Name: tumor allotransplantation in drosophila melanogaster with a programmable auto-nanoliter injector
Uploaded: 2021-02-02T14:30:00
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私たちは、このプロトコルの開発に貢献してくれた元研究室メンバーのSheng-An Yang博士とJuan-Martin Portilla氏に感謝します。北京大学生命科学院のYan Song博士の研究室が、手動の他家移植に関するプロトコルを共有してくれたことに感謝しています。また、原稿を批判的に読んでくれたカルダー・エルスワース氏とエベレスト・シャピロ氏にも感謝します。
WMDは、国立衛生研究所(https://www.nih.gov/)からこの研究のための資金提供(GM072562、CA224381、CA227789)を受け、国立科学財団(htps://nsf.gov/)から資金提供(IOS-155790)を受けました。資金提供者は、研究デザイン、データ収集と分析、出版の決定、または原稿の準備において何の役割も持っていませんでした。

1. SG虚環腫瘍の作製
<ol><li>成虫のハエを UAS-NICD (オス:10-15匹のハエ)と Act-Gal4、UAS-GFP/CyO;tub-Gal80ts (処女メス:10-15匹のハエ)の遺伝子型と交配し、18°Cで1日間繁殖させる。 選択された成虫のハエは、高い繁殖力を確保するために5〜9日齢でなければなりません。</li>
	<li>成虫のハエがバイアルに含まれるハエの餌に18°Cで24時間卵を産むのを許し、成虫のハエを取り除きます?...

<ol>
	<li>Rossi, F., Gonzalez, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Studying+tumor+growth+in+Drosophila+using+the+tissue+allograft+method.">Studying tumor growth in Drosophila using the tissue allograft method.</a> Nature Protocols. 10 (10), 1525-1534 (2015).</li><li>Magadi, S. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissecting+Hes-centred+transcriptional+networks+in+neural+stem+cell+maintenance+and+tumorigenesis+in+Drosophilia.">Dissecting Hes-centred transcriptional networks in neural stem cell maintenance and tumorigenesis in Drosophilia.</a> Development. 147 (22), (2020).</li><li>Haller, S., Limmer, S., Ferrandon, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Pseudomonas Methods and Protocols. , 723-740 (2014).</li><li>Letini&#263;, B., Kemp, A., Christian, R., Koekemoer, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Inoculation+protocol+for+the+African+malaria+vector,+Anopheles+arabiensis,+by+means+of+nano-injection.">Inoculation protocol for the African malaria vector, Anopheles arabiensis, by means of nano-injection.</a> African Entomology. 26 (2), 422-428 (2018).</li><li>Mejia, M., Heghinian, M. D., Busch, A., Mar&#237;, F., Godenschwege, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Paired+nanoinjection+and+electrophysiology+assay+to+screen+for+bioactivity+of+compounds+using+the+Drosophila+melanogaster+giant+fiber+system.">Paired nanoinjection and electrophysiology assay to screen for bioactivity of compounds using the Drosophila melanogaster giant fiber system.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. (62), e3597 (2012).</li><li>Miles, W. O., Dyson, N. J., Walker, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modeling+tumor+invasion+and+metastasis+in+Drosophila.">Modeling tumor invasion and metastasis in Drosophila.</a> Disease Models &amp; Mechanisms. 4 (6), 753 (2011).</li><li>Yang, S. A., Portilla, J. M., Mihailovic, S., Huang, Y. C., Deng, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Oncogenic+notch+triggers+neoplastic+tumorigenesis+in+a+transition-zone-like+tissue+microenvironment.">Oncogenic notch triggers neoplastic tumorigenesis in a transition-zone-like tissue microenvironment.</a> Developmental Cell. 49 (3), 461-472 (2019).</li><li>Bloomington Drosophila Stock Center. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> BDSC Cornmeal Food. , (2020).</li><li>Garelli, A., Gontijo, A. M., Miguela, V., Caparros, E., Dominguez, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaginal+discs+secrete+insulin-like+peptide+8+to+mediate+plasticity+of+growth+and+maturation.">Imaginal discs secrete insulin-like peptide 8 to mediate plasticity of growth and maturation.</a> Science. 336 (6081), 579-582 (2012).</li><li>Kennison, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissection+of+larval+salivary+glands+and+polytene+chromosome+preparation.">Dissection of larval salivary glands and polytene chromosome preparation.</a> CSH Protocols. 2008, (2008).</li><li>Ji, H., Han, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=LarvaSPA,+a+method+for+mounting+drosophila+larva+for+long-term+time-lapse+imaging.">LarvaSPA, a method for mounting drosophila larva for long-term time-lapse imaging.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. (156), (2020).</li><li>Mirzoyan, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Drosophila+melanogaster:+a+model+organism+to+study+cancer.">Drosophila melanogaster: a model organism to study cancer.</a> Frontiers in Genetics. 10, 51 (2019).</li><li>Bangi, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Drosophila+at+the+intersection+of+infection,+inflammation,+and+cancer.">Drosophila at the intersection of infection, inflammation, and cancer.</a> Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 3, 103 (2013).</li><li>Saavedra, P., Perrimon, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Drosophila+as+a+model+for+tumor-induced+organ+wasting.">Drosophila as a model for tumor-induced organ wasting.</a> Advances in Experimental Medicine and Biology. 1167, 191-205 (2019).</li><li>Figueroa-Clarevega, A., Bilder, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Malignant+drosophila+tumors+interrupt+insulin+signaling+to+induce+cachexia-like+wasting.">Malignant drosophila tumors interrupt insulin signaling to induce cachexia-like wasting.</a> Developmental Cell. 33 (1), 47-55 (2015).</li><li>Koyama, L. A. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bellymount+enables+longitudinal,+intravital+imaging+of+abdominal+organs+and+the+gut+microbiota+in+adult+Drosophila.">Bellymount enables longitudinal, intravital imaging of abdominal organs and the gut microbiota in adult Drosophila.</a> PLOS Biology. 18 (1), 3000567 (2020).</li></ol>

