Name: biobank for translational medicine: standard operating procedures for optimal sample management
Uploaded: 2022-11-30T12:40:00
Duration: 8 min 1 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Biobank for Translational Medicine: Standard Operating Procedures for Optimal Sample Management at JoVE.com

يود المؤلفون أن يشكروا جميع المرضى الذين شاركوا بنشاط خلال العقد الماضي في برامجنا البحثية من خلال التبرع بعيناتهم الحيوية. بدونهم ، لن يكون هذا البحث ممكنا. نحن ممتنون أيضا لجميع الموظفين العاملين في المعهد الأوروبي للأورام والممرضات والفنيين وعلماء الأحياء والأطباء ومديري جميع الوحدات السريرية والبحثية. يعرب المؤلفون عن امتنانهم للبروفيسور بيير باولو دي فيوري والبروفيسور جيانكارلو برونيري على توجيهاتهم. أخيرا ، نكرس هذا العمل للبروفيسور أومبرتو فيرونيسي ، مؤسس المعهد الأوروبي للأورام ، ونهجه الرائد في دمج أبحاث السرطان ورعاية المرضى.

<ol>
	<li>Pagni, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Targeting+immune-related+biological+processes+in+solid+tumors:+We+do+need+biomarkers.">Targeting immune-related biological processes in solid tumors: We do need biomarkers.</a> International Journal of Molecular Sciences. 20 (21), 5452 (2019).</li><li>Braun, K. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cancer+patient+perceptions+about+biobanking+and+preferred+timing+of+consent.">Cancer patient perceptions about biobanking and preferred timing of consent.</a> Biopreservation and Biobanking. 12 (2), 106-112 (2014).</li><li>Bycroft, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+UK+Biobank+resource+with+deep+phenotyping+and+genomic+data.">The UK Biobank resource with deep phenotyping and genomic data.</a> Nature. 562 (7726), 203-209 (2018).</li><li>Saifuddin, S. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=King's+Health+Partners'+Prostate+Cancer+Biobank+(KHP+PCaBB).">King's Health Partners' Prostate Cancer Biobank (KHP PCaBB).</a> BMC Cancer. 17 (1), 784 (2017).</li><li>Lopez, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Molecular+insights+into+the+classification+of+luminal+breast+cancers:+The+genomic+heterogeneity+of+progesterone-negative+tumors.">Molecular insights into the classification of luminal breast cancers: The genomic heterogeneity of progesterone-negative tumors.</a> International Journal of Molecular Sciences. 20 (3), 510 (2019).</li><li>Kinkorov&#225;, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biobanks+in+the+era+of+personalized+medicine:+Objectives,+challenges,+and+innovation:+Overview.">Biobanks in the era of personalized medicine: Objectives, challenges, and innovation: Overview.</a> The EPMA Journal. 7 (1), 4 (2015).</li><li>Luo, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Intravital+biobank+and+personalized+cancer+therapy:+The+correlation+with+omics.">Intravital biobank and personalized cancer therapy: The correlation with omics.</a> International Journal of Cancer. 135 (7), 1511-1516 (2014).</li><li>Invernizzi, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quality+of+life+interventions+in+breast+cancer+survivors:+State+of+the+art+in+targeted+rehabilitation+strategies.">Quality of life interventions in breast cancer survivors: State of the art in targeted rehabilitation strategies.</a> Anticancer Agents in Medicinal Chemistry. 22 (4), 801-810 (2021).</li><li>Roux, J., Zeghidi, M., Villar, S., Kozlakidis, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biosafety+and+biobanking:+Current+understanding+and+knowledge+gaps.">Biosafety and biobanking: Current understanding and knowledge gaps.</a> Biosafety and Health. 3 (5), 244-248 (2021).</li><li>Sanchini, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+trust-based+pact+in+research+biobanks.+From+theory+to+practice.">A trust-based pact in research biobanks. From theory to practice.</a> Bioethics. 30 (4), 260-271 (2016).</li><li>Vaught, J., Kelly, A., Hewitt, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+review+of+international+biobanks+and+networks:+Success+factors+and+key+benchmarks.">A review of international biobanks and networks: Success factors and key benchmarks.</a> Biopreservation and Biobanking. 7 (3), 143-150 (2009).</li><li>Ferrin, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation,+culture,+and+expansion+of+mesenchymal+stem+cells.">Isolation, culture, and expansion of mesenchymal stem cells.</a> Methods in Molecular Biology. 1590, 177-190 (2017).</li><li>Hermansen, J. U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+Norwegian+childhood+cancer+biobank.">The Norwegian childhood cancer biobank.</a> Cancer Reports. , 1555 (2021).</li><li>Schmelz, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+plan+for+emergency+shutdown+and+reopening+for+a+consortium+of+biobanks.">A plan for emergency shutdown and reopening for a consortium of biobanks.</a> Biopreservation and Biobanking. 19 (5), 394-398 (2021).</li><li>Salvaterra, E., Corfield, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Advances in Biobanking Practice Through Public and Private Collaborations. , (2017).</li><li>Snapes, E., Simeon-Dubach, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ISBER+best+practices+for+repositories,+moving+toward+the+fifth+edition.">ISBER best practices for repositories, moving toward the fifth edition.</a> Biopreservation and Biobanking. 20 (1), 107-108 (2022).</li><li>Fischer, A. H., Jacobson, K. A., Rose, J., Zeller, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cryosectioning+tissues.">Cryosectioning tissues.</a> Cold Spring Harbour Protocols. (8), 4991 (2008).