Name: organic solvent-based protein precipitation for robust proteome purification ahead of mass spectrometry
Uploaded: 2022-02-07T14:30:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Organic Solvent-Based Protein Precipitation for Robust Proteome Purification Ahead of Mass Spectrometry at JoVE.com

Эта работа финансировалась Советом по естественным наукам и инженерным исследованиям Канады. Авторы благодарят Bioinformatics Solutions Inc. (Ватерлоо, Канада) и SPARC BioCentre (молекулярный анализ) в больнице для больных детей (Торонто, Канада) за их вклад в сбор данных о РС.

1. Материальные соображения и предварительная подготовка образцов
<ol><li>Используйте только растворители высокой чистоты (ацетон, хлороформ, метанол) (>99,5%) и химические вещества, свободные от лишней влаги.</li>
	<li>Готовят растворы хлорида натрия и сульфата цинка (1 М) в воде. ПРИМЕ...

Оптимальная характеристика МС достигается при истощении остаточного СДС ниже 10 ppm. В то время как альтернативные подходы, такие как FASP и переваривание на шариках, предлагают количественное истощение SDS с переменным извлечением 31,32,33, основной целью ...

Анализ протеомов с помощью масс-спектрометрии становится все более строгим благодаря повышенной чувствительности, разрешению, скорости сканирования и универсальности современных приборов MS. Достижения РС способствуют повышению эффективности идентификации белка и более точному количественному определению 1,2,3,4,5. С улучшенными приборами MS исследователи требуют соответствующей последовательной стратегии подготовки образцов, способной количественно восстанавливать белки высокой чистоты за минимальное время на всех этапах рабочего процесса 6,7,8,9,10,11 . Чтобы точно отразить протеомный статус биологической системы, белки должны быть выделены из нативной матрицы образца эффективным и непредвзятым образом. С этой целью, включая денатурирующее поверхностно-активное вещество, такое как додецилсульфат натрия (SDS), обеспечивает эффективную экстракцию белка и солюбилизацию12. Тем не менее, SDS сильно препятствует электрораспылению ионизации, вызывая серьезное подавление сигнала MS, если не устранить должным образом13.
Для последующего анализа протеомов доступны различные стратегии истощения SDS, такие как удержание белков над фильтром отсечения молекулярной массы, содержащимся в одноразовых спиновых картриджах 14,15,16. Метод пробоподготовки с помощью фильтра (FASP) является предпочтительным, поскольку он эффективно истощает SDS ниже 10 ppm, способствуя оптимальному РС. Тем не менее, восстановление белка с помощью FASP является переменным, что побудило к исследованию других методов. Хроматографические подходы, которые избирательно захватывают белок (или поверхностно-активное вещество), превратились в различные удобные картриджи или форматы на основе бусин 17,18,19,20,21. Учитывая эти простые и (в идеале) последовательные стратегии очистки белка, классический подход осаждения белка органическими растворителями часто упускается из виду как перспективный подход к выделению белка. В то время как осаждение растворителей успешно истощает SDS ниже критических уровней, восстановление белка является давней проблемой этого подхода. Несколько групп наблюдали смещение восстановления белка, с неприемлемо низким выходом осадков в зависимости от концентрации белка, молекулярной массы и гидрофобности22,23. В связи с разнообразием протоколов осаждения, о которых сообщается в литературе, были разработаны стандартизированные условия осаждения. В 2013 году Crowell et al. впервые сообщили о зависимости ионной силы от эффективности осаждения белков в 80% ацетона24. Было показано, что для всех исследованных белков добавление до 30 мМ хлорида натрия необходимо для максимизации выхода (до 100% восстановления). Совсем недавно Nickerson et al. показали, что сочетание еще более высокой ионной силы (до 100 мМ) с повышенной температурой (20 °C) во время осаждения ацетона давало почти количественное восстановление за 2-5 мин25. Наблюдалось небольшое снижение восстановления низкомолекулярных (LMW) белков. Таким образом, последующий отчет Baghalabadi et al. продемонстрировал успешное восстановление белков и пептидов LMW (≤5 кДа) путем объединения специфических солей, особенно сульфата цинка, с более высоким уровнем органического растворителя (97% ацетона)26.
В то время как совершенствование протокола осаждения обеспечивает более надежную стратегию очистки белка для протеомики на основе MS, успех обычных осадков в значительной степени зависит от пользовательской техники. Основной целью этой работы является представление надежной стратегии осаждения, которая облегчает выделение белковой гранулы из загрязняющего супернатанта. Одноразовый фильтрационный картридж был разработан для устранения пипетирования путем выделения агрегированного белка над пористым мембранным фильтром27 из PTFE. МС-интерферирующие компоненты в супернатанте эффективно удаляются на короткой низкоскоростной стадии центрифугирования. Одноразовый фильтрующий картридж также предлагает сменный картридж SPE, который облегчает последующую очистку образца после рерастворимости и дополнительного переваривания белка перед масс-спектрометрией.