腫瘍他家移植は、ショウジョウバエの腫瘍の成長と進行の間に生じる特定の問題に研究者が対処するのに役立ちます。そのような課題の1つは、原発性腫瘍培養中の担癌幼虫または成虫の早期死亡の回避である12。この文脈において、腫瘍同種移植を継続することは、腫瘍が無期限に成長することを可能にし、腫瘍の成長、転移、および進化の縦断的研究を容易にする?...

このプロトコルは、自動ナノリットル注入装置(例えば、Nanoject)を用いて、 ショウジョウバエ 幼虫唾液腺(SG)想像上の環腫瘍を成体宿主の腹部に同種移植するための段階的なガイダンスを提供する。このプロトコルはまた、腫瘍を新世代の成体宿主に再同種移植するための指示も提供し、腫瘍の進化や腫瘍と宿主の相互作用などの腫瘍特性の継続的な縦断的研究の機会を提供する。このプロトコールは、薬物スクリーニング実験にも適用することができる。
この方法は、 ショウジョウバエ に腫瘍他家移植を行う有効性を改善するために開発されたもので、吸引力と注射力に一貫性がないことが多い手動注射器1を使用して、腫瘍同種移植の最適でない結果をもたらす。オートインジェクター装置は、より良い制御を提供し、同種移植後のハエ死亡率の低下をもたらし得る。訓練を受けたオペレータは、手動注射器を使用した場合の約80%と比較して、オートインジェクターで90%以上の宿主生存率を達成することができた1。全体的な腫瘍獲得率は、同種移植後8〜12日目に60%〜80%である。平均噴射時間も、手動インジェクタを使用した1フライあたり30〜40秒から、オートインジェクターを使用した1フライあたり20〜25秒に改善されました。
このプロトコルは、 ショウジョウバエ 腫瘍同種移植において自己注射器装置を使用する最初のいくつかのプロトコルの1つである。最近の研究では、腫瘍性神経幹細胞の他家移植にも自己注射器が使用されました2。以前は、 ショウジョウバエ で自己注射器装置を使用して、細菌病原性3、寄生虫感染および宿主防御4を研究し、ならびに異なる化合物5の生理活性をスクリーニングした。当社のプロトコルは、腫瘍注射用に自己注射装置を適応させ、 ショウジョウバエ の研究者に、かなりの時間を節約しながら、より高品質でより一貫した結果を提供することを目指しています。このプロトコルは、腫瘍の他家移植に使用することができるだけでなく、同様の口径6の野生型および変異組織の同種移植にも合わせることができる。
このプロトコールで使用された ショウジョウバエ NICD腫瘍は、Yangら7 によってSG虚環移行帯、すなわち高レベルの内因性ヤヌスキナーゼ/シグナルトランスデューサーおよび転写活性化因子(JAK-STAT)、およびc-Jun N末端キナーゼ(JNK)活性を示す「腫瘍ホットスポット」に最初に導入された。さらに、遷移帯は高レベルのマトリックスメタロプロテイナーゼ-1(MMP1)7を有し、この領域を特に腫瘍形成に資する。NICD過剰発現のみによるノッチ経路活性化は、腫瘍形成を一貫して開始するのに十分である。これらの腫瘍は、その後、腫瘍細胞分裂、浸潤、および腫瘍-宿主相互作用を含む幅広いトピックの調査を可能にするために、同種移植することができる。

