Name: assay for adhesion and agar invasion in s. cerevisiae
Uploaded: 2006-11-08T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae at JoVE.com

نود أن نشكر ليزا Schneper Duevel وكاترين لرؤاهم في تطوير هذا الاختبار.

<ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> وضع 200ul الثقافات تزايد اهتمام وسائل الاعلام على لوحات الاصطناعية مع الشروط المطلوبة التجويع (SC الجلوكوز مع 2 ٪ مقابل SC مع السكر بنسبة 0.2 ٪ ، على سبيل المثال) إذا كانت كثافة ثقافات مختلفة جدا عن بعضها البعض ، وضبط عدد الخلايا في الثقافة 200ul لذلك كل قطرة وتقري...

<ol>
	<li>Costerton, J. W., Lewandowski, Z., Caldwell, D. E., Korber, D. R., Lappin-Scott, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+biofilms.">Microbial biofilms.</a> Annu Rev Microbiol. 49, 711-745 (1995).</li><li>Elortondo, F. J. P., Salmeron, J., Albisu, M., Casas, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms+in+the+food+industry.">Biofilms in the food industry.</a> Food Science and Technology International. 5, 25-30 (1999).</li><li>Keinanen, M. M., Martikainen, P. J., Kontro, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+community+structure+and+biomass+in+developing+drinking+water+biofilms.">Microbial community structure and biomass in developing drinking water biofilms.</a> Can J Microbiol. 50, 183-191 (2004).</li><li>Biffinger, J. C., Pietron, J., Ray, R., Little, B., Ringeisen, B. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+biofilm+enhanced+miniature+microbial+fuel+cell+using+Shewanella+oneidensis+DSP10+and+oxygen+reduction+cathodes.">A biofilm enhanced miniature microbial fuel cell using Shewanella oneidensis DSP10 and oxygen reduction cathodes.</a> Biosens Bioelectron. 22, 1672-1679 (2007).</li><li>Kim, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bacterial+community+structure,+compartmentalization+and+activity+in+a+microbial+fuel+cell.">Bacterial community structure, compartmentalization and activity in a microbial fuel cell.</a> J Appl Microbiol. 101, 698-710 (2006).</li><li>Kim, J. R., Jung, S. H., Regan, J. M., Logan, B. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electricity+generation+and+microbial+community+analysis+of+alcohol+powered+microbial+fuel+cells.">Electricity generation and microbial community analysis of alcohol powered microbial fuel cells.</a> Bioresour Technol. 98, 2568-2577 (2007).</li><li>Picioreanu, C., Head, I. M., Katuri, K. P., Loosdrecht, M. C. v. a. n., Scott, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+computational+model+for+biofilm-based+microbial+fuel+cells.">A computational model for biofilm-based microbial fuel cells.</a> Water Res. 41, 2921-2940 (2007).</li><li>Singh, R., Paul, D., Jain, R. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms:+implications+in+bioremediation.">Biofilms: implications in bioremediation.</a> Trends in Microbiology. 14, 389-397 (2006).</li><li>Cullen, P. J., Sprague, G. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glucose+depletion+causes+haploid+invasive+growth+in+yeast.">Glucose depletion causes haploid invasive growth in yeast.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 97, 13619-13224 (2000).</li><li>Gimeno, C. J., Ljungdahl, P. O., Styles, C. A., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unipolar+cell+divisions+in+the+yeast+S.+cerevisiae+lead+to+filamentous+growth:+regulation+by+starvation+and+RAS.">Unipolar cell divisions in the yeast S. cerevisiae lead to filamentous growth: regulation by starvation and RAS.</a> Cell. 68, 1077-1090 (1992).</li><li>Blankenship, J. R., Mitchell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+to+build+a+biofilm:+a+fungal+perspective.">How to build a biofilm: a fungal perspective.</a> Curr Opin Microbiol. 9, 588-594 (2006).</li><li>Reynolds, T. B., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bakers'+yeast,+a+model+for+fungal+biofilm+formation.">Bakers' yeast, a model for fungal biofilm formation.</a> Science. 291, 878-881 (2001).</li><li>Verstrepen, K. J., Klis, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flocculation,+adhesion+and+biofilm+formation+in+yeasts.">Flocculation, adhesion and biofilm formation in yeasts.</a> Mol Microbiol. 60, 5-15 (2006).</li><li>Liu, H., Styles, C. A., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elements+of+the+yeast+pheromone+response+pathway+required+for+filamentous+growth+of+diploids.">Elements of the yeast pheromone response pathway required for filamentous growth of diploids.</a> Science. 262, 1741-1744 (1993).</li><li>Madhani, H. D., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+control+of+filamentous+differentiation+and+virulence+in+fungi.">The control of filamentous differentiation and virulence in fungi.</a> Trends Cell Biol. 8, 348-353 (1998).</li><li>Mosch, H. U., Kubler, E., Krappmann, S., Fink, G. R., Braus, G. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crosstalk+between+the+Ras2p-controlled+mitogen-activated+protein+kinase+and+cAMP+pathways+during+invasive+growth+of+Saccharomyces+cerevisiae.">Crosstalk between the Ras2p-controlled mitogen-activated protein kinase and cAMP pathways during invasive growth of Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Biol Cell. 10, 1325-1335 (1999).</li><li>Mosch, H. U., Roberts, R. L., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ras2+signals+via+the+Cdc42/Ste20/mitogen-activated+protein+kinase+module+to+induce+filamentous+growth+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Ras2 signals via the Cdc42/Ste20/mitogen-activated protein kinase module to induce filamentous growth in Saccharomyces cerevisiae.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 93, 5352-5356 (1996).</li><li>Pan, X., Heitman, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cyclic+AMP-dependent+protein+kinase+regulates+pseudohyphal+differentiation+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Cyclic AMP-dependent protein kinase regulates pseudohyphal differentiation in Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Cell Biol. 19, 4874-4887 (1999).</li><li>Roberts, R. L., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elements+of+a+single+MAP+kinase+cascade+in+Saccharomyces+cerevisiae+mediate+two+developmental+programs+in+the+same+cell+type:+mating+and+invasive+growth.">Elements of a single MAP kinase cascade in Saccharomyces cerevisiae mediate two developmental programs in the same cell type: mating and invasive growth.</a> Genes Dev. 8, 2974-2985 (1994).</li><li>Robertson, L. S., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+three+yeast+A+kinases+have+specific+signaling+functions+in+pseudohyphal+growth.">The three yeast A kinases have specific signaling functions in pseudohyphal growth.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 95, 13783-13787 (1998).</li><li>Reynolds, T. B., Jansen, A., Peng, X., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mat+formation+in+Saccharomyces+cerevisiae+requires+nutrient+and+pH+gradients.">Mat formation in Saccharomyces cerevisiae requires nutrient and pH gradients.</a> Eukaryot Cell. , (2007).</li></ol>

