Name: using a cyclic ion mobility spectrometer for tandem ion mobility experiments
Uploaded: 2022-01-20T15:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Using a Cyclic Ion Mobility Spectrometer for Tandem Ion Mobility Experiments at JoVE.com

S.O., doktorasını finanse ettiği için Fransız Ulusal Araştırma Ajansı'na müteşekkirdir (hibe ANR-18-CE29-0006).

NOT: Protokole genel bir bakış Şekil 1'de verilmiştir. Bu protokolde açıklanan deneyler için kullanılan parametreler Ek Tablo S1 ve Ek Tablo S2'de bulunabilir.
1. Numune çözeltisinin hazırlanması
NOT: Protokol, örnek olarak bir arabinoksilan pentasakkarit (23-α-L-arabinofuranosil-ksilotetraoz veya XA2XX; Malzeme Tablosuna bakınız) kul...

SELECT SERİSİ Döngüsel IMS, yukarı akış kromatografik ayrımına gerek kalmadan belirli bir m/z ve iyon hareketliliğinin tanımlanmış bir iyon popülasyonunun seçilmesini sağlayan güçlü bir araçtır. Cihaz, hem MS / MS hem de IMS / IMS spektrumlarının çıkarılabileceği bu iyon popülasyonunun iki boyutlu parçalanma haritasını oluşturma imkanı sunar. Bununla birlikte, kullanıcı deneysel süreç sırasında dikkat edilmesi gereken birkaç kritik noktaya dikkat etmelidir.
<p class="j...

