Name: high-throughput in vitro assay using patient-derived tumor organoids
Uploaded: 2021-06-14T14:00:00
Duration: 6 min 25 s
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Nos gustaría agradecer a los pacientes que proporcionaron las muestras clínicas utilizadas en esta investigación. Esta investigación está respaldada por subvenciones del Programa de Investigación Traslacional de la Prefectura de Fukushima.

Todos los experimentos con materiales derivados del ser humano se realizaron bajo la Declaración de Helsinki y fueron aprobados de antemano por el comité de ética de la Universidad Médica de Fukushima (números de aprobación 1953 y 2192; fechas de aprobación el 18 de marzo de 2020 y el 26 de mayo de 2016, respectivamente). Se obtuvo el consentimiento informado por escrito de todos los pacientes que proporcionaron las muestras clínicas utilizadas en este estudio.
1. Cultura de las DOP
NOTA: Los F-PDO forman grupos celulares que exhiben una variedad de morfologías heterogéneas y crecen en cultivo en suspensión(Figura 1). Además, los F-PDO se pueden cultivar durante más de 6 meses y se pueden criopreservar para su uso futuro.
<ol><li>Descongelación de las DOP almacenadas (día 0)<ol>
<li>Descongelación y siembra de PDO (por ejemplo, RLUN007, adenocarcinoma de pulmón) el día 0(Figura 1). Primero, agregue 15 ml de medio para PDO (ver Tabla de materiales)que contengan 1% de suplemento de B-27 y 30 ng / ml de factor de crecimiento epidérmico a un tubo de centrífuga estéril de 50 ml.</li>
		<li>Después de retirar el vial congelado del almacenamiento de nitrógeno líquido, agite suavemente los PDO en un baño de agua a 37 °C durante 2 min. A continuación, retire el vial del baño de agua, limpie el vial con etanol al 70% y luego mueva el vial a un gabinete de seguridad biológica.</li>
		<li>Transfiera el contenido del vial al tubo que contiene 15 ml de medio para las DOP. Mezcle los DOP y el medio canalizando suavemente hacia arriba y hacia abajo cinco veces con una pipeta de transferencia de 3 ml. Centrifugar el tubo a 200 x g durante 3 min a ~25 °C y desechar el sobrenadante. Resuspender el pellet DOP en 5 ml de medio fresco y transferir a un matraz de 25 cm2 (ver Tabla de materiales)con pipeteo suave. Por último, cultivar las DOP en una incubadora a 37 °C en 5% de CO2.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Cambie el medio dos veces por semana (días 3-7). Centrifugar la suspensión doP para precipitar los racimos celulares, y sustituir 4 mL del medio (80% de volumen). Resuspendir las células en el medio fresco. NOTA: La mayoría de RLUN007 aparecen como grupos celulares de 100-500 μm de diámetro. Cuando el color del rojo fenol en el medio cambia a amarillo como se muestra en la Figura 1A,reemplace el medio con más frecuencia. Si el medio se vuelve amarillo al día siguiente del reemplazo, y cada grupo de células se fusiona para formar grupos más grandes que tienen >500 μm de diámetro, pase a una relación de división de 1: 2.</li>
	<li>Subcultura (días 8-28) de las DOP NOTA: Dada la dificultad de medir realmente el número de células individuales, el momento de paso se determina en función de una densidad de grupo celular adecuada y el tamaño del pellet de DOP después de la centrifugación(Figura 1B). En el caso de RLUN007, el volumen del pellet DOP alcanza los 30 μL (densidad saturada en matraces de 25 cm2) aproximadamente 2 semanas después de la descongelación.<ol>
<li>Para la transferencia de un matraz de25 cm 2 a dos matraces de25 cm 2 (P1), transfiera la suspensión de la DOP a un tubo de centrífuga y centrífuga a 200 x g durante 2 min a aproximadamente 25 °C. Estime el volumen del pellet de DOP y deseche el sobrenadante. Resuspend el pellet DOP utilizando una pipeta de 5 mL en 5 mL de medio fresco. Pipete suavemente hacia arriba y hacia abajo cinco veces a baja velocidad. Luego, transfiera la mitad del volumen de la suspensión de la DOP (2,5 ml) a dos matraces y agregue 2,5 ml de medio fresco a cada matraz. Cultivar las células a 37 °C en 5% de CO2.</li>
		<li>Para la transferencia de dos matraces de25 cm 2 a un matraz de 75 cm2 (P2), transfiera la suspensión de DOP de dos matraces a dos tubos de centrífuga y centrífuga la DOP a 200 x g durante 2 min a aproximadamente 25 °C. A continuación, estime el volumen del pellet de DOP y resuspenda el pellet en 2,5 ml de medio fresco (por tubo). A continuación, combine la suspensión de la DOP en un tubo con la del otro y transfiérala a un matraz de 75 cm2 que contenga 10 ml de medio fresco. Cultivar las células a 37 °C en 5% de CO2. Transfiera las DOP subrecultivadas de dos matraces de25 cm 2 a un matraz de 75 cm2 aproximadamente 1 semana después del primer pasaje(Figura 1C).</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. Inhibición del crecimiento HTS
