Name: assay for adhesion and agar invasion in s. cerevisiae
Uploaded: 2006-11-08T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae at JoVE.com

Мы хотели бы поблагодарить Лизу Schneper и Катрин Duevel за их идеи в развитии этого анализа.

<ol><li> Положите 200ul растущих культур процентов по синтетических пластин сред с требуемым условиям голодания (ПК с 2% глюкозы по сравнению с SC с 0,2% глюкозы, например) Если плотность культур, слишком отличаются друг от друга, настроить клеток в культуре 200ul так что каждая капля имеет примерно такое же коли...

<ol>
	<li>Costerton, J. W., Lewandowski, Z., Caldwell, D. E., Korber, D. R., Lappin-Scott, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+biofilms.">Microbial biofilms.</a> Annu Rev Microbiol. 49, 711-745 (1995).</li><li>Elortondo, F. J. P., Salmeron, J., Albisu, M., Casas, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms+in+the+food+industry.">Biofilms in the food industry.</a> Food Science and Technology International. 5, 25-30 (1999).</li><li>Keinanen, M. M., Martikainen, P. J., Kontro, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Microbial+community+structure+and+biomass+in+developing+drinking+water+biofilms.">Microbial community structure and biomass in developing drinking water biofilms.</a> Can J Microbiol. 50, 183-191 (2004).</li><li>Biffinger, J. C., Pietron, J., Ray, R., Little, B., Ringeisen, B. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+biofilm+enhanced+miniature+microbial+fuel+cell+using+Shewanella+oneidensis+DSP10+and+oxygen+reduction+cathodes.">A biofilm enhanced miniature microbial fuel cell using Shewanella oneidensis DSP10 and oxygen reduction cathodes.</a> Biosens Bioelectron. 22, 1672-1679 (2007).</li><li>Kim, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bacterial+community+structure,+compartmentalization+and+activity+in+a+microbial+fuel+cell.">Bacterial community structure, compartmentalization and activity in a microbial fuel cell.</a> J Appl Microbiol. 101, 698-710 (2006).</li><li>Kim, J. R., Jung, S. H., Regan, J. M., Logan, B. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Electricity+generation+and+microbial+community+analysis+of+alcohol+powered+microbial+fuel+cells.">Electricity generation and microbial community analysis of alcohol powered microbial fuel cells.</a> Bioresour Technol. 98, 2568-2577 (2007).</li><li>Picioreanu, C., Head, I. M., Katuri, K. P., Loosdrecht, M. C. v. a. n., Scott, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+computational+model+for+biofilm-based+microbial+fuel+cells.">A computational model for biofilm-based microbial fuel cells.</a> Water Res. 41, 2921-2940 (2007).</li><li>Singh, R., Paul, D., Jain, R. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biofilms:+implications+in+bioremediation.">Biofilms: implications in bioremediation.</a> Trends in Microbiology. 14, 389-397 (2006).</li><li>Cullen, P. J., Sprague, G. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Glucose+depletion+causes+haploid+invasive+growth+in+yeast.">Glucose depletion causes haploid invasive growth in yeast.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 97, 13619-13224 (2000).</li><li>Gimeno, C. J., Ljungdahl, P. O., Styles, C. A., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Unipolar+cell+divisions+in+the+yeast+S.+cerevisiae+lead+to+filamentous+growth:+regulation+by+starvation+and+RAS.">Unipolar cell divisions in the yeast S. cerevisiae lead to filamentous growth: regulation by starvation and RAS.</a> Cell. 68, 1077-1090 (1992).</li><li>Blankenship, J. R., Mitchell, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=How+to+build+a+biofilm:+a+fungal+perspective.">How to build a biofilm: a fungal perspective.</a> Curr Opin Microbiol. 9, 588-594 (2006).</li><li>Reynolds, T. B., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Bakers'+yeast,+a+model+for+fungal+biofilm+formation.">Bakers' yeast, a model for fungal biofilm formation.</a> Science. 291, 878-881 (2001).</li><li>Verstrepen, K. J., Klis, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flocculation,+adhesion+and+biofilm+formation+in+yeasts.">Flocculation, adhesion and biofilm formation in yeasts.</a> Mol Microbiol. 60, 5-15 (2006).</li><li>Liu, H., Styles, C. A., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elements+of+the+yeast+pheromone+response+pathway+required+for+filamentous+growth+of+diploids.">Elements of the yeast pheromone response pathway required for filamentous growth of diploids.</a> Science. 262, 1741-1744 (1993).</li><li>Madhani, H. D., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+control+of+filamentous+differentiation+and+virulence+in+fungi.">The control of filamentous differentiation and virulence in fungi.</a> Trends Cell Biol. 8, 348-353 (1998).</li><li>Mosch, H. U., Kubler, E., Krappmann, S., Fink, G. R., Braus, G. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Crosstalk+between+the+Ras2p-controlled+mitogen-activated+protein+kinase+and+cAMP+pathways+during+invasive+growth+of+Saccharomyces+cerevisiae.">Crosstalk between the Ras2p-controlled mitogen-activated protein kinase and cAMP pathways during invasive growth of Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Biol Cell. 10, 1325-1335 (1999).</li><li>Mosch, H. U., Roberts, R. L., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ras2+signals+via+the+Cdc42/Ste20/mitogen-activated+protein+kinase+module+to+induce+filamentous+growth+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Ras2 signals via the Cdc42/Ste20/mitogen-activated protein kinase module to induce filamentous growth in Saccharomyces cerevisiae.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 93, 5352-5356 (1996).</li><li>Pan, X., Heitman, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cyclic+AMP-dependent+protein+kinase+regulates+pseudohyphal+differentiation+in+Saccharomyces+cerevisiae.">Cyclic AMP-dependent protein kinase regulates pseudohyphal differentiation in Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Cell Biol. 19, 4874-4887 (1999).</li><li>Roberts, R. L., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Elements+of+a+single+MAP+kinase+cascade+in+Saccharomyces+cerevisiae+mediate+two+developmental+programs+in+the+same+cell+type:+mating+and+invasive+growth.">Elements of a single MAP kinase cascade in Saccharomyces cerevisiae mediate two developmental programs in the same cell type: mating and invasive growth.</a> Genes Dev. 8, 2974-2985 (1994).</li><li>Robertson, L. S., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+three+yeast+A+kinases+have+specific+signaling+functions+in+pseudohyphal+growth.">The three yeast A kinases have specific signaling functions in pseudohyphal growth.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 95, 13783-13787 (1998).</li><li>Reynolds, T. B., Jansen, A., Peng, X., Fink, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mat+formation+in+Saccharomyces+cerevisiae+requires+nutrient+and+pH+gradients.">Mat formation in Saccharomyces cerevisiae requires nutrient and pH gradients.</a> Eukaryot Cell. , (2007).</li></ol>

