Name: single-cell characterization of calcium influx and hiv-1 infection using a multiparameter optofluidic platform
Uploaded: 2021-05-18T14:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Single-Cell Characterization of Calcium Influx and HIV-1 Infection using a Multiparameter Optofluidic Platform at JoVE.com

우리는 벤자민 첸 박사와의 과학적 토론에 감사드립니다. 이 작품은 K08AI120806(THS), R01DA052255(THS 및 KB), R21AI152833(THS 및 KB)의 지원을 받았습니다.

1. 이미징을 위한 세포 준비
<ol><li>신선한 플루오-4 AM 로딩 솔루션 준비: 100x 농축 세제 용매의 25 μL을 추가한 다음 플루오-4 AM 1000x2.5 μL을 1.5mL 튜브에 추가합니다. 혼합 소용돌이.</li>
	<li>배양 매체의 파이펫 2.5 mL을 로딩 솔루션으로 전환하여 혼합합니다. 빛으로부터 보호하십시오.</li>
	<li>원심분리기 2 x 106 MT-4 셀500 x g에서 3 분 동안.</li>
	<li>제조된 플루오-4 AM 로딩 용액의 2mL에서 ...

<ol>
	<li>Aberg, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Aging,+inflammation,+and+HIV+infection.">Aging, inflammation, and HIV infection.</a> Topics in Antiviral Medicine. 20 (3), 101-105 (2012).</li><li>Deeks, S. G., Tracy, R., Douek, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systemic+effects+of+inflammation+on+health+during+chronic+HIV+infection.">Systemic effects of inflammation on health during chronic HIV infection.</a> Immunity. 39 (4), 633-645 (2013).</li><li>Swartz, T. H., Dubyak, G. R., Chen, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Purinergic+receptors:+Key+mediators+of+HIV-1+infection+and+inflammation.">Purinergic receptors: Key mediators of HIV-1 infection and inflammation.</a> Fromtiers in Immunology. 6, 585 (2015).</li><li>Giroud, C., Marin, M., Hammonds, J., Spearman, P., Melikyan, G. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2X1+receptor+antagonists+inhibit+HIV-1+fusion+by+blocking+virus-coreceptor+interactions.">P2X1 receptor antagonists inhibit HIV-1 fusion by blocking virus-coreceptor interactions.</a> Journal of Virology. 89 (18), 9368-9382 (2015).</li><li>Hazleton, J. E., Berman, J. W., Eugenin, E. 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Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2X+Antagonists+inhibit+HIV-1+productive+infection+and+inflammatory+cytokines+interleukin-10+(IL-10)+and+IL-1&#946;+in+a+human+tonsil+explant+model.">P2X Antagonists inhibit HIV-1 productive infection and inflammatory cytokines interleukin-10 (IL-10) and IL-1&#946; in a human tonsil explant model.</a> Journal of Virology. 93 (1), 01186 (2019).</li><li>Sorrell, M. E., Hauser, K. 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K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2X-selective+purinergic+antagonists+are+strong+inhibitors+of+HIV-1+fusion+during+both+cell-to-cell+and+cell-free+infection.">P2X-selective purinergic antagonists are strong inhibitors of HIV-1 fusion during both cell-to-cell and cell-free infection.</a> Journal of Virology. 88 (19), 11504-11515 (2014).</li><li>Soare, A. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2RX7+at+the+host-pathogen+interface+of+infectious+diseases.">P2RX7 at the host-pathogen interface of infectious diseases.</a> Microbiology and Molecular Biology Reviews. 85 (1), (2021).</li><li>Chen, P., H&#252;bner, W., Spinelli, M. A., Chen, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Predominant+mode+of+human+immunodeficiency+virus+transfer+between+T+cells+is+mediated+by+sustained+Env-dependent+neutralization-resistant+virological+synapses.">Predominant mode of human immunodeficiency virus transfer between T cells is mediated by sustained Env-dependent neutralization-resistant virological synapses.</a> Journal of Virology. 81 (22), 12582-12595 (2007).</li><li>Dale, B. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cell-to-cell+transfer+of+HIV-1+via+virological+synapses+leads+to+endosomal+virion+maturation+that+activates+viral+membrane+fusion.">Cell-to-cell transfer of HIV-1 via virological synapses leads to endosomal virion maturation that activates viral membrane fusion.