NOTA: La actividad inhibidora del crecimiento de los agentes anticancerígenos contra los DOP se evalúa midiendo el contenido intracelular de ATP, como se muestra en la Figura 2. Este paso se realiza utilizando un kit de ensayo de viabilidad celular disponible en el mercado (consulte la Tabla de materiales).
<ol><li>El día 0, cultive las DOP (por ejemplo, RLUN007) en matraces hasta que se disponga de un número adecuado de grupos celulares para el ensayo. Un día antes de la siembra, transfiera la suspensión de doP de un matraz de 75 cm2 a un tubo de 15 ml y centrífuga a 200 x g durante 2 minutos para medir el volumen de pellets de DOP. Luego, vuelva a suspender el pellet de DOP en 15 ml de medio fresco y transfiéralo de nuevo a un matraz de 75 cm2. Cultivar las células a 37 °C en 5% de CO2. NOTA: El volumen de pellets de DOP requerido depende de la tasa de dilución de cada DOP y del número de placas de 384 pocillos utilizadas para el ensayo. Para RLUN007, se necesita un volumen de pellets celulares de 200 μL para la siembra en diez placas de 384 pocillos.</li>
	<li>El día 1 (24 h después de cambiar el medio), picar las DOP utilizando equipos de fragmentación y dispersión celular (ver Tabla de Materiales)con un portafiltros que contenga un filtro de malla de 70 μm. Luego, diluya 15 ml de la suspensión de la DOP en 10x. Sembrar 40 μL de la suspensión de la DOP en microplacas de esferoides de fijación ultrabajas de 384 pocillos (fondo redondo) (ver Tabla de Materiales)utilizando un dispensador de suspensión celular (ver Tabla de Materiales). NOTA: Para picar grupos de células, se recomienda utilizar el equipo de fragmentación y dispersión celular disponible en el mercado (ver Tabla de Materiales).</li>
	<li>A las 24 h después de la siembra (día 2), tratar los DOP con 0,04 μL de soluciones de agentes de ensayo en rangos de concentración final de 20 μM a 1,0 nM (10 diluciones en serie) utilizando un manipulador líquido (ver Tabla de Materiales).</li>
	<li>El día 8 (144 h después del tratamiento con la sustancia de ensayo), agregue el reactivo de medición de ATP intracelular a los pozos de prueba. Mezclar las placas con un mezclador e incubar durante 10 min a 25 °C. Mida el contenido intracelular de ATP como luminiscencia utilizando un lector de placas (ver Tabla de Materiales).</li>
	<li>Para calcular la viabilidad de la celda, divida la cantidad de ATP en los pozos de prueba por la de los pozos de control que contienen el vehículo, restando el fondo. Para calcular la tasa de crecimiento durante 6 días, divida la cantidad de ATP en los pozos de control del vehículo por la de los pozos de control del vehículo 24 horas después de la siembra.</li>
	<li>Calcular los valores de concentración inhibitoria del 50% (IC50)y área bajo la curva (AUC) a partir de las curvas dosis-respuesta utilizando software de análisis de datos biológicos (ver Tabla de Materiales). El factor Z es un parámetro adimensional que oscila entre 1 (separación infinita) y <0, definido como Z = 1 - (3σc+ + 3σc-) / |μc+ - μc-|, donde σc+, σc-, μc+ y μc- son las desviaciones estándar (σ) y medias (μ) de los controles alto (c+) y bajo (c−)14,respectivamente.</li>
</ol>3. HTS con un sistema de selección celular e imágenes para la inhibición del crecimiento
NOTA: Si hay una gran desviación (cuando el coeficiente de variación [CV] en el ensayo es superior al 20%) en los datos utilizando el protocolo 2, las DOP de un tamaño seleccionado pueden sembrarse en placas de 96 o 384 pocillos utilizando un sistema de recolección e imágenes celulares(Figura 2). El protocolo es el mismo que el descrito en los pasos 2.1 y 2.2 de la sección anterior. Este paso se realiza utilizando un sistema de selección de células e imágenes disponible en el mercado (consulte la Tabla de materiales).
<ol><li>El día 1, establezca una microplaca esferoide de fijación ultra baja de 384 pocillos con 40 μL de medio/pozo como una placa de destino en el sistema de selección de células e imágenes.</li>
	<li>Llene la cámara de recolección (ver Tabla de Materiales)con 6 mL de medio de cultivo y centrífuga a 1.500 x g durante 2 min para eliminar las burbujas de aire. Añadir los DOP suspendidos en el medio (volumen de pellets DOP, 4 μL) a la cámara de picking y colocarlos en el sistema.</li>
	<li>Coloque la cámara durante al menos 1 minuto, seguido de dispersión, de modo que los grupos de células se asienten en la parte inferior de la cámara; luego, realice un escaneo de la cámara.</li>
	<li>Establezca el tamaño de recolección en 140-160 μm (área 15,386-20,000 μm2) en el sistema para la selección automática de grupos celulares. A continuación, verifique la calidad de los grupos de celdas seleccionados en las imágenes escaneadas y transfiera diez grupos de celdas por pozo utilizando consejos de selección (consulte la Tabla de materiales)a la placa de destino.</li>
