Name: quantitative metabolomics of saccharomyces cerevisiae using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry
Uploaded: 2021-01-05T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry at JoVE.com

Vi er takknemlige overfor nåværende og tidligere medlemmer av Titorenko-laboratoriet for diskusjoner. Vi anerkjenner Centre for Biological Applications of Mass Spectrometry, Centre for Structural and Functional Genomics, og Centre for Microscopy and Cellular Imaging (alle ved Concordia University) for fremragende tjenester. Denne studien ble støttet av tilskudd fra Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) i Canada (RGPIN 2014-04482 og CRDPJ 515900 - 17). K.M. ble støttet av Concordia University Armand C. Archambault Fellowship og Concordia University Dean of Arts and Sciences Award of Excellence.

1. Å lage og sterilisere et medium for dyrking av gjær
<ol><li>Lag 180 ml av et komplett gjærekstrakt med bactopeptone (YP) medium. Det komplette YP-mediet inneholder 1% (w / v) gjærekstrakt og 2% (w / v) bactopeptone.</li>
	<li>Fordel 180 ml av YP-mediet likt i fire 250 ml Erlenmeyer-kolber. Hver av disse kolbeene inneholder 45 ml av YP-mediet.</li>
	<li>Steriliser kolbeene med YP-medium ved autoklavering ved 15 psi/121 °C i 45 minutter.</li>
</ol>2. Gjærstamme av vill type
<ol><li>Bruk...

Følg de forebyggende tiltakene som er beskrevet nedenfor for å kunne bruke protokollen som er beskrevet nedenfor. Kloroform og metanolekstrakt ulike stoffer fra laboratorieplastikk. Vær derfor forsiktig når du håndterer dem. Unngå bruk av plast i trinn som innebærer kontakt med noen av disse to organiske løsningsmidlene. Bruk borosilikatglasspipetter for disse trinnene. Øk disse pipettene med kloroform og metanol før bruk. Bruk kun mikropipettespisser og rør laget av polypropylen som er motstandsdyktige mot or...

