Name: measuring photophysiology of attached stage of colacium sp. by a cuvette-type fast repetition rate fluorometer
Uploaded: 2021-11-12T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Measuring Photophysiology of Attached Stage of Colacium sp. by a Cuvette-Type Fast Repetition Rate Fluorometer at JoVE.com

Çalışma, Japonya Çevre Bakanlığı'nın Japon Bölgesel Canlandırma Hibesi ve Çevre Araştırma ve Teknoloji Geliştirme Fonu (No. 5-1607) kapsamında Shiga Vilayeti'nden "Su ortamının sağlamlığının korunması için su kalitesi ve göl tabanı ortamı üzerine çalışma" başlıklı İşbirlikçi Araştırma Fonu tarafından desteklenmiştir. https://www.kantei.go.jp/jp/singi/tiiki/tiikisaisei/souseikoufukin.html. Yazarlar, İngilizce dil incelemesi için Enago'ya (www.enago.jp) teşekkür eder.

1. Örnekleme
<ol><li>Göl suyunu yüzeyden bir kova ile toplayın. S. mucronata'ya bağlı Colacium sp.'yi hedeflemek için (Şekil 1A-C) 100 μm naylon ağ kullanarak 0.5-10 L göl suyunu filtreleyin52. NOT: S. mucronata genellikle sazlık (fragmitler) alanlar arasında olduğu gibi sığ, ötrofik, çamurlu sularda yoğun bir şekilde toplanır.</li>
	<li>Konsantre numuneleri 500 mL plastik şişeler...

Bu protokol ilk kez, doğal bir ortamda ekli aşama sırasında Colacium sp.'nin fotofizyolojisinin, AF-6 ortamındaki planktonik aşamasıyla karşılaştırılabilir olduğunu göstermiştir. Ek olarak, açlıktan ölen S. mucronata'nın bağırsak içeriği, yoğunluk ≤5 inds · mL−1 olduğunda taban çizgisini ve Chl-a floresansını etkilememiştir (Şekil 5 ve Şekil 6). Bu sonuçlar, bu protokolün düşük substr...