Biyomoleküllerin tam kimyasal karakterizasyonu, altta yatan biyolojik ve fonksiyonel özelliklerini anlamanın anahtarıdır. Bu amaçla, son yıllarda kimyasal yapıların biyolojik konsantrasyonlarda büyük ölçekli karakterizasyonunu amaçlayan "omik" bilimleri gelişmiştir. Proteomik ve metabolomikte MS, biyolojik ortamda bulunan yapısal heterojenliği çözmek için temel bir araç haline gelmiştir - özellikle duyarlılığı ve tandem MS (MS / MS) yoluyla yapısal bilgi sağlama yeteneği sayesinde. MS / MS stratejilerinde, bir iyon kütlesine göre seçilir, daha sonra parçalanır ve son olarak, molekülün parmak izini oluşturmak için parçalarının kütleleri elde edilir. MS/MS spektrumları, özellikle, spektral veritabanlarını1,2 eşleştirmek veya üst yapıları geçici olarak yeniden yapılandırmak için kullanılabilir3,4. Benzer spektrumların benzer bileşiklere ait olduğu varsayımı altında, MS / MS verileri, ilgili türleri benzerlik skoru ile birbirine bağlayan moleküler ağlar (MN'ler) oluşturmak için de kullanılabilir5,6.
Bununla birlikte, MS'in iyonların kütle-yük oranını (m / z) tespit etme konusundaki doğal özelliği nedeniyle, teknik (stereo) izomerizm aralığına giren bir dizi yapısal özelliğe kördür. Örneğin, karbonhidratlar, çoğu stereoizomerler veya hatta epimerler olan birkaç monosakkarit alt biriminden oluşur (örneğin, Glc vs Gal veya Glc vs Man). Bu alt birimler, bağlantının konumuna (regioizomerizm) ve anomerik karbonun sterik konfigürasyonuna (anomerizm) göre farklılık gösterebilen glikosidik bağlarla bağlanır. Bu özellikler, bağımsız MS'in karbonhidrat izomerleri arasında ayrım yapmasını zorlaştırır7 ve yüksek enerjili aktivasyon yöntemleri kullanılarak yalnızca regioizomerizm ele alınabilir8,9,10. Derevcilleştirme, stereoizomerik grupların eşdeğerliğini bozmak için bir seçenek olsa da11, kapsamlı numune hazırlama gerektirir. Bir başka, daha basit seçenek, MS'i IMS gibi izomerizme duyarlı analitik bir boyutla birleştirmektir.
Bu protokol, IMS'nin temel kavramlarına zaten aşina olan kullanıcılar için tasarlandığından ve ayrıntılı incelemeler başka bir yerde mevcut olduğundan12,13, IMS ilkelerine yalnızca kısa bir genel bakış burada verilmiştir. IMS, iyonların bir tampon gaz ve bir elektrik alanı ile etkileşimine dayanan ve sonuçta iyonları gaz fazı konformasyonlarına göre ayıran bir gaz fazı ayırma yöntemidir. Ticari aletlerde MS'e bağlı farklı IMS prensipleri bulunabilir: bazıları alternatif yüksek ve düşük elektrik alanlarında (alan asimetrik IMS, FAIMS) çalışırken, çoğu düşük alan sınırı içinde çalışır - özellikle sürüklenme tüpü IMS (DTIMS, doğrusal olarak azalan elektrik alanı), hareketli dalga IMS (TWIMS, simetrik potansiyel dalgalar) ve sıkışmış IMS (TIMS, elektrik alanlarına karşı tampon gazı yakalama iyonlarının yüksek akışı)13 . Düşük alan yöntemleri, ayırma sırasında tampon gazı ile etkileşime giren iyonun yüzeyini (Å2 veya nm2 cinsinden) temsil eden iyon-gaz çiftinin bir özelliği olan CCS'ye erişime izin verir. CCS teorik olarak cihazdan bağımsızdır ve bu nedenle farklı laboratuvarlar arasında çoğaltılabilecek veriler üretmek için yararlıdır14. İyon hareketliliği ayırmaları, çeşitli parametrelerden ve özellikle hareketlilik hücresindeki gaz basıncı ve gaz sıcaklığındaki dalgalanmalardan etkilenebilir. CCS kalibrasyonu bunu düzeltmenin bir yoludur, çünkü hem kalibrant hem de ilgili türler benzer şekilde etkilenecektir13. Bununla birlikte, cihazın sıcaklık kontrollü bir odaya monte edilmesi ve güvenilir bir gaz basıncı kontrol sistemine sahip olması zorunludur.
IMS'nin ilginç bir evrimi, ilk olarak 2006 yılında Clemmer'in grubu tarafından MS / MS15,16'nın bir analoğu olarak tanıtılan IMS / IMS'dir. IMS / IMS'de, ilgilenilen bir iyon, iyon hareketliliğine bağlı olarak seçici olarak izole edilir; daha sonra aktive edilir (olası parçalanmaya kadar) ve aktive edilen iyonun veya parçaların yeni bir IMS analizi gerçekleştirilir. İlk enstrümantal tasarımda, aktivasyonun durduğu bir iyon hunisi ile ayrılan iki IMS hücresi seri olarak yerleştirildi. O zamandan beri, bir dizi IMS / IMS kurulumu önerilmiş olsa da (bir inceleme için Eldrid ve Thalassinos17'ye bakınız), IMS / IMS özelliğine sahip ilk ticari kütle spektrometresi yalnızca 201918'de kullanıma sunuldu. Bu cihaz, ilk konsepti başka bir teknolojik atılımla birleştirerek önemli ölçüde geliştirdi: IMS hücresinin döngüsel tasarımı.
Döngüsel IMS hücresi teorik olarak sürüklenme yolu uzunluğunun ve dolayısıyla cihazın çözme gücünün neredeyse sonsuz olarak artmasına izin verir19. Bu, döngüsel TWIMS hücresinin ana iyon optik eksenine ortogonal olarak yerleştirildiği belirli bir alet geometrisi ile elde edildi. IMS hücresinin girişindeki çok işlevli bir dizi bölgesi, iyon yolunun yönünü kontrol etmeyi sağlar: (i) iyonları IMS ayrımı için yana doğru göndermek, (ii) MS algılaması için ileri veya (iii) IMS hücresinden geriye doğru bir dizi öncesi hücrede saklanmak. Bu ön dizi depo hücresinden, iyonlar aktive edilebilir ve fragmanlar, stereoizomerleri20 karakterize etmek için başarıyla kullanılan bir yaklaşım olan iyon hareketliliği ölçümü için IMS hücresine yeniden enjekte edilebilir. Nihayetinde, toplanan veriler öncü ve parçaları için iyon hareketliliği ve m / z bilgilerini içerir.
