Name: measuring composition of cd95 death-inducing signaling complex and processing of procaspase-8 in this complex
Uploaded: 2021-08-02T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Measuring Composition of CD95 Death-Inducing Signaling Complex and Processing of Procaspase-8 in this Complex at JoVE.com

우리는 빌헬름 산더 재단 (2017.008.02), 다이나믹 시스템 센터 (CDS), 우리의 작업을 지원하기위한 유럽 프로그램 ERDF (유럽 지역 개발 기금)와 DFG (LA 2386)에 의해 투자 인정. 우리는 우리의 실험을 지원 카리나 Guttek 감사합니다. 우리는 우리에게 1 차적인 T 세포를 제공하기 위한 더크 Reinhold 교수 (OvGU, Magdeburg)를 인정합니다.

T세포 실험은 윤리적 합의42502-2-1273 유니 MD에 따라 수행되었다.
1. 실험을 위한 세포 준비
참고: 이 면역 침전을 위한 세포의 평균 수는 1 × 107입니다. 부착 된 세포는 실험 당일 1 × 107 세포가 되도록 실험 하루 전에 시드해야합니다.
<ol><li>실험을 위한 부착 셀 준비<ol>
<li>종자 5-8 × 106 부착 세포는 20 mL의 배지에서 (구성을?...

