Name: single-cell characterization of calcium influx and hiv-1 infection using a multiparameter optofluidic platform
Uploaded: 2021-05-18T14:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Single-Cell Characterization of Calcium Influx and HIV-1 Infection using a Multiparameter Optofluidic Platform at JoVE.com

ベンジャミン・チェン博士との科学的な議論に感謝しています。この作品は、K08AI120806(THS)、R01DA052255(THSおよびKB)、R21AI152833(THSおよびKB)によって資金提供されました。

1. イメージング用細胞の調製
<ol><li>フレッシュフルー-4 AM負荷溶液を準備する:100倍の濃縮洗剤溶剤25μLを加え、1.5 mLチューブに2.5 μLのFluo-4 AM 1000xを加えます。混ぜる渦。</li>
	<li>培養液のピペット2.5mLをローディング溶液に入れ、混入する。光から守る。</li>
	<li>遠心分離機 2 x 106 MT-4 細胞で 500 x g 3 分間.</li>
	<li>培地を取り外し、準備したFluo-4 AM負荷溶液の2mLでペレットを再?...

<ol>
	<li>Aberg, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aging,+inflammation,+and+HIV+infection.">Aging, inflammation, and HIV infection.</a> Topics in Antiviral Medicine. 20 (3), 101-105 (2012).</li><li>Deeks, S. G., Tracy, R., Douek, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systemic+effects+of+inflammation+on+health+during+chronic+HIV+infection.">Systemic effects of inflammation on health during chronic HIV infection.</a> Immunity. 39 (4), 633-645 (2013).</li><li>Swartz, T. H., Dubyak, G. R., Chen, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Purinergic+receptors:+Key+mediators+of+HIV-1+infection+and+inflammation.">Purinergic receptors: Key mediators of HIV-1 infection and inflammation.</a> Fromtiers in Immunology. 6, 585 (2015).</li><li>Giroud, C., Marin, M., Hammonds, J., Spearman, P., Melikyan, G. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2X1+receptor+antagonists+inhibit+HIV-1+fusion+by+blocking+virus-coreceptor+interactions.">P2X1 receptor antagonists inhibit HIV-1 fusion by blocking virus-coreceptor interactions.</a> Journal of Virology. 89 (18), 9368-9382 (2015).</li><li>Hazleton, J. E., Berman, J. W., Eugenin, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Purinergic+receptors+are+required+for+HIV-1+infection+of+primary+human+macrophages.">Purinergic receptors are required for HIV-1 infection of primary human macrophages.</a> Journal of Immunology. 188 (9), 4488-4495 (2012).</li><li>Marin, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput+HIV-cell+fusion+assay+for+discovery+of+virus+entry+inhibitors.">High-throughput HIV-cell fusion assay for discovery of virus entry inhibitors.</a> Assay and Drug Development Technology. 13 (3), 155-166 (2015).</li><li>Soare, A. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2X+Antagonists+inhibit+HIV-1+productive+infection+and+inflammatory+cytokines+interleukin-10+(IL-10)+and+IL-1&#946;+in+a+human+tonsil+explant+model.">P2X Antagonists inhibit HIV-1 productive infection and inflammatory cytokines interleukin-10 (IL-10) and IL-1&#946; in a human tonsil explant model.</a> Journal of Virology. 93 (1), 01186 (2019).</li><li>Sorrell, M. E., Hauser, K. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ligand-gated+purinergic+receptors+regulate+HIV-1+Tat+and+morphine+related+neurotoxicity+in+primary+mouse+striatal+neuron-glia+co-cultures.">Ligand-gated purinergic receptors regulate HIV-1 Tat and morphine related neurotoxicity in primary mouse striatal neuron-glia co-cultures.</a> Journal of Neuroimmune Pharmacology. 9 (2), 233-244 (2014).</li><li>Swartz, T. H., Esposito, A. M., Durham, N. D., Hartmann, B. M., Chen, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2X-selective+purinergic+antagonists+are+strong+inhibitors+of+HIV-1+fusion+during+both+cell-to-cell+and+cell-free+infection.">P2X-selective purinergic antagonists are strong inhibitors of HIV-1 fusion during both cell-to-cell and cell-free infection.</a> Journal of Virology. 88 (19), 11504-11515 (2014).</li><li>Soare, A. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2RX7+at+the+host-pathogen+interface+of+infectious+diseases.">P2RX7 at the host-pathogen interface of infectious diseases.</a> Microbiology and Molecular Biology Reviews. 85 (1), (2021).</li><li>Chen, P., H&#252;bner, W., Spinelli, M. A., Chen, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Predominant+mode+of+human+immunodeficiency+virus+transfer+between+T+cells+is+mediated+by+sustained+Env-dependent+neutralization-resistant+virological+synapses.">Predominant mode of human immunodeficiency virus transfer between T cells is mediated by sustained Env-dependent neutralization-resistant virological synapses.