Name: spectrophotometric methods for the study of eukaryotic glycogen metabolism
Uploaded: 2021-08-19T15:00:00
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著者は、Karoline DittmerとAndrew Brittinghamの洞察と多くの有益な議論に感謝したいと思います。この作業は、アイオワオステオパシー教育研究基金(IOER 03-17-05および03-20-04)からの助成金によって部分的に支援されました。

1. グリコーゲン合成酵素活性の測定
<ol><li>表1に示すように必要な試薬のストック溶液を調製する(実験日より前)。</li>
</ol><table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody><tr><td>コンポーネント</td>
			<td colspan="2">経路</td>
		</tr><tr><td>50 mM トリス pH 8.0</td>
			<td colspan="2">0.61 g のトリス塩基を ~ 80 mL の水に溶解します。 4°Cに冷却しま...

<ol>
	<li>Wilson, W. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+glycogen+metabolism+in+yeast+and+bacteria.">Regulation of glycogen metabolism in yeast and bacteria.</a> FEMS Microbiology Reviews. 34 (6), 952-985 (2010).</li><li>Ralton, J. E., Sernee, M. F., McConville, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Evolution+and+function+of+carbohydrate+reserve+biosynthesis+in+parasitic+protists.">Evolution and function of carbohydrate reserve biosynthesis in parasitic protists.</a> Trends in Parasitology. 1471 (21), 00144-00146 (2021).</li><li>Roach, P. 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Purification and properties of the Escherichia coli B ADPglucose:1,4-alpha-D-glucan 4-alpha-glucosyltransferase.</a> Biochemistry. 15 (4), 849-857 (1976).</li><li>Gilboe, D. P., Larson, K. L., Nuttall, F. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Radioactive+method+for+the+assay+of+glycogen+phosphorylases.">Radioactive method for the assay of glycogen phosphorylases.</a> Analytical Biochemistry. 47 (1), 20-27 (1972).</li><li>Brown, D. H., Illingworth, B., Cori, C. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+mechanism+of+the+de+novo+synthesis+of+polysaccharide+by+phosphorylase.">The mechanism of the de novo synthesis of polysaccharide by phosphorylase.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 47 (4), 479-485 (1961).</li><li>Nelson, T. E., Larner, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+rapid+micro+assay+method+for+amylo-1,6-glucosidase.">A rapid micro assay method for amylo-1,6-glucosidase.</a> Analytical Biochemistry. 33 (1), 87-101 (1970).</li><li>Leloir, L. F., Olavarria, J. M., Goldemberg, S. H., Carminatti, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biosynthesis+of+glycogen+from+uridine+diphosphate+glucose.">Biosynthesis of glycogen from uridine diphosphate glucose.</a> Archives of Biochemistry and Biophysics. 81 (2), 508-520 (1959).</li><li>Danforth, W. 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E., Bowling, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+automated+assay+of+glycogen+phosphorylase+in+the+direction+of+phosphorolysis.">An automated assay of glycogen phosphorylase in the direction of phosphorolysis.</a> Annals of Clinical Biochemistry. 27, 129-132 (1990).</li><li>Nelson, T. E., Kolb, E., Larner, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Purification+and+properties+of+rabbit+muscle+amylo-1,6-glucosidase-oligo-1,4-1,4-transferase.">Purification and properties of rabbit muscle amylo-1,6-glucosidase-oligo-1,4-1,4-transferase.</a> Biochemistry. 8 (4), 1419-1428 (1969).</li><li>Taylor, C., Cox, A. J., Kernohan, J. 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Purification and properties of the Escherichia coli b alpha-1,4,-glucan: alpha-1,4-glucan 6-glycosyltansferase.</a> Biochemistry. 16 (16), 3693-3699 (1977).</li><li>Krisman, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+method+for+the+colorimetric+estimation+of+glycogen+with+iodine.">A method for the colorimetric estimation of glycogen with iodine.