<ol>
	<li>Lavrik, I. N., Krammer, P. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+CD95/Fas+signaling+at+the+DISC.">Regulation of CD95/Fas signaling at the DISC.</a> Cell Death and Differentiation. 19 (1), 36-41 (2012).</li><li>Krammer, P. H., Arnold, R., Lavrik, I. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Life+and+death+in+peripheral+T+cells.">Life and death in peripheral T cells.</a> Nature Reviews Immunology. 7 (7), 532-542 (2007).</li><li>Dickens, L. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+death+effector+domain+chain+DISC+model+reveals+a+crucial+role+for+caspase-8+chain+assembly+in+mediating+apoptotic+cell+death.">A death effector domain chain DISC model reveals a crucial role for caspase-8 chain assembly in mediating apoptotic cell death.</a> Molecular Cell. 47 (2), 291-305 (2012).</li><li>Fu, T. -. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryo-EM+structure+of+caspase-8+tandem+DED+filament+reveals+assembly+and+regulation+mechanisms+of+the+death-inducing+signaling+complex.">Cryo-EM structure of caspase-8 tandem DED filament reveals assembly and regulation mechanisms of the death-inducing signaling complex.</a> Molecular Cell. 64 (2), 236-250 (2016).</li><li>Scaffidi, C., Medema, J. P., Krammer, P. H., Peter, M. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=FLICE+is+predominantly+expressed+as+two+functionally+active+isoforms,+caspase-8/a+and+caspase-8/b.">FLICE is predominantly expressed as two functionally active isoforms, caspase-8/a and caspase-8/b.</a> Journal of Biological Chemistry. 272 (43), 26953-26958 (1997).</li><li>Fox, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryo-EM+structural+analysis+of+FADD:Caspase-8+complexes+defines+the+catalytic+dimer+architecture+for+co-ordinated+control+of+cell+fate.">Cryo-EM structural analysis of FADD:Caspase-8 complexes defines the catalytic dimer architecture for co-ordinated control of cell fate.</a> Nature Communications. 12 (1), 1-17 (2021).</li><li>Schleich, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Stoichiometry+of+the+CD95+death-inducing+signaling+complex:+experimental+and+modeling+evidence+for+a+death+effector+domain+chain+model.">Stoichiometry of the CD95 death-inducing signaling complex: experimental and modeling evidence for a death effector domain chain model.</a> Molecular Cell. 47 (2), 306-319 (2012).</li><li>Hughes, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reconstitution+of+the+death-inducing+signaling+complex+reveals+a+substrate+switch+that+determines+CD95-mediated+death+or+survival.">Reconstitution of the death-inducing signaling complex reveals a substrate switch that determines CD95-mediated death or survival.</a> Molecular Cell. 35 (3), 265-279 (2009).</li><li>Lavrik, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+active+caspase-8+heterotetramer+is+formed+at+the+CD95+DISC+[2].">The active caspase-8 heterotetramer is formed at the CD95 DISC [2].</a> Cell Death and Differentiation. 10 (1), 144-145 (2003).</li><li>Hoffmann, J. C., Pappa, A., Krammer, P. H., Lavrik, I. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+C-terminal+cleavage+product+of+procaspase-8,+p30,+defines+an+alternative+pathway+of+procaspase-8+activation.">A new C-terminal cleavage product of procaspase-8, p30, defines an alternative pathway of procaspase-8 activation.</a> Molecular and Cellular Biology. 29 (16), 4431-4440 (2009).</li><li>Golks, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+CAP3+in+CD95+signaling:+New+insights+into+the+mechanism+of+procaspase-8+activation.">The role of CAP3 in CD95 signaling: New insights into the mechanism of procaspase-8 activation.</a> Cell Death and Differentiation. 13 (3), 489-498 (2006).</li><li>Ozt&#252;rk, S., Schleich, K., Lavrik, I. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cellular+FLICE-like+inhibitory+proteins+(c-FLIPs):+Fine-tuners+of+life+and+death+decisions.">Cellular FLICE-like inhibitory proteins (c-FLIPs): Fine-tuners of life and death decisions.</a> Experimental Cell Research. 318 (11), 1324-1331 (2012).</li><li>Golks, A., Brenner, D., Fritsch, C., Krammer, P. H., Lavrik, I. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=c-FLIPR,+a+new+regulator+of+death+receptor-induced+apoptosis.">c-FLIPR, a new regulator of death receptor-induced apoptosis.</a> Journal of Biological Chemistry. 280 (15), 14507-14513 (2005).</li><li>Hughes, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Co-operative+and+hierarchical+binding+of+c-FLIP+and+caspase-8:+A+unified+model+defines+how+c-FLIP+isoforms+differentially+control+cell+fate.">Co-operative and hierarchical binding of c-FLIP and caspase-8: A unified model defines how c-FLIP isoforms differentially control cell fate.</a> Molecular Cell. 61 (6), 834-849 (2016).</li><li>Hillert, L. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Long+and+short+isoforms+of+c-FLIP+act+as+control+checkpoints+of+DED+filament+assembly.">Long and short isoforms of c-FLIP act as control checkpoints of DED filament assembly.</a> Oncogene. 