</li><li>Staining methods in frozen section: Best lab practices. Laboratory Best Practice Blog. UC Davis Health Available from: <a target="_blank" href="https://health.ucdavis.edu/blog/lab-best-practice/staining-methods-in-frozen-section-best-lab-practices/2020/03">https://health.ucdavis.edu/blog/lab-best-practice/staining-methods-in-frozen-section-best-lab-practices/2020/03</a> (2020)</li><li>Craciun, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tumor+banks:+A+quality+control+scheme+proposal.">Tumor banks: A quality control scheme proposal.</a> Frontiers in Medicine. 6, 225 (2019).</li><li>Ma, X., Yu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Global+burden+of+cancer.">Global burden of cancer.</a> The Yale Journal of Biology and Medicine. 79 (3-4), 85-94 (2006).</li><li>Angerilli, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+role+of+the+pathologist+in+the+next-generation+era+of+tumor+molecular+characterization.">The role of the pathologist in the next-generation era of tumor molecular characterization.</a> Diagnostics. 11 (2), 339 (2021).</li><li>Correa-Aguila, R., Alonso-Pupo, N., Hern&#225;ndez-Rodr&#237;guez, E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multi-omics+data+integration+approaches+for+precision+oncology.">Multi-omics data integration approaches for precision oncology.</a> Molecular Omics. , (2022).</li><li>Salati, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ctDNA+analysis+in+the+personalized+clinical+management+of+gastroesophageal+adenocarcinoma:+Turning+hope+into+reality.">ctDNA analysis in the personalized clinical management of gastroesophageal adenocarcinoma: Turning hope into reality.</a> Future Oncology. 17 (33), 4607-4618 (2021).</li><li>Mirzayi, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reporting+guidelines+for+human+microbiome+research:+The+STORMS+checklist.">Reporting guidelines for human microbiome research: The STORMS checklist.</a> Nature Medicine. 27 (11), 1885-1892 (2021).</li><li>Cortvrindt, C., Speeckaert, R., Delanghe, J. R., Speeckaert, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Urinary+epidermal+growth+factor:+A+promising+&amp;#34;next+generation&amp;#34;+biomarker+in+kidney+disease.">Urinary epidermal growth factor: A promising &amp;#34;next generation&amp;#34; biomarker in kidney disease.</a> American Journal of Nephrology. , (2022).</li><li>Fusco, N., Fumagalli, C., Guerini-Rocco, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Looking+for+sputum+biomarkers+in+lung+cancer+secondary+prevention:+Where+are+we+now.">Looking for sputum biomarkers in lung cancer secondary prevention: Where are we now.</a> Journal of Thoracic Disease. 9 (11), 4277-4279 (2017).</li><li>Im, K., Gui, D., Yong, W. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+introduction+to+hardware,+software,+and+other+information+technology+needs+of+biomedical+biobanks.">An introduction to hardware, software, and other information technology needs of biomedical biobanks.</a> Methods in Molecular Biology. 1897, 17-29 (2019).</li><li>Paul, S., Gade, A., Mallipeddi, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+state+of+cloud-based+biospecimen+and+biobank+data+management+tools.">The state of cloud-based biospecimen and biobank data management tools.</a> Biopreservation and Biobanking. 15 (2), 169-172 (2017).</li><li>Fthenou, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=implementation,+and+integration+of+heterogenous+information+technology+infrastructures+in+the+Qatar+biobank.">implementation, and integration of heterogenous information technology infrastructures in the Qatar biobank.</a> Biopreservation and Biobanking. 17 (6), 494-505 (2019).</li><li>Tukacs, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Model+requirements+for+Biobank+Software+Systems.">Model requirements for Biobank Software Systems.</a> Bioinformation. 8 (6), 290-292 (2012).</li><li>Willers, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+versatile,+secure,+and+sustainable+all-in-one+biobank-registry+data+solution:+The+A3BC+REDCap+model.">A versatile, secure, and sustainable all-in-one biobank-registry data solution: The A3BC REDCap model.</a> Biopreservation and Biobanking. , (2021).</li><li>D'Abramo, F., Schildmann, J., Vollmann, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Research+participants'+perceptions+and+views+on+consent+for+biobank+research:+A+review+of+empirical+data+and+ethical+analysis.">Research participants' perceptions and views on consent for biobank research: A review of empirical data and ethical analysis.</a> BMC Medical Ethics. 16, 60 (2015).</li><li>Policiuc, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+foundation+of+personalized+medicine+is+the+establishment+of+biobanks+and+their+standardization.">The foundation of personalized medicine is the establishment of biobanks and their standardization.</a> Journal of BUON. 23 (3), 550-560 (2018).</li><li>Lygirou, V., Makridakis, M., Vlahou, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biological+sample+collection+for+clinical+proteomics:+Existing+SOPs.">Biological sample collection for clinical proteomics: Existing SOPs.</a> Methods in Molecular Biology. 1243, 3-27 (2015).</li><li>Pisapia, P., Malapelle, U., Troncone, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Liquid+biopsy+and+lung+cancer.">Liquid biopsy and lung cancer.</a> Acta Cytologica. 63 (6), 489-496 (2019).</li><li>Spruessel, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tissue+ischemia+time+affects+gene+and+protein+expression+patterns+within+minutes+following+surgical+tumor+excision.">Tissue ischemia time affects gene and protein expression patterns within minutes following surgical tumor excision.</a> Biotechniques. 36 (6), 1030-1037 (2004).</li></ol>