</a> Analytical Biochemistry. 4, 17-23 (1962).</li><li>Friedman, D. L., Larner, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Studies+on+UDPG-alpha-glucan+transglucosylase.+iii.+Interconversion+of+two+forms+of+muscle+UDPG-alpha-glucan+transglucosylase+by+a+phosphorylation-dephosphorylation+reaction+sequence.">Studies on UDPG-alpha-glucan transglucosylase. iii. Interconversion of two forms of muscle UDPG-alpha-glucan transglucosylase by a phosphorylation-dephosphorylation reaction sequence.</a> Biochemistry. 2, 669-675 (1963).</li><li>Hanashiro, I., Roach, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mutations+of+muscle+glycogen+synthase+that+disable+activation+by+glucose+6-phosphate.">Mutations of muscle glycogen synthase that disable activation by glucose 6-phosphate.</a> Archives of Biochemistry and Biophysics. 397 (2), 286-292 (2002).</li><li>Huang, K. P., Cabib, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Yeast+glycogen+synthetase+in+the+glucose+6-phosphate-dependent+form.+I.+Purification+and+properties.">Yeast glycogen synthetase in the glucose 6-phosphate-dependent form. I. Purification and properties.</a> Journal of Biological Chemistry. 249 (12), 3851-3857 (1974).</li><li>Pederson, B. A., Cheng, C., Wilson, W. A., Roach, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regulation+of+glycogen+synthase.+Identification+of+residues+involved+in+regulation+by+the+allosteric+ligand+glucose-6-P+and+by+phosphorylation.">Regulation of glycogen synthase. Identification of residues involved in regulation by the allosteric ligand glucose-6-P and by phosphorylation.</a> Journal of Biological Chemistry. 275 (36), 27753-27761 (2000).</li><li>Roach, P. J., Depaoli-Roach, A. A., Hurley, T. D., Tagliabracci, V. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glycogen+and+its+metabolism:+some+new+developments+and+old+themes.">Glycogen and its metabolism: some new developments and old themes.</a> Biochemical Journal. 441 (3), 763-787 (2012).</li><li>Gosselin, S., Alhussaini, M., Streiff, M. B., Takabayashi, K., Palcic, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+continuous+spectrophotometric+assay+for+glycosyltransferases.">A continuous spectrophotometric assay for glycosyltransferases.</a> Analytical Biochemistry. 220 (1), 92-97 (1994).</li><li>Wilson, W. A., Pradhan, P., Madhan, N., Gist, G. C., Brittingham, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glycogen+synthase+from+the+parabasalian+parasite+Trichomonas+vaginalis:+An+unusual+member+of+the+starch/glycogen+synthase+family.">Glycogen synthase from the parabasalian parasite Trichomonas vaginalis: An unusual member of the starch/glycogen synthase family.</a> Biochimie. 138, 90-101 (2017).</li><li>Krisman, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=alpha-1,4-glucan:+alpha-1,4-glucan+6-glycosyltransferase+from+liver.">alpha-1,4-glucan: alpha-1,4-glucan 6-glycosyltransferase from liver.</a> Biochimica et Biophysica Acta. 65, 307-315 (1962).</li><li>Sandhya Rani, M. R., Shibanuma, K., Hizukuri, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+fine+structure+of+oyster+glucogen.">The fine structure of oyster glucogen.</a> Carbohydrate Research. 227, 183-194 (1992).</li><li>Dittmer, K. E., Pradhan, P., Tompkins, Q. C., Brittingham, A., Wilson, W. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cloning+and+characterization+of+glycogen+branching+and+debranching+enzymes+from+the+parasitic+protist+Trichomonas+vaginalis.">Cloning and characterization of glycogen branching and debranching enzymes from the parasitic protist Trichomonas vaginalis.</a> Biochimie. 186, 59-72 (2021).</li></ol>

