Name: quantification of optic nerve cross sectional area on mri: a novel protocol using fiji software
Uploaded: 2021-09-04T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Quantification of Optic Nerve Cross Sectional Area on MRI: A Novel Protocol using Fiji Software at JoVE.com

Faris Haddad ve Hasan El İsa'ya video çekimi ve geliştirilmesindeki önemli katkıları için teşekkür ederiz.

Aşağıdaki çalışma Ürdün Üniversitesi Hastanesi araştırma komitesi ve kurumsal inceleme kurulu tarafından onaylanmıştır. Aşağıdaki protokol, MRI görüntülerini elde etmek için kullanılan görüntüleme tekniğini ve ardından Fiji yazılımını kullanarak görüntü işleme ve optik sinir nicelemesini açıklayacaktır.
1. MRI görüntü alımı
NOT: MR görüntü alımı, çokplaner T2 ağırlıklı yağ bastırma sırası(Malzeme Tablos...

<ol>
	<li>Quigley, H. A., Broman, A. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+number+of+people+with+glaucoma+worldwide+in+2010+and+2020.">The number of people with glaucoma worldwide in 2010 and 2020.</a> The British Journal of Ophthalmology. 90 (3), 262-267 (2006).</li><li>Weinreb, R. N., Aung, T., Medeiros, F. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+pathophysiology+and+treatment+of+glaucoma:+a+review.">The pathophysiology and treatment of glaucoma: a review.</a> JAMA. 311 (18), 1901-1911 (2014).</li><li>. Overview | Glaucoma: diagnosis and management | Guidance | NICE Available from: <a target="_blank" href="https://www.nice.org.uk/guidance/ng81">https://www.nice.org.uk/guidance/ng81</a> (2021)</li><li>Michelessi, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optic+nerve+head+and+fibre+layer+imaging+for+diagnosing+glaucoma.">Optic nerve head and fibre layer imaging for diagnosing glaucoma.</a> The Cochrane Database of Systematic Reviews. (11), 008803 (2015).</li><li>Ramli, N. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Novel+use+of+3T+MRI+in+assessment+of+optic+nerve+volume+in+glaucoma.">Novel use of 3T MRI in assessment of optic nerve volume in glaucoma.</a> Graefe's Archive for Clinical and Experimental Ophthalmology. 252 (6), 995-1000 (2014).</li><li>AlRyalat, S. A., Muhtaseb, R., Alshammari, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Simulating+a+colour-blind+ophthalmologist+for+diagnosing+and+staging+diabetic+retinopathy.">Simulating a colour-blind ophthalmologist for diagnosing and staging diabetic retinopathy.</a> Eye. , 1-4 (2020).</li><li>Chang, S. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optic+Nerve+Diffusion+Tensor+Imaging+Parameters+and+Their+Correlation+With+Optic+Disc+Topography+and+Disease+Severity+in+Adult+Glaucoma+Patients+and+Controls.">Optic Nerve Diffusion Tensor Imaging Parameters and Their Correlation With Optic Disc Topography and Disease Severity in Adult Glaucoma Patients and Controls.</a> Journal of Glaucoma. 23 (8), 513-520 (2014).</li><li>Omodaka, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Correlation+of+magnetic+resonance+imaging+optic+nerve+parameters+to+optical+coherence+tomography+and+the+visual+field+in+glaucoma.">Correlation of magnetic resonance imaging optic nerve parameters to optical coherence tomography and the visual field in glaucoma.</a> Clinical &amp; Experimental Ophthalmology. 42 (4), 360-368 (2014).</li><li>Ghadimi, M., Sapra, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Magnetic+Resonance+Imaging+Contraindications.">Magnetic Resonance Imaging Contraindications.</a> StatPearls. , (2021).</li><li>B&#228;uerle, J., Schuchardt, F., Schroeder, L., Egger, K., Weigel, M., Harloff, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reproducibility+and+accuracy+of+optic+nerve+sheath+diameter+assessment+using+ultrasound+compared+to+magnetic+resonance+imaging.">Reproducibility and accuracy of optic nerve sheath diameter assessment using ultrasound compared to magnetic resonance imaging.</a> BMC Neurology. 13 (1), 187 (2013).</li><li>Wang, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Orbital+Cerebrospinal+Fluid+Space+in+Glaucoma:+The+Beijing+Intracranial+and+Intraocular+Pressure+(iCOP)+Study.">Orbital Cerebrospinal Fluid Space in Glaucoma: The Beijing Intracranial and Intraocular Pressure (iCOP) Study.</a> Ophthalmology. 119 (10), 2065-2073 (2012).