Здесь представлен ряд рекомендуемых рабочих процессов осаждения протеомов, включая модифицированные протоколы ацетона и хлороформа/метанола/воды28 , в обычном (на основе флаконов) и полуавтоматическом формате в одноразовом двухсударственном фильтрационном и экстракционном картридже. Результирующее восстановление белка и эффективность истощения SDS выделены вместе с покрытием протеома LC-MS/MS снизу вверх, чтобы продемонстрировать ожидаемый результат от каждого протокола. Обсуждаются практические преимущества и недостатки, связанные с каждым подходом.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr >
			<td >Acetone</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >AC177170010</td>
			<td >&#8804;0.002 % aldehyde</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Acetonitrile</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >A998-4</td>
			<td >HPLC grade</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Ammonium Bicarbonate</td>
			<td >Millipore Sigma</td>
			<td>A6141-1KG</td>
			<td >solid</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Beta mercaptoethanol</td>
			<td >Millipore Sigma</td>
			<td>M3148-25ML</td>
			<td >Molecular biology grade</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Bromophenol blue</td>
			<td >Millipore Sigma</td>
			<td>B8026-5G</td>
			<td >Bromophenol blue sodium salt</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Chloroform</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >C298-400</td>
			<td >Chloroform</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Formic Acid</td>
			<td >Honeywell</td>
			<td >56302</td>
			<td >Eluent additive for LC-MS</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Fusion Lumos Mass Spectrometer</td>
			<td >ThermoFisher Scientific</td>
			<td ></td>
			<td >for analysis of standard protein mixture</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Glycerol</td>
			<td >Millipore Sigma</td>
			<td >356352-1L-M</td>
			<td >For molecular biology, &#62; 99%</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Isopropanol</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >A4641</td>
			<td >HPLC grade</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Methanol</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >A452SK-4</td>
			<td >HPLC grade</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Microcentrifuge</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >75-400-102</td>
			<td >up to 21,000 xg</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Microcentrifuge Tube (1.5 mL)</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >05-408-130</td>
			<td >tapered bottom</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Microcentrifuge Tube&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160; (2 mL)</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >02-681-321</td>
			<td >rounded bottom</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Micropipette Tips&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160; (0.1-10 &#956;L)</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >21-197-28</td>
			<td >Universal pipet tip, non-sterile</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Micropipette Tips&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160; (1-200 &#956;L)</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >07-200-302</td>
			<td >Universal pipet tip, non-sterile</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Micropipette Tips&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160; (200-1000 &#956;L)</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >07-200-303</td>
			<td >Universal pipet tip, non-sterile</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Micropipettes</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >13-710-903</td>
			<td >Micropipet Trio pack</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Pepsin</td>
			<td >Millipore Sigma</td>
			<td>P0525000</td>
			<td >Lyophilized powder,&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160;&#160; &#62;3200 units/ mg</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >ProTrap XG</td>
			<td >Proteoform Scientific</td>
			<td >PXG-0002</td>
			<td >50 complete units per box</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Sodium Chloride</td>
			<td >Millipore Sigma</td>
			<td >S9888-1KG</td>
			<td >ACS reagent, &#62;99 %</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Sodium Dodecyl Sulfate</td>
			<td >ThermoFisher Scientific</td>
			<td >28312</td>
			<td >powdered solid</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >timsTOF Pro Mass Spectrometer</td>
			<td >Bruker</td>
			<td ></td>
			<td >for analysis of liver proteome extract</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Trifluoroacetic Acid</td>
			<td >ThermoFisher Scientific</td>
			<td >L06374.AP</td>
			<td >99%</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Tris</td>
			<td >Fisher Scientific</td>
			<td >BP152-500</td>
			<td >Molecular biology grade</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Trypsin</td>
			<td >Millipore Sigma</td>
			<td >9002-07-7</td>
			<td >From bovine pancreas, TPCK-treated</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Urea</td>
			<td >Bio-Rad</td>
			<td >1610731</td>
			<td >solid</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Water (deionized)</td>
			<td>Sartorius Arium Mini Water Purification System</td>
			<td>76307-662</td>
			<td >Type 1 ultrapure (18.2 M&#937; cm)</td>
		</tr>
		<tr >
			<td >Zinc Sulfate</td>
			<td >Millipore Sigma</td>
			<td>307491-100G</td>
			<td >solid</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