一般に、提示されたすべての方法の主な利点は、低コスト、容易さ、速度、および特殊な機器への依存の欠如です。それらすべてに共通する主な欠点は、他の利用可能な方法と比較した感度です。NADH / NADPHの生産または消費を伴う手順の感度は簡単に推定できます。NADH/NADPHの吸光係数が6.22 M-1 cm-1であることを考えると、単純な算術で10~20 μMの濃度変化を容易に検出できるこ?...

グリコーゲンは自然界に広く分布しており、化合物は細菌、多くの原生生物、真菌、および動物に含まれています。微生物では、栄養素が制限されている場合、グリコーゲンは細胞の生存に重要であり、哺乳類などの高等生物では、グリコーゲンの合成と分解が血糖値を緩衝するのに役立ちます1,2,3。したがって、グリコーゲン代謝の研究は、微生物学や哺乳類生理学などの多様な分野にとって重要です。グリコーゲン代謝を理解するには、グリコーゲン合成(グリコーゲン合成酵素と分岐酵素)とグリコーゲン分解(グリコーゲンホスホリラーゼと枝切り酵素)の重要な酵素を研究する必要があります。グリコーゲン合成酵素、ホスホリラーゼ、分岐、および枝切り酵素活性のゴールドスタンダードアッセイは、放射性同位元素を使用します。例えば、グリコーゲンシンターゼは一般に、UDP-[14C]グルコース(動物および真菌酵素の場合)またはADP-[14C]グルコース(細菌酵素の場合)からのグルコースのグリコーゲン4,5への取り込みに続いて、停止した放射化学的アッセイで測定される。同様に、グリコーゲンホスホリラーゼは、[14C]グルコース-1-リン酸からグリコーゲン6へのグルコースの取り込みに続いて、グリコーゲン合成の方向に測定されます。枝切り酵素は、グリコーゲンホスホリラーゼ7によってグルコース-1-リン酸からα1,4結合鎖への[14C]グルコースの取り込みを刺激するこの酵素の能力を測定することによってアッセイされ、枝切り酵素活性は、グリコーゲン8に[14C]グルコースを取り込む酵素の能力に従うことによって決定されます。.放射性基質は非常に感度が高く、酵素活性の低い粗細胞抽出物に使用できますが、高価であり、放射性同位元素の使用に伴う規制要件の対象となります。これらの障壁により、特定のアッセイの使用は多くの労働者の手の届かないところにあります。しかしながら、長年にわたって、これらの酵素の測定に対する印象的な様々な分光光度法が記載されている。一般に、これらのアプローチは、最終的にはNADH / NADPHの生成または消費、またはグリコーゲンとヨウ素の間の着色錯体の生成の測定に依存しています。したがって、それらは単純であり、タングステンまたはキセノンフラッシュランプのみを備えた単純な分光光度計を使用して実行できます。
グリコーゲン合成酵素の分光光度アッセイは、グルコースが成長するグリコーゲン鎖に付加されるにつれて糖ヌクレオチド供与体から放出されるヌクレオシド二リン酸を測定することに依存している9,10。以下のプロトコルのセクション1に記載されているグリコーゲンシンターゼ活性を測定する手順は、Wayllaceら11によって概説されている手順の変更であり、カップリングスキームを以下に示します。
(グルコース)n + UPD-グルコース → (グルコース)n+1 + UDP
UDP + ATP → ADP + UTP
ADP + ホスホエノールピルビン酸 → ピルビン酸 + ATP
ピルビン酸 + NADH + H+ → 乳酸 + NAD+
グリコーゲン合成酵素は、UDP-グルコースからグリコーゲンにグルコースを付加します。この過程で生成したUDPは、ヌクレオシド二リン酸キナーゼ(NDPキナーゼ)によってUTPに変換され、ADPを生成する反応となる。次に、ADPはピルビン酸キナーゼの基質として機能し、ホスホエノールピルビン酸をリン酸供与体として使用してADPをリン酸化します。生成したピルビン酸は、NADHを消費する反応で酵素乳酸脱水素酵素によって乳酸に変換される。したがって、アッセイは、NADHが消費されるにつれて340nmでの吸光度の減少をモニタリングしながら、連続的に実施することができる。グルコース供与体としてADP-グルコースを必要とする酵素での使用に容易に適応します。ここでは、グリコーゲンシンターゼの作用によって放出されるADPがピルビン酸キナーゼによって直接作用されるため、カップリングステップはより単純です。
グリコーゲンホスホリラーゼ活性の測定に利用できるさまざまな分光光度アッセイがあります。古典的なバージョンでは、以下に示すように、酵素はグリコーゲン合成の方向に後方に駆動されます。
(グルコース)n + グルコース-1-リン酸 → (グルコース)n+1 +P i
時限間隔で、反応混合物のアリコートを除去し、遊離したリン酸塩の量を定量化する12,13。我々の手では、このアッセイは、ホスホリラーゼ作用に必要な高濃度のグルコース-1-リン酸と組み合わされた、グルコース-1-リン酸の多くの市販調製物中に容易に測定可能な遊離リン酸が存在するため、使用が制限されていた。むしろ、グリコーゲンがホスホリラーゼ13によって分解されるときに放出されるグルコース-1-リン酸を測定する代替アッセイを日常的に採用しています。以下に示す共役反応スキームが採用される。
