Name: swabbing the urban environment - a pipeline for sampling and detection of sars-cov-2 from environmental reservoirs
Uploaded: 2021-04-09T15:00:00
Duration: 7 min 13 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Swabbing the Urban Environment - A Pipeline for Sampling and Detection of SARS-CoV-2 From Environmental Reservoirs at JoVE.com

हम वायरल सूचना संस्थान (सातवीं) जांचकर्ताओं, डॉ Anca एम Segall, विलो Segall, पेट्रीसिया एल Rohwer, गैरी Rohwer, कैरी एल Rohwer, Magda सिल्विया Pinetta, एलिजाबेथ क्रूज़ कैनो, डॉ ग्रेगरी पीटर्स, डॉ स्टुअर्ट ए सैंडिन, और डॉ जेनिफर स्मिथ को कई नमूने इकट्ठा करने के लिए समय लेने के लिए धन्यवाद देते हैं । हम सकारात्मक नियंत्रण और उपयोगी प्रतिक्रिया को सुविधाजनक बनाने के लिए सैन डिएगो कैलिफोर्निया (UCSD) के स्कूल में बाल रोग विभाग से डॉ रोब नाइट, डॉ जैक गिल्बर्ट, डॉ पेड्रो बाल्डा-फेरे, और डॉ सारा Allard को भी धन्यवाद देते हैं । हम स्टेसी कैरोटा (एसडीएसयू कॉलेज ऑफ साइंसेज) और जीना स्पीडेल (एसडीएसयू) को साजो-सामान के समर्थन और नमूना प्रोटोकॉल के ग्राफिक डिजाइन के लिए जुआन रोड्रिगेज का धन्यवाद करते हैं। हम बहुत मुश्किल समय के दौरान इस परियोजना के प्रति उनकी प्रतिबद्धता और समर्पण के लिए सभी प्रतिभागियों को धन्यवाद देते हैं । इस काम को डॉ जो ऐन लेन (एसडीएसयू कॉलेज ऑफ साइंसेज) और नेशनल साइंस फाउंडेशन रैपिड: सार्स-सीओवी-2 ग्रांट (अवार्ड नंबर: 2030479) के पर्यावरण जलाशयों से उदार दान द्वारा समर्थित किया गया था ।