organic solvent-based protein precipitation for robust proteome purification ahead of mass spectrometry

В то время как многочисленные достижения в инструментах масс-спектрометрии (РС) улучшили качественный и количественный анализ протеомов, более надежные интерфейсные подходы к выделению, обогащению и обработке белков перед РС имеют решающее значение для успешной характеристики протеома. Низкое, непоследовательное восстановление белка и остаточные примеси, такие как поверхностно-активные вещества, наносят ущерб анализу РС. Осаждение белка часто считается ненадежным, трудоемким и технически сложным для выполнения по сравнению с другими стратегиями подготовки образцов. Эти проблемы преодолеваются путем использования оптимальных протоколов осаждения белка. Для осаждения ацетона комбинация конкретных солей, контроля температуры, состава растворителя и времени осаждения имеет решающее значение, в то время как эффективность осаждения хлороформа / метанола / воды зависит от надлежащего пипетирования и манипуляции с флаконами. В качестве альтернативы, эти протоколы осаждения оптимизированы и полуавтоматизированы в одноразовом отжимном картридже. В данной работе проиллюстрированы ожидаемые результаты осаждения белка на основе растворителя в традиционном формате и с использованием одноразового двухступенчатого фильтрационного и экстракционного картриджа. Это включает в себя детальную характеристику протеомных смесей с помощью анализа LC-MS/MS снизу вверх. Превосходная производительность рабочих процессов на основе SDS также демонстрируется по сравнению с незагрязненным белком.

На рисунке 4 обобщено ожидаемое истощение SDS после осаждения белков на основе флакона или картриджа в одноразовый фильтрующий картридж с использованием ацетона. Обычная ночная инкубация (-20 °C) в ацетоне сравнивается с протоколом быстрого осаждения ацетона при комнатно?...

Watch this Scientific Journal Video about Organic Solvent-Based Protein Precipitation for Robust Proteome Purification Ahead of Mass Spectrometry at JoVE.com

Organic Solvent-Based Protein Precipitation for Robust Proteome Purification Ahead of Mass Spectrometry

Настоящий протокол описывает осаждение белка на основе растворителей в контролируемых условиях для надежного и быстрого восстановления и очистки образцов протеома перед масс-спектрометрией.

Осаждение белка на основе органических растворителей для надежной очистки протеома перед масс-спектрометрией

While multiple advances in mass spectrometry (MS) instruments have improved qualitative and quantitative proteome analysis, more reliable front-end ...

