Name: plant sample preparation for nucleoside/nucleotide content measurement with an hplc-ms/ms
Uploaded: 2021-02-24T14:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Plant Sample Preparation for Nucleoside/Nucleotide Content Measurement with An HPLC-MS/MS at JoVE.com

Эта работа была финансово поддержана Фондами фундаментальных исследований для центральных университетов (KJQN202060), Национальным фондом естественных наук Китая (31900907), Фондом естественных наук провинции Цзянсу (BK20190528), Международным центром генной инженерии и биотехнологии (CRP / CHN20-04_EC) до M.C. и Фондами фундаментальных исследований для центральных университетов (LGZD202004) до X.L.

1 Рост растений и сбор материалов
<ol><li>Убедитесь, что семена Arabidopsis стерилизованы в 70% этаноле в течение 10 минут и посеяны на агаровых пластинах, которые были приготовлены из питательных веществ Мурашиге и Скуга половинной силы.</li>
	<li>Инкубировать пластины, содержащие семена араб...

<ol>
	<li>Liu, B., Winkler, F., Herde, M., Witte, C. -. P., Gro&#223;hans, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+link+between+deoxyribonucleotide+metabolites+and+embryonic+cell-cycle+control.">A link between deoxyribonucleotide metabolites and embryonic cell-cycle control.</a> Current Biology. 29 (7), 1187-1192 (2019).</li><li>Zrenner, R., Stitt, M., Sonnewald, U., Boldt, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pyrimidine+and+purine+biosynthesis+and+degradation+in+plants.">Pyrimidine and purine biosynthesis and degradation in plants.</a> Annual Review of Plant Biology. 57, 805-836 (2006).</li><li>Witte, C. -. P., Herde, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Nucleotide+metabolism+in+plants.">Nucleotide metabolism in plants.</a> Plant Physiology. 182 (1), 63-78 (2020).</li><li>Chen, M., Herde, M., Witte, C. -. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Of+the+nine+cytidine+deaminase-like+genes+in+Arabidopsis,+eight+are+pseudogenes+and+only+one+is+required+to+maintain+pyrimidine+homeostasis+in+vivo.">Of the nine cytidine deaminase-like genes in Arabidopsis, eight are pseudogenes and only one is required to maintain pyrimidine homeostasis in vivo.</a> Plant Physiology. 171 (2), 799-809 (2016).</li><li>Chen, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=m6A+RNA+degradation+products+are+catabolized+by+an+evolutionarily+conserved+N6-methyl-AMP+deaminase+in+plant+and+mammalian+cells.">m6A RNA degradation products are catabolized by an evolutionarily conserved N6-methyl-AMP deaminase in plant and mammalian cells.</a> The Plant Cell. 30 (7), 1511-1522 (2018).</li><li>Chen, M., Witte, C. -. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+kinase+and+a+glycosylase+catabolize+pseudouridine+in+the+peroxisome+to+prevent+toxic+pseudouridine+monophosphate+accumulation.">A kinase and a glycosylase catabolize pseudouridine in the peroxisome to prevent toxic pseudouridine monophosphate accumulation.</a> The Plant Cell. 32 (3), 722-739 (2020).</li><li>Dahncke, K., Witte, C. -. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Plant+purine+nucleoside+catabolism+employs+a+guanosine+deaminase+required+for+the+generation+of+xanthosine+in+Arabidopsis.">Plant purine nucleoside catabolism employs a guanosine deaminase required for the generation of xanthosine in Arabidopsis.</a> The Plant Cell. 25 (10), (2013).</li><li>Jung, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Uridine-ribohydrolase+is+a+key+regulator+in+the+uridine+degradation+pathway+of+Arabidopsis.">Uridine-ribohydrolase is a key regulator in the uridine degradation pathway of Arabidopsis.</a> The Plant Cell. 21 (3), 876-891 (2009).</li><li>Jung, B., Hoffmann, C., Moehlmann, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Arabidopsis+nucleoside+hydrolases+involved+in+intracellular+and+extracellular+degradation+of+purines.">Arabidopsis nucleoside hydrolases involved in intracellular and extracellular degradation of purines.