Name: standardization of transfer across labs between flow cytometers for detection of lymphocytes in japanese encephalitis vaccinated children
Uploaded: 2023-02-10T13:30:00
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RW는 중국 베이징 자연 과학 재단 (No. 7222059), 중국 국립 자연 과학 재단 (No. 82002130), XZ는 CAMS 의료 과학 혁신 기금 (No. 2019-I2M-5-026)의 지원을 받았습니다.

이 연구는 수도 의과 대학 베이징 아동 병원 윤리위원회의 승인을 받았습니다(승인 번호: 2020-k-85). 임상 시험 후 잔류 샘플만 이 연구에서 사용되었기 때문에 인간 피험자의 정보에 입각한 동의는 면제되었습니다. 이 연구에는 두 개의 실험실이 참여합니다. 이송 실험실 은 하나의 유세포 분석기를 사용하여 표준화된 방법을 개발한 곳입니다. 이 실험실의 세포분석기는 이하 세?...

<ol>
	<li>Cabanski, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Flow+cytometric+method+transfer:+Recommendations+for+best+practice.">Flow cytometric method transfer: Recommendations for best practice.</a> Cytometry Part B. Clinical Cytometry. 100 (1), 52-62 (2021).</li><li>Le Lann, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standardization+procedure+for+flow+cytometry+data+harmonization+in+prospective+multicenter+studies.">Standardization procedure for flow cytometry data harmonization in prospective multicenter studies.</a> Scientific Reports. 10 (1), 11567 (2020).</li><li>Linskens, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Improved+standardization+of+flow+cytometry+diagnostic+screening+of+primary+immunodeficiency+by+software-based+automated+gating.">Improved standardization of flow cytometry diagnostic screening of primary immunodeficiency by software-based automated gating.</a> Frontiers in Immunology. 11, 584646 (2020).</li><li>Glier, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Standardization+of+8-color+flow+cytometry+across+different+flow+cytometer+instruments:+A+feasibility+study+in+clinical+laboratories+in+Switzerland.">Standardization of 8-color flow cytometry across different flow cytometer instruments: A feasibility study in clinical laboratories in Switzerland.</a> Journal of Immunological Methods. 475, 112348 (2019).</li><li>Wang, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+epidemiology+and+disease+burden+of+children+hospitalized+for+viral+infections+within+the+family+Flaviviridae+in+China:+A+national+cross-sectional+study.">The epidemiology and disease burden of children hospitalized for viral infections within the family Flaviviridae in China: A national cross-sectional study.</a> PLOS Neglected Tropical Diseases. 16 (7), e0010562 (2022).</li><li>Ding, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reference+values+for+peripheral+blood+lymphocyte+subsets+of+healthy+children+in+China.">Reference values for peripheral blood lymphocyte subsets of healthy children in China.</a> The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 142 (3), 970-973 (2018).</li><li>Zhang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Detection+of+polyfunctional+T+cells+in+children+vaccinated+with+Japanese+encephalitis+vaccine+via+the+flow+cytometry+technique.">Detection of polyfunctional T cells in children vaccinated with Japanese encephalitis vaccine via the flow cytometry technique.</a> Journal of Visualized Experiments. (187), e64671 (2022).</li><li>Yu, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=CD4(+)+CD25+(+)+CD127+(low/-)+T+cells:+a+more+specific+Treg+population+in+human+peripheral+blood.">CD4(+) CD25 (+) CD127 (low/-) T cells: a more specific Treg population in human peripheral blood.</a> Inflammation. 35 (6), 1773-1180 (2012).</li><li>Kalina, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reproducibility+of+flow+cytometry+through+standardization:+opportunities+and+challenges.">Reproducibility of flow cytometry through standardization: opportunities and challenges.</a> Cytometry Part A. 97 (2), 137-147 (2020).</li><li>Sommer, U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Implementation+of+highly+sophisticated+flow+cytometry+assays+in+multicenter+clinical+studies:+considerations+and+guidance.">Implementation of highly sophisticated flow cytometry assays in multicenter clinical studies: considerations and guidance.</a> Bioanalysis. 7 (10), 1299-1311 (2015).</li><li>Glier, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comments+on+EuroFlow+standard+operating+procedures+for+instrument+setup+and+compensation+for+BD+FACS+Canto+II,+Navios+and+BD+FACS+Lyric+instruments.">Comments on EuroFlow standard operating procedures for instrument setup and compensation for BD FACS Canto II, Navios and BD FACS Lyric instruments.</a> Journal of Immunological Methods. 475, 112680 (2019).</li></ol>

말초 혈액 림프구 하위 집합의 면역 표현형은 소아에서 백신 접종 후 세포 매개 적응 면역의 변화를 이해하는 데 도움이 될 수 있습니다. 임상 적용에서는 적시에 샘플을 검출하지 못하거나 유세포 분석기를 교체하는 것과 같은 예기치 않은 상황이 발생합니다. 그러므로, 서로 다른 실험실에서 유세포 분석기 간의 이동을 용이하게 하는 신속하고 표준화된 방법이 필요하다 9,10,11...