Bu döngüsel tasarımı glikan analizleri için kullanan yakın tarihli bir yayında (Ollivier ve ark.21), bu tür IMS / IMS verilerinde bulunan parçaların hareketlilik profilinin, moleküler bir ağ stratejisinde kullanılabilecek bir biyomolekülün parmak izi gibi davrandığını gösterdik. IM-MN adı verilen ortaya çıkan ağ, glikomik veri kümelerinin yapısal olarak ilgili bir şekilde düzenlenmesine yol açarken, yalnızca MS / MS verilerinden (MS-MN) oluşturulan ağ çok az bilgi ortaya çıkardı. Bu yayını tamamlamak ve Döngüsel IMS kullanıcılarının bu iş akışını uygulamasına yardımcı olmak için bu protokol, verileri toplamak için kullanılan protokolün tam bir açıklamasını sağlar. Bu protokol yalnızca kullanıcıların IM-MN ağları oluşturmak için kullanabilecekleri IMS/IMS verilerinin oluşturulmasına odaklanır (bkz. 21) veya seçtikleri başka bir uygulama için. IM-MN'nin oluşturulması burada dikkate alınmayacaktır, çünkü moleküler ağ protokolleri zaten mevcuttur22. Değerli ve tekrarlanabilir IMS/IMS satın alımları oluşturmak için uyulması gereken önemli noktalar vurgulanmaktadır. Ollivier ve ark. tarafından incelenen oligosakkaritlerden birinin örneğini ele alalım. 21, aşağıdaki adımlar detaylandırılmıştır: (i) numune hazırlama, (ii) Döngüsel IMS cihazının ayarı, (iii) verilerin otomatik pik toplama ve (iv) CCS kalibrasyonu.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>33-&#945;-L- plus 23-&#945;-L-Arabinofuranosyl-xylotetraose (XA3XX/XA2XX) mixture</td>
			<td>Megazyme Ltd., Wicklow, Ireland</td>
			<td>O-XAXXMIX</td>
			<td>XA2XX + XA3XX mixture</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>33-&#945;-L-Arabinofuranosyl-xylotetraose (XA3XX)</td>
			<td>Megazyme Ltd., Wicklow, Ireland</td>
			<td>O-XA3XX</td>
			<td>Pure XA3XX standard</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Eppendorf Safe-Lock Tubes, 1.5 mL, Eppendorf Quality, colorless, 1,000 tubes</td>
			<td>Eppendorf, Hamburg, Germany</td>
			<td>0030120086</td>
			<td>Used to prepare the carbohydrate stock solution and dilution</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FALCON 50 mL Polypropylene Conical Tube 30 x 115 mm</td>
			<td>Corning Science M&#233;xico S.A. de C.V., Reynosa, Tamaulipas, Mexico</td>
			<td>352070</td>
			<td>Used to prepare the aqueous stock solution of 100 mM LiCl</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lithium Chloride (ACS reagent, &#8805;99 %)</td>
			<td>Sigma-Aldrich Inc., Saint Quentin Fallavier, France</td>
			<td>310468</td>
			<td>Used to dope the sample with lithium</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Major Mix IMS/Tof Calibration Kit</td>
			<td>Waters Corp., Wilmslow, UK</td>
			<td>186008113</td>
			<td>Calibration solution for MS and IMS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MassLynx 4.2 SCN1016 Release 6 (Waters Embedded Analyser Platform for Cyclic IMS 2.9.1 Release 9)</td>
			<td>Waters Corp., Wilmslow, UK</td>
			<td>721022377</td>
			<td>Cyclic IMS vendor software for instrument control and data processing</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol for HPLC PLUS Gradient grade</td>
			<td>Carlo-Erba Reagents, Val de Reuil, France</td>
			<td>412383</td>
			<td>High-purity solvent</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MS Leucine Enkephaline Kit</td>
			<td>Waters Corp., Wilmslow, UK</td>
			<td>700002456</td>
			<td>Reference compound used for tuning of the mass spectrometer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SCHOTT DURAN 100 mL borosilicate glass bottle</td>
			<td>VWR INTERNATIONAL, Radnor, Pennsylvania, US</td>
			<td>218012458</td>
			<td>Used to prepare the solution of 500 &#181;M LiCl in 50:50 MeOH/Water</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SELECT SERIES Cyclic IMS</td>
			<td>Waters Corp., Wilmslow, UK</td>
			<td>186009432</td>
			<td>Ion mobility-mass spectrometer equipped with a cylic IMS cell</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Website: http://mzmine.github.io/</td>
			<td>MZmine Development Team</td>
			<td>-</td>
			<td>Link to download the MZmine software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Website: https://github.com/siollivier/IM-MN</td>
			<td>INRAE, UR BIA, BIBS Facility, Nantes, France</td>
			<td>-</td>
			<td>Link to an in-house R script containing a CCS calibration function</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