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Confocal Laser Scanning Microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td>LSM 980</td>
			<td>Also known as &#34;Zeiss LSM 980&#34;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cornmeal Fly Food</td>
			<td>Bloomington Drosophila Stock Center</td>
			<td>N/A</td>
			<td>Also known as &#34;BDSC Standard Cornmeal Food&#34;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dissection Needle (30Gx1/2)</td>
			<td>BD PrecisionGlide</td>
			<td>305106</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dissection Plate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>12-565B</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fly Tape</td>
			<td>Fisherbrand</td>
			<td>159015A</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fluoresence Adapter for Stero Microscope</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>SFA-UV</td>
			<td>Also known as &#34;NightSea Fluorescence Adapter&#34;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fluoresence Microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td>495015-0001-000</td>
			<td>Also known as &#34;Zeiss Stereo Discovery.V8&#34;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Forceps</td>
			<td>Fine Science Tools</td>
			<td>11251-10</td>
			<td>Also known as &#34;Dumont #5 Forceps&#34;&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glass Capillary (3.5&#39;&#39;)</td>
			<td>Drummond</td>
			<td>3-000-203-G/X</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glue</td>
			<td>Elmer</td>
			<td>E305</td>
			<td>Also known as &#34;Elmer Washabale Clear Glue&#34;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Light Microscope</td>
			<td>Zeiss</td>
			<td>435063-9010-100</td>
			<td>Also known as &#34;Zeiss Stemi 305&#34;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Micropipette Puller</td>
			<td>World Precision Instruments</td>
			<td>PUL-1000</td>
			<td>Also known as &#34;Four Step Micropipette Puller&#34;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nanoject Apparatus</td>
			<td>Drummond</td>
			<td>3-000-204</td>
			<td>Also known as &#34;Nanoject II Auto-Nanoliter Injector&#34;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Schneider&#39;s Medium</td>
			<td>ThermoFisher</td>
			<td>21720001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Syringe (27G x1/2)</td>
			<td>BD PrecisionGlide</td>
			<td>305109</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vial</td>
			<td>Fisherbrand</td>
			<td>AS507</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

tumor allotransplantation in drosophila melanogaster with a programmable auto-nanoliter injector

このプロトコルは、自動ナノリットル注射装置を用いたショウ ジョウバエメラノガスター における腫瘍の他家移植を記載している。 オートインジェクター装置を使用することにより、訓練を受けたオペレータは、手動インジェクターを使用して得られたものと比較して、より効率的で一貫した移植結果を達成することができる。ここでは、 ショウジョウバエ の系統の交差から、原発腫瘍の誘導と解剖、原発腫瘍の新しい成人宿主への移植、および拡張研究のための腫瘍の世代移植の継続まで、時系列的にトピックをカバーします。実証として、ここではNotch細胞内ドメイン(NICD)過剰発現誘導唾液腺虚環腫瘍を世代移植に用いた。これらの腫瘍は、まず幼虫唾液腺虚環内の遷移帯微小環境で確実に誘導され、次いでインビボで同種移植および培養され、継続的な腫瘍成長、進化、および転移を研究することができる。この他家移植法は、潜在的な薬物スクリーニングプログラム、ならびに腫瘍 - 宿主相互作用の研究に有用であり得る。

ここでは、ナノリットル注射オートインジェクター装置を用いてSG想像環腫瘍の世代的他家移植を行い、その後、共焦点レーザー走査顕微鏡による腫瘍ライブイメージングを実施し、腫瘍増殖、腫瘍細胞移動、腫瘍-宿主相互作用のトピックをより深く掘り下げることができました。ハエを装着するときは、顕微鏡スライドに接着し、ポリジメチルシロキサン(PDMS)ブロック11?...