39 (8), 1756-1772 (2020).</li><li>Yu, J. W., Jeffrey, P. D., Shi, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mechanism+of+procaspase-8+activation+by+c-FLIPL.">Mechanism of procaspase-8 activation by c-FLIPL.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (20), 8169-8174 (2009).</li><li>Micheau, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+long+form+of+FLIP+is+an+activator+of+caspase-8+at+the+Fas+death-inducing+signaling+complex.">The long form of FLIP is an activator of caspase-8 at the Fas death-inducing signaling complex.</a> Journal of Biological Chemistry. 277 (47), 45162-45171 (2002).</li><li>Chang, D. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=C-FLIPL+is+a+dual+function+regulator+for+caspase-8+activation+and+CD95-mediated+apoptosis.">C-FLIPL is a dual function regulator for caspase-8 activation and CD95-mediated apoptosis.</a> EMBO Journal. 21 (14), 3704-3714 (2002).</li><li>Hillert, L. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dissecting+DISC+regulation+via+pharmacological+targeting+of+caspase-8/c-FLIPL+heterodimer.">Dissecting DISC regulation via pharmacological targeting of caspase-8/c-FLIPL heterodimer.</a> Cell Death and Differentiation. 27 (7), 2117-2130 (2020).</li><li>Fricker, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Model-based+dissection+of+CD95+signaling+dynamics+reveals+both+a+pro-+and+antiapoptotic+role+of+c-FLIPL.">Model-based dissection of CD95 signaling dynamics reveals both a pro- and antiapoptotic role of c-FLIPL.</a> Journal of Cell Biology. 190 (3), 377-389 (2010).</li><li>Arndt, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+TCR+activation+kinetics+in+primary+human+T+cells+upon+focal+or+soluble+stimulation.">Analysis of TCR activation kinetics in primary human T cells upon focal or soluble stimulation.</a> Journal of Immunological Methods. 387 (1-2), 276-283 (2013).</li><li>Pietkiewicz, S., Eils, R., Krammer, P. H., Giese, N., Lavrik, I. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Combinatorial+treatment+of+CD95L+and+gemcitabine+in+pancreatic+cancer+cells+induces+apoptotic+and+RIP1-mediated+necroptotic+cell+death+network.">Combinatorial treatment of CD95L and gemcitabine in pancreatic cancer cells induces apoptotic and RIP1-mediated necroptotic cell death network.</a> Experimental Cell Research. 339 (1), 1-9 (2015).</li><li>Schleich, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+architecture+of+the+DED+chains+at+the+DISC:+regulation+of+procaspase-8+activation+by+short+DED+proteins+c-FLIP+and+procaspase-8+prodomain.">Molecular architecture of the DED chains at the DISC: regulation of procaspase-8 activation by short DED proteins c-FLIP and procaspase-8 prodomain.</a> Cell Death and Differentiation. 23 (4), 681-694 (2016).</li><li>Lavrik, I. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Analysis+of+CD95+threshold+signaling:+Triggering+of+CD95+(FAS/APO-1)+at+low+concentrations+primarily+results+in+survival+signaling.">Analysis of CD95 threshold signaling: Triggering of CD95 (FAS/APO-1) at low concentrations primarily results in survival signaling.</a> Journal of Biological Chemistry. 282 (18), 13664-13671 (2007).</li><li>Sprick, M. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Caspase-10+is+recruited+to+and+activated+at+the+native+TRAIL+and+CD95+death-inducing+signalling+complexes+in+a+FADD-dependent+manner+but+can+not+functionally+substitute+caspase-8.">Caspase-10 is recruited to and activated at the native TRAIL and CD95 death-inducing signalling complexes in a FADD-dependent manner but can not functionally substitute caspase-8.</a> EMBO Journal. 21 (17), 4520-4530 (2002).</li><li>Neumann, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dynamics+within+the+CD95+death-inducing+signaling+complex+decide+life+and+death+of+cells.">Dynamics within the CD95 death-inducing signaling complex decide life and death of cells.</a> Molecular Systems Biology. 6 (1), 352 (2010).</li><li>Kischkel, F. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cytotoxicity-dependent+APO-1+(Fas/CD95)-associated+proteins+form+a+death-inducing+signaling+complex+(DISC)+with+the+receptor.">Cytotoxicity-dependent APO-1 (Fas/CD95)-associated proteins form a death-inducing signaling complex (DISC) with the receptor.</a> EMBO Journal. 14 (22), 5579-5588 (1995).</li><li>Seyrek, K., Richter, M., Lavrik, I. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Decoding+the+sweet+regulation+of+apoptosis:+the+role+of+glycosylation+and+galectins+in+apoptotic+signaling+pathways.">Decoding the sweet regulation of apoptosis: the role of glycosylation and galectins in apoptotic signaling pathways.</a> Cell Death and Differentiation. 26 (6), 981-993 (2019).</li><li>Kallenberger, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intra-+and+interdimeric+caspase-8+self-cleavage+controls+strength+and+timing+of+CD95-induced+apoptosis.">Intra- and interdimeric caspase-8 self-cleavage controls strength and timing of CD95-induced apoptosis.</a> Science Signaling. 7 (316), 23 (2014).</li></ol>

