality, intact RNA.  A degraded sample or the presence of impurities can lead ...

Synthesis and Calibration of Phosphorescent Nanoprobes for Oxygen Imaging in Biological Systems

Biyolojik Sistemleri Oksijen Görüntüleme Fosforlu Nanoprobes sentezi ve Kalibrasyon

Oxygen measurement by phosphorescence quenching [1, 2] consists of the following steps: 1) the probe is delivered into the medium of interest (e.g. blood ...

Microwave-assisted One-pot Synthesis of N-succinimidyl-4-[18F]fluorobenzoate ([18F]SFB)

Microwave-assisted One-pot Synthesis of N-succinimidyl-4-[18F]fluorobenzoate [18F]SFB

Mikrodalga-destekli-pot Bir Sentez N Succinimidyl-4-[ 18 F] fluorobenzoate ([ 18 F] SFB)

Biomolecules, including peptides,1-9 proteins,10,11 and antibodies and their engineered fragments,12-14 are gaining importance as both potential ...

Intracellular Refolding Assay

Hücre içi Refolding Testi

This protocol describes a method to measure the enzymatic activity of molecular chaperones in a cell-based system and the possible effects of compounds ...

Solid Phase Synthesis of a Functionalized Bis-Peptide Using "Safety Catch" Methodology

Bir Fonksiyonlu Bis-Peptid Katı Faz Sentezi Metodolojisi &quot;Güvenlik&quot; Catch Kullanımı

In 1962, R.B. Merrifield published the first procedure using solid-phase peptide synthesis as a novel route to efficiently synthesize peptides. This ...

Autonomously Bioluminescent Mammalian Cells for Continuous and Real-time Monitoring of Cytotoxicity

Sitotoksisite Sürekli ve gerçek zamanlı izlenmesi için özerk Bioluminescent Memeli Hücre

Mammalian  cell-based in vitro assays have been  widely employed as alternatives to animal testing for toxicological studies but  have been limited due to ...

Rapid Synthesis and Screening of Chemically Activated Transcription Factors with GFP-based Reporters

Hızlı Sentezi ve GFP-tabanlı Muhabirleri ile Kimyasal Aktif Transkripsiyon Faktörleri Taraması

Synthetic biology aims to rationally design and build synthetic circuits with desired quantitative properties, as well as provide tools to interrogate the ...

Analysis of Global RNA Synthesis at the Single Cell Level following Hypoxia

Ününüz Aşağıdaki Tek Hücre Düzeyinde Küresel RNA Sentezi Analizi

Hypoxia or lowering of the oxygen availability is involved in many physiological and pathological processes. At the molecular level, cells initiate a ...

Measurement of Heme Synthesis Levels in Mammalian Cells

Memeli Hücrelerde Heme Sentezi Düzeylerinin Ölçümü

Heme serves as the prosthetic group for a wide variety of proteins known as hemoproteins, such as hemoglobin, myoglobin and cytochromes. It is involved in ...