Vannløselige metabolitter er lavmolekylære mellomprodukter og produkter av metabolisme som bidrar til essensielle cellulære prosesser. Disse evolusjonært bevarte prosessene inkluderer konvertering av næringsstoffer til brukbar energi, syntese av makromolekyler, cellulær vekst og signalering, cellesykluskontroll, regulering av genuttrykk, stressrespons, postoversettelsesregulering av metabolisme, vedlikehold av mitokondriefunksjonalitet, bilikulær smugling, autofagi, cellulær aldring og regulert celledød1,2,3.
Mange av disse viktige rollene til vannløselige metabolitter har blitt oppdaget av studier i den spirende gjæren S. cerevisiae1,3,4,7,9,14,15,16,17,18,19,20,21,22. Denne encellede eukaryotten er en nyttig modellorganisme for dissekeringsmekanismer der vannløselige metabolitter bidrar til cellulære prosesser på grunn av dens egnethet til avanserte biokjemiske, genetiske og molekylære biologiske analyser23,24,25,26. Selv om LC-MS / MS-metodene for ikke-målrettet metabolomics har blitt brukt til å studere rollene til vannløselige metabolitter i spirende gjær3,18,22,27, krever denne typen analyse forbedring av allsidigheten, robustheten, følsomheten og evnen til å skille mellom forskjellige strukturelle isomerer og stereoisomeriske former for disse metabolittene.
De siste årene er preget av betydelige fremskritt i å anvende LC-MS / MS metoder for ikke-målrettet metabolomics til profilering av vannløselige metabolitter in vivo. Mange utfordringer ved bruk av denne metodikken er imidlertidfortsatt 2,28,29,30,31,32,33,34,35,36. Disse utfordringene inkluderer følgende. For det første er de intracellulære konsentrasjonene av mange vannløselige metabolitter under en terskel for følsomhet for de for tiden brukte metodene. For det andre er effektiviteten av metabolsk aktivitetsslukking for lav, og omfanget av slukke-assosiert cellelekkasje av intracellulære metabolitter er for høy for dagens metoder; Derfor undervurderer de for tiden brukte metodene de intracellulære konsentrasjonene av vannløselige metabolitter. For det tredje kan de eksisterende metodene ikke skille de strukturelle isomerene (dvs. molekyler med samme kjemiske formel, men forskjellige atomforbindelser) eller stereoisomerer (dvs. molekyler med samme kjemiske formel og atomforbindelse, men med det forskjellige atomarrangementet i rommet) av spesifikke metabolitter; Dette forhindrer riktig merknad av visse metabolitter ved dagens brukte metoder. For det fjerde er de eksisterende elektroniske massespektraldatabasene for overordnede ioner (MS1) og sekundære ioner (MS2) ufullstendige. Dette påvirker riktig identifisering og kvantifisering av spesifikke metabolitter ved hjelp av rå LC-MS / MS-data produsert ved hjelp av de nåværende metodene. For det femte kan de eksisterende metodene ikke bruke en enkelt type metabolittutvinning for å gjenopprette alle eller de fleste klasser av vannløselige metabolitter. For det sjette kan de eksisterende metodene ikke bruke en enkelt type LC-kolonne for å skille seg fra hverandre alle eller de fleste klasser av vannløselige metabolitter.
Her optimaliserte vi forhold for slukking av metabolsk aktivitet i S. cerevisiae celler, opprettholde de fleste vannløselige metabolitter i disse cellene før utvinning, og trekke ut de fleste klasser av vannløselige metabolitter fra gjærceller. Vi utviklet en allsidig, robust og sensitiv metode for LC-MS/MS-basert identifisering og kvantifisering av mer enn 370 vannløselige metabolitter ekstrahert fra S. cerevisiae celler. Denne metoden for ikke-målrettede metabolomics gjør det mulig å vurdere intracellulære konsentrasjoner av ulike energibærermolekyler, nukleotider, aminosyrer, monosakkarider, mellomprodukter av glykolyse og trikarboksylsyklus mellomprodukter. Den utviklede LC-MS/MS-metoden tillater identifisering og kvantifisering av forskjellige strukturelle isomerer og stereoisomeriske former for vannløselige metabolitter med forskjellige strukturelle, fysiske og kjemiske egenskaper.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td colspan="4">Chemicals</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A9554</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium acetate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A11450</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium bicarbonate</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>9830</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bactopeptone</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP1420-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloroform</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>C297-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glucose</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>D16-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-histidine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>H8125</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-leucine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L8912</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-lysine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L5501</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A4564</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A4564</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Propidium iodide</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>R37108</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Uracil</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>U0750</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast extract</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP1422-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Hardware equipment</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>500 ml centrifuge bottles</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>355664</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agilent 1100 series LC system</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>G1312A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Beckman Coulter Centrifuge</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>6254249</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Beckman Coulter Centrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>JA-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centra CL2 clinical centrifuge</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>004260F</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Digital thermometer</td>
			<td>Omega</td>
			<td>HH509</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Foam Tube Holder Kit with Retainer</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>02-215-388</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SeQuant ZIC-pHILIC zwitterionic-phase column (5&#181;m polymer 150 x 2.1 mm)</td>
			<td>Sigma Milipore</td>
			<td>150460</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermo Orbitrap Velos MS</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>ETD-10600</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ultrasonic sonicator</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>15337416</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vortex</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>2215365</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ZORBAX Bonus-RP, 80&#197;, 2.1 x 150 mm, 5 &#181;m</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>883725-901</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Laboratory materials</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>2-mL Glass sample vials with Teflon lined caps</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>60180A-SV9-1P</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass beads (acid-washed, 425-600 &#956;m)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>G8772</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hemacytometer</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>267110</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>15-mL High-speed glass centrifuge tubes with Teflon lined caps</td>
			<td>PYREX</td>
			<td>05-550</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Compound Discoverer 3.1</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>V3.1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Yeast strain</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast strain BY4742</td>
			<td>Dharmacon</td>
			<td>YSC1049</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantitative metabolomics of saccharomyces cerevisiae using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry

