Name: thermochemical studies of ni(ii) and zn(ii) ternary complexes using ion mobility-mass spectrometry
Uploaded: 2022-06-08T13:50:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Thermochemical Studies of NiII and ZnII Ternary Complexes Using Ion Mobility-Mass Spectrometry at JoVE.com

Detta material är baserat på arbete som stöds av National Science Foundation under 1764436, NSF REU-programmet (CHE-1659852), NSF-instrumentstöd (MRI-0821247), Physics and Astronomy Scholarship for Success (PASS) NSF-projekt (1643567), Welch Foundation (T-0014) och datorresurser från Department of Energy (TX-W-20090427-0004-50) och L3 Communications. Författarna tackar Kent M. Ervin (University of Nevada - Reno) och Peter B. Armentrout (University of Utah) för att de delar CRUNCH-programmet och för råd om montering från PBA. Författarna tackar Michael T. Bowers grupp vid University of California - Santa Barbara för att dela Sigma-programmet.

OBS: Figur 1 visar en översikt över protokollet.
1. Beredning av reagenser
<ol><li>Köp frystorkade amb-peptider (>98% renhet) och förvara dem i en −80 °C frys.</li>
	<li>Köp >99% renhet zink (II) nitrathexahydrat och nickel (II) nitrathexahydrat. VARNING: Nickel(II)nitrathexahydrat utgör en miljö- och hälsorisk.</li>
	<li>Köp nitrilotriättiksyra, poly-DL-alaninpolymerer, ultraren / spår metallkvalitet ammoniumacetat, ammoniumhyd...

Kritiska steg ES-IM-MS analyser av tröskelkollisionsinducerad dissociation (TCID). TCID använde överförings-T-vågcellen i närvaro av argon som kollisionscell. Före dissociation termiseras prekursorjonerna av lågenergikollisioner med kvävgas när de passerar genom jonmobilitetscellen (IM). Detta resulterar i en mer reproducerbar energiupplöst TCID än vad som uppnås genom att använda fällan som kollisionscell 6,40....