using a cyclic ion mobility spectrometer for tandem ion mobility experiments

Kimyasal yapıların doğru karakterizasyonu, altta yatan biyolojik mekanizmaları ve fonksiyonel özelliklerini anlamak için önemlidir. Kütle spektrometresi (MS) popüler bir araçtır, ancak tüm yapısal özellikleri tamamen ortaya çıkarmak için her zaman yeterli değildir. Örneğin, karbonhidratlar biyolojik olarak alakalı olmasına rağmen, karakterizasyonları sayısız izomerizm seviyesi ile karmaşıktır. İyon hareketlilik spektrometresi (IMS) ilginç bir tamamlayıcıdır çünkü iyon konformasyonlarına ve dolayısıyla izomerizme duyarlıdır. 
Ayrıca, son gelişmeler tekniği önemli ölçüde geliştirmiştir: son nesil Döngüsel IMS cihazları, doğrusal IMS cihazlarına kıyasla, artan çözme gücü veya tandem iyon hareketliliği (IMS / IMS) deneyleri gerçekleştirme olasılığı gibi ek yetenekler sunmaktadır. IMS / IMS sırasında, bir iyon iyon hareketliliğine göre seçilir, parçalanır ve parçaları hakkında iyon hareketliliği bilgisi elde etmek için yeniden analiz edilir. Son zamanlarda yapılan çalışmalar, bu tür IMS / IMS verilerinde bulunan parçaların hareketlilik profillerinin, belirli bir glikanın parmak izi olarak hareket edebileceğini ve glikomik veri kümelerini yapısal olarak ilgili bir şekilde düzenlemek için moleküler bir ağ stratejisinde kullanılabileceğini göstermiştir. 
Bu protokolün amacı, numune hazırlamadan, tekrarlanabilir spektrumlar veren iyon hareketlilik boyutunun son Çarpışma Kesiti (CCS) kalibrasyonuna kadar IMS / IMS verilerinin nasıl üretileceğini tanımlamaktır. Bir temsili glikan örneğini alarak, bu protokol bir Döngüsel IMS cihazı üzerinde bir IMS / IMS kontrol dizisinin nasıl oluşturulacağını, IMS varış zamanını sürüklenme zamanına (yani, iyonlara uygulanan etkili ayırma süresi) çevirmek için bu kontrol dizisinin nasıl hesaplanacağını ve ham verilerden ilgili hareketlilik bilgilerinin nasıl çıkarılacağını gösterecektir. Bu protokol, bir IMS/IMS deneyinin kritik noktalarını açıkça açıklamak ve böylece yeni Döngüsel IMS kullanıcılarının basit ve tekrarlanabilir alımlar gerçekleştirmesine yardımcı olmak için tasarlanmıştır.

Bu protokolü göstermek için örnek olarak bir arabinoksilan pentasakkarit, XA2XX seçildi. Bu bileşik ticari olarak temin edilebilir, ancak yalnızca başka bir arabinoksilan pentasakkarit, XA3XX (saf XA3XX de ticari olarak temin edilebilir) ile bir karışım olarak temin edilebilir. XA2XX ve XA3XX'in yapıları Ek Şekil S1'de verilmiştir. Ticari karışımdaki XA2XX ve XA3XX oranı ~ 50:50 olduğundan, karışımın 20 μg / mL'sin...

Watch this Scientific Journal Video about Using a Cyclic Ion Mobility Spectrometer for Tandem Ion Mobility Experiments at JoVE.com

Using a Cyclic Ion Mobility Spectrometer for Tandem Ion Mobility Experiments

İyon hareketlilik spektrometresi (IMS), biyomoleküllerin karakterizasyonu için kütle spektrometrisinin ilginç bir tamamlayıcısıdır, özellikle izomerizme duyarlı olduğu için. Bu protokol, bir molekülün izolasyonuna ve parçalarının hareketlilik profillerinin oluşturulmasına izin veren bir tandem IMS (IMS / IMS) deneyini tanımlar.

