Name: line shape analysis of dynamic nmr spectra for characterizing coordination sphere rearrangements at a chiral rhenium polyhydride complex
Uploaded: 2022-07-27T14:25:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Line Shape Analysis of Dynamic NMR Spectra for Characterizing Coordination Sphere Rearrangements at a Chiral Rhenium Polyhydride Complex at JoVE.com

يشكر المؤلفون قسم الكيمياء والفيزياء وبرنامج منح الإبداع والبحث (Naik ، Moehring) في جامعة مونماوث على الدعم المالي لهذا العمل.

1. إعداد العينات
<ol><li>إعداد ReH7 (PPh3)235<ol><li>اجمع 0.15 غرام من بوروهيدريد الصوديوم و 0.41 غرام من ReOCl3 (PPh3)2 في قارورة مستديرة القاع بعنقين أو ثلاث رقبتين 100 مل مزودة بحاجز مطاطي ومنفذ غاز ، أو قارورة Kjeldahl سعة 100 مل (مع منفذ غاز ذراع جانبي) مزودة ...

هناك أربعة عناصر في إعداد ReH7 (PPh3)2 يمكن أن تؤثر على كمية ونقاء المواد التي يتم إنتاجها. أولا ، يعد استخدام حمام ثلجي خلال أول 15 دقيقة من التفاعل أمرا مهما لإزالة الحرارة من التفاعل الذي يحدث بين بوروهيدريد الصوديوم والماء. تؤدي درجات الحرارة الأولية المرتفعة إلى انخفاض إنت...

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Bruker Avance II 400 MHz NMR spectrometer</td>
			<td>Bruker Biospin</td>
			<td></td>
			<td>The instrument includes a two channel probe (1H and X) with the X channel tunable from 162 MHz to 10 Mhz. The instrument is also VT capable with a dewar and heat exchanger for VT work.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>d8-toluene</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>434388</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Powerstat variable transformer</td>
			<td>Powerstat</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sec-butyl amine</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>B89000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium borohydride</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>452882</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tetrahydrofuran</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>186562</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thermowell C3AM 100 mL</td>
			<td>Thermowell</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Topspin 3.0 or 4.1.4 with dNMR</td>
			<td>Bruker Biospin</td>
			<td></td>
			<td>Data was acquired with Topspin version 3.0 and data handling was performed on a second computer that was running Topspin version 4.1.4..</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Trichlorooxobis(triphenylphosphine) rhenium(V)</td>
			<td>MilliporeSigma</td>
			<td>370193</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Vacuubrand PC3000 vacuum pump with a CVC 3000 controller</td>
			<td>Vacuubrand</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

line shape analysis of dynamic nmr spectra for characterizing coordination sphere rearrangements at a chiral rhenium polyhydride complex

التحليل الطيفي للرنين المغناطيسي النووي (NMR) هو الطريقة النموذجية لتوصيف عمليات إعادة الترتيب الديناميكي للذرات داخل مجال التنسيق لمجمعات البولي هيدريد الفلزية الانتقالية. يمكن أن يؤدي تركيب شكل الخط لأطياف الرنين المغناطيسي النووي الديناميكي إلى تقديرات لمعلمات التنشيط لعمليات إعادة الترتيب الديناميكي. قد يحدد مزيج من التحليل الطيفي الديناميكي 31P-{1 H} NMR لذرات الفوسفور المرتبطة بالمعادن مع التحليل الطيفي الديناميكي 1H-{31P} NMR لروابط الهيدريد إعادة ترتيب روابط الهيدريد التي تحدث بالتزامن مع إعادة ترتيب ذرة الفوسفور. بالنسبة للجزيئات التي تظهر مثل هذا الزوج المقترن من إعادة الترتيب ، يمكن استخدام التحليل الطيفي الديناميكي للرنين المغناطيسي النووي لاختبار النماذج النظرية لإعادة ترتيب الليغاند. يمكن للتحليل الطيفي الديناميكي 1H-{31P} NMR وتركيب شكل الخط أيضا تحديد وجود عملية تبادل تحرك رباط هيدريد معين خارج مجال التنسيق الداخلي للمعدن من خلال تبادل البروتون مع جزيء مذيب مثل الماء المغامر. يتم تقديم إعداد مركب جديد ، ReH5 (PPh3) 2 (أمين سيك-بوتيل) ، والذي يجسد عمليات إعادة ترتيب ديناميكية متعددة جنبا إلى جنب مع تركيب شكل الخط لأطياف الرنين المغناطيسي النووي الديناميكية للمعقد. يمكن تحليل نتائج تركيب شكل الخط بواسطة معادلة Eyring لتقدير معلمات التنشيط للعمليات الديناميكية المحددة.