ليس لدى المؤلفين أي تضارب في المصالح للكشف عنه.

على الرغم من أن علم الأورام قد حقق تقدما هائلا ، إلا أن السرطان لا يزال السبب الرئيسي للمراضة والوفيات في جميع أنحاء العالم20. يعتمد فهم عدم تجانس الورم وتطوره الزمني بمرور الوقت ونتائج العلاج المستهدف بشكل صارم على جمع البيانات الدقيقة في سياق الرعاية السريرية الروتينية21. في هذا الصدد ، يكتسب نهج "multi-omics" زخما في علم الأمراض التنبئي للأورام22. يتم دمج تقييم العلامات الحيوية التقليدية القائمة على الأنسجة باستخدام العديد من التحليلات الحيوية الجديدة ، مثل الدم والبلازما والبول واللعاب والبراز23،24،25،26. لذلك ، يتم التعرف على البنوك الحيوية الآن كبنى تحتية محورية لتعزيز الممارسة السريرية. إذا نظرنا إلى الوراء في تاريخ أبحاث السرطان ، فإننا ندرك أن الاكتشافات الأكثر إثارة للإعجاب والرائدة لم تكن ممكنة بدون الفحص المباشر للأنسجة السرطانية أو الخزعات السائلة. بمرور الوقت ، تطور مصدر الأنسجة السرطانية ونوع الخزعة السائلة المراد فحصها من التشريح الخام ، و "لقاءات الصدفة" العشوائية ، وفي بعض الحالات ، الاتجار غير المشروع إلى مجموعات السرطان المنظمة وبنوك الأورام الحديثة الاستراتيجية. لقد تغير النظر في العديد من القضايا الأخلاقية بشكل كبير سواء في الممارسة أو في العوامل الرئيسية التي تميز بنوك الأورام الحديثة عن مجموعات الأورام في الماضي.
نظرا للتقدم في أبحاث السرطان والكم الهائل من المعلومات الجزيئية التي توفرها الآن التقنيات الحديثة ، أصبح من الواضح أكثر فأكثر أن البنوك الحيوية ، وخاصة تلك الموجودة في مراكز السرطان ، قد تواجه عدة أنواع من المشكلات المنهجية. ومن بين هذه التحديات، أصبحت التكنولوجيا تحديا عالميا لا يزال يحول دون توحيد الإجراءات التشغيلية الموحدة ومواءمتها. جانب آخر مهم للحفاظ على أنشطة البنك الحيوي الأساسية هو وجود برنامج LIMS متكامل قادر على تلقي جميع معرفات المستشفى وجميع البيانات السريرية المقننة القادمة من برنامج المستشفى والحفاظ عليها تلقائيا. من الجدير بالذكر أنه يمكن الحصول على برامج قيمة أخرى تستخدم لإدارة البنوك الحيوية وبعض البرامج المجانية لإدارة البنوك الحيوية27،28،29،30،31. خطوة أخرى حاسمة في البنوك الحيوية هي تنفيذ ميثاق المشاركة لجميع المرضى والاتفاق القانوني والأخلاقي اللازم لتخزين البيانات السريرية والعينات الحيوية10،32.
وفي هذا الصدد، يحتوي هذا البروتوكول على مبادئ توجيهية محددة جيدا لا تسمح بجمع وتخزين العينات البيولوجية في غياب الموافقة. هذه أيضا قضية حرجة حيث يمكن للمرضى سحب مشاركتهم حتى بعد تخزين عيناتهم. وهكذا، تم تنفيذ طرق لأخذ هذه العينات بسرعة من نظام البنوك الحيوية. تتبع العينات الحيوية التي تصل من المرضى الذين تم تجنيدهم من قبل البنك الحيوي لدينا بروتوكولات صارمة للجمع والتخزين. وفي هذا الصدد، تم تقييم عدة جوانب هامة لرصد هذه العملية ويجري تحسينها باستمرار. على وجه الخصوص ، تتطلب شهادة ISO9001 عدة مؤشرات للأداء ، مثل الوقت الإقفاري الدافئ ، والذي يجب الحفاظ عليه لمدة تقل عن 30 دقيقة أو 60 دقيقة اعتمادا على مصدر الأنسجة. بالإضافة إلى ذلك ، يتم جمع الخزعات السائلة والسوائل البيولوجية باستخدام بروتوكولات موحدة تتبع إجراءات زمنية صارمة 15،33،34،35،36.
هناك ميزات محددة ذات أهمية كبيرة في سير عمل البنوك الحيوية. وتشمل هذه وجود أخصائي علم الأمراض المعتمد ، والذي يضمن أخذ عينات من الأنسجة لأسباب تشخيصية ، وجمع الأنسجة للبنوك الحيوية في إطار زمني متوافق مع جودة عالية من العينات (الوقت الإقفاري هو مؤشر مهم لبعض أنواع البحوث ، مثل المقايسات المعتمدة على الحمض النووي الريبي ، والتي تتطلب وقتا أقل تروية دافئة). علاوة على ذلك ، فإن إدارة المساحة المطلوبة لتخزين العينات لها أهمية كبيرة في البنوك الحيوية. يمكن أن يكون عدد الخزعات السائلة التي تم جمعها مدفوعا بتصميم الدراسة. غالبا ما يتم جمع الخزعات السائلة خلال فترة ما قبل الجراحة وفترة المتابعة ، على النحو المحدد في كل تصميم دراسة.
وبفضل حملات الفحص للوقاية من السرطان والتشخيص المبكر للأورام، أي أورام الثدي الصغيرة الحجم في المراحل المبكرة من النمو، فضلا عن توافر التقنيات الجراحية طفيفة التوغل، فقد قللت من عدد عينات الأنسجة المتاحة للبحث (حيث أن معظم عينات الأنسجة تستخدم دائما لأغراض التشخيص). تحسنت القدرة على جمع وتخزين العينات البيولوجية بشكل كبير خلال السنوات القليلة الماضية. ويمكن ملاحظة ذلك بالنسبة للسوائل البيولوجية، مما يعكس زيادة قدرة هذا البنك الحيوي على دعم المجموعات البحثية لهذا المعهد في الطلب المتزايد على المواد المشروحة المشتقة من المريض. على الرغم من هذه التحسينات ، فقد واجهنا بعض القيود على الدراسات متعددة المراكز التي تتطلب التنسيق بين البنوك الحيوية من مختلف أنحاء العالم ، والتي لا يمكن دمجها إلا من خلال تنفيذ إجراءات مماثلة.
بعد استبعاد معظم القضايا الأخلاقية والتقنية المتعلقة بالبنوك الحيوية ، بما في ذلك جمع جميع المعلومات السريرية والديموغرافية ، فإن الهدف التالي هو تنفيذ رقمنة جميع المستحضرات النسيجية والتلوين المستخدمة لأغراض التشخيص والبحث. هذا أمر ذو أهمية أساسية للجيل القادم من الدراسات التي ستستفيد بشكل كبير من علم الأمراض الرقمي المتكامل والبنك الحيوي ، والذي سيصبح المعيار للمستقبل. فقط سلسلة كبيرة من المرضى الذين لديهم بيانات متكاملة وصور رقمية قد تغذي دراسات الذكاء الاصطناعي (الذكاء الاصطناعي) الكبيرة متعددة المراكز لتحسين رعاية مرضى السرطان. في الختام ، نعتقد أن الرعاية الصحية الجيدة لا تنتهي بالتشخيص والعلاج. تشمل أفضل الممارسات إيجاد طرق للتشخيص المستمر وتحسين العلاج لأي مرض ، لا سيما تلك التي تؤثر بشدة على متوسط العمر المتوقع أو الجودة.