Denna studie beskriver en ny teknik med hjälp av en kommersiellt tillgänglig jonmobilitetsmasspektrometer som möjliggör bestämning av den relativa termokemin för dissociation av ett alternativt metallbindande (amb) ternära metallkomplex [amb + M (II) + NTA], där M = Zn eller Ni och NTA = nitrilotriättiksyra (Figur 1). Dessa reaktioner modellerar dissociationen av det amb-taggade rekombinanta proteinet fäst vid den NTA-immobiliserade metallen under immobiliserad metallaffinitetskromatografi (IMAC)1,2. Som ett exempel beskrivs denna metod med hjälp av amb heptapeptidtaggarna amb A och H (figur 2) (vald från tidigare studier 3,4,5,6,7,8,9,10,11,12 ) som uppvisar Zn(II) och Ni(II)-bindande egenskaper och därmed har potentiella tillämpningar som reningstaggar. Den beskrivna processen kan emellertid användas för att utvärdera termokemiska energier i vilket organometalliskt system som helst. Dessa amb-peptider har metallbindningsställen i positionerna Aa1-Aa 2 och Aa6-Aa 7 som konkurrerar med NTA: s karboxylat- och aminställen. De tre centrala amb-aminosyrorna ger en distans (Gly3), gångjärnet för de två armarna (Pro4) och en långdistansinteraktion mellan π och metall katjon (Tyr5).
Det totala 1− laddningstillståndet för [amb + M (II) + NTA] - -komplexen bestäms av protoneringstillståndet för deras potentiella bindningsställen. Eftersom det finns Ni(II) eller Zn(II) med oxidationstillståndet 2+ måste det finnas ett nät av tre deprotonerade negativt laddade platser. Den molekylära modelleringen av [amb + M (II) + NTA] - komplexen förutsäger att dessa är två protoner från NTA och en proton från amb (dvs [amb-H + M (II) + NTA-2H]-). Produktkanalerna innehåller en jonart och en neutral art (dvs. [NTA-3H+M(II)]- + amb eller [amb-3H+M(II)]- + NTA). I manuskriptet utesluts "-3H" i komplexens namn, men läsaren bör veta att -3H är underförstått. Instrumentet mäter de relativa intensiteterna hos de två joniska mass-till-laddning-arterna (m/z). En viktig egenskap hos ES-IM-MS-analyser är att den möjliggör undersökning av reaktiviteten hos en specifik m/z-art, som används här och i tidigare amb-studier 3,4,5,6,7,8,9,10,11,12.
Att förvärva termokemiska data för stora komplex med hjälp av kollisionsinducerad dissociation är ett ämne av betydande intresse13,14. Metoder inklusive den kinetiska metoden bidrar inte till att anpassa data över en rad energier, och de tar inte heller hänsyn till miljöer med flera kollisioner15,16,17,18. Här tillämpas tröskel-CID (TCID) -metoden, utvecklad med hjälp av styrd jonstråle tandemmasspektrometri av Armentrout, Ervin och Rodgers19 på en ny ES-IM-MS-instrumentplattform som använder resevågsjonguider. TCID-metoden möjliggör relativ termokemisk analys av dissociationen av de ternära komplexen i deras två produktkanaler och inkluderar en tröskellag som beskriver överföringen av kollisionsenergi mellan reaktantens translationella energi (ternära komplex i denna forskning) och en inert målgas (argon i detta fall). Metoden inkluderar integration över reaktantens interna energifördelning 20, de translationella energifördelningarna mellan reaktanten och målgasen21 och de totala rörelsemängdsmomentfördelningarna22,23. En dissociationssannolikhet och statistisk Rice-Ramsperger-Kassel-Marcus (RRKM) korrigering av de kinetiska skiften till följd av det begränsade tidsfönstret för observation av produkterna ingår24. För två oberoende produktkanaler möjliggör den konkurrenskraftiga TCID-metoden samtidig anpassning av de två konkurrerande produktkanalerna. Dissociation av komplexet sker genom ett kretsande övergångstillstånd, som har produkternas egenskaper men hålls samman av en låst dipol25. TCID-metoden ingår i CRUNCH-programmet26, och användargränssnittets funktion beskrivs här för att utvärdera termokemin för de två dissociationskanalerna i de ternära [amb + M (II) + NTA] - komplexen. CRUNCH-programmet är tillgängligt på begäran från utvecklarna26.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Acetonitrile HPLC-grade</td>
			<td>Fisher Scientific (www.Fishersci.com)</td>
			<td>A998SK-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Alternative metal binding (amb) peptides</td>
			<td>PepmicCo (www.pepmic.com)</td>
			<td></td>
			<td>designed peptides were synthized by order</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium acetate (ultrapure)</td>
			<td>VWR</td>
			<td>97061-014</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ammonium hydroxide (trace metal grade)</td>
			<td>Fisher Scientific (www.Fishersci.com)</td>
			<td>A512-P500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Driftscope 2.1 software program</td>
			<td>Waters (www.waters.com)</td>
			<td></td>
			<td>software analysis program</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Gaussian 09</td>
			<td>Gaussian</td>
			<td></td>
			<td>Electronic Structure Modeling Software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GaussView</td>
			<td>Gaussian</td>
			<td></td>
			<td>Graphical Interface to Visualize Computations</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glacial acetic acid (Optima grade)</td>
			<td>Fisher Scientific (www.Fishersci.com)</td>
			<td>A465-250</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ion-scaled Lennard-Jones (LJ) method</td>
			<td>Sigma</td>
			<td></td>
			<td>Michael T. Bowers&#8217; group of University of California at Santa Barbara</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MassLynx 4.1</td>
			<td>Waters (www.waters.com)</td>
			<td></td>
			<td>software analysis program</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microcentrifuge Tubes</td>
			<td>VWR</td>
			<td>87003-294</td>
			<td>1.7 mL, polypropylene</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microcentrifuge Tubes</td>
			<td>VWR</td>
			<td>87003-298</td>
			<td>2.0 mL, polypropylene</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ni(II) nitrate hexahydrate (99% purity)</td>
			<td>Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>A15540</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Poly-DL-alanine</td>
			<td>Sigma-Aldrich (www.sigmaaldrich.com)</td>
			<td>P9003-25MG</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Waters Synapt G1 HDMS</td>
			<td>Waters (www.waters.com)</td>
			<td></td>
			<td>&#160;quadrupole - ion mobility- time-of-flight mass spectrometer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Zn(II) nitrate hexahydrate (99%+ purity)</td>
			<td>Alfa Aesar (www.alfa.com)</td>
			<td>12313</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

