Name: quantification of optic nerve cross sectional area on mri: a novel protocol using fiji software
Uploaded: 2021-09-04T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantification of Optic Nerve Cross Sectional Area on MRI: A Novel Protocol using Fiji Software at JoVE.com

ברצוננו להודות לפאריס חדד וחסן אל-איסא על תרומתם החשובה בצילומי וידאו ופיתוח.

המחקר הבא אושר על ידי ועדת המחקר וועדת הביקורת המוסדית של בית החולים אוניברסיטת ירדן. הפרוטוקול הבא יתאר את טכניקת ההדמיה המשמשת לרכישת תמונות MRI, ואחריה עיבוד תמונה וכימות עצב הראייה באמצעות תוכנת פיג'י.
1. רכישת תמונת MRI
הערה: רכישת התמונה MR נעשתה באמצעות MRI 3 ט?...

<ol>
	<li>Quigley, H. A., Broman, A. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+number+of+people+with+glaucoma+worldwide+in+2010+and+2020.">The number of people with glaucoma worldwide in 2010 and 2020.</a> The British Journal of Ophthalmology. 90 (3), 262-267 (2006).</li><li>Weinreb, R. N., Aung, T., Medeiros, F. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+pathophysiology+and+treatment+of+glaucoma:+a+review.">The pathophysiology and treatment of glaucoma: a review.</a> JAMA. 311 (18), 1901-1911 (2014).</li><li>. Overview | Glaucoma: diagnosis and management | Guidance | NICE Available from: <a target="_blank" href="https://www.nice.org.uk/guidance/ng81">https://www.nice.org.uk/guidance/ng81</a> (2021)</li><li>Michelessi, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optic+nerve+head+and+fibre+layer+imaging+for+diagnosing+glaucoma.">Optic nerve head and fibre layer imaging for diagnosing glaucoma.</a> The Cochrane Database of Systematic Reviews. (11), 008803 (2015).</li><li>Ramli, N. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+use+of+3T+MRI+in+assessment+of+optic+nerve+volume+in+glaucoma.">Novel use of 3T MRI in assessment of optic nerve volume in glaucoma.</a> Graefe's Archive for Clinical and Experimental Ophthalmology. 252 (6), 995-1000 (2014).</li><li>AlRyalat, S. A., Muhtaseb, R., Alshammari, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simulating+a+colour-blind+ophthalmologist+for+diagnosing+and+staging+diabetic+retinopathy.">Simulating a colour-blind ophthalmologist for diagnosing and staging diabetic retinopathy.</a> Eye. , 1-4 (2020).</li><li>Chang, S. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optic+Nerve+Diffusion+Tensor+Imaging+Parameters+and+Their+Correlation+With+Optic+Disc+Topography+and+Disease+Severity+in+Adult+Glaucoma+Patients+and+Controls.">Optic Nerve Diffusion Tensor Imaging Parameters and Their Correlation With Optic Disc Topography and Disease Severity in Adult Glaucoma Patients and Controls.</a> Journal of Glaucoma. 23 (8), 513-520 (2014).</li><li>Omodaka, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Correlation+of+magnetic+resonance+imaging+optic+nerve+parameters+to+optical+coherence+tomography+and+the+visual+field+in+glaucoma.">Correlation of magnetic resonance imaging optic nerve parameters to optical coherence tomography and the visual field in glaucoma.</a> Clinical &amp; Experimental Ophthalmology. 42 (4), 360-368 (2014).</li><li>Ghadimi, M., Sapra, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Magnetic+Resonance+Imaging+Contraindications.">Magnetic Resonance Imaging Contraindications.</a> StatPearls. , (2021).</li><li>B&#228;uerle, J., Schuchardt, F., Schroeder, L., Egger, K., Weigel, M., Harloff, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reproducibility+and+accuracy+of+optic+nerve+sheath+diameter+assessment+using+ultrasound+compared+to+magnetic+resonance+imaging.">Reproducibility and accuracy of optic nerve sheath diameter assessment using ultrasound compared to magnetic resonance imaging.</a> BMC Neurology. 13 (1), 187 (2013).</li><li>Wang, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Orbital+Cerebrospinal+Fluid+Space+in+Glaucoma:+The+Beijing+Intracranial+and+Intraocular+Pressure+(iCOP)+Study.">Orbital Cerebrospinal Fluid Space in Glaucoma: The Beijing Intracranial and Intraocular Pressure (iCOP) Study.</a> Ophthalmology. 119 (10), 2065-2073 (2012).</li><li>Weigel, M., Lagr&#232;ze, W. A., Lazzaro, A., Hennig, J., Bley, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fast+and+Quantitative+High-Resolution+Magnetic+Resonance+Imaging+of+the+Optic+Nerve+at+3.0+Tesla.">Fast and Quantitative High-Resolution Magnetic Resonance Imaging of the Optic Nerve at 3.0 Tesla.