خلايا الخميرة وسائط عرض مختلفة المفاضلة وفقا لتوافر المواد الغذائية والظروف البيئية ، بما في ذلك تشكيل بوغ في ظل ظروف المجاعة والإجهاد ، وتحت الضغوط filamentation المغذيات المختلفة ، وتلبد. ويمكن أيضا الخمائر المختلفة ، بما في ذلك وخميرة S. albicans C. ، يمكن العثور عليها في الأغشية الحيوي?...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Moticam 350</td>
<td>Camera</td>
<td>Motic</td>
<td>discontinued (new model: Moticam 352)</td>
<td>A relatively cheap camera that attaches to eye pieces of microscopes and captures digital images for PC or Mac.</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>

assay for adhesion and agar invasion in s. cerevisiae

تم العثور على الخمائر في الأغشية الحيوية الطبيعية ، حيث العديد من الكائنات الحية الدقيقة استعمار السطوح. في البيئات الاصطناعية ، مثل أسطح الأشياء التي يصنعها الإنسان ، ويمكن الحد من الأغشية الحيوية الإنتاجية الصناعية ، وتدمير الهياكل ، وتهدد حياة الإنسان. 1-3 ومن ناحية أخرى ، يمكن تسخير قوة الأغشية الحيوية مساعدتها في تنظيف البيئة وتوليد الطاقة المستدامة. تم تجاهل معظمها 4-8 قدرة الجعوية S. لاستعمار سطوح والمشاركة في الأغشية الحيوية المعقدة إلى إعادة اكتشاف البرامج الناجمة عن تمايز مختلف مسارات إشارات ومنبهات البيئية في هذا الحي. 9 و 10 على الاهتمام المستمر في استخدام S. الجعوية باعتباره النموذج الحي لفهم التفاعل والتقارب بين مسارات الإشارات ، مثل رأس PKA ، MAPK Kss1 ، ومسارات الأسمولية Hog1 ، وضعت بسرعة S. الجعوية في تقاطع بيوفيلم البيولوجيا والبحوث إشارة تنبيغ. 11-20 ولتحقيق هذه الغاية ، وأصبح التمييز بين خلايا الخميرة إلى الطويل ، خيوط لاصقة الكاذبة قراءات مناسبة لتفعيل مسارات نقل الإشارة إلى التغيرات البيئية المختلفة. ومع ذلك ، filamentation هي عبارة عن مجموعة من الظواهر المعقدة ، الأمر الذي يجعل يعاير لأنها كما لو كانت بسيطة النمط الظاهري مضلل. في العقد الماضي ، تم اعتماد المقايسات بنجاح العديد من الدراسات للبحث عن البكتيريا بيوفيلم الخميرة ، مثل تشكيل MAT المقايسات لقياس انتشار مستعمرة أغار على الناعمة والكريستال البنفسجي تلطيخ لقياس الكمي سطح الخلية الانضمام. 12 ، 21 ومع ذلك ، كان هناك بعض الارتباك في المقايسات وضعت لتقييم الظواهر نوعيا لاصقة والغازية من الخميرة في أجار. هنا ، نقدم طريقة بسيطة وموثوق بها لتقييم جودة لاصقة والغازية من سلالات الخميرة مع سهلة لفهم خطوات لعزل تقييم التصاق من الاقتطاعات الإلزامية من الغزو. لدينا وسيلة ، من خلال الدراسات السابقة التي اعتمدت ، 10 ، 16 ينطوي على الخلايا المتزايد في وسائل الإعلام والطلاء السائل على المغذيات الشروط التفضيلية للنمو بقع كبيرة ، ونحن ثم يغسل بالماء لتقييم التصاق الخلايا تماما وفرك قبالة سطح آغار لتقييم الغزو في وآغار. نقضي على ضرورة streaking الخلايا على أجار ، مما يؤثر على غزو الخلايا في أجار. بصفة عامة ، لاحظنا أن السلالات التي تغزو فرداني آغار دائما لاصقة ، ولكن ليس كل سلالات لاصقة يمكن غزو المتوسطة أجار. ويمكن استخدام النهج الذي نتبعه في بالاشتراك مع فحوصات أخرى لتشريح دقيق للخطوات التمايز ومتطلبات نقل الإشارة الخميرة ، والتمايز ، والاستشعار عن النصاب القانوني ، وتشكيل بيوفيلم.

