Name: an enrichment method for small extracellular vesicles derived from liver cancer tissue
Uploaded: 2023-02-03T12:50:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about An Enrichment Method for Small Extracellular Vesicles Derived from Liver Cancer Tissue at JoVE.com

Yazarlar, Gannan Tıp Üniversitesi Birinci Bağlı Hastanesi'ne bu çalışmayı destekledikleri için teşekkür eder. Bu çalışma Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı tarafından desteklenmiştir (hibe numaraları 82260422).

İnsan karaciğer kanseri dokusu, Gannan Tıp Üniversitesi Birinci Bağlı Hastanesi'nde karaciğer malignitesi teşhisi konan hastalardan toplandı. Tüm hastalar bilgilendirilmiş onam formu imzaladı ve insan doku örneklerinin toplanması Gannan Tıp Üniversitesi Birinci Bağlı Hastanesi'nin etik komitesi tarafından onaylandı. Bu protokolde kullanılan tüm malzemeler, ekipmanlar ve yazılımlarla ilgili ayrıntılar için Malzeme Tablosuna bakın.
1. Hazırlık...

<ol>
	<li>Isaac, R., Reis, F. C. G., Ying, W., Olefsky, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exosomes+as+mediators+of+intercellular+crosstalk+in+metabolism.">Exosomes as mediators of intercellular crosstalk in metabolism.</a> Cell Metabolism. 33 (9), 1744-1762 (2021).</li><li>Hou, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Advances+in+exosome+isolation+methods+and+their+applications+in+proteomic+analysis+of+biological+samples.">Advances in exosome isolation methods and their applications in proteomic analysis of biological samples.</a> Analytical and Bioanalytical Chemistry. 411 (21), 5351-5361 (2019).</li><li>Zhang, L., Yu, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Exosomes+in+cancer+development,+metastasis,+and+immunity.">Exosomes in cancer development, metastasis, and immunity.</a> Biochimica et Biophysica Acta - Reviews on Cancer. 1871 (2), 455-468 (2019).</li><li>Yang, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=and+perspective+on+exosome+isolation+-+Efforts+for+efficient+exosome-based+theranostics.">and perspective on exosome isolation - Efforts for efficient exosome-based theranostics.</a> Theranostics. 10 (8), 3684-3707 (2020).</li><li>Crescitelli, R., L&#228;sser, C., L&#246;tvall, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+characterization+of+extracellular+vesicle+subpopulations+from+tissues.">Isolation and characterization of extracellular vesicle subpopulations from tissues.</a> Nature Protocols. 16 (3), 1548-1580 (2021).</li><li>Crescitelli, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Subpopulations+of+extracellular+vesicles+from+human+metastatic+melanoma+tissue+identified+by+quantitative+proteomics+after+optimized+isolation.">Subpopulations of extracellular vesicles from human metastatic melanoma tissue identified by quantitative proteomics after optimized isolation.</a> Journal of Extracellular Vesicles. 9 (1), 1722433 (2020).</li><li>Jang, S. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mitochondrial+protein+enriched+extracellular+vesicles+discovered+in+human+melanoma+tissues+can+be+detected+in+patient+plasma.">Mitochondrial protein enriched extracellular vesicles discovered in human melanoma tissues can be detected in patient plasma.</a> Journal of Extracellular Vesicles. 