Name: assay for adhesion and agar invasion in s. cerevisiae
Uploaded: 2006-11-08T00:00:00
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Nous tenons à remercier Lisa Schneper et Katrin Duevel pour leurs idées dans le développement de ce dosage.

<ol><li> Mettez 200ul de cultures de plus en plus d&#39;intérêt sur les plaques supports synthétiques avec les conditions de famine requis (SC avec 2% de glucose par rapport SC avec 0,2% de glucose, par exemple) Si la densité des cultures sont trop différentes les unes des autres, d&#39;ajuster le nombre de cellules par culture 200ul de sorte que chaque goutte a à peu près la même quantité de cellules. </li><li> Assurez-vous de tenir des registres de qui tombent sur les plaques est où la culture. </li><li> Gardez le couvercle de la pl...

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	<li>Costerton, J. W., Lewandowski, Z., Caldwell, D. E., Korber, D. R., Lappin-Scott, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+biofilms.">Microbial biofilms.</a> Annu Rev Microbiol. 49, 711-745 (1995).</li><li>Elortondo, F. J. P., Salmeron, J., Albisu, M., Casas, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms+in+the+food+industry.">Biofilms in the food industry.</a> Food Science and Technology International. 5, 25-30 (1999).</li><li>Keinanen, M. M., Martikainen, P. J., Kontro, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+community+structure+and+biomass+in+developing+drinking+water+biofilms.">Microbial community structure and biomass in developing drinking water biofilms.</a> Can J Microbiol. 50, 183-191 (2004).</li><li>Biffinger, J. C., Pietron, J., Ray, R., Little, B., Ringeisen, B. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+biofilm+enhanced+miniature+microbial+fuel+cell+using+Shewanella+oneidensis+DSP10+and+oxygen+reduction+cathodes.">A biofilm enhanced miniature microbial fuel cell using Shewanella oneidensis DSP10 and oxygen reduction cathodes.</a> Biosens Bioelectron. 22, 1672-1679 (2007).</li><li>Kim, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bacterial+community+structure,+compartmentalization+and+activity+in+a+microbial+fuel+cell.">Bacterial community structure, compartmentalization and activity in a microbial fuel cell.</a> J Appl Microbiol. 101, 698-710 (2006).</li><li>Kim, J. R., Jung, S. H., Regan, J. M., Logan, B. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electricity+generation+and+microbial+community+analysis+of+alcohol+powered+microbial+fuel+cells.">Electricity generation and microbial community analysis of alcohol powered microbial fuel cells.</a> Bioresour Technol. 98, 2568-2577 (2007).</li><li>Picioreanu, C., Head, I. M., Katuri, K. P., Loosdrecht, M. C. v. a. n., Scott, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+computational+model+for+biofilm-based+microbial+fuel+cells.">A computational model for biofilm-based microbial fuel cells.</a> Water Res. 41, 2921-2940 (2007).</li><li>Singh, R., Paul, D., Jain, R. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms:+implications+in+bioremediation.">Biofilms: implications in bioremediation.</a> Trends in Microbiology. 14, 389-397 (2006).</li><li>Cullen, P. J., Sprague, G. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glucose+depletion+causes+haploid+invasive+growth+in+yeast.">Glucose depletion causes haploid invasive growth in yeast.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 97, 13619-13224 (2000).</li><li>Gimeno, C. J., Ljungdahl, P. O., Styles, C. A., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unipolar+cell+divisions+in+the+yeast+S.+cerevisiae+lead+to+filamentous+growth:+regulation+by+starvation+and+RAS.">Unipolar cell divisions in the yeast S. cerevisiae lead to filamentous growth: regulation by starvation and RAS.</a> Cell. 68, 1077-1090 (1992).</li><li>Blankenship, J. R., Mitchell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+to+build+a+biofilm:+a+fungal+perspective.">How to build a biofilm: a fungal perspective.</a> Curr Opin Microbiol. 9, 588-594 (2006).</li><li>Reynolds, T. B., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bakers'+yeast,+a+model+for+fungal+biofilm+formation.">Bakers' yeast, a model for fungal biofilm formation.</a> Science. 291, 878-881 (2001).</li><li>Verstrepen, K. J., Klis, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flocculation,+adhesion+and+biofilm+formation+in+yeasts.">Flocculation, adhesion and biofilm formation in yeasts.</a> Mol Microbiol. 60, 5-15 (2006).</li><li>Liu, H., Styles, C. A., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elements+of+the+yeast+pheromone+response+pathway+required+for+filamentous+growth+of+diploids.">Elements of the yeast pheromone response pathway required for filamentous growth of diploids.</a> Science. 262, 1741-1744 (1993).</li><li>Madhani, H. D., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+control+of+filamentous+differentiation+and+virulence+in+fungi.">The control of filamentous differentiation and virulence in fungi.</a> Trends Cell Biol. 8, 348-353 (1998).</li><li>Mosch, H. U., Kubler, E., Krappmann, S., Fink, G. R., Braus, G. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crosstalk+between+the+Ras2p-controlled+mitogen-activated+protein+kinase+and+cAMP+pathways+during+invasive+growth+of+Saccharomyces+cerevisiae.">Crosstalk between the Ras2p-controlled mitogen-activated protein kinase and cAMP pathways during invasive growth of Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Biol Cell. 10, 1325-1335 (1999).</li><li>Mosch, H. U., Roberts, R. L., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ras2+signals+via+the+Cdc42/Ste20/mitogen-activated+protein+kinase+module+to+induce+filamentous+growth+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Ras2 signals via the Cdc42/Ste20/mitogen-activated protein kinase module to induce filamentous growth in Saccharomyces cerevisiae.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 93, 5352-5356 (1996).</li><li>Pan, X., Heitman, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cyclic+AMP-dependent+protein+kinase+regulates+pseudohyphal+differentiation+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Cyclic AMP-dependent protein kinase regulates pseudohyphal differentiation in Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Cell Biol. 19, 4874-4887 (1999).</li><li>Roberts, R. L., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elements+of+a+single+MAP+kinase+cascade+in+Saccharomyces+cerevisiae+mediate+two+developmental+programs+in+the+same+cell+type:+mating+and+invasive+growth.">Elements of a single MAP kinase cascade in Saccharomyces cerevisiae mediate two developmental programs in the same cell type: mating and invasive growth.</a> Genes Dev. 8, 2974-2985 (1994).</li><li>Robertson, L. S., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+three+yeast+A+kinases+have+specific+signaling+functions+in+pseudohyphal+growth.">The three yeast A kinases have specific signaling functions in pseudohyphal growth.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 95, 13783-13787 (1998).</li><li>Reynolds, T. B., Jansen, A., Peng, X., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mat+formation+in+Saccharomyces+cerevisiae+requires+nutrient+and+pH+gradients.">Mat formation in Saccharomyces cerevisiae requires nutrient and pH gradients.</a> Eukaryot Cell. , (2007).</li></ol>

