Name: quantitative metabolomics of saccharomyces cerevisiae using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry
Uploaded: 2021-01-05T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry at JoVE.com

Vi er taknemmelige over for nuværende og tidligere medlemmer af Titorenko-laboratoriet for drøftelser. Vi anerkender Center for Biologiske Anvendelser af Mass Spectrometry, Center for Strukturel og Funktionel Genomforskning, og Center for Mikroskopi og Cellulær Imaging (alle på Concordia University) for fremragende tjenester. Denne undersøgelse blev støttet af tilskud fra Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) i Canada (RGPIN 2014-04482 og CRDPJ 515900 - 17). K.M. blev støttet af Concordia University Armand C. Archambault Fellowship og Concordia University Dean of Arts and Sciences Award of Excellence.

1. Fremstilling og sterilisering af et medium til dyrkning af gær
<ol><li>Lav 180 mL af en komplet gær ekstrakt med bactopeptone (YP) medium. Det komplette YP-medium indeholder 1% (w/v) gærekstrakt og 2% (w/v) bactopeptone.</li>
	<li>YP-mediet fordeles ligeligt i fire 250 mL Erlenmeyer kolber. Hver af disse kolber indeholder 45 mL af YP-mediet.</li>
	<li>Kolberne steriliseres med YP-medium ved autoklavering ved 15 psi/121 °C i 45 min.</li>
</ol>2. Gærstamme af vildtypen
<ol><li>Brug BY474...

Hvis du vil bruge den protokol, der er beskrevet her, skal du følge de forebyggende foranstaltninger, der er beskrevet nedenfor. Kloroform og methanol ekstraherer forskellige stoffer fra laboratorieplast. Håndter dem derfor med forsigtighed. Undgå brug af plast i trin, der involverer kontakt med nogen af disse to organiske opløsningsmidler. Brug borosilicate glas pipetter til disse trin. Oplad disse pipetter med kloroform og methanol før brug. Brug kun mikropipetspidser og rør lavet af polypropylen, der er resisten...