Metabolomics er en metodikk som brukes for identifisering og kvantifisering av mange lavmolekylære mellomprodukter og produkter av metabolisme i en celle, vev, organ, biologisk væske eller organisme. Metabolomics fokuserer tradisjonelt på vannløselige metabolitter. Den vannløselige metabolome er det endelige produktet av et komplekst mobilnettverk som integrerer ulike genomiske, epigenomiske, transkripsjons-, proteomiske og miljømessige faktorer. Derfor vurderer den metabolomiske analysen direkte utfallet av handlingen for alle disse faktorene i en mengde biologiske prosesser innenfor ulike organismer. En av disse organismene er den spirende gjæren Saccharomyces cerevisiae, en encellulær eukaryote med det fullt sekvenserte genomet. Fordi S. cerevisiae er egnet til omfattende molekylære analyser, brukes den som modell for dissekeringsmekanismer som ligger til grunn for mange biologiske prosesser i den eukaryote cellen. En allsidig analytisk metode for den robuste, sensitive og nøyaktige kvantitative vurderingen av det vannløselige metabolomet vil gi den essensielle metodikken for dissekering av disse mekanismene. Her presenterer vi en protokoll for optimaliserte forhold for metabolsk aktivitet slukking i og vannløselig metabolittutvinning fra S. cerevisiae celler. Protokollen beskriver også bruk av flytende kromatografi kombinert med tandemmassespektrometri (LC-MS/MS) for kvantitativ analyse av de ekstraherte vannløselige metabolittene. LC-MS/MS-metoden for ikke-målrettet metabolomikk som er beskrevet her, er allsidig og robust. Det muliggjør identifisering og kvantifisering av mer enn 370 vannløselige metabolitter med forskjellige strukturelle, fysiske og kjemiske egenskaper, inkludert forskjellige strukturelle isomerer og stereoisomeriske former for disse metabolittene. Disse metabolittene inkluderer ulike energibærermolekyler, nukleotider, aminosyrer, monosakkarider, mellomprodukter av glykolyse og trikarboksylsyklus mellomprodukter. LC-MS/MS-metoden for ikke-målrettet metabolomikk er følsom og tillater identifisering og kvantifisering av noen vannløselige metabolitter ved konsentrasjoner så lave som 0,05 pmol/μL. Metoden har blitt vellykket brukt til å vurdere vannløselige metabolomer av villtype og mutant gjærceller dyrket under forskjellige forhold.

For å forbedre en kvantitativ vurdering av vannløselige metabolitter i en gjærcelle, optimaliserte vi betingelsene for celleslukking for metabolittdeteksjon. Celleslukking for dette formålet innebærer en rask arrestasjon av alle enzymatiske reaksjoner i en celle31,33,37,38. En slik arrestasjon av cellulær metabolsk aktivitet er et viktig trinn i enhver met...

Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry at JoVE.com

Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Vi presenterer en protokoll for identifisering og kvantifisering av store klasser av vannløselige metabolitter i gjæren Saccharomyces cerevisiae. Den beskrevne metoden er allsidig, robust og sensitiv. Det tillater separasjon av strukturelle isomerer og stereoisomeriske former for vannløselige metabolitter fra hverandre.

Kvantitativ metabolomikk av saccharomyces cerevisiae ved hjelp av flytende kromatografi kombinert med tandemmassespektrometri

Metabolomics is a methodology used for the identification and quantification of many low-molecular-weight intermediates and products of metabolism within ...