	<li>Realice los pasos del protocolo desde el paso 2.3 en adelante.</li>
</ol>4. HTS para la citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos
NOTA: Este paso se realiza utilizando un sistema disponible comercialmente (ver Tabla de Materiales),que es un instrumento de medición de impedancia eléctrica. Se utiliza para evaluar la citólisis de las DOP por citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC) con anticuerpos monoclonales y células asesinas naturales (NK)(Figura 3). Las células NK se producen a partir de células mononucleares de sangre periférica utilizando el kit de producción de células NK (consulte la Tabla de materiales),siguiendo las instrucciones del fabricante.
<ol><li>Medición de la actividad de ADCC<ol>
<li>El día 0, cubra una placa de 96 pocillos (ver Tabla de Materiales)con 50 μL de solución de fibronectina de 10 μg/ml (0,5 μg/pocillo) a 4 °C durante la noche.</li>
		<li>El día 1, después de retirar la solución de fibronectina, agregue 50 μL del medio de cultivo a cada pocillo para medir la impedancia de fondo.</li>
		<li>Antes de la siembra, añadir 5 ml de reactivo de disociación de cultivo celular (véase la Tabla de materiales)a las DOP (RLUN007: 100 μL del pellet de DOP en un matraz de 75 cm2) e incubar en una incubadora de CO2 a 37 °C durante 20 min para dispersar las DOP. Para detener la tripsinización, agregue 5 ml de medio, centrífuga y retire el reactivo de disociación. Enjuague los DOP con medio fresco y filtre a través de un colador de células de 40 μm (consulte la Tabla de materiales).</li>
		<li>Contar el número de celdas utilizando un analizador de viabilidad celular (consulte la Tabla de materiales).</li>
		<li>Transfiera la suspensión de la DOP a un depósito y mezcle con un pipettor multicanal. Agregue la suspensión de doP en pozos a 5 x 104 celdas / pozo en una placa de 96 pocillos. Cada pozo contiene un volumen final de 100 μL. Luego, coloque la placa en un gabinete de seguridad biológica a aproximadamente 25 ° C durante 30 min.</li>
		<li>Transfiera la placa al instrumento en una incubadora de CO2 a 37 °C. Registre los cambios en las señales de impedancia cada 15 minutos como índice celular.</li>
		<li>Descongelar las células NK en un baño de agua a 37 °C el mismo día de la siembra doP. Transfiera las células del vial a un tubo de 15 ml que contenga 10 ml de medio para células NK (consulte la Tabla de materiales)y centrífuga a 300 x g durante 5 min a aproximadamente 25 °C. Deseche el sobrenadante y vuelva a suspender el pellet celular en 10 ml de medio fresco. Después del recuento de células, ajuste la densidad celular a 1 x10 6 celdas/ml y transfiérala a un matraz de 75 cm2. Cultive las células NK en una incubadora de CO2 al 5% a 37 °C.</li>
		<li>El día 2, prepare las soluciones de anticuerpos (solución salina tamponada con fosfato) a 10 veces la concentración final en placas estériles de 96 pocillos con fondo en V.</li>
		<li>Retire 60 μL de medio de cada pocillo y agregue 10 μL de trastuzumab o solución de cetuximab (10 μg/mL, 1 μg/mL y 0,1 μg/mL) a las PDO. Transfiera las placas de vuelta al instrumento en una incubadora y registre el índice de la célula durante 1 h.</li>
		<li>Transfiera la suspensión de la célula NK a un tubo de 50 ml y cuente el número de celda. Centrifugar las células a 300 x g durante 5 min y ajustar la densidad de células NK a 1 x 106 celdas/ml y 2 x 106 células/ml con el medio para las PDO.</li>
		<li>Agregue 50 μL de suspensión de células NK a las células efectoras (NK) en una proporción de células objetivo (RLUN007) de 1:1 o 2:1. Las concentraciones finales de los anticuerpos son 1 μg/mL, 0,1 μg/mL y 0,01 μg/mL. Mantenga la placa a aproximadamente 25 °C durante 15 minutos y devuelva las placas al instrumento.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Recopilación y análisis de datos<ol>
<li>Convierta el índice celular a valores porcentuales de citólisis utilizando un software de análisis (consulte la Tabla de materiales).</li>
		<li>El porcentaje de citólisis se refiere al porcentaje de células diana muertas por células NK frente a células diana (PDO) solas como control. Reste los índices celulares de los pozos que contienen solo células NK del índice de los pozos de muestra en cada punto de tiempo. Normalizar cada valor al índice celular inmediatamente antes de la adición de anticuerpos. Convierta el índice celular normalizado en porcentaje de citólisis utilizando la siguiente ecuación: % citólisis = (1 - índice celular normalizado [pocillos de muestra]) / índice celular normalizado (pozos objetivo solo) x 100.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