(グルコース)n + Pi → (グルコース)n-1 + グルコース-1-リン酸
グルコース-1-リン酸 → グルコース-6-リン酸
グルコース-6-リン酸 + NADP+ → 6-ホスホグルコノラクトン + NADPH + H+
グルコース-1-リン酸はホスホグルコムターゼによってグルコース-6-リン酸に変換され、グルコース-6-リン酸は6-ホスホグルコノラクトンに酸化され、同時にNADP+がNADPHに還元されます。以下のプロトコルのセクション2に詳述されている手順は、Mendicino et al.14およびSchreiber & Bowling 15によって記述された方法に由来する。アッセイは、時間の経過とともに340nmでの吸光度が増加し、反応速度の決定を可能にする連続的に容易に実施することができる。
枝切り酵素活性の吸光光度測定は、ホスホリラーゼ限界デキストリン16に対する酵素の作用によって放出されるグルコースの測定に依存する。この化合物は、グリコーゲンホスホリラーゼでグリコーゲンを網羅的に処理することによって作られます。グリコーゲンホスホリラーゼ作用はα1,6-分岐点から4グルコース残基離れて停止するので、限界デキストリンにはグリコーゲンが含まれており、その外鎖は~4グルコース残基に短縮されています。ホスホリラーゼ限界デキストリンの調製は、Taylorら17 およびMakino & Omichi18によって開発されたものに由来する手順を用いて、本明細書に記載されている。
分岐解除は 2 段階のプロセスです。二官能性枝切り酵素の4-α-グルカノトランスフェラーゼ活性は、最初に3つのグルコース残基を分岐点から近くのα1,4結合グルコース鎖の非還元末端に転移する。分岐点に残っている単一のα1,6結合グルコース残基は、次いでα1,6-グルコシダーゼ活性19によって加水分解される。アッセイは通常、停止した方法で実行され、所与の時間(または一連の回)後に放出されるグルコースは、以下に示すように結合酵素アッセイで測定されます。
(グルコース)n → (グルコース)n-1 + グルコース
グルコース + ATP → グルコース-6-リン酸 + ADP
グルコース-6-リン酸 + NADP+ → 6-ホスホグルコノラクトン + NADPH + H+
産生されるNADPHの測定は、グルコース産生の尺度を与える。以下のプロトコルのセクション3で概説されている手順は、Nelsonら16によって記述されたものに基づいています。NADH/NADPHの消費または生成に依存する他の方法と同様に、アッセイは非常に感度が高いです。ただし、ホスホリラーゼ限界デキストリンから遊離グルコースを遊離させる可能性のあるアミラーゼまたは他のグルコシダーゼの存在は、重大な干渉を引き起こします(ディスカッションを参照)。
分岐酵素活性の比色測定は、グルコースのα1,4結合鎖がヨウ素に結合するらせん構造を採用し、着色錯体を形成するという事実に依存しています20。形成される複合体の色は、α1,4結合鎖の長さに依存する。したがって、α1,4結合グルコースの長くて大部分が分岐していない鎖からなるアミロースは、ヨウ素と濃い青色の複合体を形成します。対照的に、その外鎖が一般にわずか6〜8グルコース残基長のオーダーであるグリコーゲンは、橙赤色の複合体を形成する。アミロースの溶液を分岐酵素と共にインキュベートする場合、アミロースへの分岐の導入は、より短いα1,4結合グルコース鎖の生成をもたらす。したがって、アミロース/ヨウ素錯体の吸収極大はより短い波長にシフトします。ここで説明する手順は、Boyer & Preiss21 によって詳述されたものに由来し、分岐酵素活性は、時間の経過に伴う660nmでのアミロース/ヨウ素複合体の吸収の減少として定量化されます。
上記の議論からすぐに明らかなように、ヨウ素とα1,4-グルコース鎖の間に形成される錯体の色が鎖長によって変化するという事実は、グリコーゲン/ヨウ素複合体の吸光度スペクトルがグリコーゲン分岐の程度によって変化することを意味する。これは確かに事実であり、より分岐の少ないグリコーゲン/より長い外鎖を有するグリコーゲンは、より分岐している/より短い外鎖を有するグリコーゲンよりも長い波長の光を吸収する。したがって、ヨウ素染色反応を使用して、グリコーゲン分岐の程度に関する迅速で定性的なデータを得ることができます22。ヨウ素とのグリコーゲン錯体が特に強くない場合、オレンジ - 茶色が形成されます。しかしながら、発色は、飽和塩化カルシウム溶液22を含有させることによって増強することができる。これにより、メソッドの感度が約10倍になり、マイクログラム量のグリコーゲンをすぐに分析できます。下記のプロトコルのセクション4に記載される分岐の決定のためのアッセイは、Krisman22によって開発された手順から適応される。グリコーゲンサンプルをキュベット内のヨウ素溶液および塩化カルシウムと組み合わせ、330nmから800nmの吸収スペクトルを収集するだけで実施できます。吸光度の最大値は、分岐の程度が減少するにつれて、より長い波長にシフトします。
まとめると、ここで説明する方法は、グリコーゲン代謝の重要な酵素の活性を評価し、グリコーゲン分岐の程度に関する定性的データを取得するための簡単で信頼性の高い手段を提供します。