</a> Plant Journal. 65 (5), 703-711 (2011).</li><li>Riegler, H., Geserick, C., Zrenner, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Arabidopsis+thaliana+nucleosidase+mutants+provide+new+insights+into+nucleoside+degradation.">Arabidopsis thaliana nucleosidase mutants provide new insights into nucleoside degradation.</a> New Phytologist. 191 (2), 349-359 (2011).</li><li>Zrenner, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+functional+analysis+of+the+pyrimidine+catabolic+pathway+in+Arabidopsis.">A functional analysis of the pyrimidine catabolic pathway in Arabidopsis.</a> New Phytologist. 183 (1), 117-132 (2009).</li><li>Hauck, O. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Uric+acid+accumulation+in+an+Arabidopsis+urate+oxidase+mutant+impairs+seedling+establishment+by+blocking+peroxisome+maintenance.">Uric acid accumulation in an Arabidopsis urate oxidase mutant impairs seedling establishment by blocking peroxisome maintenance.</a> The Plant Cell. 26 (7), 3090-3100 (2014).</li><li>Qu, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparative+analysis+of+nucleosides,+nucleobases,+and+amino+acids+in+different+parts+of+Angelicae+Sinensis+Radix+by+ultra+high+performance+liquid+chromatography+coupled+to+triple+quadrupole+tandem+mass+spectrometry.">Comparative analysis of nucleosides, nucleobases, and amino acids in different parts of Angelicae Sinensis Radix by ultra high performance liquid chromatography coupled to triple quadrupole tandem mass spectrometry.</a> Journal of Separation Science. 42 (6), 1122-1132 (2019).</li><li>Zong, S. -. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fast+simultaneous+determination+of+13+nucleosides+and+nucleobases+in+Cordyceps+sinensis+by+UHPLC-ESI-MS/MS.">Fast simultaneous determination of 13 nucleosides and nucleobases in Cordyceps sinensis by UHPLC-ESI-MS/MS.</a> Molecules. 20 (12), 21816-21825 (2015).</li><li>Moravcov&#225;, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Separation+of+nucleobases,+nucleosides,+and+nucleotides+using+two+zwitterionic+silica-based+monolithic+capillary+columns+coupled+with+tandem+mass+spectrometry.">Separation of nucleobases, nucleosides, and nucleotides using two zwitterionic silica-based monolithic capillary columns coupled with tandem mass spectrometry.</a> Journal of Chromatography. A. 1373, 90-96 (2014).</li><li>Guo, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Hydrophilic+interaction+ultra-high+performance+liquid+chromatography+coupled+with+triple+quadrupole+mass+spectrometry+for+determination+of+nucleotides,+nucleosides+and+nucleobases+in+Ziziphus+plants.">Hydrophilic interaction ultra-high performance liquid chromatography coupled with triple quadrupole mass spectrometry for determination of nucleotides, nucleosides and nucleobases in Ziziphus plants.</a> Journal of Chromatography. A. 1301, 147-155 (2013).</li><li>Seifar, R. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simultaneous+quantification+of+free+nucleotides+in+complex+biological+samples+using+ion+pair+reversed+phase+liquid+chromatography+isotope+dilution+tandem+mass+spectrometry.">Simultaneous quantification of free nucleotides in complex biological samples using ion pair reversed phase liquid chromatography isotope dilution tandem mass spectrometry.</a> Analytical Biochemistry. 388 (2), 213-219 (2009).</li><li>Baccolini, C., Witte, C. -. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=AMP+and+GMP+catabolism+in+Arabidopsis+converge+on+xanthosine,+which+is+degraded+by+a+nucleoside+hydrolase+heterocomplex.">AMP and GMP catabolism in Arabidopsis converge on xanthosine, which is degraded by a nucleoside hydrolase heterocomplex.</a> The Plant Cell. 31 (3), 734-751 (2019).</li></ol>