</li><li>Weigel, M., Lagr&#232;ze, W. A., Lazzaro, A., Hennig, J., Bley, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fast+and+Quantitative+High-Resolution+Magnetic+Resonance+Imaging+of+the+Optic+Nerve+at+3.0+Tesla.">Fast and Quantitative High-Resolution Magnetic Resonance Imaging of the Optic Nerve at 3.0 Tesla.</a> Investigative Radiology. 41 (2), 83-86 (2006).</li><li>Yiannakas, M. C., Toosy, A. T., Raftopoulos, R. E., Kapoor, R., Miller, D. H., Wheeler-Kingshott, C. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=MRI+Acquisition+and+Analysis+Protocol+for+In+Vivo+Intraorbital+Optic+Nerve+Segmentation+at+3T.">MRI Acquisition and Analysis Protocol for In Vivo Intraorbital Optic Nerve Segmentation at 3T.</a> Investigative Ophthalmology &amp; Visual Science. 54 (6), 4235-4240 (2013).</li><li>Al-Haddad, C. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optic+Nerve+Measurement+on+MRI+in+the+Pediatric+Population:+Normative+Values+and+Correlations.">Optic Nerve Measurement on MRI in the Pediatric Population: Normative Values and Correlations.</a> American Journal of Neuroradiology. 39 (2), 369-374 (2018).</li><li>Mncube, S. S., Goodier, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Normal+measurements+of+the+optic+nerve,+optic+nerve+sheath+and+optic+chiasm+in+the+adult+population.">Normal measurements of the optic nerve, optic nerve sheath and optic chiasm in the adult population.</a> South African Journal of Radiology. 23 (1), 7 (2019).</li><li>Nguyen, B. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ultra-High+Field+Magnetic+Resonance+Imaging+of+the+Retrobulbar+Optic+Nerve,+Subarachnoid+Space,+and+Optic+Nerve+Sheath+in+Emmetropic+and+Myopic+Eyes.">Ultra-High Field Magnetic Resonance Imaging of the Retrobulbar Optic Nerve, Subarachnoid Space, and Optic Nerve Sheath in Emmetropic and Myopic Eyes.</a> Translational Vision Science &amp; Technology. 10 (2), (2021).</li><li>Lagr&#232;ze, W. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Retrobulbar+Optic+Nerve+Diameter+Measured+by+High-Speed+Magnetic+Resonance+Imaging+as+a+Biomarker+for+Axonal+Loss+in+Glaucomatous+Optic+Atrophy.">Retrobulbar Optic Nerve Diameter Measured by High-Speed Magnetic Resonance Imaging as a Biomarker for Axonal Loss in Glaucomatous Optic Atrophy.</a> Investigative Ophthalmology &amp; Visual Science. 50 (9), 4223-4228 (2009).</li><li>Nielsen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Magnetic+Resonance+Imaging+at+3.0+Tesla+Detects+More+Lesions+in+Acute+Optic+Neuritis+Than+at+1.5+Tesla.">Magnetic Resonance Imaging at 3.0 Tesla Detects More Lesions in Acute Optic Neuritis Than at 1.5 Tesla.</a> Investigative Radiology. 41 (2), 76-82 (2006).</li><li>Mafee, M. F., Rapoport, M., Karimi, A., Ansari, S. A., Shah, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Orbital+and+ocular+imaging+using+3-+and+1.5-T+MR+imaging+systems.">Orbital and ocular imaging using 3- and 1.5-T MR imaging systems.</a> Neuroimaging Clinics of North America. 15 (1), 1-21 (2005).</li><li>Gala, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Magnetic+resonance+imaging+of+optic+nerve.">Magnetic resonance imaging of optic nerve.</a> The Indian Journal of Radiology &amp; Imaging. 25 (4), 421-438 (2015).</li><li>Gao, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Optic+Nerve+Cross-Sectional+Area+Measurement+with+High-Resolution,+Isotropic+MRI+in+Optic+Neuritis+(P6.159).">Optic Nerve Cross-Sectional Area Measurement with High-Resolution, Isotropic MRI in Optic Neuritis (P6.159).</a> Neurology. 84 (14), (2015).</li><li>Zou, H., M&#252;ller, H. J., Shi, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Non-spatial+sounds+regulate+eye+movements+and+enhance+visual+search.">Non-spatial sounds regulate eye movements and enhance visual search.</a> Journal of Vision. 12 (5), 2 (2012).</li><li>Yang, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Connective+Tissue+Components+of+Optic+Nerve+Head+Cupping+in+Monkey+Experimental+Glaucoma+Part+1:+Global+Change.">The Connective Tissue Components of Optic Nerve Head Cupping in Monkey Experimental Glaucoma Part 1: Global Change.</a> Investigative Ophthalmology &amp; Visual Science. 56 (13), 7661-7678 (2015).</li><li>Mwanza, J. -. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Retinal+nerve+fibre+layer+thickness+floor+and+corresponding+functional+loss+in+glaucoma.">Retinal nerve fibre layer thickness floor and corresponding functional loss in glaucoma.</a> The British Journal of Ophthalmology. 99 (6), 732-737 (2015).</li></ol>