이 접근법은 Kischkel 외27에 의해 처음 설명되었으며 여러 그룹에 의해 그 이후로 성공적으로 개발되었습니다. 이 복합체에서 효율적인 DISC 면역 침전 및 모니터링 caspase-8 처리를 위해 몇 가지 중요한 문제를 고려해야 합니다.
첫째, 면역 침전 중에 모든 세척 단계를 따르는 것이 필수적입니다. 특히 중요한 것은 세파로즈 구슬의 최종 세척 단계와 세파로즈 구?...

가장 잘 연구 된 죽음 수용체 중 하나 (DRs) CD95 (Fas, APO-1). 외래 식수 막멸 경로는 COgnate 리간드, 즉 CD95L과 상호 작용하거나 TRAIL-Rs에 결합하는 DR의 상호 작용으로 시작됩니다. 이 결과 해당 DR. DISC에서 디스크의 형성은 CD95, FADD, procaspase-8/-10 및 c-FLIP 단백질1,2로구성된다. 더욱이, DISC는 CD95 및 FADD와 같은 데스 도메인(DD)-함유 단백질, 및 FADD, procaspase-8/-10 및 c-FLIP(도1)와같은 DED 함유 단백질 간의 상호 작용에 의해 조립된다. Procaspase-8은 DEDs의 협회를 통해 올리고머화를 거치며 DED 필라멘트의 형성을 초래하고 procaspase-8 활성화 및 처리가 뒤따릅니다. 이것은 세포 사멸로 이끌어 내는 caspase 폭포를 트리거합니다(그림 1)3,4. 따라서, procaspase-8은 CD95 또는 TRAIL-Rs에 의해 매개되는 외외 세포사멸 경로의 중앙 시인터 카스파제이며, 해당 거대 분자 플랫폼, DISC에서 활성화된다.
procaspase-8의 2개의 등소 형태, 즉 procaspase-8a (p55) 및 -8b (p53), DISC5에모집되는 것으로 알려져 있습니다. 두 등도 형태 모두 두 개의 DED를 포함한다. DED1 및 DED2는 프로카스파스-8a/b의 N 단말 부분에 위치하고 있으며 촉매 p18 및 p10 도메인이 뒤따릅니다. procaspase-8 DEDs의 상세한 극저온 전자 현미경 검사법 (cryo-EM) 분석은 DED 필라멘트4,6에게불린 필라멘트 구조물로 procaspase-8 단백질의 조립을 밝혔습니다. 놀랍게도, 선형 procaspase-8 체인은 처음에 DISC에서 procaspase-8 활성화에 선행된 이질에 종사하는 것이 제안되었습니다. 지금, 그 체인은 procaspase-8 DED 필라멘트의 하위 구조, 세 개의 나선으로 조립 된 세 개의 체인을 포함하는 후자는 알려져 있다3,4,6,7.
DED 필라멘트에서 분화하면, 프로카스파스-8a/b의 형성적 변화는 프로카스파스-8의 활성 센터형성과 활성화3,8로이어진다. 이것은 두 개의 경로를 통해 매개되는 procaspase-8 처리에 선행됩니다: 첫번째는 p43/p41 분열 제품의 생성을 통해 가고 p30 분열 제품의 초기 생성을 통해 두 번째. p43/p41 통로는 Asp374에서 procaspase-8a/b의 분열에 의해 개시되어 p43/p41 및 p12 분열제품(그림 2)을초래한다. 또한, 이들 단편은 Asp384 및 Asp210/216에서 자동 촉매로 갈라져 활성 카스파스-8 이테로테트라머, p10 2/p1829,10,11의형성을초래한다. 또한, 처리의 p43/p41 경로에 병행하여, procaspase-8a/b는 또한 아스p216에서 절단되어 C-단말 분열 제품 p30의 형성으로 이어지고, 그 다음으로 p10 및 p1810(도 2)에대한 프로테올리시스가 뒤따랐다.
DED 필라멘트에서 Procaspase-8a/b 활성화는 c-FLIPs12라는단백질에 의해 엄격하게 조절된다. c-FLIP 단백질은 c-FLIP Long(c-FLIP L),c-FLIP Short(c-FLIPS),c-FLIPRaji(c-FLIP R)세 가지 등등형태로 발생합니다. 세 개의 동소형태모두 N단자 지역에 2개의 DED가 포함되어 있습니다. c-FLIPL은 또한 C-단말 촉매 비활성 카스파스와 같은도메인(12,13)을가지고 있다. c-FLIP-c-FLIPS및 c-FLIPR-의짧은 동소형태는모두 DISC6,14,15에서DED 필라멘트 형성을 방해하여 반석멸 방식으로 작용한다. 또한, c-FLIPL은 농도 의존적 방식으로 카스파제-8 활성화를 조절할 수 있다. 이것은 프로- 및 반-apoptotic 효과16,17,18귀착될 수 있다. 촉매 활성 프로카스파스-8/c-FLIPL 이성애를 형성함으로써 c-FLIPL은 프로카스파스-8의 활성 중심의 안정화및 활성화로 이어집니다. c-FLIPL의 프로-또는 반-아포토틱 기능은 DED 필라멘트의 양과 조립된 procaspase-8/c-FLIPL 이종수(19)의 후속 양에 직접적으로 의존한다. 디스크에서 c-FLIPL의 낮거나 중간 농도는 caspase-8의 활성화를 지원하는 DED 필라멘트에서 충분한 양의 procaspase-8/c-FLIPL 이종수의 결과를 초래한다. 대조적으로, c-FLIPL의 증가양은 직접 DISC20에서그것의 반 자멸 효과로 이끌어 내다.
함께 촬영, 활성화 및 디스크에서 procaspase-8a/b의 처리는 여러 단계를 포함하는 매우 규제 과정이다. 이 백서에서는 DISC에서 직접 프로카스파스-8 처리의 측정과 이 복합체의 조성에 대한 분석에 대해 설명합니다. 이것은 모범적인 DR 복합체로 CD95 DISC를 사용하여 표시됩니다.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>12.5% SDS gel</td>
			<td>self made</td>
			<td></td>
			<td>for two separating gels: 
			3.28 mL distilled H2O 
			2.5 mL Tris; pH 8.8; 1.5 M 
			4.06 mL acrylamide 
			100 &#181;L 10% SDS 
			100 &#181;L 10% APS 
			7.5 &#181;L TEMED 
			 