Tandem İyon Hareketlilik Deneyleri için Döngüsel İyon Hareketlilik Spektrometresi Kullanma

Accurate characterization of chemical structures is important to understand their underlying biological mechanisms and functional properties. Mass ...

Protokol, kütle spektrometresinde bir molekülün aktivasyonu üzerine üretilen parçalar için bir iyon hareketlilik profilinin nasıl kaydedileceğini ve izomerik yapılar arasında ayrım yapılacağını açıklar. Protokol, glikanların bazı temel yapısal özelliklerine göre 11 gruba ayrılmasına izin verir ve böylece elde edilmesi zor bir bilgi sağlar. Son derece jenerik olan ve birçok araştırma alanında ilgi çekici metabolitler veya ilaçlar gibi birçok moleküler aileye uygun moleküler ağlar oluşturmaya hizmet edebilir.Bu yaklaşım, iyon hareketlilik spektrometrisinde yeni bir kavramdan en iyi şekilde yararlanır ve kütle spektrometrisinin tek başına iki yapı arasında ayrım yapamayacağı durumlarda yararlı olacaktır. Deney, kütle spektrometresi ve iyon hareketliliği konusunda iyi bir hakimiyet gerektirir. Bununla birlikte, deneyci, adımların her birini dikkatlice takip ederse, yöntemi uygulamada başarılı olmalıdır.Prosedürü gösteren, laboratuvarımdan doktora öğrencisi Simon Ollivier olacak. Başlamak için Ayar sayfasından tek geçişli bir IMS dizisi ayarlayın, aleti Mobilite moduna geçirin ve Döngüsel Sıra Denetimi penceresini açın. Bu yeni pencerenin Döngüsel İşlevler sekmesinden Gelişmiş mod'u, Paket Ekle'yi ve ardından Tekli/Çok Geçişli'yi seçin.Aynı pencerenin Sıra sekmesinde bir dizi mobilite olayının görünmesini bekleyin. Sekansı, tüm kalibrant iyonlarının döngüsel IMS yarış pistinin etrafında tek bir geçiş yapması için uyarlayın. Enjekte etme süresini veya Çıkarma ve Edinme süresini değiştirmeyin, ancak Ayrı süreyi bir milisaniyeye düşürün.Kalibrasyon karışımının bazı iyonları görüntülenen varış zamanı penceresine sığmazsa, ADC Ayarları sekmesindeki kutu başına itme sayısını artırarak IMS'nin ortogonal ivmeli TOF analizörünün iticisiyle senkronizasyonunu değiştirin. Döngüsel Sıra Denetimi penceresinde iki dakikalık bir alımı kaydetmek için, Edinme Ayarları açılır penceresini açmak için Al'a tıklayın, Dosya Adı, Açıklama ve Edinme Uzunluğu, dakikalar girin ve Kaydet'e tıklayın. Sinyalin kararlılığını kontrol etmek için cihazı MS Tune sayfasından TOF moduna geçirin.Bir dakika boyunca numunenin tam bir MS alımını kaydedin, bu da izotopik paterni ve potansiyel kirleticilerin varlığını kontrol etmek için yararlı olacaktır. Cihazı ana Ayar sayfasının Quad/MS profil sekmesinden MSMS moduna getirin. Kuadrupolde izolasyon için MSMS Kütle alanında hedeflenen demirin kütlesini seçin.Verileri işlerken öncü yalıtımını kontrol etmek için bir dakikalık bir alma kaydedin. İlgilenilen izomerin mobilite tabanlı bir seçimini gerçekleştirmek için, Döngüsel Sıra Denetimi penceresinde cihazı Hareketlilik moduna geçirin, Döngüsel İşlevler sekmesinden, Paket Ekle'yi ve ardından Dilimleme'yi seçin. Dizi sekmesinde karmaşık bir mobilite olayları dizisinin görünmesini bekleyin.Eject and Acquire olayını ilk Ayrı olaydan hemen sonra konumlandırın ve ardından Çalıştır'ı tıklatın. Gerçek zamanlı olarak görüntülenecek ilk ayrımın sonuçlarını arayın. IMS tepe