Glokom hasta değerlendirmesi için kullanılabilecek optik sinir beyazı maddesini değerlendirmek ve ölçmek için bir protokol tanımladık. Protokol, görüntü alımı için yaygın olarak kullanılabilen görüntüleme dizilerini kullanır ve görüntü analizi için açık kaynaklı Fiji yazılımını kullanır. Daha önce optik sinir görüntüsü alımında en doğru ve yüksek oranda tekrarlanabilir olduğu tespit edilen görüntü parametrelerini standartlaştırdık, hastadan düz bir şekilde sabitlenerek ...

Glokom, geri dönüşü olmayan körlüğün en yaygın nedeni olarak kabul edilen optik bir nöropatidir1. Buna rağmen, patofizyolojisi ve tanısı açısından hala yezih anlaşılmaktadır, tanıyı belirlemek için tek bir standart referans yoktur2. Ulusal Sağlık ve Bakım Mükemmelliği Enstitüsü'ne (NICE) göre, primer açık açılı glokom (POAG) tanısı, fundus sınavı veya optik tutarlılık tomografisi (OCT) görüntüleme, görsel alan değerlendirmesi ve göz içi basınç ölçümü 3dahil olmak üzere birden fazla alanın değerlendirilmesini gerektirir. Glokom tanısının arkasındaki fikir, OCT4'tenicel olarak yapılabilen ilerleyen optik nöropatinin varlığını belirlemektir. Bu bağlamda, MRI optik sinir değerlendirmesi ve beyaz madde alanının nicelemesi için de kullanılabilir5, ancak bunun klinik olarak anlamlı olması için optik sinir beyaz madde nicelemesinde kullanılan protokolün standartlaştırılması gerekir. Ayrıca, bir protokol, farklı hastalıklarda doğruluğu etkileyebilecek bir faktör olan bireyler arası varyasyonu da karşılamalıdır6.
Glokomda optik sinir değerlendirmesi, optik sinirin en ön kısmının (örneğin optik disk) değerlendirildiği OCT dahil olmak üzere oftalmik görüntüleme ile en iyi şekilde değerlendirilir. Öte yandan, optik sinir değerlendirmesi için MRG kullanımı genellikle optik sinirin retrobulbar kısmını dünya çapından çeşitli mesafelerde değerlendirir. Çeşitli çalışmalar OCT ve MRI7,8kullanılarak optik disk değerlendirmesi arasında güçlü bir korelasyon buldu. Bununla birlikte, MRG'de optik sinir değerlendirmesi ve niceliği için hala birleşik bir protokol yoktur. MRG'deki optik sinir kenarlığının ana hatları kesitsel alanını ölçmek için kullanılmıştır5. Bununla birlikte, bu yöntem deneyimli bir oranlayıcı tarafından yapılması gerektiğinden ve anahat için önemli bir zaman gerektirdiği için önemli bir oranlar arası değişkenliğe sahiptir. Mevcut projenin amacı, görüntü alımı için 3 T MRI ve görüntü işleme ve niceleme için ImageJ'in Fiji yazılımı kullanılarak optik sinir kesitsel değerlendirme ve niceleme için birleşik bir metodoloji için bir protokol sağlamaktı.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Magnetic resonance imaging (MRI) machine</td>
			<td>Siemens Magnetom Verio</td>
			<td>N/A</td>
			<td>3T MRI scanner</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