thermochemical studies of ni(ii) and zn(ii) ternary complexes using ion mobility-mass spectrometry

Denna artikel beskriver ett experimentellt protokoll med elektrospray-jonmobilitet-masspektrometri (ES-IM-MS) och energiupplöst tröskelkollisionsinducerad dissociation (TCID) för att mäta termokemin för dissociationen av negativt laddad [amb + M (II) + NTA] - ternära komplex i två produktkanaler: [amb + M (II)] + NTA eller [NTA + M (II)] -  + amb, där M = Zn eller Ni och NTA är nitrilotriättiksyra. Komplexen innehåller en av de alternativa metallbindande (amb) heptapeptiderna med de primära strukturerna acetyl-His 1-Cys 2-Gly 3-Pro 4-Tyr 5-His 6-Cys 7 eller acetyl-Asp 1-Cys 2-Gly 3-Pro 4-Tyr 5-His 6-Cys 7, där aminosyrornas Aa1,2,6,7 positioner är de potentiella metallbindningsställena. Geometrioptimerade stationära tillstånd för de ternära komplexen och deras produkter valdes från kvantkemiska beräkningar (för närvarande PM6 semi-empirisk Hamiltonian) genom att jämföra deras elektroniska energier och deras kollisionstvärsnitt (CCS) med de som mättes av ES-IM-MS. Från PM6-frekvensberäkningarna modellerar de molekylära parametrarna för det ternära komplexet och dess produkter de energiberoende intensiteterna hos de två produktkanalerna med hjälp av en konkurrenskraftig TCID-metod för att bestämma tröskelenergierna för reaktionerna som relaterar till 0 K-entalpierna av dissociation (ΔH0). Statistisk mekanik termiska och entropikorrigeringar med hjälp av PM6 rotations- och vibrationsfrekvenser ger 298 K entalpier av dissociation (ΔH298). Dessa metoder beskriver en EI-IM-MS-rutin som kan bestämma termokemi och jämviktskonstanter för en rad ternära metalljonkomplex.

Den konkurrenskollisionsinducerade dissociationen av [amb + M (II) + NTA] - ternära komplex av A och H till [amb + M (II) - + NTA eller [NTA + M (II) - + amb, visas i figur 3. Amb visas som antingen A eller H och M = Zn eller Ni. [A+Zn(II)+NTA]- ternära komplex (figur 3A) uppvisar uppenbara trösklar på cirka 0,7 eV kollisionsenergi (CE) för att producera [A+...

Watch this Scientific Journal Video about Thermochemical Studies of NiII and ZnII Ternary Complexes Using Ion Mobility-Mass Spectrometry at JoVE.com

Thermochemical Studies of NiII and ZnII Ternary Complexes Using Ion Mobility-Mass Spectrometry

Denna artikel beskriver ett experimentellt protokoll som använder elektrospray-jonmobilitet-masspektrometri, semi-empiriska kvantberäkningar och energiupplöst tröskelkollisionsinducerad dissociation för att mäta den relativa termokemin för dissociationen av relaterade ternära metallkomplex.