Les cellules de levure modes d&#39;affichage différents de différenciation en fonction de la disponibilité des nutriments et des conditions environnementales, y compris la formation de spores dans des conditions de famine et le stress, la filamentation sous diverses contraintes en éléments nutritifs, et de floculation. Levures différentes, y compris S. cerevisiae et C. albicans, peuvent également être trouvés dans les biofilms formés par un ensemble diversifié de micro-organismes. Bien qu&#39;il y ait une certaine corrélation av...

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<td>Moticam 350</td>
<td>Camera</td>
<td>Motic</td>
<td>discontinued (new model: Moticam 352)</td>
<td>A relatively cheap camera that attaches to eye pieces of microscopes and captures digital images for PC or Mac.</td>
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assay for adhesion and agar invasion in s. cerevisiae

Les levures sont trouvés dans des biofilms naturels, où de nombreux microorganismes colonisent les surfaces. Dans les milieux artificiels, tels que les surfaces des objets artificiels, les biofilms peuvent réduire la productivité industrielle, détruire les structures, et menacent la vie humaine. 1-3 sur l&#39;autre côté, en exploitant la puissance des biofilms peuvent aider à nettoyer l&#39;environnement et générer de l&#39;énergie durable. 4-8 La capacité de S. cerevisiae à coloniser les surfaces et de participer à des biofilms complexes a été largement ignorée jusqu&#39;à ce que la redécouverte de la différenciation des programmes déclenchés par diverses voies de signalisation et les signaux environnementaux dans cet organisme. 9, 10 L&#39;intérêt continue en utilisant S. cerevisiae comme organisme modèle pour comprendre l&#39;interaction et de convergence des voies de signalisation, tels que le Ras-PKA, Kss1 MAPK et Hog1 voies osmolarité, rapidement placé S. cerevisiae dans la jonction du biofilm biologie et la recherche de transduction du signal. 11-20 à cette fin, la différenciation des cellules de levure en longues adhésif, filaments pseudohyphal est devenu une lecture commode pour l&#39;activation des voies de transduction du signal lors de différents changements de l&#39;environnement. Toutefois, la filamentation est un ensemble complexe de phénotypes, ce qui rend dosant pour elle comme si elle était un phénotype simples trompeuse. Dans la dernière décennie, plusieurs tests ont été adoptées avec succès des études de biofilm bactérien à la recherche de levures, telles que la formation des dosages MAT pour mesurer la propagation des colonies sur agar mou et coloration au cristal violet à mesurer quantitativement l&#39;adhérence à la surface cellulaire. 12, 21 Cependant, il ya eu une certaine confusion dans les analyses développées pour évaluer qualitativement les phénotypes adhésif et envahissante de la levure dans l&#39;agar. Ici, nous présentons une méthode simple et fiable pour évaluer la qualité adhésive et envahissantes de souches de levure faciles à comprendre des mesures pour isoler l&#39;évaluation de l&#39;adhérence de l&#39;évaluation d&#39;invasion. Notre méthode, adoptée par les études précédentes, 10, 16 implique des cellules en croissance dans des milieux liquides et le placage sur le traitement différencié des conditions de nutriments pour la croissance des grandes taches, que nous avons ensuite laver à l&#39;eau pour évaluer l&#39;adhérence des cellules et frottez complètement hors de la surface de la gélose pour évaluer l&#39;invasion dans l&#39;agar-agar. Nous éliminons le besoin de stries sur gélose cellules, ce qui affecte l&#39;invasion des cellules dans la gélose. En général, nous avons observé que les souches haploïdes qui envahissent agar sont toujours adhésif, mais pas toutes les souches adhésive peut envahir gélose. Notre approche peut être utilisée en conjonction avec d&#39;autres dosages soigneusement disséquer les étapes de différenciation et les exigences de la transduction du signal de la levure, la différenciation, le quorum sensing et la formation de biofilm.

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Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae

Nous décrivons un test qualitatif pour l&#39;adhésion de la levure et l&#39;invasion d&#39;agar comme une mesure de la différenciation invasive et pseudohyphal. Ce test simple peut être utilisé pour évaluer le phénotype invasif de divers mutants ainsi que les indices des effets environnementaux et les voies de signalisation sur la différenciation des levures.

Dosage de l&#39;adhésion et l&#39;invasion Agar chez S. cerevisiae

Yeasts are found in natural biofilms, where many microorganisms colonize surfaces. In artificial environments, such as surfaces of man-made objects, ...

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