सभी लेखकों की घोषणा है कि कोई प्रतिस्पर्धी हितों मौजूद हैं ।

सिटीजन साइंटिस्ट एंगेजमेंट। नागरिक वैज्ञानिकों को नमूना और शहरी वातावरण में सार्स-CoV-2 की उपस्थिति का पता लगाने के लिए सैन डिएगो काउंटी भर में सतहों झाड़ू के लिए भर्ती किया गया । वितरित नमूना किट के बहुमत (70%) प्रयोगशाला में वापस आ गए थे, और उन में से, लगभग सभी नमूने पूरे थे (91%) (चित्रा 3A,बी और तालिका 4)। स्वयंसेवक आसानी से वेब आधारित मंच के माध्यम से किट वितरण/पिक का अनुरोध कर सकते हैं, और वितरण मार्ग-योजना सॉफ्टवेयर ने आगमन के अनुमानित समय के नागरिक वैज्ञानिकों को अधिसूचित किया, दोनों ने देखी गई सफलता के लिए संभावित महत्वपूर्ण कारकों को । जब किट नागरिक वैज्ञानिक को दिया गया था जब यह प्रयोगशाला में वापस आ गया था से औसत समय 8 दिन था, 3 दिनों की एक औसत और 1-64 दिनों की एक सीमा के साथ (चित्रा 3A और तालिका 4)। स्वयंसेवकों को अधिक लगातार अनुस्मारक की संभावना इस अंतराल समय को कम करेगा ।
डेटा संग्रह प्लेटफ़ॉर्म का सफलतापूर्वक उपयोग अधिकांश उपयोगकर्ताओं द्वारा किया गया था (73%) (टेबल 4)। हालांकि नागरिक वैज्ञानिकों के प्रयासों को मापा नहीं गया, लेकिन फील्ड परीक्षणों से पता चला कि डेटा संग्रह मंच ने नमूना संग्रह को ठीक से पूरा करने के लिए आवश्यक प्रयास और समय को काफी कम कर दिया । इस प्रकार, बहीखाता की मात्रा को कम करने से नागरिक वैज्ञानिक जुड़ाव को प्रोत्साहित किया गया । वेब-आधारित मंच का उद्देश्य बहुभाषी तंत्रिका मशीन अनुवाद सेवा प्रदान करके और अंग्रेजी और स्पेनिश में ग्राफिक और ऑडियोविजुअल प्रोटोकॉल प्रदान करके जनसांख्यिकीय सीमाओं को दूर करना था। यह केवल आंशिक रूप से सफल रहा क्योंकि दक्षिण खाड़ी और उत्तरी काउंटी दोनों से कम नमूने एकत्र किए गए थे, जहां काउंटी की अधिकांश हिस्पैनिक/लैटिनोआबादी ४५रहती है । इन क्षेत्रों में सैन डिएगो काउंटी में कुल COVID-19 मामलों में 63% (1,700 मामले प्रति 100,000) भी आश्रय दिया गया, जिसमें रोग की उच्चतम व्यापकता46 और अस्पताल में भर्ती (62%)47,48की दर है। हालांकि नमूनों के अधिकांश केंद्रीय काउंटी से आया था, एक प्रतिनिधि संख्या सबसे COVID-19 प्रभावित जिलों से एकत्र किया गया था और नमूनों का केवल एक छोटा सा अंश सकारात्मक था, जो पता चलता है कि सार्स के सतह जलाशयों-CoV-2 शहरी वातावरण में अपेक्षाकृत दुर्लभ हैं ।
नमूना प्रसंस्करण। नमूने झाड़ू एसडीएस के साथ गीला किया गया था, जो अपने लिफाफे को बाधित करके वायरस को निष्क्रिय कर दिया और RNases३२खुलासा करके नग्न आरएनए स्थिर । संग्रह के दौरान सुविधाजनक रूप से, झाड़ू में डिटर्जेंट ने नमूना सतह को साफ किया। पर्यावरण के नमूनों में अक्सर आरएनए की बहुत कम मात्रा होती है। वसूली को अधिकतम करने के लिए, आरएनए अलगाव एक GITC आधारित, कॉलम मुक्त, कच्चे तेल निष्कर्षण विधि का उपयोग कर प्रदर्शन किया गया था । जीआईसीसी, एक मजबूत चैट्रोपिक एजेंट, हाइड्रोजन बांड को बाधित करता है जो प्रोटीन फोल्डिंग (यानी हाइड्रोफोबिक प्रभाव) को बनाए रखता है। इस क्रिया के परिणामस्वरूप वायरल कणों की निष्क्रियता होती है, और आरएनएस34, 35, 36के अवरोध के कारण आरएनए स्थिररहताहै। GITC समाधान सख्त ठंड श्रृंखला विचार है, जो नागरिकों को कमरे के तापमान पर नमूनों को बनाए रखने के लिए अगर प्रदान की बर्फ पैक के लिए एक फ्रीजर उपलब्ध नहीं था बिना आरएनए नमूनों की स्थिरता बनाए रखा । संभावित खतरे को कम करने के लिए यह अभिकर् प बन गया है जब प्रत्यक्ष त्वचा या म्यूकोसल संपर्क होता है, नागरिकों को किट में प्रदान की गई सामग्री सुरक्षा डेटा शीट को शामिल करके इन जोखिमों के बारे में जागरूक किया गया था और ट्यूबों वाले बॉक्स में एक चेतावनी सील रखी गई थी।