Termokemiska studier av Ni(II) och Zn(II) ternära komplex med jonmobilitet-masspektrometri

This article describes an experimental protocol using electrospray-ion mobility-mass spectrometry (ES-IM-MS) and energy-resolved threshold ...

Denna nya teknik kombinerar jonmobilitet-masspektrometri med molekylär modellering och reaktionsdynamikteori för att bestämma den relativa termokemin för två konkurrerande dissociationsreaktioner i ett ternära komplex. Kombinationen av dessa tekniker karakteriserar reaktanternas och produkternas reaktionsvägar, konformationsstrukturer och ligandens affinitet för att bilda ett ternära komplex med metalljonen. Denna forskning modellerar reaktiviteten hos två potentiella peptidtaggar för rekombinant proteinrening, där taggen reagerar med metallen kelaterad av nitrilotriättiksyra i en immobiliserad metallaffiniteskolonn.Börja med att ladda 2 ml-provet i en 2,5-milliliters trubbig nässpruta och injicera provet i instrumentets elektrospray med instrumentets sprutpump med en flödeshastighet på 10 mikroliter per minut. Placera instrumentet i negativ jonmobilitet-masspektrometri, eller IM-MS-läge. Identifiera mass-till-laddning-isotopmönstret för det negativt laddade alternativa metallbindande ternära komplexet, eller amb-metall-NTA-komplexet, genom att öppna masspektrometriprogrammet och välja Spektrum.Välj sedan Verktyg följt av Isotopmodell. I popup-fönstret listar du komplexets molekylformel, markerar rutan för Visa laddad jon, anger 1 för laddning av negativ och klickar på OK.In det visade isotopmönstret för komplexet, notera den lägsta masstoppen. I instrumentprogramvaran väljer du Inställningar följt av Quad Profile.Välj sedan Manuell fast och ange massan för den lägsta isotopmönstertoppen. Klicka på Uppdatera och stäng fönstret. Välj igen Setup och klicka sedan på Resolving Quad.Samla in IM-MS-spektra med negativ jon som börjar med den första överföringskollisionsenergin med en 5-minuters körtid och 2-sekunders skanningstid. Upprepa för att samla in IM-MS-spektra för var och en av de andra kollisionsenergierna. Använd de integrerade ankomsttidsfördelningarna, eller ATD-områdena, för det ternära amb-metal-NTA-komplexet och två produkter, NTA-metallkomplex och amb-metallkomplex, för att normalisera till en relativ procentuell skala.Från den replikaterade tröskelkollisionsinducerade dissociationen, eller TCID-mätningarna, hitta medelvärdet och standardavvikelserna för varje datapunkt. Konvertera sedan lab-frame-överföringskollisionsenergin till centrum för masskollisionsenergin. För att mäta kollisionstvärsnitt, samla in de negativa jon-IM-MS-spektra för 10 ppm poly-DL-alanin, eller PA-provet, i 10 minuter med hjälp av de instrumentella driftsförhållandena.Samla sedan IM-MS-spektra för varje ternärt komplex i 5 minuter. Extrahera ATD för vart och ett av PA- och ternära komplex och exportera deras filer till masspektrometriprogramvaran med alternativet Behåll drifttid. Hitta de genomsnittliga ankomsttiderna från maxima för motsvarande ATD-kurvor.Använd en tvärsnittskalibreringsmetod för att konvertera de genomsnittliga ankomsttiderna till kollisionstvärsnitt av det ternära komplexet. Från CRUNCH-huvudmenyn öppnar du GB5-textfilen som innehåller energin i masscentrum eller ECM-beroende relativa intensiteter för produkterna. Svara Nej för att läsa parametrar.Välj sedan Modellering följt av Ange alla parametrar. Från reaktionsmodellalternativen väljer du standardalternativet Threshold CID följt av RRKM med integration över energiöverföringsfördelningen för det ternära komplexet. Ange 2 