Эти протоколы предназначены для максимального восстановления, а также чистоты белков посредством осаждения на основе растворителей. Мы покажем вам пару трюков для выполнения осадков во флаконах, а также полуавтоматический подход в формате спин-картриджа. Мы также оптимизировали протокол осадков, чтобы быть последовательным и быстрым.Весь протокол занимает всего несколько минут. Эти протоколы демонстрируют, что осаждение белков растворителем идеально подходит для подготовки образцов перед масс-спектрометрией. Протоколы будут легко вписываться как в рабочие процессы снизу вверх, так и сверху вниз.Сегодня нам продемонстрируют Ziheng Dang и Victoria Miller, старший научный сотрудник Proteoform Scientific в Галифаксе, Новая Шотландия Pipette 90 микролитров раствора белка без частиц в полипропиленовую микроцентрифужную трубку. Затем добавьте 10 микролитров одного моля водного хлорида натрия и 400 микролитров ацетона в образец раствора, колпачок и осторожно постучите флаконом, чтобы соединить растворители. Дайте флакону высиживать его.Комнатную температуру без помех в течение как минимум двух минут после инкубации центрифугируют образцы, отмечая ориентацию флакона и отжим в течение как минимум двух минут при 10 000 RCF или выше при комнатной температуре. После центрифугирования на дне трубки наблюдается видимая белая гранула. В этот момент открутите трубку и декантируйте супернат в контейнер для отходов, перевернув трубку.Используйте бумажное полотенце, чтобы извлечь любой остаточный растворитель из флакона. Для SDS, содержащих образцы. Осторожно дозируйте 400 микролитров свежего ацетона, не нарушая гранулу.Немедленно центрируйте образец в течение одной минуты при 10 000 G или выше при комнатной температуре, поместив флакон в ротор в той же ориентации, что и начальный спин. Рассчитайте промывочный растворитель, как описано выше. Высушите образец с открытым колпачком в течение примерно одной минуты.В вытяжке, перед гранулированной солюбилизацией. Дозируйте 100 микролитров белкового раствора во флакон с полипропиленом. В вытяжной шкаф добавьте 400 микролитров метанола, а затем 100 микролитров хлороформа.На короткое время замыкайте флакон и вихрь, чтобы перемешать. Быстро дозируйте 300 микролитров воды непосредственно в центр флакона. Укройте флакон крышкой и дайте ему спокойно постоять на столешнице в течение одной минуты, после поместите флакон с полипропиленом в центрифугу и вращайте его в течение пяти минут при 10 000 G или выше при комнатной температуре.Флакон имеет два слоя растворителя и видимую белую гранулу до флакона при температуре приблизительно 45 градусов. Удалите приблизительно 700 микролитров растворителя из верхнего слоя с равномерной скоростью, используя сначала большой наконечник микропипетки в один миллилитр, а затем с наконечником пипетки объемом 200 микролитров, пока он не образует шарик во флаконе. Добавьте 400 микролитров свежего метанола во флакон с образцом, не нарушая гранулу, дозируя растворитель вниз по стороне флакона.Закройте флакон крышкой и соедините слои растворителя, осторожно раскачивая флакон, чтобы закрутить растворители вместе. Наблюдать за белым белком гранулы, отмечая ориентацию флакона в роторной центрифуге в течение минимум 10 минут при 10 000 раз G или выше при комнатной температуре. Угльте флакон гранулой лицом вниз.Поместите наконечник пипетки вдоль верхнего края флакона и удалите супернатант с помощью одного миллилитра микропипетки с медленной, но равномерной скоростью. Удержание приблизительно 20 микролитров растворителя. Дайте остаточному растворителю высохнуть в вытяжном шкафу.Для осаждения белка. С помощью одноразового фильтрационного картриджа прикрепите заглушку к верхнему фильтрационному картриджу. Совместите 90 микролитров белкового раствора 10 микролитров одного моля акваса, хлорида натрия и 400 микролитров ацетона.Инкубируйте в течение как минимум двух минут на столешнице, центрифугируйте подготовленный образец белка с помощью пробки, все еще прикрепленной к фильтрационному картриджу, в течение двух минут при 2 500 раз G.At комнатной температуры, переверните картридж и открутите и извлеките пробку из основания картриджа. Поместите фильтрационный картридж в чистый флакон центрифуги с образцом белка на три минуты при 500 G при комнатной температуре. Отбросьте поток через растворитель из нижнего флакона.