Vandopløselige metabolitter er lavdybtrykære mellemprodukter og metabolismeprodukter, der bidrager til væsentlige cellulære processer. Disse evolutionært bevarede processer omfatter konvertering af næringsstoffer til brugbar energi, syntese af makromolekyler, cellulær vækst og signalering, cellecykluskontrol, regulering af genekspression, stressrespons, post-translationel regulering af metabolisme, vedligeholdelse af mitokondriefunktionalitet, køretøjs cellulær handel, autofagi, cellulær aldring og reguleret celledød1,2,3.
Mange af disse væsentlige roller af vandopløselige metabolitter er blevet opdaget ved undersøgelser i den spirende gær S. cerevisiae1,3,4,7,9,14,15,16,17,18,19,20,21,22. Denne encellede eukaryote er en nyttig modelorganisme til dissekeringsmekanismer , hvorigennem vandopløselige metabolitter bidrager til cellulære processer på grund af dets aenabilitet til avancerede biokemiske, genetiske og molekylære biologiske analyser23,24,25,26. Selv om LC-MS/MS-metoderne for ikke-målrettede metabolomics er blevet anvendt til at studere de vandopløselige metabolitters roller i spirende gær3,18,22,27, kræver denne type analyse en forbedring af dens alsidighed, robusthed, følsomhed og evne til at skelne mellem forskellige strukturelle isomerer og stereoisomeriske former af disse metabolitter.
De seneste år er præget af betydelige fremskridt med hensyn til at anvende LC-MS/MS-metoderne for ikke-målrettede metabolomics på profilering af vandopløselige metabolitter in vivo. Mange udfordringer ved at bruge denne metode er dog fortsat2,28,29,30,31,32,33,34,35,36. Disse udfordringer omfatter følgende. For det første er de intracellulære koncentrationer af mange vandopløselige metabolitter under en følsomhedstærskel for de nuværende anvendte metoder. For det andet er effektiviteten af metabolisk aktivitetsslukning for lav, og omfanget af slukningsrelateret cellelækage af intracellulære metabolitter er for høj til de nuværende metoder; Derfor undervurderer de nuværende anvendte metoder de intracellulære koncentrationer af vandopløselige metabolitter. For det tredje kan de eksisterende metoder ikke differentiere de strukturelle isomerer (dvs. molekyler med den samme kemiske formel, men forskellige atomnektivitet) eller stereoisomerer (dvs. molekyler med samme kemiske formel og atomare konnektivitet, men med den forskellige atomare ordning i rummet) af specifikke metabolitter; Dette forhindrer den korrekte anmærkning af visse metabolitter ved hjælp af de nuværende anvendte metoder. For det fjerde er de eksisterende massespektrale onlinedatabaser over forældre (MS1) og sekundære ioner (MS2) ufuldstændige; dette påvirker den korrekte identifikation og kvantitet af specifikke metabolitter ved hjælp af de rå LC-MS/MS-data, der er produceret ved hjælp af de nuværende metoder. For det femte kan de eksisterende metoder ikke anvende en enkelt type metabolitudvinding til at genvinde alle eller de fleste klasser af vandopløselige metabolitter. For det sjette kan de eksisterende metoder ikke bruge en enkelt type LC-kolonnen til at adskille alle eller de fleste klasser af vandopløselige metabolitter fra hinanden.
Her optimerede vi betingelserne for dæmpning af metabolisk aktivitet i S. cerevisiae celler, opretholde de fleste af de vandopløselige metabolitter i disse celler før ekstraktion, og udvinde de fleste klasser af vandopløselige metabolitter fra gærceller. Vi udviklede en alsidig, robust og følsom metode til LC-MS/MS-baseret identifikation og kvantificering af mere end 370 vandopløselige metabolitter udvundet fra S. cerevisiae celler. Denne metode til ikke-målrettede metabolomics gør det muligt at vurdere de intracellulære koncentrationer af forskellige energibærermolekyler, nukleotider, aminosyrer, monosaccharider, mellemprodukter af glykolyse og tricarboxyliske cyklus mellemprodukter. Den udviklede LC-MS/MS-metode gør det muligt at identificere og kvantificere forskellige strukturelle isomerer og stereoisomeriske former for vandopløselige metabolitter med forskellige strukturelle, fysiske og kemiske egenskaber.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td colspan="4">Chemicals</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A9554</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium acetate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A11450</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium bicarbonate</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>9830</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bactopeptone</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP1420-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloroform</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>C297-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glucose</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>D16-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-histidine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>H8125</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-leucine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L8912</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-lysine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L5501</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A4564</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A4564</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Propidium iodide</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>R37108</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Uracil</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>U0750</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast extract</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP1422-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Hardware equipment</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>500 ml centrifuge bottles</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>355664</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agilent 1100 series LC system</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>G1312A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Beckman Coulter Centrifuge</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>6254249</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Beckman Coulter Centrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>JA-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centra CL2 clinical centrifuge</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>004260F</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Digital thermometer</td>
			<td>Omega</td>
			<td>HH509</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Foam Tube Holder Kit with Retainer</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>02-215-388</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SeQuant ZIC-pHILIC zwitterionic-phase column (5&#181;m polymer 150 x 2.1 mm)</td>
			<td>Sigma Milipore</td>
			<td>150460</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermo Orbitrap Velos MS</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>ETD-10600</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ultrasonic sonicator</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>15337416</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vortex</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>2215365</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ZORBAX Bonus-RP, 80&#197;, 2.1 x 150 mm, 5 &#181;m</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>883725-901</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Laboratory materials</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>2-mL Glass sample vials with Teflon lined caps</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>60180A-SV9-1P</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass beads (acid-washed, 425-600 &#956;m)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>G8772</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hemacytometer</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>267110</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>15-mL High-speed glass centrifuge tubes with Teflon lined caps</td>
			<td>PYREX</td>
			<td>05-550</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Compound Discoverer 3.1</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>V3.1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Yeast strain</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast strain BY4742</td>
			<td>Dharmacon</td>
			<td>YSC1049</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantitative metabolomics of saccharomyces cerevisiae using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry