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Tumor Allotransplantation in Drosophila melanogaster with a Programmable Auto-Nanoliter Injector

このプロトコルは、新生物形成の様々な側面を研究するための成体宿主の腹部への ショウジョウバエ 腫瘍の初期および継続的な世代間他家移植のための詳細なガイダンスを提供する。オートインジェクター装置を使用すると、研究者は従来の手動の方法によって達成されたものと比較して、効率と腫瘍収量を改善することができます。

ショウジョウバエメラノガスターにおけるプログラム可能な自動ナノリットル注射器による腫瘍他家移植

This protocol describes the allotransplantation of tumors in Drosophila melanogaster using an auto-nanoliter injection apparatus. With the use of an ...

このプロトコルは、ショウジョウバエ腫瘍同種移植における自己注射器装置の使用を記載する最初のものの一つである。近年人気が高まっているトピック。この方法の主な利点は、腫瘍他家移植の速度、一貫性および収量を改善することによってショウジョウバエにおける癌研究の効率を高めることである。ショウジョウバエの腫瘍他家移植は、習得するのが難しい繊細な技術です。忍耐強く、練習が完璧になると信じてください。ハエを交配し、卵を摂氏18度で6日間孵化させた後、孵化した幼虫を含むバイアルを摂氏29度に設定したインキュベーターに移す。麻酔をかけられた野生型または突然変異型の成虫のハエを性別に基づいてソートする。長さ 5 cm のフライ テープを顕微鏡スライドに固定し、粘着性のある面を上にします。鉗子で翼をテープに接着してハエを固定する。コントローラーボックスとオートインジェクターを光学顕微鏡の反対側に置きます。ガラスキャピラリーの一端を4段階のマイクロピペットプーラーを用いて処理し、それを狭い閉じた端に加熱する。鉗子を使用してキャピラリーを約60度の角度でクリップし、3.5インチのガラスキャピラリーを準備します。インジェクタのキャップを軽く緩めます。空のボタンを押したままにして、全長の70〜80%が表示されるまでインジェクター針を進めます。シリンジを使用して、ガラスキャピラリーを鉱物油で満たします。幼虫の1つを選択し、100マイクロリットルのシュナイダー培地で満たされた解剖プレートに移して、SG想像上のリング腫瘍解剖に備えます。1対の鉗子を使用して幼虫体の中央部を保持し、別の一対の鉗子を使用して幼虫の頭をつまみ、縦方向に伸張力を加える。幼虫のY字型SGを見つけて単離し、次いで隣接する組織を除去することによってSG想像上の環腫瘍を解剖する。充填ボタンを押したまま、シュナイダーのミディアムでガラスキャピラリーを上部の0.5センチメートルセグメントまで満たします。原発腫瘍を見つけ、腫瘍が毛細血管に吸引されるまで充填ボタンを押します。腫瘍が毛細血管の先端または毛細血管の先端から数ミリメートル離れていることを確認してください。テープに固定されている成体のハエを見つけます。次に、鉗子を使用して下腹部を静かに押さえ、毛細血管で腹部の下側キューティクルを突き刺します。腫瘍が新しい宿主の腹部に入るまで空のボタンを押します。鉗子を使用して、ホストの翼をそっとつまんでテープから取り外します。それからそれを新鮮な食物と一緒に新しいバイアルに入れます。アログラフ撮影後10〜14日頃に蛍光顕微鏡を用いて宿主腹部に増殖した腫瘍をスクリーニングし、2対の鉗子を用いて宿主から増殖した同種移植腫瘍を解剖した。1対の鉗子を使用して腹部を押さえ、もう1対を使用して腹部キューティクルを切り開き、同種移植腫瘍を露出させます。付着した宿主組織から腫瘍を慎重に単離する。滅菌針を使用し、腫瘍を毛細血管のサイズに適した小さな断片に解剖します。腫瘍の他家移植を完了するために、新世代の成体宿主に対してこのプロセスを繰り返します。腫瘍発生の過程は、他家移植後10日目に成人宿主腹部に生育する第1世代SG想像環腫瘍のライブイメージングによって追跡した。10日目に宿主腹部の大部分を占める第6世代SG虚環腫瘍を、他家移植後がここに示されている。この段階でのイメージングは、腫瘍の成長パターン、ならびに腫瘍の遊走および浸潤挙動を明らかにするのに役立つ可能性がある。腫瘍移植は、腫瘍の進行、進化および転移のための縦断的研究のための素晴らしい技術である。非常に重要な結果, 腫瘍宿主の相互作用を研究するために.このプロトは、テモダルという薬剤を使用した抗がん剤スクリーニングにおいて大きな可能性を秘めています。この手法を使用すると、研究者は調査の時間と労力を大幅に節約できます。

