Name: visualizing subcellular localization of a protein in the heart using quantum dots-mediated immuno-labeling followed by transmission electron microscopy
Uploaded: 2022-09-16T13:30:00
Duration: 8 min 13 s
Description: Watch this Scientific Journal Video about Visualizing Subcellular Localization of a Protein in the Heart Using Quantum Dots-Mediated Immuno-Labeling Followed by Transmission Electron Microscopy at JoV

Diese Arbeit wurde durch die Zuschüsse der National Institutes of Health unterstützt: R01HL145753, R01HL145753-01S1, R01HL145753-03S1 und R01HL152723; LSUHSC-S CCDS Finish Line Award, COVID-19 Research Award und LARC Research Award an MSB; LSUHSC-S Malcolm Feist Herz-Kreislauf- und AHA-Postdoc-Stipendium für CSA (20POST35210789); und LSUHSC-S Malcolm Feist Pre-doctoral Fellowship zu RA.

Die Verfahren zur Handhabung von Tieren in diesem Protokoll entsprachen dem Leitfaden für die Pflege und Verwendung von Labortieren (achte Ausgabe, National Institutes of Health, Bethesda, MD) und wurden vom Animal Care and Use Committee des Louisiana State University Health Sciences Center-Shreveport genehmigt. Sechs Monate alte männliche Mäuse mit FVB / N-Hintergrund wurden für die vorliegende Studie verwendet. Die Mäuse wurden aus kommerziellen Quellen gewonnen (siehe Materialtabelle). Die verwendeten Mäuse wurden in einer gut regulierten Umgebung in Käfigen untergebracht, die einen 12-stündigen Hell-Dunkel-Zyklus ermöglichten, mit Wasser und einer regelmäßigen Chow-Diät ad libitum versorgt und gemäß dem NIH-Leitfaden für die Pflege und Verwendung der Labortiere gepflegt. Der Gesamtprozess ist in Abbildung 1 dargestellt.
1. Tierische Zubereitung
<ol><li>Anästhesieren Sie die Mäuse mit 3% Isofluran. Öffnen Sie die Brust, indem Sie einen horizontalen Schnitt in der Region über dem Mittelbauch machen und die Haut ziehen. Machen Sie vorsichtig einen weiteren Schnitt, um die Brusthöhle zu öffnen, ohne andere Organe zu punktieren21,22,23.<ol><li>Perfusion24 zuerst das Herz durch die Spitze und dann den rechten Ventrikel mit kaltem 3% Glutaraldehyd in kardioplegischer Lösung (50 mM KCl, 5% Dextrose in PBS, siehe Zusatzdatei 1) für 2 min, um eine vollständige myokardiale Entspannung zu gewährleisten.</li>
	</ol></li>
	<li>Durchbluten Sie das Herz mit eiskaltem 3% Glutaraldehyd in 0,1 M Natriumcacodylatpuffer (pH 7,4, Schritt 2.1.1) für weitere 2 min. Verwenden Sie unter Schwerkraftdruck eine 25 G 5/8 "Nadel, um die Fixiermittel in das Herz einzuführen. Unmittelbar nachdem sich das Herz mit dem Fixiermittel gefüllt hat, heben Sie die Herzspitze an und schneiden Sie die darunter liegenden Gefäße 1-2 mm vom Herzen ab, um den Druck zu verringern und die Flüssigkeiten abfließen zu lassen.</li>
	<li>Sezieren Sie das Herz, entfernen Sie die Vorhöfe24 und lassen Sie die Ventrikel in eiskaltes 3% Glutaraldehyd / 0,1 M Natriumcacodylat in einer Petrischale fallen. Nach 30-60 min Fixierung einen Schmetterlingsschnitt machen und in eine Petrischale geben, die 3% Glutaraldehyd/Cacodylat enthält (siehe Materialtabelle). Hacken Sie das Herz mit einer chirurgischen Klinge in kleine Würfel von 1 mm3 , während es in Glutaraldehyd / Cacodylatlösung ist.</li>
	<li>Fixieren/tauchen Sie das zerlegte Herzgewebe in Glutaraldehyd/Cacodylat-Lösung für 24 h bei 4 °C.</li>
</ol>2. Herzgewebeaufbereitung
<ol><li>Nach 24 h Fixierung waschen Sie das Gewebe in 0,1 M Natriumcacodylatpuffer für 20 min.<ol><li>Bereiten Sie 0,1 M Cacodylatpuffer vor, indem Sie die folgenden Schritte ausführen.<ol><li>Zur Herstellung von 0,1 M Natriumcacodylatpuffer wird eine Brühe von 1 M Natriumcacodylatpuffer durch Auflösen von Natriumcacodylat (21,4 g) und von 1% iger Calciumchloridlösung (3 ml) in 90 ml destilliertem Wasser hergestellt. Erhöhen Sie die Lösung auf 100 ml, indem Sie das destillierte Wasser hinzufügen. Rühren Sie die Lösung gut um und lassen Sie sie über Nacht stehen, um den gelösten Stoff aufzulösen.</li>