			for two collecting gels: 
			3.1 mL distilled H2O 
			1.25 mL Tris; pH 6.8; 1.5 M 
			0.5 mL acrylamide 
			50 &#181;L 10% SDS 
			25 &#181;L 10% APS 
			7.5 &#181;L TEMED</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>14.5 cm cell dishes</td>
			<td>Greiner</td>
			<td>639160</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>acrylamide</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>A124.1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-actin Ab</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>A2103</td>
			<td>dilution: 1:4000 in PBST + 1:100 NaN3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-APO-1 Ab</td>
			<td>provided in these experiments by Prof. P. Krammer or can be purchased by Enzo</td>
			<td>ALX-805-038-C100</td>
			<td>used only for immunoprecipitation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-caspase-10 Ab</td>
			<td>Biozol</td>
			<td>MBL-M059-3</td>
			<td>dilution: 1:1000 in PBST + 1:100 NaN3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-caspase-3 Ab</td>
			<td>cell signaling</td>
			<td>9662 S</td>
			<td>dilution: 1:2000 in PBST + 1:100 NaN3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-caspase-8 Ab C15</td>
			<td>provided in these experiments by Prof. P. Krammer or can be purchased by ENZO</td>
			<td>ALX-804-242-C100</td>
			<td>dilution: 1:20 in PBST + 1:100 NaN3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-CD95 Ab</td>
			<td>Santa Cruz</td>
			<td>sc-715</td>
			<td>dilution: 1:2000 in PBST + 1:100 NaN3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-c-FLIP NF6 Ab</td>
			<td>provided in these experiments by Prof. P. Krammer or can be purchased by ENZO</td>
			<td>ALX-804-961-0100</td>
			<td>dilution: 1:10 in PBST + 1:100 NaN3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-FADD 1C4 Ab</td>
			<td>provided in these experiments by Prof. P. Krammer or can be purchased by ENZO</td>
			<td>ADI-AAM-212-E</td>
			<td>dilution: 1:10 in PBST + 1:100 NaN3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-PARP Ab</td>
			<td>cell signaling</td>
			<td>9542</td>
			<td>dilution: 1:1000 in PBST + 1:100 NaN3</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>APS</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>9592.3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#946;-mercaptoethanol</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>4227.2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bradford solution 
			Protein Assay Dye Reagent Concentrate 450ml</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>500-0006</td>
			<td>used according to manufacturer&#39;s instructions</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CD95L</td>
			<td>provided in these experiments by Prof. P. Krammer or can be purchased by ENZO</td>
			<td>ALX-522-020-C005</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>chemoluminescence detector 
			Chem Doc XRS+</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cOmplete Protese Inhibitor Cocktail (PIC)</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>11 836 145 001</td>
			<td>prepared according to manufacturer&#39;s instructions</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DPBS (10x) w/o Ca, Mg</td>
			<td>PAN Biotech</td>
			<td>P04-53500</td>
			<td>dilution 1:10 with H2O, storage in the fridge</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>eletrophoresis buffer</td>
			<td>self made</td>
			<td></td>
			<td>10x electrophoresis buffer: 
			60.6 g Tris 
			288 g glycine 
			20 g SDS 
			ad 2 L H2O 
			1:10 dilution before usage</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>glycine</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>3908.3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat Anti-Mouse IgG1 HRP</td>
			<td>SouthernBiotech</td>
			<td>1070-05</td>
			<td>dilution 1:10.000 in PBST + 5% milk</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat Anti-Mouse IgG2b</td>
			<td>SouthernBiotech</td>
			<td>1090-05</td>
			<td>dilution 1:10.000 in PBST + 5% milk</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat Anti-Rabbit IgG-HRP</td>
			<td>SouthernBiotech</td>
			<td>4030-05</td>
			<td>dilution 1:10.000 in PBST + 5% milk</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Interleukin-2 Human(hIL-2)</td>
			<td>Merckgroup/ Roche</td>
			<td>11011456001</td>
			<td>for activation of T cells</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>KCl</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>6781.2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>KH2PO4</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>3904.1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>loading buffer 
			4x Laemmli Sample Buffer,10 mL</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>161-0747</td>
			<td>prepared according to manufacturer&#39;s instructions</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Luminata Forte Western HRP substrate</td>
			<td>Millipore</td>
			<td>WBLUFO500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>lysis buffer</td>
			<td>self made</td>
			<td></td>
			<td>13.3 mL Tris-HCl; pH 7.4; 1.5 M 
			27.5 mL NaCl; 5 M 
			10 mL EDTA; 2 mM 
			100 mL Triton X-100 
			add 960 mL H2O</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>medium for adhaerent cells DMEM F12 (1:1) w stable Glutamine,&#160; 2,438 g/L</td>
			<td>PAN Biotech</td>
			<td>P04-41154</td>
			<td>adding 10% FCS, 1% Penicillin-Streptomycin and 0.0001% Puromycin to the medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>medium for primary T cells</td>
			<td>gibco by Life Technologie</td>
			<td>21875034</td>
			<td>adding 10% FCS and 1% Penicillin-Streptomycin to the medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>milk powder</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>T145.4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Na2HPO4</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>P030.3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaCl</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>3957.2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBST</td>
			<td>self made</td>
			<td></td>
			<td>20x PBST: 
			230 g NaCl 
			8 g KCl 
			56.8 g Na2HPO4 
			8 g KH2PO4 
			20 mL Tween-20 
			ad 2 L H2O 
			dilution 1:20 before usage</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PBST + 5% milk</td>
			<td>self made</td>
			<td></td>
			<td>50 g milk powder + 1 L PBST</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PHA</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>R30852801</td>
			<td>for actavation of T ells</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Power Pac HC</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Precision Plus Protein Standard All Blue</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>161-0373</td>
			<td>use between 3-5 &#181;L</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Protein A Sepharose CL-4B beads</td>
			<td>Novodirect/ Th.Geyer</td>
			<td>GE 17-0780-01</td>
			<td>affinity resin beads prepared according to manufacturer&#39;s instructions</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>scraper</td>
			<td>VWR</td>
			<td>734-2602</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SDS</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>4360.2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>shaker</td>
			<td>Heidolph</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sodium azide</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>K305.1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TEMED</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>2367.3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trans Blot Turbo mini-size transfer stacks</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>170-4270</td>
			<td>used according to manufacturer&#39;s instructions</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TransBlot Turbo 5x Transfer Buffer</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>10026938</td>
			<td>prepared according to manufacturer&#39;s instructions</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TransBlot Turbo Mini-size nictrocellulose membrane</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td>170-4270</td>
			<td>used according to manufacturer&#39;s instructions</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trans-Blot-Turbo</td>
			<td>Bio Rad</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tris</td>
			<td>Chem Solute</td>
			<td>8,08,51,000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Triton X-100</td>
			<td>Carl Roth</td>
			<td>3051.4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tween-20</td>
			<td>Pan Reac Appli Chem</td>
			<td>A4974,1000</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