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Amylopectin (amylose free) from waxy corn</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>A0456</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Amylose</td>
			<td>Biosynth Carbosynth</td>
			<td>YA10257</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ATP, disodium salt</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>A3377</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>D-Glucose-1,6-bisphosphate, potassium salt</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>G6893</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>D-glucose-6-phosphate, sodium salt</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>G7879</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glucose-6-phosphate dehydrogenase, Grade I, from yeast</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>10127655001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycogen, Type II from oyster</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>G8751</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hexokinase</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>11426362001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methacrylate cuvettes, 1.5 mL</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>14-955-128</td>
			<td>Methacrylate is required since some procedures are conducted at 340 nm or below</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#946;-Nicotinamide adenine dinucleotide phosphate sodium salt</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>N0505</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#946;-Nicotinamide adenine dinucleotide, reduced disodium salt</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>43420</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nucleoside 5&#39;-diphosphate kinase</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>N0379</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphoenolpyruvate, monopotassium salt</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>P7127</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphoglucomutase from rabbit muscle</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>P3397</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphorylase A from rabbit muscle</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>P1261</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pyruvate Kinase/Lactic Dehydrogenase enzymes from rabbit muscle</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>P0294</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>UDP-glucose, disodium salt</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>U4625</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

spectrophotometric methods for the study of eukaryotic glycogen metabolism

グリコーゲンは、細菌から動物に至るまで、さまざまな生物によってグルコースの貯蔵形態として合成されます。この分子は、α1,6結合の付加によって導入された分岐を有するα1,4結合グルコース残基の直鎖を含む。グリコーゲンの合成と分解がどのように制御され、グリコーゲンがその特徴的な分岐構造をどのように達成するかを理解するには、グリコーゲン貯蔵の酵素の研究が必要です。しかしながら、これらの酵素活性を研究するために最も一般的に使用される方法は、典型的には、すべての研究者が利用できるわけではない試薬または技術を使用する。ここでは、技術的に単純で費用効果が高く、それでもグリコーゲン貯蔵の制御に関する貴重な洞察を提供できる一連の手順について説明します。この技術は、330〜800nmの範囲で動作する分光光度計へのアクセスを必要とし、ユーザーが使い捨てのプラスチックキュベットを使用することを想定して説明されています。ただし、手順は容易に拡張でき、マイクロプレートリーダーで使用するために変更できるため、高度な並列分析が可能です。

グリコーゲン合成酵素活性の測定 図1 は、精製酵素を用いたグリコーゲン合成酵素アッセイの代表的な結果を示す。パネルAでは、わずかな遅れの後、約12分間、時間の経過とともに340nmでの吸収が直線的に減少しました。 図1A の吸収の変化率は~0.12吸光度単位/分であった。吸光度の変化速度は~0.010〜~0.20吸光度単位/分の間で最適で?...

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Spectrophotometric Methods for the Study of Eukaryotic Glycogen Metabolism

可視域で動作する単純な分光光度計を使用して、グリコーゲン代謝の重要な酵素の活性を測定する技術が提示されます。

真核生物グリコーゲン代謝研究のための吸光光度法

Glycogen is synthesized as a storage form of glucose by a wide array of organisms, ranging from bacteria to animals. The molecule comprises linear chains ...