</a> Journal of Virology. 81 (22), 12582-12595 (2007).</li><li>Dale, B. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-to-cell+transfer+of+HIV-1+via+virological+synapses+leads+to+endosomal+virion+maturation+that+activates+viral+membrane+fusion.">Cell-to-cell transfer of HIV-1 via virological synapses leads to endosomal virion maturation that activates viral membrane fusion.</a> Cell Host Microbe. 10 (6), 551-562 (2011).</li><li>Gee, K. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+and+physiological+characterization+of+fluo-4+Ca(2+)-indicator+dyes.">Chemical and physiological characterization of fluo-4 Ca(2+)-indicator dyes.</a> Cell Calcium. 27 (2), 97-106 (2000).</li><li>He, M. L., Zemkova, H., Koshimizu, T. A., Tomi&#263;, M., Stojilkovic, S. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intracellular+calcium+measurements+as+a+method+in+studies+on+activity+of+purinergic+P2X+receptor+channels.">Intracellular calcium measurements as a method in studies on activity of purinergic P2X receptor channels.</a> American Journal of Physiology and Cell Physiology. 285 (2), 467-479 (2003).</li><li>Li, H., Zony, C., Chen, P., Chen, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reduced+potency+and+incomplete+neutralization+of+broadly+neutralizing+antibodies+against+cell-to-cell+transmission+of+HIV-1+with+transmitted+founder+envs.">Reduced potency and incomplete neutralization of broadly neutralizing antibodies against cell-to-cell transmission of HIV-1 with transmitted founder envs.</a> Journal of Virology. 91 (9), 02425 (2017).</li><li>Beaumont, K. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiparameter+cell+characterization+using+nanofluidic+technology+facilitates+real-time+phenotypic+and+genotypic+elucidation+of+intratumor+heterogeneity.">Multiparameter cell characterization using nanofluidic technology facilitates real-time phenotypic and genotypic elucidation of intratumor heterogeneity.</a> bioRxiv. , 457010 (2018).</li><li>Le, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assuring+clonality+on+the+beacon+digital+cell+line+development+platform.">Assuring clonality on the beacon digital cell line development platform.</a> Biotechnology Journal. 15 (1), 1900247 (2020).</li><li>Mocciaro, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Light-activated+cell+identification+and+sorting+(LACIS)+for+selection+of+edited+clones+on+a+nanofluidic+device.">Light-activated cell identification and sorting (LACIS) for selection of edited clones on a nanofluidic device.</a> Communications in Biology. 1, 41 (2018).</li><li>Winters, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+single+B+cell+antibody+discovery+using+nanopens+and+structured+light.">Rapid single B cell antibody discovery using nanopens and structured light.</a> MAbs. 11 (6), 1025-1035 (2019).</li><li>Wu, N., Nishioka, W. K., Derecki, N. C., Maher, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput-compatible+assays+using+a+genetically-encoded+calcium+indicator.">High-throughput-compatible assays using a genetically-encoded calcium indicator.</a> Science Reports. 9 (1), 12692 (2019).</li><li>Esposito, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+high-throughput+cre-lox+activated+viral+membrane+fusion+assay+to+identify+inhibitors+of+HIV-1+viral+membrane+fusion.">A high-throughput cre-lox activated viral membrane fusion assay to identify inhibitors of HIV-1 viral membrane fusion.</a> Journal of Visualized Experiments. (138), e58074 (2018).</li><li>Soare, A. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2X1+selective+antagonists+block+HIV-1+infection+through+inhibition+of+envelope+conformation-dependent+fusion.">P2X1 selective antagonists block HIV-1 infection through inhibition of envelope conformation-dependent fusion.</a> Journal of Virology. 94 (6), 01622 (2020).</li></ol>

単一細胞におけるカルシウム流入とHIV-1生産的感染との関係を研究する記述された方法論は、他のアゴニストまたは関心のあるアンタゴニストに応答して細胞内カルシウム運動薬を研究するために適応することができる。イメージング用の細胞の調製は、簡単で、時間のかかる負担が最小限であり、試薬は広く使用されているメーカーの便利なキットで入手可能です。Fluo-4ベースのカルシウ?...