أفضل طريقة لوصف كل من منتجات بولي هيدريد الرينيوم الموصوفة في هذه المخطوطة هي 1 H-{31 P} و 31P-{1H} NMR spectroscopy. في محلول6-بنزين في درجة حرارة الغرفة، يظهر رنين رباط الهيدريد ل ReH7 (PPh3)2 كثلاثي ذو حدين عند δ = -4.2 جزء في المليون مع 2 JPH = 18 Hz × 1H NMR التحليل ?...

Watch this Scientific Journal Video about Line Shape Analysis of Dynamic NMR Spectra for Characterizing Coordination Sphere Rearrangements at a Chiral Rhenium Polyhydride Complex at JoVE.com

Line Shape Analysis of Dynamic NMR Spectra for Characterizing Coordination Sphere Rearrangements at a Chiral Rhenium Polyhydride Complex

يعمل تحليل شكل الخط لأطياف الرنين المغناطيسي النووي التي تم جمعها عبر مجموعة من درجات الحرارة كدليل لإعادة ترتيب ذرات كرة التنسيق الداخلي في مركب متعدد هيدريد الرينيوم (V) ، ReH5 (PPh3) 2 (sec-butyl amine). يستخدم تحليل شكل الخط أيضا لتحديد معلمات التنشيط ΔH‡ و ΔS‡ و ΔG‡ لإعادة ترتيب الذرة هذه.

تحليل شكل الخط لأطياف الرنين المغناطيسي النووي الديناميكية لتوصيف عمليات إعادة ترتيب مجال التنسيق في مركب بوليهيدريد الرينيوم الدائري

Dynamic solution nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy is the typical method of characterizing the dynamic rearrangements of atoms within the ...