Klorofil değişken floresansı, alg fotosistem II (PSII) fotofizyolojisini ölçmek için yararlı bir araçtır. Algler, PSII fotofizyolojilerini değiştirerek aşırı ışık ve besin eksikliği gibi çeşitli çevresel streslere yanıt verir. Hızlı tekrarlama hızı florometresi (FRRf), PSII fotofizyolojisini1,2 ölçmek ve birincil üretkenliği tahmin etmek için yaygın bir yöntemdir1,3,4, fitoplankton PSII fotofizyolojisinin yanı sıra geniş uzamsal ve zamansal ölçeklerde birincil üretkenliğin izlenmesini sağlar5,6,7. FRRf aynı anda PSII (σ PSII) absorpsiyon kesitini, reaksiyon merkezi ([RCII]) konsantrasyonunu, maksimum fotokimyasal verimliliği (Fv / Fm), etkili fotokimyasal verimliliği (Fq ′ / Fm) ve fotokimyasal olmayan söndürmeyi (NPQNSV) ölçebilir (Tablo 1). Genel olarak, Fv/Fm ve Fq′/Fm′ PSII aktivitesi8 olarak tanımlanırken, NPQNSV göreceli ısı ile dağılmış enerji9 olarak tanımlanır.
Önemli olarak, FRRf'nin tek devirli (ST) flaşları, birincil kinon elektron alıcısı QA'yı tamamen azaltır, ancak plastokinon havuzunu azaltmaz. Tersine, bir darbe genlik modülasyonu (PAM) florometresinden gelen çoklu devir (MT) yanıp sönmeleri her ikisini de azaltabilir. ST yöntemi, Fv/Fm, Fq′/Fm′, NPQNSV ve σ PSII10'un geri kazanım kinetiğini eşzamanlı olarak ölçerek NPQNSV'nin olası kökenlerini belirlerken MT yöntemine göre açık bir avantaja sahiptir. Bugüne kadar, dalgıç tipi, küvet tipi ve akış tipi gibi çeşitli FRRf enstrümanları ticari olarak temin edilebilir. Dalgıç tipi FRRf, okyanuslarda ve göllerde yerinde ölçümlere olanak tanırken, küvet tipi FRRf, küçük numune hacimlerini ölçmek için uygundur. Akış tipi, yüzey sularındaki fitoplanktonların fotofizyolojisini sürekli olarak ölçmek için yaygın olarak kullanılır.
Çok çeşitli denekler için11 küvet tipi de dahil olmak üzere PAM florometrelerinin gelişimi göz önüne alındığında, PAM florometreleri alg fotofizyolojisi araştırmalarında FRRf'lerden hala daha yaygındır12. Örneğin, bu aletler arasındaki numune haznesi yapısı ve küvet kapasitesi sadece biraz farklılık gösterse de, küvet tipi PAM fitoplanktons13,14,15, bentik mikroalgler16,17,18, buz algleri19 ve epizoik alglere20 uygulanırken, küvet tipi FRRf öncelikle fitoplanktonlara21,22,23 uygulanmıştır. ve sınırlı sayıda buz alg topluluğu24,25. Etkinliği göz önüne alındığında, küvet tipi FRRf, bentik ve epizoik alglere eşit derecede uygulanabilir. Bu nedenle, uygulamasının genişletilmesi, özellikle daha az bilinen epizoik alg fotofizyolojisi için PSII fotofizyolojisi hakkında önemli bilgiler sağlayacaktır.
Epizoik algler, PSII fotofizyolojilerini20,26 inceleyen az sayıda çalışmayla, büyük olasılıkla sucul gıda ağlarındaki küçük rollerinden dolayı27,28 çok az dikkat çekmiştir. Bununla birlikte, epizoik algler de dahil olmak üzere epibiyontlar, üreme ve hayatta kalma oranlarının artması gibi zooplankton topluluk dinamiklerini29,30 ve ayrıca batma oranını29,31 ve görsel yırtıcılara karşı savunmasızlığı artırmak gibi süreçleri olumsuz yönde etkileyebilir32,33,34,35,36 . Bu nedenle, zooplankton topluluklarında epibiyont dinamiklerini kontrol eden çevresel ve biyolojik faktörlerin araştırılması çok önemlidir.
Epizoik algler arasında, Colacium Ehrenberg 1834 (Euglenophyta), ekli (Şekil 1A-D), hareketli olmayan planktonik (Şekil 1E, F) ve hareketli planktonik aşamalar dahil olmak üzere çeşitli yaşam aşamalarına sahip yaygın, tatlı su, alg grubu32,37,38,39'dur40,41 . Hareketli olmayan planktonik aşamada, hücreler müsilaj ile kaplı tek hücreli planktonlar, toplanmış koloniler veya tek katmanlı tabaka kolonileri olarak yaşarlar42. Ekli aşamada, Colacium sp., substrat organizmalarına (bazibiontlar), özellikle de mikrokabuklulara41,43 bağlanmak için hücrenin ön ucundan atılan müsilajı kullanır37,39,41. Yaşam döngüleri ayrıca erimiş dış iskeletten veya ölü bazibionttan ayrılmayı ve başka bir substrat organizması bulmak için flagellalarıyla yüzmeyi içerir39. Hem planktonik hem de ekli aşamalar mitoz ile popülasyon büyüklüklerini artırabilir40. Her ne kadar bunlara bağlı aşamalarının ışık44 ve eser elementler41,45,46 gibi kaynakları toplamak için evrimsel bir özellik olduğu veya bir dağılım stratejisi27 olduğu varsayılmış olsa da, bu yönlerle37,41,44 hakkında çok az deneysel kanıt mevcuttur ve anahtar bağlanma mekanizmaları büyük ölçüde bilinmemektedir. Örneğin, Rosowski ve Kugrens, Colacium'un dış iskelette47 yoğunlaşan substrat kopepodlarından41 manganez (Mn) elde etmesini beklediler.