慢性炎症は、HIV関連の早期罹患率および死亡率1、2、3の主要な原因である。HIVが炎症シグナルを活性化する複数のメカニズムがあり、最近の証拠は、カルシウム腺三リン酸(ATP)受容体であるHIVエントリにおけるP2X受容体の役割を示唆している3、4、5、6、7、8、9、10。P2Xサブタイプのプリナージック受容体(P2XR)は、この炎症の重要な促進役とすることができる。しかし、HIV-P2XR相互作用の分子メカニズムはほとんど知られておらず、HIV-1ウイルスの初期および後期のライフサイクルステップに影響を与える可能性があります。HIV関連慢性炎症を引き起こす経路と運動学を定義することは、HIV患者の治療オプションを進める上で極めて重要である。
HIV-1がP2X受容体を直接苦しめるかどうかを評価するには、P2XR活性化およびHIV-1感染を並行して測定する必要があります。P2XR活性とHIV-1感染のアッセイは独立して確立されています:細胞カルシウム流入はP2XR活性化の指標であり、HIV-1の生産的な感染はRNAの豊富さによって定量することができます。カルシウム流入の蛍光検出は、Fluo-4カルシウム感受性色素で可能であり、そして、HIV-1感染は、mCherry蛍光レポーターウイルスHIV-NLCI11、12、13、14、15で可視化することができる。
P2X活性化(急性細胞カルシウム流入)およびHIV-1感染(HIV-1 RNA合成)のこれらの指標は、異なるタイムスケール(分対日)に発生するため、P2XR活性化とHIV-1感染のペア分析を可能にする高スループットの方法が欠けている。フローサイトメトリーなどの標準的なハイスループット実験技術では、集団分析が可能ですが、単一細胞の急性事象と縦断事象の関係を評価することはできません。あるいは、標準的な蛍光顕微鏡による単細胞イメージングは、低スループットである。これらの実験的な制限は、急性細胞事象と縦断細胞事象との関連性を直接測定するための新しいハイスループット技術の必要性を示す。
記述される光流体システムは、単一細胞の選別および単一細胞の分離、培養、イメージング、およびソフトウェアオートメーション16、17、18、19を可能にする新しいプラットフォームである。このシステムは、従来のイメージング方法の制限に代わる、統合されたハイスループットの代替手段を提供します。ビーコンプラットフォームは、チップに含まれる細胞をサポートする二酸化炭素(CO2)と温度制御インキュベーターで構成されています。チップは、ターゲット光に応答して電気勾配を生成する感光トランジスタを有する。この結果得られる二電気泳動力は、個々の細胞をナノ流体チップを越えて所望の領域に移動させるために使用される。細胞はチップ上のペンに分類され、個々の細胞を物理的に分離する障壁を提供します。チップ全体の成長媒体の連続的な層流は、栄養素および実験特異的試薬の小粒子拡散を可能にしながら、ペンからの細胞の移動を防ぐ。蛍光顕微鏡はチップの上に座っています。ソフトウェアオートメーションは、ユーザー指定のタイムポイントでチップのイメージをキャプチャするために使用されます。
全ての細胞特性評価は、単一細胞選択および操作のための検体系を用いて行った。このシステムは、単一細胞操作、アッセイ、培養、イメージングを可能にする、機械的、マイクロ流体、光学的なコンポーネントの統合から成ります。細胞は、3,500個の個々のチャンバー(ペン)からなる使い捨てのナノ流体デバイス上にロードされ、培養され、それぞれがサブナノリットル体積を保持することができる。細胞は、光誘発性双電気泳動「ケージ」を使用してペン内に配置し、温度およびCO2制御条件下で培養することができる。マイクロ流体は細胞培養または薬物治療のためのチップ上の媒体または緩衝液の灌流を可能にする。作動した針は、インキュベートおよびシャッター付きウェルプレートからの細胞の輸出入を可能にする。チップ領域は、明視野および蛍光チャネル(DAPI、FITC、TRed、Cy5を含む)で4倍または10倍の倍率で画像化して、細胞のフェノタイプまたは機能解析を特徴付けることができます。システム全体は、設計済みのワークフローやカスタム実験に使用できるソフトウェアを使用して自動化されています。
HIV-1感染とP2XRの関係は検討されているが、これらの相互作用を並行して直接特徴付けるためのハイスループットの手順は報告されていない。ここでは、急性カルシウム流入とその後のHIV-1生産的感染を単細胞レベルで追跡することでHIV-P2XR相互作用を研究する方法論を説明する。特に、これは単一細胞内の複数のターゲットの直接的で高スループット、縦方向の測定を可能にする新しいツールを確立する。