تفحص هذه الطريقة السلوك الديناميكي للذرات الثماني المرتبطة بذرة معدنية مركزية من خلال شكل خط مناسب لطيف الرنين المغناطيسي النووي الديناميكي. تسمح الطبيعة البصرية لتقنية تركيب شكل الخط بالتطوير الجاهز لنماذج التبادل الديناميكي في مقارنات نتائج النموذج مع الأطياف المرصودة. تركيب شكل الخط لأطياف الرنين المغناطيسي النووي هو طريقة تستخدم للتحقيق في مجموعة متنوعة من العمليات الجزيئية الديناميكية مع طاقات التنشيط في حدود 5 إلى 25 سعرة حرارية لكل مول.أتوقع أن يكون لدى المستخدمين المبتدئين أسئلة تتعلق بكيفية إكمال المدخلات لتطبيق تركيب شكل الخط. التدرب على التطبيق ، خاصة مع مستخدم ذي خبرة ، مفيد. للبدء ، اجمع 0.15 جرام من بوروهيدريد الصوديوم و 0.41 جرام من أوكسوتريكلوروبيس ثلاثي فينيل فوسفين رينيوم-V في قارورة مستديرة القاع سعة 100 ملليلتر ذات رقبتين أو ثلاث رقبتين مزودة بحاجز مطاطي ومنفذ غاز ، أو قارورة Kjeldahl سعة 100 ملليلتر مزودة بحاجز مطاطي.في غطاء الدخان ، استخدم قطعة من أنابيب الضغط المطاطية لتوصيل منفذ الغاز في وعاء التفاعل بأحد السدادات الخاصة بمشعب زجاجي مزدوج للفراغ وغاز النيتروجين. قم بتوصيل مشعب الفراغ الزجاجي بمضخة فراغ مزودة بأنابيب ضغط مطاطية ، ومشعب نيتروجين زجاجي بأسطوانة غاز نيتروجين منظمة ، وغاز الخروج من مشعب غاز النيتروجين إلى جهاز إيقاف يمكن استخدامه لتوجيه الغاز المنفث من خلال عمود طوله سنتيمترين من الزيت المعدني أو الزئبق. ثم افتح الصنبور على أسطوانة النيتروجين واضبط الضغط على الغاز المتدفق إلى 34 رطلا لكل بوصة مربعة وقم بتنفيس تدفق غاز النيتروجين عبر فقاعة الزئبق.بعد ذلك ، قم بإخلاء الغاز داخل وعاء التفاعل عن طريق ضبط الموقوف على المشعب الزجاجي لتوصيل الوعاء بمشعب الفراغ ، وملء وعاء التفاعل بغاز النيتروجين عن طريق تغيير مشعب الزجاج المتقاطع الذي يربط مشعب الغاز بوعاء التفاعل. ثم ، أضف ثمانية ملليلترات من الماء غير المؤكسج وثمانية ملليلترات من رباعي هيدروفوران غير المؤكسج إلى المواد الصلبة في وعاء التفاعل عبر حقنة. عند تحقيق لون برتقالي إلى أسمر لخليط التفاعل ، قم بتصفية الخليط من خلال قمع زجاجي متوسط المركز سعة 30 ملليلتر واغسل المادة الصلبة المستردة ثلاث مرات لكل منها بأجزاء 15 ملليلتر من الماء والميثانول والأثير الإيثيلي.بعد ذلك ، قم بتركيب القارورة في مكثف مجهز بمنفذ غاز وأضف حجما قدره ثمانية ملليلترات من رباعي هيدروفوران غير المؤكسج إلى وعاء التفاعل عبر حقنة عن طريق تكسير المفصل بين القارورة ذات القاع المستدير والمكثف. ثم ، صب خليط التفاعل في 25 ملليلتر من الميثانول في قارورة Erlenmeyer سعة 125 ملليلتر وأضف خمسة ملليلترات من الماء للحث على تكوين راسب أصفر نضر. لإعداد مقياس الطيف ، أدخل معدل تدفق قدره 200 لتر في الساعة لغاز التبريد ودرجة حرارة مستهدفة تبلغ 290 كلفن للمسبار ، مع السماح لمقياس الطيف بالاستقرار عند درجة الحرارة المستهدفة لمدة دقيقتين.بعد مسح العينة عند 290 كلفن، قم بتغيير اسم الملف لكل طيف من الأطياف التي تم قياسها مسبقا عن طريق إضافة درجة الحرارة إلى نهاية اسم الملف والحصول على مجموعة من ثلاثة أطياف عند 290 كلفن. ثم قم بزيادة معدل تدفق غاز التبريد بأكثر من أو يساوي 30 لترا في الساعة حسب الحاجة لتحقيق الاستقرار عند درجة الحرارة التالية وتقليل درجة الحرارة المستهدفة بمقدار 10 كلفن. لتحليل شكل الخط للأطياف المقاسة، انقر فوق الزر تحرير النطاق لإدخال التحولات الكيميائية العلوية والسفلية لتركيب شكل الخط، وانقر فوق الزر موافق ( OK) لقبول هذه الحدود.بعد ذلك ، ابدأ نموذجا لتركيب شكل الخط بالنقر فوق علامة التبويب SpinSystem في نافذة تركيب شكل الخط وانقر فوق الزر "إضافة" للسماح ببناء نظام دوران نموذجي. بعد ذلك، قم بإلغاء تحديد LB وأدخل قيمة توسيع الخط يدويا باستخدام الماوس وزر LB على شريط أدوات تركيب شكل الخط. أضف النواة الأولى إلى النموذج بالنقر فوق علامة التبويب Nucleus ، متبوعة بالنقر فوق الزر "إضافة" ، وستظهر مجموعة من القيم الافتراضية للنواة الأولى.