measuring composition of cd95 death-inducing signaling complex and processing of procaspase-8 in this complex

외래 세포멸은 CD95/Fas/APO-1 또는 종양 괴사 인자-유도 리간드(TRAIL)-수용체 1/수용체 2(TRAIL-R1/R2)와 같은 사망 수용체(DRs)의 활성화에 의해 중재된다. 그들의 cognate 리간드로 이 수용체의 자극은 죽음을 유도하는 신호 복합체 (DISC)의 조립으로 이끌어 냅니다. DISC는 DR, 어댑터 단백질 Fas-연관 단백질을 데스 도메인(FADD), procaspases-8/-10, 및 세포 FADD 와 같은 인터류신(IL)-1β 변환 효소 억제 단백질(c-FLIPs)으로 포함한다. DISC는 procaspase-8 처리 및 활성화를 위한 플랫폼 역할을 합니다. 후자는 디스크에 조립된 데스 이펙터 도메인(DED) 필라멘트의 이질/올리고머화를 통해 발생합니다. 
procaspase-8의 활성화는 여러 단계에서 발생하는 처리 뒤에 있습니다. 이 작업에서는 이 컴플렉스에서 DISC 형성 및 프로카스파스-8의 처리를 측정할 수 있는 확립된 실험 워크플로우가 설명되어 있습니다. 워크플로는 서양 얼룩 분석에 의해 지원되는 면역 침전 기술을 기반으로 합니다. 이 워크플로우를 통해 DISC 및 그 처리에 대한 다양한 단계의 procaspase-8 모집을 주의 깊게 모니터링할 수 있으며 외외 세포멸의 분자 메커니즘을 조사하는 데 매우 관련이 있습니다.

CD95 DISC에서 DISC및 해당 처리를 위해 caspase-8 채용을 분석하기 위해 CD95 DISC의 IP와 서부 블롯 분석을 결합한 고전적인 워크플로우를 설명합니다. 이를 통해 DISC에서 caspase-8 활성화의 몇 가지 주요 기능을 검출할 수 있습니다: caspase-8-활성화 매크로 분자 플랫폼의 조립, DISC에 procaspase-8의 모집, 그리고 이 시터 카스파제의처리(도 1 및 도 2). 이러한 워크플?...

Watch this Scientific Journal Video about Measuring Composition of CD95 Death-Inducing Signaling Complex and Processing of Procaspase-8 in this Complex at JoVE.com

Measuring Composition of CD95 Death-Inducing Signaling Complex and Processing of Procaspase-8 in this Complex

여기서, 죽음을 유도하는 신호 복합체(DISC)에서 직접 카스파제-8 처리를 감지하고 이 복합체의 조성을 결정하는 실험 워크플로우가 제시된다. 이 방법론은 세포 사멸 경로의 분자 메커니즘을 해명에서 세포 사멸 네트워크의 동적 모델링에 이르기까지 광범위한 응용 프로그램을 가지고 있습니다.

이 단지에서 CD95 사망 유도 신호 복합체 및 프로카스파스-8의 처리 구성 측정

Extrinsic apoptosis is mediated by the activation of death receptors (DRs) such as CD95/Fas/APO-1 or tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ...