البنوك الحيوية هي مستودعات حيوية تهدف إلى جمع وتخزين ومعالجة وتبادل العينات البيولوجية البشرية والبيانات المرتبطة بها للبحث والتشخيص. دورهم حاسم ليس فقط لاكتشاف العلامات الحيوية والتحقق من صحتها ولكن أيضا لتطوير أدوية جديدة1. وبالتالي ، فإن الغالبية العظمى من برامج البحوث الانتقالية والسريرية تعتمد على الوصول إلى عينات حيوية عالية الجودة. في هذا الصدد ، تعتبر البنوك الحيوية جسرا بين البحث الأكاديمي وصناعة الأدوية / التكنولوجيا الحيوية2،3،4،5. نظرا للفرص غير المسبوقة التي يوفرها جمع البيانات الضخمة والذكاء الاصطناعي ، فإن دور البنوك الحيوية في أبحاث السرطان يتطور باستمرار6.
يقترن الطيف الواسع من المواد الحيوية التي تتعامل معها البنوك الحيوية بالمعلومات السريرية المرضية ، بما في ذلك البيانات الديموغرافية والبيئية ، ونوع الورم ، والدرجة النسيجية ، والمرحلة ، ووجود غزو الأوعية الدموية اللمفاوية ، وحالة المؤشرات الحيوية 7,8. كلما توفرت المزيد من العينات والبيانات عالية الجودة ، كلما تقدمت الأبحاث بشكل أسرع وأثرت على تقديم الرعاية الصحية9. هناك إطار تنظيمي صارم يعتمد على المبادئ الأخلاقية والقانونية التي يجب أن تتبع إجراءات التشغيل الموحدة المعتمدة على نطاق واسع ، وضوابط الجودة ، والمبادئ التوجيهية (على سبيل المثال ، المعهد الوطني الأمريكي للسرطان ، واتحاد المملكة المتحدة للبنوك الحيوية للسرطان ، والجمعية الدولية للاتحاد الأوروبي للمستودعات البيولوجية والبيئية)10،11.
يجلب تطوير إجراءات التشغيل الموحدة لجميع الجوانب الرئيسية للبنوك الحيوية العديد من المزايا من حيث الجودة وإمكانية التتبع والاتساق وقابلية التكرار وأوقات الاستجابة12,13. يتمثل جانب آخر مهم من تنفيذ الإجراء التشغيلي الموحد في تحسين إدارة البنك الحيوي ، مما يسمح بحل المشكلات بشكل أفضل وإجراءات بديلة لموظفي البنوك الحيوية والباحثين14. كل هذه الجوانب هي جزء من سير عمل البنك الحيوي (الشكل 1).
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63950/63950fig01v2.jpg"> الشكل 1: العوامل المختلفة التي تساهم في تحسين البنوك الحيوية. اختصار: LIMS = نظام إدارة معلومات المختبر. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63950/63950fig01large.jpg" target="_blank">الرجاء الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.</a>
تتطلب هذه البيانات المحددة والحساسة للغاية إجراءات قياسية إدارية صارمة في البنوك الحيوية. يجب توفير نموذج مشروع مفصل ومعتمد لجميع الباحثين الذين يحتاجون إلى الوصول إلى عينات وبيانات البنك الحيوي. يجب أن تتضمن المعلومات المقدمة في الطلب منهجية الدراسة وتصميمها وأهدافها وغاياتها وميزانيتها. وينبغي إنشاء لجنة علمية تقنية تابعة للبنك الحيوي يكون لها دور رأسمالي يتمثل في تقييم طلبات المشاريع البحثية. وينبغي أن تضم هذه الهيئة أعضاء من وحدة البنك الحيوي، والأقسام السريرية، ومجموعات البحوث، وحماية البيانات، والمكتب القانوني، ومكتب نقل التكنولوجيا.
يعد البنك الحيوي لوحدة الطب الانتقالي والرقمي التابع للمعهد الأوروبي للأورام (IEO) مرجعا عالميا للبنوك الحيوية من حيث جودة وكمية الخدمات المقدمة ، فضلا عن الابتكار. يعد هذا المرفق المعتمد بالكامل (UNI EN ISO 9001: 2015-Certiquality) جزءا لا يتجزأ من العقدة الإيطالية BBMRI-ERIC (أي البنية التحتية لأبحاث البنوك الحيوية والموارد الجزيئية الحيوية) ويتفاعل مع كل من الوحدات السريرية والبنية التحتية للأبحاث.
هناك عدم تجانس كبير في أنواع العينات الحيوية المخزنة في البنوك الحيوية. وتشمل هذه عينات الأنسجة - إما الطازجة المجمدة أو البارافين المحفوظة - السوائل الحيوية (على سبيل المثال ، البلازما ، المصل ، الدم ، البول ، البراز) ، مزارع الخلايا ، وخلايا الدم أحادية النواة المحيطية (PBMCs). يعمل البنك الحيوي الخاص بنا بشكل تآزري مع البنية التحتية البحثية الأوروبية للبنوك الحيوية (BBMRI-ERIC) ، والتي تعد واحدة من أكبر شبكات البنوك الحيوية في أوروبا وتوفر بوابة للوصول إلى البنوك الحيوية والموارد الجزيئية الحيوية التي تنسقها العقد الوطنية15. بالإضافة إلى BBMRI-ERIC ، لعبت الجمعية الدولية للمستودعات البيولوجية والبيئية (ISBER) أيضا دورا مهما في توحيد إجراءات التشغيل للبنوك الحيوية16.
تلتزم وحدة البنك الحيوي ، وهي جزء من قسم علم الأمراض ، بمركزية المريض ، ودعم تطوير البحوث السريرية ، والتحسين المستمر ، وتعزيز الموارد البشرية ، والتعاون الدولي ، ودعم أحداث التدريب ، والسلامة في مكان العمل ، والنمو العلمي والتكنولوجي. تتمثل الرؤية المشتركة في إنشاء المعالم الوطنية والأوروبية للبنوك الحيوية من حيث جودة وكمية الخدمات والابتكار. تستخدم العينات البيولوجية التي تم جمعها لتحديد المؤشرات الحيوية الجديدة والأدوية الجديدة (على سبيل المثال ، لتطوير علاجات شخصية بشكل متزايد) ولضمان أفضل علاج متاح للمرضى من خلال التميز في البحث.
يتم جمع كل عينة بيولوجية والتعامل معها بعد التحقق المسبق من وجود اتفاقية المشاركة في البحث العلمي التي عبر عنها المريض15. تستخدم العينات البيولوجية التي تم جمعها لإجراء مشاريع بحثية أو تجارب سريرية وتشمل العينات الجراحية المرضية وغير المرضية الزائدة (أي غير اللازمة لأغراض التشخيص) ، والخزعات السائلة (مثل الدم والمصل والبلازما والبول) ، والعينات البيولوجية الأخرى. يتم تخزين هذه المواد الحيوية وفقا لبروتوكولات الحفظ بالتبريد المخصصة. تقدم هذه الورقة بروتوكولات البنك الحيوي لمركز كبير للسرطان.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Blue Max Con Tubes 15 mL</td>
			<td>Falcon B.D</td>
			<td>352096</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Blue Max Con Tubes 50 mL</td>
			<td>Euroclone Spa</td>
			<td>FLC352070</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Box with 81 position for tissue storage</td>
			<td>Ettore Pasquali Srl.</td>
			<td>06.0945.00</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>cf-DNA/cf-RNA Preservative Tubes</td>
			<td>Norgen Biotek</td>
			<td>63950</td>
			<td>Preservation and isolation of both cf-DNA and cf-RNA from a single tube and in particular preserve cf-DNA/ct-DNA for 30 days at ambient temperature and for up to 8 days at 37 &#176;C</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cryomold Standard (25 X 20 X 5 mm)</td>
			<td>Olympus Italia S.r.l.</td>
			<td>4557</td>
			<td>Disposable plastic Cryomold molds create a uniformly shaped, flat-surface specimen block when used with O.C.T</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dimethyl Sulfoxide Plastic Bottle - 1 L</td>
			<td>Vwr International S.R.L.</td>
			<td>MFCD00002089</td>