بعد ذلك ، اضبط التحول الكيميائي للنواة الأولى عن طريق إدخال قيمة للتحول الكيميائي في مربع NuISO الجديد أو باستخدام أداة التحول الكيميائي على شريط أدوات تركيب شكل الخط. بالنسبة للنواة الأولى، أدخل عدد النوى المكافئة للنواة 1 مع كل نواة نصف دوران تعادل 0.5 في العد، وأدخل مجموع اللفات في مربع الدوران الزائف من أجل حساب جميع النوى المكافئة. باستخدام المربع In Molecule ، قم بتعيين الرنين الذي ينشأ من جزيئات مختلفة لفصل الجزيئات باستخدام تسميات مثل 1 و 2 وما إلى ذلك لجزيئات مختلفة ، وبالنسبة للرنين الذي ينشأ من جزيء واحد ، قم بتعيين 1 للجميع في قيم الجزيء.بعد ذلك ، أضف النوى الثانية وجميع النوى اللاحقة إلى النموذج بالنقر فوق علامة التبويب Nucleus ، متبوعا بالنقر فوق الزر إضافة. بعد ذلك ، قم بتضمين اقتران الدوران بين النوى إما عن طريق إدخال الاقتران في مربع JM المناسب أو عن طريق ضبط زر اقتران المقشر على شريط أدوات تركيب شكل الخط. ابدأ عملية وصف تبادلات الذرات بالنقر فوق علامة التبويب تفاعل وانقر فوق مربع الاختيار.إذا كان من المقرر أن يكون ثابت السعر للتبادل متنوعا في شكل خط مناسب ، فأدخل عدد النوى التي سيتم تبادلها في مربع التبادلات لأول تبادل في النموذج. بعد ذلك ، حدد التبادلات بين علامات تبويب النواة في المربعات الموجودة أسفل مربع التبادلات ، مما يضمن أن تكون التبادلات دورية ، حيث أنه إذا تم نقل النواة من النواة الأولى ، فيجب نقل نواة أخرى إلى النواة الأولى. استخدم زر سرعة التبادل على شريط أدوات تركيب شكل الخط لتغيير القيمة الأولية ل K من أجل ضبط قيمة K بشكل متكرر، حتى إذا تم تحديد خانة الاختيار لثابت المعدل.أضف المزيد من التبادلات إلى النموذج بالنقر فوق علامة التبويب رد الفعل ، متبوعا بالنقر فوق الزر إضافة. استخدم الأدوات الموجودة على شريط أدوات ملائمة شكل الخط لضبط متغيرات البدء وبدء ملاءمة شكل الخط التكراري بالنقر فوق الزر بدء ملاءمة الطيف على شريط أدوات تركيب شكل الخط. استمر في التركيب التكراري حتى لا يتم العثور على أي تغيير في أفضل تداخل بين الطيف والنموذج أو حتى يتم الوصول إلى 1000 تكرار.إذا توقف التركيب عند 1000 تكرار، فتابع المزيد من التكرارات باستخدام الزر بدء ملاءمة الطيف، ويتم عرض طيف النموذج مع الطيف الفعلي للمقارنة. تم قياس أطياف الفوسفور-31 NMR الديناميكية المنفصلة بالبروتون لمجمع الرينيوم عند عدة درجات حرارة. تظهر الأطياف تلاحم الرنينين اللذين ينشآن من ذرات الفوسفور النمطي في رنين واحد في درجات حرارة أعلى.تم تحديد الاعتماد على درجة الحرارة للفرق في التحولات الكيميائية بين رنين فوسفوريين منفصلين عن البروتون. يسمح الاستقراء بتقدير التحولات الكيميائية للرنين الفردي في درجات حرارة أعلى. تم تحديد الاعتماد على درجة الحرارة للتحولات الكيميائية لرنين الهيدريد.تم استخدام التحولات الكيميائية المحسوبة من أفضل النوبات الخطية لتناسب شكل الخط للأطياف المرصودة. تمت مقارنة نتائج الشكل الخطي المناسب للتبادل الزوجي لأربطة هيدريد الموقع A ، وتبادل الباب الدوار لثلاثة روابط هيدريد متجاورة ، وتبادل البروتون بين بروتون واحد من الماء ورباط الهيدريد الفريد من نوعه مع منطقة الهيدريد المرصودة لسلسلة من أطياف الفوسفور -31 NMR المنفصلة عن البروتون من 225 كلفن إلى 240 كلفن. مقارنة بين نماذج إعادة ترتيب روابط الهيدريد، مع وبدون تبادل البروتونات، مقابل طيف الرنين المغناطيسي النووي الفوسفوري-31 المنفصل بالبروتون الذي تم قياسه عند 225 كلفن.تظهر ثوابت المعدل الناشئة عن تركيب الشكل الخطي لأطياف الرنين المغناطيسي النووي الفوسفورية-31 المنفصلة بالبروتون ملاءمة جيدة لمعادلة آيرينغ. يجب ألا تتجاوز تغيرات درجة الحرارة للعينة 10 كلفن ، ويجب الحفاظ على درجة الحرارة المستهدفة لمدة دقيقتين على الأقل لحماية مسبار الأداة.