क्रूड जीआईसीसी-क्लोरोफॉर्म निष्कर्षण विधि ने झाड़ू से आरएनए के निशान की वसूली में सहायता की, और जैसा कि नुकीला नमूनों के प्रवर्धन द्वारा दिखाया गया है, अवरोधक शायद ही कभी निष्कर्षण के बाद नमूनों में कायम थे। नमूने, जो सार्स-CoV-2 के लिए नकारात्मक थे और कोई आरटी-लैंप अवरोध दिखाया, सच नकारात्मक का प्रतिनिधित्व किया या १००% आवृत्ति पर LOD की तुलना में एक कम प्रतिलिपि संख्या थी । इसके विपरीत, एक सतह पर वायरल आरएनए का पता लगाने से सीधे संपर्क के माध्यम से संचरण का खतरा नहीं होता है क्योंकि सकारात्मक नमूनों से वायरस की संक्रमण का परीक्षण करने की आवश्यकता होती है । पर्यावरण की त्वरित स्क्रीनिंग, परिष्कृत आपूर्ति या उच्च योग्य कर्मियों की उपलब्धता से सीमित नहीं है, यह आकलन करने के लिए महत्वपूर्ण है कि क्या सतहों एक वायरल जलाशय का गठन और बेहतर प्रत्यक्ष रोकथाम और रोकथाम के प्रयासों के लिए ।
प्रस्तावित डिटेक्शन पाइपलाइन के लिए उपयुक्त सर्वोत्तम विधि के लिए आरटी-लैंप का चयन किया गया था। यह एक तेजी से और सस्ती विधि साबित हुई जो शेष अवरोधकों के अधिकांश के लिए अत्यधिक प्रतिरोधी थी और अन्य आरटी-क्यूपीसीआर विधियों के रूप में संवेदनशील और विशिष्ट थी। सार्स-सीओवी-2 महामारी के दौरान नैदानिक सेटिंग्स में उनके उपयोग के कारण, आरटी-क्यूपीसीआर किट की उपलब्धता वैश्विक मांग से प्रभावित हुई। इसके अलावा, आर टी-क्यूपीसीआर तकनीकें- यहां तक कि अवरोधकों का विरोध करने के लिए तैयार की गई थीं- एंजाइम बाध्यकारी49के लिए अवरोधक प्रतिस्पर्धा को कम करने के लिए अन्य सामान्य रणनीतियों के उपयोग के बाद भी नागरिक वैज्ञानिकों के पायलट पलटन द्वारा एकत्र किए गए पर्यावरणीय नमूनों में निहित पदार्थों के प्रति संवेदनशील थे। इन निष्कर्षों को हाल ही में एक अध्ययन द्वारा पुष्ट किया जाता है कि दोनों तरीकों की तुलना में COVID-19 रोगियों द्वारा संभाला कैंडी से झाड़ू नमूनों पर सार्स-CoV-2 का पता लगाने के लिए और ८३% से अधिक परिणाम सामंजस्य पाया, आरटी द्वारा विश्लेषण नमूनों में 25% कम अवरोध के साथ-दीपक15। इसके अलावा, आरटी-लैंप के साथ मिलकर जीईटीसी-क्लोरोफॉर्म क्रूड निष्कर्षण ने आरएनए किट निष्कर्षण और आरटी-क्यूपीसीआर (सामग्रियों की तालिका) कीतुलना में 42% तक रिएजेंट्स और आपूर्ति की लागत कम कर दी।
इस विधि सतह झाड़ू नमूनों के हजारों के उच्च थ्रूपुट विश्लेषण के लिए अनुमति दी। 80 पूल तक, 640 नमूनों का प्रतिनिधित्व करते हुए, आरटी-लैंप द्वारा आरएनए निष्कर्षण से सार्स-सीओवी-2 डिटेक्शन तक 2 दिनों में संसाधित किया गया था। प्रस्तावित प्रोटोकॉल अर्धकांवणात्मक है, जो वायरल आरएनए का पता लगाने तक सीमित है, और संक्रमित वायरल कणों की उपस्थिति का संकेत नहीं देता है। इसके अलावा विश्लेषण के लिए swabbed सतहों पर मौजूद संक्रमित fomites से सार्स-CoV-2 के संचरण के जोखिम का आकलन करने की आवश्यकता है ।
यह अध्ययन एक प्रोटोकॉल प्रस्तुत करता है जो जल्दी से एक परीक्षण रणनीति स्थापित करता है जिसमें संचारी रोग के साथ स्वास्थ्य आपातकाल का सामना करते समय एक प्रभावी कार्यप्रवाह शामिल है। प्रस्तावित नमूना प्रोटोकॉल सरल है और आमतौर पर घरों में पाया आपूर्ति का उपयोग करता है, और वायरल का पता लगाने की विधि एक थर्मोसाइकिलर के बदले में एक पानी स्नान के रूप में बुनियादी प्रयोगशाला सेटिंग्स में उपलब्ध उपकरणों पर किया जाता है । आरटी-लैंप रिएजेंट्स की लागत आरटी-क्यूपीसीआर के लिए आवश्यक लोगों की तुलना में काफी कम है और उच्च वैश्विक मांग परिदृश्यों के लिए कम संवेदनशील है। यह अध्ययन भविष्य में महामारी फैलने और वैश्विक महामारी में पर्यावरण वायरल जलाशयों के आकलन के लिए एक ढांचे के रूप में कार्य करता है ।