8 (1), 1635420 (2019).</li><li>Muralidharan-Chari, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=ARF6-regulated+shedding+of+tumor+cell-derived+plasma+membrane+microvesicles.">ARF6-regulated shedding of tumor cell-derived plasma membrane microvesicles.</a> Current Biology. 19 (22), 1875-1885 (2009).</li><li>Matejovi&#269;, A., Wakao, S., Kitada, M., Kushida, Y., Dezawa, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+separation+methods+for+tissue-derived+extracellular+vesicles+in+the+liver,+heart,+and+skeletal+muscle.">Comparison of separation methods for tissue-derived extracellular vesicles in the liver, heart, and skeletal muscle.</a> FEBS Open Bio. 11 (2), 482-493 (2021).</li><li>Zhou, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Brown+adipose+tissue-derived+exosomes+mitigate+the+metabolic+syndrome+in+high+fat+diet+mice.">Brown adipose tissue-derived exosomes mitigate the metabolic syndrome in high fat diet mice.</a> Theranostics. 10 (18), 8197-8210 (2020).</li><li>Chen, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+the+variability+of+small+extracellular+vesicles+derived+from+human+liver+cancer+tissues+and+cultured+from+the+tissue+explants+based+on+a+simple+enrichment+method.">Comparison of the variability of small extracellular vesicles derived from human liver cancer tissues and cultured from the tissue explants based on a simple enrichment method.</a> Stem Cell Reviews and Reports. 18 (3), 1067-1077 (2022).</li><li>Fang, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tumor-derived+exosomal+miR-1247-3p+induces+cancer-associated+fibroblast+activation+to+foster+lung+metastasis+of+liver+cancer.">Tumor-derived exosomal miR-1247-3p induces cancer-associated fibroblast activation to foster lung metastasis of liver cancer.</a> Nature Communications. 9 (1), 1247-1243 (2018).</li><li>Huang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=RNA+sequencing+of+plasma+exosomes+revealed+novel+functional+long+noncoding+RNAs+in+hepatocellular+carcinoma.">RNA sequencing of plasma exosomes revealed novel functional long noncoding RNAs in hepatocellular carcinoma.</a> Cancer Science. 111 (9), 3338-3349 (2020).</li><li>Chen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=HCC-derived+exosomes+elicit+HCC+progression+and+recurrence+by+epithelial-mesenchymal+transition+through+MAPK/ERK+signalling+pathway.">HCC-derived exosomes elicit HCC progression and recurrence by epithelial-mesenchymal transition through MAPK/ERK signalling pathway.</a> Cell Death &amp; Disease. 9 (5), 513 (2018).</li><li>Jingushi, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Extracellular+vesicles+isolated+from+human+renal+cell+carcinoma+tissues+disrupt+vascular+endothelial+cell+morphology+via+azurocidin.">Extracellular vesicles isolated from human renal cell carcinoma tissues disrupt vascular endothelial cell morphology via azurocidin.</a> International Journal of Cancer. 142 (3), 607-617 (2018).</li><li>Camino, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Deciphering+adipose+tissue+extracellular+vesicles+protein+cargo+and+its+role+in+obesity.">Deciphering adipose tissue extracellular vesicles protein cargo and its role in obesity.</a> International Journal of Molecular Sciences. 21 (24), 9366 (2020).</li></ol>

