Name: small-scale extraction of caenorhabditis elegans genomic dna
Uploaded: 2022-06-07T13:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Small-Scale Extraction of Caenorhabditis elegans Genomic DNA at JoVE.com

Штамм N2 и бактерии E. coli OP50 были получены из Центра генетики Caenorhabditis (CGC), который финансируется Управлением исследовательских инфраструктурных программ NIH (P40 OD010440). Штамм blmp-1(tm548) был получен в результате Национального проекта биоресурсов, Япония. Авторы благодарят WormBase. Эта работа была поддержана NIH R01GM097591 для T.L.G., внутренним финансированием Техасского женского университета для T.L.G и Центром студенческих исследований TWU для M.F.L.

1. Обслуживание C. elegans
ПРИМЕЧАНИЕ: Штаммы N2 (дикий тип) и blmp-1(tm548) C. elegans поддерживались на стандартных пластинах среды роста нематод (NGM) при 20 °C.
<ol><li>Приготовьте пластины NGM, растворив 23,005 г порошка NGM в 973 мл воды в колбе 2 л. Накройте отверстие колбы алюмин?...

<ol>
	<li>Corsi, A. K., Wightman, B., Chalfie, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+transparent+window+into+biology:+A+on+Caenorhabditis+elegans.">A transparent window into biology: A on Caenorhabditis elegans.</a> WormBook. , 1-31 (2015).</li><li>Page, A. P., Johnstone, I. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+cuticle.">The cuticle.</a> WormBook. , (2007).</li><li>Williams, B. D., Schrank, B., Huynh, C., Shownkeen, R., Waterston, R. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+genetic+mapping+system+in+Caenorhabditis+elegans+based+on+polymorphic+sequence-tagged+sites.">A genetic mapping system in Caenorhabditis elegans based on polymorphic sequence-tagged sites.</a> Genetics. 131, 609-624 (1992).</li><li>Lissemore, J. L., Lackner, L. L., Fedoriw, G. D., De Stasio, E. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+of+Caenorhabditis+elegans+genomic+DNA+and+detection+of+deletions+in+the+unc-93+gene+using+PCR.">Isolation of Caenorhabditis elegans genomic DNA and detection of deletions in the unc-93 gene using PCR.</a> Biochemistry and Molecular Biology Education. 33, 219-226 (2005).</li><li>Fay, D., Bender, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=SNPs:+introduction+and+two-point+mapping.">SNPs: introduction and two-point mapping.</a> WormBook. , 1-10 (2008).</li><li>Biron, D., Haspel, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> C. elegans: Methods and Applications. , (2015).</li><li>. Extract-N-Amp Tissue PCR Kit technical bulletin Available from: <a target="_blank" href="https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/product/documents/249/244/xnat2bul.pdf">https://www.sigmaaldrich.com/deepweb/assets/sigmaaldrich/product/documents/249/244/xnat2bul.pdf</a> (2013)</li><li>Stiernagle, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Maintenance+of+C.+elegans.">Maintenance of C. elegans.</a> WormBook. , (2006).</li><li>Sutphin, G. L., Kaeberlein, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Measuring+Caenorhabditis+elegans+life+span+on+solid+media.">Measuring Caenorhabditis elegans life span on solid media.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. (27), e1152 (2009).</li><li>Chaudhuri, J., Parihar, M., Pires-daSilva, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+introduction+to+worm+lab:+from+culturing+worms+to+mutagenesis.">An introduction to worm lab: from culturing worms to mutagenesis.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. (47), e2293 (2011).</li><li>Lee, P. Y., Costumbrado, J., Hsu, C. Y., Kim, Y. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Agarose+gel+electrophoresis+for+the+separation+of+DNA+fragments.">Agarose gel electrophoresis for the separation of DNA fragments.</a> Journal of Visualized Experiments: JoVE. (62), e3923 (2012).</li><li>Gumienny, T. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Caenorhabditis+elegans+SMA-10/LRIG+is+a+conserved+transmembrane+protein+that+enhances+bone+morphogenetic+protein+signaling.">Caenorhabditis elegans SMA-10/LRIG is a conserved transmembrane protein that enhances bone morphogenetic protein signaling.</a> PLoS Genetics. 6, 1000963 (2010).</li><li>Nelson, M. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+bow-tie+genetic+architecture+for+morphogenesis+suggested+by+a+genome-wide+RNAi+screen+in+Caenorhabditis+elegans.">A bow-tie genetic architecture for morphogenesis suggested by a genome-wide RNAi screen in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS Genetics. 7, 1002010 (2011).</li><li>Zhang, L., Zhou, D., Li, S., Jin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=BLMP-1+contributes+to+collagen-related+morphogenesis+in+C.+elegans.">BLMP-1 contributes to collagen-related morphogenesis in C. elegans.</a> Life Science Journal. 9, 1080-1088 (2012).</li><li>Horn, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=DRE-1/FBXO11-dependent+degradation+of+BLMP-1/BLIMP-1+governs+C.+elegans+developmental+timing+and+maturation.">DRE-1/FBXO11-dependent degradation of BLMP-1/BLIMP-1 governs C. elegans developmental timing and maturation.</a> Developmental Cell. 28, 697-710 (2014).</li><li>Huang, T. -. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=BLMP-1/Blimp-1+regulates+the+spatiotemporal+cell+migration+pattern+in+C.+elegans.">BLMP-1/Blimp-1 regulates the spatiotemporal cell migration pattern in C. elegans.</a> PLoS Genetics. 10, 1004428 (2014).</li><li>Lakdawala, M. F., Madhu, B., Faure, L., Vora, M., Padgett, R. W., Gumienny, T. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Genetic+interactions+between+the+DBL-1/BMP-like+pathway+and+dpy+body+size-associated+genes+in+Caenorhabditis+elegans.">Genetic interactions between the DBL-1/BMP-like pathway and dpy body size-associated genes in Caenorhabditis elegans.</a> Molecular Biology of the Cell. 30, 3151-3160 (2019).</li><li>Madeira, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+EMBL-EBI+search+and+sequence+analysis+tools+APIs+in+2019.">The EMBL-EBI search and sequence analysis tools APIs in 2019.</a> Nucleic Acids Research. 47, 636-641 (2019).</li></ol>