<ol>
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Fujifilm Wako Bio Solutions Corporation es una subsidiaria de Fujifilm Wako Pure Chemicals, el propietario comercial de medios F-PDO y F-PDO por transferencia de licencia.

La característica única de las DOP es que no se separan enzimáticamente en células individuales durante el cultivo o ensayo y mantienen grupos celulares en cultivo. Por lo tanto, el número de células no se puede contar con precisión bajo un microscopio. Para resolver este problema, el número de células se determina visualmente forrando un tubo centrífugo que contiene las células con tubos marcados con niveles de 50-200 μL(Figura 1B). Además, debido a que es difícil medir visualmente el volumen de pellets de grupos celulares cultivados en un matraz de25 cm 2, el tiempo de paso se determinó utilizando el cambio de color medio de rojo a amarillo y el aumento notable de células individuales o escombros en comparación con el tiempo de paso como indicadores(Figura 1A,C). Este es el punto de paso para las DOP. La cantidad de pellets DOP se mide visualmente después de la centrifugación en cada cambio de medio. Cuando el volumen del pellet deja de aumentar, y el medio se vuelve amarillo el día después del reemplazo del medio, se considera que el medio está saturado de densidad y se realiza el pasaje. El volumen de pellets se define para cada DOP. Si las DOP no proliferan, la cantidad de medio se cambia del 80% al 50% en el momento del intercambio de medio, y la densidad de las DOP aumenta en el cultivo.
Se desarrolló un HTS adecuado para PDOs. Su rendimiento es de al menos diez a veinte placas de 384 pocillos realizadas con un matraz de 75 cm2 de DOP, y el número de placas procesadas por día es de al menos 50. Además, ya se han informado los resultados de la evaluación de varios medicamentos contra el cáncer por HTS utilizando DOP.
Al realizar HTS, la obstrucción del filtro de malla causada por el picado de los F-PDO utilizando el equipo de fragmentación y dispersión celular se aborda inicialmente cambiando el tamaño de malla del filtro a 100 μm. El siguiente paso es reducir el volumen de la suspensión doptada aplicada al recipiente de vidrio. Al preparar soluciones de sustancias de ensayo para HTS, los compuestos de bajo peso molecular generalmente se disuelven en dimetilsulfóxido, y los anticuerpos se disuelven en solución salina tamponada con fosfato. Se utiliza el disolvente adecuado como sustancia de ensayo y los datos de control se obtienen del disolvente utilizado.
La siguiente es una descripción de cómo lidiar con la variabilidad en los datos del ensayo. Si hay una gran variación en los datos en la prueba utilizando placas de 384 pocillos, la placa de ensayo debe cambiarse a un formato de placa de 96 pocillos. El factor de dilución de la DOP (número de grupos de células sembradas) también se examina después de sembrar la placa. Finalmente, el sistema de selección de células e imágenes se puede utilizar para seleccionar el tamaño de las PDO para el ensayo. Antes de agregar PDO a la cámara, las células individuales y los grupos de células pequeñas deben eliminarse mediante centrifugación de baja velocidad para poder reconocer correctamente los DOP. Si las células individuales o los grupos de células pequeñas son visibles después de agregar PDO a la cámara, se pueden realizar múltiples dispersiones para eliminar las células individuales. A continuación, aunque el sistema de selección e imagen celular tiene una función que permite que la placa se mantenga caliente, esta función no se utiliza debido a la evaporación del medio de cultivo cuando el sistema está funcionando durante un largo período de tiempo. Por último, el volumen de los grupos celulares es desconocido porque es reconocido por una imagen plana. Además, si dos o más DOP se superponen, una sola DOP no se puede reconocer correctamente. Sin embargo, es posible eliminar las PDO no deseadas utilizando la función de eliminación comprobándolas en la imagen escaneada después del movimiento.
El instrumento de medición de impedancia eléctrica se usa generalmente para las células cancerosas diana adherentes para monitorear los cambios en la impedancia durante la proliferación celular. Por lo tanto, no se detecta un cambio en el índice celular de las DOP no adherentes. En un intento de resolver este problema, es necesario investigar las condiciones de siembra como la densidad de la DOP y el tratamiento enzimático (enzima de disociación celular y tiempo de tratamiento) dependiendo del tipo de DOP. Los pocillos en la placa también deben estar recubiertos con una matriz extracelular apropiada para sembrar PDO. Las DOP se siembran sin tratamiento enzimático, dependiendo del tipo de DOP. RLUN007 se utilizó para medir la impedancia sembrando los DOP en una placa de 96 pocillos después de dispersarlos mediante tratamiento enzimático. RLUN007 se trató con el reactivo de disociación de cultivo celular durante 20 min a 37 °C para dispersar las células y unirlas a los pocillos de una placa de 96 pocillos. Dado que las células RLUN007 disociadas forman inmediatamente agregados, es deseable sembrar en las placas justo después de la filtración con un colador. Después de transferir la suspensión celular del tubo a un depósito, el depósito se movió suavemente de derecha a izquierda dos o tres veces y se canalizó hacia arriba y hacia abajo cinco veces antes de sembrar en la placa. La suspensión también se mezcló con cada adición al pozo. Luego, la placa se colocó en un gabinete de seguridad biológica durante 30 minutos (para PDO) o 15 minutos (para células NK) para permitir que las células se distribuyan uniformemente en el pozo. El segundo punto importante es que el tratamiento con anticuerpos y células NK debe programarse para que ocurra antes de que el índice celular alcance una meseta y el valor no sea inferior a 0,5. En el caso de RLUN007, el tiempo óptimo para iniciar el ensayo es de 20-22 h después del emplatado, y el número de celdas para la siembra es de 5 x 104 células/pozo.
En general, el cultivo y los ensayos para organoides tumorales utilizan matrices extracelulares como Matrigel para crear andamios de tejido tumoral o enzimas como tripsina y colagenasa para alterar los organoides3,4,5,6,7. La ventaja de este método es que no se requiere matriz extracelular o tratamiento enzimático durante el cultivo y el ensayo (a excepción de los ensayos que utilizan el instrumento de medición de impedancia eléctrica), lo que reduce significativamente los requisitos y costos de mano de obra. Además, este método es relativamente fácil de adaptar a los sistemas de ensayo HTS y varios sistemas de medición. Sin embargo, el uso de una matriz extracelular es deseable para algunos propósitos de investigación porque puede actuar como un andamio para las células y afectar la morfogénesis, la diferenciación y la homeostasis en los tejidos.
En este estudio, se utilizaron PDOs (RLUN007) con una mutación EGFR (L858R) que es clínicamente sensible a los inhibidores egfr y alta expresión del gen EGFR (datos no mostrados) para evaluar los inhibidores de EGFR. Se demostró que la sensibilidad de RLUN007 a los inhibidores de EGFR era mayor que la de otros F-PDO derivados del cáncer de pulmón13 (Figura 4). Por lo tanto, un HTS que utiliza PDO, que conservan las características del tejido tumoral, es superior para la evaluación de posibles agentes anticancerígenos y presenta oportunidades para la evaluación de medicamentos y avances en la medicina personalizada. Aunque el HTS es adecuado para el cribado inicial de agentes, no reproduce el microambiente tumoral y, por lo tanto, no puede evaluar la eficacia de los fármacos in vivo. Por lo tanto, un sistema in vitro que puede imitar el tejido tumoral humano in vivo mediante el cocultivo con células endoteliales vasculares y otras células estromales o tecnología de órgano en un chip en ausencia de modelos animales está ahora en desarrollo.