Bu protokol, karaciğer kanseri dokusundan sEV'leri çıkarmak için tekrarlanabilir bir yöntemi tanımlar. Yüksek kaliteli sEV'ler keskin doku izolasyonu, sindirim enzimleri ile tedavi, diferansiyel ultrasantrifüjleme ve 0.22 μm filtre membranı filtrasyonu ve saflaştırılması ile elde edilir. Aşağı akış analizi için, sEV'lerin yüksek saflığını sağlamak son derece önemlidir. Diferansiyel santrifüjleme sürecinde, süpernatanın yüzeyinde bir beyaz madde tabakası (bilinmeyen bileşim) görünecekti...

Küçük hücre dışı veziküller (sEV'ler) yaklaşık 30 nm ila 150 nm çapındadır ve çeşitli hücreler tarafından salgılanır1. Doku hücreleri ile iletişim kurabilir ve lipitler, proteinler, DNA ve RNA gibi önemli biyolojik molekülleri çeşitli organlara, dokulara, hücrelere ve hücre içi parçalara taşıyarak yerel veya uzak mikro ortamı düzenleyebilirler. Böylece, alıcı hücrelerin davranışını da değiştirebilirler 2,3. Belirli sEV'lerin izolasyonu ve saflaştırılması, hastalığın gelişimi ve seyri sırasında biyolojik davranışlarını incelemek için gerekli bir ön koşuldur. Altın standart olarak kabul edilen diferansiyel ultrasantrifüjleme, sEV'leri normalde bulundukları dokulardan ayırmak için yaygın olarak kullanılır4. Doku kalıntıları, hücre kalıntıları, büyük veziküller ve apoptotik cisimler bu teknikle çıkarılabilir ve sadece sEV'ler bırakılabilir.
Kollajenaz D ve DNaz I'in, hücrelerin veya veziküllerin moleküler özelliklerini etkilemediği, her iki enzimin özelliklerinin hücre dışı matris 5'teki veziküllerin salınımına katkıda bulunduğu gösterilmiştir. Bu enzimler, insan metastatik melanom dokusundan, kolon kanseri dokusundan ve kolonik mukozal dokudan sEV'leri çıkarmak için kullanılmıştır 5,6,7. Bununla birlikte, bu yöntemlerde kollajenaz D ve DNaz I'in konsantrasyonu ve sindirim süresi farklılık göstermekte ve tutarsız sonuçlara yol açmaktadır. Diğer sEV alt tiplerinin kopyalanmasını önlemek için, araştırmacılar filtrasyon ve / veya diferansiyel santrifüjleme8 ile daha büyük hücre dışı vezikülleri (0.1 μm veya 0.2 μm çapında) çıkardılar. Kaynak dokuya bağlı olarak, farklı izolasyon ve saflaştırma yöntemleri gerekebilir 9,10.
Karaciğer dokusundan sEV'leri çıkarmak için geleneksel diferansiyel ultrasantrifüjleme yönteminin kullanılması, özelliklerini belirlemenin herhangi bir yolu olmadan, süpernatanın yüzeyinde bir beyaz madde tabakası ile sonuçlanır. Önceki bir çalışmada11, bu beyaz madde tabakasının sEV'lerin saflığını etkilediği bulunmuştur. Geleneksel yöntemle izole edilen numunelerin partikül sayısı ve protein konsantrasyonu mevcut yöntemden daha yüksek olmasına rağmen, varyasyon katsayısı büyüktü, çünkü muhtemelen birçok kirletici sonuçların zayıf tekrarlanabilirliğine yol açabilir. Yani, deterjan kullanarak (yani,% 1 Triton X-100'deki parçacıkların çözünürlüğünü tespit ederek), bu yöntemle elde edilen sEV'lerin saflığının daha büyük olduğunu bulduk. Bu nedenle, proteomik araştırmalar için kolorektal kanser dokusundan türetilen sEV'leri izole etmek ve saflaştırmak için bu yöntemi kullanıyoruz.
Şu anda, karaciğer kanserinde sEV'ler üzerine yapılan araştırmalar esas olarak serum, plazma ve hücre kültürünün süpernatantı12,13,14'e odaklanmıştır. Bununla birlikte, karaciğer kanseri dokusundan türetilen sEV'ler, fizyolojik patolojiyi ve karaciğer kanserinin çevresindeki mikro ortamı daha doğru bir şekilde yansıtabilir ve diğer EV'lerin bozulmasını ve kirlenmesini etkili bir şekilde önleyebilir15,16. Diferansiyel ultrasantrifüjleme kullanımı ile, bu yöntem verimi zenginleştirebilir ve yüksek kaliteli sEV'ler elde edebilir ve karaciğer kanserinin daha ileri çalışmaları için önemli bir temel sağlar. Bu yöntem, karaciğer kanseri dokusunun keskin bir ayırma ile ayrılmasını ve kollajenaz D ve DNaz I ile ayrışmasını sağlar. Daha sonra, hücresel enkaz, büyük veziküller ve apoptotik cisimler filtrasyon ve diferansiyel ultrasantrifüjleme ile daha da uzaklaştırılır. Son olarak, sEV'ler daha sonraki çalışmalar için izole edilir ve saflaştırılır.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>0.22 &#181;m Membrane Filter Unit</td>
			<td>Millex</td>
			<td>SLGPR33RB</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>1 mL Sterile syringe</td>
			<td>Hubei Xianming Medical Instrument Company</td>
			<td>YL01329</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>2% Uranyl Acetate</td>
			<td>Electron Microscopy Sciences</td>
			<td>22400-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>4.7 mL Centrifuge Tube</td>