Дрожжевые клетки отображать различные режимы дифференциации в зависимости от наличия питательных веществ и условий окружающей среды, в том числе образование спор в голоде и стрессе, филаментации в различных питательных напряжений и флокуляции. Различные дрожжи, в том числе С. CEREVISIAE и C. Albicans, такж...

<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" xml:lang="en" lang="en">	
		
		<div>
		<table border="1">
		<thead>
		<tr>
		<th>Material Name</th>
		<th>Type</th>
		<th>Company</th>
		<th>Catalogue Number</th>
		<th>Comment</th>
		</tr>
		</thead>
		<tbody>
		
<tr>
<td>Moticam 350</td>
<td>Camera</td>
<td>Motic</td>
<td>discontinued (new model: Moticam 352)</td>
<td>A relatively cheap camera that attaches to eye pieces of microscopes and captures digital images for PC or Mac.</td>
</tr>		</tbody>
		</table>
		</div>

assay for adhesion and agar invasion in s. cerevisiae

Дрожжи находятся в естественном биопленки, где многие микроорганизмы колонизировать поверхности. В искусственных условиях, таких как поверхности искусственных объектов, биопленки может снизить производительность, уничтожить структур, и поставить под угрозу человеческую жизнь. 1-3 С другой стороны, использование энергии биопленок может помочь очистить окружающую среду и создания устойчивой энергетики. 4-8 способность ЗассЬаготусез С. колонизировать поверхности и участвовать в сложных биопленки в основном игнорируются, пока новое открытие дифференциация программ вызваны различные сигнальные пути и сигналами окружающей среды в данном организме. 9, 10 по-прежнему заинтересовано в использовании С. CEREVISIAE качестве модельного организма для понимания взаимодействия и сближения сигнальных путей, таких, как Рас-ПКА, Kss1 МАРК, и Hog1 пути осмолярность, быстро размещены С. CEREVISIAE на стыке биопленки биологии и исследования передачи сигнала. 11-20 С этой целью, дифференциация клеток дрожжей в длинные, клей, pseudohyphal нитей стал удобным отсчет для активации пути передачи сигналов от различных изменений окружающей среды. Тем не менее, филаментации представляет собой сложный набор фенотипов, что делает опробование для него, как будто это простая фенотипа в заблуждение. В последнее десятилетие в ряде тестов были успешно приняты от бактериального исследования биопленки на дрожжах исследований, таких как формирование MAT тесты для измерения колонии распространяются на мягком агаре и окрашивания кристаллическим фиолетовым количественно измерить на поверхности клеток приверженности. 12, 21, однако, наблюдается некоторая путаница в анализах разработана с целью качественного анализа клея и инвазивного фенотипа дрожжей в агар. Здесь мы приведем простой и надежный метод оценки клея и инвазивных качества штаммов дрожжей с легким для понимания шагов, чтобы изолировать адгезии оценки от вторжения оценки. Наш метод, принятый от предыдущих исследований, 10, 16 включает в себя растущих клеток в жидкой среде и покрытие по дифференциальным питательных условий для роста крупных пятен, которые мы затем промыть водой для оценки адгезии и втирать клетки полностью от поверхности агара для оценки вторжение в агар. Мы устраняем необходимость полос клеток на агар, который влияет на вторжение в клетки в агар. В целом, мы обнаружили, что гаплоидных штаммов, которые вторгаются в агар всегда клея, но не все штаммы клей может вторгнуться в агар. Наш подход может быть использован в сочетании с другими анализы тщательно анализировать дифференциацию шагов и требований дрожжей передачи сигнала, дифференциация, кворума, а также формирование биопленок.