Las líneas celulares de cáncer humano son ampliamente aceptadas para estudiar la biología del cáncer y evaluar los agentes anticancerígenos. Sin embargo, estas líneas celulares no necesariamente conservan las características originales de su tejido fuente porque su morfología, mutación genética y perfil de expresión génica pueden cambiar durante el cultivo durante largos períodos. Además, la mayoría de estas líneas celulares se cultivan en una monocapa o se utilizan como xenoinjertos murinos, ninguno de los cuales representa físicamente el tejido tumoral1,2. Por lo tanto, la eficacia clínica de los agentes anticancerígenos puede no ser la misma que la observada en las líneas celulares de cáncer. Por lo tanto, se han desarrollado sistemas in vitro, como ensayos ex vivo que utilizan xenoinjertos tumorales derivados del paciente u organoides tumorales derivados del paciente (PDO) y modelos de esferoides tumorales que reproducen con precisión la estructura y función de los tejidos tumorales. La creciente evidencia sugiere que estos modelos predicen la respuesta de los pacientes a los agentes anticancerígenos al ser directamente comparables al tejido canceroso correspondiente. Estos sistemas in vitro se han establecido para diferentes tipos de tejido tumoral, y también se han desarrollado sistemas de ensayo de alto rendimiento (HTS) asociados para el cribado de fármacos3,4,5,6,7. Los cultivos organoides heterogéneos ex vivo de tumores primarios obtenidos de pacientes o xenoinjertos tumorales derivados de pacientes han ganado una tracción considerable en los últimos años debido a su facilidad de cultivo y capacidad para mantener la complejidad de las células en el tejido estromal8,9,10. Se espera que estos modelos mejoren la comprensión de la biología del cáncer y faciliten la evaluación de la eficacia de los medicamentos in vitro.
Recientemente se crearon una serie de nuevas DOP a partir de diferentes tipos de tejido tumoral, designados como F-PDO, en el marco del Proyecto de Investigación Traslacional de Fukushima. Los DOP forman grandes grupos celulares con una morfología similar a la del tumor de origen y pueden cultivarse durante más de seismeses 11. La histología comparativa y los análisis exhaustivos de expresión génica mostraron que las características de las DOP son cercanas a las de sus tejidos tumorales de origen, incluso después de un crecimiento prolongado en condiciones de cultivo. Además, se estableció un HTS adecuado para cada tipo de DOP en placas de 96 y 384 pocillos. Estos ensayos se utilizaron para evaluar varios agentes y anticuerpos moleculares dirigidos. Aquí, los quimioterapéuticos estándar (paclitaxel y carboplatino) utilizados para el cáncer de endometrio se evaluaron utilizando F-PDO derivados de un paciente que no respondió a paclitaxel y carboplatino. En consecuencia, la actividad inhibidora del crecimiento celular de paclitaxel y carboplatino contra esta DOP fue débil (IC50: >10 μM). Además, investigaciones anteriores han reportado que la sensibilidad de algunos F-PDO a agentes quimioterapéuticos y agentes moleculares dirigidos es consistente con la eficacia clínica11,12,13. Finalmente, se analizaron los cambios en la estructura de orden superior de los DOP causados por agentes anticancerígenos utilizando un sistema de análisis celular tridimensional12,13. Los resultados de la evaluación de agentes anticancerígenos utilizando un HTS basado en DOP son comparables con los resultados clínicos obtenidos para estos agentes. Aquí, se presenta un protocolo para un HTS más simple y preciso que se puede utilizar para evaluar la potencia de los agentes anticancerígenos y la inmunoterapia utilizando los modelos de DOP.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>384-well Ultra-Low Attachment Spheroid Microplate</td>
			<td>Corning</td>
			<td>4516</td>
			<td>Plates for HTS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>40-&#181;m Cell Strainer</td>
			<td>Corning</td>
			<td>352340</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>AdoptCell-NK kit</td>
			<td>Kohjin Bio</td>
			<td>16030400</td>
			<td>Kit for NK cell production</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cancer Cell Expansion Media plus</td>
			<td>Fujifilm Wako Pure Chemical</td>
			<td>032-25745</td>
			<td>Medium for F-PDO</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ALyS505N-175</td>
			<td>Cell Science &#38; Technology institute</td>
			<td>10217P10</td>
			<td>Medium for NK cells</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CELL HANDLER</td>
			<td>Yamaha Motor</td>
			<td>-</td>
			<td>Cell picking and imaging system</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CellPet FT</td>
			<td>JTEC</td>
			<td>-</td>
			<td>Cell fragmentation and dispersion equipment</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CellTiter-Glo 3D Cell Viability Assay</td>
			<td>Promega</td>
			<td>G9683</td>
			<td>Cell viability luminescent assay, intracellular ATP measuring reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Echo 555</td>
			<td>Labcyte</td>
			<td>-</td>
			<td>Liquid handler</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EnSpire</td>
			<td>PerkinElmer</td>
			<td>-</td>
			<td>Plate reader</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>E-plate VIEW 96</td>
			<td>Agilent</td>
			<td>300601020</td>
			<td>Plates are specifically designed to perform cell-based assays with the xCELLigence RTCA System</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fibronectin Solution</td>
			<td>Fujifilm Wako Pure Chemical</td>
			<td>063-05591</td>
			<td>Plate coating for xCELLigence RTCA System</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>F-PDO</td>
			<td>Fujifilm Wako Pure Chemical or Summit Pharmaceuticals International</td>
			<td>-</td>
			<td>The F-PDO can be purchased from Fujifilm Wako Pure Chemicals or Summit Pharmaceuticals International</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Morphit software, version 6.0</td>
			<td>The Edge Software Consultancy</td>
			<td></td>
			<td>Biological data analysis software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Multidrop Combi</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>5840300</td>
			<td>Cell suspension dispenser</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Precision Chamber</td>
			<td>Yamaha Motor</td>
			<td>JLE9M65W230</td>
			<td>Chamber for picking cell clusters using CELL HANDLER</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Precision Tip</td>
			<td>Yamaha Motor</td>
			<td>JLE9M65W300</td>
			<td>Micro tip for picking cell clusters using CELL HANDLER</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RLUN007</td>
			<td>Fujifilm Wako Pure Chemical or Summit Pharmaceuticals International</td>
			<td></td>
			<td>Lung tumor derived F-PDO</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TrypLE Express</td>
			<td>ThermoFisher Scientific</td>
			<td>12604021</td>
			<td>Cell culture dissociation reagent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ultra-Low Attachment 25 cm&#178; Flask</td>
			<td>Corning</td>
			<td>4616</td>
			<td>Culture flask for PDO</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ultra-Low Attachment 75 cm&#178; Flask</td>
			<td>Corning</td>
			<td>3814</td>
			<td>Culture flask for PDO</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vi-CELL XR Cell Viability Analyzer System</td>
			<td>Beckman coulter</td>
			<td>-</td>
			<td>Cell viability analyzer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>xCELLigence immunotherapy software, version 2.3</td>
			<td>ACEA Bioscience</td>
			<td>-</td>
			<td>Analysis software for xCELLigence RTCA System</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>xCELLigence RTCA System</td>
			<td>ACEA Bioscience</td>
			<td>-</td>
			<td>Electrical impedance measuring instrument for cytolysis</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