för oberoende produktkanaler modellerade och välj Beräkna tvärsnitt.För typen av oinvecklad modell, välj 0 Kelvin tvärsnitt, vilket inkluderar den statistiska RRKM-korrigeringen av de kinetiska skiften på grund av tidsfönstret på 50 mikrosekunder från kollisionscellen till flygtidsdetektorn. För faltningsalternativen väljer du Tiernans dubbelintegral, som inkluderar faltningen över translationella energifördelningar mellan den ternära komplexa jonen och argonkollisionsgasen. För den numeriska integreringsmetoden väljer du Gaussisk kvadratur med försparade tvärsnitt.Från alternativen för att ange molekylära parametrar anger du G för att läsa den strukturella modelleringsfilen med PM6-vibrations- och rotationsfrekvenserna i det ternära komplexet. Svar Ja på frågan:Är en av reaktanterna atomisk? Skriv platsen och namnet på modelleringsfilen.Ange 1 för laddningen på jon och 1.664 för polariserbarheten hos argongasen. Massan av jon och målmassa är för det ternära komplexet respektive argon och läses automatiskt från GB5-textfilen. Ange 0 för harmoniska vibrationer.Tryck på Enter för att läsa 1D- och 2-D-rotationskonstanterna från den strukturella modelleringsfilen. Välj standardvärdena 0 för de hindrade rotorbehandlingarna och 1 för molekylsymmetri. Välj standard 300 Kelvin för reaktanttemperatur.Välj Integrering som metod för minskning av densiteten för tillståndsmatris. Välj Ja för att trunkera energifördelningen. Ange 40000 vågnummer för maximal energi för distribution, 2 vågnummer för fackstorlek och 32 för antal punkter i energifördelningen.För parametrar för TCID/RRKM-modell väljer du Ja för Ändra, anger 0 för Fast tid och 0,000050 sekunder för den övre gränsen för identifieringsfönstret. För produktkanal 1 väljer du 1 för ett enda övergångstillstånd från dissociationskanalalternativen och 0 för ingen av den sekventiella dissociationen. För övergångstillståndstypen väljer du 1 för omloppsbana.Välj G för att läsa modelleringsprogramfilerna som innehåller PM6-rotations- och vibrationsparametrarna för amb-metallkomplexet plus NTA-produkter. Ange Nej för:Är ett av fasrumsgränsövergångstillståndet, eller PSL TS, arter atomiskt? Ange plats och namn på amb-metal-komplexfilen.Använd 1.062 för skalfrekvenser, tryck Enter för antalet atomer och ange Nej för:Är molekylen linjär? Upprepa samma sak för modelleringsfilen som innehåller vibrations- och rotationsfrekvenserna för NTA-produkten. Ange beskrivningen av den kretsande TS. Ange 1.0 för laddning av amb-metalljon och ange sedan polariserbarheten och dipolmomentet för NTA.Välj 0 Kelvin för rotationstemperatur och låst dipol för behandling av omloppsövergångstillståndet. Ange de genomsnittliga massorna av amb-metalljonen och NTA. Tryck på Enter för att läsa 1D- och 2-D-rotationskonstanterna från modelleringsfilerna.Välj 0 för hindrade rotorer, 1 för molekylsymmetri och 1 för reaktionsdegenerering. Ange alternativet Inga ändringar. För produktkanal 2 väljer du 1 för enstaka övergångstillstånd, 0 för ingen för sekventiell dissociation och 1 för omloppsbana för övergångstillståndstypen.Välj G för att läsa i modelleringsfiler som innehåller PM6-rotations- och vibrationsparametrarna för NTA-metallkomplexet och amb-produkterna. Ange sedan beskrivningen av den kretsande TS. Ange 1.0 för laddning av NTA-metallkomplexjon och ange polariserbarheten och dipolmomentet för amb. Välj 0 Kelvin för rotationstemperaturen och låst dipol för behandling av det kretsande övergångstillståndet.Ange de genomsnittliga massorna för NTA-metallkomplexet och amb-produkterna. Tryck på Enter för att