सार्स-सीओवी-2 को मुख्यरूप से संक्रमित व्यक्तियों1,2,3,4 के साथ सीधे संपर्क से दूषित एयरोसोल और बूंदों के साँस लेने के माध्यम से प्रेषित कियाजाताहै। हालांकि, वैश्विक COVID-19 महामारी के प्रारंभिक चरणों के दौरान, सार्स-CoV-2 के संचरण को नियंत्रित करने के प्रयासों को कीटाणुरहित सतहों, हैंडवाशिंग और स्वच्छता पर दृढ़ता से ध्यान केंद्रित किया गया । २०२० के अंत तक, विश्व स्वास्थ्य संगठन (डब्ल्यूएचओ)5 और अमेरिका के रोग नियंत्रण और रोकथाम केंद्र (सीडीसी) से संचरण दिशानिर्देश6 एयरबोर्न ट्रांसमिशन को मुख्य रूप से एक खतरा समझा जब एक संक्रमित व्यक्ति के साथ (<2 मीटर) या एयरोसोल पैदा करने वाली चिकित्सा प्रक्रियाओं की उपस्थिति में । दूषित सतहों के संपर्क या एयरोसोलाइज्ड फोमाइट्स के साँस लेने के बाद आत्म-टीका अभी तक सार्स-सीओवी-2 के संचरण के मार्ग के रूप में इंकार किया जाना है ।
COVID-19 मामलों की सूचना दी गई है जहां हवाई संचरण की संभावना नहीं है7,8। सार्स-CoV-2 virions 8 घंटे तक के लिए तांबे पर संक्रामक रहते हैं, गत्ता और स्टेनलेस स्टील पर अप करने के लिए 24 घंटे तक, और प्लास्टिक पर अप करने के लिए ४८ एच9। क्रूज शिप केबिन में, सार्स-CoV-2 आरएनए का पता चला 17 दिन बाद यात्रियों को7रवाना किया था । अस्पतालों और मास-ट्रांजिट सिस्टम से हवा और सतह के नमूनों कासार्स-सीओवी-2 और अन्य कोरोनावायरस8,10, 11,12,13, 14केलिए सकारात्मक परीक्षण किया गया है। स्पर्शोन्मुख और मध्यम/हल्का रोगसूचक COVID-19 रोगियों द्वारा संभाला हैलोवीन कैंडी की बाहरी पैकेजिंग पर किए गए एक अध्ययन में यह निष्कर्ष निकाला गया कि हैंडलर द्वारा हाथ धोने और हाथ साबुन के साथ कैंडी की धुलाई के संयोजन ने सार्स-सीओवी-2 आरएनए को सीमा स्तर से नीचे15तक कम कर दिया ।
सार्स-सीओवी-2 डायग्नोस्टिक्स के लिए कई तरीके वास्तविक समय रिवर्स-ट्रांसक्रिप्शन पॉलीमरेज चेन रिएक्शन (आरटी-क्यूपीसीआर)16,17,रिवर्स-ट्रांसक्रिप्शन लूप-मध्यस्थता आइसोथर्मल प्रवर्धन (आरटी-लैंप)11,18,19,20,21,और CRISPR-Cas टेक्नोलॉजीज18,19,22, 23केआधार पर प्रकाशित किए गए हैं । सबसे आरएनए निष्कर्षण किट है कि महत्वपूर्ण वैश्विक मांग की अवधि के दौरान कम आपूर्ति में अक्सर कर रहे है की आवश्यकता है, और बहुत कुछ वायरस24के पर्यावरण स्क्रीनिंग के लिए इस्तेमाल किया गया है । आरटी-लैंप का उपयोग करके सार्स-सीओवी-2 आरएनए का पता लगाने को आरटी-क्यूपीसीआर का उपयोग करने के लिए 83% से अधिक कॉनकॉर्डेंट होने का प्रदर्शन किया गया है। इसके अलावा, आरटी-लैंप के परिणामस्वरूप आरटी-क्यूपीसीआर 15 की तुलना में अनिर्णानीय परिणामों में25%की कमी आई ।
आर टी-लैंप एक सरल तकनीक है जो आरएनए टेम्पलेट25से सीडीएनए को संश्लेषित करने के लिए रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेज का उपयोग करती है, जिसके बाद मजबूत स्ट्रैंड-विस्थापन गतिविधि के साथ डीएनए पॉलीमरेज होता है जो निरंतर तापमान पर डीएनए को संश्लेषित करता है (यानी, आइसोथर्मल प्रवर्धन)26। वायरल जीनोम का पता लगाने की उच्च विशिष्टता चार या छह प्राइमर का उपयोग करके हासिल की जाती है जो लक्ष्य डीएनए के छह या आठ क्षेत्रों को पहचानते हैं । प्रवर्धन एक आंतरिक प्राइमर से शुरू किया जाता है और एक अर्द्ध डबल फंसे डीएनए संरचना पैदावार । प्रमुख कतरा तो एक बाहरी प्राइमर द्वारा परिलक्षित होता है । ये प्रवर्धन रिवर्स प्राइमर के लिए दोहराए जाते हैं। दोनों छोर पर आंतरिक और बाहरी प्राइमर में एक आंतरिक रिवर्स आत्म-पूरक साइट होती है जो प्रवर्धन उत्पाद26,27में एक पाश बनाती है। आइसोथर्मल स्ट्रैंड विस्थापन में, अतुल्यकालिक डीएनए संश्लेषण उच्च मात्रा में प्रवर्धित उत्पाद उत्पन्न करता है जहां निरंतरबहुलीकरण 11,20,28प्रति 10 प्रतियों के संकेत को बढ़ाता है। कोलोरिमेट्रिक आरटी-लैंप मिश्रण कमजोर रूप से बफर होता है और पीएच संकेतक के रूप में फिनोल लाल का उपयोग करता है। चूंकि पॉलीमरेज में न्यूक्लियोटाइड शामिल है, यह एक प्रोटॉन जारी करता है, और पर्याप्त प्रोटॉन समाधान के पीएच के साथ-साथ गुलाबी से पीलेरंग के11,20, 28,29में बदल देगा।
आर टी-लैंप को परिधीय स्वास्थ्य देखभाल सुविधाओं में मच्छर जनित रोगों का पता लगाने के लिए विकसित किया गया था जिसमें पूरी तरह से सुसज्जित प्रयोगशालाओं की कमीहै 25 और मानव इम्यूनोडेफिशिएंसी वायरस30जैसे अन्य आरएनए वायरस का तेजी से पता लगाने के लिए । महामारी फैलने में सबसे कमजोर आबादी- डब्ल्यूएचओ की परिभाषा के अनुसार- अक्सर पर्याप्त आर्थिक संसाधनों और उचित उपकरणों की कमी का पता लगाने के लिए (संयुक्त राष्ट्र वैश्विक सार्वजनिक स्वास्थ्य एजेंडा) की कमी होती है। वर्तमान सार्स-सीओवी-2 महामारी में, आरएनए निष्कर्षण किट के लिए मेडिकल ग्रेड झाड़ू और अभिकर्मक जैसी आपूर्ति वैश्विक मांग को पूरा करने में सक्षम नहीं रही है, विशेष रूप से गैर-विनिर्माण देशों में । प्रस्तावित प्रोटोकॉल में एक ग्वानिनियम थिओसाइनेट (जीईटीसी) आधारित क्रूड आरएनए निष्कर्षण का उपयोग किया गया, जिसने आरएनए को ठंड-श्रृंखला स्वतंत्र तरीके से प्रभावी ढंग से संरक्षित किया और नमूने से अवरोधकों के हठ को काफी कम कर दिया। इसके अलावा, जीआईसीसी-क्लोरोफॉर्म निष्कर्षण प्रोटोकॉल डीएनए और प्रोटीन से आरएनए के अलगाव पर आधारित है जिसके बाद संबंधित वर्षा होती है, जिससे अधिकांश आनुवंशिक सामग्री की वसूली की अनुमति होती है । यदि उन्हें जोखिमों के बारे में उचित रूप से सूचित करने के लिए उपाय किए जाते हैं तो ये लाभ रसायन से निपटने वाले नागरिक वैज्ञानिकों के संभावित खतरों से पल्ला झाड़ लेते हैं ।
प्रस्तावित कार्यप्रवाह उन सामग्रियों और अभिकर् ती का उपयोग करता है जो सामान्य उपयोग के होते हैं। इसके लिए ऐसे उपकरणों की आवश्यकता होती है जो बुनियादी, अक्सर ग्रामीण, प्रयोगशाला सेटिंग्स में उपलब्ध होते हैं। ये विधियां सस्ती हैं, अक्सर पर्यावरणीय नमूनों या नमूनों में पाए जाने वाले अवरोधकों के लिए अत्यधिक प्रतिरोधी हैं जिन्हें निष्कर्षण किट के साथ संसाधित नहीं किया जा सकता है, और उच्च सटीक थर्मोसाइकिलर की आवश्यकता को खत्म किया जा सकता है। यह अध्ययन आमतौर पर छुआ और घरों और शहरी पर्यावरण की सतहों को शायद ही कभी कीटाणुरहित करने पर पर्यावरण जलाशयों से सार्स-CoV-2 के नमूने और पता लगाने के लिए एक पाइपलाइन प्रस्तुत करता है ।