자멸 개시는 마커 분자 플랫폼에서 카스파스의 활성화에 의해 중재된다. 우리는 caspase-8 활성화를 위한 플랫폼 역할을 하는 키 개시 세포 죽음 복합 디스크의 검출을 제시합니다. 이 기술의 장점은 이 단지에서 caspase-8 처리에 대한 정보를 제공하는 것과 함께 DISC 컴플렉스의 어셈블리 및 조성물을 검출할 수 있다는 것입니다.80%에서 90%의 컨런트및 접시를 준수하는 세포로 실험을 시작합니다. 배지를 버리고 부착 셀에 신선한 배지를 추가합니다. 그런 다음 플레이트를 비스듬히 잡고 응집세포를 건드리지 않고 배지로 리간드를 피펫팅하여 CD95L의 선택된 농도로 세포를 자극한다.세포를 수확하려면 세포 접시를 얼음 위에 놓습니다. 셀 서스펜션에 차가운 PBS 10 밀리리터를 추가하고 부착된 세포를 플레이트에서 긁어냅니다. 50 밀리리터 튜브에서 세포 현탁액을 수집합니다.차가운 PBS 10 밀리리터로 셀 접시를 두 번 씻고 동일한 50 밀리리터 튜브에 세척 용액을 추가하십시오. 그런 다음 섭씨 4도에서 5 분 동안 500 배 G에서 세포 현탁액을 원심 분리합니다. 상체를 폐기한 후, 차가운 PBS의 1 밀리리터에서 세포 펠릿을 다시 놓습니다.그런 다음 세포 현탁액을 1.5 밀리리터 튜브로 옮기십시오. 세포 현탁액을 원심분리하고 감기 PBS의 1 밀리리터에서 세포 펠릿을 다시 중단합니다. 원심분리를 다시 한 번 반복한 다음, 세포 펠릿을 용해 버퍼 1밀리리터로 다시 분리하고 얼음에서 30분 동안 배양합니다.인큐베이션 후, 섭씨 4도에서 최대 속도로 lysate을 원심분리한 다음 상체를 깨끗한 튜브로 옮킵니다. 펠릿을 버리고 단백질 농도를 결정하기 위해 다른 튜브에서 용액의 50 마이크로 리터 샘플을 수집합니다. 면역 침전을 위해, 용액에 항체 항체의 2개의 마이크로리터 및 준비된 단백질 A Sepharose 구슬의 10 마이크로리터를 용액에 추가합니다.비즈 컨트롤역할을 하기 위해 비드의 마이크로리터 10개만 별도의 튜브에 첨가한다. lysate를 포함 하는 혼합물을 배양, 항체, 그리고 단백질 A Sepharose 부드러운 혼합과 섭씨 4 섭씨에서 하룻밤 구비. 다음 날, 원심 분리는 섭씨 4도에서 4 분 동안 500 배 G에서 혼합물을 분리합니다.상체를 폐기한 후, 차가운 PBS 의 1 밀리리터를 추가하고 원심 분리 후 상퍼를 폐기하여 구슬을 씻으십시오. 이 단계를 적어도 세 번 반복합니다. 마지막 PBS 세척을 폐기 한 후, 바람직하게는 50 마이크로 리터 해밀턴 주사기와 구슬을 흡인.서부 블롯을 수행하려면 구슬에 4X 로딩 버퍼 20 마이크로리터를 추가하고 10분 동안 섭씨 95도의 열을 가열합니다. 동시에 용액 컨트롤을 섭씨 95도에서 5분간 가열합니다. 12.5%SDS 젤에 lysates, 면역 침전제 및 단백질 표준을 적재하고 80볼트의 일정한 전압으로 실행합니다.젤 실행이 완료되면 SDS 젤에서 니트로 셀룰로오스 막으로 단백질을 전달합니다. 전송이 완료되면, 상자에 블로티 드 멤브레인을 배치하고 부드러운 동요에서 블록 용액에 한 시간 동안 인큐베이션, 다음 PBST와 5 분 동안 멤브레인을 세 번 세척. 단백질을 검출하기 위하여는, 막에 표시된 희석에 첫번째 1 차적인 항체를 추가하고 온화한 동요와 섭씨 4도에서 밤새 인큐베이션합니다.다음 날, 3 개의 5 분 PBST 세척으로 막을 씻은 다음 실온에서 1 시간 동안 부드러운 흔들림으로 20 밀리리터의 이차 항체로 멤브레인을 배양하십시오. 다시 PBST로 멤브레인을 세 번 씻으십시오. 마지막 PBST 세척을 폐기한 후, 고추냉이 과산화기기류의 약 1밀리리터를 멤브레인에 추가하고 화학 발광 신호를 감지합니다.CD95L을 가진 자궁 경관암 HeLa-CD95 세포의 자극은 CD95 면역 침전을 통해 감시된 CD95 DISC 형성의 높은 수준을 초래했습니다. CD95, FADD, procaspase-8, procaspase-10 및 c-FLIPS는 효율적인 디스크 형성을 나타내는 이러한 CD95 면역 침전물에서 관찰되었다. p43-FLIP 및 p22-FLIP의 골짜기 제품은 면역 침전물에서 검출되었으며, 이는 caspase-8 활성화를 나타낸다.C-FLIP를 오랫동안 과도하게 발현하는 HeLa-CD95 세포는 CD95 DISC 형성의 분석을 위해 사용되었습니다. 부모 HeLa-CD95 세포와 유사하게, CD95L 처리 없이 이들 세포로부터 의 면역침전증에서 FADD, procaspase-9, procaspase-10, c-FLIP 단백질 및 PARP1의 모집이 검출되지 않았다. 활성화된 1차 T세포는 CD95 면역침전에서 높은 수준의 CD95, FADD, procaspase-8, procaspase-10 및 c-FLIPS를 특징으로 하였다.이 기술은 DISC에서 caspase-8의 처리를 포함하여 분자 디스크 형성의 분석을 허용합니다. 모든 세탁 단계는 매우 중요합니다. 또한 자극 지점과 인큐베이션 시간을 심각하게 고려해야 합니다.이것은 DISC 컴플렉스에서 어셈블리를 측정하는 유일한 방법입니다. 그러나 caspase-8 활성화를 측정하기 위해 caspase-8 활동 에세이도 구현할 수 있습니다. 이 접근 방식을 통해 우리는 자멸 개시에 대한 새로운 통찰력을 얻을 수 있었습니다.