läsa 1D- och 2-D-rotationskonstanterna från modelleringsfilerna. Välj 0 för hindrade rotorer, 1 för molekylsymmetri och 1 för reaktionsdegenerering.Ange sedan Inga ändringar. För att hantera inaktiva 2D-rotationer, välj standardalternativen för statistisk vinkelmomentfördelning och integrera P-E, G över J-fördelning. Använd standardvärdet 32 i antalet punkter i integreringen.För menyn Modell väljer du Optimera parametrar för att anpassa data och anger minsta energi och maximal energi för att påbörja respektive avsluta datapassningen. Välj 1 för viktningsmodellernas experimentella standardavvikelser. Baserat på data väljer du en minsta acceptabel standardavvikelse på vanligtvis 0,01 till 0,001.Använd standardvärdet för E0-konvergensgränsen och välj Nej för att hålla någon parameter vid nuvarande värde, 0,5 och 2,0 elektronvolt för de nedre och övre gränserna och 2 för derivatutvärderingsmetoden. På menyn Optimering väljer du Börja optimering. CRUNCH-programmet optimerar den valda TCID-modellen till experimentella data.Slutligen, i modellmenyn, välj delta-H och S vid T för den termokemiska utvärderingen av de två dissociationskanalerna. Den representativa bilden visar de primära strukturerna för alternativa metallbindande A- och H-peptider. Färgen belyser de potentiella metallbindningsställena.Energiberoendet för att bilda amb-metall- och NTA-metallproduktjonerna visas här. Centrum-av-masskollisionsenergin, där det finns 50% dissociation av amb-metal-NTA-ternära komplexet, ingår i graferna. De representativa bilderna visar dynamikmodellen för den energiupplösta TCID-metoden.Kollisionerna mellan ambH-zink-NTA-komplexet plus argon resulterar i dissociation till ambH-zinkkomplexet och fria NTA, eller NTA-zinkkomplex och fria ambH-produkter. Tröskelenergierna E1 och E2 motsvarar 0 Kelvin-entalpierna för dissociation för reaktionerna ambH-zink-NTA-komplex till ambH-zinkkomplex och fritt NTA, eller ambH-zink-NTA-komplex till NTA-zinkkomplex respektive fritt ambH. De PM6-geometrioptimerade ternära amb-metal-NTA-komplexen av A och H visas här.Dessa konformare användes i TCID-modelleringen av experimentella data och valdes från andra kandidatstrukturer genom att jämföra deras PM6-elektroniska energier och hur deras beräknade kollisionstvärsnitt jämfört med IM-MS mätte kollisionstvärsnitt. Den energiupplösta TCID för de fyra amb-metal-NTA-komplexen avbildas i dessa bilder. För art A och H visas produktjonerna av amb-metall och NTA-metall med de invecklade CRUNCH-tröskelpassningarna här.Energivärdena är entalpierna av dissociation vid 0 Kelvin för reaktionerna amb-metal-NTA till amb-metal och free NTA, eller amb-metaL-NTA till NTA-metal och free amb. En jämförelse av Gibbs fria associationsenergier i kilojoule per mol och bildningskonstanter härledda från dissociationens entalpier, nettonoll Kelvin, med statiska mekanikberäkningar med PM6-parametrarna visas här. Reaktionen av NTA-nickel och fri ambA för att bilda ambA-nickel-NTA-komplexet uppvisar den högsta bildningskonstanten och representerar reaktionen där det ambA-märkta proteinet immobiliseras av NTA-nickel inuti affinitetskolonnen.CRUNCH-montering kräver noggrann screening av reaktanter och produkter för att få exakta tröskelenergier. Expertis inom molekylär modellering för att erhålla strukturer och tillförlitliga molekylära parametrar krävs. De övergripande metoder som beskrivs här kan utvecklas för att screena effektiviteten hos molekyler som är utformade för att binda metallkofaktorer och aktiva platser av proteiner för att blockera de enzymatiska funktionerna.