Burada, planktonik alglerin PSII fotofizyolojisinin nasıl ölçüleceğini ve küvet tipi FRRf kullanarak Colacium sp. hücreleri ile bağlı algleri (zooplanktona bağlanarak) hedeflemek için ilgili uygulama yöntemini açıklıyoruz. 444 nm, 512 nm ve 633 nm48 merkezli flaş uyarma enerjisi sağlayan üç ışık yayan diyot (LED) ile donatılmış Act2 sistemini kullanıyoruz. Burada, 444 nm (mavi), krofil a'nın (Chl-a) absorpsiyon zirvesine karşılık gelirken, 512 nm (yeşil) ve 633 nm (turuncu) sırasıyla fikoeritrin ve fikosiyaninin absorpsiyon zirvelerine karşılık gelir. Floresan sinyal algılama zirvesi, 30 nm yarım bant genişliği ile 682 nm'dir. Colacium sp.'nin planktonik evresini doğal ortamlarda bulmak zor olduğundan, deneyler için ekli aşamaları toplanmıştır. Çok sayıda substrat organizması arasında, Scapholeberis mucronata O.F. Müller 1776 (Branchiopoda, Daphniidae; Şekil 1A, B, G), yavaş yüzme hızları, büyük vücut boyutları (400-650 μm) ve benzersiz davranışları (su yüzeyinde baş aşağı asılı) nedeniyle kullanımı en basit olanlardan biridir. Bu nedenle, bu protokol Kolacium-bazibiont sisteminin bir vaka çalışması olarak S. mucronata'ya bağlı Colacium sp.'yi kullanır. Bağırsak içeriğinden türetilen floresansı önlemek için, S. mucronata aç bırakıldı. Önceki bir çalışmada, bağırsak içeriğinden (yutulan algler) gelen floresan sinyalinin 40 dakika 49'dan sonra beş kat azalma gösterdiği bildirildiğinden, 90 dakikalık açlığın, FRRf ölçümünü etkileyen bağırsak içeriği floresansı olasılığını en aza indirmek için yeterli olacağını bekledik. Ayrıca, bu protokol Colacium sp.'nin bağlanma mekanizmasını açıklığa kavuşturmak ve iki metalin, kalsiyum (Ca) ve manganezin (Mn) hem planktonik hem de bağlı aşamaların fotofizyolojisini nasıl etkilediğini belirlemek için uygulanmıştır. Kalsiyum, fotosentetik yollarda50 birçok yönden kilit rol oynar ve PSII51'in oksijenle evrimleşen komplekslerini oluşturmak için her iki metal de gereklidir. Kalsiyum ve manganez, kabuklu zooplankton47'nin kabuğunda oldukça yoğunlaştığından, Colacium sp. fotofizyolojisinin, bu yaşam aşaması bu elementleri ekli aşamada S. mucronata'dan elde ederse, planktonik aşamada Ca ve Mn zenginleştirmesine daha belirgin bir şekilde yanıt verebileceğini varsayıyoruz.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Acrodisc syringe filter</td>
			<td>Pall Corporation, Ann Arbor, MI, USA</td>
			<td></td>
			<td>0.2 &#956;m pore size</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Act2Run</td>
			<td>CTG Ltd., West Molesey, UK</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Biotin</td>
			<td>Wako</td>
			<td>023-08711</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CaCl2&#183;2H2O</td>
			<td>Wako</td>
			<td>031-25031</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CaCO3</td>
			<td>Wako</td>
			<td>036-00382</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Citric acid</td>
			<td>Wako</td>
			<td>036-05522</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CoCl2&#183;6H2O</td>
			<td>Wako</td>
			<td>036-03682</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Concentrated Chlorella</td>
			<td>Recenttec, Tokyo, Japan</td>
			<td></td>
			<td>20 mg C&#183;mL&#8722;1 ; store at 4 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FastOcean Act2</td>
			<td>CTG Ltd., West Molesey, UK</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fe-citrate</td>
			<td>Wako</td>
			<td>093-00952</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FeCl3&#183;6H2O</td>
			<td>Wako</td>
			<td>091-00872</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HCLP-880PF</td>
			<td>Nippon Medical and Chemical Instruments 
			&#160;Co., Ltd., Osaka, Japan</td>
			<td></td>
			<td>With LED light bulbs</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>K2HPO4</td>
			<td>Wako</td>
			<td>160-04292</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>KH2PO4</td>
			<td>Wako</td>
			<td>167-04241</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MgSO4&#183;7H2O</td>
			<td>Wako</td>
			<td>137-00402</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MnCl3&#183;4H2O</td>
			<td>Wako</td>
			<td>139-00722</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Na2EDTA</td>
			<td>Wako</td>
			<td>343-01861</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Na2MoO4</td>
			<td>Wako</td>
			<td>196-02472</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NaNO3</td>
			<td>Wako</td>
			<td>191-02542</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NH4NO3</td>
			<td>Wako</td>
			<td>015-03231</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Plankton Counter</td>
			<td>Matsunami Glass, Osaka, Japan</td>
			<td>S6300</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pylex test tube</td>
			<td>CTG Ltd., West Molesey, UK</td>
			<td></td>
			<td>With rim, 16 x 100 mm</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vit. B1</td>
			<td>Wako</td>
			<td>203-00851</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vit. B12</td>
			<td>Wako</td>
			<td>226-00343</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vit. B6</td>
			<td>Wako</td>
			<td>165-05401</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ZnSO4&#183;7H2O</td>
			<td>Wako</td>
			<td>264-00402</td>
			<td>AF-6 medium</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