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>&#160;Beacon Optofluidic System</td>
			<td>Berkeley Lights</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Fetal Bovine Serum</td>
			<td>Gibco</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;FIJI</td>
			<td colspan="2">Open-source software</td>
			<td>PMID: 22743772, 22930834</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Fluo-4 Calcium Imaging Kit</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>&#160;F10489</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;HIV-1 NLCINL4-3</td>
			<td colspan="2">Laboratory of Benjamin Chen</td>
			<td>PMID: 28148796</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Hyclone Pennecillin Streptomycin solution</td>
			<td colspan="2">GE Healthcare Life sciences</td>
			<td>&#160;SV30010</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;MT-4 cells</td>
			<td>NIH AIDS Reagent</td>
			<td></td>
			<td>&#160;ARP-120</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;OptoSelect 3500 chip</td>
			<td>Berkeley Lights</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Pipettor Tips</td>
			<td>Denville Scientific</td>
			<td>&#160;P3020-CPS</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Prism 9.0.0</td>
			<td>GraphPad</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;RPMI-1640 Medium</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>&#160;R8758</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Serological Pipettes</td>
			<td>Fisher Brand</td>
			<td>&#160;13-678-11E</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tissue Culture Hood</td>
			<td>Various models</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>T75 flasks</td>
			<td>Corning</td>
			<td>3073</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

single-cell characterization of calcium influx and hiv-1 infection using a multiparameter optofluidic platform

HIV-1は、世界中で3700万人以上の人々に影響を与える慢性感染症を引き起こします。ヒト免疫不全ウイルス(HIV)を持つ人々は、抗レトロウイルス療法にもかかわらず、慢性炎症に関連する併存疾患を経験する。しかしながら、これらの炎症シグナル伝達は十分に特徴付けられていない。細胞シグナル伝達事象および下流遺伝子発現の活性化に関する早期参入事象の役割は、単細胞レベルでは捉えられてはいません。ここでは、ライブ細胞蛍光顕微鏡の原理を、ユーザーがカスタマイズした時間コースを介して細胞を培養および画像化する自動単細胞プラットフォームに適用する方法について述べ、動的細胞プロセスのハイスループット分析を可能にする。このアッセイは、HIV-1感染直後の初期の事象、特にウイルスへの暴露に伴うカルシウムの流入、および蛍光レポーターウイルスを用いた生産的感染の発症の単細胞生蛍光顕微鏡を追跡することができる。MT-4細胞はカルシウム感受性染料を装填し、ナノ流体装置上の単離されたペンで培養される。培養細胞はHIV-1レポーターウイルス(HIV-1 NLCI)に感染している。ナノ流体装置の上に位置する蛍光顕微鏡は、急性HIV-1曝露後の8分の時間経過でカルシウムの流入を測定する。HIV-1生産的な感染は、4日間にわたって同じ細胞で測定される。これらの時間コースからの画像データを分析して、ウイルス宿主受容体相互作用およびシグナル伝達経路ダイナミクスを定義する。著者らは、単一細胞の選別、培養、イメージング、およびソフトウェア自動化が可能な新しい光流体プラットフォームを使用して、従来のイメージング法に代わる統合的でスケーラブルな代替手段を提示する。このアッセイは、パラメータの配列を測定しながら、細胞の種類、アゴニスト、またはアンタゴニスト効果を含む様々な条件下での事象の運動を測定することができます。これは、ナノ流体ハイスループット縦単細胞培養およびイメージングのための最初の確立された方法です:この技術は、細胞シグナル伝達動態と動的分子相互作用を研究するために広く適応することができます。

図1は、蛍光顕微鏡を介して取得したチップおよび生撮像データの形式を示す。mCherry測定による未感染細胞および感染細胞の同定とクラスタリングを 図2に示す。これらのクラスターは、HIV感染細胞における初期のカルシウム流入を示す 図3のカルシウム流入動態について分析される。 図4 は、カルシウ?...