Определение генотипов C. elegans является важным шагом при выполнении генетических скрещиваний для создания новых штаммов C. elegans . Геномная экстракция ДНК с использованием одного или нескольких C. elegans является решающим шагом в генотипировании C. elegans. Этот протокол описы?...

Здесь представлены два связанных протокола для лизиса Caenorhabditis elegans, чтобы сделать ДНК доступной для приложений на основе ПЦР. ПЦР является широко используемым молекулярным методом, используемым для многих применений, включая генотипирование и амплиферацию фрагментов ДНК для клонирования и секвенирования, среди прочих. Маленький (1 мм), свободно живущий круглый червь C. elegans является популярной животной системой для биологических исследований. Получение подходящей геномной ДНК от одного животного или нескольких животных достаточно для амплиации последовательности с помощью ПЦР. Поздние личинки L4 и взрослые особи содержат только ~ 1000 соматических клеток (включая некоторые многоядерные, полиплоидные клетки), половые клетки и (если животное является гравидным гермафродитом) потомство в утробе матери1. Однако эти животные защищены кутикулой, которая должна быть нарушена для извлечения геномной ДНК2. Стандартные методы подготовки шаблона геномной ДНК нематоды для ПЦР включают в себя несколько шагов и занимают несколько часов. Животных сначала замораживают в буфере лизиса червей, содержащем протеиназу K (−70 °C или ниже) в течение не менее 15-45 мин (более длительный рекомендуется некоторыми протоколами)3,4,5,6. Этот шаг раскалывает животных.
После замораживания животных инкубируют в течение 1 ч при 60-65 °С для работы протеиназы К, затем фермент инактивируют в течение 15-30 мин при 95 °С. Протеиназа К разрушает нуклеазы, которые разрушают ДНК. Инактивация протеиназы К перед ПЦР важна для предотвращения деградации протеиназы К ДНК-полимеразы. Два описанных здесь протокола на основе наборов являются быстрыми, надежными и экономически эффективными методами извлечения геномной ДНК либо из одного животного, либо из нескольких нематод для повседневных исследований и обучения лабораторным приложениям. Используемый набор был первоначально оптимизирован производителем для извлечения ДНК из тканей животных, слюны и волос7. Он использует запатентованный раствор для подготовки тканей и экстракционный раствор для лизирования клеток и делает геномную ДНК доступной. Запатентованный нейтрализующий раствор затем нейтрализует компоненты, которые могут ингибировать ПЦР (например, соли, ионы и Mg2+-связывающие молекулы).
При генотипировании может быть протестировано одно животное. При определении того, является ли штамм гомозиготным, тестирование шести или более потомков от одного животного дает высокую уверенность в том, что линия гомозиготна или нет (существует 0,02% вероятность случайного выбора шести гомозиготных мутантных потомков от гетерозиготного родителя [(1/4)6 × 100% = 0,02%]). Этот метод 1) является простым, с меньшим количеством шагов, чем метод протеиназы К, и 2) сокращает время приготовления шаблона до 15 минут. Результаты этой работы демонстрируют, что разработанный протокол надежно работает при извлечении геномной ДНК из одного или нескольких червей, которые могут быть надежно использованы для последующих применений, не требующих высокоочищенной ДНК, включая ПЦР.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>autoclave tape</td>
			<td>Defend</td>
			<td>43237-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>aluminium foil, heavy duty</td>
			<td>Reynolds Wrap</td>
			<td>2182934</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>calcium chloride</td>
			<td>Millipore Sigma</td>
			<td>102382 (CAS 10035-04-8)</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Extract-N-Amp kit (includes Tissue Preparation Solution, Extraction Solution, and Neutralization Solution)</td>
			<td>Sigma-Aldrich Co. LLC</td>
			<td>XNAT2-1KT</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Isotemp hotplate/stirrer</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>11-100-495H</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LB media, Lennox, capsules</td>