			<td>It acts to preserve the reconstitution of the medium for the storage of frozen cells</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dpbs 1x W/o Ca And Mg - 500 mL</td>
			<td>Microtech Srl</td>
			<td>TL1006-500ML</td>
			<td>Washing Buffer cell</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dualfilter T.I.P.S 1,000 &#181;L</td>
			<td>Euroclone Spa</td>
			<td>4809</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dualfilter T.I.P.S 200 &#181;L</td>
			<td>Euroclone Spa</td>
			<td>4823</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Easytrack Barcode Reader for single tube datamatrix&#160;</td>
			<td>Twin Helix Srl</td>
			<td>TH-ETR4400</td>
			<td>2D barcode tubes reader with USB connection</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fetal Bovine Serum Origin Brazileu S/fil</td>
			<td>Microtech S.R.L</td>
			<td>RM10532-500ML</td>
			<td>Defrost at +4 &#176;C, usually for two days, and once melted, start decomplementation at 56 &#176;C for 45 min 
			Let it cool down to room temperature, and aliquot it. Refroze them to -20 &#176;C, and remember to defrost them every time the aliquots are needed</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ficoll Paque Plus (ge) 6 x 500 mL</td>
			<td>Euroclone Spa</td>
			<td>GEH17144003</td>
			<td>Ficoll is a medium for density gradient, It is sterile and ready for use. It alloes to get peripheral blood mononuclear cells, bone marrow and umbilical cord blood</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fixing solution Killik of 100 mL (OCT)</td>
			<td>Bio-optica Milano S.p.a.</td>
			<td>05-9801</td>
			<td>Gel inclusion medium that solidifies at cold the water-soluble tissue (e.g., biopsies, frustules)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FLASH-FREEZE&#160;</td>
			<td>Milestone</td>
			<td>n.a.</td>
			<td>Freezing appliance</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Forma 8600 Series Chest Freezers (Temperature Range: -50 &#176;C to -86 &#176;C) 85 liters</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific Srl</td>
			<td>803CV</td>
			<td>Orizzontal freezer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Isopentane&#160; 500 mL</td>
			<td>Vwr International S.R.L.</td>
			<td>24872260</td>
			<td>Liquid included in theFLASH-FREEZE&#160; camera for freezing&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nautilus Lims Software</td>
			<td>Thermo Scientific&#8482;</td>
			<td>n.a.</td>
			<td>The software implementation&#160; is able to&#160; track all patients&#8217; biological samples. Receives Personal and Clinical information automatically during registration due to the integration with IEO operating systems. Nautilus is integrated with the web service through three IEO operative systems: BAC - IEO central registry with personal information, wHospital - medical record&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pasteur pipette 10 mL</td>
			<td>&#160;Euroclone Spa&#160;</td>
			<td>CC4488</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pasteur pipette 3 mL</td>
			<td>Euroclone Spa</td>
			<td>APT1502</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PATHOX</td>
			<td>Dedalus ItaliTesi Elettronica e Sistemi Informativi S.p.A.a S.p.A.</td>
			<td>n.a.</td>
			<td>&#160;PATHOX - management system for the Pathology unit where several factors are registered for the Biobank, such as the histological samples, the related diagnoses, and biomarkers</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Petri dishes, polystyrene - size 100 mm x 20 mm, slippable</td>
			<td>Euroclone Spa</td>
			<td>FLC353003</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Set of 4 adapters 19 x 5/7 mL vac</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific Srl</td>
			<td>75003680</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Set of 4 adapters 4 x 50 conical</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific Srl</td>
			<td>75003683</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Set of 4 adapters 9 x 15 mL conical</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific Srl</td>
			<td>75003682</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Single-use slide for counting cell</td>
			<td>Biosigma S.P.A.</td>
			<td>347143/001</td>
			<td>Specifically used for individual cell count</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Stamps Freezerbondz for tissue boxes, nitrogen-liquid proof , H 9,53 mm x L 25,40 mm</td>
			<td>Twin Helix Srl</td>
			<td>THT-152-492-3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermo Scientific&#160; TSX Series Ultra-Low Freezers (-50 &#176;C to -86 &#176;C) 949 liters</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific Srl</td>
			<td>TSX70086V</td>
			<td>Vertical freezer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermo Scientific Refrigerated Centrifuge SL16R</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific Srl</td>
			<td>75004030</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tissue box labels in Permanent</td>
			<td>Twin Helix Srl</td>
			<td>THT-199-482-3</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tuerks Solution</td>
			<td>Merck Life Science S.R.L.</td>
			<td>1092770100</td>
			<td>In light microscopy, it is specifically used as stain for leukocyte</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TX-400 Rotor TX-400 swinging bucket hol</td>
			<td>Thermo Fisher Scientific Srl</td>
			<td>75003181</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>White box for storage</td>
			<td>Bio Optica</td>
			<td>07-7300</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>wHospital Software</td>
			<td>wHealth Lutech Group</td>
			<td>n.a.</td>
			<td>wHospital - medical record management system with personal information, administrative cases, and the informed consent of the patients</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