</a> Cell Host Microbe. 10 (6), 551-562 (2011).</li><li>Gee, K. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chemical+and+physiological+characterization+of+fluo-4+Ca(2+)-indicator+dyes.">Chemical and physiological characterization of fluo-4 Ca(2+)-indicator dyes.</a> Cell Calcium. 27 (2), 97-106 (2000).</li><li>He, M. L., Zemkova, H., Koshimizu, T. A., Tomi&#263;, M., Stojilkovic, S. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intracellular+calcium+measurements+as+a+method+in+studies+on+activity+of+purinergic+P2X+receptor+channels.">Intracellular calcium measurements as a method in studies on activity of purinergic P2X receptor channels.</a> American Journal of Physiology and Cell Physiology. 285 (2), 467-479 (2003).</li><li>Li, H., Zony, C., Chen, P., Chen, B. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reduced+potency+and+incomplete+neutralization+of+broadly+neutralizing+antibodies+against+cell-to-cell+transmission+of+HIV-1+with+transmitted+founder+envs.">Reduced potency and incomplete neutralization of broadly neutralizing antibodies against cell-to-cell transmission of HIV-1 with transmitted founder envs.</a> Journal of Virology. 91 (9), 02425 (2017).</li><li>Beaumont, K. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multiparameter+cell+characterization+using+nanofluidic+technology+facilitates+real-time+phenotypic+and+genotypic+elucidation+of+intratumor+heterogeneity.">Multiparameter cell characterization using nanofluidic technology facilitates real-time phenotypic and genotypic elucidation of intratumor heterogeneity.</a> bioRxiv. , 457010 (2018).</li><li>Le, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Assuring+clonality+on+the+beacon+digital+cell+line+development+platform.">Assuring clonality on the beacon digital cell line development platform.</a> Biotechnology Journal. 15 (1), 1900247 (2020).</li><li>Mocciaro, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Light-activated+cell+identification+and+sorting+(LACIS)+for+selection+of+edited+clones+on+a+nanofluidic+device.">Light-activated cell identification and sorting (LACIS) for selection of edited clones on a nanofluidic device.</a> Communications in Biology. 1, 41 (2018).</li><li>Winters, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rapid+single+B+cell+antibody+discovery+using+nanopens+and+structured+light.">Rapid single B cell antibody discovery using nanopens and structured light.</a> MAbs. 11 (6), 1025-1035 (2019).</li><li>Wu, N., Nishioka, W. K., Derecki, N. C., Maher, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=High-throughput-compatible+assays+using+a+genetically-encoded+calcium+indicator.">High-throughput-compatible assays using a genetically-encoded calcium indicator.</a> Science Reports. 9 (1), 12692 (2019).</li><li>Esposito, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+high-throughput+cre-lox+activated+viral+membrane+fusion+assay+to+identify+inhibitors+of+HIV-1+viral+membrane+fusion.">A high-throughput cre-lox activated viral membrane fusion assay to identify inhibitors of HIV-1 viral membrane fusion.</a> Journal of Visualized Experiments. (138), e58074 (2018).</li><li>Soare, A. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=P2X1+selective+antagonists+block+HIV-1+infection+through+inhibition+of+envelope+conformation-dependent+fusion.">P2X1 selective antagonists block HIV-1 infection through inhibition of envelope conformation-dependent fusion.</a> Journal of Virology. 94 (6), 01622 (2020).</li></ol>

단일 세포에서 칼슘 유입과 HIV-1 생산감염 사이의 관계를 연구하는 기술된 방법론은 다른 작용제 또는 관심있는 길항제에 대한 응답으로 세포내 칼슘 운동학을 연구하도록 적응할 수 있다. 이미징을 위한 세포 의 준비는 간단하고 최소한의 시간 집약적이며, 시약은 널리 사용되는 제조업체의 편리한 키트에서 사용할 수 있습니다. 플루오-4 기반 칼슘 측정은 문헌에 잘 설명되어 있으며, HIV-1은 이 ?...