Metabolomics er en metode, der anvendes til identifikation og kvantificering af mange lav-molekylvægt mellemprodukter og produkter af stofskiftet i en celle, væv, organ, biologisk væske, eller organisme. Metabolomics traditionelt fokuserer på vandopløselige metabolitter. Den vandopløselige metabolom er det endelige produkt af et komplekst mobilnetværk, der integrerer forskellige genomiske, epigenomic, transskriptomiske, proteomiske og miljømæssige faktorer. Derfor vurderer den metabolomiske analyse direkte resultatet af handlingen for alle disse faktorer i en overflod af biologiske processer inden for forskellige organismer. En af disse organismer er den spirende gær Saccharomyces cerevisiae, en encellet eukaryote med det fuldt sekventeret genom. Fordi S. cerevisiae er modtagelig for omfattende molekylære analyser, bruges det som model for dissekere mekanismer, der ligger til grund for mange biologiske processer i den eukaryote celle. En alsidig analysemetode til en robust, følsom og nøjagtig kvantitativ vurdering af det vandopløselige metabolom ville være den nødvendige metode til dissekering af disse mekanismer. Her præsenterer vi en protokol for de optimerede betingelser for metabolisk aktivitet, der slukker i og vandopløselig metabolitudvinding fra S. cerevisiae celler. Protokollen beskriver også brugen af flydende kromatografi kombineret med tandem massespektrometri (LC-MS/MS) til kvantitativ analyse af de ekstrahviderede vandopløselige metabolitter. Den LC-MS/MS-metode til ikke-målrettede metabolomics, der er beskrevet her, er alsidig og robust. Det muliggør identifikation og kvantificering af mere end 370 vandopløselige metabolitter med forskellige strukturelle, fysiske og kemiske egenskaber, herunder forskellige strukturelle isomerer og stereoisomeriske former af disse metabolitter. Disse metabolitter omfatter forskellige energibærermolekyler, nukleotider, aminosyrer, monosaccharider, mellemprodukter af glykolyse og tricarboxylsyrecyklusprodukter. LC-MS/MS-metoden for ikke-målrettede metabolomics er følsom og gør det muligt at identificere og kvantificere nogle vandopløselige metabolitter i koncentrationer helt ned til 0,05 pmol/μL. Metoden er med succes blevet anvendt til vurdering af vandopløselige metabolomer af vilde og mutante gærceller, der dyrkes under forskellige forhold.

For at forbedre en kvantitativ vurdering af vandopløselige metabolitter i en gærcelle optimerede vi betingelserne for celleslukning til metabolitdetektering. Celleslukning til dette formål indebærer en hurtig anholdelse af alle enzymatiske reaktioner i en celle31,33,37,38. En sådan anholdelse af cellulær metabolisk aktivitet er et vigtigt trin i enhver met...

Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry at JoVE.com

Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Vi præsenterer en protokol for identifikation og kvantificering af større klasser af vandopløselige metabolitter i gær saccharomyces cerevisiae. Den beskrevne metode er alsidig, robust og følsom. Det gør det muligt at udskille strukturelle isomerer og stereoisomeriske former for vandopløselige metabolitter fra hinanden.

Kvantitative metabolomics af saccharomyces Cerevisiae Ved hjælp af flydende kromatografi kombineret med tandem massespektrometri

Metabolomics is a methodology used for the identification and quantification of many low-molecular-weight intermediates and products of metabolism within ...