			<td>Beckman Coulter</td>
			<td>361621</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>6-well Cell cuture plate</td>
			<td>LABSELECT</td>
			<td>11110</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 mL Beaker</td>
			<td>Tianjin Kangyiheng Experimental Instrument Sales Company</td>
			<td>CF2100800</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>70 &#181;m Cell strainer</td>
			<td>Biosharp</td>
			<td>BS-70-XBS</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>100 mm Cell culture dish</td>
			<td>CELL TER</td>
			<td>CS016-0128</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>600 &#181;L Centrifuge tube</td>
			<td>Axygen</td>
			<td>MCT060C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BCA protein quantification kit</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>RJ240544</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Beckman Coulter Optima-Max-TL</td>
			<td>Beckman&#160;</td>
			<td>A95761</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BioRad Mini trans-blot</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td>1703930</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BioRad Mini-Protean</td>
			<td>Bio-Rad</td>
			<td>1645050</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CD63 Antibody</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab134045</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CD9 Antibody</td>
			<td>Abcam</td>
			<td>ab263019</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge 5430R</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>5428HQ527333</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cleaning Solution</td>
			<td>NanoFCM</td>
			<td>C1801</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Collagenase D</td>
			<td>Roche</td>
			<td>11088866001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Copper net</td>
			<td>Henan Zhongjingkeyi Technology Company</td>
			<td>DJZCM-15-N1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Dry Thermostat</td>
			<td>Hangzhou allsheng instruments company</td>
			<td>AS-01030-00</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>FITC Anti Human CD9 Antibody</td>
			<td>Elabscience</td>
			<td>E-AB-F1086C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Glycine</td>
			<td>Solarbio</td>
			<td>G8200</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat horseradish peroxidase (HRP)-coupled secondary anti-mouse antibody&#160;</td>
			<td>Proteintech</td>
			<td>SA00001-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Goat horseradish peroxidase (HRP)-coupled secondary anti-rabbit antibody&#160;</td>
			<td>Proteintech</td>
			<td>SA00001-2</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Shanghai Zhenxing Chemical Company</td>
			<td></td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nanoparticle flow cytometer</td>
			<td>NanoFCM INC</td>
			<td>FNAN30E20112368</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphatase inhibitors(PhosSTOP)</td>
			<td>Roche</td>
			<td>4906845001</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphate Buffered Saline(PBS)</td>
			<td>Servicebio</td>
			<td>G4202</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Polyvinylidene Difluoride Membrane</td>
			<td>Solarbio</td>
			<td>ISEQ00010</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>QC Beads</td>
			<td>NanoFCM</td>
			<td>QS2502</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RPMI-1640 basic medium</td>
			<td>Biological Industries&#160;</td>
			<td>C11875500BT</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Scalpel</td>
			<td>Guangzhou Kehua Trading Company</td>
			<td>NN-0623-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Silica Nanospheres</td>
			<td>NanoFCM</td>
			<td>S16M-Exo</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Transference Decoloring Shaker TS-8</td>
			<td>Kylin-Bell</td>
			<td>E0018</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Transmission Electron Microscope</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>Talos L120C</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tris</td>
			<td>Solarbio</td>
			<td>T8060</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TSG101 Antibody</td>
			<td>Proteintech</td>
			<td>28283-1-AP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tweezer</td>
			<td>Guangzhou Lige Technology Company</td>
			<td>LG01-105-4X</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