プロトコルは、放射性同位元素の使用を回避し、多くの労働者がグリコーゲン代謝の酵素を研究することを妨げる可能性のある障壁を取り除くため、重要です。記載された手順は安価であり、単純な分光光度計へのアクセスのみを必要とする。グリコーゲンシンターゼ活性の測定から始めるには、UDPグルコース、ATP、ホスホエノールピルビン酸、およびNDPキナーゼの予め調製したストック溶液を氷上で解凍する。水浴を摂氏30度に予熱します。ストック溶液の準備ができたら、テキストプロトコルに記載されているように、試薬を15ミリリットルのチューブに追加することにより、グリコーゲンシンターゼアッセイの数に応じて十分なアッセイ混合物を調製します。反応混合物のNADHを水で置換してブランク反応を調製し、反応物を使い捨てメタクリレートキュベットに移します。ブランク反応を使用して、分光光度計の波長を340ナノメートルに設定します。1.5ミリリットルのチューブに反応混合物の770マイクロリットルのアリコートを1つ取り、NDPキナーゼとピルビン酸キナーゼ乳酸デヒドロゲナーゼ混合物をそれぞれ2マイクロリットルずつチューブに順次加えます。混合後、チューブを水浴中で摂氏30度で3分間静かにインキュベートし、反応混合物を予熱する。次に、グリコーゲンシンターゼを含むサンプル30マイクロリットルをpH 7.8の20ミリモルトリスバッファーに加え、穏やかに混合してから、反応混合物を廃棄メタクリレートキュベットに移します。キュベットを分光光度計に入れ、340ナノメートルの吸光度を10〜20分間、時間間隔で記録します。次に、得られた吸光度を時間に対してプロットする。放出されたグルコースを測定するには、加熱されたグリコーゲンサンプルから使い捨てメタクリレートキュベットに40マイクロリットルの上清を移します。そして、原稿に記載されているように、測定量のトリエタノールアミン、塩酸硫酸マグネシウム緩衝液、NADP ATP混合物および水を加える。気泡を発生させずに穏やかに上下にピペッティングして混合物を混合します。各キュベットに0.5マイクロリットルのグルコース-6-リン酸デヒドロゲナーゼを加える。ピペッティングで混合した後、混合物を室温で10分間インキュベートし、340ナノメートルの吸光度を記録します。次に、前述のように各キュベットに0.5マイクロリットルのヘキソキナーゼを混合し、15分間インキュベートしてから、340ナノメートルの吸収セットを記録する。その後、室温で5分間インキュベーションを続け、吸光度を記録した。吸収が15分で記録されたものから増加した場合は、340ナノメートルで最終的な吸収を記録する前に5分間インキュベーションを続けます。グリコーゲン分岐を決定するには、650マイクロリットルのヨウ素塩化カルシウムカラー試薬ストックを1.5ミリリットルのチューブ内の100マイクロリットルの水と組み合わせ、溶液を完全に混合してから使い捨てメタクリレートキュベットに移します。キュベットを分光光度計に入れて、330〜800ナノメートルのバックグラウンドスペクトルを収集する波長スキャンモードで実行を行います。別の1.5ミリリットルのチューブに、650マイクロリットルの作業用ヨウ素塩化カルシウムカラー試薬と50マイクログラムのカキグリコーゲンを混ぜ合わせ、水で最終容量を750マイクロリットルに構成します。混合物を完全にブレンドした後、溶液を使い捨てメタクリレートキュベットに移し、330〜800ナノメートルの吸収スペクトルを収集します。同様に、前述のように50マイクログラムのアミロペクチンおよび30マイクログラムのアミロースで吸収スペクトルを得る。特性評価されていないグリコーゲンサンプルの分岐構造の指標を得るには、25〜50マイクログラムのグリコーゲンと650マイクロリットルの作業ヨウ素塩化カルシウム呈色試薬を組み合わせ、前述のように進めて吸収スペクトルを取得します。グリコーゲン合成酵素アッセイでは、経時的に340ナノメートルでの吸収の直線的な減少が観察された。アッセイにグリコーゲンシンターゼを添加しすぎると、反応は最初の2分以内に完了しました。グリコーゲンシンターゼを含まない対照反応は、吸光度の測定可能な減少を示さなかった。精製酵素を用いたグリコーゲンホスホリラーゼアッセイからのデータは、3分間持続する線状相を有していた。毎分約0.01〜0.04単位の吸光度増加速度が最適です。グリコーゲン脱分岐酵素アッセイにおいて、反応は少なくとも10分間持続する線状相を示した。グリコーゲン分岐酵素アッセイの代表的なデータは、分岐酵素を含まない対照サンプルと分岐酵素を含む反応との間の吸光度の差を示した。アッセイの狭いダイナミックレンジが例示される。生成できる吸光度の最大変化は0.4吸光度単位であり、吸収の変化が約0.2吸光度単位である場合、直線性は失われます。グリコーゲン分岐評価に使用されたグリコーゲン、アミロペクチン、およびアミロースの質量は、それぞれ異なる吸光度の最大値で、約0.7〜0.8の最大吸光度測定値を示しました。グリコーゲンサンプルは、約400ナノメートルと460ナノメートルに2つのピークを生成しました。ヨウ素塩化カルシウム発色試薬は非常に濃いです。吸収スペクトルを収集する前に、グリコーゲンサンプルが試薬と完全に混合されていることを確認することが重要です。

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