quantification of optic nerve cross sectional area on mri: a novel protocol using fiji software

Optik sinir değerlendirmesi glokom tanı ve takibinin önemli bir yönüdür. Bu proje, görüntü alımı için 3 T MRI ve görüntü işleme nicelemesi için ImageJ'in Fiji yazılımı kullanılarak optik sinir kesitsel değerlendirme ve nicelemenin birleşik bir metodolojisi için bir protokol açıklamaktadır. Görüntü alımı, görüntüleme sırasında düz fiksasyonu sağlamak için hastanın uygun talimatlarla birlikte 3 T MR kullanılarak gerçekleştirildi. T2 ağırlıklı yağ baskılanmış dizi kullanıldı. Dünyanın 3 mm gerisinden alınan ve optik sinir eksenine dik bir koronal kesim yazılıma yüklenmelidir. Eşik fonksiyonu kullanılarak, optik sinirin beyaz madde alanı seçilir ve ölçülür, böylece bireyler arası ölçüm önyargısı ortadan kalkar. Ayrıca daha önce yayınlanan literatüre dayanarak, yaşa göre optik sinir kesit alanı için normal sınırları tanımladık. Şüpheli bir glokom hastasının optik sinirini değerlendirmek için tarif edilen protokolü kullandık. Optik sinir kesit alanının normal sınırlar içinde olduğu tespit edildi, bu da optik sinirin optik tutarlılık tomografisi ile daha da doğrulandı.

Checkup oftalmolojisi muayenesine başvuran 30 yaşındaki erkek hastanın fincandan diske oranı 0.8(Şekil 1A)idi, bu şüpheli ve glokom düşündürücü olabilir. Sinir lifi tabakası kalınlığı için optik koherens tomografisi yapıldıktan sonra sinir kalınlığının yaş için normal sınırlar içinde olduğunu gördük (Şekil 1B). Hastanın yörünge MRI'ı için planlandı, burada optik sinir değerlendirmesi için koronal bir kesim emredildi ve...

Watch this Scientific Journal Video about Quantification of Optic Nerve Cross Sectional Area on MRI: A Novel Protocol using Fiji Software at JoVE.com

Quantification of Optic Nerve Cross Sectional Area on MRI: A Novel Protocol using Fiji Software

MRI kullanarak standartlaştırılmış bir optik sinir değerlendirmesi ve niceleme yöntemi, yaygın olarak bulunan bir görüntüleme dizisi ve görüntü analizi için açık erişim yazılımı için ayrıntılı bir protokol sağladık. Bu standartlaştırılmış protokolün ardından farklı hastalar ve farklı çalışmalar arasında karşılaştırma için anlamlı veriler sağlayacaktır.

MRG'de Optik Sinir Kesit Alanının Nicelemesi: Fiji Yazılımını Kullanan Yeni Bir Protokol

Optic nerve assessment is an important aspect of glaucoma diagnosis and follow-up. This project describes a protocol for a unified methodology of optic ...