</a> Investigative Radiology. 41 (2), 83-86 (2006).</li><li>Yiannakas, M. C., Toosy, A. T., Raftopoulos, R. E., Kapoor, R., Miller, D. H., Wheeler-Kingshott, C. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MRI+Acquisition+and+Analysis+Protocol+for+In+Vivo+Intraorbital+Optic+Nerve+Segmentation+at+3T.">MRI Acquisition and Analysis Protocol for In Vivo Intraorbital Optic Nerve Segmentation at 3T.</a> Investigative Ophthalmology &amp; Visual Science. 54 (6), 4235-4240 (2013).</li><li>Al-Haddad, C. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optic+Nerve+Measurement+on+MRI+in+the+Pediatric+Population:+Normative+Values+and+Correlations.">Optic Nerve Measurement on MRI in the Pediatric Population: Normative Values and Correlations.</a> American Journal of Neuroradiology. 39 (2), 369-374 (2018).</li><li>Mncube, S. S., Goodier, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Normal+measurements+of+the+optic+nerve,+optic+nerve+sheath+and+optic+chiasm+in+the+adult+population.">Normal measurements of the optic nerve, optic nerve sheath and optic chiasm in the adult population.</a> South African Journal of Radiology. 23 (1), 7 (2019).</li><li>Nguyen, B. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ultra-High+Field+Magnetic+Resonance+Imaging+of+the+Retrobulbar+Optic+Nerve,+Subarachnoid+Space,+and+Optic+Nerve+Sheath+in+Emmetropic+and+Myopic+Eyes.">Ultra-High Field Magnetic Resonance Imaging of the Retrobulbar Optic Nerve, Subarachnoid Space, and Optic Nerve Sheath in Emmetropic and Myopic Eyes.</a> Translational Vision Science &amp; Technology. 10 (2), (2021).</li><li>Lagr&#232;ze, W. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Retrobulbar+Optic+Nerve+Diameter+Measured+by+High-Speed+Magnetic+Resonance+Imaging+as+a+Biomarker+for+Axonal+Loss+in+Glaucomatous+Optic+Atrophy.">Retrobulbar Optic Nerve Diameter Measured by High-Speed Magnetic Resonance Imaging as a Biomarker for Axonal Loss in Glaucomatous Optic Atrophy.</a> Investigative Ophthalmology &amp; Visual Science. 50 (9), 4223-4228 (2009).</li><li>Nielsen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Magnetic+Resonance+Imaging+at+3.0+Tesla+Detects+More+Lesions+in+Acute+Optic+Neuritis+Than+at+1.5+Tesla.">Magnetic Resonance Imaging at 3.0 Tesla Detects More Lesions in Acute Optic Neuritis Than at 1.5 Tesla.</a> Investigative Radiology. 41 (2), 76-82 (2006).</li><li>Mafee, M. F., Rapoport, M., Karimi, A., Ansari, S. A., Shah, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Orbital+and+ocular+imaging+using+3-+and+1.5-T+MR+imaging+systems.">Orbital and ocular imaging using 3- and 1.5-T MR imaging systems.</a> Neuroimaging Clinics of North America. 15 (1), 1-21 (2005).</li><li>Gala, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Magnetic+resonance+imaging+of+optic+nerve.">Magnetic resonance imaging of optic nerve.</a> The Indian Journal of Radiology &amp; Imaging. 25 (4), 421-438 (2015).</li><li>Gao, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optic+Nerve+Cross-Sectional+Area+Measurement+with+High-Resolution,+Isotropic+MRI+in+Optic+Neuritis+(P6.159).">Optic Nerve Cross-Sectional Area Measurement with High-Resolution, Isotropic MRI in Optic Neuritis (P6.159).</a> Neurology. 84 (14), (2015).</li><li>Zou, H., M&#252;ller, H. J., Shi, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Non-spatial+sounds+regulate+eye+movements+and+enhance+visual+search.">Non-spatial sounds regulate eye movements and enhance visual search.</a> Journal of Vision. 12 (5), 2 (2012).</li><li>Yang, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Connective+Tissue+Components+of+Optic+Nerve+Head+Cupping+in+Monkey+Experimental+Glaucoma+Part+1:+Global+Change.">The Connective Tissue Components of Optic Nerve Head Cupping in Monkey Experimental Glaucoma Part 1: Global Change.</a> Investigative Ophthalmology &amp; Visual Science. 56 (13), 7661-7678 (2015).</li><li>Mwanza, J. -. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Retinal+nerve+fibre+layer+thickness+floor+and+corresponding+functional+loss+in+glaucoma.">Retinal nerve fibre layer thickness floor and corresponding functional loss in glaucoma.</a> The British Journal of Ophthalmology. 99 (6), 732-737 (2015).</li></ol>