Research

JoVE Journal

Chemistry

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Structure and Coordination Determination of Peptide-metal Complexes Using 1D and 2D 1H NMR

Copper (I) binding by metallochaperone transport proteins prevents copper oxidation and release of the toxic ions that may participate in harmful redox ...

Atomically Defined Templates for Epitaxial Growth of Complex Oxide Thin Films

قوالب المعرفة بالذرة لالفوقي النمو من أكسيد مجمع الأغشية الرقيقة

Atomically defined substrate surfaces are prerequisite for the epitaxial growth of complex oxide thin films. In this protocol, two approaches to obtain ...

Dissolution Dynamic Nuclear Polarization Instrumentation for Real-time Enzymatic Reaction Rate Measurements by NMR

حل الحيوي النووية الاستقطاب الأجهزة لفي الوقت الحقيقي القياسات الأنزيمية ردود الفعل قيم وNMR

The main limitation of NMR-based investigations is low sensitivity. This prompts for long acquisition times, thus preventing real-time NMR measurements of ...

Rapid High-throughput Species Identification of Botanical Material Using Direct Analysis in Real Time High Resolution Mass Spectrometry

سريع سرعة عالية الإنتاجية الأنواع النباتية تحديد المواد عن طريق تحليل المباشر في الوقت الحقيقي عالية الدقة قياس الطيف الكتلي

We demonstrate that direct analysis in real time-high resolution mass spectrometry can be used to produce mass spectral profiles of botanical material, ...

On-line Analysis of Nitrogen Containing Compounds in Complex Hydrocarbon Matrixes

على الخط تحليل النيتروجين التي تحتوي على مركبات في مصفوفة الهيدروكربونية مجمع

The shift to heavy crude oils and the use of alternative fossil resources such as shale oil are a challenge for the petrochemical industry. The ...

Synthesis of a Water-soluble Metal&#8211;Organic Complex Array

Synthesis of a Water-soluble MetalÃƒÆ’Ã‚Â¢ÃƒÂ¢Ã¢â‚¬Å¡Ã‚Â¬ÃƒÂ¢Ã¢â€šÂ¬Ã…â€œOrganic Complex Array

توليف مجموعة معقدة للذوبان في الماء المعدنية العضوية

We demonstrate a method for the synthesis of a water-soluble multimetallic peptidic array containing a predetermined sequence of metal centers such as ...

Real-time Breath Analysis by Using Secondary Nanoelectrospray Ionization Coupled to High Resolution Mass Spectrometry

تحليل التنفس في الوقت الحقيقي باستخدام التأين نانوليكتروسبراي الثانوية بالإضافة إلى دقة عالية الطيف الكتلي

Exhaled volatile organic compounds (VOCs) have aroused considerable interest, since they can serve as biomarkers for disease diagnosis and environmental ...

Synthesis of Terpolymers at Mild Temperatures Using Dynamic Sulfur Bonds in Poly(S-Divinylbenzene)

Synthesis of Terpolymers at Mild Temperatures Using Dynamic Sulfur Bonds in PolyS-Divinylbenzene

توليف البوليمرات في درجات حرارة معتدله باستخدام السندات الكبريت الديناميكية في بولي (S-ديفييلبنزين)

Elemental sulfur (S8) is a byproduct of the petroleum industry with millions of tons produced annually. Such abundant production and limited applications ...

Application of Voltage in Dynamic Light Scattering Particle Size Analysis

تطبيق الجهد في الضوء الديناميكي التشتت تحليل حجم الجسيمات

Dynamic light scattering (DLS) is a common method for characterizing the size distribution of polymers, proteins, and other nano- and microparticles. ...

Excitonic Hamiltonians for Calculating Optical Absorption Spectra and Optoelectronic Properties of Molecular Aggregates and Solids

هاميلتونيون مثيرون لحساب أطياف الامتصاص البصري والخصائص الإلكترونية البصرية للمجاميع الجزيئية والمواد الصلبة

Rational design of disordered molecular aggregates and solids for optoelectronic applications relies on our ability to predict the properties of such ...