Bu protokol, MRG kullanılarak optik sinir kesit alanı değerlendirmesi için standartlaştırılmış yöntemleri tanımlamayı amaçlamaktadır. Yaygın olarak kullanılabilen görüntüleme dizisini kullanarak görüntü alımını açıklayacağız. Ayrıca açık kaynaklı özellik yazılımını kullanarak görüntü analizini açıklayacağız.Bu protokolün önemli kullanımlarından biri, optik sinir bütünlüğü hakkında değerli veriler sağlayacağı glokom hasta değerlendirmesindedir. Görüntü alma protokolü, hastaya muayenenin tam olarak açıklanmasıyla başlayacak ve aşağıdaki talimatlara uyulması gerektiği. Görüntüleme için özel bir gece elbisesine dönüşmeniz gerekecektir.Metalik malzeme taşımadığınızdan veya takmadığınızdan emin olmanız gerekir, bu bazı yüz maskeleri içerebilir. Bazı implante edilebilir cihazlar MRI görüntüleme ile uyumlu olmayabilir, bu kalp pilleri ve insülin pompaları içerebilir. Vücudunuzun içinde kalan herhangi bir metalik nesneyi hekime bildirmelisiniz.MR makinesinin kapalı alanı nedeniyle, muayene klostrofobisi olan hastalar için uygun olmayabilir. Hastanın hareketsiz kalması gereken sınava 15 dakika süre verilmesi bekleniyor. Hasta tarafından uygun bir onay formunun imzalanması gerekir.Görüntülemeden önce, hekim hastaya adımları açıklayacak ve düzgün bir şekilde yönlendirilmiş bir görüntü elde etmek için MR makinesi içinde düz bir hedefe odaklanmalarını sağlayacaktır. Daha fazla önlem açıklanır ve uygun ve rahat bir muayene sağlamak için hastaya kulaklık ve panik düğmesi gibi güvenlik cihazları sağlanır. Optik sinirin koronal bir kesimi ortogonal, yani alınacaktır.dünyaya üç milimetrelik posterior sinire dik. Transfer testeres ve eğik sagittal düzlemlerdeki scout görüntüleri, optimum optik sinir yönü ve optik sinir küre kavşak konumlandırmasını sağlamak için kullanılacaktır. Bakış fiksasyonunun kalitesine, her tarafta neredeyse eşit kalınlıkta sinirin etrafına eşit olarak dağıtılması gereken optik sinirin etrafındaki CSF dağılımı ile erişilebilir.Görüntü alımı için aşağıdaki parametreleri girin. T2 ağırlıklı yağ bastırma sekansında, TR, 3000 milisaniye. TE, 90 milisaniye.Görüş alanı, 16'ya 16 santimetre. Matrix, 296'ya 384. Dilim kalınlığı, üç milimetre.Dilim boşluğu, 0.3 milimetre. Analiz edilen son görüntü, dünyanın üç milimetre gerisinde eğik bir koronal görüntüydü. Görüntü analizi protokolü için, fiji görüntü işleme paketini imagej.net'dan indirerek başlayacağız.Web sitelerine giderek, İndirilenler, Fiji'yi seçerek ve ardından cihazınız için uygun sürümü seçerek başlayacağız. Yükledikten sonra Fiji programını başlatın. Dosya, Aç'ı seçip ardından istediğiniz koronal görüntüyü seçerek optik sinirin koronal görüntüsünü programa yükleyin.Bunu yapmamanız güvenilir olmayan görüntü analizi sonuçlarına neden olacağı için aktarım sırasında görüntü kalitesini korumanız gerektiğini lütfen unutmayın. Bir uzunluk birimi başına piksel sayısını belirterek ölçeği standartlaştırın. Bu, harita ölçeğinde düz bir çizgi çizilerek yapılabilir.Ardından Çözümle menü çubuğundan Ölçeği Ayarla'yı seçin. Uygun uzunluk birimiyle harita ölçeğinde göründüğü gibi satırın uzunluğunu belirtin. Görüntü menüsünü kullanarak görüntüyü gri ölçeğe dönüştürün, sonra Yaz'ı ve ardından 8 bit'i seçin.Beyaz madde piksellerinin yoğunluk aralığını ölçerek, Eklenti