an enrichment method for small extracellular vesicles derived from liver cancer tissue

Dokudan türetilen küçük hücre dışı veziküller (sEV'ler), kaynak hücrelerin fonksiyonel durumunu ve dokunun interstisyel boşluğunun özelliklerini yansıtabilir. Bu sEV'lerin verimli bir şekilde zenginleştirilmesi, biyolojik işlevlerinin incelenmesi için önemli bir önkoşuldur ve klinik tespit tekniklerinin ve terapötik taşıyıcı teknolojisinin geliştirilmesinin anahtarıdır. SEV'leri dokudan izole etmek zordur, çünkü genellikle ağır kirlenirler. Bu çalışma, karaciğer kanseri dokusundan yüksek kaliteli sEV'lerin hızlı bir şekilde zenginleştirilmesi için bir yöntem sunmaktadır. Yöntem dört aşamalı bir işlem içerir: sindirim enzimlerinin (kollajenaz D ve DNaz Ι) doku ile inkübasyonu, 70 μm hücre süzgecinden filtrasyon, diferansiyel ultrasantrifüjleme ve 0.22 μm membran filtresi ile filtrasyon. Diferansiyel ultrasantrifüjleme adımının optimizasyonu ve bir filtreleme adımının eklenmesi sayesinde, bu yöntemle elde edilen sEV'lerin saflığı, klasik diferansiyel ultrasantrifüjleme ile elde edilenden daha yüksektir. Doku kaynaklı sEV'lerin incelenmesi için önemli bir metodoloji ve destekleyici veriler sağlar.

İnsan karaciğer kanseri dokularından elde edilen sEV'ler, karaciğer kanserli hastaların tanı, tedavi ve prognozunda çok önemli bir rol oynamıştır. Bu yöntem, karaciğer kanseri dokularından türetilen sEV'leri izole etmek ve saflaştırmak için yaygın laboratuvar araçlarını kullandı; bu, sEV'lerin incelenmesi için metodolojik destek sağlayabilir. Şekil 2, karaciğer kanseri dokularından sEV'leri zenginleştirmenin genel sürecini göstermektedir. Dokuların hücreler a...

Watch this Scientific Journal Video about An Enrichment Method for Small Extracellular Vesicles Derived from Liver Cancer Tissue at JoVE.com

An Enrichment Method for Small Extracellular Vesicles Derived from Liver Cancer Tissue

Burada, karaciğer kanseri dokusundan elde edilen küçük hücre dışı veziküllerin optimize edilmiş bir diferansiyel ultrasantrifüjleme yöntemi ile zenginleştirilmesini açıklıyoruz.

Karaciğer Kanseri Dokusundan Elde Edilen Küçük Hücre Dışı Veziküller İçin Bir Zenginleştirme Yöntemi

Small extracellular vesicles (sEVs) derived from tissue can reflect the functional status of the source cells and the characteristics of the tissue's ...