measuring photophysiology of attached stage of colacium sp. by a cuvette-type fast repetition rate fluorometer

Hızlı tekrarlama hızı florometresi (FRRf), fotosistem II (PSII) fotofizyolojisini ve birincil üretkenliği ölçmek için faydalı bir yöntemdir. FRRf, çeşitli ökaryotik algler ve siyanobakteriler için PSII absorpsiyon kesitini (σ PSII), maksimum fotokimyasal verimliliği (Fv / Fm), etkili fotokimyasal verimliliği (Fq ′ / Fm ′) ve fotokimyasal olmayan söndürmeyi (NPQNSV) ölçebilse de, bugüne kadar neredeyse tüm FRRf çalışmaları fitoplanktonlara odaklanmıştır. Burada, protokol epizoik alg Colacium sp'nin PSII fotofizyolojisinin nasıl ölçüleceğini açıklamaktadır. Ehrenberg 1834 (Euglenophyta), ekli aşamasında (zooplanktona bağlı), küvet tipi FRRf kullanarak. İlk olarak, substrat zooplanktonunun (Scapholeberis mucronata O.F. Müller 1776, Cladocera, Daphniidae) bazal floresan ve σ PSII, Fv / Fm, Fq′ / Fm′ ve planktonik Colacium sp'nin NPQNSV'si üzerindeki etkilerini tahmin ettik. Bu metodolojiyi doğrulamak için, S. mucronata'ya bağlı Colacium sp.'nin fotofizyoloji ölçümlerini kaydettik ve bu sonuçları planktonik aşamasıyla karşılaştırdık. Temsili sonuçlar, protokolün kalsiyum (Ca) ve manganezin (Mn) Colacium sp. fotofizyolojisi üzerindeki etkilerini nasıl belirleyebileceğini ve Mn zenginleştirmenin bağlı ve planktonik aşamalar arasındaki çeşitli etkilerini nasıl tanımlayabileceğini göstermiştir. Son olarak, bu protokolün diğer perifitik alglere uyarlanabilirliğini tartışıyoruz.