Организмы содержат различные нуклеозиды/нуклеотиды, в том числе канонические и аберрантные. Однако происхождение и метаболические конечные точки их, особенно модифицированных нуклеозидов, все еще неясны. Кроме того, современное понимание функции и гомеостаза метаболизма нуклеозидов...

Нуклеозиды / нуклеотиды являются центральными метаболическими компонентами во всех живых организмах, которые являются предшественниками нуклеиновых кислот и многих коферментов, таких как никотинамидадениндинуклеотид (NAD), и важны в синтезе макромолекул, таких как фосфолипиды, гликолипиды и полисахариды. Структурно нуклеозид содержит нуклеоосно, которое может быть аденином, гуанином, урацилом, цитозином или тимином, и сахарный мутик, который может представлять собой рибозу или дезоксирибозу1,2. Нуклеотиды имеют до трех фосфатных групп, связывающихся с 5-углеродным положением сахарного муля нуклеозидов3. Метаболизм нуклеотидов в растениях необходим для прорастания семян и роста листьев4,5,6. Чтобы лучше понять их физиологическую роль в развитии растений, следует установить методы абсолютной количественной оценки различных нуклеозидов/нуклеотидов in vivo.
Один из наиболее часто используемых подходов к измерению нуклеозидов /нуклеотидов использует высокоэффективную жидкостную хроматографию (ВЭЖХ) в сочетании с ультрафиолетовым (UV-VIS) детектором4,7,8,9,10,11. В 2013 году, используя ВЭЖХ, Данке и Витте количественно оценили несколько типов нуклеозидов в Arabidopsis thaliana7. Они идентифицировали повышенное содержание гуанозина в мутанте, нацеленном на вставку Т-ДНК в гене гуанозиндезаминазы по сравнению с растением дикого типа. Другой пиримидин нуклеозид, цитидин, также был количественно обнаружен в растениях, использующих этот метод, что привелок идентификации гена 4 добросовестной цитидиндеаминазы. Однако, основанный на УФ-детекторе, этот метод не может легко отличить нуклеозиды, которые имеют сходные спектры и время удержания, например, гуанозин или ксантозин. Предел обнаружения метода ВЭЖХ относительно высок, поэтому его часто используют для измерения высокого содержания нуклеозидов in vivo, таких как цитидин, уридин и гуанозин.
Кроме того, газовая хроматография в сочетании с масс-спектрометрией (GC-MS) также может быть использована в измерении нуклеозидов. Извлекая из этого выгоду, Хаук и др. al. успешно обнаружены уридин и мочевая кислота, которая является последующим метаболитом нуклеозидного катаболического пути, в семенах A. thaliana12. Однако ГК обычно используется для разделения летучих соединений, но не подходит для термически лабильных веществ. Поэтому жидкостная хроматография, связанная с масс-спектрометрией (LC-MS/MS), вероятно, является более подходящим и точным аналитическим методом для идентификации, разделения и количественного определения нуклеозидов/нуклеотидов in vivo13,14. В нескольких предыдущих исследованиях сообщалось, что колонка HILIC может быть использована для разделения нуклеозидов и нуклеотидов15,16 и изотопно меченые внутренние стандарты были использованы для количественной оценки соединения17. Тем не менее, оба компонента являются относительно дорогими, особенно коммерческие стандарты, маркированные изотопами. Здесь мы сообщаем об экономически применимом подходе LC-MS/MS для измерения нуклеозидов/нуклеотидов. Этот метод уже успешно используется для количественного определения различных нуклеозидов/нуклеотидов, включая АТФ,N6-метил-АМФ,АМФ, GMP, уридин, цитидин и псевдоуридин1,5,6,18,у растений и дрозофилы. Более того, метод, о который мы здесь сообщаем, может быть использован и в других организмах.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>acetonitrile</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>1000291000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>adenosine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>A9251-1G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ammonium acetate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>73594-100G-F</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AMP</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>01930-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CMP</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>C1006-500MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cytidine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>C122106-1G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GMP</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>G8377-500MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>guanosine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>G6752-1G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hypercarb column</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific GmbH</td>
			<td>35005-054630</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>IMP</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>57510-5G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>inosine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>I4125-1G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>methanol</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>34860-1L-R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>N1-methyladenosine</td>
			<td>Carbosynth</td>
			<td>NM03697</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>O6-methylguanosine</td>
			<td>Carbosynth</td>
			<td>NM02922</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Murashige and Skoog Medium</td>
			<td>Duchefa Biochemie</td>
			<td>M0255.005</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Polaris 5 C18A column</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>A2000050X046</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>pseudouridine</td>
			<td>Carbosynth</td>
			<td>NP11297</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UMP</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>U6375-1G</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>uridine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>U3750-1G</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

plant sample preparation for nucleoside/nucleotide content measurement with an hplc-ms/ms

Нуклеозиды / нуклеотиды являются строительными блоками нуклеиновых кислот, частей косубстратов и коферментов, клеточных сигнальных молекул и энергоносителей, которые участвуют во многих клеточных действиях. Здесь мы описываем быстрый и надежный метод абсолютной квалификации содержания нуклеозидов/нуклеотидов в растениях. Вкратце, 100 мг гомогенизированного растительного материала экстрагировали с помощью 1 мл экстракционного буфера (метанол, ацетонитрил и вода в соотношении 2:2:1). Позже образец концентрировали пять раз в сублимационной сушилке, а затем вводили в ВЭЖХ-MS/MS. Нуклеотиды отделяли на пористой графитовой углеродной (PGC) колонке, а нуклеозиды отделяли на колонке C18. Массовые переходы каждого нуклеозида и нуклеотида контролировались масс-спектрометрией. Содержание нуклеозидов и нуклеотидов было количественно определено в сопоставлении с их внешними стандартами (ESTD). Поэтому, используя этот метод, исследователи могут легко количественно оценить нуклеозиды / нуклеотиды в разных растениях.

