Name: quantitative metabolomics of saccharomyces cerevisiae using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry
Uploaded: 2021-01-05T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry at JoVE.com

Vi är tacksamma mot nuvarande och tidigare medlemmar av Titorenkolaboratoriet för diskussioner. Vi bekräftar Centre for Biological Applications of Mass Spectrometry, Centre for Structural and Functional Genomics och Centre for Microscopy and Cellular Imaging (alla vid Concordia University) för enastående tjänster. Denna studie stöddes av bidrag från Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) i Kanada (RGPIN 2014-04482 och CRDPJ 515900 - 17). K.M. stöddes av Concordia University Armand C. Archambault Fellowship och Concordia University Dean of Arts and Sciences Award of Excellence.

1. Göra och sterilisera ett medium för odling av jäst
<ol><li>Gör 180 ml av ett komplett jästextrakt med bactopepton (YP) medium. Det kompletta YP-mediet innehåller 1% (w/v) jästextrakt och 2% (w/v) bactopepton.</li>
	<li>Fördela 180 ml YP-medium lika i fyra 250 ml Erlenmeyerkolvar. Var och en av dessa flaskor innehåller 45 ml YP-medium.</li>
	<li>Sterilisera kolvarna med YP-medium genom automatisk automatisk enklavning vid 15 psi/121 °C i 45 min.</li>
</ol>2. Jäststam av vild typ
<...

Följ de förebyggande åtgärder som beskrivs nedan för att framgångsrikt använda protokollet som beskrivs här. Kloroform och metanol extraherar olika ämnen från laboratorieplastartiklar. Hantera dem därför med försiktighet. Undvik användning av plast i steg som innebär kontakt med något av dessa två organiska lösningsmedel. Använd borosilikatglaspipetter för dessa steg. Jäs dessa pipetter med kloroform och metanol före användning. Använd endast mikropipettespetsar och rör av polypropylen som är re...