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Tumor Allotransplantation in Drosophila melanogaster with a Programmable Auto-Nanoliter Injector

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ザ<em&gt;ショウジョウバエ</em&gt;成虫盤腫瘍モデル：遺伝的モザイクを用いた遺伝子発現と腫瘍侵襲性の可視化と定量化

Drosophila melanogaster has emerged as a powerful experimental system for functional and mechanistic studies of tumor development and progression in the ...

Labeling of Breast Cancer Patient-derived Xenografts with Traceable Reporters for Tumor Growth and Metastasis Studies

腫瘍の増殖と転移研究のためのトレーサブル記者との乳癌患者由来の異種移植片の標識

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A Murine Orthotopic Bladder Tumor Model and Tumor Detection System

マウス同所性膀胱腫瘍モデルおよび腫瘍検出システム

This protocol describes the generation of bladder tumors in female C57BL/6J mice using the murine bladder cancer cell line MB49, which has been modified ...

Tumor Engraftment in a Xenograft Mouse Model of Human Mantle Cell Lymphoma

人間マントル細胞リンパ腫の異種移植マウス モデルにおける腫瘍生着

B lymphocytes are key players in immune cell circulation and they mainly home to and reside in lymphoid organs. While normal B cells only proliferate when ...

In Vivo EPR Assessment of pH, pO2, Redox Status, and Concentrations of Phosphate and Glutathione in the Tumor Microenvironment

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生体内でPH、 pO2、酸化還元状態とリン酸濃度および腫瘍微小環境におけるグルタチオンの EPR 評価

This protocol demonstrates the capability of low-field electron paramagnetic resonance (EPR)-based techniques in combination with functional paramagnetic ...

Digital Polymerase Chain Reaction Assay for the Genetic Variation in a Sporadic Familial Adenomatous Polyposis Patient Using the Chip-in-a-tube Format

チップ チューブ形式を使用して散発的な家族性大腸腺腫症患者の遺伝的変異のデジタル ポリメラーゼ連鎖反応分析

The quantitative analysis of human genetic variation is crucial for understanding the molecular characteristics of serious medical conditions, such as ...

In Vivo Inhibition of MicroRNA to Decrease Tumor Growth in Mice

マウスの腫瘍増殖を減少させるマイクロRNAの生体内阻害

MicroRNAs (miRNAs) are important regulators of gene expression through their ability to destabilize mRNA and inhibit translation of target mRNAs. An ...

Predicting In Vivo Payloads Delivery using a Blood-brain Tumor-barrier in a Dish

皿に血液脳腫瘍-障壁を使用して生体ペイロード配信で予測

Highly selective by nature, the blood-brain barrier (BBB) is essential for the brain homeostasis in physiological conditions. However, in the context of ...

In Vitro Assay to Study Tumor-macrophage Interaction

腫瘍マクロファージ相互作用を研究するインビトロアッセイ

Tumor associated macrophages (TAMs) account for a large percentage of cells in the tumor mass for different types of cancers. Glioblastoma (GBM), a ...

Analyzing Tumor Gene Expression Factors with the CorExplorer Web Portal

CorExplorer Web ポータルを用した腫瘍遺伝子発現因子の解析

Differential gene expression analysis is an important technique for understanding disease states. The machine learning algorithm CorEx has shown utility ...