			<li>Als nächstes nehmen Sie 10 ml 1 M Natriumcacodylat-Stammlösung und fügen Sie sie zu 80 ml destilliertem Wasser hinzu. Stellen Sie den pH-Wert mit HCl auf 7,4 ein und bemessen Sie ihn durch Zugabe von destilliertem Wasser auf bis zu 100 ml.</li>
		</ol></li>
	</ol></li>
	<li>Wiederholen Sie die Wäsche in 0,1 M Natriumcacodylatpuffer für weitere 20 Minuten. Entfernen Sie die Gewebe aus dem Natriumcacodylatpuffer und tauchen Sie sie für 4 h bei Raumtemperatur in 2% ige Osmiumtetroxidlösung. Dieser Prozess wird Osmierung genannt.<ol><li>Bereiten Sie 2% ige Osmiumtetroxidlösung wie folgt vor.<ol><li>Um 2% ige Osmiumtetroxidlösung herzustellen, nehmen Sie 4% Osmiumtetroxidlösung, 4 ml (siehe Materialtabelle), 1 M Natriumcacodylat-Stammlösung (0,8 ml) und destilliertes Wasser (3,2 ml), um insgesamt 8 ml Lösung herzustellen. HINWEIS: Dieser gesamte Prozess und die Schritte von nun an müssen im Abzug durchgeführt werden.</li>
		</ol></li>
	</ol></li>
	<li>Nach der Osmulation tauchen Sie das Gewebe für 10 min bei Raumtemperatur in 2% ige Natriumacetatlösung.<ol><li>Bereiten Sie 2% ige Natriumacetatlösung vor, indem Sie 4 g Natriumacetat in 20 ml destilliertem Wasser auflösen.</li>
	</ol></li>
	<li>Als nächstes tauchen Sie das Gewebe für 1 h bei Raumtemperatur in 2% ige Uranylacetatlösung.<ol><li>2%ige Uranylacetatlösung durch Auflösen von 4 g Uranylacetat in 20 ml destilliertem Wasser hergestellt.</li>
	</ol></li>
	<li>Nach der Uranylacetatfärbung dehydrieren Sie das Gewebe nacheinander durch die abgestuften Alkohole und das Aceton in der in der Zusatzakte 1 angegebenen Reihenfolge.</li>
</ol>3. Einbettung von Herzgewebe
<ol><li>Betten Sie das dehydrierte Gewebe in niedrigviskoses Epoxidharz ein, indem Sie die folgenden Schritte ausführen.<ol><li>Zur Herstellung von niedrigviskosem Epoxidharz mischen Sie 10,24 ml Vinylcyclohexendioxid (ERL 4221) Epoxidmonomer, 6,74 ml Diglycidylether Polypropylenglykol (DER 732) und 30,05 ml Nonenylbernsteinsäureanhydrid (NSA) (siehe Materialtabelle) in einem 50-ml-Röhrchen. Rühren Sie die Suspension 2 min lang gut von Hand um.</li>
		<li>Fügen Sie 18 Tropfen 2-Dimethylaminoethanol (DMAE, siehe Materialtabelle) Epoxidbeschleuniger hinzu und rühren Sie die Suspension um, um die Komponenten gründlich zu mischen.</li>
		<li>Imprägnant die Gewebe in Epoxidharz in der folgenden Mischungssequenz.<ol><li>Ersetzen Sie das 100% ige Aceton durch 1:1 Harz: Acetonsuspension und tauchen Sie das Gewebe für 1 h bei Raumtemperatur ein.</li>
			<li>Ersetzen Sie 1:1 Harz: Acetonsuspension durch 6:1 Harz: Acetonsuspension und tauchen Sie das Gewebe für 3 h hinein.</li>
			<li>Ersetzen Sie schließlich die 6:1-Harz-Aceton-Suspension durch eine 100% ige Harzsuspension und lassen Sie das Gewebe über Nacht bei Raumtemperatur darin eintauchen.</li>
		</ol></li>
	</ol></li>
	<li>Die Gewebe in 8 mm Mikroformen in frisches Harz geben (siehe Materialtabelle) und das eingebettete Gewebe bei 70 °C über Nacht aushärten. HINWEIS: Stellen Sie sicher, dass das Harz hart, aber nach dem Aushärten nicht spröde ist.</li>
</ol>4. Gewebeschnitt mit einem Ultramikrotom
<ol><li>Schneiden Sie die Harzblöcke mit dem Gewebe auf nicht größer als 1 mm, bevor Sie sie auf das Ultramikrotom montieren (siehe Materialtabelle). Platzieren Sie die Form so präzise wie möglich im segmentierten Arm des Ultramikrotoms und schieben Sie die Probenform manuell in Richtung Diamantmesser.</li>
	<li>Schneiden Sie die Abschnitte mit einer Dicke von 500 nm (ein halbes Mikrometer) mit einem Histo-Messer (siehe Materialtabelle), heben Sie sie mit dem EM-Schlaufenwerkzeug auf und legen Sie sie auf einen Glasobjektträger.</li>
	<li>Legen Sie den Glasobjektträger auf eine Heizplatte für ToluidinblauFärbung 25 , um den interessierenden Bereich zu finden.</li>
	<li>Nachdem Sie den interessierenden Bereich gefunden haben, verwenden Sie ein Ultra 45°-Messer (siehe Materialtabelle), um ultradünne Schnitte aus hellem Gold (100 nm) herzustellen. Platzieren Sie diese ultradünnen Abschnitte auf der stumpfen Seite eines 200-mesh-Kupfergitters.</li>