menüsüne, Segmentasyon'a, ardından Kement seçimine giderek Kement Seçimi aracını seçin, ardından yeterli bir beyaz madde alanı seçin. Alanı genişletmek için Shift tuşunu basılı tutun ve beyaz maddeyi genişletin. İşlem sırasında herhangi bir gri maddeyi kapsamadığınızı unutmayın.Toplam seçilen alan 1000 piksel yeterlidir. Seçili alanı ölçmek için Analiz et ve ölç'e giderek 1000 piksel seçtiğinizden emin olabilirsiniz. Piksel yoğunluğunun seçilen beyaz madde alanındaki dağılımını gösteren Histogram aracını Analiz menüsünden açın.Histogramın seçili alanı değerlendirdiğinden emin olmak için Canlı kutusunu tıklatın. Histogramdaki grafik normal bir yoğunluk dağılımı göstermelidir. Beyaz madde yoğunluk aralığını aşağıdaki gibi hesaplayın, düşük sınır ortalama yoğunluk, eksi üç kat standart sapmadır.Bizim durumumuz için bu 94.372, eksi üç, 7.085 ile çarpılmış. Üst sınır ortalama yoğunluk, artı standart sapmanın üç katıdır. Bizim durumumuz için 94.372 artı üç kez 7.085.Eşik aracını açmak için Görüntü menüsüne gidin ve Ardından Ayarla'yı seçin ve Eşik'i seçin. Kümeyi seçip üst ve alt sınırı yazarak önceki adımdan hesaplanan aralığı belirtin. Bizim durumumuzda, 73 ve 115.Yalnızca Koyu Arka Plan işlevini işaretleyin ve açılan listeden siyah beyaz ek açıklamaları belirtin, B&W, ardından Uygula'yı tıklatın. Optik disk içinde bulunan beyaz madde maskesi görünecektir. Yukarıda açıklandığı gibi Eklenti menüsünden veya Hızlı Seçim menüsünden seçilebilen Kement seçim aracını kullanarak, optik diski temsil eden siyah alanı seçin.Santimetre olarak ölçülen optik diskin alanını hesaplamak için Analiz Et menü çubuğundaki ölçü işlevini kullanın. Bizim durumumuzda ise 0.069. Oftalmoloji kontrol muayenesi için başvuran 30 yaşındaki bir erkek hastanın fincandan diske oranı 0.8 idi, bu şüpheli ve glokom düşündürücü olabilir.Sinir lifi tabakası kalınlığı için optik koherens tomografisi yapıldıktan sonra sinir kalınlığının yaş için normal sınırda olduğunu gördük. Hasta, daha önce bahsedilen protokolde ayrıntılı olarak belirtildiği gibi optik sinir değerlendirmesi için koronal kesimin emredildiği bir kafa MR'ı için planlandı. Optik diskin arkasında üç milimetrelik koronal MRI kesimini elde ettik.Beyaz madde ortalama yoğunluğu 94.372, standart sapma 7.085, bu da alt sınır beyaz madde yoğunluğu aralığı, 94.372 eksi 21.255, eşittir 73.117 idi. Üst sınır, 94.372, artı 21.255, 115.627'ye eşittir. Şekil 2A koronal görüntüyü göstermektedir.Şekil 2B, hesaplanan üst ve alt sınırları kullanarak beyaz madde eşiğini uyguladıktan sonra koronal görüntüyü gösterir. Şekil 2C'de nicelik için optik sinir beyazı maddesi gösterilirken. Sol optik sinirin beyaz maddesinin kesit alanı 6.9 milimetre kareydi, bu da yaşına göre normal sınırlar içindeydi.Uzman olmayan tıp doktorlarının yüksek güvenilirlikle yürütebileceği MRI makinelerini kullanarak optik sinir değerlendirmesi ve niceleme için standartlaştırılmış bir yöntem için ayrıntılı bir protokol sağladık. Çalışma bulguları arasında karşılaştırma sağlayacak optik sinir değerlendirmesi ile ilgili çalışmalar için bu protokolün kabul edilmesini öneririz. Ayrıca, MRI görüntülerinin optik sinir nöropatisi ve glokomun ikincil nedenlerini dışlaması emredildiğinde bu protokolün kullanılmasını öneririz.