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>SMP, LIMS, and community outreach:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Authentication Application Programming Interface</td>
			<td>Google</td>
			<td>Google Sign-In</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Commercial hosting platform</td>
			<td>GoDaddy</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Data Charting Application Programming Interface</td>
			<td>Google</td>
			<td>Google Charts</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Database software</td>
			<td>MySQL&#160;</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Delivery route planning software&#160;</td>
			<td>Circuit</td>
			<td>Circuit for Teams</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Free email service</td>
			<td>Google</td>
			<td>Google Email</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Geospatial Application Programming Interface</td>
			<td>Google</td>
			<td>Google Maps API</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Multilingual neural machine translation service</td>
			<td>Google</td>
			<td>Google Translate</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Online form</td>
			<td>Google</td>
			<td>Google Form</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Operating system</td>
			<td>Linux</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Web and database development&#160;</td>
			<td>Big Rose Web Design</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Web server software</td>
			<td>Apache&#160;</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sampling kit:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Coolers</td>
			<td>Coleman (Amazon)</td>
			<td>B00363X3F2</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 70</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gallon Ziploc bags</td>
			<td>Solimo (Amazon)</td>
			<td>B07BJ495GL</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 18</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycerol (hand sanitizer)</td>
			<td>FischerScientific</td>
			<td>G33-4</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 9</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ice packs</td>
			<td>Ice-Brix (Amazon)</td>
			<td>B075GLD3X1</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 110</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Isopropanol (hand sanitizer)</td>
			<td>FischerScientific</td>
			<td>AA36644K7</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 43</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>KN95 masks</td>
			<td>Echo-Sigma</td>
			<td>Echo-Sigma</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 400</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Paper for Protocols and Trizol Safety Sheet</td>
			<td>Office Depot</td>
			<td>348037</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 36</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>30 mL spray bottles (SDS and hand sanitizer)</td>
			<td>Anyumocz (Amazon)</td>
			<td>B07T64FHXR</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 80</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNase, DNase, DNA &#38; PCR inhibitors free Microcentrifuge tubes</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>22-281</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 83</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sample ID solvent resistant labels</td>
			<td>LABTAG</td>
			<td>XST-10C1-1WH</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 68</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Swiffer WetJet pads (swabs)</td>
			<td>Swiffer (Amazon)</td>
			<td>B001F0RBT2</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 8</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Toothpicks</td>
			<td>Kitchen Essential (Amazon)</td>
			<td>B00PBK4NG6</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 8</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trizol Reagent (guanidinium isothiocyanate solution - GITC), not LS</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>15596018</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 40</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tube boxes</td>
			<td>Genesee Scientific</td>
			<td>21-119</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 180</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Small Ziploc bags</td>
			<td>Ziploc (Amazon)</td>
			<td>B01LRKEI9K</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 8</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Zebra Thermal Transfer Desktop Printer&#160;</td>
			<td>Zebra</td>
			<td>GK420t</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Total Sampling kit Cost (US$) per 100 rxns: 1,160</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trizol RNA extraction:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium Acetate RNase-free</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM9070G</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 2</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloroform</td>
			<td>FisherScientific</td>
			<td>C298-500</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 2</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GlycoBlue (glycogen 15 mg/mL)</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM9515</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 80</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Molecular-grade absolute (200 proof) Ethanol</td>
			<td>FisherScientific</td>
			<td>BP2818500</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 30</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Molecular-grade Isopropanol</td>
			<td>FisherScientific</td>
			<td>BP2618500</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TURBO DNA-free Kit&#160;</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM1907</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 110</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Multiplexed colorimetric RT-LAMP:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Guanidine Hydrochloride</td>
			<td>Alfa Aesar</td>
			<td>AAJ6548522</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RT-LAMP E1-Primers</td>
			<td>IDT</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 7</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RT-LAMP N2-Primers</td>
			<td>IDT</td>
			<td>n/a</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 7</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Synthetic SARS-CoV-2 RNA</td>
			<td>ATCC</td>
			<td>VR-3276SD</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 14</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>WarmStart Colorimetric LAMP 2X Master Mix with UDG</td>
			<td>NEB</td>
			<td>M1800S</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 210</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Eppendorf Mastercycler Pro Thermal Cycler</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>950030010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Total Trizol RNA extraction + LAMP Cost (US$) per 100 rxns: 470</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Kit for RNA extraction:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>QIAamp DSP Viral RNA Mini Kit</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>61904</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 570</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RT-qPCR:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Synthetic SARS-CoV-2 RNA</td>
			<td>ATCC</td>
			<td>VR-3276SD</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 14</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TaqMan Fast Virus 1-Step Master Mix</td>
			<td>Applied Biosystems</td>
			<td>4444432</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 180</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SARS-CoV-2 (2019-nCoV) N1,N2 Primers and Probes</td>
			<td>IDT</td>
			<td>10006713</td>
			<td>Cost (US$) per 100 rxns: 20</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>qScript XLT 1-Step RT-qPCR ToughMix</td>
			<td>Quantabio</td>
			<td>95132-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>QuantiNova Pathogen&#160;</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>208652</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>QuantiNova Probe</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>208352</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UltraPlex 1-Step ToughMix&#160;</td>
			<td>Quantabio</td>
			<td>95166-100</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CFX96 Touch Real-Time PCR Detection System</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>1855196</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Kit for RNA extraction + RT-qPCR Cost (US$) per 100 rxns: 790&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RT-PCR:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SuperScript IV One-Step RT-PCR&#160;</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>12594025</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lab cleanup:</td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DNAZap</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM9890</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNAZap</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>AM9780</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