</ol>5. Ultradünne Herzschnittfärbung
<ol><li>Beginnen Sie die Färbung, indem Sie das Antigen mit einer Ätzlösung, d. H. 5% Natriummetaperiodatlösung, demaskieren.<ol><li>500 μL 5%ige Natriummetaperiodatlösung (siehe Materialtabelle) in destilliertem Wasser herstellen. HINWEIS: Bereiten Sie vor Gebrauch eine frische Lösung vor.</li>
		<li>Geben Sie 20 μL Natriummetaperiodatlösung auf einen sauberen Paraffinfilm. Legen Sie die vollständig getrockneten Gitter mit Gewebeschnitten auf den Tropfen der Ätzlösung. HINWEIS: Die stumpfe Seite des Gitters mit dem Gewebeschnitt muss zur Ätzlösung zeigen.</li>
		<li>Lassen Sie das Schnittgitter 30 min bei Raumtemperatur auf der Lösung.</li>
	</ol></li>
	<li>Waschen Sie den geätzten Gewebeabschnitt, indem Sie ihn 60 s lang auf einen Tropfen destilliertes Wasser legen.</li>
	<li>Blockieren Sie die Restaldehydehyde, indem Sie die Abschnittsgitter für 10 min bei Raumtemperatur auf einen Tröpfchen von 0,05 M Glycinlösung legen. Tupfen Sie die Ränder des Gitters auf Filterpapier ab, um die restliche Glycinlösung zu entfernen.<ol><li>Bereiten Sie 0,05 M Glycinlösung (siehe Materialtabelle) vor, indem Sie 3,75 mg Glycin in 1 ml 1x PBS (pH 7,4) auflösen.</li>
	</ol></li>
	<li>Legen Sie die Abschnittsgitter für 25 min bei Raumtemperatur in 10-20 μL Blockierlösung. HINWEIS: Zusammensetzung der Blockierungslösung: 2 μL 1% normales Ziegenserum (NGS) + 20 μL 1% BSA (Endkonzentration: 10%) + 178 μL 1x PBS (pH 7,4), um ein Endvolumen von 200 μL zu erhalten.</li>
	<li>Tupfen Sie die Gitterränder auf Filterpapier und legen Sie den Gitterabschnitt auf Antikörperverdünner zur Konditionierung bei Raumtemperatur für 10 min.</li>
	<li>Die Gitterschnitte mit primärem Antikörper (in diesem Fall Sigmar1, siehe Materialtabelle; verdünnt 1:10 in Antikörperverdünnungsmittel) für 1 h 30 min in einer befeuchteten Kammer inkubieren.</li>
	<li>Trocknen Sie das Rost und waschen Sie die Gitterabschnitte zweimal für jeweils 5 min mit Antikörperverdünnungsmittel.</li>
	<li>Die Gitterschnitte mit biotinyliertem sekundärem Antikörper (in diesem Fall biotinylierter polyklonaler Ziegenantikaninchen-Sekundärantikörper, siehe Materialtabelle; 1:10 in Antikörperverdünnungsmittel verdünnt) für 1 h in einer befeuchteten Kammer inkubieren.</li>
	<li>Trocknen Sie das Rost und waschen Sie die Gitterabschnitte zweimal für jeweils 5 min mit Antikörperverdünnungsmittel.</li>
	<li>Inkubation der Gitterschnitte in handelsüblicher Streptavidin-konjugierter QD (QD655nm, siehe Materialtabelle; verdünnt 1:10 in Antikörperverdünnungsmittel) für 1 h in einer befeuchteten Kammer bei Raumtemperatur. Verhindern Sie Lichteinwirkung, indem Sie die Kammer mit Aluminiumfolie abdecken.</li>
	<li>Die Gitterränder mit Filterpapier abtupfen und die Gitterabschnitte waschen, indem Sie sie 2 min auf Wassertröpfchen legen.</li>
	<li>Tupfen Sie die Ränder des Gitters zum Trocknen ab.</li>
</ol>6. Bildgebung der Transmissionselektronenmikroskopie (TEM)
<ol><li>Legen Sie die ultradünnen Schnitte auf Kupfergitter in einen Probenquartetthalter und klemmen Sie sie so fest, dass die Auswahl von Gittern im Elektronenstrahl möglich ist.</li>
	<li>Führen Sie den Probenhalter in die Mikroskopsäule ein und betätigen Sie den Pumpenschalter, um das Goniometer zu evakuieren, gefolgt von einem vollständigen Einsetzen des Probenhalters in die Mikroskopsäule (siehe Materialtabelle).</li>
	<li>Stellen Sie die Spannung auf 80 kV ein, bevor Sie den Strahl für die Bildbeobachtung erzeugen.</li>
	<li>Fokussieren Sie sich gut auf den gewünschten Bereich, nehmen Sie das Bild mit einer Hochgeschwindigkeits-Digitalkamera auf und speichern Sie die Datei in .tif Format. HINWEIS: Die Mikroskopeinstellung zur Aufnahme des Bildes in dieser Studie war eine Beschleunigungsspannung oder Hochspannungsspannung von 80 kV und eine Vergrößerung von 20.000x.</li>
</ol>