Denne protokollen har mange fordeler i forhold til den for tiden brukte gjærmetabolomics fordi den har høy spesifisitet, høy følsomhet, og det kan også profilere mange forskjellige klasser av metabolitter, inkludert isomeriske, isobariske, hydrofile og hydrofobe molekyler. Slukkemetoden som brukes i denne protokollen stopper alle enzymatiske reaksjoner, samtidig som lekkasjen av metabolitter fra cellene reduseres betydelig. MS1-biblioteket som er bygget i denne protokollen, er fra de forskjellige MS2-kjøringene.Etter nattkultur ved 30 grader Celsius og 200 omdreininger per minutt, bestem antall gjærceller per milliliter kultur og legg til fem milliliter sterilisert 20% lagerløsning av glukose til hver av to Erlenmeyer kolber som inneholder 45 milliliter autoklaved YP medium per kolbe. Bruk en steril overføringspipette for å legge fem ganger 10 til de syvende gjærcellene til hver kolbe og vokse gjærcellene i minst 24 ekstra timer ved 30 grader Celsius ved 200 omdreininger per minutt. For metabolittutvinning, etter kultur, samle gjærcellene ved sentrifugering og fjern raskt supernatanten.Legg røret på tørris og tilsett to milliliter minus 20 grader Celsius kloroform, en milliliter minus 20 grader Celsius metanol, en milliliter iskaldt nano rent vann og 200 mikroliter med 425 til 600 mikronsyrevaskede glassperler til cellene. Når perlene er tilsatt, plasser røret dekket med aluminiumsfolie i et skumrørholdersett med holder og virvelprøven i 30 minutter med middels hastighet ved fire grader Celsius for å lette metabolittutvinning. Deretter inkuberer du røret i 15 minutter på is før du sentrifugerer prøven for å tillate separasjon av den øvre vandige fasen fra midtre rusk og protein og lavere organiske faser.Bruk en mikropipette til å overføre ca. 400 mikroliter av den øvre vandige fasen til et vasket og merket 1,5 milliliterrør som inneholder 800 mikroliter minus 20 grader Celsius acetonitril. Sentrifuger deretter prøven og overfør 800 mikroliter av den øvre delen av supernatanten til et merket massespektrometrihette for nullgrads lagring til flytende kromatografi tandem massespektrometrianalyse. For å skille de ekstraherte metabolittene, ultralydsprøve hetteglasset i 15 minutter, etterfulgt av tre 10-sekunders virveler ved romtemperatur.Etter virveling, plasser hetteglasset i brønnplaten til væskekromatografen og sett kolonnen til 45 grader Celsius med en strømningshastighet på 0,25 milliliter per minutt og brønnplaten til null grader Celsius. Bruk deretter tabellen til å angi væskekromatografigradientene for analysen. Etter separasjon, bruk 10 mikroliter prøvevolumer av injeksjonen i både elektrosprayionisering positive og negative moduser i et massespektrometer utstyrt med oppvarmet elektrosprayionisering for å identifisere og kvantifisere vannløselige metabolitter.På slutten av analysen åpner du rådataene i et passende program for sammensatt analyse og bruker massespektral fragmenteringsbiblioteket for å matche massespektraet for å kommentere metabolittene som er identifisert i analysen. De eksakte massene av MS1- og isotopmønstrene kan også identifiseres for å tillate merknad av metabolittene ved hjelp av online databaser. Bruk deretter biblioteket med databaser og spektra til å søke etter MS2-spektraet for rådataene.Neste dag, etter å ha slukket gjærcellene, vask cellene grundig med 15 milliliter ABC-buffer og samle cellene ved sentrifugering. Resuspend pellet i en milliliter fersk ABC buffer og tilsett 500 mikroliter av propidiumjodidoppløsningen til cellene. Virvel prøven tre ganger i 10 sekunder per virvel og inkuber cellene i 10 minutter på is beskyttet mot lys.På slutten av inkubasjonen samler cellene ved sentrifugering og vasker cellene tre ganger med en milliliter fersk ABC-buffer per vask. Etter den siste vasken, resuspend pellet i 300 mikroliter av fersk ABC buffer og tilsett 10 mikroliter av den resulterende celle suspensjon til et mikroskop lysbilde. Bruk et fluorescensmikroskop for å fange differensialinterferenskontrast- og fluorescensmikroskopibilder av cellene med filtrene satt til en eksitasjonsbølgelengde på 593 nanometer og en utslippsbølgelengde på 636 nanometer.Bruk deretter et passende bildeanalyseprogram for å telle det totale celleantallet av celler i brightfield- og fluorescensbildene, og for å bestemme fluorescensintensiteten av farging for individuelle celler. Den modifiserte celleslukkingsmetoden forårsaker betydelig lavere skade på plasmamembranen og celleveggen enn den ikke-bufrede 80% metanol ved minus 40 grader Celsius slukkemetode. Faktisk viser nesten alle cellene som utsettes for slukking ved hjelp av den modifiserte metoden rødt fluorescensutslipp, som er karakteristisk for gjærceller der plasmamembranen og celleveggen ikke er skadet.Derimot viste nesten alle cellene som ble utsatt for slukking ved hjelp av den ikke-bufrede 80% metanol ved 40 grader Celsius-metoden, grønn fluorescensutslipp, som er karakteristisk for gjærceller der plasmamembranen og celleveggen er betydelig skadet. Den modifiserte celleslukkingsmetoden forårsaker også betydelig lavere lekkasje av vannløselige metabolitter fra gjærceller enn den ikke-bufrede 80% metanol ved minus 40 grader Celsius slukkemetode. Oppbevaringstidsskiftverdiene for vannløselige metabolittstandarder er betydelig lavere, og toppformene er vesentlig skarpere for den zwitterioniske fasekolonnen sammenlignet med omvendt fasekolonne.En annen fordel med den flytende kromatografi tandem massespektrometri metoden er evnen til å bruke zwitterionic fase kolonne for å effektivt skille forskjellige vannløselige metabolitter med ulike strukturelle, fysiske og kjemiske egenskaper. Pass på å gjøre propidiumjodden stående i mørket og sørg også for å samle den øvre fasen mens du ikke forstyrrer midtfasen. Hvis en MSP ikke kan kommenteres på grunn av mangelen på MS2-spektralbiblioteket, bruker du en NMR til å illustrere denne strukturen.