Research

JoVE Journal

Medicine

A Novel Technique of Rescuing Capsulorhexis Radial Tear-out using a Cystotome

Bir Cystotome kullanarak Radyal Kurtarma kapsüloreksis Roman Tekniği Gözyaşı-

Part 1 : Purpose:   To demonstrate a capsulorhexis radial tear out rescue technique using a cystotome on a virtual reality cataract surgery simulator and ...

MRI-guided Disruption of the Blood-brain Barrier using Transcranial Focused Ultrasound in a Rat Model

Sıçan Modelinde Transkraniyal Odaklanmış Ultrason kullanarak Kan-beyin bariyeri MRG eşliğinde bozulması

Focused ultrasound (FUS) disruption of the blood-brain barrier (BBB) is an increasingly investigated technique for circumventing the BBB1-5. The BBB is a ...

Epidural Intracranial Pressure Measurement in Rats Using a Fiber-optic Pressure Transducer

Bir Fiber optik Basıç kullanarak Sıçanlarda Epidural İntrakraniyal Basınç Ölçümü

Elevated intracranial pressure (ICP) is a significant problem in several forms of ischemic brain injury including stroke, traumatic brain injury and ...

A Three-dimensional Tissue Culture Model to Study Primary Human Bone Marrow and its Malignancies

İlköğretim İnsan Kemik İliği ve Maligniteleri Eğitim Bir Üç boyutlu Doku Kültürü Modeli

Tissue culture has been an invaluable tool to study many aspects of cell function, from normal development to disease. Conventional cell culture methods ...

Candida albicans Biofilm Development on Medically-relevant Foreign Bodies in a Mouse Subcutaneous Model Followed by Bioluminescence Imaging

Candida albicans Biofilm Development on Medically-relevant Foreign Bodies in a Mouse Subcutaneous Model Followed by Bioluminescence Imaging

Biyoparlaklık Görüntüleme Ardından Fare Subkutan Modeli Tıbben-ilgili yabancı Organları Candida albicans Biyofilm Geliştirme

Candida albicans biofilm development on biotic and/or abiotic surfaces represents a specific threat for hospitalized patients. So far, C. albicans ...

Quantification of the Immunosuppressant Tacrolimus on Dried Blood Spots Using LC-MS/MS

LC-MS / MS kullanarak Kurutulmuş Kan Spotlar Immünosupresan Tacrolimus Niceleme

The calcineurin inhibitor tacrolimus is the cornerstone of most immunosuppressive treatment protocols after solid organ transplantation in the United ...

A Multicenter MRI Protocol for the Evaluation and Quantification of Deep Vein Thrombosis

Derin Ven Trombozu Değerlendirilmesi ve Niceleme A Çok Merkezli MRI Protokolü

We evaluated a magnetic resonance venography (MRV) approach with gadofosveset to quantify total thrombus volume changes as the principal criterion for ...

A Step by Step Protocol for Subretinal Surgery in Rabbits

Tavşanlarda Subretinal Cerrahi Adım Protokolle Bir Adım

Age related macular degeneration (AMD), retinitis pigmentosa, and other RPE related diseases are the most common causes for irreversible loss of vision in ...

A Detailed Protocol for Perspiration Monitoring Using a Novel, Small, Wireless Device

Bir Roman kullanarak Terleme İzleme Detaylı Protokol, Küçük Kablosuz Aygıt

Perspiration monitoring can be utilized for the detection of certain diseases, such as thermoregulation and mental disorders, particularly when the ...

A Rabbit Venous Interposition Model Mimicking Revascularization Surgery using Vein Grafts to Assess Intimal Hyperplasia under Arterial Blood Pressure

Arteriyel Kan Basıncı Altında İntimal Hiperplazi değerlendirmek için Ven Greftleri kullanarak Revaskülarizasyon Cerrahisi Taklit Bir Tavşan Venöz Interposition Modeli

Although vein grafts have been commonly used as autologous grafts in revascularization surgeries for ischemic diseases, the long-term patency remains poor ...