<ol>
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K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Pharmaceutical+applications+of+quantum+dots.">Pharmaceutical applications of quantum dots.</a> AAPS PharmSciTech. 22 (7), 233 (2021).</li></ol>

Die Autoren haben nichts offenzulegen.

In der vorliegenden Studie wurde QD-vermittelte Immunmarkierung verwendet, um die subzelluläre Lokalisation von Sigmar1 deutlich zu zeigen. Mit Hilfe von QD wurde die Lokalisation von Sigmar1 auf der mitochondrialen Membran, insbesondere der inneren Mitochondrienmembran, im Herzgewebe dargestellt. Darüber hinaus wurde festgestellt, dass Sigmar1 auch auf sarkoplasmatischen/endoplasmatischen Retikulum (S/ER) und Lysosomen auf ultrastruktureller Ebene lokalisiert ist, wie in Abbildung 2A-D gezeigt.
Ein kritischer Schritt in diesem Protokoll ist der Ätz- oder Antigen-Demaskierungsschritt unter Verwendung hochkonzentrierter Natriummetaperiodatlösung zur Demaskierung des Antigens nach Glutaraldehydfixierung und Osmierung. Dieses Protokoll verwendete eine einmalige Behandlung mit einer hohen Konzentration (5%) Natriummetaperiodat für 30 Minuten bei Raumtemperatur. In diesem Schritt ist besondere Vorsicht geboten, da eine längere Dauer oder höhere Konzentration für die Natriummetaperiodat-Inkubation zur Aggregation von Strukturen, zum Verlust der Membrandefinition für die Organellen führt und Perforationen im Abschnitt verursacht, was es schwierig macht, das Protein oder die Struktur zu visualisieren. Alternativ kann anstelle von 5% Metaperiodat auch eine niedrigere Konzentration von (3%) Metaperiodatlösung in zwei Schritten für 30 min verwendet werden. Studien haben gezeigt, dass diese Option ähnliche Ergebnisse wie bei einer 5% igen Metaperiodatlösung für eine einstufige 30-minütige Inkubation zeigt. Eine 3% ige Metaperiodatlösung für 30 Minuten Inkubation für zwei Mal bietet jedoch eine bessere Kontrolle über den Prozess26,27,28. Anfangs verwendete dieses Protokoll die Inkubation der Abschnitte mit 10% iger Metaperiodatlösung für 30 min. Aufgrund zu vieler Perforationen, die durch diese Konzentration im Gewebeschnitt entstehen, wurde jedoch die Endkonzentration und Inkubationsdauer der Metaperiodatlösung reduziert und für 30 min auf 5% optimiert.
Ein weiterer Schritt erforderte die Optimierung der Fixierungszeit mit Glutaraldehyd. Eine suboptimale Fixierung von Geweben führt zu einer unzureichenden QD-Markierung, während eine Überfixierung von Geweben zu einer höheren unspezifischen Markierung führt. Daher muss bei der Bestimmung und Titration eines optimalen Gewebefixierungsgrades für eine korrekte und spezifische Markierung von Proteinen sorgfältig abgewogen werden. Bei dieser Methode mit Herzgewebe wurde die Fixierungszeit mit Glutaraldehyd unter Verwendung von 24 h und 48 h als Zeitpunkte titriert. Basierend auf den Färbebildern der Abschnitte, die für beide Zeitpunkte festgelegt wurden, wurde festgestellt, dass Abschnitte, die für 24 Stunden fixiert waren, bessere Ergebnisse zeigten. Bis heute sind QD-Nanokristalle in verschiedenen Größen erhältlich, darunter 525, 565, 585, 605, 655 und 705 nm11,29. Jede dieser QD hat ihre eigenen Emissionsspektren und emittiert Fluoreszenz bei verschiedenen Wellenlängen. Darüber hinaus weisen diese kommerziell erhältlichen QDs unterschiedlicher Größe unterschiedliche Formen auf; Zum Beispiel sind QD 525, 565 und 585 praktisch kugelförmig mit unterschiedlichen Größen, während QD 605, 655 und 705 unregelmäßig länglich geformt sind. Von diesen verschiedenen QD-Nanokristallen sind QD 525, 565 und 655 leicht voneinander zu unterscheiden11,29. Diese Unterschiede in Emissionsspektren und -formen machen QD zu einem großartigen Kandidaten für die Multi-Markierung von Proteinen und die Visualisierung durch Fluoreszenz- und Elektronenmikroskopie. In dieser Studie wurde eine kommerziell erhältliche QD, QD 655, verwendet, um das Sigmar1-Protein zu markieren, um es von jedem unspezifischen Hintergrund in den gefärbten Abschnitten zu unterscheiden.
Ein weiteres Gegenstück zur QD für die Proteinmarkierung in der hochauflösenden Mikroskopie ist das Immunogoldpartikel. Die Immungoldpartikel werden traditionell verwendet, um Proteine für die hochauflösende Mikroskopie zu markieren. Diese Goldpartikel sind sehr elektronendicht und im Vergleich zu QD-Nanokristallen leicht identifizierbar. QD zeigt jedoch eine bessere Effizienz mit besserer Penetration in Gewebe, höherer Stabilität und Haltbarkeit und besserer Retention ultrastruktureller Komponenten, was sie zu einem besseren Kandidaten für die Proteinmarkierung macht 4,5. QD hat auch eine einzigartige Fähigkeit, sowohl durch Licht- als auch durch Elektronenmikroskopie nachgewiesen zu werden, was seinen Wert gegenüber der Immunogold-Markierung10 erhöht.
Eine Einschränkung dieser QD-vermittelten Immunmarkierung ist die Verwendung von Osmiumtetroxid während der Verarbeitung. Osmiumtetroxid wird verwendet, um die Elektronendichte, Leitfähigkeit und den Kontrast von ansonsten weniger elektronendichten und weniger kontrastierenden biologischen Membranstrukturen zu erhöhen 5,30. Die Verwendung von Osmiumtetroxid zerstört jedoch sofort und irreversibel die Eigenschaft der Probe, Fluoreszenz zu erzeugen, wenn sie mit QD6 markiert wird. Dies schränkt die Verwendung von QD in der Fluoreszenzmikroskopie ein. Ein alternativer Ansatz, der auf die Verwendung von Osmiumtetroxid verzichtet, wird vorteilhaft sein, um die fluoreszierenden Eigenschaften und damit die doppelte Anwendung der QD-vermittelten Immunmarkierung beizubehalten. Einige der neueren Modelle von TEM haben die Möglichkeit, das energiedispersive Röntgenanalysesystem (EDX) anzubringen, das die Identifizierung der Elementzusammensetzung von Materialien ermöglicht. Eine weitere Einschränkung der Studie ist das Fehlen einer Elementkartierung einer Probe und Bildanalyse mittels EDX. Daher sollten sich zukünftige Studien auf die EDX-Analyse der QD-Spektren konzentrieren, um die elementare Zusammensetzung zu analysieren.
Die QD-Markierung von Proteinen hat in letzter Zeit viel Aufmerksamkeit erregt. QD bietet mehrere Anwendungen und Vorteile sowohl in der biologischen Forschung als auch in der medizinischen Therapeutika. QD, das zusätzlich mit polyzähnigen Liganden umwickelt ist, zeigt eine erhöhte Stabilität, die die Quantenausbeute beibehält. Darüber hinaus erhöht die Verkapselung von QD mit diesen biogünstigen Wirkstoffen auch seine Bioverfügbarkeit in Geweben, was es zu einem guten Kandidaten für eine mögliche Anwendung bei der Erkennung von Tumoren, der Bildgebung lebender Zellen, der Wirkstoffabgabe und der Gewebebildgebung macht 3,31,32.