Здесь мы показываем идентификацию и количественную оценку N1-метиладенозина, известного модифицированного нуклеозида, в 2-недельных саженцах дикого типа Arabidopsis (Col-0) в качестве примера. Профиль масс-спектрометрии указывает, что ионыпродукта, образующи?...

Watch this Scientific Journal Video about Plant Sample Preparation for Nucleoside/Nucleotide Content Measurement with An HPLC-MS/MS at JoVE.com

Plant Sample Preparation for Nucleoside/Nucleotide Content Measurement with An HPLC-MS/MS

Здесь описан точный и воспроизводимый метод количественного определения in vivo нуклеозидов/нуклеотидов в растениях. Этот метод использует ВЭЖХ-МС/МС.

Заводская пробоподготовка для измерения содержания нуклеозидов/нуклеотидов с помощью ВЭЖХ-MS/MS

Nucleosides/nucleotides are building blocks of nucleic acids, parts of cosubstrates and coenzymes, cell signaling molecules, and energy carriers, which ...

Нуклеозиды и нуклеотиды являются центральными метаболическими компонентами во всех живых организмах. Метаболизм их необходим для развития клеток. Этот подход обеспечивает мощный инструмент для количественной оценки этих метаболитов.Этот метод позволяет быстро и точно количественно определять нуклеозиды и нуклеотиды в растениях. Полная предварительная обработка образцов и анализ LC-MS / MS занимают около двух дней для набора из 10-20 образцов. Этот метод можно применять ко всем растениям и даже другим организмам.Продемонстрировать процедуру будет Чанхуа Чжу, адъюнкт-профессор из Лаборатории Чэнь. Чтобы вырастить растения, убедитесь, что семена Arabidopsis стерилизованы в 70% этаноле в течение 10 минут и посеяны на агаровых пластинах с питательными веществами 1/2 силы Murashige и Skoog. Высиживая пластины в темноте при четырех градусах Цельсия в течение 48 часов, затем перенесите их в контролируемую камеру роста под 16 часами света при 22 градусах Цельсия и восемью часами темноты при 20 градусах Цельсия.Соберите 100 миллиграммов двухнедельной рассады и заморозьте их в жидком азоте для извлечения метаболитов. Измельчите 100 миллиграммов замороженных растительных тканей с семью-восемью стальными шариками в предварительно охлаждаемой смесительной мельнице в течение пяти минут с частотой 60 Гц. Готовят экстракционный раствор, который содержит метанол, ацетонитрил и воду в соотношении два к одному.Повторное суспендируемые гомогенизированные материалы одним миллилитром экстракционного раствора. Центрифугируют полученный раствор при 12 000 XG в течение 15 минут при четырех градусах Цельсия, затем переложат 0,5 миллилитра суспензии в новую трубку объемом 1,5 миллилитра и заморозят в жидком азоте. Выпарить замороженный образец в сублимационной сушилке и повторно суспендировать его в 0,5 миллилитра 5% ацетонитрила и 95% воды.Центрифугируют полученный раствор при 4 000 XG в течение 10 минут при четырех градусах Цельсия. Загрузите супернатант во флакон для измерения LC-MS/MS. Приготовьте 10-миллимолярный буфер ацетата аммония, растворив 1,5 грамма ацетата аммония в двух литрах двойной деионизированной воды.Отрегулируйте рН до 9,5 с 10% аммония и ацетатной кислоты. Подготовьте два литра сверхчистого 100% метанола для измерения нуклеозидов, затем подготовьте два литра сверхчистого ацетонитрила для измерения нуклеотидов. Впрыскиваем 0,02 миллилитра предварительно обработанной экстракции метаболита каждого ранее подготовленного образца в систему ВЭЖХ с бинарными насосами в сочетании с тройным четырехкратным масс-спектрометром.Чтобы сгенерировать стандартные калибровочные кривые, объедините шесть извлечений образцов вместе и вихрьте смесь, а затем снова аликвотируйте ее до шести экстракций, чтобы получить каждый фон. Добавьте шесть различных концентраций каждого стандарта к этим шести экстракциям соответственно и вводите их одну за другой в систему ВЭЖХ. Регистрировать пиковые области каждого стандарта в разных концентрациях через массовые переходы.Этот протокол использовался для идентификации и количественной оценки N1-метиладенозина, известного модифицированного нуклеозида, в двухнедельных саженцах дикого типа Arabidopsis. Профиль масс-спектрометрии показал, что ионы продукта, образующиеся из стандарта N1-метиладенозина, имеют соотношение 150 и 133 МЗ. И такой же профиль наблюдался в Колумбии нулевой добычи.Из-за высокой обилия продукта-иона 150 МЗ для идентификации N1-метиладенозина был выбран массовый переход от 282,1 до 150. Время удержания целевого пика составило 7,05 минуты. Аналогично времени удержания стандарта N1-метиладенозина.Серия концентраций стандартов N1-метиладенозина была добавлена в шесть образцов экстракции. Стандартные образцы вводили в LC-MS/MS, и увеличенные пиковые площади N1-метиладенозина были построены в сопоставлении с номинальными концентрациями стандартов. Шесть равных фоновых извлечений важны для создания точной и повторяемой калибровочной кривой для количественной оценки.Наш метод может быть применен для изучения метаболических путей в растениях. Сравнивая профили метаболитов между мутантами дикого типа и мутантами с потерей функции, можно было бы вывести метаболический поток.