Denne protokol har mange fordele i forhold til de aktuelt anvendte gær metabolomics, fordi det har høj specificitet, høj følsomhed, og også det kan profilere mange forskellige klasser af metabolitter, herunder isomerisk, isobar, hydrofil, og hydrofobiske molekyler. Den slukningsmetode, der anvendes i denne protokol, stopper alle enzymatiske reaktioner, mens det reducerer lækagen af metabolitter fra cellerne betydeligt. MS1-biblioteket, der er indbygget i denne protokol, er fra de forskellige MS2-kørsler.Efter overnatning kultur på 30 grader Celsius og 200 omdrejninger i minuttet, bestemme antallet af gærceller pr milliliter af kultur og tilføje fem milliliter steriliseret 20% lageropløsning af glukose til hver af to Erlenmeyer kolber indeholdende 45 milliliter autoklavet YP medium pr kolbe. Brug en steril overførsel pipette til at tilføje fem gange 10 til den syvende gær celler til hver kolbe og vokse gærceller i mindst 24 ekstra timer ved 30 grader Celsius ved 200 omdrejninger i minuttet. Til metabolitudvinding, efter kultur, opsamle gærcellerne ved centrifugering og fjern hurtigt supernatanten.Placer røret på tøris og tilsæt to milliliter minus 20 grader Celsius chloroform, en milliliter på minus 20 grader Celsius methanol, en milliliter iskoldt nano rent vand og 200 mikroliter af 425 til 600 mikron syrevaskede glasperler til cellerne. Når perlerne er tilsat, placere røret dækket med aluminiumsfolie i et skum rørholder kit med en holder og vortex prøven i 30 minutter ved medium hastighed ved fire grader Celsius for at lette metabolitudvinding. Derefter inkuberes røret i 15 minutter på is, før prøven centrifugeres for at tillade adskillelse af den øvre vandige fase fra mellemaffald og protein og lavere organiske faser.Brug en mikropipette til at overføre ca. 400 mikroliter af den øvre vandige fase til et vasket og mærket 1,5 milliliterrør, der indeholder 800 mikroliter på minus 20 grader Celsius acetonitril. Derefter centrifugere prøven og overføre 800 mikroliter af den øverste del af supernatanten til en mærket massespektrometri hætteglas for nul graders opbevaring indtil flydende kromatografi tandem massespektrometri analyse. For at adskille de ekstraherede metabolitter ultralydsprøver prøveglasset i 15 minutter efterfulgt af tre 10-sekunders hvirvler ved stuetemperatur.Efter hvirvlen skal hætteglasset placeres i væskekromatografiens brøndplade og indstille kolonnen til 45 grader Celsius med en strømningshastighed på 0,25 milliliter i minuttet og brøndpladen til nul grader Celsius. Brug derefter tabellen til at indstille de flydende kromatografigradienter til analysen. Efter adskillelse skal du bruge 10 mikroliterprøvemængder af injektionen i både elektrosprayioniseringspositive og negative tilstande i et massespektrometer udstyret med opvarmet elektrosprayionisering for at identificere og kvantificere de vandopløselige metabolitter.I slutningen af analysen skal du åbne de rå data i et passende softwareprogram til sammensatte analyser og bruge massespektralfragmenteringsbiblioteket til at matche massespektret for at kommentere de metabolitter, der er identificeret i analysen. De nøjagtige masser af MS1- og isotopmønstrene kan også identificeres for at tillade anmærkning af metabolitterne ved hjælp af onlinedatabaser. Brug derefter biblioteket af databaser og spektre til at søge efter MS2-spektret af de rå data.Den næste dag, efter at have slukket gærcellerne, vask cellerne grundigt med 15 milliliter ABC-buffer og opsamler cellerne ved centrifugering. Resuspend pellet i en milliliter frisk ABC buffer og tilsæt 500 mikroliter af propidium jodopløsningen til cellerne. Vortex prøven tre gange i 10 sekunder pr vortex og inkubere cellerne i 10 minutter på is beskyttet mod lys.I slutningen af inkubationen opsamles cellerne ved centrifugering og cellerne vaskes tre gange med en milliliter frisk ABC-buffer pr. Vask. Efter den sidste vask skal pelleten genbruges i 300 mikroliter af frisk ABC-buffer og tilføje 10 mikroliter af den resulterende celleaffjedring til et mikroskopdias. Brug et fluorescensmikroskop til at fange differentialinterferenskontrast og fluorescensmikroskopibilleder af cellerne med filtrene indstillet til en excitationsbølgelængde på 593 nanometer og en emissionsbølgelængde på 636 nanometer.Brug derefter et passende billedanalyseprogram til at tælle det samlede celletal af celler i lysmarks- og fluorescensbillederne og til at bestemme fluorescensintensiteten af farvning for individuelle celler. Den modificerede celleslukningsmetode forårsager betydeligt lavere skade på plasmamembranen og cellevæggen end den ikke-bufferede 80%methanol ved minus 40 grader Celsius slukningsmetode. Faktisk udviser næsten alle de celler, der udsættes for dæmpning ved hjælp af den modificerede metode, rød fluorescensemission, som er karakteristisk for gærceller, hvor plasmamembranen og cellevæggen ikke beskadiges.I modsætning hertil viste næsten alle de celler, der blev udsat for slukning ved hjælp af den ikke-bufferede 80%metanol ved 40 grader Celsius-metoden, grøn fluorescensemission, som er karakteristisk for gærceller, hvor plasmamembranen og cellevæggen er betydeligt beskadiget. Den modificerede celleslukningsmetode forårsager også betydeligt lavere lækage af vandopløselige metabolitter fra gærceller end den ikke-bufferede 80%methanol ved minus 40 grader Celsius slukningsmetode. Retentionstidsskifteværdierne for vandopløselige metabolitstandarder er betydeligt lavere, og topformerne er væsentligt skarpere for den zwitterioniske fasekolonne sammenlignet med den omvendte fasekolonne.En anden fordel ved den flydende kromatografi tandem massespektrometri metode er evnen til at bruge den zwitterioniske fase kolonne til effektivt at adskille forskellige vandopløselige metabolitter med forskellige strukturelle, fysiske og kemiske egenskaber. Sørg for at gøre propidium jod stående i mørke og sørg også for at indsamle den øverste fase, mens ikke forstyrre den midterste fase. Hvis en MFP ikke kan kommenteres på grund af manglen på MS2-spektralbiblioteket, skal du bruge en NMR til at illustrere denne struktur.