high-throughput in vitro assay using patient-derived tumor organoids

Se espera que los organoides tumorales derivados del paciente (PDO) sean un modelo preclínico de cáncer con una mejor reproducibilidad de la enfermedad que los modelos tradicionales de cultivo celular. Las PDO se han generado con éxito a partir de una variedad de tumores humanos para recapitular la arquitectura y la función del tejido tumoral de manera precisa y eficiente. Sin embargo, las DOP no son adecuadas para un sistema de ensayo de alto rendimiento (HTS) in vitro o análisis celular utilizando placas de 96 pocillos o 384 pocillos al evaluar medicamentos contra el cáncer porque son heterogéneos en tamaño y forman grandes grupos en cultivo. Estos cultivos y ensayos utilizan matrices extracelulares, como Matrigel, para crear andamios de tejido tumoral. Por lo tanto, las DOP tienen un bajo rendimiento y un alto costo, y ha sido difícil desarrollar un sistema de ensayo adecuado. Para abordar este problema, se estableció un HTS más simple y preciso utilizando PDO para evaluar la potencia de los medicamentos contra el cáncer y la inmunoterapia. Se creó un HTS in vitro que utiliza PDO establecidos a partir de tumores sólidos cultivados en placas de 384 pocillos. También se desarrolló un HTS para la evaluación de la actividad de citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos para representar la respuesta inmune utilizando PDO cultivados en placas de 96 pocillos.

Se desarrolló un HTS de alta precisión utilizando DOP y microplacas de 384 pocillos para evaluar los agentes anticancerígenos, y el desarrollo de un HTS para cada DOP se informó previamente10,11,12,13. El rendimiento del HTS se evaluó calculando los CV y el factor Z'. El factor Z es un método ampliamente aceptado para la validación de la calidad y el rendimiento del ensayo, y el ensayo es adecuado para HTS si este valor es >0,514. Los puntos de referencia de control en el ensayo de placa de 384 pocillos utilizando RLUN007 mostraron poca variabilidad, con valores CV de 5,8% y factores Z calculados de 0,83, como se muestra en la Figura 4. Estos resultados indican que este ensayo tiene un alto rendimiento para HTS. Para investigar la sensibilidad de los DOP a los agentes anticancerígenos mediante HTS, la inhibición del crecimiento se evaluó mediante RLUN007 tratado con ocho agentes anticancerígenos, específicamente, inhibidores del receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR) (afatinib, erlotinib, gefitinib, lapatinib, osimertinib y rociletinib) y paclitaxel, que son tratamientos clínicos estándar para el cáncer de pulmón de células no pequeñas, y la mitomicina C como control positivo. Los valores de IC50 y AUC de los agentes anticancerígenos para cada DOP se muestran en la Figura 4. El RLUN007 mostró alta sensibilidad (IC50 < 2 μM, AUC < 282) para todos los inhibidores de EGFR y otros agentes anticancerígenos. Las curvas sigmoides calculadas para todos los datos indicaron que la actividad inhibidora del crecimiento de los agentes anticancerígenos podría medirse con precisión.
El sistema de selección de células e imágenes se utiliza cuando los datos varían significativamente utilizando la metodología anterior. El sistema de selección e imágenes celulares, que selecciona los grupos celulares con precisión sin dañarlos, permite ensayos HTS precisos al alinear el tamaño del grupo celular para excluir los desechos celulares del sistema de ensayo. Cuando no se utilizó el sistema, el valor CV fue del 26,0% y el valor del factor Z fue de 0,23 (datos no mostrados). Sin embargo, los valores de los factores CV y Z se mejoraron en 6,4% y 0,81, respectivamente, utilizando el sistema.
Para investigar la citólisis de los DOP con actividad ADCC utilizando el instrumento de medición de impedancia eléctrica, que monitorea el número, la morfología y la unión de las células durante mucho tiempo, los cambios en las señales de impedancia se evaluaron utilizando RLUN007 tratado con los anticuerpos (trastuzumab y cetuximab) y células NK como células efectoras en una placa de 96 pocillos. En comparación con el control que consiste solo en células diana, el porcentaje de citólisis aumentó con el tiempo. Alcanzó el 45% o 75% después de 6 h en una relación E:T de 1:1(Figura 5A,C)o 2:1(Figura 5B,D)sin los anticuerpos. La citólisis mediada por células NK con trastuzumab fue de aproximadamente 60% y 90% en una proporción de 1:1(Figura 5A,1 μg/mL) y 2:1(Figura 5B,1 μg/mL), respectivamente, a 6 h. Por el contrario, cetuximab tuvo un impacto dependiente de la dosis en la citólisis mediada por células NK (Figura 5C,D). A la concentración más alta de cetuximab, RLUN007 se destruyeron al 90% y 100% en una proporción de 1:1 y 2:1, respectivamente (Figura 5C,D). El efecto de trastuzumab fue más débil que el de cetuximab, con sólo un 60% de citotoxicidad. Estos resultados indican que el sistema de ensayo PDO puede evaluar la actividad de ADCC utilizando tecnología basada en impedancia en tiempo real.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62668/62668fig1v5.jpg"> Figura 1: Puntos críticos para la cultura de la DOP. (A) Cambio de color en el medio. (B) Medición de la cantidad de DOP a partir del tamaño del pellet mediante el revestimiento de un tubo de centrífuga que contiene los DOP con tubos marcados a niveles de 50-200 μL. (C) Densidad de DOP. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62668/62668fig1v5large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62668/62668fig02.jpg"> Figura 2: Resumen del protocolo utilizado para crear un sistema de ensayo de alto rendimiento utilizando microplacas de 384 pocillos. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62668/62668fig02large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62668/62668fig03.jpg"> Figura 3: Resumen del protocolo para el ensayo de alto rendimiento de la actividad de ADCC. ADCC: citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos; NK, asesino natural. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62668/62668fig03large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62668/62668fig04.jpg"> Figura 4: Sistema de ensayo de alto rendimiento para la inhibición del crecimiento con agentes anticancerígenos. Curva dosis-respuesta de RLUN007 a agentes anticancerígenos. Las DOP picadas se sembraron en placas de 384 pocillos. Estos fueron tratados durante 6 días con diez concentraciones diferentes de agentes anticancerígenos (entre 10 μM y 1,5 nM). Los datos representan la media ± desviación estándar de los experimentos triplicados. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62668/62668fig04large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/62668/62668fig05.jpg"> Figura 5: Ensayo de alto rendimiento para la actividad de ADCC. (A,B) Trastuzumab. (C,D) Cetuximab. (A,C) Una proporción de 1:1 de RLUN007 a las células efectoras. (B,D) Citólisis con una relación de RLUN007: células efectoras de 1:2. La actividad se midió 12 h después de la adición de las células efectoras. Los datos se presentan como la media ± desviación estándar de tres muestras replicadas. ADCC: citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/62668/62668fig05large.jpg" target="_blank">Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.</a>