תיארנו פרוטוקול להערכה וכימות של חומר לבן של עצב הראייה שעשוי לשמש להערכת מטופל גלאוקומה. הפרוטוקול משתמש ברצפי הדמיה זמינים נרחבים לרכישת תמונות, והוא משתמש בתוכנת פיג'י בקוד פתוח לניתוח תמונה. תיקנו את פרמטרי התמונה שנמצאו בעבר כמדויקים ביותר וניתן לשחזור גבוהים ביותר ברכישת תמונת עצב ...

גלאוקומה היא נוירופתיה אופטית הנחשבת לסיבה הנפוצה ביותר לעיוורון בלתי הפיך1. למרות זאת, הוא עדיין מובן היטב מבחינת הפתופיזיולוגיה והאבחון שלו, ללא התייחסות סטנדרטית אחת לביסוס האבחנה2. על פי המכון הלאומי למצוינות בבריאות ובטיפול (NICE) האבחנה של גלאוקומה בזווית פתוחה ראשונית (POAG) דורשת הערכה של תחומים מרובים, כולל הערכת דיסק אופטי על בדיקת פונדוס או טומוגרפיה קוהרנטית אופטית (OCT), הערכת שדה ראייה ומדידת לחץ תוך עיני 3. הרעיון מאחורי אבחון גלאוקומה הוא ביסוס נוכחות של נוירופתיה אופטית מתקדמת, אשר ניתן לעשות כמותית על OCT4. בהקשר זה, MRI יכול לשמש גם להערכה וכימות עצב הראייה של אזור החומר הלבן שלה5, אבל כדי שזה יהיה משמעותי מבחינה קלינית, הפרוטוקול המשמש כימות חומר לבן עצב הראייה צריך להיות מתוקנן. יתר על כן, פרוטוקול צריך להכיל גם וריאציה בין אינדיבידואלית, גורם שעשוי להשפיע על הדיוק במחלות שונות6.
הערכת עצב הראייה בגלאוקומה מוערכת באופן אופטימלי באמצעות הדמיה עיניים, כולל OCT, שם מוערך החלק החלקי ביותר של עצב הראייה (למשל, דיסק אופטי). מצד שני, השימוש ב- MRI להערכת עצב הראייה בדרך כלל מעריך את החלק הרטרובולבר של עצב הראייה במרחקים שונים מהגלובוס. מספר מחקרים מצאו מתאם חזק בין הערכת דיסק אופטי באמצעות OCT ו- MRI7,8. עם זאת, עדיין אין פרוטוקול מאוחד להערכת עצב הראייה וכימות על MRI. תיוג הגבול העצבי האופטי ב-MRI שימש לכימות האזור החתך שלו5. עם זאת, שיטה זו יש שונות בין-שיעור ניכרת, כפי שהוא צריך להיעשות על ידי שיעור מנוסה ודורש זמן רב עבור מתווה. מטרת הפרויקט הנוכחי הייתה לספק פרוטוקול למתודולוגיה מאוחדת להערכה וכימות חתך רוחב של עצב הראייה באמצעות 3 T MRI לרכישת תמונות ותוכנת פיג'י של ImageJ לעיבוד וכימות תמונה.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Magnetic resonance imaging (MRI) machine</td>
			<td>Siemens Magnetom Verio</td>
			<td>N/A</td>
			<td>3T MRI scanner</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantification of optic nerve cross sectional area on mri: a novel protocol using fiji software