biobank for translational medicine: standard operating procedures for optimal sample management

البنوك الحيوية هي البنى التحتية البحثية الرئيسية التي تهدف إلى جمع وتخزين ومعالجة وتبادل العينات البيولوجية البشرية عالية الجودة والبيانات المرتبطة بها للبحث والتشخيص والطب الشخصي. يعد البنك الحيوي لوحدة الطب الانتقالي والرقمي في المعهد الأوروبي للأورام (IEO) علامة فارقة في هذا المجال. تتعاون البنوك الحيوية مع الأقسام السريرية ومجموعات البحث الداخلية والخارجية والصناعة ، مما يدعم علاج المرضى والتقدم العلمي ، بما في ذلك التشخيص المبتكر واكتشاف العلامات الحيوية وتصميم التجارب السريرية. نظرا للدور المركزي للبنوك الحيوية في البحوث الحديثة، يجب أن تكون إجراءات التشغيل القياسية للبنوك الحيوية دقيقة للغاية. تضمن إجراءات التشغيل الموحدة والضوابط من قبل متخصصين معتمدين أعلى جودة للعينات لتنفيذ الاستراتيجيات الشخصية القائمة على العلم والتشخيصية والتنبؤية والعلاجية. ومع ذلك، وعلى الرغم من الجهود العديدة المبذولة لتوحيد وتنسيق البنوك الحيوية، فإن هذه البروتوكولات، التي تتبع مجموعة صارمة من القواعد وضوابط الجودة والمبادئ التوجيهية القائمة على المبادئ الأخلاقية والقانونية، لا يمكن الوصول إليها بسهولة. تقدم هذه الورقة إجراءات التشغيل القياسية للبنك الحيوي لمركز كبير للسرطان.

وباتباع الإجراءات التشغيلية الموحدة الموصوفة أعلاه، جمعنا ما مجموعه 38,446 خزعة سائلة بيولوجية مشروحة وما مجموعه 10,205 عينة من الأنسجة في الفترة من نيسان/أبريل 2012 إلى كانون الأول/ديسمبر 2021 (الشكل 6أ). بالإضافة إلى ذلك ، قمنا بتحليل العينات التي تم جمعها بالتفصيل من أقسام جراحة المسالك البولية وأمراض النساء وأمراض الثدي ، وكذلك أقسام الرأس والرقبة والبطن والحوض وجراحة الصدر. كان أكبر عدد من عينات الأنسجة التي جمعناها من أورام الثدي (الشكل 6 ب ، ج). منذ عام 2019 ، بدأنا أيضا في جمع عينات بيولوجية أخرى ، مثل مسحات البول والبراز والشدق ، بعد زيادة الطلب بشكل كبير على مر السنين (الشكل 6 د).
كما هو موضح في الشكل 6 أ ، عانت كمية العينات التي تم جمعها ، وخاصة الأنسجة ، خلال الفترة 2020-2021 بسبب جائحة COVID-19 والانخفاض المرتبط بها في إجراءات الأورام. والأهم من ذلك أن العمل العلمي لم يتضاءل خلال هذه الفترة بسبب استخدام عينات البنك الحيوي المخزنة والمشروحة بشكل صحيح والتي تم جمعها في السنوات السابقة. سمح لنا الجمع السليم للعينات البيولوجية والبيانات السريرية المرضية المرتبطة بها بالحصول على بنك حيوي بأثر رجعي وتنافسي جيد التنظيم. تحقيقا لهذه الغاية ، يجب أن يتم اختيار العينة الجراحية من قبل أخصائي علم الأمراض ، لضمان التشخيص الصحيح وإتاحة الفرصة لإجراء البحوث مع عينات الأنسجة المناسبة. في البنك الحيوي لدينا ، يتم وضع إجراءات عمل محددة واتباعها بحزم ، بحيث نطبق إجراءات موحدة تتوافق مع شهادة ISO 9001 في سياق البنوك الحيوية للبحث.
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63950/63950fig06.jpg"> الشكل 6: المجموعة التراكمية للبنوك الحيوية للعينات الحيوية في المعهد الأوروبي للأورام ، من 2012 إلى 2021. الجمع التراكمي لعينات الأنسجة (أ) (المنحنى البرتقالي) والدم مع عينات المصل (المنحنى الأزرق) ؛ الجمع التراكمي لعينات أنسجة الثدي (B) (منحنى أحمر) ؛ الجمع التراكمي لعينات أنسجة المبيض (C) (المنحنى الأخضر) والبروستاتا (المنحنى الرمادي) والرئة (المنحنى الأزرق الفاتح) وعينات أنسجة القولون (المنحنى الأصفر). من عام 2019 إلى عام 2021 ، جمع تراكمي ل (د) عينات بيولوجية إضافية: البراز (الخط الأزرق) ، مسحة الشدق (الخط الوردي) ، البلازما (الخط الأخضر الفاتح) ، والبول (الخط البنفسجي). <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63950/63950fig06large.jpg" target="_blank">الرجاء الضغط هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.</a>

Watch this Scientific Journal Video about Biobank for Translational Medicine: Standard Operating Procedures for Optimal Sample Management at JoVE.com

Biobank for Translational Medicine: Standard Operating Procedures for Optimal Sample Management

تعد البنوك الحيوية موارد حاسمة للبحوث الطبية الحيوية ، ويعد البنك الحيوي لوحدة الطب الانتقالي والرقمي في المعهد الأوروبي للأورام نموذجا في هذا المجال. نقدم هنا وصفا مفصلا لإجراءات التشغيل القياسية للبنوك الحيوية لإدارة أنواع مختلفة من العينات البيولوجية البشرية.

