Name: a rapid screening workflow to identify potential combination therapy for gbm using patient-derived glioma stem cells
Uploaded: 2021-03-28T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about A Rapid Screening Workflow to Identify Potential Combination Therapy for GBM using Patient-Derived Glioma Stem Cells at JoVE.com

Wir danken der National Natural Science Foundation of China (81672962), der Jiangsu Provincial Innovation Team Program Foundation und der Joint Key Project Foundation der Southeast University und der Nanjing Medical University für ihre Unterstützung.

Die GBM-Probe wurde von einem Patienten während einer Routineoperation erworben, nachdem die Ethikkommission für humane Forschung des ersten angeschlossenen Krankenhauses der Nanjing Medical University die Zustimmung vollständig informiert erhalten hatte.
1. Isolierung und Kultur von patientenbasierten GSCs
<ol><li>Legen Sie frisches chirurgisch reseziertes Glioblastomgewebe in ein 15 ml Zentrifugenröhrchen, das mit sterilem PBS gefüllt ist, und lagern Sie das Gewebe bis zur weiteren Op...

<ol>
	<li>Lathia, J. D., Mack, S. C., Mulkearns-Hubert, E. E., Valentim, C. L., Rich, J. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cancer+stem+cells+in+glioblastoma.">Cancer stem cells in glioblastoma.</a> Genes &amp; Development. 29 (12), 1203-1217 (2015).</li><li>Binello, E., Germano, I. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Targeting+glioma+stem+cells:+a+novel+framework+for+brain+tumors.">Targeting glioma stem cells: a novel framework for brain tumors.</a> Cancer Science. 102 (11), 1958-1966 (2011).</li><li>Mathews Griner, L. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+combinatorial+screening+identifies+drugs+that+cooperate+with+ibrutinib+to+kill+activated+B-cell-like+diffuse+large+B-cell+lymphoma+cells.">High-throughput combinatorial screening identifies drugs that cooperate with ibrutinib to kill activated B-cell-like diffuse large B-cell lymphoma cells.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111 (6), 2349-2354 (2014).</li><li>Di Veroli, G. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Combenefit:+an+interactive+platform+for+the+analysis+and+visualization+of+drug+combinations.">Combenefit: an interactive platform for the analysis and visualization of drug combinations.</a> Bioinformatics. 32 (18), 2866-2868 (2016).</li><li>Shi, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ibrutinib+inactivates+BMX-STAT3+in+glioma+stem+cells+to+impair+malignant+growth+and+radioresistance.">Ibrutinib inactivates BMX-STAT3 in glioma stem cells to impair malignant growth and radioresistance.</a> Science Translational Medicine. 10 (443), 1-13 (2018).</li><li>Tan, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systematic+identification+of+synergistic+drug+pairs+targeting+HIV.">Systematic identification of synergistic drug pairs targeting HIV.</a> Nature Biotechnology. 30 (11), 1125-1130 (2012).</li><li>Jansen, V. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Kinome-wide+RNA+interference+screen+reveals+a+role+for+PDK1+in+acquired+resistance+to+CDK4/6+inhibition+in+ER-positive+breast+cancer.">Kinome-wide RNA interference screen reveals a role for PDK1 in acquired resistance to CDK4/6 inhibition in ER-positive breast cancer.</a> Cancer Research. 77 (9), 2488-2499 (2017).</li><li>Malyutina, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Drug+combination+sensitivity+scoring+facilitates+the+discovery+of+synergistic+and+efficacious+drug+combinations+in+cancer.">Drug combination sensitivity scoring facilitates the discovery of synergistic and efficacious drug combinations in cancer.</a> PLoS Computational Biology. 15 (5), 1006752 (2019).</li><li>He, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Methods+for+High-throughput+drug+combination+screening+and+synergy+scoring.">Methods for High-throughput drug combination screening and synergy scoring.</a> Cancer Systems Biology. 1711, 351-398 (2018).</li><li>Chen, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Targeting+the+synthetic+vulnerability+of+PTEN-deficient+glioblastoma+cells+with+MCL1+inhibitors.">Targeting the synthetic vulnerability of PTEN-deficient glioblastoma cells with MCL1 inhibitors.</a> Molecular Cancer Therapeutics. 19 (10), 2001-2011 (2020).</li></ol>

In der vorliegenden Studie wurde ein Protokoll beschrieben, das angewendet werden kann, um eine mögliche Kombinationstherapie für GBM mit patientenbasierten GSCs zu identifizieren. Im Gegensatz zum Standard-Synergie-/Additivitätsmetrikmodell wie Loewe-, BLISS- oder HSA-Methoden wurde ein einfacher und schneller Workflow verwendet, bei dem kein Arzneimittelpaar bei mehreren Konzentrationen in einer vollständig faktoriellen Weise wie bei den traditionellen Methoden kombiniert werden muss. In diesem Workflow wurde SI (S...

