Name: assay for adhesion and agar invasion in s. cerevisiae
Uploaded: 2006-11-08T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae at JoVE.com

ברצוננו להודות ליסה Schneper ואת קתרין Duevel עבור התובנות שלהם בפיתוח זה assay.

<ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> שים 200ul של תרבויות הולכת וגדלה של הריבית על צלחות התקשורת סינתטי עם התנאים הנדרשים רעב (SC עם גלוקוז 2% לעומת SC עם 0.2% גלוקוז, למשל) אם את הצפיפות של תרבויות שונות מדי אחד מהשני, להתאים לספור תאים לכל תרבות 200ul כך לכל אחד יש ירידה בערך את אותה כמות של תאים. </li><li s...

<ol>
	<li>Costerton, J. W., Lewandowski, Z., Caldwell, D. E., Korber, D. R., Lappin-Scott, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+biofilms.">Microbial biofilms.</a> Annu Rev Microbiol. 49, 711-745 (1995).</li><li>Elortondo, F. J. P., Salmeron, J., Albisu, M., Casas, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms+in+the+food+industry.">Biofilms in the food industry.</a> Food Science and Technology International. 5, 25-30 (1999).</li><li>Keinanen, M. M., Martikainen, P. J., Kontro, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+community+structure+and+biomass+in+developing+drinking+water+biofilms.">Microbial community structure and biomass in developing drinking water biofilms.</a> Can J Microbiol. 50, 183-191 (2004).</li><li>Biffinger, J. C., Pietron, J., Ray, R., Little, B., Ringeisen, B. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+biofilm+enhanced+miniature+microbial+fuel+cell+using+Shewanella+oneidensis+DSP10+and+oxygen+reduction+cathodes.">A biofilm enhanced miniature microbial fuel cell using Shewanella oneidensis DSP10 and oxygen reduction cathodes.</a> Biosens Bioelectron. 22, 1672-1679 (2007).</li><li>Kim, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bacterial+community+structure,+compartmentalization+and+activity+in+a+microbial+fuel+cell.">Bacterial community structure, compartmentalization and activity in a microbial fuel cell.</a> J Appl Microbiol. 101, 698-710 (2006).</li><li>Kim, J. R., Jung, S. H., Regan, J. M., Logan, B. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electricity+generation+and+microbial+community+analysis+of+alcohol+powered+microbial+fuel+cells.">Electricity generation and microbial community analysis of alcohol powered microbial fuel cells.</a> Bioresour Technol. 98, 2568-2577 (2007).</li><li>Picioreanu, C., Head, I. M., Katuri, K. P., Loosdrecht, M. C. v. a. n., Scott, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+computational+model+for+biofilm-based+microbial+fuel+cells.">A computational model for biofilm-based microbial fuel cells.</a> Water Res. 41, 2921-2940 (2007).</li><li>Singh, R., Paul, D., Jain, R. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms:+implications+in+bioremediation.">Biofilms: implications in bioremediation.</a> Trends in Microbiology. 14, 389-397 (2006).</li><li>Cullen, P. J., Sprague, G. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glucose+depletion+causes+haploid+invasive+growth+in+yeast.">Glucose depletion causes haploid invasive growth in yeast.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 97, 13619-13224 (2000).</li><li>Gimeno, C. J., Ljungdahl, P. O., Styles, C. A., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unipolar+cell+divisions+in+the+yeast+S.+cerevisiae+lead+to+filamentous+growth:+regulation+by+starvation+and+RAS.">Unipolar cell divisions in the yeast S. cerevisiae lead to filamentous growth: regulation by starvation and RAS.</a> Cell. 68, 1077-1090 (1992).</li><li>Blankenship, J. R., Mitchell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+to+build+a+biofilm:+a+fungal+perspective.">How to build a biofilm: a fungal perspective.</a> Curr Opin Microbiol. 9, 588-594 (2006).</li><li>Reynolds, T. B., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bakers'+yeast,+a+model+for+fungal+biofilm+formation.">Bakers' yeast, a model for fungal biofilm formation.</a> Science. 291, 878-881 (2001).</li><li>Verstrepen, K. J., Klis, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flocculation,+adhesion+and+biofilm+formation+in+yeasts.">Flocculation, adhesion and biofilm formation in yeasts.</a> Mol Microbiol. 60, 5-15 (2006).</li><li>Liu, H., Styles, C. A., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elements+of+the+yeast+pheromone+response+pathway+required+for+filamentous+growth+of+diploids.">Elements of the yeast pheromone response pathway required for filamentous growth of diploids.</a> Science. 262, 1741-1744 (1993).</li><li>Madhani, H. D., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+control+of+filamentous+differentiation+and+virulence+in+fungi.">The control of filamentous differentiation and virulence in fungi.</a> Trends Cell Biol. 8, 348-353 (1998).</li><li>Mosch, H. U., Kubler, E., Krappmann, S., Fink, G. R., Braus, G. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crosstalk+between+the+Ras2p-controlled+mitogen-activated+protein+kinase+and+cAMP+pathways+during+invasive+growth+of+Saccharomyces+cerevisiae.">Crosstalk between the Ras2p-controlled mitogen-activated protein kinase and cAMP pathways during invasive growth of Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Biol Cell. 10, 1325-1335 (1999).</li><li>Mosch, H. U., Roberts, R. L., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ras2+signals+via+the+Cdc42/Ste20/mitogen-activated+protein+kinase+module+to+induce+filamentous+growth+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Ras2 signals via the Cdc42/Ste20/mitogen-activated protein kinase module to induce filamentous growth in Saccharomyces cerevisiae.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 93, 5352-5356 (1996).</li><li>Pan, X., Heitman, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cyclic+AMP-dependent+protein+kinase+regulates+pseudohyphal+differentiation+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Cyclic AMP-dependent protein kinase regulates pseudohyphal differentiation in Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Cell Biol. 19, 4874-4887 (1999).</li><li>Roberts, R. L., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elements+of+a+single+MAP+kinase+cascade+in+Saccharomyces+cerevisiae+mediate+two+developmental+programs+in+the+same+cell+type:+mating+and+invasive+growth.">Elements of a single MAP kinase cascade in Saccharomyces cerevisiae mediate two developmental programs in the same cell type: mating and invasive growth.</a> Genes Dev. 8, 2974-2985 (1994).</li><li>Robertson, L. S., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+three+yeast+A+kinases+have+specific+signaling+functions+in+pseudohyphal+growth.">The three yeast A kinases have specific signaling functions in pseudohyphal growth.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 95, 13783-13787 (1998).</li><li>Reynolds, T. B., Jansen, A., Peng, X., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mat+formation+in+Saccharomyces+cerevisiae+requires+nutrient+and+pH+gradients.">Mat formation in Saccharomyces cerevisiae requires nutrient and pH gradients.</a> Eukaryot Cell. , (2007).</li></ol>