			<td>MP Biomedicals, LLC</td>
			<td>3002-131</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>magnesium sulfate, 97% pure, anhydrous</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>AC413485000 (CAS 7487-88-9)</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>microcentrifuge</td>
			<td>Labnet International, Inc.</td>
			<td>PrismR, C2500-R</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NEB Q5U Hot Start High-Fidelity DNA polymerase</td>
			<td>New England Biolabs, Inc.</td>
			<td>M0515S</td>
			<td>&#34;Pol E&#34; used in Supplemental Figure S1, a high-speed, high-fidelity polymerase (20&#8211;30 s/kb)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NGM media powder</td>
			<td>US Biological Life Sciences</td>
			<td>N1000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phusion High-Fidelity PCR Master Mix with HF Buffer</td>
			<td>New England Biolabs, Inc.</td>
			<td>M0531S</td>
			<td>&#34;Pol D&#34; in Figure 1B, a high-speed, high-fidelity polymerase (15&#8211;30 s/kb)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>primers</td>
			<td>Integrated DNA Technologies</td>
			<td>custom DNA oligos</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PrimeSTAR GXL polymerase</td>
			<td>Takara Bio Inc.</td>
			<td>R050B</td>
			<td>&#34;Pol C&#34; in Figure 1B, a high-fidelity polymerase (1 min/kb) for GC-rich templates and templates up to 30 kb</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Quick-Load Purple 2-log DNA Ladder (0.1&#8211;10.0 kb)</td>
			<td>New England Biolabs, Inc.</td>
			<td>N0550S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SapphireAmp Fast PCR Master Mix</td>
			<td>Takara Bio Inc.</td>
			<td>RR350A</td>
			<td>&#34;Pol A&#34; in Figure 1B, polymerase used in Figure 1A, C, D, a high-speed polymerase (10 s/kb) for targets up to 5 kb</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sigma ReadyMix Taq PCR reaction mix</td>
			<td>Sigma-Aldrich Co. LLC</td>
			<td>P4600</td>
			<td>&#34;Pol B&#34; in Figure 1B, a polymerase (1 min/kb) for targets up to 7 kb</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SimpliAmp thermal cycler</td>
			<td>Applied Biosystems</td>
			<td>A24812</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>stir bar</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>14-512-126</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>vortex mixer</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>2215365</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>worm pick</td>
			<td>Genesee Scientific Corporation</td>
			<td>59-AWP</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

small-scale extraction of caenorhabditis elegans genomic dna

Геномная экстракция ДНК из одного или нескольких Caenorhabditis elegans имеет много последующих применений, включая ПЦР для генотипирования линий, клонирования и секвенирования. Традиционные методы протеиназы на основе K для геномной экстракции ДНК из C. elegans занимают несколько часов. Коммерческие наборы для экстракции, которые эффективно разрывают кутикулу C. elegans и извлекают геномную ДНК, ограничены. Здесь сообщается о простом, быстром (~ 15 мин) и экономически эффективном методе извлечения геномной ДНК C. elegans , который хорошо подходит для классных и исследовательских приложений. Этот метод экстракции ДНК оптимизирован для использования одной или нескольких поздних личинок (L4) или взрослых нематод в качестве исходного материала для получения надежного шаблона для выполнения ПЦР. Результаты показывают, что качество ДНК подходит для амплификации генных мишеней разных размеров с помощью ПЦР, что позволяет генотипировать одного или нескольких животных даже при разведении до одной пятидесятой геномной ДНК от одного взрослого человека за реакцию. Сообщенные протоколы могут быть надежно использованы для быстрого получения шаблона ДНК из одного или небольшого образца C. elegans для приложений на основе ПЦР.