Der menschliche Körper besteht aus vielen Proteinen, die für zahlreiche Körperfunktionen verantwortlich sind. Die Funktion von Proteinen hängt maßgeblich von ihrer Lokalisation im Organ und in den Zellorganellen ab. Verschiedene Techniken, einschließlich subzellulärer Fraktionierung, Immunfluoreszenz und detergensvermittelter Proteinextraktion, werden häufig verwendet, um die subzelluläre Lokalisation des Proteins zu bestimmen 1,2. Die Mikroskopie mit Immunfluoreszenzfarbstoff ist die am weitesten verbreitete Methode unter diesen Techniken. Die bei dieser Technik verwendeten Fluoreszenzfarbstoffe sind jedoch weniger stabil und anfällig für Photobleiche3. Andere Techniken beinhalteten hochauflösende Mikroskopie, um das Protein auf ultrastruktureller Ebene sichtbar zu machen, indem Proteine mit elektronendichten, Schwermetallen (Gold, Ferritin) oder Quantenpunkt-Nanokristallen immunisiert und anschließend mit Transmissionselektronenmikroskopie (TEM) sichtbar gemacht wurden4,5.
QD ist ein Halbleiter-Nanokristall, der aus Halbleitermetallverbindungen mit kontrollierbaren Photolumineszenzeigenschaften besteht, die in biologischen Systemen eine große Bedeutung haben3. QD-Nanokristalle werden in einem Kern-Schale-Format hergestellt, bei dem ein Nanokristall in die Bildung von Nanokristallen eingekapselt wird, um ihre ordnungsgemäße Stabilität und Funktion zu gewährleisten. Häufig verwendete Kern-Schale-Nanokristallkombinationen sind CdSe/ZnS, CdSe/CdS CdSe/ZnSe, CdTe/CdS, CdTe/ZnS und CdTe/CdS/ZnS (Kern/Schale/Schale)3. Unter diesen Nanokristallkombinationen werden CdSe/ZnS und CdSe/CdS am intensivsten untersucht und häufig als sekundäre Antikörperkonjugate 3,6 verwendet. Diese QD-Nanopartikel besitzen auch fluoreszierende Eigenschaften mit anderen Anregungs- und Emissionsspektren als herkömmliche Fluorophore. QD nutzt die Anregung von Elektronen aus dem Bulk-Valenzband, um im Vergleich zu herkömmlichen Fluorophoren höhere Fluoreszenzquantenausbeuten zu zeigen. Die Nanokristallanordnung von Halbleitermetallen macht QD-vermittelte Markierungen stabiler und resistenter gegen Photobleiche6. Darüber hinaus ermöglicht der Nanokristallkern in QD und seine kristalline Struktur QD unterschiedlicher Größe eine breite Palette von Absorptionsspektren und sehr enge Emissionspeaks7. Darüber hinaus sind diese QD-Partikel groß genug, um eine hohe Elektronendichte zu erzielen, was sie in hochauflösenden Mikroskopietechniken, einschließlich der Transmissionselektronenmikroskopie 5,8,9, nützlich macht. Diese QD-Nanokristalle sind auch kommerziell in mehreren Größen mit unterschiedlichen Fluoreszenzemissionsspektren und -formen erhältlich, was sie zu einem großartigen Kandidaten für die Markierung mit mehreren Antikörpernmacht 10,11.
Die QD-Technologie erlangte in der biologischen Forschung aufgrund ihrer vielfältigen funktionellen Eigenschaften große Bedeutung, einschließlich der Verwendung in der Bildgebung lebender Zellen, der Untersuchung von Transportmechanismen in der Zelle, des Membrantransports der Diffusionsbewegung des Proteins, der funktionellen Heterogenität von Zellen und der Markierung intrazellulärer Organellen 3,12,13,14,15,16 . QD ist auch nützlich in der molekularen Diagnostik für die gezielte und Erkennung von Krebsgewebe, die Charakterisierung des molekularen Profils und des Immunstatus des Tumors und die Visualisierung von Glaskörper- und Epiretinalmembranen 3,17,18. Darüber hinaus kann QD auch in medizinischen Therapien verwendet werden, um Tumormalignome durch photodynamische Therapie und ophthalmologische Anomalien zu behandeln, indem Medikamente an die Augen abgegebenwerden 3,17,18,19.
Unter Verwendung dieser hochnützlichen QD-Nanokristalle bestimmte die vorliegende Studie die subzelluläre Lokalisation eines Proteins namens Sigma-1-Rezeptor (Sigmar1). Sigmar1 ist ein ubiquitär exprimiertes multitasking-molekulares Chaperonprotein. Umfangreiche Studien, die sich auf die subzelluläre Lokalisation von Sigmar1 in verschiedenen Geweben und Organen konzentrierten, berichteten über eine zell- und gewebetypspezifische subzelluläre Lokalisation, die molekulare Funktionen auslöste20. In verschiedenen Zellen (neuronale, Photorezeptor- und Immunzellen) und Geweben (Leber und Gehirn) mit unterschiedlichen biochemischen Ansätzen berichteten Studien über die Lokalisation von Sigmar1 auf endoplasmatischem Retikulum (ER), Mitochondrien-assoziierter ER-Membran (MAM), Kernhülle, Plasmamembran, nukleoplasmatischem Retikulum, Kern und Mitochondrien. Trotz all dieser Studien blieb die subzelluläre Lokalisation von Sigmar1 im Herzen unbekannt20. Daher wurde die subzelluläre Lokalisation von Sigmar1 im Herzgewebe mittels QD-vermittelter Immunmarkierung und anschließender TEM-Bildgebung bestimmt.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>200 Mesh copper grid</td>
			<td>Ted Pella</td>
			<td>G200HH</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>6-month-old male mice with FVB/N background</td>
			<td>Jackson Laboratory, Bar Harbor, ME</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Acetone 100%</td>
			<td>Fisher Chemicals</td>
			<td>A949</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Antibody diluent</td>
			<td>Dako</td>
			<td>S3022</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>anti-Sigmar1 antibody</td>
			<td>Cell Signaling</td>
			<td>61994S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Biotinylated goat anti-rabbit IgG antibody</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>B7389</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BSAc (10%)</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>25557</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Calcium chloride</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>C7902</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cytoseal Xyl</td>
			<td>Thermo fisher</td>
			<td>8312-4</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DER 732C36AA10:C33</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>13010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dextrose</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>G7528</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Diamond Knife</td>
			<td>Diatome</td>
			<td>Histo; Ultra 450</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DMAE</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>13300</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Electron microscope</td>
			<td>JEOL</td>
			<td>JEOL-1400 Flash</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>ERL 4221</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>15004</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethanol 100%</td>
			<td>Fisher Chemicals</td>
			<td>A405P</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glutaraldehyde 3%</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>16538-15</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycine</td>
			<td>Alfa Aesar</td>
			<td>A13816</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Hydrochloric acid</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>SA56</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Micromolds</td>
			<td>Ted Pella</td>
			<td>10505</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microtome</td>
			<td>Leica Microsystem</td>
			<td>EM UC7</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Normal goat serum</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>PCN5000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>NSA</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>19050</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Osmium tetroxide</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>19150</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Parafilm</td>
			<td>Genesse Scientific</td>
			<td>16-101</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Potassium Chloride</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>P5655</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Potassium Phosphate monobasic</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>71640</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Qdot 655 Streptavidin Conjugate</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>Q10121MP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Acetate</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP334</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Cacodylate</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>12300</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Chloride</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>BP358</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium metaperiodate</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>71859</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Phosphate dibasic</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>P9541</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Surgical blade (size 10)</td>
			<td>Aspen surgical</td>
			<td>371110</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TEM&#160; image software</td>
			<td>AMT-V700</td>
			<td>AMT TEM imaging systems</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TEM imaging camera</td>
			<td>XR80 TEM series</td>
			<td>AMT TEM imaging systems</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Toluidine Blue O solution (0.5%)</td>
			<td>Fisher Scientic</td>
			<td>S25612</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Uranyl acetate</td>
			<td>Polysciences</td>
			<td>21447</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