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Protein Complex Affinity Capture from Cryomilled Mammalian Cells

Cryomilled 포유 동물 세포에서 단백질 단지 선호도 캡처

Affinity capture is an effective technique for isolating endogenous protein complexes for further study. When used in conjunction with an antibody, this ...

연구

생화학

A Method for Measuring Metabolism in Sorted Subpopulations of Complex Cell Communities Using Stable Isotope Tracing

안정 동위 원소 추적을 사용하여 복잡한 세포 공동체의 정렬 된 부분 집단에서 대사를 측정하는 방법

Mammalian cell types exhibit specialized metabolism, and there is ample evidence that various co-existing cell types engage in metabolic cooperation. ...

Preparation of Giant Vesicles Encapsulating Microspheres by Centrifugation of a Water-in-oil Emulsion

유 중수 에멀젼의 원심 분리에 의해 거 소포 캡슐화 미소 구의 제조

The constructive biology and the synthetic biology approach to creating artificial life involve the bottom-up assembly of biological or nonbiological ...

Measuring G-protein-coupled Receptor Signaling via Radio-labeled GTP Binding

무선 표지 된 GTP 결합을 통한 G- 단백질 결합 수용체 신호 측정

G-Protein-Coupled Receptors (GPCRs) are a large family of transmembrane receptors that play critical roles in normal cellular physiology and constitute a ...

A Modified Yeast-one Hybrid System for Heteromeric Protein Complex-DNA Interaction Studies

이성질체 단백질 복합체 -DNA 상호 작용 연구를위한 수정 된 효모 원 하이브리드 시스템

Over the years, the yeast one-hybrid assay has proven to be an important technique for the identification and validation of physical interactions between ...

Biochemical and Structural Characterization of the Carbohydrate Transport Substrate-binding-protein SP0092

탄수화물 전송 기질 바인딩 단백질 SP0092의 생 화 학적 및 구조적 특성

Development of new antimicrobials and vaccines for Streptococcus pneumoniae (pneumococcus) are necessary to halt the rapid rise in multiple resistant ...

Toeprinting Analysis of Translation Initiation Complex Formation on Mammalian mRNAs

번역 개시 포유류 mRNAs에 복잡 한 대형의 Toeprinting 분석

Translation initiation is the rate-limiting step of protein synthesis and represents a key point at which cells regulate their protein output. Regulation ...

Strategic Screening and Characterization of the Visual GPCR-mini-G Protein Signaling Complex for Successful Crystallization

성공적인 결정화를 위한 시각적 GPCR-mini-G 단백질 신호 복합체의 전략적 스크리닝 및 특성화

The key to determining crystal structures of membrane protein complexes is the quality of the sample prior to crystallization. In particular, the choice ...

Crystallization and Structural Determination of an Enzyme:Substrate Complex by Serial Crystallography in a Versatile Microfluidic Chip

다목적 미세 유체 칩의 직렬 결정학에 의한 효소의 결정화 및 구조적 결정: 기질 복합체

The preparation of well diffracting crystals and their handling before their X-ray analysis are two critical steps of biocrystallographic studies. We ...

Complementation of Splicing Activity by a Galectin-3 - U1 snRNP Complex on Beads

구슬에 갈렉틴-3 - U1 snRNP 복합체에 의한 접합 활동의 보완

Classic depletion-reconstitution experiments indicate that galectin-3 is a required splicing factor in nuclear extracts. The mechanism of incorporation of ...