Vattenlösliga metaboliter är lågmolekylära intermediärer och produkter av metabolism som bidrar till väsentliga cellulära processer. Dessa evolutionärt bevarade processer inkluderar omvandling av näringsämnen till användbar energi, syntes av makromolekyler, cellulär tillväxt och signalering, cellcykelkontroll, reglering av genuttryck, stressrespons, postöversättningsreglering av metabolism, underhåll av mitokondriell funktionalitet, fordonscellshandel, autofagi, cellulärt åldrande och reglerad celldöd1,2,3.
Många av dessa väsentliga roller av vattenlösliga metaboliter har upptäckts genom studier i den spirande jästen S. cerevisiae1,3,4,7,9,14,15,16,17,18,19,20,21,22. Denna encelliga eukaryote är en användbar modellorganism för dissekeringsmekanismer genom vilka vattenlösliga metaboliter bidrar till cellulära processer på grund av dess mottaglighet för avancerade biokemiska, genetiska och molekylärbiologiska analyser23,24,25,26. Även om LC-MS/MS-metoderna för icke-riktad metabolomik har använts för att studera rollerna för vattenlösliga metaboliter i spirande jäst3,18,22,27, kräver denna typ av analys förbättring av dess mångsidighet, robusthet, känslighet och förmåga att skilja mellan olika strukturella isomererer och stereoisomeriska former av dessa metaboliter.
De senaste åren kännetecknas av betydande framsteg vid tillämpning av LC-MS/MS-metoderna för icke-riktad metabolomik vid profilering av vattenlösliga metaboliter in vivo. Många utmaningar med att använda denna metod är dockfortfarande 2,28,29,30,31,32,33,34,35,36. Dessa utmaningar inkluderar följande. För det första ligger de intracellulära koncentrationerna av många vattenlösliga metaboliter under ett tröskelvärde för känslighet för de nuvarande metoderna. För det andra är effektiviteten av metabolisk aktivitetssläckning för låg, och omfattningen av släckningsrelaterade cellläckage av intracellulära metaboliter är för hög för nuvarande metoder; De metoder som för närvarande används underskattar därför de intracellulära koncentrationerna av vattenlösliga metaboliter. För det tredje kan de befintliga metoderna inte skilja mellan de strukturella isomererna (dvs. molekyler med samma kemiska formel men olika atomanslutning) eller stereoisomerer (dvs. molekyler med samma kemiska formel och atomanslutning, men med de olika atomarrangemangen i rymden) hos specifika metaboliter. Detta förhindrar korrekt anteckning av vissa metaboliter med de nuvarande metoderna. För det fjärde är de befintliga masspektrala onlinedatabaserna för föräldrajoner (MS1) och sekundärjoner (MS2) ofullständiga. Detta påverkar korrekt identifiering och kvantifiering av specifika metaboliter med hjälp av de råa LC-MS/MS-data som produceras med hjälp av de nuvarande metoderna. För det femte kan de befintliga metoderna inte använda en enda typ av metabolitextraktion för att återställa alla eller de flesta klasser av vattenlösliga metaboliter. För det sjätte kan de befintliga metoderna inte använda en enda typ av LC-kolumnen för att skilja alla eller de flesta klasser av vattenlösliga metaboliter från varandra.
Här optimerade vi villkoren för släckning av metabolisk aktivitet inom S. cerevisiae celler, upprätthålla de flesta av de vattenlösliga metaboliter inom dessa celler före extraktion, och extrahera de flesta klasser av vattenlösliga metaboliter från jästceller. Vi utvecklade en mångsidig, robust och känslig metod för LC-MS/MS-baserad identifiering och kvantifiering av mer än 370 vattenlösliga metaboliter extraherade från S. cerevisiae celler. Denna metod för icke-målinriktad metabolomik gör det möjligt att bedöma intracellulära koncentrationer av olika energibärarmolekyler, nukleotider, aminosyror, monosackarider, intermediärer av glykolys och trikarboxylic cykel intermediärer. Den utvecklade LC-MS/MS-metoden gör det möjligt att identifiera och kvantifiera olika strukturella isomererer och stereoisomeriska former av vattenlösliga metaboliter med olika strukturella, fysiska och kemiska egenskaper.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td colspan="4">Chemicals</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A9554</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium acetate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A11450</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium bicarbonate</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>9830</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bactopeptone</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP1420-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloroform</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>C297-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glucose</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>D16-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-histidine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>H8125</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-leucine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L8912</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>L-lysine</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>L5501</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A4564</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A4564</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Propidium iodide</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>R37108</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Uracil</td>
			<td>Sigma</td>
			<td>U0750</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast extract</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP1422-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Hardware equipment</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>500 ml centrifuge bottles</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>355664</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agilent 1100 series LC system</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>G1312A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Beckman Coulter Centrifuge</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>6254249</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Beckman Coulter Centrifuge Rotor</td>
			<td>Beckman</td>
			<td>JA-10</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centra CL2 clinical centrifuge</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>004260F</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Digital thermometer</td>
			<td>Omega</td>
			<td>HH509</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Foam Tube Holder Kit with Retainer</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>02-215-388</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SeQuant ZIC-pHILIC zwitterionic-phase column (5&#181;m polymer 150 x 2.1 mm)</td>
			<td>Sigma Milipore</td>
			<td>150460</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermo Orbitrap Velos MS</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>ETD-10600</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ultrasonic sonicator</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>15337416</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vortex</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>2215365</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ZORBAX Bonus-RP, 80&#197;, 2.1 x 150 mm, 5 &#181;m</td>
			<td>Agilent Technologies</td>
			<td>883725-901</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Laboratory materials</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>2-mL Glass sample vials with Teflon lined caps</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>60180A-SV9-1P</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass beads (acid-washed, 425-600 &#956;m)</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>G8772</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hemacytometer</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>267110</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>15-mL High-speed glass centrifuge tubes with Teflon lined caps</td>
			<td>PYREX</td>
			<td>05-550</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Compound Discoverer 3.1</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>V3.1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Yeast strain</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Yeast strain BY4742</td>
			<td>Dharmacon</td>
			<td>YSC1049</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantitative metabolomics of saccharomyces cerevisiae using liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry

Metabolomik är en metod som används för identifiering och kvantifiering av många lågmolekylära intermediärer och metabolismprodukter inom cell, vävnad, organ, biologisk vätska eller organism. Metabolomik fokuserar traditionellt på vattenlösliga metaboliter. Den vattenlösliga metabolomen är slutprodukten av ett komplext mobilnät som integrerar olika genomiska, epigenomiska, transkriptomiska, proteomiska och miljömässiga faktorer. Därför bedömer den metabolomiska analysen direkt resultatet av åtgärden för alla dessa faktorer i en mängd biologiska processer inom olika organismer. En av dessa organismer är den spirande jästen Saccharomyces cerevisiae, en encellig eukaryote med det helt sekvenserade genomet. Eftersom S. cerevisiae är mottaglig för omfattande molekylära analyser, används det som en modell för dissekeringsmekanismer som ligger till grund för många biologiska processer inom eukaryota cellen. En mångsidig analysmetod för en robust, känslig och korrekt kvantitativ bedömning av den vattenlösliga metabolomen skulle ge den viktigaste metoden för att dissekera dessa mekanismer. Här presenterar vi ett protokoll för optimerade villkor för metabolisk aktivitetssläckning i och vattenlöslig metabolit extraktion från S. cerevisiae celler. Protokollet beskriver också användningen av flytande kromatografi i kombination med tandem masspektrometri (LC-MS/MS) för kvantitativ analys av extraherade vattenlösliga metaboliter. LC-MS/MS-metoden för icke-riktad metabolomik som beskrivs här är mångsidig och robust. Det möjliggör identifiering och kvantifiering av mer än 370 vattenlösliga metaboliter med olika strukturella, fysiska och kemiska egenskaper, inklusive olika strukturella isomerer och stereoisomeriska former av dessa metaboliter. Dessa metaboliter inkluderar olika energibärarmolekyler, nukleotider, aminosyror, monosackarider, intermediärer av glykolys och trikarboxylcykel intermediärer. LC-MS/MS-metoden för icke-riktad metabolomik är känslig och gör det möjligt att identifiera och kvantifiera vissa vattenlösliga metaboliter vid koncentrationer så låga som 0,05 pmol/μL. Metoden har framgångsrikt använts för att bedöma vattenlösliga metabolomer av vilda och mutanta jästceller odlade under olika förhållanden.

För att förbättra en kvantitativ bedömning av vattenlösliga metaboliter i en jästcell optimerade vi villkoren för cellsläckning för metabolitdetektering. Cellsläckning för detta ändamål innebär ett snabbt gripande av alla enzymatiska reaktioner i en cell31,33,37,38. Ett sådant gripande av cellulär metabolisk aktivitet är ett viktigt steg i alla ...

Watch this Scientific Journal Video about Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry at JoVE.com

Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Vi presenterar ett protokoll för identifiering och kvantifiering av stora klasser av vattenlösliga metaboliter i jästen Saccharomyces cerevisiae. Den beskrivna metoden är mångsidig, robust och känslig. Det möjliggör separation av strukturella isomerer och stereoisomeriska former av vattenlösliga metaboliter från varandra.

Kvantitativ metabolomik av sackaromyces Cerevisiae med flytande kromatografi i kombination med tandemmasspektrometri

Metabolomics is a methodology used for the identification and quantification of many low-molecular-weight intermediates and products of metabolism within ...