Das Glioblastom (GBM) ist die häufigste und aggressivste Art von primärem Hirntumor. Derzeit ist das Gesamtüberleben von GBM-Patienten, die eine maximale Behandlung (eine Kombination aus Operation, Chemotherapie und Strahlentherapie) erhalten haben, immer noch kürzer als 15 Monate; daher sind neuartige und wirksame Therapien für GBM dringend erforderlich.
Das Vorhandensein von Gliomstammzellen (GSCs) in GBM stellt eine erhebliche Herausforderung für die konventionelle Behandlung dar, da diese stammähnlichen Zellen eine Schlüsselrolle bei der Aufrechterhaltung der Tumormikroumgebung, der Arzneimittelresistenz und des Tumorrezidials spielen1. Daher könnte die Ausrichtung auf GSCs eine vielversprechende Strategie für die GBM-Behandlungsein 2. Ein großer Nachteil für die Wirksamkeit des Medikaments bei GBM ist jedoch seine heterogene Natur, einschließlich, aber nicht beschränkt auf den Unterschied in genetischen Mutationen, gemischten Subtypen, epigenetischer Regulation und Tumormikroumgebung, was sie für die Behandlung sehr refraktär macht. Nach vielen gescheiterten klinischen Studien erkannten Wissenschaftler und klinische Forscher, dass eine zielgerichtete Einzelwirkstofftherapie wahrscheinlich nicht in der Lage ist, das Fortschreiten von hochgradig heterogenen Krebsarten wie GBM vollständig zu kontrollieren. Während sorgfältig ausgewählte Arzneimittelkombinationen für ihre Wirksamkeit zugelassen wurden, indem sie synergistisch die Wirkung voneinander verstärken und somit eine vielversprechende Lösung für die GBM-Behandlung bieten.
Obwohl es viele Möglichkeiten gibt, die Arzneimittel-Arzneimittel-Wechselwirkungen einer Arzneimittelkombination zu bewerten, wie z. B. CI (Combination Index), HSA (Highest Single Agent) und Bliss-Werte usw.3,4, basieren diese Berechnungsmethoden in der Regel auf mehreren Konzentrationskombinationen. In der Tat können diese Methoden eine positive Bewertung der Wechselwirkung zwischen Arzneimitteln ermöglichen, können jedoch sehr mühsam sein, wenn sie im Hochdurchsatz-Screening angewendet werden. Um den Prozess zu vereinfachen, wurde ein Screening-Workflow zur schnellen Identifizierung der potenziellen Arzneimittelkombinationen, die das Wachstum von GSCs hemmen, aus chirurgischen Biopsien von Patienten-GBM entwickelt. Ein Sensitivitätsindex (SI), der die Differenz zwischen der erwarteten kombinierten Wirkung und der beobachteten kombinierten Wirkung widerspiegelt, wurde in diese Methode eingeführt, um die synergisierende Wirkung jedes Arzneimittels zu quantifizieren, so dass die potenziellen Kandidaten leicht durch das SI-Ranking identifiziert werden können. In der Zwischenzeit zeigt dieses Protokoll ein Beispiel-Screening, um die potenziellen Kandidaten zu identifizieren, die den Anti-Gliom-Effekt mit Temozolomid, der Erstlinien-Chemotherapie für die GBM-Behandlung, unter 20 kleinen molekularen Inhibitoren synergisieren können.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>B-27</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>17504-044</td>
			<td>50X</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EGF</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>PHG0313</td>
			<td>20 ng/ml</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FGF</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>PHG0263</td>
			<td>20 ng/ml</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gluta Max</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>35050061</td>
			<td>100X</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Neurobasal</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>21103049</td>
			<td>1X</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Penicillin-Streptomycin</td>
			<td>HyClone</td>
			<td>SV30010</td>
			<td>P: 10,000 units/ml&#160;&#160;&#160;&#160; S:&#160; 10,000 ug/ml</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Pyruvate</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>2088876</td>
			<td>100 mM</td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Table 1. The&#160;formulation&#160;of GSC&#160;complete culture medium.&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ABT-737</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Selective and BH3 mimetic&#160;Bcl-2,&#160;Bcl-xL&#160;and&#160;Bcl-w&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Adavosertib (MK-1775)</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Wee1&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Axitinib</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Multi-targeted tyrosine kinase inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AZD5991</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Mcl-1&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>A 83-01</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Potent inhibitor of TGF-&#946; type I receptor&#160;ALK5 kinase</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CGP57380</td>
			<td>Selleck</td>
			<td></td>
			<td>Potent&#160;MNK1&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dactolisib (BEZ235)</td>
			<td>Selleck</td>
			<td></td>
			<td>Dual ATP-competitive&#160;PI3K&#160;and&#160;mTOR&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dasatinib</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Dual&#160;Bcr-Abl and Src family tyrosine kinase&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Erlotinib</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>EGFR&#160;tyrosine kinase inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gefitinib</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>EGFR tyrosine kinase&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Linifanib</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Multi-target inhibitor of&#160;VEGFR&#160;and&#160;PDGFR&#160;family</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Masitinib</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Inhibitor of&#160;c-Kit</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ML141</td>
			<td>Selleck</td>
			<td></td>
			<td>Non-competitive inhibitor of&#160;Cdc42 GTPase&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>OSI-930</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Multi-target inhibitor of Kit, KDR and CSF-1R&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Palbociclib</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Selective&#160;CDK4&#160;and&#160;CDK6&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SB 202190</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Selective&#160;p38 MAP kinase&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sepantronium bromide (YM-155)</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Survivin&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TCS 359</td>
			<td>Selleck</td>
			<td></td>
			<td>Potent FLT3 inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UMI-77</td>
			<td>MCE</td>
			<td></td>
			<td>Selective&#160;Mcl-1&#160;inhibitor</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>4-Hydroxytamoxifen(Afimoxifene)</td>
			<td>Selleck</td>
			<td></td>
			<td>Selective&#160;estrogen receptor (ER)&#160;modulator</td>
		</tr>
		<tr>
			<td colspan="4">Table 2. The information of 20 targeted agents used in the test screen. All of these are target selective small molecular inhibitors. The provider, name, and targets were given in the table.</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