Watch this Scientific Journal Video about Single-Cell Characterization of Calcium Influx and HIV-1 Infection using a Multiparameter Optofluidic Platform at JoVE.com

Single-Cell Characterization of Calcium Influx and HIV-1 Infection using a Multiparameter Optofluidic Platform

ここでは、単一の細胞が急性事象およびナノ流体装置上の生産的なHIV-1感染を監視するプロトコルを提示する。イメージングデータは、ウイルスと宿主の受容体相互作用とシグナル伝達経路のダイナミクスを定義します。これは、ナノ流体ハイスループット縦単細胞培養およびイメージングにおけるシグナリング動態と分子相互作用を研究する最初の方法です。

多パラメータ光流体プラットフォームを用いたカルシウム流入とHIV-1感染の単細胞特性

HIV-1 causes a chronic infection that affects more than 37 million people worldwide. People living with human immunodeficiency virus (HIV) experience ...

このプロトコルは、単一細胞レベルでリアルタイムの運動をキャプチャすることができます。私たちは、HIV感染に応答して個々の細胞パラメータを測定し、ウイルスライフサイクルの遅れたステップと早期のシグナル伝達イベントを関連付けることができます。これは、単一細胞の選別、培養、イメージング、およびソフトウェア自動化のための新しい光流体プラットフォームを使用した従来のイメージング方法に代わる、スケーラブルな統合型の代替手段です。これは、ナノ流体、ハイスループット、縦単細胞培養およびイメージングのための最初の確立された方法です。この技術は、様々な疾患状態における細胞シグナル伝達動態および動的分子相互作用を研究するために広く採用することができる。この方法の視覚的なデモンストレーションは、実験がどのように設定されているか、細胞がどのようにペンに光学的に分類され、どのようにチップを介して注入を設定するかを伝えるために重要です。まず、100X濃縮洗剤溶剤25マイクロリットルと1,000X Fluo-4 AMの2.5マイクロリットルを1.5ミリリットルチューブに加え、次に渦を混合して、フレッシュフルー-4 AMローディング液を調製します。ピペット2.5ミリリットルの培養培地をローディング溶液に入れ、混ぜ合わせる。200万M MT-4細胞をGの500倍で3分間遠心し、その後、培地を取り除き、調製したFluo-4 AM負荷溶液の2ミリリットルでペレットを再懸濁します。ピペットは細胞を35ミリメートルペトリ皿に再懸濁した。摂氏37度で15~30分インキュベートし、室温でさらに15~30分インキュベートします。細胞懸濁液を遠心分離管に移し、500倍Gで細胞を3分間遠心分離し、上清を取り除く。培養培地の1ミリリットルにピペット化し、遠心分離機を500倍Gで3分間洗浄して細胞ペレットを再懸濁した。少なくとも50マイクロリットルの1ミリリットル当たり200万個の細胞の濃度で培養培地中でピペット処理することにより、細胞ペレットを再懸濁する。細胞ペニングを容易にする湿潤溶液でチップを調製するには、2ミリリットルの湿潤溶液と50ミリリットルの脱イオン水を含む遠心チューブを新しい光流体チップで器具に積み込み、チップに湿潤液をあふれさせるウェットチップ機能を実行します。チップを摂氏50度でインキュベートし、チップを水で3回洗い流します。水の洗い流しが完了したら、250マイクロリットルの培養培地の3サイクルでチップを洗い流します。前のステップの細胞懸濁液を、負荷の前にF127洗浄剤溶質100個につき1個ずつ補充し、細胞がチップチャネルに付着する可能性を低減します。器械輸出針を使用して、荷重操作と5マイクロリットルセルパッケージの体積のための少量インポートと1.5ミリリットル遠心管から細胞をインポートします。自動ペン機能を使用して最適化された光電子測位またはOEP電圧を使用したペンセルは、自動自動検出機能を使用してOEPケージで囲み、近くのペンに移動します。目的のセルが自動ペニングに続く場合は、手動ペン機能を使用してターゲットセルとターゲットペンを選択します。ペニングが完了したら、250マイクロリットルの培養培地の3サイクルでチップを洗い流し、残りの未セプンセルをチップから取り除きます。細胞をペニングした後、FITC、テキサスレッドおよびDAPIチャネルの細胞の蛍光画像を得て、ベースラインFluo-4、mCherry、および自己蛍光を測定します。HIV-1を200万細胞当たり13ナノグラムのHIV-1 NLCIの濃度でマイクロチップに注入し、徐々に輸出針を通して懸濁液をチップに浸透させる。HIV-1添加直後、FITCおよびDAPIチャネル内の画像を10分間の時間経過で繰り返し取得します。感染後1日、2日、3日、4日間でテキサスレッドチャンネルとDAPIチャンネルで画像を取得します。この方法論は、mCherry測定を介してHIV感染細胞および未感染細胞の同定およびクラスタリングに使用された。mCherryシグナルの変化を有する細胞は、40,000以上の蛍光強度をそれぞれmCherry高またはmCherry低集団に集積した。これらのクラスターは、9分間の時間経過で蛍光4を使用して細胞内カルシウムを繰り返し測定することにより、カルシウム流入運動学について分析し、HIV感染細胞における初期のカルシウム流入を実証した。カルシウム流入とmCherryの蛍光との間には有意な正の相関が認められた。この手順を試みる間、増殖した細胞はこのアッセイからのシグナルの劇的な減少をもたらすので、ウイルス産生と感染の両方の指数関数的増殖範囲内の細胞から始めることを覚えておくことが重要です。HIV-1での作業は危険です。したがって、この手順を実行する間、OSHA血液媒介病原体標準に示されているBSL-2の実践は、常に取られるべきです。この技術は、制御された条件下で単一細胞の表皮または転写変化を研究できるようになるため、刺激的です。これは、多くの細胞型における分子経路に対する刺激の影響を相関させる広い可能性を秘めています。