הערכת עצב הראייה היא היבט חשוב של אבחון גלאוקומה ומעקב. פרויקט זה מתאר פרוטוקול למתודולוגיה מאוחדת של הערכה וכימות חתך של עצב הראייה באמצעות 3 T MRI לרכישת תמונות ותוכנת פיג'י של ImageJ לכימות עיבוד תמונה. רכישת תמונה בוצעה באמצעות 3 T MRI, עם הוראות מתאימות למטופל כדי להבטיח קיבוע ישר במהלך ההדמיה. נעשה שימוש ברצף מודחק שומן משוקלל T2. יש להעלות לתוכנה חתך קורונל שנלקח 3 מ"מ מאחורי הגלובוס וניצב לציר עצב הראייה. באמצעות פונקציית הסף, אזור החומר הלבן של עצב הראייה נבחר ומכומת, ובכך מבטל הטיית מדידה בין-אישית. תיארנו גם את הגבולות הרגילים לאזור חתך עצב הראייה בהתאם לגיל, בהתבסס על ספרות שפורסמה בעבר. השתמשנו בפרוטוקול המתואר כדי להעריך עצב ראייה של חולה גלאוקומה חשוד. אזור חתך עצב הראייה נמצא בגבולות הנורמליים, ממצא שאושר עוד יותר באמצעות טומוגרפיה קוהרנטית אופטית של עצב הראייה.

יחס הכוס לדיסק עבור מטופל בן 30 שהציג לבדיקת עיניים לבדיקה היה 0.8 (איור 1A),שהוא חשוד ועשוי להיות מרמז על גלאוקומה. לאחר ביצוע טומוגרפיה קוהרנטית אופטית לעובי שכבת סיבי עצב, גילינו שעובי העצבים נמצא בגבולות הנורמליים לגיל(איור 1B). החולה תוכנן ל-MRI במסלול, שם הוז?...

Watch this Scientific Journal Video about Quantification of Optic Nerve Cross Sectional Area on MRI: A Novel Protocol using Fiji Software at JoVE.com

Quantification of Optic Nerve Cross Sectional Area on MRI: A Novel Protocol using Fiji Software

סיפקנו פרוטוקול מפורט לשיטה סטנדרטית של הערכה וכימות של עצב הראייה באמצעות MRI, תוך שימוש ברצף הדמיה זמין נרחב ותוכנת גישה פתוחה לניתוח תמונה. בעקבות פרוטוקול מתוקנן זה יספק נתונים משמעותיים להשוואה בין חולים שונים ומחקרים שונים.

כימות אזור חתך עצב הראייה על MRI: פרוטוקול חדשני באמצעות תוכנת פיג'י

Optic nerve assessment is an important aspect of glaucoma diagnosis and follow-up. This project describes a protocol for a unified methodology of optic ...