Watch this Scientific Journal Video about Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae at JoVE.com

Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae

نحن تصف مقايسة النوعية لالتصاق الخميرة وغزو آغار كمقياس للتمايز الغازية والكاذبة. ويمكن استخدام هذا الاختبار البسيط لتقييم النمط الظاهري الغازية من المسوخ المختلفة فضلا عن الآثار البيئية والعظة مما يشير مسارات على التفرقة الخميرة.

مقايسة للالتصاق وغزو آجار في البيرة س.

Yeasts are found in natural biofilms, where many microorganisms colonize surfaces. In artificial environments, such as surfaces of man-made objects, ...

Research

JoVE Journal

Biology

A high-throughput method to globally study the organelle morphology in S. cerevisiae

أسلوب الإنتاجية العالية عالميا لدراسة مورفولوجية عضية في البيرة س.

High-throughput methods to examine protein localization or organelle morphology is an effective tool for studying protein interactions and can help ...

Identification of protein complexes with quantitative proteomics in S. cerevisiae

تحديد بروتين المجمعات مع كمية البروتينات في البيرة س.

Lipids are the building blocks of cellular membranes that function as barriers and in compartmentalization of cellular processes, and recently, as ...

An In vitro FluoroBlok Tumor Invasion Assay

An In vitro FluoroBlok Tumor Invasion Assay

و في المختبر غزو الورم FluoroBlok الفحص

The hallmark of metastatic cells is their ability to invade through the basement membrane and migrate to other parts of the body. Cells must be able to ...

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

آغار بلوك عوالم مصغرة لتحليل الأنسجة النباتية الخاضعة للرقابة من قبل الفطريات الهوائية

The two principal methods for studying fungal biodegradation of lignocellulosic plant tissues were developed for wood preservative testing (soil-block; ...

A Fluorescence Microscopy Assay for Monitoring Mitophagy in the Yeast Saccharomyces cerevisiae

A Fluorescence Microscopy Assay for Monitoring Mitophagy in the Yeast Saccharomyces cerevisiae

والفحص المجهري لالإسفار Mitophagy الرصد في الخميرة السكيراء الجعوية

Autophagy is important for turnover of cellular components under a range of different conditions. It serves an essential homeostatic function as well as a ...

Studying Age-dependent Genomic Instability using the S. cerevisiae Chronological Lifespan Model

Studying Age-dependent Genomic Instability using the S. cerevisiae Chronological Lifespan Model

دراسة السن التي تعتمد على عدم الاستقرار الجيني باستخدام س. خميرة يفسبن الزمني النموذجي

Studies using the Saccharomyces cerevisiae aging model have uncovered life span regulatory pathways that are partially conserved in higher eukaryotes1-2. ...

Isolation of Primary Mouse Trophoblast Cells and Trophoblast Invasion Assay

عزل خلايا الأرومة الغاذية الابتدائية ماوس والأرومة الغاذية الفحص الغزو

The placenta is responsible for the transport of nutrients, gasses and growth factors to the fetus, as well as the elimination of wastes.  
Thus, defects ...

Flow Cytometry-based Purification of S. cerevisiae Zygotes

Flow Cytometry-based Purification of S. cerevisiae Zygotes

تدفق الخلوي على أساس تنقية<em&gt; S. خميرة</em&gt; بيضات ملقحة

Zygotes are essential intermediates between haploid and diploid states in the life cycle of many organisms, including yeast (Figure 1) 1. S. cerevisiae ...

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

التصور والتحليل من جزيئات الرنا المرسال عن طريق الإسفار<em&gt; في الموضع</em&gt; التهجين في<em&gt; خميرة الخباز</em

The Fluorescence in situ Hybridization (FISH) method allows one to detect nucleic acids in the native cellular environment. Here we provide a protocol for ...

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

فحوصات بالإضافة لرصد طوي ثانية بروتين في<em&gt; خميرة الخباز</em

Proteostasis, defined as the combined processes of protein folding/biogenesis, refolding/repair, and degradation, is a delicate cellular balance that must ...