visualizing subcellular localization of a protein in the heart using quantum dots-mediated immuno-labeling followed by transmission electron microscopy

Die subzelluläre Lokalisation ist entscheidend für die Beschreibung der richtigen Funktion und die Bestimmung der molekularen Mechanismen eines bestimmten Proteins. Mehrere qualitative und quantitative Techniken werden verwendet, um die subzelluläre Lokalisation von Proteinen zu bestimmen. Eine der aufkommenden Techniken zur Bestimmung der subzellulären Lokalisation eines Proteins ist die Quantenpunkt-(QD)-vermittelte Immunmarkierung eines Proteins, gefolgt von der Abbildung mit Transmissionselektronenmikroskopie (TEM). QD ist ein Halbleiter-Nanokristall mit einer doppelten Eigenschaft der kristallinen Struktur und der hohen Elektronendichte, was sie für die Elektronenmikroskopie anwendbar macht. Diese aktuelle Methode visualisierte die subzelluläre Lokalisation des Sigma-1-Rezeptors (Sigmar1) mittels QD-TEM im Herzgewebe auf ultrastruktureller Ebene. Kleine Würfel der Herzgewebeschnitte einer Wildtyp-Maus wurden in 3% Glutaraldehyd fixiert, anschließend osmiert, mit Uranylacetat gefärbt, gefolgt von sequentieller Dehydratisierung mit Ethanol und Aceton. Diese dehydrierten Herzgewebeschnitte wurden in niedrigviskose Epoxidharze eingebettet, in dünne Abschnitte von 500 nm Dicke geschnitten, auf das Gitter gelegt und anschließend einer Antigen-Demaskierung mit 5% Natriummetaperiodat unterzogen, gefolgt von der Abschreckung der Restaldehyde mit Glycin. Die Gewebe wurden blockiert, gefolgt von einer sequentiellen Inkubation in primären Antikörpern, biotinylierten sekundären Antikörpern und streptavidin-konjugierter QD. Diese gefärbten Abschnitte wurden getupft getrocknet und mit hoher Vergrößerung mit TEM abgebildet. Die QD-TEM-Technik ermöglichte die Visualisierung der subzellulären Lokalisation des Sigmar1-Proteins auf ultrastruktureller Ebene im Herzen. Diese Techniken können verwendet werden, um das Vorhandensein von Proteinen und subzellulären Lokalisationen in jedem Organsystem zu visualisieren.