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Resolving Affinity Purified Protein Complexes by Blue Native PAGE and Protein Correlation Profiling

Løsning affinitetsrensede proteinkomplekser ved Blå Native PAGE og protein Korrelation Profilering

Most proteins act in association with others; hence, it is crucial to characterize these functional units in order to fully understand biological ...

A Tandem Liquid Chromatography&#8211;Mass Spectrometry-based Approach for Metabolite Analysis of Staphylococcus aureus

A Tandem Liquid ChromatographyÃƒÆ’Ã‚Â¢ÃƒÂ¢Ã¢â‚¬Å¡Ã‚Â¬ÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã…â€œMass Spectrometry-based Approach for Metabolite Analysis of Staphylococcus aureus

En Tandem væskekromatografi-massespektrometri-baseret tilgang til Metabolit Analyse af<em&gt; Staphylococcus aureus</em

In an effort to thwart bacterial pathogens, hosts often limit the availability of nutrients at the site of infection. This limitation can alter the ...

Lipid Droplet Isolation for Quantitative Mass Spectrometry Analysis

Lipid Droplet Isolation for Kvantitativ massespektrometri Analyse

Lipid droplets are vital to the replication of a variety of different pathogens, most prominently the Hepatitis C Virus (HCV), as the putative site of ...

Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Dyb proteomet profilering af Isobar mærkning, omfattende væskekromatografi, massespektrometri og Software-assisteret kvantificering

Many exceptional advances have been made in mass spectrometry (MS)-based proteomics, with particular technical progress in liquid chromatography (LC) ...

Identification of Inositol Phosphate or Phosphoinositide Interacting Proteins by Affinity Chromatography Coupled to Western Blot or Mass Spectrometry

Identifikation af inositol fosfat eller Phosphoinositide interagerende proteiner ved affinitets kromatografi koblet til Western blot eller massespektrometri

Inositol phosphates and phosphoinositides regulate several cellular processes in eukaryotes, including gene expression, vesicle trafficking, signal ...

Absolute Quantification of Cell-Free Protein Synthesis Metabolism by Reversed-Phase Liquid Chromatography-Mass Spectrometry

Absolut kvantificering af celle frit protein syntese metabolisme ved omvendt fase-væskekromatografi-massespektrometri

Cell-free protein synthesis (CFPS) is an emerging technology in systems and synthetic biology for the in vitro production of proteins. However, if CFPS is ...

Quantitative Analysis of the Cellular Lipidome of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Quantitative Analysis of the Cellular Lipidome of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Kvantitativ analyse af cellulære lipidom af Saccharomyces Cerevisiae Ved hjælp af flydende kromatografi kombineret med tandem massespektrometri

Lipids are structurally diverse amphipathic molecules that are insoluble in water. Lipids are essential contributors to the organization and function of ...

Untargeted Liquid Chromatography-Mass Spectrometry-Based Metabolomics Analysis of Wheat Grain

Umålrettet flydende kromatografi-massespektrometri-baserede metabolomiske analyse af hvedekorn

Understanding the interactions between genes, the environment and management in agricultural practice could allow more accurate prediction and management ...

Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics

Semikvantitativ analyse af peptidoglycan ved væskekromatografi, massespektrometri og bioinformatik

Peptidoglycan is an important component of bacterial cell walls and a common cellular target for antimicrobials. Although aspects of peptidoglycan ...

Labelling and Visualization of Mitochondrial Genome Expression Products in Baker's Yeast Saccharomyces cerevisiae

Labelling and Visualization of Mitochondrial Genome Expression Products in Baker's Yeast Saccharomyces cerevisiae

Mærkning og visualisering af mitokondriegenomudtryksprodukter i Baker&apos;s Yeast Saccharomyces cerevisiae

Mitochondria are essential organelles of eukaryotic cells capable of aerobic respiration. They contain circular genome and gene expression apparatus. A ...