Watch this Scientific Journal Video about Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae at JoVE.com

Assay for Adhesion and Agar Invasion in S. cerevisiae

Мы описываем качественный анализ для адгезии дрожжей и агар вторжение в качестве меры инвазивных и pseudohyphal дифференциации. Этот простой анализ может быть использован для оценки инвазивного фенотипа различных мутантов, а также эффекты сигналами окружающей среды и сигнальных путей на дрожжах дифференциации.

Анализ для адгезии и агар Вторжение в CEREVISIAE С.

Yeasts are found in natural biofilms, where many microorganisms colonize surfaces. In artificial environments, such as surfaces of man-made objects, ...

Research

JoVE Journal

Biology

A high-throughput method to globally study the organelle morphology in S. cerevisiae

Высокой пропускной метод глобально исследования морфологии органелл в CEREVISIAE С.

High-throughput methods to examine protein localization or organelle morphology is an effective tool for studying protein interactions and can help ...

Identification of protein complexes with quantitative proteomics in S. cerevisiae

Идентификация белковых комплексов с количественной протеомики в CEREVISIAE С.

Lipids are the building blocks of cellular membranes that function as barriers and in compartmentalization of cellular processes, and recently, as ...

An In vitro FluoroBlok Tumor Invasion Assay

An In vitro FluoroBlok Tumor Invasion Assay

В пробирке FluoroBlok опухолевой инвазии Пробирной

The hallmark of metastatic cells is their ability to invade through the basement membrane and migrate to other parts of the body. Cells must be able to ...

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

Агар-Block Микрокосмы для управляемого разложения тканей завод по Аэробные Грибы

The two principal methods for studying fungal biodegradation of lignocellulosic plant tissues were developed for wood preservative testing (soil-block; ...

A Fluorescence Microscopy Assay for Monitoring Mitophagy in the Yeast Saccharomyces cerevisiae

A Fluorescence Microscopy Assay for Monitoring Mitophagy in the Yeast Saccharomyces cerevisiae

Флуоресценция Пробирной микроскопии для мониторинга Mitophagy в Дрожжи Saccharomyces CEREVISIAE

Autophagy is important for turnover of cellular components under a range of different conditions. It serves an essential homeostatic function as well as a ...

Studying Age-dependent Genomic Instability using the S. cerevisiae Chronological Lifespan Model

Studying Age-dependent Genomic Instability using the S. cerevisiae Chronological Lifespan Model

Изучение, зависящими от возраста геномной нестабильности использованием С. CEREVISIAE Хронологические Модель продолжительность жизни

Studies using the Saccharomyces cerevisiae aging model have uncovered life span regulatory pathways that are partially conserved in higher eukaryotes1-2. ...

Isolation of Primary Mouse Trophoblast Cells and Trophoblast Invasion Assay

Изоляция первичной мышь клетки трофобласта и анализа трофобласта Вторжение

The placenta is responsible for the transport of nutrients, gasses and growth factors to the fetus, as well as the elimination of wastes.  
Thus, defects ...

Flow Cytometry-based Purification of S. cerevisiae Zygotes

Flow Cytometry-based Purification of S. cerevisiae Zygotes

Проточной цитометрии на основе очистки<em&gt; S. CEREVISIAE</em&gt; Зиготы

Zygotes are essential intermediates between haploid and diploid states in the life cycle of many organisms, including yeast (Figure 1) 1. S. cerevisiae ...

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

Visualization and Analysis of mRNA Molecules Using Fluorescence In Situ Hybridization in Saccharomyces cerevisiae

Визуализации и анализа молекул мРНК с помощью флуоресцентной<em&gt; В Ситу</em&gt; Гибридизация в<em&gt; Saccharomyces CEREVISIAE</em

The Fluorescence in situ Hybridization (FISH) method allows one to detect nucleic acids in the native cellular environment. Here we provide a protocol for ...

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

Coupled Assays for Monitoring Protein Refolding in Saccharomyces cerevisiae

В сочетании Анализы для мониторинга рефолдинг Белок в<em&gt; Saccharomyces CEREVISIAE</em

Proteostasis, defined as the combined processes of protein folding/biogenesis, refolding/repair, and degradation, is a delicate cellular balance that must ...