בתאי שמרים להציג מצבי בידול שונים על פי זמינות חומרי מזון ותנאים סביבתיים, כולל יצירת הנבגים בתנאי רעב ומתח, filamentation תחת מדגיש תזונה שונים, הפתתה. שמרים שונים, כולל cerevisiae ס ו ג אלביקנס, ניתן למצוא גם ב biofilms שהוקמה על ידי קבוצה מגוונת של מיקרואורגניזמים. אמנם יש איזשהו יחס עם filamentatio...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Moticam 350</td>
<td>Camera</td>
<td>Motic</td>
<td>discontinued (new model: Moticam 352)</td>
<td>A relatively cheap camera that attaches to eye pieces of microscopes and captures digital images for PC or Mac.</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>

assay for adhesion and agar invasion in s. cerevisiae

שמרים נמצאים biofilms טבעי, שבו מיקרואורגניזמים רבים ליישב משטחים. בסביבות מלאכותי, כגון משטחים של אובייקטים מעשה ידי אדם, biofilms יכול להפחית את התפוקה התעשייתית, להרוס את המבנים, ומאיימים על חיי אדם. 1-3 מצד שני, רתימת העוצמה של biofilms יכול לעזור לנקות את הסביבה וליצור אנרגיה בת קיימא. 4-8 היכולת של cerevisiae ס ליישב משטחים ולהשתתף biofilms מורכב בעיקר התעלמו עד הגילוי מחדש של תוכניות בידול מופעלות על ידי איתות המסלולים השונים רמזים סביבתיים אורגניזם הזה. 9, 10 ההתעניינות המתמשכת באמצעות cerevisiae ס כאורגניזם מודל כדי להבין את האינטראקציה ההתכנסות של מסלולי איתות, כגון ראס PKA, Kss1 MAPK, ו Hog1 מסלולים osmolarity, הניח במהירות cerevisiae ס בצומת של biofilm ביולוגיה התמרה מחקר האות. 11-20 לשם כך, התמיינות של תאים השמרים לתוך ארוך, חוטים דבק pseudohyphal הפך readout נוח להפעלה של מסלולים הולכת אותות על שינויים סביבתיים שונים. עם זאת, filamentation הוא אוסף מורכב של פנוטיפים, מה שהופך assaying על זה כאילו זה פנוטיפ פשוט מטעה. בעשור האחרון, מספר מבחני אומצו בהצלחה ממחקרים biofilm חיידקי מחקר שמרים, כגון היווצרות מבחני MAT למדוד להפיץ המושבה על אגר רך סגול מכתים קריסטל כמותית למדוד על פני קרום התא דבקות. 12, 21 עם זאת, יש כבר כמה בלבול מבחני איכותית שפותחה כדי להעריך את פנוטיפים דבק פולשני של השמרים אגר. כאן, אנו מציגים שיטה פשוטה ואמינה להערכת איכות דבק פולשני של זני שמרים עם קל להבין את השלבים הבאים כדי לבודד את הערכה הידבקות מהערכה הפלישה. השיטה שלנו, אימצו ממחקרים קודמים, 10, 16 כולל התאים גדל התקשורת נוזלי ציפוי על תנאי מזין ההפרש לצמיחה של כתמים גדולים, אשר אנו מכן לשטוף עם מים כדי להעריך את הידבקות ולשפשף התאים לחלוטין מעל פני השטח אגר להעריך הפלישה אגר. אנו לבטל את הצורך נמרח על גבי תאים אגר, אשר משפיע על פלישה של תאים לתוך אגר. באופן כללי, אנו ציין כי זנים הפלואידים כי לפלוש אגר תמיד דבק, אך לא כל זני דבק יכול לפלוש בינוני אגר. הגישה שלנו יכולים לשמש בשילוב עם מבחני אחרים כדי לנתח בזהירות את הצעדים בידול והדרישות של התמרה שמרים האות, בידול, חישה קוורום, היווצרות biofilm.