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High-Throughput In Vitro Assay using Patient-Derived Tumor Organoids

Se desarrolló un sistema de ensayo de alto rendimiento in vitro de alta precisión para evaluar medicamentos contra el cáncer utilizando organoides tumorales (PDO) derivados del paciente, similares a los tejidos cancerosos, pero que no son adecuados para sistemas de ensayo de alto rendimiento in vitro con placas de 96 pocillos y 384 pocillos.

Ensayo in vitro de alto rendimiento utilizando organoides tumorales derivados del paciente

Patient-derived tumor organoids (PDOs) are expected to be a preclinical cancer model with better reproducibility of disease than traditional cell culture ...

Los organoides tumorales derivados del paciente recapitulan la arquitectura y la función del tejido tumoral con precisión con una mejor reproducibilidad de la enfermedad. Por lo tanto, la respuesta de un paciente a los medicamentos contra el cáncer se puede evaluar con precisión utilizando este modelo. Los organoides tumorales no son adecuados para un sistema de ensayo de alto rendimiento in vitro o análisis celular debido a la formación de grandes grupos en cultivo.Utilizando esta técnica, se desarrolló HTS simple y más preciso para la evaluación de fármacos moleculares dirigidos. Dado que el cultivo de organoides es muy diferente del cultivo 2D, uno puede sentirse confundido sobre el cultivo al principio, pero es importante observar cuidadosamente los cambios morfológicos de los organoides. Después de eliminar el vil congelado del almacenamiento de nitrógeno líquido, agite suavemente los organoides tumorales derivados del paciente en un baño de agua a 37 grados centígrados durante un minuto.Retire el vil del baño de agua y limpie con etanol al 70%. Luego coloque el vial en el gabinete de bioseguridad. Transfiera los organoides tumorales en un tubo de 15 mililitros que contenga el medio para los organoides.Use una pipeta de transferencia de tres mililitros para mezclar suavemente los organoides tumorales y el medio mediante la pipetería hacia arriba y hacia abajo cinco veces. Peletizar los organoides tumorales por centrifugación. Deseche el sobrenadante y vuelva a suspender el gránulo organoide tumoral en cinco mililitros de medio fresco.Transfiera la suspensión organoide del tumor a un matraz T25 e incube a 37 grados Centígrados y 5% de dióxido de carbono. Después de una semana del primer pasaje, transfiera la suspensión organoide tumoral de dos matraces T25 a dos tubos de centrífuga y grica por los organoides tumorales por centrifugación. Estimar el volumen de gránulos organoides tumorales y resuspendir el gránulo en 2,5 mililitros de medio fresco por tubo.Agrupe la suspensión organoide del tumor en un tubo. Transfiera la suspensión agrupada a un matraz T75 que contenga 10 mililitros de medio fresco e incube a 37 grados Celsius y 5% de dióxido de carbono. Después de 24 horas de cambio de medio, picar los organoides tumorales utilizando un instrumento de fragmentación y dispersión celular equipado con un soporte de filtro que contiene un filtro de malla de 70 micrómetros.Diluir 15 mililitros de suspensión organoide tumoral 10 veces. Use el dispensador de suspensión celular para sembrar 40 microlitros de suspensión de organoides tumorales diluidos en una microplaca de esferoides de unión ultra baja de 384 pocillos. Después de 24 horas, use un manipulador de líquidos para agregar 0.04 microlitros de soluciones de agentes de prueba de 10 diluciones en serie en rangos de concentración final de 20 micromolares a 1.0 nanomolares en los pozos, e incube la placa durante seis días.Al final de la incubación, agregue un reactivo de medición de ATP intracelular en los pozos de prueba. Use un mezclador para mezclar el contenido de la placa e incubar la placa durante 10 minutos a aproximadamente 25 grados centígrados. Utilice un lector de placas para medir el contenido intracelular de ATP como luminiscencia.Después de 24 horas del tercer pasaje, coloque una microplaca esferoide de fijación ultra baja de 384 pocillos con 40 microlitros de medio por pozo como una placa de destino en el sistema de selección e imágenes celulares. Construya la cámara de recolección con seis mililitros de medio de cultivo y centrífuga a 1, 500 veces G durante dos minutos para eliminar las burbujas de aire. Agregue cuatro microlitros de suspensión de organoides tumorales en la cámara de recolección y coloque la cámara de recolección en el sistema.Permita que los grupos de células se asienten en la parte inferior de la cámara durante un minuto después de la dispersión y luego inicie el escaneo de la cámara. Establezca el tamaño de recolección en 140 a 160 micrómetros en el sistema para la selección automática de grupos de células. A continuación, verifique la calidad de los grupos de células seleccionados en las imágenes escaneadas y transfiera 10 grupos de células por pozo utilizando puntas de selección en la placa de destino.En el estudio actual, se evaluó el efecto de los agentes anticancerígenos sobre el organoide tumoral derivado del paciente. La alta sensibilidad para todos los agentes anticancerígenos fue indicada por los valores de concentración inhibitoria medio máximos inferiores a dos micromolares en el área bajo los valores de la curva inferiores a 282. Para una evaluación de citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos, se midió el porcentaje de citólisis de organoides tumorales en presencia de dos anticuerpos diferentes.El porcentaje de citólisis aumentó con el tiempo. Sin los anticuerpos a las seis horas con la relación efector-célula diana de uno a uno, la citólisis alcanzó el 45%Mientras que en la proporción de dos a uno, la citólisis alcanzó el 70%La citólisis mediada por células asesinas naturales con trastuzumab fue de aproximadamente el 60% en la relación efector-célula diana de uno a uno, y el 80% en la proporción de dos a uno a las seis horas. En contraste, cetuximab tuvo un impacto dependiente de la dosis en la citólisis mediada por células asesinas naturales.A la concentración más alta de cetuximab, se observó un 90% de citólisis en la relación efectora-célula diana de uno a uno, y se observó un 100% de citólisis en la proporción de dos a uno, lo que indica una alta efectividad de cetuximab. Un sistema de ensayo de alto rendimiento que utiliza organoides tumorales derivados del paciente es superior a la evaluación de posibles agentes anticancerígenos y presenta oportunidades para la evaluación de medicamentos y avances en la medicina personalizada.