البنك الحيوي للطب الانتقالي: إجراءات التشغيل القياسية للإدارة المثلى للعينات

Biobanks are key research infrastructures aimed at the collection, storage, processing, and sharing of high-quality human biological samples and ...

تعد البنوك الحيوية موارد أساسية للبحوث الأساسية الانتقالية والسريرية، ولكنها تعمل أيضا كلاعبين رئيسيين يربطون بين البحث الأكاديمي وصناعة التكنولوجيا الحيوية الدوائية. يقدم هذا البروتوكول إجراءات التشغيل القياسية للبنك الحيوي في IAO ، وهو بنك حيوي معتمد بالكامل يعمل وفقا لأحدث المعايير للتكنولوجيا الحيوية والبنوك الحيوية والمتطلبات العامة للبنوك الحيوية. يعد توفر العينات الحيوية عالية الجودة من مرضى السرطان أمرا بالغ الأهمية لتطوير أدوات التشخيص من الجيل التالي ويقوم المعالجون بتكييفها مع المرضى الفرديين.يتطلب البنك الحيوي للمواد البيولوجية من مريض السرطان موظفين متخصصين والعديد من الشهادات. يجب تدريب الموظفين وتحديثهم باستمرار. لذلك يجب أن يكون هذا البروتوكول نقطة البداية لأولئك الذين يرغبون في إنشاء بنك حيوي.للبدء ، قم ببث فيديو كرتوني تعليمي في غرف الانتظار لإعلام المرضى بأهمية تأثير RPA. توفير إشارات مرجعية للأداة لجميع المرضى. استخدم برنامج LIMS لتتبع جميع العينات البيولوجية.تحديد المرضى باستخدام الرموز. قم بتعيين رمز فريد لكل فرد يطابق رقم السجل الطبي. تحقق مما إذا كان المريض مسجلا في تجربة سريرية أو مشروع بحث معتمد محدد من خلال إكمال حقل مشروع الدراسة بشكل صحيح في كل ملف تعريف للمريض.أبلغ الفنيين إذا كان خطر العدوى غير معروف. تجاهل العينات ذات النتائج الإيجابية أو المخاطر غير المعروفة. للحصول على عينات جديدة ، قم بتسجيل عينات الدم في برنامج البنك الحيوي.قم بتسمية vacutainers برمز معرف البنك الحيوي وتسليمها إلى المستخدمين المصرح لهم. بالنسبة للعينات المجمدة المخزنة في البنك الحيوي ، قم بإعداد أنبوبين مغلفين ب cryobank 2D يحتوي كل منهما على 900 ميكرولتر من الدم. تسجيل الحصص في برنامج البنك الحيوي.ضعها على لوحة باركود محددة وقم بتخزينها في درجة حرارة 80 درجة مئوية تحت الصفر لضمان درجة حرارة ثابتة. صب الدم من أنابيب جمع EDTA في الأنبوب المخروطي المعقم الفارغ سعة 50 ملليلتر وقم بتخفيفه باستخدام 1X PBS المعقم. استخدم PBS لشطف أنبوب الدم.أجهزة الطرد المركزي للأنابيب عند 400 RCF لمدة 30 دقيقة عند 20 درجة مئوية ومعالجة الأنابيب تحت غطاء بيولوجي. استرجع الطبقة البيضاء الوسطى التي تحتوي على PBMCs باستخدام ماصة باستور وضعها في أنبوب مخروطي معقم جديد سعة 50 ملليلتر. أضف ما يصل إلى 45 ملليلتر من PBS لغسل PBMCs.امزج وجهاز طرد مركزي عند 400 RCF لمدة 10 دقائق عند أربع درجات مئوية. استعادة بيليه وإعادة تعليقها في برنامج تلفزيوني. ثم عد الخلايا باستخدام غرف Burker التي يمكن التخلص منها.كرر غسل PBS ل PBMCs كما هو موضح في مخطوطة النص. تمييع PBMCs في وسط التجميد وإعداد أنابيب cryobank 2D المغلفة عن طريق نقل ملليلتر واحد من الخلايا المعاد تعليقها إلى كل أنبوب تبريد. ضع العينات في صندوق تبريد محدد وقم بتخزينها في درجة حرارة 80 درجة مئوية تحت الصفر في أسرع وقت ممكن.جهاز طرد مركزي يحتوي على عينات الدم الكاملة عند 2،000 غرام لمدة 10 دقائق عند أربع درجات مئوية. قم بإزالة الطبقة العليا من البلازما باستخدام ماصة باستور سعة ثلاثة ملليلتر وانقلها إلى أنبوب مخروطي معقم سعة 15 ملليلتر. ثم أجهزة الطرد المركزي في 16،000 RCF لمدة 10 دقائق عند أربع درجات مئوية للقضاء على خلايا الدم الملوثة.نقل البلازما إلى واحد ملليلتر cryobank 2D المغلفة الأنابيب. تسجيل الحصص في برنامج البنك الحيوي. ضعها على لوحة باركود محددة وقم بتخزينها في 80 درجة تحت الصفر لضمان درجة حرارة ثابتة.قم بفحص عينات الأنسجة من قبل أخصائي علم الأمراض لتحديد ما إذا كانت المادة غير الضرورية لإجراءات التشخيص كافية لأغراض البحث. كلما كان ذلك ممكنا ، وجمع حتى النظير غير المرضي للأنسجة المرضية. ضع العينات في أطباق بتري المعقمة التي تحمل علامة P و NP. احتفظ بالأنسجة على الجليد عند أربع درجات مئوية وقسمها إلى ثلاثة أجزاء لكل منها.A و B و C إذا توفرت مواد كافية. بالنسبة لعينات الأنسجة الطازجة المصنفة على أنها A ، ضع الحصص الطازجة لأنسجة P و NP في أنابيب مع وسيط الاستزراع المناسب المحدد في كل بروتوكول محدد وأرسلها إلى وحدات البحث الخارجية. بالنسبة لعينات أنسجة OCT المصنفة على أنها B ، املأها براتنج OCT وضعها على الفور في جهاز تجميد فلاش عند 80 درجة مئوية تحت الصفر.بالنسبة لعينات الأنسجة المصنفة على أنها C ، ضع عينات الأنسجة المتبقية في أنابيب مغلفة ب cryobank 2D في جهاز التجميد السريع. تخزين لوحات في ناقص 80 درجة مئوية. تم جمع ما مجموعه 38،446 خزعة سائلة بيولوجية مشروحة و 10،205 عينة من الأنسجة من أبريل 2012 إلى ديسمبر 2021.انخفض عدد العينات التي تم جمعها ، وخاصة الأنسجة من 2020 إلى 2021 ، بسبب جائحة COVID-19 والانخفاض المرتبط بها في إجراءات الأورام. تم تحليل العينات التي تم جمعها من أقسام المسالك البولية وأمراض النساء والموجات فوق الصوتية وأقسام جراحة الرأس والرقبة والبطن والحوض والصدر بالتفصيل. تم جمع أكبر عدد من عينات الأنسجة من أورام الثدي.زادت مجموعة العينات البيولوجية الأخرى ، مثل البول والبراز ومسحات الشدق ، بشكل كبير بعد الطلب على مر السنين. يوفر هذا الخيار منصة أساسية لتخزين العينات البيولوجية وتحسين قابلية استنساخ برامج أبحاث السرطان. يمكن استخدام هذه العينات لتطبيقات بحثية مختلفة مثل تسلسل الجيل التالي أو قياس الطيف الكتلي.منصتنا قادرة على تنفيذ خوارزميات ذكاء اصطناعي جديدة في الأبحاث الانتقالية مع إمكانية تغيير طريقة علاج مرضى السرطان.