S. mucronata tarafından 5 bireye (inds.) mL−1'e kadar bazal floresan (Şekil 5) veya Chl-a floresansının (Şekil 6) anlamlı bir etkisi yoktu. Bununla birlikte, Fv / Fm ve NPQNSV, S. mucronata 7.5 inds · mL − 1 olduğunda önemli ölçüde etkilendi. Bu nedenle, ekli aşamada Colacium sp.'nin fotofizyolojisini ölçmek için, küvette yeterli <e...

Watch this Scientific Journal Video about Measuring Photophysiology of Attached Stage of Colacium sp. by a Cuvette-Type Fast Repetition Rate Fluorometer at JoVE.com

Measuring Photophysiology of Attached Stage of Colacium sp. by a Cuvette-Type Fast Repetition Rate Fluorometer

Hızlı tekrarlama hızı florometresi (FRRf), fotosistem II fotofizyolojisini ve birincil üretkenliği ölçmek için faydalı bir yöntemdir. Burada, küvet tipi FRRf kullanarak substrat zooplankton üzerindeki epizoik alglerin, Colacium sp.'nin PSII fotofizyolojisini ölçmek için bir protokol tarif ediyoruz.

Colacium sp.'nin Bağlı Aşamasının Fotofizyolojisinin Küvet Tipi Hızlı Tekrarlama Hızı Florometresi ile Ölçülmesi

Fast repetition rate fluorometer (FRRf) is a beneficial method for measuring photosystem II (PSII) photophysiology and primary productivity. Although FRRf ...