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Sample Preparation for Mass Spectrometry-based Identification of RNA-binding Regions

Пробоподготовка для массы на основе спектрометрии идентификации RNA-связывая регионов

Noncoding RNAs play important roles in several nuclear processes, including regulating gene expression, chromatin structure, and DNA repair. In most ...

Determination of the Glycogen Content in Cyanobacteria

Определение содержания гликогена в цианобактериях

Cyanobacteria accumulate glycogen as a major intracellular carbon and energy storage&#160;during photosynthesis. Recent developments in research have ...

Spectrophotometric Determination of Phycobiliprotein Content in Cyanobacterium Synechocystis

Spectrophotometric Determination of Phycobiliprotein Content in Cyanobacterium Synechocystis

Спектрофотометрические определение содержания Phycobiliprotein в цианобактерии Synechocystis

This is a simple protocol for the quantitative determination of phycobiliprotein content in the model cyanobacterium Synechocystis. Phycobiliproteins are ...

An All-in-one Sample Holder for Macromolecular X-ray Crystallography with Minimal Background Scattering

Универсальный выборочный держатель для макромолекулярной рентгеновской кристаллографии с минимальным рассеянием фона

Macromolecular X-ray crystallography (MX) is the most prominent method to obtain high-resolution three-dimensional knowledge of biological macromolecules. ...

A Plasma Sample Preparation for Mass Spectrometry using an Automated Workstation

Подготовка образца плазмы для масс-спектрометрии с использованием автоматизированной рабочей станции

Sample preparation for mass spectrometry analysis in proteomics requires enzymatic cleavage of proteins into a peptide mixture. This process involves ...

Sample Preparation for Probe Electrospray Ionization Mass Spectrometry

Образец Подготовки для зонда Электроспрей ионизации масс-спектрометрии

Mass spectrometry (MS) is a powerful tool in analytical chemistry because it provides very accurate information about molecules, such as mass-to-charge ...

TMT Sample Preparation for Proteomics Facility Submission and Subsequent Data Analysis

TMT Пример ы подготовки к протеомики объекта представления и последующего анализа данных

Proteomic technologies are powerful methodologies that can aid our understanding of mechanisms of action in biological systems by providing a global view ...

Estimation of Plant Biomass Lignin Content using Thioglycolic Acid (TGA)

Estimation of Plant Biomass Lignin Content using Thioglycolic Acid TGA

Оценка содержания лигнина в растительной биомассе с использованием тиогликолиновой кислоты (TGA)

Lignin is a natural polymer that is the second most abundant polymer on Earth after cellulose. Lignin is mainly deposited in plant secondary cell walls ...

A Sample Preparation Pipeline for Microcrystals at the VMXm Beamline

Конвейер пробоподготовки микрокристаллов на лучевой линии VMXm

The mounting of microcrystals (&#60;10 &#181;m) for single crystal cryo-crystallography presents a non-trivial challenge. Improvements in data quality ...

Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization

Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies Mo-GWAS: Guidelines for Sample Preparation and Normalization

Крупномасштабные мультиомные исследования геномных ассоциаций (Mo-GWAS): руководство по подготовке и нормализации образцов

Both gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) and liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) are widely used metabolomics approaches to detect ...