Bu yöntem, karaciğer kanseri dokusundan türetilmiş küçük hücre dışı veziküllerin, klasik, diferansiyel ultrasantrifüjleme ile elde edilenden daha yüksek bir saflıkta izole edilmesine izin verir. Bu teknoloji basit, kullanışlı ve kullanımı kolaydır, bu da küçük hücre dışı veziküllerin incelenmesi için metodolojik destek sağlayabilir. Başlamak için, doku örneğini 80 santigrat derece dondurucudan çıkarın.Yaklaşık 400 miligram dokuyu buz kutusunun üzerindeki 10 santimetrelik bir hücre kültürü kabına yerleştirin ve dokuyu bir neşterle ince ince kıyın. Dokuyu 1.5 mililitre sindirim çözeltisi ile altı kuyucuklu bir plakaya aktarın. Daha sonra, plakayı transfer renk açma çalkalayıcısına yerleştirin ve karaciğer kanseri dokusunun tamamen ayrışması ve küçük hücre dışı veziküllerin veya sEV'lerin salınması için 20 dakika boyunca 37 santigrat derecede inkübe edin.Kuluçkadan sonra, altı kuyucuklu plakayı buz kutusuna yerleştirin. Sindirimi durdurmak için 80 mikrolitre fosfataz inhibitörü ve 200 mikrolitre tam proteaz inhibitörü çözeltisi ekleyin. Ardından, sindirim çözeltisini iki mililitrelik bir santrifüj tüpüne yerleştirilmiş 70 mikrometrelik bir hücre süzgecine aktarın ve büyük doku kalıntılarını gidermek için yavaşça filtreleyin.Küçük doku kalıntılarını gidermek için filtratı 10 dakika boyunca 500 g'da santrifüj edin ve süpernatantı yeni bir iki mililitrelik santrifüj tüpünde toplayın. Hücre kalıntılarını gidermek için süpernatantı 20 dakika boyunca 3.000 g'da santrifüj edin. Pipetin ucu alttaki beyaz döküntüye temas etmek üzere olana kadar süpernatantı dikkatlice yeni bir santrifüj tüpüne aktarın.Kalan sıvının santrifüjlemesini tekrarladıktan sonra, süpernatantı enkazı rahatsız etmeden tüpün içine toplayın. Toplanan süpernatantı 20 dakika boyunca 12.000 g'da santrifüj edin ve süpernatantın 900 mikrolitresini 4.7 milimetrelik bir ultrasantrifüj tüpüne aktarın. Kalan sıvının santrifüjlemesini tekrarlayın ve ardından her iki süpernatantı da aynı ultrasantrifüj tüpünde toplayın ve karıştırın.Tüpü tamamen PBS ile doldurun. Süpernatantı 60 dakika boyunca 100.000 g'da santrifüj edin. Süpernatanı attıktan sonra, ultrasantrifüj tüpünü PBS ile doldurarak pelet yeniden askıya alın.Santrifüjlemeyi 60 dakika boyunca 100.000 g'da tekrarladıktan sonra, peleti 50 mikrolitre PBS ile askıya alın. Bir mililitrelik steril bir şırınga kullanarak sEV süspansiyonunu aspire edin ve 0,22 mikrometrelik bir membran filtresinden 600 mikrolitrelik bir santrifüj tüpüne filtreleyin. Daha fazla analiz için filtratı 80 santigrat derecede saklayın.sEV'lerin boyut dağılımını ve saflığını belirlemek için bir nanopartikül akış sitometresi kullanın. Temizleme çözeltisinin hacmini kontrol edin. Ardından, kılıf seviyeleri ile atık sıvı arasındaki farkı not edin.Cihazın ana güç kaynağını açtıktan 20 saniye sonra bilgisayarı açın. Yazılımı çalıştırmak için cihazın düzgün bağlandığını gösteren bip seslerini bekleyin. Kamerayı, lazeri ve hava pompasını açmak için Başlat'a tıklayın.Ardından, Sheath Flow'a tıklayın ve Start Up'ı seçin.Yükleme platformuna ultra saf su yerleştirin. Dört dakika sonra Numune ve Güçlendirme'ye tıklayın ve ardından Örnek'te Boşalt'ı seçin. 