만성 염증은 HIV와 관련된 초기 이환율및 사망률1,2,3의주요 원인입니다. HIV가 염증 신호를 활성화할 수 있는 여러 메커니즘이 있으며, 최근 증거는 칼슘 게이팅 아데노신 삼위산염(ATP) 수용체3,4,4,5,6,7,8,9,10인HIV 항목에서 P2X 수용체에 대한 역할을 시사한다. 퓨리너기체 수용체의 P2X 특수형(P2XR)은 이 염증의 중요한 촉진자가 될 수 있다. 그러나, HIV-P2XR 상호 작용의 분자 기계장치는 크게 알려지지 않으며 초기 및 늦은 HIV-1 바이러스 성 수명 주기 단계에 영향을 미칠 수 있습니다. HIV 관련 만성 염증을 유발하는 경로와 운동학을 정의하는 것은 HIV 를 가진 사람들을 위한 치료 옵션을 발전시키는 데 중요합니다.
HIV-1이 P2X 수용체를 직접 고통스럽게 하는지 여부를 평가하려면 P2XR 활성화 및 HIV-1 감염을 병렬로 측정해야 합니다. P2XR 활성 및 HIV-1 감염의 분석이 독립적으로 확립되었습니다: 세포 칼슘 유입은 P2XR 활성화의 지표이며, HIV-1 생산적인 감염은 RNA 풍부에 의해 정량화될 수 있다. 플루오-4 칼슘 에 민감한 염료로 칼슘 유입의 형광 검출이 가능하며, HIV-1 감염은 mCherry 형광 기자 바이러스 HIV-NLCI11,12,13,14,15로시각화될 수 있다.
P2X 활성화(급성 세포 칼슘 유입) 및 HIV-1 감염(HIV-1 RNA 합성)의 이러한 지표는 다른 시간대(분 대 일)에서 발생하기 때문에 P2XR 활성화 및 HIV-1 감염의 쌍을 이루는 분석을 허용하는 고처리량 방법이 부족합니다. 유동 세포측정과 같은 표준 고처리량 실험 기술은 인구 분석을 허용하지만 단일 세포에서 급성 및 세로 이벤트 사이의 관계를 평가할 수 없습니다. 대안적으로, 표준 형광 현미경 검사를 가진 단세포 화상 진찰은 낮은 처리량입니다. 이러한 실험적 한계는 급성 및 세로 세포 이벤트 사이의 연관성을 직접 측정하는 새로운 높은 처리량 기술의 필요성을 제시합니다.
설명된 광유체 시스템은 단일 세포 분류 및 격리, 배양, 이미징 및 소프트웨어 자동화16,17,18,19를할 수 있는 새로운 플랫폼이다. 이 시스템은 기존의 이미징 방법의 한계에 대한 통합된 높은 처리량 대안을 제시합니다. 비콘 플랫폼은 칩에 포함된 세포를 지원하는이산화탄소(CO2)및 온도 제어 인큐베이터로 구성됩니다. 칩에는 표적 광에 대응하여 전기 그라데이션을 생성하는 감광성 트랜지스터가 있습니다. 이 결과 이 생성 된 이전기 력은 나노 유체 칩을 가로 질러 개별 세포를 원하는 영역으로 이동하는 데 사용됩니다. 세포는 칩의 펜으로 정렬되어 개별 세포를 물리적으로 격리하는 장벽을 제공합니다. 칩 전체의 성장 매체의 연속 라미나르 흐름은 펜에서 세포 이동을 방지하면서 영양소와 실험별 시약의 작은 입자 확산을 허용합니다. 형광 현미경은 칩 위에 앉아 있다. 소프트웨어 자동화는 사용자가 지정한 시점에서 칩이미지를 캡처하는 데 사용됩니다.
모든 세포 특성화는 단세포 선택 및 조작을 위한 광유체 시스템을 사용하여 수행되었다. 이 시스템은 단일 세포 조작, 분석, 배양 및 이미징을 가능하게 하는 통합 기계, 미세 유체 및 광학 부품으로 구성됩니다. 세포는 3,500개의 개별 챔버(pens)로 구성된 일회용 나노유체 장치에 적재 및 배양되며, 각 장치는 하위 나노리터 부피를 보유할 수 있습니다. 세포는 빛 유도 된 디전기 전성 "케이지"를 사용하여 펜 내에서 배치될 수 있으며 온도 및 CO2-제어조건하에서 배양 될 수 있습니다. 미세 유체는 세포 배양 또는 약물 치료를 위한 칩에 미디어 또는 버퍼의 관류를 허용합니다. 작동 바늘은 배양 및 셔터 웰 플레이트에서 세포의 가져오기 및 수출을 허용합니다. 칩 영역은 세포 표현형 또는 기능적 분석을 특성화하기 위해 브라이트필드 및 형광 채널(DAPI, FITC, TRed 또는 Cy5 포함)에서 4배 또는 10배 배율로 배율할 수 있다. 전체 시스템은 미리 설계된 워크플로 또는 사용자 지정 실험에 사용할 수 있는 소프트웨어를 사용하여 자동화됩니다.
HIV-1 감염과 P2XR 사이의 관계는 연구되었지만 이러한 상호 작용을 병렬로 직접 특성화하는 높은 처리량 절차는 보고되지 않았습니다. 여기에서 저자는 단일 세포 수준에서 급성 칼슘 유입 및 후속 HIV-1 생산감염을 추적하여 HIV-P2XR 상호 작용을 연구하는 방법론을 설명합니다. 특히, 이것은 단일 셀에서 여러 표적의 직접적이고 높은 처리량, 세로 측정을 허용하는 새로운 도구를 설정합니다.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>&#160;Beacon Optofluidic System</td>
			<td>Berkeley Lights</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Fetal Bovine Serum</td>
			<td>Gibco</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;FIJI</td>
			<td colspan="2">Open-source software</td>
			<td>PMID: 22743772, 22930834</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Fluo-4 Calcium Imaging Kit</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>&#160;F10489</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;HIV-1 NLCINL4-3</td>
			<td colspan="2">Laboratory of Benjamin Chen</td>
			<td>PMID: 28148796</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Hyclone Pennecillin Streptomycin solution</td>
			<td colspan="2">GE Healthcare Life sciences</td>
			<td>&#160;SV30010</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;MT-4 cells</td>
			<td>NIH AIDS Reagent</td>
			<td></td>
			<td>&#160;ARP-120</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;OptoSelect 3500 chip</td>
			<td>Berkeley Lights</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Pipettor Tips</td>
			<td>Denville Scientific</td>
			<td>&#160;P3020-CPS</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Prism 9.0.0</td>
			<td>GraphPad</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;RPMI-1640 Medium</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>&#160;R8758</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Serological Pipettes</td>
			<td>Fisher Brand</td>
			<td>&#160;13-678-11E</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tissue Culture Hood</td>
			<td>Various models</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>T75 flasks</td>
			<td>Corning</td>
			<td>3073</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