Research

JoVE Journal

Cancer Research

High-Throughput In Vitro Assay using Patient-Derived Tumor Organoids

High-sensitivity Detection of Micrometastases Generated by GFP Lentivirus-transduced Organoids Cultured from a Patient-derived Colon Tumor

Alta sensibilidad detección de micrometástasis de GFP Lentivirus-transduced organitas cultivados de un Tumor de Colon paciente derivado

Despite current advances in human colorectal cancer (CRC) treatment, few radical therapies are effective for the late stages of CRC. To overcome this ...

Investigación

Investigación sobre el cáncer

Real Time Detection of In Vitro Tumor Cell Apoptosis Induced by CD8+ T Cells to Study Immune Suppressive Functions of Tumor-infiltrating Myeloid Cells

Real Time Detection of In Vitro Tumor Cell Apoptosis Induced by CD8+ T Cells to Study Immune Suppressive Functions of Tumor-infiltrating Myeloid Cells

Tiempo real detección de Vitro Tumor de la célula apoptosis inducida por CD8+ T las células para el estudio de las funciones inmunológicas de supresores de Tumor infiltrante de células mieloides

Potentiation of the tumor-killing ability of CD8+ T cells in tumors, along with their efficient tumor infiltration, is a key element of successful ...

In Vitro Assay to Study Tumor-macrophage Interaction

Ensayo In Vitro para estudiar la interacción tumor-macrofago

Tumor associated macrophages (TAMs) account for a large percentage of cells in the tumor mass for different types of cancers. Glioblastoma (GBM), a ...

Establishment and Characterization of Small Bowel Neuroendocrine Tumor Spheroids

Establecimiento y caracterización de esferoides de tumores neuroendocrinos de intestino delgado

Small bowel neuroendocrine tumors (SBNETs) are rare cancers originating from enterochromaffin cells of the gut. Research in this field has been limited ...

Drug Screening of Primary Patient Derived Tumor Xenografts in Zebrafish

Examen de drogas de xenoinjertos de tumores derivados del paciente primario en peces cebra

Patient derived xenograft models are critical in defining how different cancers respond to drug treatment in an in vivo system. Mouse models are the ...

Creating Matched In vivo/In vitro Patient-Derived Model Pairs of PDX and PDX-Derived Organoids for Cancer Pharmacology Research

Creación de pares de modelos in vivo/in vitro derivados de pacientes de PDX y organoides derivados de PDX para la investigación farmacológica del cáncer

Patient-derived tumor xenografts (PDXs) are considered the most predictive preclinical models, largely believed to be driven by cancer stem cells (CSC) ...

Profiling Sensitivity to Targeted Therapies in EGFR-Mutant NSCLC Patient-Derived Organoids

Perfil de la sensibilidad a las terapias dirigidas en organoides derivados de pacientes con NSCLC con mutación de EGFR

Novel 3D cancer organoid cultures derived from clinical patient specimens represent an important model system to evaluate intratumor heterogeneity and ...

Generation and Culturing of High-Grade Serous Ovarian Cancer Patient-Derived Organoids

Generación y cultivo de organoides derivados de pacientes con cáncer de ovario seroso de alto grado

Organoids are 3D dynamic tumor models that can be grown successfully from patient-derived ovarian tumor tissue, ascites, or pleural fluid and aid in the ...

Establishment and Culture of Patient-Derived Breast Organoids

Establecimiento y cultivo de organoides mamarios derivados de pacientes

Breast cancer is a complex disease that has been classified into several different histological and molecular subtypes. Patient-derived breast tumor ...

Visualizing DNA Damage Repair Proteins in Patient-Derived Ovarian Cancer Organoids via Immunofluorescence Assays

Visualizing DNA Damage Repair Proteins in Patient-Derived Ovarian Cancer Organoids via Immunofluorescence Assays

Visualización de proteínas de reparación del daño del ADN en organoides de cáncer de ovario derivados de pacientes a través de ensayos de inmunofluorescencia

Immunofluorescence is one of the most widely used techniques to visualize target antigens with high sensitivity and specificity, allowing for the accurate ...