डीएनए हेलो पर सीटू संकरण में प्रतिदीप्ति पूरे गुणसूत्र, टेलोमेरेस और जीन लोकी को प्रकट करने की तैयारी करती है

सीटू संकरण में प्रतिदीप्ति के साथ डीएनए हेलो तैयारी का संयोजन न्यूक्लियोस्केलेटन के साथ जीनोमिक इंटरैक्शन के उच्च-रिज़ॉल्यूशन विश्लेषण को सक्षम बनाता है। संलग्न जीनोम अवशिष्ट निकाले गए नाभिक के भीतर स्थित संकरित फ्लोरोसेंट संकेतों की ओर जाता है, जबकि गैर-संलग्न जीनोम अवशिष्ट नाभिक के आसपास डीएनए के प्रभामंडल में होता है।