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Specific Marking of HIV-1 Positive Cells using a Rev-dependent Lentiviral Vector Expressing the Green Fluorescent Protein

緑色蛍光タンパク質を発現するリビジョンに依存するレンチウイルスベクターを用いたHIV - 1陽性細胞の特定のマーキング

Most of HIV-responsive expression vectors are based on the HIV promoter, the long terminal repeat (LTR). While responsive to an early HIV protein, Tat, ...

Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3

V3の人口ベースのシーケンシングを用いたHIV - 1トロピズムの遺伝子型推論

Background: Prior to receiving a drug from CCR5-antagonist class in HIV therapy, a patient must undergo an HIV tropism test to confirm that his or her ...

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage (Tropism) by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage Tropism by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

遺伝子型アプローチを用いた配列解析によるHIV-1コレセプター使用（指向性）の予測

Maraviroc (MVC) is the first licensed antiretroviral drug from the class of coreceptor antagonists. It binds to the host coreceptor CCR5, which is used by ...

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

HIV - 1コアのin vitroでの脱殻で

The genome of the retroviruses is encased in a capsid surrounded by a lipid envelope. For lentiviruses, such as HIV-1, the conical capsid shell is ...

Single-cell Analysis of Bacillus subtilis Biofilms Using Fluorescence Microscopy and Flow Cytometry

Single-cell Analysis of Bacillus subtilis Biofilms Using Fluorescence Microscopy and Flow Cytometry

の単一細胞解析枯草菌</em蛍光顕微鏡とフローサイトメトリーを用いて>バイオフィルム

Biofilm formation is a general attribute to almost all bacteria 1-6. When bacteria form biofilms, cells are encased in extracellular matrix that is mostly ...

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

HIV-1感染CD4の生得センシングを評価<sup&gt; +</sup&gt;使用して形質細胞様樹状細胞によるT細胞<em&gt;エクスビボ</em&gt;共培養系。

HIV-1 innate sensing requires direct contact of infected CD4+ T cells with plasmacytoid dendritic cells (pDCs). In order to study this process, the ...

Conformational Evaluation of HIV-1 Trimeric Envelope Glycoproteins Using a Cell-based ELISA Assay

細胞ベースのELISAアッセイを使用して、HIV-1エンベロープ糖タンパク質三量体の構造評価

HIV-1 envelope glycoproteins (Env) mediate viral entry into target cells and are essential to the infectious cycle. Understanding how those glycoproteins ...

Isolation of Exosomes from the Plasma of HIV-1 Positive Individuals

HIV-1陽性個体の血漿からエキソソームの単離

Exosomes are small vesicles ranging in size from 30 nm to 100 nm that are released both constitutively and upon stimulation from a variety of cell types. ...

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle (GUV) Membranes

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle GUV Membranes

巨大単層ベシクル（GUV）膜への結合HIV-1のGagの可視化

The structural protein of HIV-1, Pr55Gag (or Gag), binds to the plasma membrane in cells during the virus assembly process. Membrane binding of Gag is an ...

Measurement of In Vitro Integration Activity of HIV-1 Preintegration Complexes

Measurement of In Vitro Integration Activity of HIV-1 Preintegration Complexes

の測定<em&gt;インビトロ</em&gt; HIV-1プレインテグレーション複合体の統合活動

HIV-1 envelope proteins engage cognate receptors on the target cell surface, which leads to viral-cell membrane fusion followed by the release of the ...