Промыть белковую гранулу, добавив 400 микролитров ацетона в фильтрационный картридж, центрифугировать в течение трех минут при 500 g при комнатной температуре или до тех пор, пока в верхнем картридже не останется растворителя. Следуя ранее продемонстрированным протоколам осаждения белка. Повторно солюбилизируют белок путем смачивания мембраны у основания фильтрационного картриджа путем дозирования от двух до пяти микролитров ISO-пропанола непосредственно на мембрану непосредственно перед переходом к протоколу повторной солюбилизации для повторной солюбилизации белковой гранулы, готовят 80% объем по объему раствор муравьиной кислоты в воде.Предварительно охладите этот раствор кислоты при минус 20 градусах Цельсия и фильтрующий картридж, содержащий осажденный белок. Дозируйте 50 микролитров холодной разбавленной муравьиной кислоты в охлажденный колпачок картриджа и вихрь в течение 30 секунд. Верните фильтрационный картридж в морозильную камеру при минус 20 градусах Цельсия в течение 10 минут.Повторите предыдущие этапы вихря и инкубации. Добавьте 450 микролитров воды к конечному объему 500 микролитров. Разбавляя муравьиную кислоту до 8% Инвертируйте картридж, открутите и извлеките пробку из основания картриджа и прикрепите картридж SPE к флакону.Раскрутите белок через картридж SPE в центрифуге при комнатной температуре в течение пяти минут при 800 G.Если растворитель остается в верхнем картридже, верните картридж в центрифугу и повторите вращение. Промыть, добавив 300 микролитров 5% ацетонитрила с 0,1% TFA в воде в картридж SPE, пропустить через картридж SPE в течение двух минут при 2000 раз больше G.Для низкомолекулярных белков или переваренных пептидов элюируют образец, протекая 300 микролитров. 50%-ацетонитрил с 0,1% TFA в течение пяти минут в 2,500 г. Для интактных белков.Затем следует дополнительная стадия элюзии с использованием 300 микролитров 75% ацетонитрила с 0,1% трифтораскетической кислоты. Смешайте два полученных экстракта. На рисунке сравнивается истощение SDS после флакона или осаждения белков в одноразовый фильтрующий картридж.Использование ацетона с обычными протоколами rapid и CMW. Все подходы снижают SDS, чтобы обеспечить оптимальный масс-спектрометрический анализ. Этот рисунок показывает количественное восстановление белка путем быстрого осаждения ацетона и осаждения CMW с помощью SDS-анализа обработанного дрожжевого общего клеточного лизата.Последовательное восстановление было получено со всеми протоколами осадков. Осаждение в одноразовом фильтрационном картридже устраняет необходимость осторожной пипетки SDS, содержащей супернатант, сохраняя при этом агрегированные белки над мембранным фильтром. Таким образом, в надводных фракциях не было обнаружено видимых полос в трех независимых репликах.Осаждение белка на основе картриджа демонстрирует превосходное восстановление переваренного пепсином образца бычьей плазмы по сравнению с осаждением на основе флакона. Более существенные различия в выходе отмечены в картридже при использовании хлорида натрия, в то время как использование растворителя цинка привело к наибольшему выходу. Этот рисунок количественно определяет пиковую интенсивность пептида из каждого образца пептида с соотношением выше единицы, отражающим более высокое содержание пептидов для образцов, обработанных в одноразовых фильтрующих картриджах.На рисунке сравнивается количество идентифицированных пептидов на белок в трех реплицированных пробоотборниках. Коэффициенты корреляции от 0,94 до 0,95 на этих графиках демонстрируют высокую согласованность подхода к пробоподготовке для масс-спектрометрического анализа снизу вверх. Поэтому, как только эта гранула сформирована, вы действительно хотите не беспокоить ее.Если вы сохраните его в виде неповрежденной гранулы, вы получите более высокий выход. Поэтому не забудьте промыть эту гранулу дополнительным ацетоном. Это гарантирует, что мы избавляемся от SDS, сохраняя наш образец как можно более чистым, и это дает нам лучший масс-спектрометрический анализ.Таким образом, мы обнаружили, что удаление избыточного растворителя путем инвертирования намного проще, чем попытка пипетки образца. Таким образом, вы получите более стабильные урожаи. Осаждение ацетона при комнатной температуре привело к более последовательному и быстрому восстановлению, чем традиционное осаждение в морозильной камере.