Watch this Scientific Journal Video about Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae at JoVE.com

Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae

אנו מתארים assay איכותי עבור הידבקות שמרים הפלישה אגר כאמצעי בידול פולשני pseudohyphal. Assay זה פשוט יכול לשמש כדי להעריך את פנוטיפ פולשני של מוטנטים שונים, כמו גם את ההשפעות רמזים סביבתיים איתות המסלולים על בידול שמרים.

Assay עבור הידבקות ואת הפלישה אגר ב cerevisiae ס

Yeasts are found in natural biofilms, where many microorganisms colonize surfaces. In artificial environments, such as surfaces of man-made objects, ...

Research

JoVE Journal

Biology

A high-throughput method to globally study the organelle morphology in S. cerevisiae

שיטת תפוקה גבוהה ברחבי העולם כדי ללמוד את המורפולוגיה של אברון cerevisiae ס

High-throughput methods to examine protein localization or organelle morphology is an effective tool for studying protein interactions and can help ...

Identification of protein complexes with quantitative proteomics in S. cerevisiae

זיהוי של קומפלקסים חלבונים עם proteomics כמותיים cerevisiae ס

Lipids are the building blocks of cellular membranes that function as barriers and in compartmentalization of cellular processes, and recently, as ...

An In vitro FluoroBlok Tumor Invasion Assay

An In vitro FluoroBlok Tumor Invasion Assay

במבחנה Invasion FluoroBlok גידול Assay

The hallmark of metastatic cells is their ability to invade through the basement membrane and migrate to other parts of the body. Cells must be able to ...

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

אגר-Block מיקרוקוסמוס של פירוק רקמות הצמח מבוקרת על ידי פטריות אירובית

The two principal methods for studying fungal biodegradation of lignocellulosic plant tissues were developed for wood preservative testing (soil-block; ...

A Fluorescence Microscopy Assay for Monitoring Mitophagy in the Yeast Saccharomyces cerevisiae

A Fluorescence Microscopy Assay for Monitoring Mitophagy in the Yeast Saccharomyces cerevisiae

Assay מיקרוסקופ פלואורסצנטי עבור Mitophagy ניטור השמרים Saccharomyces cerevisiae

Autophagy is important for turnover of cellular components under a range of different conditions. It serves an essential homeostatic function as well as a ...

Studying Age-dependent Genomic Instability using the S. cerevisiae Chronological Lifespan Model

Studying Age-dependent Genomic Instability using the S. cerevisiae Chronological Lifespan Model

לימוד גיל תלויי חוסר יציבות הגנום באמצעות ס cerevisiae דגם כרונולוגי תוחלת חיים

Studies using the Saccharomyces cerevisiae aging model have uncovered life span regulatory pathways that are partially conserved in higher eukaryotes1-2. ...

Isolation of Primary Mouse Trophoblast Cells and Trophoblast Invasion Assay

בידוד של תאים ראשוניים עכבר Trophoblast וAssay הפלישה Trophoblast

The placenta is responsible for the transport of nutrients, gasses and growth factors to the fetus, as well as the elimination of wastes.  
Thus, defects ...

Flow Cytometry-based Purification of S. cerevisiae Zygotes

Flow Cytometry-based Purification of S. cerevisiae Zygotes

טיהור הזרימה Cytometry מבוסס<em&gt; ס cerevisiae</em&gt; זיגוטות

Zygotes are essential intermediates between haploid and diploid states in the life cycle of many organisms, including yeast (Figure 1) 1. S. cerevisiae ...

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

הדמיה וניתוח של מולקולות ה-mRNA באמצעות הקרינה<em&gt; באתרו</em&gt; הכלאה ב<em&gt; Cerevisiae Saccharomyces</em

The Fluorescence in situ Hybridization (FISH) method allows one to detect nucleic acids in the native cellular environment. Here we provide a protocol for ...

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

מבחני יחד לrefolding החלבון בניטור<em&gt; Cerevisiae Saccharomyces</em

Proteostasis, defined as the combined processes of protein folding/biogenesis, refolding/repair, and degradation, is a delicate cellular balance that must ...