swabbing the urban environment - a pipeline for sampling and detection of sars-cov-2 from environmental reservoirs

2020 वैश्विक महामारी के दौरान गंभीर तीव्र श्वसन सिंड्रोम कोरोनावायरस 2 (सार्स-सीओवी-2) के सामुदायिक संचरण को नियंत्रित करने के लिए, अधिकांश देशों ने प्रत्यक्ष मानव परीक्षण, चेहरे को कवर करने और सतह कीटाणुशोधन के आधार पर रणनीतियों को लागू किया। इस धारणा के तहत कि संचरण के मुख्य मार्ग में एयरोसोल और श्वसन बूंदें शामिल हैं, फोमाइट्स में सार्स-सीओवी-2 का पता लगाने के प्रयासों ने उच्च व्यापकता (जैसे, अस्पताल के वार्ड, क्रूज जहाजों और बड़े पैमाने पर परिवहन प्रणाली) के संदिग्ध स्थानों पर ध्यान केंद्रित किया है। शहरी वातावरण में सतहों पर सार्स-CoV-2 की उपस्थिति की जांच करने के लिए जो शायद ही कभी साफ होते हैं और शायद ही कभी कीटाणुरहित होते हैं, ३५० नागरिकों को ग्रेटर सैन डिएगो काउंटी से सूचीबद्ध किया गया था । कुल मिलाकर इन नागरिक वैज्ञानिकों ने ४,०८० नमूने एकत्र किए । नमूना किट वितरण और पिकअप की निगरानी के साथ-साथ नमूना डेटा एकत्र करने के लिए एक ऑनलाइन मंच विकसित किया गया था। नमूना किट ज्यादातर महामारी पर बल दिया दुकानों में उपलब्ध आपूर्ति से बनाया गया था । नमूनों को रिएजेंट्स का उपयोग करके संसाधित किया गया था जो आवर्ती आपूर्ति की कमी के बावजूद आसान थे। उपयोग किए जाने वाले तरीके अत्यधिक संवेदनशील और अवरोधकों के लिए प्रतिरोधी थे जो आमतौर पर पर्यावरणीय नमूनों में मौजूद होते हैं। प्रस्तावित प्रायोगिक डिजाइन और प्रसंस्करण विधियां कई नागरिक वैज्ञानिकों को उलझाने में सफल रहीं, जिन्होंने विभिन्न सतह क्षेत्रों से प्रभावी ढंग से नमूने एकत्र किए । यहां वर्णित कार्यप्रवाह और विधियां अन्य वायरसों के लिए शहरी वातावरण का सर्वेक्षण करने के लिए प्रासंगिक हैं, जो सार्वजनिक स्वास्थ्य चिंता के हैं और भविष्य में महामारी के लिए खतरा पैदा करते हैं ।

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Swabbing the Urban Environment - A Pipeline for Sampling and Detection of SARS-CoV-2 From Environmental Reservoirs

एक नागरिक विज्ञान परियोजना के लिए सैन डिएगो निवासियों की भर्ती के लिए सार्स-CoV-2 के लिए पर्यावरण के नमूने इकट्ठा डिजाइन किया गया था । उपयोगकर्ता के अनुकूल मोबाइल डिवाइस इंटरफेस का उपयोग करके डेटा सबमिशन के लिए एक बहुभाषी वेब-आधारित मंच बनाया गया था। एक प्रयोगशाला सूचना प्रबंधन प्रणाली ने वास्तविक समय परिणाम ट्रैकिंग के साथ हजारों भौगोलिक रूप से विविध नमूनों के संग्रह की सुविधा प्रदान की।

शहरी पर्यावरण को स्वैबिंग - पर्यावरण जलाशयों से सार्स-सीओवी-2 के नमूने और पता लगाने के लिए एक पाइपलाइन

To control community transmission of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) during the 2020 global pandemic, most countries ...