a rapid screening workflow to identify potential combination therapy for gbm using patient-derived glioma stem cells

Die Gliomstammzellen (GSCs) sind ein kleiner Teil der Krebszellen, die eine wesentliche Rolle bei der Tumorinitiierung, Angiogenese und Arzneimittelresistenz beim Glioblastom (GBM), dem häufigsten und verheerendsten primären Hirntumor, spielen. Das Vorhandensein von GSCs macht das GBM sehr refraktär gegenüber den meisten einzelnen Zielerregern, so dass Hochdurchsatz-Screening-Methoden erforderlich sind, um potenziell wirksame Kombinationstherapeutika zu identifizieren. Das Protokoll beschreibt einen einfachen Workflow, um ein schnelles Screening auf eine mögliche Kombinationstherapie mit synergistischer Interaktion zu ermöglichen. Die allgemeinen Schritte dieses Workflows bestehen aus der Einrichtung von Mit Luciferase markierten GSCs, der Vorbereitung von matrigelbeschichteten Platten, dem Kombinations-Drug-Screening, der Analyse und Validierung der Ergebnisse.

Die XG387-Zellen bildeten Neurosphären in dem in Tabelle 1 beschriebenen Kulturmedium in einer ultra-low attachment 6-Well-Kulturplatte oder einer nicht beschichteten Platte5 (Abbildung 1A). Zunächst wurde ein Test durchgeführt, um zu überprüfen, ob die Biolumineszenzintensität von XG387-Luc-Zellen proportional zur Zellzahl war. Wie in Abbildung 1Bgezeigt, nahm die Biolumineszenzintensität proportional zur Zelldich...

Watch this Scientific Journal Video about A Rapid Screening Workflow to Identify Potential Combination Therapy for GBM using Patient-Derived Glioma Stem Cells at JoVE.com

A Rapid Screening Workflow to Identify Potential Combination Therapy for GBM using Patient-Derived Glioma Stem Cells

Ein schneller Screening-Workflow zur Identifizierung einer potenziellen Kombinationstherapie für GBM unter Verwendung von vom Patienten abgeleiteten Gliomstammzellen

The glioma stem cells (GSCs) are a small fraction of cancer cells which play essential roles in tumor initiation, angiogenesis, and drug resistance in ...