noktalarının çözünürlüğü tatmin edici olana kadar dizideki bu olayın zaman değerini değiştirerek çok geçişli bir ayırma için ilk Ayrı olayın süresini artırın.Referans için bir dakikalık bir alma kaydedin. Duraklat'ı tıklatın, Çıkar ve Al olayını Çıkar, Ön Depoya Çıkar ve Beklet ve Çıkar olaylarının altına konumlandırın. Olayların süresini, hedeflenen tepe noktası Ön Depoya Çıkar bölgesinde ve diğer iyonlar Çıkar veya Beklet ve Çıkar bölgesinde olacak şekilde ayarlayın.Eject and Acquire olayını dizinin sonunda, Ön Mağazadan Yeniden Enjekte Et ve ikinci Ayrı olaylarının altına yerleştirin. Seçili popülasyonu görüntülemek için Çalıştır'ı tıklatın. İzolasyonun kalitesini kontrol edin.Referans için bir dakikalık bir alma kaydedin. Sıra sekmesinde, kullanıcı tanımlı olay zamanlarının yanındaki sütunda, tüm olayların toplam zamanlarını arayın. CCS kalibrasyonunu gerçekleştirmek için Pre-Store'dan Reinject etkinliğinin hattında bulunan Time Abs'yi not alın.Doğrudan Çıkar ve Al'ı devam ettiren Ayrı olayının süresini bir milisaniyeye ayarlayın. Mağaza Öncesinden Yeniden Enjekte Et satırında, Etkinleştirmeyi Etkinleştir kutusunu işaretleyin ve yerleşik denetimle parçalanmayı optimize edin. Parçalanma yerleşik denetimle tatmin edici değilse, Etkinleştirmeyi Etkinleştir kutusunun işaretini kaldırın ve reenjeksiyon voltajlarını manuel olarak optimize etmeye, Ön Dizi Degradesini artırmaya ve sonuçlar tatmin edici olana kadar Dizi Ofset voltajını düşürmeye devam edin.Edinme açılır penceresine iki dakikalık bir alma işlemi kaydetmek için, Sapma Süresini Koru seçeneğini işaretleyerek yalnızca varış saatlerini içeren bir dosya oluşturun ve _dt.raw olarak etiketlenmiş Z üzerinden M'yi seçin. Arabinoksilan pentasakkarit karışımının MS analizini yaptıktan sonra, spektrum, iki bileşiğin doğada izomerik olduğunu düşündüren Z 685.24 üzerinde M'de tek bir tepe noktasına sahip izotopik bir desen sergiledi. Pentasakkaritlerin adduktları siklik IMS hücresi boyunca ayrıldı ve üç tepe noktası farklı varış zamanlarıyla ayrıldı.Saf XA3XX, zirveleri 83 ve 90 milisaniyede gösterirken, XA2XX 94 milisaniyede bir zirve sergiler. IMS ayrımının ilk aşamasından sonra, XA3XX'e ait iyonlar dışarı atıldı ve IMS-IMS analizi için 94 milisaniyedeki tepe noktası seçildi. İyonu aktivasyon olmadan yeniden enjekte ettikten sonra üç geçişli bir ayırma gerçekleştirildi ve XA2XX için 199 milisaniyede bir tepe noktası elde edildi.Oluşturulan IMS-IMS MS verileri, varış zamanı ve M üzerinden Z boyutları kullanılarak birleştirilerek IMS-IMS spektrumları oluşturuldu. CCS kalibrasyonu için %0,2 bağıl yoğunluğun üzerindeki pikler ihraç edildi ve bu da merkezlenmiş CCS kalibre edilmiş IMS-IMS spektrumu ile sonuçlandı. Öncü iyonun izolasyonunu kontrol etmek her zaman önemlidir, aksi takdirde spektrum, ilgilenilen bileşiğin ve kirleticilerin bir karışımından gelebilir.Daha önce ağlar oluşturmak ve bileşikleri sınıflandırmak için IMS-IMS spektrumlarını kullandık, ancak bileşik tanımlamaları için veritabanlarına karşı arama yapmak için de kullanılabilirler. Bu teknik çok yenidir, ancak glikomikte ve analistlerin izomerik moleküllerle karşı karşıya kaldığı herhangi bir bağlamda son derece yararlı olacağını umuyoruz.