Геномная ДНК из одного или нескольких взрослых особей дикого типа была извлечена с использованием коммерческого набора или традиционного протокола лизиса для сравнения эффективности этих двух методов. Эти лизаты затем использовались в качестве шаблонов для ПЦР для усиления либо бол?...

Watch this Scientific Journal Video about Small-Scale Extraction of Caenorhabditis elegans Genomic DNA at JoVE.com

Small-Scale Extraction of Caenorhabditis elegans Genomic DNA

Здесь представлено описание простого и относительно быстрого выделения геномной ДНК Caenorhabditis elegans от одного или нескольких животных с использованием коммерчески доступного набора тканей. Полученный препарат гДНК является подходящим шаблоном для ПЦР.

Мелкомасштабная экстракция геномной ДНК Caenorhabditis elegans

Genomic DNA extraction from single or a few Caenorhabditis elegans has many downstream applications, including PCR for genotyping lines, cloning, and ...

Мы разработали простой, быстрый и экономичный метод извлечения геномной ДНК C.elegans, который отлично подходит для классных и исследовательских приложений. Эти протоколы могут быть надежно использованы для быстрого создания шаблонов ДНК из одного или небольшого образца C.elegance для приложений на основе ПЦР. Пользователи, которые не имеют опыта сбора червей или использования микропипеттера, могут бороться с шагами, требующими этих навыков.Наблюдение за квалифицированным практикующим и практикующим может помочь. Продемонстрировать процедуру будет Фархан Лакдавала, старший аспирант моей лаборатории. Для извлечения ДНК из одного червя Caenorhabditis elegans, во-первых, установите программу лизиса, состоящую из одного цикла при 55 градусах Цельсия в течение 10 минут, а затем 95 градусов Цельсия в течение трех минут в термоциклере.Для приготовления лизисного раствора сначала добавляют 0,8 микролитра экстракционного раствора из комплекта на внутреннюю стенку 0,2-миллилитра ПЦР-трубки на льду. Затем добавляют 0,2 микролитра раствора тканевого препарата из набора в каплю экстракционного раствора и перемешивают путем облепки. При выборе червя для извлечения ДНК, во-первых, идентифицируют L4 или взрослое животное под рассекающим микроскопом.Гермафродит L4 может быть идентифицирован по характерной вульве, которая видна как бледный полукруг в середине животного. Чтобы идентифицировать взрослого гермафродита, выберите одно из самых крупных животных на пластине, которое может иметь овальные эмбрионы, видимые в матке. Далее, используя платиновую проволоку, перенесите выбранное животное в раствор.Чтобы собрать содержимое на дне трубки, центрифугируйте трубку в течение двух-трех секунд при 2000 х г при комнатной температуре. Затем поместите трубку в термоциклер и запустите программу лизиса, установленную ранее. После того, как эта программа лизиса закончится, ненадолго центрифугируйте трубку и положите ее на лед.Затем добавляют 0,8 микролитра нейтрализационного раствора из комплекта и перемешивают путем пипетки. Опять же, центрифугируйте трубку в течение двух-трех секунд при 2000 х г при комнатной температуре. Если лизат не используется сразу, храните трубку при четырех градусах Цельсия для будущего использования.Чтобы извлечь ДНК из отдельных червей, также, во-первых, установите программу лизиса одного цикла при 55 градусах Цельсия в течение 10 минут, а затем 95 градусов Цельсия в течение трех минут в термоциклере. Далее готовят раствор лизиса, сначала добавляя два микролитра экстракционного раствора из набора на внутреннюю стенку 0,2-миллилитрной ПЦР-трубки на льду, затем добавляя 0,5 микролитра раствора для приготовления ткани из набора в каплю экстракционного раствора, затем перемешивают содержимое путем пипетирования. После идентификации L4 или взрослых животных используйте платиновую проволоку для переноса достаточного количества животных в раствор.Затем центрифугируйте трубку в течение двух-трех секунд при 2000 х г при комнатной температуре, затем поместите трубку в термоциклер и запустите ранее установленную программу лизиса. После завершения программы ненадолго центрифугируйте трубку и поместите ее на лед. Затем добавляют два микролитра нейтрализационного раствора из комплекта в трубку и перемешивают путем пипетки.Опять же, центрифугируйте трубку в течение двух-трех секунд при 2000 х г при комнатной температуре. Если не используется немедленно, храните лизат при четырех градусах Цельсия для будущего использования. Геномная ДНК, извлеченная протоколом, может быть успешно использована в качестве шаблона ПЦР, как коммерческий набор, так и традиционный метод протеиназы K, продуцируемый ДНК с аналогичными уровнями амплификации ПЦР продукта 2100 пар оснований и продукта 500 пар оснований.Метод набора для лизиса ДНК также предоставил шаблоны ПЦР, эффективные для различных ферментов ДНК-полимеразы. Даже при различных разведениях ДНК, извлеченная из одного животного коммерческим набором, поддерживала амплификацию ПЦР фрагмента ДНК пары оснований 2100 с эквивалентной эффективностью. Однако амплификация фрагмента ДНК из 500 пар оснований варьировалась в зависимости от концентрации шаблона.Пригодность ДНК, извлеченной либо из одного животного, либо из нескольких животных в качестве шаблона ПЦР для определения генотипа, была дополнительно продемонстрирована успешной амплификацией гена и его мутировавшего варианта. Поскольку этот протокол включает в себя пипетирование небольшого объема реагентов, чтобы обеспечить консистенцию, используйте мастер-смесь для нескольких реакций, хорошую технику трубопроводов и хорошо откалиброванные пипетки. Кроме того, раскручивание содержимого трубки обеспечивает надлежащий лизис.Этот метод может быть расширен, адаптирован для извлечения геномной ДНК C.elegans для других последующих применений и может быть использован для извлечения ДНК из других видов нематод. Учитывая простоту, скорость, надежность и низкую стоимость протокола, он хорошо подходит как для исследовательских, так и для классных приложений, где время и ресурсы ограничены.