30 saniye sonra, boş tüpü yükleme platformuna yerleştirin.Örnek'e tıklayın, Öne Çıkarma'yı seçin ve ardından Örnek'te Boşalt'ı seçin. Ardından, ultra saf su içeren tüpü yükleme platformuna yerleştirin. Aynı anda, Numune ve Artırma'ya, ardından Kılıf Akışı ve Temizleme'ye tıklayın.Manuel Çalışma'ya tıklayın ve partikül konsantrasyon tüpünü yükleme platformuna yerleştirin. Ardından, Numune'ye tıklayın, bir dakika boyunca Güçlendirme'yi seçin ve aynı anda Numune Bilgileri'nde 250 nanometre Standart Floresan Silika Nanospheres kalite kontrolünü seçin. Numuneden Örnekleme'yi seçin ve SPCM'ye tıklayarak dedektörü açın.Ardından, Otomatik Örnekleme'ye tıklayın ve basıncı bir kilopaskalda sabitlemek için Örnekleme Kümesi'ne 1.0 girin. Araç çubuğuna tıklayın ve Büyük Sinyal'i seçin. Lazerin yatay konumunu ayarlayın ve lazeri iki mikrometreye ayarlayın.Ardından, sinyalin güçlü ve düzgün olduğundan emin olmak için sürekli olarak L ve R'ye tıklayın. İşiniz bittiğinde otomatik olarak Arabelleğe atlayan verileri toplamak için Kayıt Süresi'ne tıklayın. Ardından, verileri Nfa Dosyasına kaydedin ve Kaldır'ı seçmek için Örnek'e tıklayın.Temizleme çözeltisi tüpünü yükleme platformuna yerleştirin. Örnekle'ye tıklayın, Öne Çıkarma'yı seçin ve bir dakika sonra Örnekle ve Boşalt'a tıklayın. Artık temizleme solüsyonunu kılcal uçtan çıkarmak için ultra saf su kullanın.Partikül boyutu standart tüpünü yükleme platformuna yerleştirin ve bir dakika boyunca Numune Artırma'ya tıklayın. Numune Bilgileri'nde 68 - 155 S16M-Exo kalite kontrolünü seçin ve Numune'ye ve ardından Örnekleme'ye tıklayın. Ardından, araç çubuğuna tıklayın ve Küçük Sinyal'i seçin.İşiniz bittiğinde otomatik olarak Arabelleğe atlayan verileri toplamak için Kayıt Süresi'ne tıklayın. Ardından, verileri bir Nfa dosyasına kaydedin ve Kaldır'ı seçmek için Örnek'e tıklayın. Kalıntıları temizleme çözeltisi ile çıkardıktan sonra, PBS tüpünü yükleme platformuna yerleştirin ve partikül boyutu standart tüp için gösterilen adımları uygulayın.Ardından, kılcal ucu daha önce gösterildiği gibi temizleyin ve parçacık boyutu standart tüp için daha önce açıklanan verileri analiz etmek için sEV örneğini yükleyin. Saflaştırılmış sEV'ler, fincan şeklinde bir morfolojiye sahip sEV'lerin varlığını ortaya çıkaran bir transmisyon elektron mikroskobu altında incelendi. sEV'ler için akım sitometrisi yapıldı.Ve parçacık boyutu 40 ila 200 nanometre arasında değişiyordu ve ortalama parçacık boyutu 89 nanometre idi. Zenginleştirilmiş sEV'lerin saflığı %68.32 olarak bulunduCD63, CD9 ve TSG101 gibi sEV'lerin protein belirteçleri western blot ile tespit edildi. GM130, doku hücrelerinde bulunan ancak sEV'lerde bulunmayan sEV'lerin negatif kontrol belirteci olarak kullanıldı.Küçük hücre dışı veziküllerin saflığını sağlamak için enzimatik sindirim, diferansiyel ultrasantrifüjleme ve membran filtrasyonu adımlarını büyük bir özenle gerçekleştirmek çok önemlidir.