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Operating Procedures of the Electrochemotherapy for Treatment of Tumor in Dogs and Cats

إجراءات عمل لElectrochemotherapy للعلاج من ورم في الكلاب والقطط

Electrochemotherapy (ECT) is a local approach which is used for treating solid tumors of different histologies. Its mechanism is based on cell membrane ...

Surgical Procedures and Methodology for a Preclinical Murine Model of De Novo Mammary Cancer Metastasis

Surgical Procedures and Methodology for a Preclinical Murine Model of De Novo Mammary Cancer Metastasis

الإجراءات الجراحية ومنهجية لنموذج الفئران قبل السريرية<em&gt; دي نوفو</em&gt; سرطان الثديي الانبثاث

A rate-limiting aspect of transgenic mouse models of mammary adenocarcinoma is that primary tumor burden in mammary tissue typically defines study ...

Determining the Optimal Inhibitory Frequency for Cancerous Cells Using Tumor Treating Fields (TTFields)

Determining the Optimal Inhibitory Frequency for Cancerous Cells Using Tumor Treating Fields TTFields

تحديد التردد المثبط الأمثل للخلايا السرطانية باستخدام حقول علاج الورم (تفيلدس)

Tumor Treating Fields (TTFields) are an effective treatment modality delivered via the continuous, noninvasive application of low-intensity (1-3 V/cm), ...

Using 22C3 Anti-PD-L1 Antibody Concentrate on Biopsy and Cytology Samples from Non-small Cell Lung Cancer Patients

3 22 باستخدام الأجسام المضادة-PD-L1 تركز على خزعة وعينات عنق من مرضى سرطان الرئة من الخلايا غير الصغيرة

Pembrolizumab monotherapy has been approved for the first- and second-line treatment of patients with PD-L1-expressing advanced non-small cell lung cancer ...

Patient-derived Orthotopic Xenograft Models for Human Urothelial Cell Carcinoma and Colorectal Cancer Tumor Growth and Spontaneous Metastasis

نماذج Xenograft المتوارثية المستمدة من المريض لسرطان الخلايا البولية البشرية ونمو ورم سرطان القولون والمستقيم وورم الانبثاث العفوي

Cancer patients have poor prognoses when lymph node (LN) involvement is present in both high-grade urothelial cell carcinoma (HG-UCC) of the bladder and ...

Management of Respiratory Motion Artefacts in 18F-fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography using an Amplitude-Based Optimal Respiratory Gating Algorithm

Management of Respiratory Motion Artefacts in 18F-fluorodeoxyglucose Positron Emission Tomography using an Amplitude-Based Optimal Respiratory Gating Algorithm

إدارة التحف الحركة التنفسية في 18F-fluorodeoxyglucose Positron الانبعاثات التصوير المقطعي باستخدام خوارزمية الغاءات التنفسية الأمثل القائم على السعة

Positron emission tomography (PET) combined with X-ray computed tomography (CT) is an important molecular imaging platform that is required for accurate ...

Creation and Maintenance of a Living Biobank - How We Do It

إنشاء وصيانة بيوبنك الحية -- كيف نفعل ذلك

In light of the growing knowledge about the inter-individual properties and heterogeneity of cancers, the emerging field of personalized medicine requires ...

Circulating Tumor Cell Lines: an Innovative Tool for Fundamental and Translational Research

تعميم خطوط الخلايا السرطانية: أداة مبتكرة للبحوث الأساسية والترجمة

Metastasis is a leading cause of cancer death. Despite improvements in treatment strategies, metastatic cancer has a poor prognosis. We thus face an ...

Preparation of Human Tissues Embedded in Optimal Cutting Temperature Compound for Mass Spectrometry Analysis

تحضير الأنسجة البشرية المضمنة في مركب درجة حرارة القطع الأمثل لتحليل مطياف الكتلة

Sphingolipids are cellular components that have well-established roles in human metabolism and disease. Mass spectrometry can be used to determine whether ...

In Vivo Immunogenicity Screening of Tumor-Derived Extracellular Vesicles by Flow Cytometry of Splenic T Cells

In Vivo Immunogenicity Screening of Tumor-Derived Extracellular Vesicles by Flow Cytometry of Splenic T Cells

في فيفو فحص المناعة للحويصلات خارج الخلية المشتقة من الورم عن طريق قياس التدفق الخلوي للخلايا التائية الطحالية

Immunogenic cell death of tumors, caused by chemotherapy or irradiation, can trigger tumor-specific T cell responses by releasing danger-associated ...