Research

JoVE Journal

Biology

Small-Scale Extraction of Caenorhabditis elegans Genomic DNA

Isolation of Genomic DNA from Mouse Tails

Выделение геномной ДНК из хвостов мышей

Extraction of High Molecular Weight Genomic DNA from Soils and Sediments

Добыча высокомолекулярных ДНК Геномная Вес от почвы и осадков

The soil microbiome is a vast and relatively unexplored reservoir of genomic diversity and metabolic innovation that is intimately associated with ...

Isolation and In vitro Activation of Caenorhabditis elegans Sperm

Isolation and In vitro Activation of Caenorhabditis elegans Sperm

Выделение и В пробирке Активация Caenorhabditis Элеганс Сперма

Males and hermaphrodites are the two naturally found sexual forms in the nematode C. elegans. The amoeboid sperm are produced by both males and ...

Genomic MRI - a Public Resource for Studying Sequence Patterns within Genomic DNA

Геномная МРТ - общественный ресурс для изучения последовательности Шаблоны в геномной ДНК

Non-coding genomic regions in complex eukaryotes, including intergenic areas, introns, and untranslated segments of exons, are profoundly non-random in ...

Vampiric Isolation of Extracellular Fluid from Caenorhabditis elegans

Vampiric Isolation of Extracellular Fluid from Caenorhabditis elegans

Vampiric выделение внеклеточной жидкости из<em&gt; Caenorhabditis Элеганс</em

The genetically tractable model organism C. elegans has provided insights into a myriad of biological questions, enabled by its short generation time, ...

Basic Caenorhabditis elegans Methods: Synchronization and Observation

Basic Caenorhabditis elegans Methods: Synchronization and Observation

Основной<em&gt; Caenorhabditis Элеганс</em&gt; Методы синхронизации и наблюдения

Research into the molecular and developmental biology of the nematode Caenorhabditis elegans was begun in the early seventies by Sydney Brenner and it has ...

Selective Capture of 5-hydroxymethylcytosine from Genomic DNA

Селективный захват 5-hydroxymethylcytosine из геномной ДНК

5-methylcytosine (5-mC) constitutes ~2-8% of the total cytosines in human genomic DNA and impacts a broad range of biological functions, including gene ...

Prostaglandin Extraction and Analysis in Caenorhabditis elegans

Prostaglandin Extraction and Analysis in Caenorhabditis elegans

Добыча простагландинов и анализа в<em&gt; Caenorhabditis Элеганс</em

Caenorhabditis elegans is emerging as a powerful animal model to study the biology of lipids1-9. Prostaglandins are an important class of eicosanoids, ...

Amplification, Next-generation Sequencing, and Genomic DNA Mapping of Retroviral Integration Sites

Amplification, следующего поколения Секвенирование и геномную ДНК Mapping ретровирусных интеграции сайты

Retroviruses exhibit signature integration preferences on both the local and global scales. Here, we present a detailed protocol for (1) generation of ...

Measurement of Oxygen Consumption Rates in Intact Caenorhabditis elegans

Measurement of Oxygen Consumption Rates in Intact Caenorhabditis elegans

Измерение коэффициентов потребления кислорода в неповрежденной Caenorhabditis elegans

Optimal mitochondrial function is critical for healthy cellular activity, particularly in cells that have high energy demands like those in the nervous ...