Research

Education

JoVE Core

JoVE Journal

Analytical Chemistry

Chemistry

Unit 1

Complexometric Titration, Precipitation Titration, and Gravimetry

SCIENTISTS IN ACTION

Analyzing Protein Dynamics Using Hydrogen Exchange Mass Spectrometry

Анализируя Динамика белков с использованием водорода валютный масс-спектрометрии

All cellular processes depend on the functionality of proteins. Although the functionality of a given protein is the direct consequence of its unique ...

Analysis of Volatile and Oxidation Sensitive Compounds Using a Cold Inlet System and Electron Impact Mass Spectrometry

Анализ летучих и окисления чувствительных соединений с использованием системы подачи холодной и электронного удара масс-спектрометрии

This video presents a protocol for the mass spectrometrical analysis of volatile and oxidation sensitive compounds using electron impact ionization. The ...

Visualization of Ambient Mass Spectrometry with the Use of Schlieren Photography

Визуализация Ambient масс-спектрометрии с использования шлирен Фото

This manuscript outlines how to visualize mass spectrometry ambient ionization sources using schlieren photography. In order to properly optimize the mass ...

An HS-MRM Assay for the Quantification of Host-cell Proteins in Protein Biopharmaceuticals by Liquid Chromatography Ion Mobility QTOF Mass Spectrometry

HS-мно Assay для количественного определения белков клетки хозяина в области биофармацевтики белка по жидкостной хроматографии ионной подвижности QTOF масс-спектрометрии

The analysis of low-level (1-100 ppm) protein impurities (e.g., host-cell proteins (HCPs)) in protein biotherapeutics is a challenging assay requiring ...

Fizzy Extraction of Volatile Organic Compounds Combined with Atmospheric Pressure Chemical Ionization Quadrupole Mass Spectrometry

Физзи-экстракция летучих органических соединений в сочетании с химическим ионизацией при атмосферном давлении. Квадрупольная масс-спектрометрия

Chemical analysis of volatile and semivolatile compounds dissolved in liquid samples can be challenging. The dissolved components need to be brought to ...

Real-time Breath Analysis by Using Secondary Nanoelectrospray Ionization Coupled to High Resolution Mass Spectrometry

Анализ реального времени дыхание с помощью вторичных Nanoelectrospray ионизации в сочетании с масс-спектрометрии высокого разрешения

Exhaled volatile organic compounds (VOCs) have aroused considerable interest, since they can serve as biomarkers for disease diagnosis and environmental ...

Synthesis and Mass Spectrometry Analysis of Oligo-peptoids

Синтез и анализ масс-спектрометрии Oligo-peptoids

Peptoids are sequence-controlled peptide-mimicking oligomers consisting of N-alkylated glycine units. Among many potential applications, peptoids have ...

Analyzing Protein Architectures and Protein-Ligand Complexes by Integrative Structural Mass Spectrometry

Анализ архитектуры белка и белка Ligand комплексов по интегративной структурных масс-спектрометрии

Proteins are an important class of biological macromolecules that play many key roles in cellular functions including gene expression, catalyzing ...

Mass Spectrometry-Guided Genome Mining as a Tool to Uncover Novel Natural Products

Масс-спектрометрии-управляемый геном добычи в качестве инструмента для выявления новых природных продуктов

The chemical space covered by natural products is immense and widely unrecognized. Therefore, convenient methodologies to perform wide-ranging evaluation ...

Capillary Electrophoresis Mass Spectrometry Approaches for Characterization of the Protein and Metabolite Corona Acquired by Nanomaterials

Подходы масс-спектрометрии капиллярного электрофореза для характеристики белковой и метаболитовой короны, приобретенной наноматериалами

The adsorption of biomolecules from surrounding biological matrices to the surface of nanomaterials (NMs) to form the corona has been of interest for the ...