פרוטוקול זה נועד לתאר שיטות מתוקנן להערכת אזור חתך עצב הראייה באמצעות MRI. נתאר רכישת תמונות באמצעות רצף הדמיה זמין באופן נרחב. אנו גם נתאר ניתוח תמונה באמצעות תוכנת תכונות הקוד הפתוח.אחד השימושים החשובים של פרוטוקול כזה הוא בהערכת חולה גלאוקומה, שם הוא יספק נתונים יקרי ערך על שלמות עצב הראייה. פרוטוקול רכישת התמונה יתחיל בהסבר מלא של הבדיקה למטופל, וכי יש לבצע את ההוראות הבאות. תצטרכי להחליף לשמלה מיוחדת להדמיה.אתה צריך לוודא לא לשאת או ללבוש כל חומר מתכתי, זה עשוי לכלול כמה סוגים של מסכות פנים. ייתכן שמכשירים מושתלים מסוימים לא יהיו תואמים להדמיית MRI, הדבר עשוי לכלול קוצבי לב ומשאבות אינסולין. עליך ליידע את הרופא על כל חפץ מתכתי שנותר בתוך גופך.בשל המרחב הסגור של מכונת ה- MRI, ייתכן שהבחינה לא תתאים לחולים עם קלסטרופוביה. הבדיקה צפויה להימשך 15 דקות שבהן המטופל נדרש להישאר במקום. טופס הסכמה מתאים צריך להיות חתום על ידי המטופל.לפני ההדמיה, הרופא יסביר למטופל את הצעדים וינחה אותו להתמקד במטרה ישרה בתוך מכונת ה-MRI, על מנת לקבל תמונה מכוונת כראוי. אמצעי זהירות נוספים מוסברים ומנגנוני בטיחות, כגון אוזניות וכפתור מצוקה מסופקים למטופל כדי להבטיח בדיקה נכונה ונוחה. חתך קורונל של עצב הראייה יילקח אורתוגונל, כלומר.בניצב לעצב שלושה מילימטרים אחוריים לכדור הארץ. תמונות צופים במישורי הקשת האלפי ישמשו להבטחת כיוון אופטימלי של עצב הראייה ומיצוב צומת גלובוס עצב הראייה. איכות קיבוע מבט ניתן לגשת על ידי התפלגות CSF סביב עצב הראייה, שם זה צריך להיות מחולק באופן אחיד סביב העצב עם עובי כמעט שווה מכל הצדדים.הזן את הפרמטרים הבאים עבור רכישת תמונה. ברצף דיכוי שומן משוקלל T2, TR, 3000 אלפיות השנייה. ת"א, 90 אלפיות השנייה.שדה ראייה, 16 על 16 ס"מ. מטריקס, 296 על 384. עובי פרוסה, שלושה מילימטרים.מרווח פרוסה, 0.3 מילימטרים. התמונה הסופית שנותחה הייתה תמונה קורונית עקשנית, שלושה מילימטרים מאחורי הגלובוס. עבור פרוטוקול ניתוח התמונה, נתחיל על ידי הורדת חבילת עיבוד התמונה פיג'י imagej.net.נתחיל על ידי הולך לאתר האינטרנט שלהם, בחירת הורדות, פיג'י, ולאחר מכן בחירת הגירסה המתאימה עבור המכשיר שלך. לאחר ההתקנה, הפעל את תוכנית פיג'י. העלה את התמונה הקוורלית של עצב הראייה לתוכנית על ידי בחירת קובץ, פתח ולאחר מכן בחירת התמונה קורונל הרצוי.שים לב שעליך לשמור על איכות התמונה במהלך ההעברה, מכיוון שלא תעשה זאת יגרום לתוצאות ניתוח תמונה לא אמינות. תקן את קנה המידה על-ידי ציון מספר הפיקסלים ליחידת אורך. ניתן לעשות זאת על-ידי ציור קו ישר בסולם המפה.לאחר מכן בחרו 'קבע קנה מידה' בשורת התפריטים 'נתח'. ציין את אורך הקו כפי שמופיע בסולם המפה עם יחידת האורך המתאימה. המירו את התמונה לקנה מידה אפור בעזרת תפריט 'תמונה', ולאחר מכן בחרו 'אות' ולאחר מכן ב-8 סיביות.