यह अध्ययन सतहों पर सार्स-सीओवी-2 का पता लगाने के लिए एक उपन्यास वर्कफ़्लो प्रस्तुत करता है जो शहरी वातावरण में शायद ही कभी साफ होते हैं, जैसे गैस पंप हैंडल, खेल के मैदान और एटीएम। एक महामारी में, आपूर्ति दुर्लभ हैं । हम बुनियादी प्रयोगशाला सेटिंग्स में उपलब्ध आसानी से प्राप्य सामग्री और अभिकर्ण और उपकरणों का उपयोग करते हैं।हम एक निष्कर्षण विधि का उपयोग करते हैं जो बिना कोल्ड चेन के आरएनए को बरकरार रखता है, और अवरोधकों के लिए प्रतिरोधी एक पहचान विधि। यह प्रोटोकॉल सार्वजनिक स्वास्थ्य हित का है। यह भविष्य के वैश्विक प्रकोपों के दौरान वर्तमान COVID-19 महामारी और अन्य संक्रामक एजेंटों के लिए पर्यावरण वायरल जलाशयों के आकलन के लिए एक रूपरेखा प्रदान करता है ।स्थानीय और सामाजिक मीडिया के माध्यम से जारी कार्रवाई के लिए एक प्रत्यक्ष और स्पष्ट कॉल का उपयोग कर नागरिक वैज्ञानिकों की भर्ती । सोशल मीडिया सामग्री में विषय को जोड़ने के लिए एक सोशल मीडिया हैंडल बनाएं। एसएमपी के लिए एक लिंक बनाएं, एक बहुभाषी प्लग-इन प्रदान करने के लिए व्यक्तियों के लिए कई भाषाओं में नेविगेशन सक्षम करने के लिए एक ऑनलाइन फार्म में निर्दिष्ट जैव सुरक्षा से संबंधित सवालों का जवाब देकर पर्यावरण नमूना प्रयास में भाग लेने के लिए आवेदन करने के लिए ।अंग्रेजी और स्पेनिश में नमूना अनुभाग ग्राफिक और ऑडियोविजुअल प्रोटोकॉल में शामिल करें। क्लाउड कंप्यूटर सेवा प्रदाता द्वारा सुविधाजनक भू-स्थानिक एप्लिकेशन प्रोग्रामिंग इंटरफेस का उपयोग करके भू-स्थानिक डेटा की कल्पना करें। केंद्रीकृत भंडारण, प्रसंस्करण कार्यप्रवाह की ट्रैकिंग और रसद के प्रबंधन की सुविधा के लिए एसएमपी के माध्यम से लिम्स को प्रस्तुत डेटा को स्टोर करें।डेटा प्रकार अनुपालन को सक्षम करने और त्रुटि को कम करने के लिए नमूना किट आईडी, नमूना आईडी, तिथि, समय और ग्लोबल पोजिशनिंग सिस्टम जैसी प्री-लोड जानकारी निर्देशांक करती है। प्रतिभागियों के लिए एक नमूना पिकअप अनुरोध लिंक शामिल करें, जिसे वे सभी नमूनों को एकत्र करने के बाद उपयोग कर सकते हैं। एक किट बनाएं जिसमें आवश्यक व्यक्तिगत सुरक्षा उपकरण, जैसे मास्क और दस्ताने, एक नमूना प्रोटोकॉल और जैव सुरक्षा प्रासंगिक जानकारी शामिल है।झाड़ू शायद ही कभी घरों और शहरी वातावरण में कीटाणुरहित सतहों को एक सेंटीमीटर वर्ग पॉलिएस्टर शोषक झाड़ू को डिटर्जेंट के साथ गीला करके और 10 सेंटीमीटर चुकता की सतह को स्वैब करके। एक टूथपिक द्वारा सहायता प्राप्त, पूर्व लेबल ट्यूब में प्रत्येक नमूना झाड़ू जलमग्न ग्वानिउद्दीनियम थिओसाइनेट के २०० माइक्रोलीटर युक्त । क्रॉस-संदूषण से बचने के लिए प्रत्येक नमूने के संग्रह के लिए प्रदान किए गए मास्क और दस्ताने की एक नई जोड़ी पहनें।सैंपलिंग खत्म करने के बाद दिए गए हैंड सैनिटाइजर का इस्तेमाल करें। ट्यूबों को चार डिग्री सेल्सियस पर स्टोर करें जब तक कि उन्हें प्रयोगशाला में ले जाया न जाए। एक बार नमूने प्रयोगशाला में आने के बाद, उन्हें शून्य से 80 डिग्री सेल्सियस पर स्टोर करें।जांच की गति बढ़ाने के लिए, पूल में नमूनों की प्रक्रिया करें। यदि एक पूल सकारात्मक है, तो स्वतंत्र रूप से प्रत्येक नमूने के आरएनए निकालें। प्रत्येक सैंपलिंग किट से नमूनों को दो पूल में मिलाकर आठ नमूनों में से प्रत्येक के ५० माइक्रोलीटर को माइक्रोसेंट्रफ्यूज ट्यूब में पूल करके और शेष नमूनों को शून्य से ८० डिग्री सेल्सियस पर बचाया जा सकता है ।15 सेकंड के लिए क्लोरोफॉर्म और भंवर के 80 माइक्रोलीटर जोड़ें। फिर चार डिग्री सेल्सियस पर 20 मिनट के लिए इनक्यूबेट। 13, 000 बार जी पर 20 मिनट के लिए चार डिग्री सेल्सियस पर सेंट्रलाइज ।जलीय परत को एक नई माइक्रोसेंट्रफ्यूज ट्यूब में स्थानांतरित करें। शेष इंटरफेस और गुलाबी तरल को माइनस 80 डिग्री सेल्सियस फ्रीजर में स्टोर करें। इन अंशों में डीएनए और प्रोटीन होते हैं।बरामद जलीय परत से आरएनए निकालें एक ग्वानिनियम थिओसाइनेट आधारित आरएनए क्रूड निष्कर्षण प्रोटोकॉल का उपयोग कर। पिपटिंग हानि के लिए खाते में 10% अतिरिक्त मात्रा के साथ कमरे के तापमान पर आरटी-लैंप प्रतिक्रिया मिश्रण तैयार करें। नमूना प्रतिक्रिया के लिए आरएनए के पांच माइक्रोलीटर और आरएनए के पांच माइक्रोलीटर प्लस सिंथेटिक सार्स-CoV-2 आरएनए के २.५ माइक्रोलीटर नुकीला प्रतिक्रिया के लिए जोड़ें ।सकारात्मक नियंत्रण के लिए सिंथेटिक सार्स-CoV-2 आरएनए के 2.5 माइक्रोलीटर और नकारात्मक नियंत्रण के लिए पानी के पांच माइक्रोलीटर जोड़ें। अच्छी तरह से मिलाएं और प्रतिक्रियाओं को स्पिन करें। कोलोरिमेट्रिक अवलोकन के लिए, गुलाबी द्वारा एक नकारात्मक परिणाम इंगित किया जाता है और पीले रंग से सकारात्मक परिणाम इंगित किया जाता है।आरटी-लैंप के बाद, जेल इलेक्ट्रोफोरेसिस करें। यहां नमूना संग्रह स्थलों का वितरण दिखाया गया है। अधिकांश किट पूर्ण हो गए थे, और इसी डेटा को लिम्स पर अपलोड किया गया था।100% की आवृत्ति पर पता लगाने की सीमा प्रतिक्रिया के 25 माइक्रोलीटर प्रति 500 प्रतियां थी। कोलोरिमेट्रिक आरटी-लैंप में, सकारात्मक नमूनों ने आठ से 5.5 तक पीएच शिफ्ट होने के कारण गुलाबी से पीले रंग में रंग बदल दिया। कम कॉपी नंबरों पर, नमूने एक agarose जेल पर चलाया गया जिसके परिणामस्वरूप सीढ़ी की तरह पैटर्न के साथ सकारात्मक पुष्टि करने के लिए ।आरटी क्यूपीसीआर के तरीकों का पर्यावरणीय नमूनों के साथ परीक्षण किया गया । सभी मास्टर घोला जा सकता है सकारात्मक नियंत्रण की कम कॉपी संख्या सांद्रता पर अवरोधकों के प्रति संवेदनशील थे । टेम्पलेट की कम सांद्रता पर, पारंपरिक आरटी पीसीआर तरीकों ने झूठी सकारात्मक और झूठी नकारात्मक दिखाई।अंत में, रोलिंग सर्कल प्रवर्धन नामक एक तकनीक ने लक्ष्य अनुक्रम की छोटी मात्रा का पता लगाया। हालांकि, यह एक आरएनए टेम्पलेट के अभाव में जांच का प्रवर्धन दिखाया । यह कार्रवाई के लिए एक फोन जारी करने के लिए महत्वपूर्ण है कि समुदाय के सभी क्षेत्रों तक पहुंचता है तो नमूना वास्तव में उस समुदाय के सभी सदस्यों के जोखिम के जोखिम का प्रतिनिधित्व करता है ।यह फ्रेमवर्क सार्स-सीओवी-2 जेनेटिक मैटेरियल का पता लगाता है । वायरल व्यवहार्यता का परीक्षण करने के लिए अध्ययन अगला कदम है।