single-cell characterization of calcium influx and hiv-1 infection using a multiparameter optofluidic platform

HIV-1은 전 세계적으로 3,700만 명 이상에게 영향을 미치는 만성 감염을 일으킵니다. 인간 면역 결핍 바이러스 (HIV)와 함께 사는 사람들은 항 레트로 바이러스 치료에도 불구하고 만성 염증과 관련된 혼변성을 경험합니다. 그러나 이러한 염증 성 신호는 완전히 특징적이지 않았습니다. 세포 신호 이벤트 및 다운스트림 유전자 발현의 활성화에 대한 초기 진입 이벤트의 역할은 단일 세포 수준에서 포착되지 않았습니다. 여기서 저자는 동적 셀룰러 프로세스의 높은 처리량 분석을 허용하는 사용자 맞춤형 시간 과정을 통해 배양 및 이미지 세포를 배양하는 자동화 된 단일 셀 플랫폼에 살아있는 세포 형광 현미경 검사법의 원리를 적용하는 방법을 설명합니다. 이 분석법은 HIV-1 감염을 즉시 따르는 초기 사건의 단일 세포 살아있는 형광 현미경 검사법, 특히 바이러스에 노출과 형광 기자 바이러스를 사용하여 생산적인 감염의 발달을 수반하는 칼슘의 유입을 추적할 수 있습니다. MT-4 세포는 칼슘에 민감한 염료를 장착하고 나노유체 장치에 있는 격리된 펜에서 배양됩니다. 배양된 세포는 HIV-1 리포터 바이러스(HIV-1 NLCI)에 감염된다. 나노유체 장치 위에 위치한 형광 현미경은 급성 HIV-1 노출 후 8분 의 시간 과정을 통해 칼슘 유입을 측정합니다. HIV-1 생산성 감염은 4일 간격을 통해 동일한 세포에서 측정됩니다. 이 시간 과정의 이미징 데이터는 바이러스 호스트 수용체 상호 작용 및 신호 경로 역학을 정의하기 위해 분석됩니다. 저자는 단일 세포 정렬, 배양, 이미징 및 소프트웨어 자동화가 가능한 새로운 광유체 플랫폼을 사용하여 전통적인 이미징 방법에 대한 통합적이고 확장 가능한 대안을 제시합니다. 이 분석체는 매개 변수의 배열을 측정하는 동안 세포 유형, 고뇌스트 또는 길항제 효과를 포함한 다양한 조건하에서 이벤트의 운동학을 측정할 수 있습니다. 이것은 나노 유체 고처리량 종방향 단세포 배양 및 화상 진찰을 위한 첫번째 확립된 방법입니다: 이 기술은 세포 신호 운동및 동적 분자 상호 작용을 공부하기 위하여 광범위하게 적응될 수 있습니다.