Die vorliegende QD-TEM-Methodik visualisierte das Vorhandensein von Sigmar1 und seine Lokalisation in den subzellulären Herzkompartimenten, indem Anti-Sigmar1-gezielte QD-Markierungen an ultradünnen Herzabschnitten erwachsener Mäuse durchgeführt wurden. Elektronendichte Anti-Sigmar1-markierte QD auf mitochondrialen Membranen (innen und außen), Lysosomen und der endoplasmatischen Retikulum/sarkoplasmatischen Retikulum (ER/SR) Membran-Mitochondrien-Grenzfläche (Abbildung 2A,B) wurden durch die QD-TEM-Bilder veranschaulicht. Darüber hinaus wurden Herzabschnitte auch mit Kaninchen-IgG und QD als Isotyp-Kontrolle für Anti-Sigmar1-Kaninchen-Primärantikörper markiert (Abbildung 2C, D). Daher hob die QD-TEM-Bildgebung die Lokalisation von endogenem Sigmar1 und seine Anreicherung hauptsächlich an den Lysosomen und den Mitochondrienmembranen hervor.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/64085/64085fig01.jpg"> Abbildung 1: Schematische Darstellung der aufeinanderfolgenden Schritte und Verfahren zur Durchführung von QD-TEM. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/64085/64085fig01large.jpg" target="_blank">Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/64085/64085fig02.jpg"> Abbildung 2: Sigmar1 immun-markierte QD in adulten Mäuseherzgeweben. (A,B) Repräsentative TEM-Bilder, die Sigmar1-markierte QD auf Mitochondrien (äußere und innere Membran), Mitochondrien-assoziierten endoplasmatischen Retikulum (ER) / sarkoplasmatischen Retikulummembranen (SR) und Lysosomen zeigen. (C,D) TEM-Aufnahme der Herzabschnitte der Isotypkontrolle, markiert mit QDs und Kaninchen-IgG. Maßstabsleiste: 200 nm. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/64085/64085fig02large.jpg" target="_blank">Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.</a>
Ergänzende Datei 1: Zusammensetzung von PBS und anderen Lösungen zur Gewebetrocknung. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/64085/64085_Supplementary%20File%201.docx" target="_blank">Bitte klicken Sie hier, um diese Datei herunterzuladen.</a>

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Visualizing Subcellular Localization of a Protein in the Heart Using Quantum Dots-Mediated Immuno-Labeling Followed by Transmission Electron Microscopy

Das vorliegende Protokoll beschreibt eine Methode zur Immunmarkierung eines Proteins in den Herzgewebeschnitten unter Verwendung von Quantenpunkten. Diese Technik bietet ein nützliches Werkzeug, um die subzelluläre Lokalisation und Expression eines Proteins auf ultrastruktureller Ebene zu visualisieren.

Visualisierung der subzellulären Lokalisation eines Proteins im Herzen mittels Quantenpunkt-vermittelter Immunmarkierung gefolgt von Transmissionselektronenmikroskopie

The subcellular localization is critical to delineating proper function and determining the molecular mechanisms of a particular protein. Several ...