כימות טווח העוצמה של פיקסלים של חומר לבן, בחר בכלי בחירת לאסו על-ידי שימוש בתפריט תוסף, סגמנטציה ולאחר מכן בחירת לאסו, ולאחר מכן בחר אזור מספיק של חומר לבן. כדי להרחיב את האזור, החזק את מקש Shift לחוץ והרחב את החומר הלבן. ודא שאינך מכסה כל חומר אפור במהלך התהליך.מספיק שטח נבחר של 1000 פיקסלים. באפשרותך לוודא שבחרת 1000 פיקסלים על-ידי כך שתבצע ניתוח ולאחר מכן מדוד כדי לכמת את האזור שנבחר. פתחו את הכלי היסטוגרמה מתפריט 'ניתוח', המציג את התפלגות עוצמת הפיקסלים באזור החומר הלבן שנבחר.לחץ על התיבה Live כדי לוודא שההיסטוגרמה מעריכה את האזור שנבחר. הגרף על היסטוגרמה צריך להראות התפלגות נורמלית של אינטנסיביות. חשב את טווח עוצמת החומר הלבן כדלקמן, גבול נמוך הוא עוצמה ממוצעת, מינוס שלוש פעמים סטיית תקן.במקרה שלנו, זה 94.372, מינוס שלוש, כפול 7.085. הגבול העליון הוא עוצמה ממוצעת, בתוספת פי שלוש סטיית תקן. במקרה שלנו, זה 94.372, ועוד שלוש כפול 7.085.לפתיחת הכלי סף, עבור לתפריט תמונה ולאחר מכן התאם ולאחר מכן בחר סף. ציין את הטווח המחושב מהשלב הקודם על-ידי בחירת ערכה ולאחר מכן הקלדה בגבול העליון והתחתון. במקרה שלנו, זה 73 ו-115.סמן את פונקציית הרקע הכהה בלבד וציין ביאורים בשחור-לבן, B&W, מהרשימה הנפתחת ולאחר מכן לחץ על החל. המסכה לחומר לבן הנמצאת בתוך הדיסק האופטי תופיע. באמצעות כלי הבחירה של לאסו, שניתן לבחור מתפריט תוסף, כפי שהוסבר לעיל, או מתפריט 'בחירה מהירה', בחר את האזור השחור המייצג את הדיסק האופטי.השתמש בפונקציית המידה שורת התפריטים נתח כדי לחשב את האזור של הדיסק האופטי הנמדד בסנטימטרים. במקרה שלנו, זה 0.069. יחס הכוס לדיסק עבור מטופל זכר בן 30 שהציג לבדיקת בדיקת עיניים היה 0.8, וזה חשוד ועשוי להיות מרמז על גלאוקומה.עם ביצוע טומוגרפיה קוהרנטית אופטית לעובי שכבת סיבי עצב, מצאנו כי עובי העצבים היה בגבול הנורמלי לגיל. החולה תוכנן לבדיקת MRI בראש, שם הוזמן חתך קורונל להערכת עצב הראייה, כמפורט בפרוטוקול שהוזכר קודם לכן. השגנו את ה-MRI קורונל לחתוך שלושה מילימטרים מאחורי הדיסק האופטי.חומר לבן ממוצע עוצמה הייתה 94.372, סטיית תקן 7.085, אשר הביא טווח עוצמת החומר הלבן של גבול תחתון, 94.372 פחות 21.255, שווה 73.117. גבול עליון, 94.372, ועוד 21.255, שווה 115.627. איור 2A מציג את התמונה החשופה.איור 2B מציג את התמונה העגמומית לאחר החלת סף החומר הלבן באמצעות הגבולות העליונים והתחתונים המחושב. בעוד איור 2C מראה את החומר הלבן עצב הראייה לכימות. האזור החתך של החומר הלבן של עצב הראייה השמאלי היה 6.9 מילימטרים בריבוע, וזה בגבולות הנורמליים לגילו.סיפקנו פרוטוקול מפורט לשיטה סטנדרטית להערכה וכימות של עצב הראייה באמצעות מכונות MRI, שרופאים שאינם מתמחים יכולים לבצע באמינות גבוהה. אנו ממליצים לאמץ פרוטוקול זה למחקרים על הערכת עצב הראייה, אשר יאפשר השוואה בין ממצאי המחקר. יתר על כן, אנו ממליצים על השימוש בפרוטוקול זה כאשר תמונות MRI מצווה לא לכלול גורמים משניים של נוירופתיה עצבית אופטית וגלאוקומה.