Research

JoVE Journal

Chemistry

Thermochemical Studies of Ni(II) and Zn(II) Ternary Complexes Using Ion Mobility-Mass Spectrometry

Preparation and Use of Samarium Diiodide (SmI2) in Organic Synthesis: The Mechanistic Role of HMPA and Ni(II) Salts in the Samarium Barbier Reaction

Preparation and Use of Samarium Diiodide SmI2 in Organic Synthesis: The Mechanistic Role of HMPA and NiII Salts in the Samarium Barbier Reaction

Beredning och användning av samariumdijodid (SMI<sub&gt; 2</sub&gt;) I Organic Synthesis: den mekanistiska roll HMPA och Ni (II) salter i Samarium Barbier Reaktion

Although initially considered an esoteric reagent, SmI2 has become a common tool for synthetic organic chemists. SmI2 is generated through the addition of ...

Production of Disulfide-stabilized Transmembrane Peptide Complexes for Structural Studies

Produktion av disulfid-stabiliserade transmembran peptidkomplex för strukturstudier

Physical  interactions among the lipid-embedded alpha-helical domains of membrane  proteins play a crucial role in folding and assembly of membrane ...

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Struktur och samordning Fastställande av peptid-metallkomplex Använda 1D och 2D<sup&gt; 1</sup&gt; H-NMR

Copper (I) binding by metallochaperone transport proteins prevents copper oxidation and release of the toxic ions that may participate in harmful redox ...

Construction and Systematical Symmetric Studies of a Series of Supramolecular Clusters with Binary or Ternary Ammonium Triphenylacetates

Konstruktion och Systematiska Symmetrisk Studier av en serie av Supramolecular Clusters med binära eller ternära Ammonium Triphenylacetates

Functions of clusters in nano or sub-nano scale significantly depend on not only kinds of their components but also arrangements, or symmetry, of their ...

Site Directed Spin Labeling and EPR Spectroscopic Studies of Pentameric Ligand-Gated Ion Channels

Sätesriktad Spin Labeling och EPR Spektroskopiska studier av pentamer ligandreglerade jonkanaler

Ion channel gating is a stimulus-driven orchestration of protein motions that leads to transitions between closed, open, and desensitized states. ...

Analyzing the Photo-oxidation of 2-propanol at Indoor Air Level Concentrations Using Field Asymmetric Ion Mobility Spectrometry

Analysera Photo-oxidation av 2-propanol i inomhusluft nivå koncentrationer använder fältet asymmetrisk Ion rörlighet spektrometri

We demonstrate a versatile protocol to be used for determining the effectiveness of photocatalysts in degrading indoor air concentration (ppb) volatile ...

Analyzing Protein Architectures and Protein-Ligand Complexes by Integrative Structural Mass Spectrometry

Analysera Protein arkitekturer och Protein-Ligand komplex av integrativ strukturella masspektrometri

Proteins are an important class of biological macromolecules that play many key roles in cellular functions including gene expression, catalyzing ...

Imaging Corrosion at the Metal-Paint Interface Using Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry

Imaging korrosion vid metal-Paint Interface använda Time-of-Flight sekundär Jon masspektrometri

Corrosion developed at the paint and aluminum (Al) metal-paint interface of an aluminum alloy is analyzed using time-of-flight secondary ion mass ...

Ion Mobility-Mass Spectrometry Techniques for Determining the Structure and Mechanisms of Metal Ion Recognition and Redox Activity of Metal Binding Oligopeptides

Jon mobilitet-masspektrometri tekniker för att bestämma strukturen och mekanismerna för metall Jon igenkänning och redox aktivitet av metall bindning Oligopeptides

Electrospray ionization (ESI) can transfer an aqueous-phase peptide or peptide complex to the gas-phase while conserving its mass, overall charge, ...

Preparation of Binary and Ternary Deep Eutectic Systems

Beredning av binära och Ternary djupa Eutectic system

The preparation of deep eutectic systems (DES) is a priori a simple procedure. By definition, two or more components are mixed together at a given molar ...