Detta protokoll har många fördelar jämfört med den för närvarande använda jästmetabolomiken eftersom den har hög specificitet, hög känslighet, och det kan också profilera många olika klasser av metaboliter, inklusive isomeriska, isobariska, hydrofila och hydrofobiska molekyler. Den släckningsmetod som används i detta protokoll stoppar alla enzymatiska reaktioner samtidigt som läckaget av metaboliter från cellerna minskar avsevärt. MS1-biblioteket som är inbyggt i det här protokollet kommer från de olika MS2-körningarna.Efter över natten kultur vid 30 grader Celsius och 200 varv per minut, bestämma antalet jästceller per milliliter kultur och tillsätt fem milliliter steriliserad 20%lagerlösning glukos till var och en av två Erlenmeyer flaskor som innehåller 45 milliliter autoklaver av autoklaverat YP medium per kolv. Använd en steril överföringspipett för att lägga till fem gånger 10 till de sjunde jästcellerna till varje kolv och odla jästcellerna i minst 24 extra timmar vid 30 grader Celsius vid 200 varv per minut. För metabolitextraktion, efter odling, samla jästcellerna genom centrifugation och ta snabbt bort supernatanten.Placera röret på torris och tillsätt två milliliter minus 20 grader Celsius kloroform, en milliliter minus 20 grader Celsius metanol, en milliliter iskallt nano rent vatten och 200 mikroliter på 425 till 600 mikronsyra tvättade glaspärlor till cellerna. När pärlorna har tillsatts, placera röret täckt med aluminiumfolie i ett skumrörshållaresats med en hållare och virvel provet i 30 minuter med medelhastighet vid fyra grader Celsius för att underlätta metabolitextraktion. Inkubera sedan röret i 15 minuter på is innan provet centrifugerar för att möjliggöra separation av den övre vattenfasen från mellanskräpet och proteinet och lägre organiska faser.Använd en mikropipett för att överföra cirka 400 mikroliter av den övre vattenfasen till ett tvättat och märkt 1,5 milliliter rör som innehåller 800 mikroliter minus 20 grader Celsius acetonitril. Centrifugera sedan provet och överför 800 mikroliter av den övre delen av supernaten till en märkt masspektrometriflaska för nollgradig lagring tills vätskekromatografi tandemmasspektrometrianalys. För att separera de extraherade metaboliterna, ultraljud provflaskan i 15 minuter, följt av tre 10-sekunders virvlar vid rumstemperatur.Efter virvelvind, placera injektionsflaskan i brunnsplattan på vätskekromatografen och ställ in kolonnen på 45 grader Celsius med en flödeshastighet på 0,25 milliliter per minut och brunnsplattan till noll grader Celsius. Använd sedan tabellen för att ställa in de flytande kromatografigradienterna för analysen. Efter separationen, använd 10 mikroliterprovvolymer av injektionen i både elektrosprayjoniseringspositiva och negativa lägen i en masspektrometer utrustad med uppvärmd elektrosprayjonisering för att identifiera och kvantifiera vattenlösliga metaboliter.I slutet av analysen, öppna rådata i ett lämpligt sammansatt analysprogram och använd masspektrafragmenteringsbiblioteket för att matcha masspektrat för att kommentera de metaboliter som identifierats i analysen. De exakta massorna av MS1- och isotopmönstren kan också identifieras för att möjliggöra annotering av metaboliterna med hjälp av onlinedatabaser. Använd sedan biblioteket med databaser och spektra för att söka efter MS2-spektrat för rådata.Nästa dag, efter att ha släckt jästcellerna, tvätta cellerna noggrant med 15 milliliter ABC-buffert och samla cellerna genom centrifugation. Återanvänd pelleten i en milliliter färsk ABC-buffert och tillsätt 500 mikroliter av propidiumidlösningen till cellerna. Virvel provet tre gånger i 10 sekunder per virvel och inkubera cellerna i 10 minuter på is skyddad från ljus.I slutet av inkubationen, samla cellerna genom centrifugation och tvätta cellerna tre gånger med en milliliter färsk ABC-buffert per tvätt. Efter den senaste tvätten, återanvänd pelleten i 300 mikroliter färsk ABC-buffert och tillsätt 10 mikroliter av den resulterande cellfjädringen till en mikroskopbild. Använd ett fluorescensmikroskop för att fånga differential interferens kontrast och fluorescens mikroskopi bilder av cellerna med filtren inställda på en excitation våglängd på 593 nanometer och en utsläpp våglängd på 636 nanometer.Använd sedan ett lämpligt bildanalysprogram för att räkna det totala cellantalet celler i bilder av brightfield och fluorescens och för att bestämma färgningsintensiteten för enskilda celler. Den modifierade cellsläckande metoden orsakar betydligt lägre skador på plasmamembranet och cellväggen än den icke-buffrade 80%metanol vid minus 40 grader Celsius släckningsmetod. Faktum är att nästan alla celler som utsätts för släckning med den modifierade metoden uppvisar röda fluorescensutsläpp, vilket är karakteristiskt för jästceller där plasmamembranet och cellväggen inte skadas.Däremot visade nästan alla celler som utsattes för släckning med den icke-buffrade 80%metanol vid 40 grader Celsius metod grönt fluorescensutsläpp, vilket är karakteristiskt för jästceller där plasmamembranet och cellväggen skadas avsevärt. Den modifierade cellsläckningsmetoden orsakar också betydligt lägre läckage av vattenlösliga metaboliter från jästceller än den icke-buffrade 80%metanol vid minus 40 grader Celsius släckningsmetod. Retentionstidens skiftvärden för vattenlösliga metabolitstandarder är betydligt lägre och toppformerna är betydligt skarpare för den zwitterioniska faskolonnen jämfört med den omvända faskolonnen.En annan fördel med den flytande kromatografi tandem masspektrometri metoden är förmågan att använda zwitterionic faskolonnen för att effektivt separera olika vattenlösliga metaboliter med olika strukturella, fysiska och kemiska egenskaper. Se till att propidiumidodiden står i mörker och se också till att samla den övre fasen utan att störa mittfasen. Om det inte går att kommentera msp på grund av bristen på MS2-spektralbiblioteket använder du en NMR för att illustrera den här strukturen.