Bu protokol, bağlı alglerin fotosentetik aktivitesini, tıpkı doğada olduğu gibi hala planktona bağlanırken ölçer. Bu tekniğin temel avantajı, fotofizyolojinin ölçümünün numunenin dikkati dağılmadan gerçek zamanlı olarak yapılabilmesidir. Zooplankton bireylerinin temel floresan üzerindeki etkilerini incelemek için, yetişkin scapholeberis mucronata'yı kültürden herhangi bir organizmaya bağlı olmadan hazırlayın.Şimdi FLW'deki bireyleri bağırsak içeriğinden floresan önlemek için en az 90 dakika boyunca 20 santigrat derecede aç bırakın. Bir küvete 1,5 mililitre FWL dökün. İstediğiniz s sayısını alın.100 kat büyütmede optik mikroskop altında pipet kullanan mucronata bireyleri ve bunları küvete aktarır. Numune hacmini 2 mililitreye çıkarmak için FLW ekleyin ve hızlı tekrarlama hızı florometre ölçümünden 15 dakika önce 20 santigrat derecede düşük ışık altında alışmasına izin verin. Ardından, ölçümü başlatmak ve ölçümleri numune başına üç defadan fazla tekrarlamak için "çalıştırmak için harekete geç" düğmesine tıklayın.Elde edilen grafikten F0 değerini okuyun. 100 kat büyütmede optik mikroskop altında bir pipet kullanarak erimiş bir karapaks ile kolakyum türlerini toplayın ve FLW ile yıkayın. AF-6 ortamındaki kolakyum türlerini temiz bir tezgahta 10 mililitrelik bir cam tüpte aseptik olarak aşılayın.Kültürü, bir büyüme odasında NC2 sıcaklığında tutun, hücre yerleşimini önlemek için cam tüpü günde en az bir kez elle hafifçe sallayın. Zooplankton bireylerinin kolakyum türlerinden bir floresan klorofil üzerindeki etkilerini incelemek için, herhangi bir bağlı organizma olmadan yetişkin s. mucronata kullanın.Bağırsak içeriğinden floresan önlemek için, FLW'deki bireyleri en az 90 dakika aç bırakın. Küvet tipi hızlı tekrarlama oranı florometresi kurun. Şimdi önceden kültürlenmiş kolakyum türlerinin 1,5 mililitrelik bir alt örneğini bir küvete dökün.Daha sonra istenen sayıda s. mucronata bireyini bu küvetlere aktarın ve numune hacmini filtrelenmiş ortamla 2 mililitreye kadar getirin. Hızlı tekrarlama hızı florometre ölçümünü yapmadan önce bireyleri 20 santigrat derecede düşük ışık altında 15 dakika boyunca alıştırın.Ölçümü başlatmak için "çalıştırmak için harekete geç" seçeneğine tıklayın, ölçümleri numune başına üç defadan fazla tekrarlayın. Elde edilen grafikten F0 ve FM değerlerini okuyun. Temel floresanı düzeltmek için, 0,2 mikrometrelik dökme boyutunda bir filtre kullanarak kültür ortamını filtreleyin ve floresanı ölçün.Colacium türlerinin F0 ve FM'sinden taban çizgisi örneğinin F0'ını çıkarın veya seçenekler sekmesindeki ayarlardaki boş düzeltme değerini değiştirin.Sonra FLW kullanarak s. mucronata'yı yıkayın. Transfer s.100 mililitre FLW'ye mucronata ve açlık için 90 dakika boyunca NC2 sıcaklığında karanlık koşullar altında saklayın. Bir küvete 1,5 mililitre FLW dökün. Yaklaşık on s aktarın.Colacium türlerine sahip mucronata bireyleri bir küvete ve numuneyi 2 mililitreye çıkarmak için FLW ekleyin. Bireyleri N2C sıcaklığında düşük ışık altında 15 dakika boyunca iklimlendirin ve metin yazısında belirtildiği gibi klorofil bir floresan ölçün. Bağlı hücrelerin sayısını numaralandırmak için, hızlı tekrarlama hızı florometre ölçümünü aldıktan sonra numuneyi% 2 glutaraldehit ile sabitleyin.Daha sonra ışık mikroskobu altında s. mucronata'nın çeşitli odak derinliklerinde ve konumlarında fotoğraf çekin. Taban çizgisi floresansı veya klorofil a floresan üzerinde s ile anlamlı bir etki yoktu.mililitre başına 5 kişiye kadar mukronata. Bununla birlikte, maksimum fotokimyasal verimlilik ve fotokimyasal olmayan söndürme, s. mucronata yoğunluğu mililitre başına 7.5 kişi olduğunda önemli ölçüde etkilenmiştir.Bağlanma aşamasında kolakyum türlerinin fitofizyolojisindeki mevsimsel değişiklikler ve AF-6 ortamındaki durağan faz için planktonik aşama, benzer ortalama maksimum fotokimyasal verimlilik ve fotokimyasal olmayan söndürme göstermiştir. Karanlık koşullar altında kolakyum türlerinin ekli aşaması için, fotokimyasal olmayan söndürmenin üç saat sonra manganez için kalsiyumdan daha yüksek olması ve 21 saatte düşük ışık yoğunluğunda olması dışında, fotofizyolojik parametrelerde anlamlı bir fark yoktu. Planktonik aşama için, PS2 absorpsiyon kesiti manganezde üç saatte kalsiyum tedavisinden önemli ölçüde daha düşüktü.Etkili fotokimyasal verimlilik önemli ölçüde daha yüksekti, ancak fotokimyasal olmayan söndürme, manganez tedavisinde 21 saatteki kontrolden daha düşüktü. Artan ışık altında, manganez, PS2 absorpsiyon kesitini üç saatte, fotokimyasal olmayan söndürmede 21 saatte azaltma eğilimindeyken, üç saatte etkili fotokimyasal verimliliği artırdı. Kalsiyum, artan ışık altında fotokimyasal olmayan söndürmeyi biraz geliştirdi.Bununla birlikte, etkili fotokimyasal verimliliği üç saatte azalttı. En önemli şey, substrat organizmalarının etkisidir. Algler farklı türlere veya malzemelere bağlanırsa, etki farklı olabilir.Bu protokole ek olarak, karbon fiksasyonunun veya oksijen üretim oranlarının ölçülmesi, kalsiyum verimliliğinin deneysel manipülasyonlara tepkisini açıklığa kavuşturmak için yararlıdır. Bu protokol, bağlı alglerin fotosentetik aktivitesinin çevresel değişikliklere nasıl tepki verdiğini açıklığa kavuşturmamızı sağlar.