Research

JoVE Journal

Medicine

A Novel Technique of Rescuing Capsulorhexis Radial Tear-out using a Cystotome

טכניקה חדשנית של Capsulorhexis הצלת מחוגי מדמיע-out באמצעות Cystotome

Part 1 : Purpose:   To demonstrate a capsulorhexis radial tear out rescue technique using a cystotome on a virtual reality cataract surgery simulator and ...

MRI-guided Disruption of the Blood-brain Barrier using Transcranial Focused Ultrasound in a Rat Model

MRI-מודרך שיבוש של מחסום דם מוח באמצעות אולטרסאונד ממוקד Transcranial מודל עכברים

Focused ultrasound (FUS) disruption of the blood-brain barrier (BBB) is an increasingly investigated technique for circumventing the BBB1-5. The BBB is a ...

Epidural Intracranial Pressure Measurement in Rats Using a Fiber-optic Pressure Transducer

מדידת לחץ תוך גולגולתי אפידורל בחולדות באמצעות מתמר סיבים אופטיים לחץ

Elevated intracranial pressure (ICP) is a significant problem in several forms of ischemic brain injury including stroke, traumatic brain injury and ...

A Three-dimensional Tissue Culture Model to Study Primary Human Bone Marrow and its Malignancies

דגם תרבות רקמות תלת ממדי למחקר עיקרי עצם אדם מח וממאיר שלו

Tissue culture has been an invaluable tool to study many aspects of cell function, from normal development to disease. Conventional cell culture methods ...

Candida albicans Biofilm Development on Medically-relevant Foreign Bodies in a Mouse Subcutaneous Model Followed by Bioluminescence Imaging

Candida albicans Biofilm Development on Medically-relevant Foreign Bodies in a Mouse Subcutaneous Model Followed by Bioluminescence Imaging

קנדידה אלביקנס Biofilm פיתוח על גופי חוץ-רפואי רלוונטיים בתת עורי מודל עכבר ואחרי פליטת אור הדמיה

Candida albicans biofilm development on biotic and/or abiotic surfaces represents a specific threat for hospitalized patients. So far, C. albicans ...

Quantification of the Immunosuppressant Tacrolimus on Dried Blood Spots Using LC-MS/MS

כימות של Tacrolimus לדיכוי מערכת החיסון בכתמי דם יבש באמצעות LC-MS / MS

The calcineurin inhibitor tacrolimus is the cornerstone of most immunosuppressive treatment protocols after solid organ transplantation in the United ...

A Multicenter MRI Protocol for the Evaluation and Quantification of Deep Vein Thrombosis

MRI פרוטוקול Multicenter להערכה וכימות של פקקת וריד העמוק

We evaluated a magnetic resonance venography (MRV) approach with gadofosveset to quantify total thrombus volume changes as the principal criterion for ...

A Step by Step Protocol for Subretinal Surgery in Rabbits

צעד אחר פרוטוקול שלב לכירורגיה subretinal בארנבונים

Age related macular degeneration (AMD), retinitis pigmentosa, and other RPE related diseases are the most common causes for irreversible loss of vision in ...

A Detailed Protocol for Perspiration Monitoring Using a Novel, Small, Wireless Device

פרוטוקול מפורט עבור ניטור זיעה באמצעות רומן, קטן, מכשיר אלחוטי

Perspiration monitoring can be utilized for the detection of certain diseases, such as thermoregulation and mental disorders, particularly when the ...

A Rabbit Venous Interposition Model Mimicking Revascularization Surgery using Vein Grafts to Assess Intimal Hyperplasia under Arterial Blood Pressure

ורידי ארנב מודל האינטרפוזיציה מחקה ניתוח מחדש באמצעות שתלי וריד כדי להעריך את היפרפלזיה באמצעות לחץ דם עורקי

Although vein grafts have been commonly used as autologous grafts in revascularization surgeries for ischemic diseases, the long-term patency remains poor ...