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Resolving Affinity Purified Protein Complexes by Blue Native PAGE and Protein Correlation Profiling

Løse affinitetsrenset protein komplekser av Blå Native PAGE og Protein korrelasjon Profiling

Most proteins act in association with others; hence, it is crucial to characterize these functional units in order to fully understand biological ...

A Tandem Liquid Chromatography&#8211;Mass Spectrometry-based Approach for Metabolite Analysis of Staphylococcus aureus

A Tandem Liquid ChromatographyÃƒÆ’Ã‚Â¢ÃƒÂ¢Ã¢â‚¬Å¡Ã‚Â¬ÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã…â€œMass Spectrometry-based Approach for Metabolite Analysis of Staphylococcus aureus

Et tandem-væskekromatografi-massespektrometri basert tilnærming for Metabolitt Analyse av<em&gt; Staphylococcus aureus</em

In an effort to thwart bacterial pathogens, hosts often limit the availability of nutrients at the site of infection. This limitation can alter the ...

Lipid Droplet Isolation for Quantitative Mass Spectrometry Analysis

Lipid Droplet Isolasjon for Quantitative massespektrometri analyse

Lipid droplets are vital to the replication of a variety of different pathogens, most prominently the Hepatitis C Virus (HCV), as the putative site of ...

Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Dyp proteom profilering av isobar merking, omfattende flytende Ture, massespektrometri og Software-baserte kvantifisering

Many exceptional advances have been made in mass spectrometry (MS)-based proteomics, with particular technical progress in liquid chromatography (LC) ...

Identification of Inositol Phosphate or Phosphoinositide Interacting Proteins by Affinity Chromatography Coupled to Western Blot or Mass Spectrometry

Identifisering av Inositol fosfat eller Fosfoinositid samspill proteiner av affinitet kromatografi koplet til Western Blot eller Mass massespektrometri

Inositol phosphates and phosphoinositides regulate several cellular processes in eukaryotes, including gene expression, vesicle trafficking, signal ...

Absolute Quantification of Cell-Free Protein Synthesis Metabolism by Reversed-Phase Liquid Chromatography-Mass Spectrometry

Absolutt kvantifisering av Cell-fri protein syntese metabolisme av reversert-fase flytende kromatografi-Mass massespektrometri

Cell-free protein synthesis (CFPS) is an emerging technology in systems and synthetic biology for the in vitro production of proteins. However, if CFPS is ...

Quantitative Analysis of the Cellular Lipidome of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Quantitative Analysis of the Cellular Lipidome of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Kvantitativ analyse av cellulær lipidom eav saccharomyces cerevisiae ved hjelp av flytende kromatografi kombinert med tandem massespektrometri

Lipids are structurally diverse amphipathic molecules that are insoluble in water. Lipids are essential contributors to the organization and function of ...

Untargeted Liquid Chromatography-Mass Spectrometry-Based Metabolomics Analysis of Wheat Grain

Umålrettet flytende kromatografi-massespektrometribasert metabolomikkanalyse av hvetekorn

Understanding the interactions between genes, the environment and management in agricultural practice could allow more accurate prediction and management ...

Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics

Semi-kvantitativ analyse av peptidoglykan ved væskekromatografi, massespektrometri og bioinformatikk

Peptidoglycan is an important component of bacterial cell walls and a common cellular target for antimicrobials. Although aspects of peptidoglycan ...

Labelling and Visualization of Mitochondrial Genome Expression Products in Baker's Yeast Saccharomyces cerevisiae

Labelling and Visualization of Mitochondrial Genome Expression Products in Baker's Yeast Saccharomyces cerevisiae

Merking og visualisering av mitokondriegenomuttrykksprodukter i Baker&apos;s Yeast Saccharomyces cerevisiae

Mitochondria are essential organelles of eukaryotic cells capable of aerobic respiration. They contain circular genome and gene expression apparatus. A ...