Gliomstammzellen sind Subpopulationen von Zellen im Gliom, die in der Regel resistent gegen Chemo- und Strahlentherapie sind. Hier haben wir die Methode zur schnellen Identifizierung von Kombinationstherapien beschrieben, die auf Gliomstammzellen anstelle von differenzierten Gliomzellen abzielen. Im Vergleich zu anderen Methoden, die mühsam und kompliziert sein können.Dieses Protokoll ist relativ einfach und schnell, um potenzielle nützliche Arzneimittelkombinationen zu identifizieren. Beginnen Sie, indem Sie die Gliomstammzellen oder GSCs aus dem Kulturmedium sammeln und sie bei 70 mal G für drei Minuten bei Raumtemperatur zentrifugieren. Nachdem Sie den Überstand entfernt haben, verdauen Sie die Zellen mit Accutase für vier Minuten bei 37 Grad Celsius.Pipetten Sie die Zellen mit einer 200-Mikroliter-Spitze wiederholt, um sich zu dissoziieren, und regenerieren Sie das Zellpellet. Fügen Sie die GSCs mit einer Dichte von 200.000 Zellen in einem Milliliter Kulturmedium in jede Vertiefung einer 12-Well-Kulturplatte hinzu und inkubieren Sie sie über Nacht. Oh am nächsten Tag, fügen Sie 30 Mikroliter Luciferase-eGFP-Virusüberstand in jede Vertiefung der Platte hinzu.Zentrifugieren Sie die Zellen bei 1000 mal G für zwei Stunden, bei 25 Grad Celsius und inkubieren Sie sie über Nacht. Ersetzen Sie am nächsten Tag das Medium in den Vertiefungen, indem Sie die GSCs sammeln, zentrifugieren, den Überstand entfernen, sie in frischem Medium wieder auffüllen und neu plattieren. Kulturieren Sie die Zellen für weitere 48 Stunden.Beobachten Sie die Platte unter einem Fluoreszenzmikroskop und bestätigen Sie das Auftreten von GFP-positiven Zellen. Sortieren und sammeln Sie die GSCs mit hoher Fluoreszenz mit einem Flusszellensortierer und kulturieren Sie sie weiter. 96 gut optische Bodenplatten mit einer extrazellulären Matrixmischung wie Matrigel beschichten und eine Stunde lang bei 37 Grad Celsius inkubieren.Entfernen Sie die überschüssige Mischung und spülen Sie die Platten vorsichtig einmal mit PBS aus, dann säen Sie XG387-Luc-Zellen mit einer Dichte von 1000 Zellen in 100 Mikrolitern Kulturmedium und zu jeder Vertiefung der beschichteten Platten und kultivieren Sie sie über Nacht. Beobachten Sie am nächsten Tag die Zellen unter einem Mikroskop, um ihre Befestigung an der Platte zu bestätigen. Als nächstes bereiten Sie eine 200-mikromolare Temozolomid-Lösung und zwei mikromolare Lösungen der Zielmittel in Kulturmedium vor.Für das Kombinations-Arzneimittel-Screening entfernen Sie das leere Medium und fügen Sie das Medium, das entweder 200 mikromolaren Temozolomid oder zwei mikromolaren Zielmittel oder eine Kombination aus beiden enthält, in jede Vertiefung für drei technische Replikate pro Behandlung hinzu. Inkubieren Sie die Platte bei 37 Grad Celsius und 5% Kohlendioxid für drei Tage. Nehmen Sie Bilder der zellulären Biolumineszenz in der Platte mit dem IVIS-Spektrum-Bildgebungssystem auf.Erstellen Sie mit der integrierten Software mehrere kreisförmige Bereiche der interessierenden Region und quantifizieren Sie die zelluläre Biolumineszenz. Um potenzielle Kandidaten zu identifizieren, die die Antiglioblastom-Wirkung von Temozolomid verstärken könnten, wurden 20 zielselektive niedermolekulare Inhibitoren durch Arzneimittelkombinationsscreening analysiert. Die empfindlichen Indexwerte von 13 Zielerregern lagen über Null und fünf von ihnen über 0,1.Der empfindliche Index der beiden Top-Kandidaten UMI-77 und A 83-01 lag über 0,25, was auf ihr Potenzial zur Synergie mit Temozolomid hindeutet. Die kombinierte Behandlung von Temozolomid und UMI-77 wurde mit einem antiproliferativen Assay in einer Titrationsmatrix mit sechs mal sechs Dosen bewertet. Die Kombinationsindexwerte lagen unter eins.Und die hohen Einzelmittelwerte waren für die meisten Kombinationen von Temozolomid und UMI-77 in unterschiedlichen Konzentrationen größer als Null. Dies deutet auf eine synergistische Gesamtinteraktion von Temozolomid und UMI-77 in XG387- und XG328-GSCs hin. Dieses Protokoll kann auch bei der Suche nach einer Arzneimittelkombination mit adhärenten Krebszellen angewendet werden, indem einfach der Plattenbeschichtungsschritt entfernt wird.