도 1은 형광 현미경을 통해 획득한 칩 및 원시 이미징 데이터의 형식을 도시한다. mCherry 측정을 통해 감염되지 않은 및 감염된 세포의 식별 및 클러스터링은 도 2에도시된다. 이 클러스터는 HIV 감염 된 세포에 있는 초기 칼슘 유입을 보여주는 그림 3에있는 칼슘 유입 운동학을 위해 분석됩니다. 도 4는 칼슘 유...

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Single-Cell Characterization of Calcium Influx and HIV-1 Infection using a Multiparameter Optofluidic Platform

여기서, 우리는 나노 유체 장치에 있는 급성 사건 및 생산적인 HIV-1 감염을 위해 단 하나 세포가 감시되는 프로토콜을 제시합니다. 이미징 데이터는 바이러스 호스트 수용체 상호 작용 및 신호 경로 역학을 정의합니다. 이것은 나노 유체 고처리량 종방향 단세포 배양 및 이미징을 위한 첫번째 방법이다 운동및 분자 상호 작용을 연구하기 위하여.

다중 매개 변수 광유체 플랫폼을 사용하여 칼슘 유입 및 HIV-1 감염의 단세포 특성화

HIV-1 causes a chronic infection that affects more than 37 million people worldwide. People living with human immunodeficiency virus (HIV) experience ...