Research

JoVE Journal

Chemistry

Characterization, Quantification and Compound-specific Isotopic Analysis of Pyrogenic Carbon Using Benzene Polycarboxylic Acids (BPCA)

Characterization, Quantification and Compound-specific Isotopic Analysis of Pyrogenic Carbon Using Benzene Polycarboxylic Acids BPCA

Karakterizasyon, benzen polikarboksilik asitler kullanılarak Pirojenik karbon miktarının ve Bileşik özgü izotopik Analizi (BPCA)

Fire-derived, pyrogenic carbon (PyC), sometimes called black carbon (BC), is the carbonaceous solid residue of biomass and fossil fuel combustion, such as ...

Site Directed Spin Labeling and EPR Spectroscopic Studies of Pentameric Ligand-Gated Ion Channels

Site Yönetmen Spin Etiketleme ve pentameric ligand-kapılı iyon Kanallarının EPR Spektroskopik Çalışmaları

Ion channel gating is a stimulus-driven orchestration of protein motions that leads to transitions between closed, open, and desensitized states. ...

Analyzing the Photo-oxidation of 2-propanol at Indoor Air Level Concentrations Using Field Asymmetric Ion Mobility Spectrometry

2-propanol iç hava düzey konsantrasyonlarda alan asimetrik iyon mobilite spektrometresi kullanılarak fotoğraf oksidasyonunu analiz

We demonstrate a versatile protocol to be used for determining the effectiveness of photocatalysts in degrading indoor air concentration (ppb) volatile ...

A Novel Technique for Raman Analysis of Highly Radioactive Samples Using Any Standard Micro-Raman Spectrometer

Herhangi bir standart mikro-Raman spektrometresi ile yüksek radyoaktif Örneklerin Raman Analizi için yeni bir teknik

A novel approach for the Raman measurement of nuclear materials is reported in this paper. It consists of the enclosure of the radioactive sample in a ...

An HS-MRM Assay for the Quantification of Host-cell Proteins in Protein Biopharmaceuticals by Liquid Chromatography Ion Mobility QTOF Mass Spectrometry

Bir HS-MRM tahlil için Protein Biyofarmasötikler sıvı Kromatografi iyon hareketlilik QTOF kütle spektrometresi tarafından Host-hücre proteinleri miktar

The analysis of low-level (1-100 ppm) protein impurities (e.g., host-cell proteins (HCPs)) in protein biotherapeutics is a challenging assay requiring ...

A Practical Guide on Coupling a Scanning Mobility Sizer and Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometer (SMPS-ICPMS)

A Practical Guide on Coupling a Scanning Mobility Sizer and Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometer SMPS-ICPMS

Tarama Hareketlilik Cetvelini ve İndüktif olarak Birleştirilmiş Plazma Kütle Spektrometresini (SMPS-ICPMS) birleştiren Pratik Bir Kılavuz

A large variety of analytical methods are available to characterize particles in aerosols and suspensions. The choice of the appropriate technique depends ...

Real-time Breath Analysis by Using Secondary Nanoelectrospray Ionization Coupled to High Resolution Mass Spectrometry

İkincil Nanoelectrospray iyonlaşma kullanarak gerçek zamanlı nefes analiz için yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi birleştiğinde

Exhaled volatile organic compounds (VOCs) have aroused considerable interest, since they can serve as biomarkers for disease diagnosis and environmental ...

Membrane Remodeling of Giant Vesicles in Response to Localized Calcium Ion Gradients

Yanıt olarak lokalize kalsiyum iyon degradeler dev veziküller membran Remodeling

In a wide variety of fundamental cell processes, such as membrane trafficking and apoptosis, cell membrane shape transitions occur concurrently with local ...

Imaging Corrosion at the Metal-Paint Interface Using Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry

Uçuş süresi Ikincil Iyon kütle spektrometresi kullanılarak metal-Paint arayüzünde görüntüleme korozyon

Corrosion developed at the paint and aluminum (Al) metal-paint interface of an aluminum alloy is analyzed using time-of-flight secondary ion mass ...

Ion Mobility-Mass Spectrometry Techniques for Determining the Structure and Mechanisms of Metal Ion Recognition and Redox Activity of Metal Binding Oligopeptides

Metal Bağlama Oligopeptidlerinin Yapısı ve Mekanizmalarının Belirlenmesinde Iyon Hareketliliği-Kütle Spektrometresi Teknikleri ve Metal Bağlayıcı Oligopeptidlerin Redoks Aktivitesi