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Quantitative Metabolomics of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Resolving Affinity Purified Protein Complexes by Blue Native PAGE and Protein Correlation Profiling

Lösa affinitetsrenat proteinkomplex av Blue Native PAGE och protein Korrelation profilering

Most proteins act in association with others; hence, it is crucial to characterize these functional units in order to fully understand biological ...

A Tandem Liquid Chromatography&#8211;Mass Spectrometry-based Approach for Metabolite Analysis of Staphylococcus aureus

A Tandem Liquid ChromatographyÃƒÆ’Ã‚Â¢ÃƒÂ¢Ã¢â‚¬Å¡Ã‚Â¬ÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã…â€œMass Spectrometry-based Approach for Metabolite Analysis of Staphylococcus aureus

En Tandem vätskekromatografi-masspektrometri baserad strategi för metabolit analys av<em&gt; Staphylococcus aureus</em

In an effort to thwart bacterial pathogens, hosts often limit the availability of nutrients at the site of infection. This limitation can alter the ...

Lipid Droplet Isolation for Quantitative Mass Spectrometry Analysis

Lipid Droplet Isolation för Kvantitativ masspektrometri Analys

Lipid droplets are vital to the replication of a variety of different pathogens, most prominently the Hepatitis C Virus (HCV), as the putative site of ...

Deep Proteome Profiling by Isobaric Labeling, Extensive Liquid Chromatography, Mass Spectrometry, and Software-assisted Quantification

Djupa proteomet profilering av isobariska märkning, omfattande vätskekromatografi, masspektrometri och programvara-assisted kvantifiering

Many exceptional advances have been made in mass spectrometry (MS)-based proteomics, with particular technical progress in liquid chromatography (LC) ...

Identification of Inositol Phosphate or Phosphoinositide Interacting Proteins by Affinity Chromatography Coupled to Western Blot or Mass Spectrometry

Identifiering av inositol fosfat eller fosfoinositid samverkande proteiner genom affinitetskromatografi kopplad till Western blot eller masspektrometri

Inositol phosphates and phosphoinositides regulate several cellular processes in eukaryotes, including gene expression, vesicle trafficking, signal ...

Absolute Quantification of Cell-Free Protein Synthesis Metabolism by Reversed-Phase Liquid Chromatography-Mass Spectrometry

Absolut kvantifiering av cellfri protein syntes metabolism genom omvänd fas vätskekromatografi-masspektrometri

Cell-free protein synthesis (CFPS) is an emerging technology in systems and synthetic biology for the in vitro production of proteins. However, if CFPS is ...

Quantitative Analysis of the Cellular Lipidome of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Quantitative Analysis of the Cellular Lipidome of Saccharomyces Cerevisiae Using Liquid Chromatography Coupled with Tandem Mass Spectrometry

Kvantitativ analys av cellulär lipidom e av Saccharomyces Cerevisiae med hjälp av flytande kromatografi tillsammans med Tandem Mass Spectrometri

Lipids are structurally diverse amphipathic molecules that are insoluble in water. Lipids are essential contributors to the organization and function of ...

Untargeted Liquid Chromatography-Mass Spectrometry-Based Metabolomics Analysis of Wheat Grain

Oriktad flytande kromatografi-Mass Pektrometri-Baserade metabolomika analys av vetekorn

Understanding the interactions between genes, the environment and management in agricultural practice could allow more accurate prediction and management ...

Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics

Semikvantitativ analys av peptidoglykan genom vätskekromatografi, masspektrometri och bioinformatik

Peptidoglycan is an important component of bacterial cell walls and a common cellular target for antimicrobials. Although aspects of peptidoglycan ...

Labelling and Visualization of Mitochondrial Genome Expression Products in Baker's Yeast Saccharomyces cerevisiae

Labelling and Visualization of Mitochondrial Genome Expression Products in Baker's Yeast Saccharomyces cerevisiae

Märkning och visualisering av mitokondriella genomuttrycksprodukter i bagerijäst Saccharomyces cerevisiae

Mitochondria are essential organelles of eukaryotic cells capable of aerobic respiration. They contain circular genome and gene expression apparatus. A ...