이 프로토콜은 단일 셀 수준에서 실시간 운동학을 캡처할 수 있습니다. 우리는 HIV 감염에 응하여 개별 세포 매개 변수를 측정하고 바이러스 성 수명 주기의 지연된 단계와 초기 신호 이벤트를 연관시킬 수 있습니다. 이것은 단일 세포 정렬, 배양, 이미징 및 소프트웨어 자동화를 위한 새로운 광유체 플랫폼을 사용하여 전통적인 이미징 방법에 대한 통합 확장 가능한 대안입니다.이것은 나노 유체, 높은 처리량, 세로 단세포 배양 및 화상 진찰을 위한 첫번째 확립된 방법입니다. 이 기술은 다양한 질병 상태에서 세포 신호 운동 및 동적 분자 상호 작용을 연구하기 위해 광범위하게 채택 될 수 있습니다. 이 방법의 시각적 데모는 실험이 설정된 방법, 세포가 펜으로 광학적으로 정렬되는 방법 및 칩을 통해 주입을 설정하는 방법을 전달하는 것이 중요합니다.우선, 100X 농축 세제 용매 25마이크로리터와 1.000X 플루오-4 AM의 2.5 마이크로리터를 1.5 밀리리터 튜브에 첨가한 다음, 혼합하는 소용돌이를 추가하여 신선한 플루오-4 AM 로딩 솔루션을 준비한다. 배양 매체의 파이펫 2.5 밀리리터가 로딩 솔루션에 넣고 혼합을 반전시다. 원심분리기 2백만 MT-4 셀은 3분 동안 500배 G로, 미디어를 제거하고 준비된 플루오-4 AM 로딩 용액의 2밀리리터에서 펠릿을 재연한다.파이펫은 35mm 페트리 접시에 세포를 다시 매달아 넣습니다. 섭씨 37도에서 15~30분 동안 배양한 다음 실온에서 15~30분 동안 추가로 배양합니다. 세포 현탁액을 원심분리관으로 옮기고 세포를 500회 G로 3분간 원심분리한 다음 상퍼를 제거합니다.배양 배지의 1밀리리터와 원심분리기의 1밀리리터로 3분간 세척하여 세포 펠릿을 다시 분리합니다. 적어도 50 마이크로리터에 대한 밀리리터 당 2백만 개의 세포 의 농도에서 배양 배지에서 파이펫팅하여 세포 펠릿을 다시 중단합니다. 웨트 용액으로 칩을 준비하려면, 젖은 용액의 두 밀리리터와 50 밀리리터의 습윤된 물을 포함하는 원심분리기 튜브를 새로운 광유체 칩으로 기기에 적재하고 습윤 솔루션으로 칩을 범람시키는 습식 칩 기능을 실행합니다.칩을 섭씨 50도에서 배양하고 칩을 물로 세 번 플러시합니다. 물 플러싱이 완료되면 250 마이크로리터의 문화 매체3사이클로 칩을 플러시하십시오. 칩 채널에 달라붙는 세포의 가능성을 줄이기 위해 로딩 전에 100부 F127 세제 용솔테로 이전 단계에서 세포 현탁액을 보완한다.계측기 내보내기 바늘을 사용하여 하중 작동과 5 마이크로리터 셀 패키지 부피를 위한 소량 가져오기를 사용하여 1.5 밀리리터 원심분리기 튜브에서 세포를 가져옵니다. 단일 세포를 자동 감지하고 OEP 케이지로 둘러싸서 근처 펜으로 이동하는 자동 펜 기능을 사용하여 최적화된 광전자 위치 또는 4.3볼트 및 초당 5 마이크로미터의 OEP 전압을 사용하는 펜 셀. 관심 있는 셀이 자동 페닝을 따라 남아 있는 경우 수동 펜 함수를 사용하여 대상 셀과 대상 펜을 선택합니다.페닝이 완료되면 칩에서 남은 펜닝되지 않은 세포를 지우기 위해 배양 매체의 250 마이크로리터의 3사이클로 칩을 플러시하십시오. 페닝 세포 후, FITC, 텍사스 레드 및 DAPI 채널에서 세포의 형광 이미지를 얻어 기준형 플루오-4, mCherry 및 자동 형광을 측정합니다. 2백만 개의 세포당 13 나노그램의 HIV-1 NLCI 농도로 HIV-1을 마이크로칩에 주입하여 수출 바늘을 통해 칩으로 서스펜션을 천천히 피펫팅합니다.HIV-1 추가 직후, 10분 의 시간 과정을 통해 FITC 및 DAPI 채널에서 이미지를 반복적으로 얻습니다. 텍사스 레드 및 DAPI 채널에서 1, 2, 3 및 4 일 후에 이미지를 가져옵니다. 이 방법론은 mCherry 측정을 통해 HIV 감염 및 감염되지 않은 세포의 식별 및 클러스터링에 사용되었습니다.mCherry 신호가 40보다 크거나 낮은 세포, 000평균 형광 강도가 각각 mCherry 고또는 mCherry 저인구로 군집하였다. 이들 클러스터는 9분 동안 플루오-4 형광을 반복적으로 사용하여 세포내 칼슘을 측정하여 칼슘 유입 운동학을 분석하여 HIV 감염 세포에서 초기 칼슘 유입을 입증하였다. 칼슘 유입과 mCherry 꽃의 사이의 상당한 긍정적 인 상관 관계가 관찰되었다.이 절차를 시도하는 동안, 자란 세포가 이 분석에서 신호의 극적인 감소를 초래할 것이기 때문에 바이러스 생산과 감염 둘 다를 위한 기하급수적인 성장 범위 내의 세포로 시작하는 것을 기억하는 것이 중요합니다. HIV-1로 작업하는 것은 위험할 수 있습니다. 따라서, OSHA 혈액 매개 병원체 표준에 표시된 바와 같이 BSL-2 관행은 항상이 절차를 수행하는 동안 취해야한다.이 기술은 우리가 통제된 조건의 밑에 단세포 phenotypic 또는 전사 변경을 공부할 수 있기 때문에 흥미롭습니다. 이것은 많은 세포 모형에 있는 분자 통로에 자극의 충격을 상관관계를 위한 광범위한 잠재력을 가지고 있습니다.