Research

JoVE Journal

Cancer Research

Modeling Osteosarcoma Using Li-Fraumeni Syndrome Patient-derived Induced Pluripotent Stem Cells

Li-Fraumeni sendromu hasta kaynaklı indüklenmiş Pluripotent kök hücreler kullanılarak osteosarkom modelleme

Li-Fraumeni syndrome (LFS) is an autosomal dominant hereditary cancer disorder. Patients with LFS are predisposed to a various type of tumors, including ...

Extraction of Extracellular Vesicles from Whole Tissue

Hücre dışı veziküller çekme--dan tüm doku

Circulating and interstitial small membrane-bound extracellular vesicles (EVs) represent promising targets for the development of novel diagnostic or ...

Studying Normal Tissue Radiation Effects using Extracellular Matrix Hydrogels

Ekstrasellüler matris Hidrogeller kullanarak normal doku radyasyon etkileri eğitim

Radiation is a therapy for patients with triple negative breast cancer. The effect of radiation on the extracellular matrix (ECM) of healthy breast tissue ...

Spatial and Temporal Control of Murine Melanoma Initiation from Mutant Melanocyte Stem Cells

Mutant melanosit kök hücrelerinden Murine Melanoma başlangıcı uzamsal ve temporal kontrol

Cutaneous melanoma is well known as the most aggressive skin cancer. Although the risk factors and major genetic alterations continue to be documented ...

Isolation of Exosome-Enriched Extracellular Vesicles Carrying Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor from Embryonic Stem Cells

Embriyonik Kök Hücrelerden Granülosit-Makrofaj Kolonisi Uyarıcı Faktör Taşıyan EkzozomLa Zenginleştirilmiş Hücre Dışı Veziküllerin İzolasyonu

Embryonic stem cells (ESCs) are pluripotent stem cells capable of self-renewal and differentiation into all types of embryonic cells. Like many other cell ...

Studying Triple Negative Breast Cancer Using Orthotopic Breast Cancer Model

Ortotopik Meme Kanseri Modeli Kullanarak Üçlü Negatif Meme Kanseri Eğitimi

Triple-negative breast cancer (TNBC) is an aggressive breast cancer subtype with limited therapeutic options. When compared to patients with less ...

Sequencing Small Non-coding RNA from Formalin-fixed Tissues and Serum-derived Exosomes from Castration-resistant Prostate Cancer Patients

Formalin-sabit Dokulardan Küçük Kodlamaz RNA'nın ve Kastrasyona Dirençli Prostat Kanseri Hastalarından Serum Türetilmiş Ekzozomların Dizilimi

Ablation of androgen receptor (AR) signaling by androgen deprivation is the goal of the first line of therapy for prostate cancer that initially results ...

Expansion and Enrichment of Gamma-Delta (&#947;&#948;) T Cells from Apheresed Human Product

Expansion and Enrichment of Gamma-Delta ÃƒÅ½Ã‚Â³ÃƒÅ½Ã‚Â´ T Cells from Apheresed Human Product

Aferezli İnsan Ürününden Gama-Delta (φδ) T Hücrelerinin Genişlemesi ve Zenginleştirilmesi

Although V&#947;9V&#948;2 T cells are a minor subset of T lymphocytes, this population is sought after for its ability to recognize antigens in a major ...

In Vivo Immunogenicity Screening of Tumor-Derived Extracellular Vesicles by Flow Cytometry of Splenic T Cells

In Vivo Immunogenicity Screening of Tumor-Derived Extracellular Vesicles by Flow Cytometry of Splenic T Cells

İn Vivo Dalak T Hücrelerinin Akım Sitometrisi ile Tümör Kaynaklı Hücre Dışı Veziküllerin İmmünojenite Taraması

Immunogenic cell death of tumors, caused by chemotherapy or irradiation, can trigger tumor-specific T cell responses by releasing danger-associated ...

A Three-Dimensional Spheroid Model to Investigate the Tumor-Stromal Interaction in Hepatocellular Carcinoma

Hepatosellüler Karsinomdaki Tümör-Stromal Etkileşimi Araştırmak İçin Üç Boyutlu Sferoid Modeli

The aggressiveness and lack of well-tolerated and widely effective treatments for advanced hepatocellular carcinoma (HCC), the predominant form of liver ...