Research

JoVE Journal

Cancer Research

A Protocol for Rapid Post-mortem Cell Culture of Diffuse Intrinsic Pontine Glioma (DIPG)

A Protocol for Rapid Post-mortem Cell Culture of Diffuse Intrinsic Pontine Glioma DIPG

Ein Protokoll für schnelle Post-mortem-Zellkultur von Diffuse Intrinsic Ponsgliom (DIPG)

Diffuse Intrinsic Pontine Glioma (DIPG) is a childhood brainstem tumor that carries a universally fatal prognosis. Because surgical resection is not a ...

Forschung

Krebsforschung

Genome-wide RNAi Screening to Identify Host Factors That Modulate Oncolytic Virus Therapy

Genomweiten RNAi-Screening, Host Faktoren zu identifizieren, die onkolytische Viren Therapie zu modulieren

High-throughput genome-wide RNAi (RNA interference) screening technology has been widely used for discovering host factors that impact&#160;virus ...

Modeling Osteosarcoma Using Li-Fraumeni Syndrome Patient-derived Induced Pluripotent Stem Cells

Modellierung von Osteosarkom mit Li-Fraumeni-Syndrom, die Patienten abgeleitet induzierten pluripotenten Stammzellen

Li-Fraumeni syndrome (LFS) is an autosomal dominant hereditary cancer disorder. Patients with LFS are predisposed to a various type of tumors, including ...

A Melanoma Patient-Derived Xenograft Model

Ein melanompatientenabgeleitetes Xenograft-Modell

Accumulating evidence suggests that molecular and biological properties differ in melanoma cells grown in traditional two-dimensional tissue culture ...

Physiologic Patient Derived 3D Spheroids for Anti-neoplastic Drug Screening to Target Cancer Stem Cells

Physiologische Rand-3D-Sphäroide für antineoplastisches Arzneimittel-Screening, um Krebs-Stammzellen gezielt anzusprechen

In this protocol, we outline the procedure for generation of tumor spheroids within 384-well hanging droplets to allow for high-throughput screening of ...

Using Human Induced Pluripotent Stem Cells for the Generation of Tumor Antigen-specific T Cells

Verwendung von humaninduzierten pluripotenten Stammzellen zur Erzeugung von Tumorantigen-spezifischen T-Zellen

The generation and expansion of functional T cells in vitro can lead to a broad range of clinical applications. One such use is for the treatment of ...

A Data Integration Workflow to Identify Drug Combinations Targeting Synthetic Lethal Interactions

Ein Datenintegrations-Workflow zur Identifizierung von Arzneimittelkombinationen, die auf synthetische tödliche Wechselwirkungen abzielen

A synthetic lethal interaction between two genes is given when knock-out of either one of the two genes does not affect cell viability but knock-out of ...

Combined Conditional Knockdown and Adapted Sphere Formation Assay to Study a Stemness-Associated Gene of Patient-derived Gastric Cancer Stem Cells

Cancer stem cells (CSCs) are implicated in tumor initiation, development and recurrence after treatment, and have become the center of attention of many ...

Drug Screening of Primary Patient Derived Tumor Xenografts in Zebrafish

Arzneimittel-Screening von Primärpatienten abgeleitetTumor Xenografts in Zebrafischen

Patient derived xenograft models are critical in defining how different cancers respond to drug treatment in an in vivo system. Mouse models are the ...

Pooled shRNA Library Screening to Identify Factors that Modulate a Drug Resistance Phenotype

Gepooltes shRNA-Bibliotheksscreening zur Identifizierung von Faktoren, die einen Phänotyp der Arzneimittelresistenz modulieren

Understanding clinically relevant driver mechanisms of acquired chemo-resistance is crucial for elucidating ways to circumvent resistance and improve ...