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

Specific Marking of HIV-1 Positive Cells using a Rev-dependent Lentiviral Vector Expressing the Green Fluorescent Protein

그린 형광 단백질을 표현 레브 종속 Lentiviral 벡터를 사용하여 HIV - 1 양성 세포의 특정 마킹

Most of HIV-responsive expression vectors are based on the HIV promoter, the long terminal repeat (LTR). While responsive to an early HIV protein, Tat, ...

연구

면역학 및 감염병학

Genotypic Inference of HIV-1 Tropism Using Population-based Sequencing of V3

V3의 HIV - 1 Tropism의 Genotypic 추론 사용 인구를 기반 시퀀싱

Background: Prior to receiving a drug from CCR5-antagonist class in HIV therapy, a patient must undergo an HIV tropism test to confirm that his or her ...

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage (Tropism) by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Prediction of HIV-1 Coreceptor Usage Tropism by Sequence Analysis using a Genotypic Approach

Genotypic 접근 방법을 사용하여 시퀀스 분석에 의한 HIV-1 Coreceptor 사용 (Tropism)의 예측

Maraviroc (MVC) is the first licensed antiretroviral drug from the class of coreceptor antagonists. It binds to the host coreceptor CCR5, which is used by ...

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

In vitro Uncoating of HIV-1 Cores

HIV - 1 코어의 시험 관내 Uncoating에서

The genome of the retroviruses is encased in a capsid surrounded by a lipid envelope. For lentiviruses, such as HIV-1, the conical capsid shell is ...

Single-cell Analysis of Bacillus subtilis Biofilms Using Fluorescence Microscopy and Flow Cytometry

Single-cell Analysis of Bacillus subtilis Biofilms Using Fluorescence Microscopy and Flow Cytometry

의 단일 세포 분석 바실러스 subtilis</em형광 현미경 및 유동세포계측법 사용> Biofilms

Biofilm formation is a general attribute to almost all bacteria 1-6. When bacteria form biofilms, cells are encased in extracellular matrix that is mostly ...

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

Assessing the Innate Sensing of HIV-1 Infected CD4+ T Cells by Plasmacytoid Dendritic Cells Using an Ex vivo Co-culture System.

HIV-1 감염 CD4의 타고난 감지 평가<sup&gt; +</sup&gt;를 사용하여 형질 수지상 세포에 의한 T 세포<em&gt; 예 생체 내</em&gt; 공동 문화 시스템.

HIV-1 innate sensing requires direct contact of infected CD4+ T cells with plasmacytoid dendritic cells (pDCs). In order to study this process, the ...

Conformational Evaluation of HIV-1 Trimeric Envelope Glycoproteins Using a Cell-based ELISA Assay

셀 기반의 ELISA 분석을 사용하여 HIV-1 삼량 봉투 당 단백질의 구조적 평가

HIV-1 envelope glycoproteins (Env) mediate viral entry into target cells and are essential to the infectious cycle. Understanding how those glycoproteins ...

Isolation of Exosomes from the Plasma of HIV-1 Positive Individuals

HIV-1 양성 개인의 플라즈마에서 엑소 좀의 분리

Exosomes are small vesicles ranging in size from 30 nm to 100 nm that are released both constitutively and upon stimulation from a variety of cell types. ...

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle (GUV) Membranes

Visualization of HIV-1 Gag Binding to Giant Unilamellar Vesicle GUV Membranes

거대한 단일 층 소포 (GUV) 막 바인딩 HIV-1 개그의 시각화

The structural protein of HIV-1, Pr55Gag (or Gag), binds to the plasma membrane in cells during the virus assembly process. Membrane binding of Gag is an ...

Measurement of In Vitro Integration Activity of HIV-1 Preintegration Complexes

Measurement of In Vitro Integration Activity of HIV-1 Preintegration Complexes

측정<em&gt; 체외</em&gt; HIV-1 사전 통합 단지의 통합 활동

HIV-1 envelope proteins engage cognate receptors on the target cell surface, which leads to viral-cell membrane fusion followed by the release of the ...