Research

JoVE Journal

Biology

A Noninvasive Hair Sampling Technique to Obtain High Quality DNA from Elusive Small Mammals

एक अवेध्य बालों नमूनाकरण मायावी छोटे स्तनधारी से उच्च गुणवत्ता डीएनए प्राप्त तकनीक

Noninvasive genetic sampling approaches are becoming increasingly important to study wildlife populations. A number of studies have reported using ...

Chromosomics: Detection of Numerical and Structural Alterations in All 24 Human Chromosomes Simultaneously Using a Novel OctoChrome FISH Assay

Chromosomics: संख्यात्मक और स्ट्रक्चरल बदलाव की जांच सभी 24 मानव गुणसूत्रों में इसके साथ ही एक उपन्यास OctoChrome मछली परख का उपयोग

Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a technique that allows specific DNA sequences to be detected on metaphase or interphase chromosomes in cell ...

Production of Tissue Microarrays, Immunohistochemistry Staining and Digitalization Within the Human Protein Atlas

ऊतक, immunohistochemistry धुंधला और डिजिटलीकरण की मानव प्रोटीन एटलस के भीतर उत्पादन

The  tissue microarray (TMA) technology provides the means for high-throughput  analysis of multiple tissues and cells. The technique is used within the ...

Collection, Isolation and Enrichment of Naturally Occurring Magnetotactic Bacteria from the Environment

संग्रह है, और स्वाभाविक रूप से पर्यावरण से Magnetotactic बैक्टीरिया उत्पन्न का अलगाव संवर्धन

Magnetotactic bacteria (MTB) are aquatic microorganisms that were first notably described in 19751 from sediment samples collected in salt marshes of ...

Autonomously Bioluminescent Mammalian Cells for Continuous and Real-time Monitoring of Cytotoxicity

Cytotoxicity की सतत और वास्तविक समय निगरानी के लिए स्वतंत्र Bioluminescent स्तनधारी कोशिकाओं

Mammalian  cell-based in vitro assays have been  widely employed as alternatives to animal testing for toxicological studies but  have been limited due to ...

Sampling Blood from the Lateral Tail Vein of the Rat

चूहा के पार्श्व पूंछ नस से रक्त नमूने

Blood samples are commonly obtained in many experimental contexts to measure targets of interest, including hormones, immune factors, growth factors, ...

Gap Junctional Intercellular Communication: A Functional Biomarker to Assess Adverse Effects of Toxicants and Toxins, and Health Benefits of Natural Products

गैप junctional कहनेवाला संचार: एक कार्यात्मक Biomarker विषैले पदार्थ और विषाक्त पदार्थों के प्रतिकूल प्रभाव का आकलन करने के लिए, और स्वास्थ्य प्राकृतिक उत्पादों के लाभ

This protocol describes a scalpel loading-fluorescent dye transfer (SL-DT) technique that measures intercellular communication through gap junction ...

Studying Ribonucleotide Incorporation: Strand-specific Detection of Ribonucleotides in the Yeast Genome and Measuring Ribonucleotide-induced Mutagenesis

अध्ययन Ribonucleotide निगमन: किनारा-खमीर जीनोम में Ribonucleotides के विशिष्ट पता लगाने और Ribonucleotide प्रेरित Mutagenesis को मापने

The presence of ribonucleotides in nuclear DNA has been shown to be a source of genomic instability. The extent of ribonucleotide incorporation can be ...

Quasi-metagenomic Analysis of Salmonella from Food and Environmental Samples

Quasi-metagenomic Analysis of Salmonella from Food and Environmental Samples

खाद्य और पर्यावरणीय नमूनों से साल्मोनेला का अर्ध-metagenomic विश्लेषण

Quasi-metagenomics sequencing refers to the sequencing-based analysis of modified microbiomes of food and environmental samples. In this protocol, ...

A Labor-saving and Repeatable Touch-force Signaling Mutant Screen Protocol for the Study of Thigmomorphogenesis of a Model Plant Arabidopsis thaliana

A Labor-saving and Repeatable Touch-force Signaling Mutant Screen Protocol for the Study of Thigmomorphogenesis of a Model Plant Arabidopsis thaliana

एक मॉडल संयंत्र Arabidopsis thaliana के Thigmomorphogenesis के अध्ययन के लिए एक श्रम की बचत और दोहराने योग्य टच बल संकेतन उत्परिवर्ती स्क्रीन प्रोटोकॉल

Plants responding to both intracellular and extracellular mechanical stimulations (or force signals) and develop special morphological changes, a called ...