Die Bestimmung der subzellulären Lokalisation eines Proteins ist entscheidend für die Beschreibung seiner eigentlichen Funktion und der daran beteiligten Mechanismen. Diese Methode kann uns helfen, die subzelluläre Lokalisation eines Proteins auf der Ultrastrukturebene sichtbar zu machen. Quantenpunkt-vermittelte Immunmarkierung ist stabiler, resistent gegen Photobleaching, hat eigene Emissionsspektren, liefert eine hohe Elektronendichte und zeigt eine höhere Effizienz und Retention auf Geweben mit besserer Penetration in Gewebe.Mehrere Schritte des Prozesses, d. h. Fixierung, Ätzung, Blockierung und optimale Konzentration von Quantenpunkten, sind herausfordernde Schritte zur Optimierung. Es ist ratsam, mehrere Zeitpunkte und Konzentrationen der verwendeten Reagenzien auszuprobieren. Eine weitere Herausforderung ist der Umgang mit Gittern, bei denen nur Geduld und natürlich Übung funktionieren.Chowdhury Abdullah, ein Postmitarbeiter, Naznin Remex, ein Doktorand aus meinem Labor, und Brandon Hartman, Elektronenmikroskopie-Supervisor von unseren Elektronenmikroskopie-Diensten, werden das Verfahren demonstrieren. Nach der Betäubung der Mäuse und dem Öffnen der Brusthöhle das Herz mit eiskaltem 3% Glutaraldehyd in 0,1 Molar Natriumcacodylatpuffer für zwei Minuten überladen. Verwenden Sie eine 25-Gauge-Nadel von fünf mal acht Zoll, um die Fixiermittel mit Schwerkraftdruck in das Herz einzuführen.Unmittelbar nachdem sich das Herz mit dem Fixiermittel füllt, heben Sie die Herzspitze an, um den Druck zu lindern. Schneiden Sie die darunter liegenden Gefäße ein bis zwei Millimeter vom Herzen ab und lassen Sie die Flüssigkeiten abfließen. Seziere das Herz.Entfernen Sie die Vorhöfe und lassen Sie die Ventrikel in eine Petrischale fallen, die eiskaltes 3% Glutaraldehyd und 0,1 molares Natriumcacodylat enthält. Machen Sie einen Schmetterlingsschnitt nach 30 bis 60 Minuten Fixierung und legen Sie den Ventrikel wieder in die Petrischale. Hacken Sie das Herz mit einer chirurgischen Klinge in kleine Würfel von einem Kubikmillimeter.Fixieren und tauchen Sie das zerlegte Herzgewebe 24 Stunden lang bei vier Grad Celsius in Glutaraldehyd- und Cacodylatlösung. Nach 24 Stunden Fixierung waschen Sie das Gewebe zweimal für 20 Minuten in einem 0,1-molaren Natriumcacodylatpuffer. Entfernen Sie das Gewebe aus dem Natriumcacodylatpuffer und tauchen Sie vier Stunden bei Raumtemperatur in 2% Osmiumtetroxidlösung ein.Nach der Osmulation tauchen Sie das Gewebe für 10 Minuten bei Raumtemperatur in 2% ige Natriumacetatlösung. Als nächstes tauchen Sie das Gewebe für eine Stunde bei Raumtemperatur in 2% Uranylacetatlösung. Nach der Uranylacetatfärbung dehydrieren Sie das Gewebe nacheinander durch die abgestuften Alkohole und Aceton.Betten Sie das dehydrierte Gewebe in niedrigviskoses Epoxidharz ein, wie im Manuskript beschrieben. Geben Sie das Gewebe in acht Millimeter Mikroformen in frisches Harz und härten Sie das eingebettete Gewebe bei 70 Grad Celsius über Nacht aus. Nachdem Sie den interessierenden Bereich gefunden haben, produzieren Sie mit einem Ultra-45-Grad-Messer hellgoldene ultradünne Schnitte.Platzieren Sie diese ultradünnen Abschnitte auf der stumpfen Seite eines 200-mesh-Kupfergitters. Beginnen Sie die Färbung, indem Sie das Antigen demaskieren, indem Sie 20 Mikroliter Ätzlösungsmetaperiodat auf einen sauberen Paraffinfilm geben. Legen Sie den getrockneten Rost mit Gewebeschnitten auf den Tröpfchen der Ätzlösung.Lassen Sie das Schnittgitter 30 Minuten bei Raumtemperatur auf der Lösung. Waschen Sie die geätzten Gewebeabschnitte, indem Sie sie 60 Sekunden lang auf einen Tropfen destilliertes Wasser legen. Blockieren Sie die Restaldehydehyde, indem Sie das Schnittgitter für 10 Minuten bei Raumtemperatur auf einen Tröpfchen mit 0,05 molärer Glycinlösung legen.Tupfen Sie die Ränder des Gitters auf Filterpapier ab, um die restliche Glycinlösung zu entfernen. Legen Sie das Schnittgitter für 25 Minuten bei Raumtemperatur in 10 bis 20 Mikroliter Blockierlösung. Tupfen Sie die Gitterränder auf Filterpapier ab und legen Sie die Gitterabschnitte auf Antikörperverdünnungsmittel zur Konditionierung bei Raumtemperatur für 10 Minuten.Inkubieren Sie die Gitterschnitte mit primären Antikörpern für eine Stunde 30 Minuten in einer befeuchteten Kammer. Trocknen Sie das Gitter und waschen Sie die Gitterabschnitte zweimal für jeweils fünf Minuten mit Antikörperverdünnungsmittel. Inkubieren Sie die Gitterschnitte mit biotinylierten sekundären Antikörpern für eine Stunde in einer befeuchteten Kammer.Sobald das Gitter getrocknet ist, waschen Sie die Gitterabschnitte zweimal für jeweils fünf Minuten mit Antikörperverdünnungsmittel. Inkubieren Sie die Gitterabschnitte in handelsüblicher Streptavidin-konjugierter QD für eine Stunde in einer Kammer bei Raumtemperatur. Verhindern Sie Lichteinwirkung, indem Sie die Kammer mit Aluminiumfolie abdecken.Nachdem Sie die Gitterkanten mit Filterpapier getrocknet haben, waschen Sie die Gitterabschnitte, indem Sie sie zwei Minuten lang auf Wassertröpfchen legen und die Gitterkanten zum Trocknen abtupfen. Führen Sie den Probenhalter in die Mikroskopsäule ein und betätigen Sie den Pumpschalter, um das Goniometer auszuwerten, gefolgt von einem vollständigen Einsetzen des Probenhalters in die Mikroskopsäule. Konzentrieren Sie sich gut auf den gewünschten Bereich.Nehmen Sie das Bild mit einer Hochgeschwindigkeits-Digitalkamera auf und speichern Sie die Datei im TIF-Format. Die mitochondrialen Membranen, Lysosomen und die endoplasmatische Retikulums- oder sarkoplasmatische Retikulummembran-Mitochondrienschnittstelle zeigten das Vorhandensein von Sigmar1-markierten Quantenpunkten. Herzschnitte wurden mit Kaninchen-Immunglobulin G und Quantenpunkten als Isotypkontrolle für Anti-Sigmar1-Kaninchen-Primärantikörper visualisiert.Eine wichtige Sache, die bei der Arbeit an diesem Protokoll zu berücksichtigen ist, ist die Demaskierungszeit für Antigen. Wenn die Gewebeschnitte zu lange geätzt werden, erzeugt die Metaperiodatlösung Perforationen in dünnen Gewebeschnitten. Quantenpunkt-vermittelte Markierung gewinnt an Aufmerksamkeit bei der Tumorerkennung, der molekularen und Immunstatus-Profilerstellung von Tumoren und der Gewebebildgebung und ebnet einen neuen Weg für die medizinische Diagnostik.Quantenpunkte sind auch nützlich bei der Behandlung von Tumoren durch photodynamische Therapien und ophthalmische Anomalien, indem sie Medikamente an die Augen abgeben.

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