Research

JoVE Journal

Biology

Measuring Photophysiology of Attached Stage of Colacium sp. by a Cuvette-Type Fast Repetition Rate Fluorometer

Preparation of Neuronal Cultures from Midgastrula Stage Drosophila Embryos

Nöronal Kültürler Midgastrula Sahne Drosophila Embriyolar hazırlanması

This video illustrates the procedure for making primary neuronal cultures from midgastrula stage Drosophila embryos. The methods for collecting embryos ...

Chromatin Immunoprecipitation Assay for Tissue-specific Genes using Early-stage Mouse Embryos

Erken evre Fare Embriyolar kullanarak Doku özel Genler Kromatin Immunoprecipitation Testi

Chromatin immunoprecipitation (ChIP) is a powerful tool to identify protein:chromatin interactions that occur in the context of living cells 1-3. This ...

Measuring Fast Calcium Fluxes in Cardiomyocytes

Hızlı Kalsiyum Dekapanları kardiyomiyositlerde Ölçme

Cardiomyocytes have multiple Ca2+ fluxes of varying duration that work together to optimize function 1,2. Changes in Ca2+ activity in response to ...

Improving the Success Rate of Protein Crystallization by Random Microseed Matrix Screening

Rastgele Microseed Matrix ELEME Protein Belirginleşmesine Başarı Oranı artırma

Random microseed matrix screening  (rMMS) is a protein crystallization technique in which seed crystals are added  to random screens. By increasing the ...

Monitoring Functionality and Morphology of Vasculature Recruited by Factors Secreted by Fast-growing Tumor-generating Cells

Hızlı büyüyen Tümör üreten hücreleri tarafından salgılanan faktörler tarafından işe alınmış İzleme İşlevsellik ve vaskülatürüne morfolojisi

The subcutaneous matrigel plug assay in mice is a method of choice for the in vivo evaluation of pro- and anti-angiogenic factors. In this method, desired ...

One-channel Cell-attached Patch-clamp Recording

Tek kanallı bir hücre-bağlı Patch-clamp kayıt

Ion channel proteins are universal devices for fast communication across biological membranes. The temporal signature of the ionic flux they generate ...

In Vivo 4-Dimensional Tracking of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Adult Mouse Calvarial Bone Marrow

In Vivo 4-Dimensional Tracking of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Adult Mouse Calvarial Bone Marrow

Yetişkin Fare Kalvaryal Kemik İliği içinde Hematopoietik kök hücrelerin Vivo 4-Boyutlu Takip

Through a delicate balance between quiescence and proliferation, self renewal and production of differentiated progeny, hematopoietic stem cells (HSCs) ...

Generation of Enterobacter sp. YSU Auxotrophs Using Transposon Mutagenesis

Generation of Enterobacter sp. YSU Auxotrophs Using Transposon Mutagenesis

Üretilmesi<em&gt; Enterobacter</em&gt; Sp. YSU oksotroflan transpozon mutajenezi kullanarak,

Prototrophic bacteria grow on M-9 minimal salts medium supplemented with glucose (M-9 medium), which is used as a carbon and energy source. Auxotrophs can ...

Floral-Dip Transformation of Flax (Linum usitatissimum) to Generate Transgenic Progenies with a High Transformation Rate

Floral-Dip Transformation of Flax Linum usitatissimum to Generate Transgenic Progenies with a High Transformation Rate

Keten Çiçekli-Dip Dönüşüm (<em&gt; Linum usitatissimum</em&gt;) Yüksek Dönüşüm Oranı ile Transgenik progeny&#39;lerinde oluşturmak için

Agrobacterium-mediated plant transformation via floral-dip is a widely used technique in the field of plant transformation and has been reported to be ...