유세포 분석의 표준화는 서로 다른 실험실 및 연구 센터의 서로 다른 세포계에서 얻은 결과를 비교할 수 있는 데 유용하며 결과를 상호 인식하여 작업 효율성을 개선하는 데 도움이 됩니다. 점점 더 많은 시나리오에 표준화가 필요합니다. 약물 개발 과정에서 유세포 분석 표준화는 중요한데, 이는 개발되고 검증된 분석법이 전임상부터 임상 분석에 이르는 전체 약물 개발 프로세스를 지원하기 때문입니다. 유세포 분석법은 제약 산업과 협력 실험실 간에 자주 이전됩니다1. 또한 다중심 임상 연구에서 비교 가능한 데이터를 얻는 것이 필수적입니다. 예를 들어, 다기관 유세포 분석(multicentric flow cytometry)에서 비교 가능한 데이터를 얻기 위해 전신 자가면역 질환 다기관 임상 연구 프로젝트(Systemic Autoimmune Diseases Multicenter Clinical Research Project)에서 표준화 워크플로우가 개발되었습니다2.
유세포 분석법의 표준화는 어려운 과제입니다. 실험실 전반에서 발생하는 문제는 표준화된 재료의 부족, 소프트웨어 호환성 문제, 기기 설정의 불일치, 서로 다른 유세포 분석기 간의 서로 다른 구성 사용 및 센터 간의 다양한 게이팅 전략에 기인합니다 3,4. 따라서 실험실 간의 갭 분석을 수행하는 것이 중요합니다. 시료 접근, 품질 시스템, 인력 자격 및 기기 구성을 검토하여 요구 사항이 충족되는지 확인해야 합니다.
현재 일본뇌염(JE) 백신을 접종한 어린이는 JE5의 발병률이 유의하게 감소했습니다. 말초 혈액 면역 세포를 모니터링하면 백신 접종 후 세포 매개 적응 면역의 변화와 말초 혈액 림프구 하위 집합의 변화와 백신 접종 효과 간의 상관 관계를 이해하는 데 도움이 될 수 있습니다. 전혈 샘플의 제한된 안정성으로 인해 백신 효능 평가는 종종 여러 센터에서 수행됩니다. 이 분석을 위해 우리는 나이브 CD8+ 또는 CD4+ T 세포를 CD27+ CD45RA+로, 중심 기억 T 세포(TCM)를 CD27+ CD45RA-로, 이펙터 기억 T 세포(TEM)를 CD27-CD45RA-로, 말단 분화 이펙터 기억 T 세포(TEMRA)를 CD27-CD45RA+로 정의했습니다. CD19+ B 세포는 IgD 6,7 대 CD27을 발현하는 집단으로 분리할 수 있고, 나이브 B 세포는 IgD6의 발현을 기반으로 CD27n 기억 B 세포(mBC)를 발현하는 집단으로 분리할 수 있으며, 조절 T 세포(Treg)는 CD4+CD25++CD127low 8로 식별할 수 있습니다. 여러 센터에서 실험 결과의 일관성과 비교 가능성을 달성하기 위해 표준화된 유세포 분석 실험을 확립하기 위해 JE 백신 접종을 받은 어린이의 전혈에서 림프구를 검출하기 위해 다양한 유세포 분석기에 걸친 프로토콜 전달을 용이하게 하기 위해 신속하고 실현 가능한 표준화 방법을 수립했습니다. 6 명의 건강한 어린이 (2 세)가 수도 의과 대학 베이징 아동 병원에서 모집되었습니다. 6개월 이내에 약독화 생백신인 JE SA14-14-2 백신으로 프라임 및 부스트 백신을 접종한 후 지원자로부터 말초 혈액 샘플을 수집했습니다. 표준화된 절차에 따라 다양한 기기에서 매우 유사한 데이터를 얻었으며, 이는 다기관 평가에 도움이 됩니다.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>BD CompBeads Anti-Mouse Ig, &#954;/Negative Control Compensation Particles Set</td>
			<td>BD</td>
			<td>552843</td>
			<td>compensation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD FACSCanto</td>
			<td>BD</td>
			<td>FACSCanto</td>
			<td>flow Cytometry A in the transferring lab</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD FACSDiva CS&#38;T Research Beads</td>
			<td>BD</td>
			<td>655051</td>
			<td>define flow cytometer baseline and track cytometer performance</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Horizon BV421 Mouse Anti-Human CD127</td>
			<td>BD</td>
			<td>562436</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Horizon BV605 Mouse Anti-Human CD27</td>
			<td>BD</td>
			<td>562656</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Horizon V500 Mouse Anti-Human CD45</td>
			<td>BD</td>
			<td>560777</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD LSRFortessa</td>
			<td>BD</td>
			<td>LSRFortessa</td>
			<td>flow Cytometry B in the test method lab</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD OptiBuild BB700 Mouse Anti-Human CD19</td>
			<td>BD</td>
			<td>745907</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD OptiBuild R718 Mouse Anti-Human CD8</td>
			<td>BD</td>
			<td>751953</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Pharmingen APC Mouse Anti-Human CD45RA</td>
			<td>BD</td>
			<td>550855</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Pharmingen APC-H7 Mouse Anti-Human CD3</td>
			<td>BD</td>
			<td>560176</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Pharmingen FITC Mouse Anti-Human CD4</td>
			<td>BD</td>
			<td>566320</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Pharmingen PE Mouse Anti-Human CD25</td>
			<td>BD</td>
			<td>555432</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Pharmingen PE-Cy7 Mouse Anti-Human IgD</td>
			<td>BD</td>
			<td>561314</td>
			<td>Fluorescent antibody&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Brilliant Staining Buffer Plus</td>
			<td>BD</td>
			<td>566385</td>
			<td>Staining Buffer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge</td>
			<td>Eppendorf</td>
			<td>5810</td>
			<td>Cell centrifugation</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Centrifuge Tube</td>
			<td>BD Falcon</td>
			<td>BD-35209715</td>
			<td>15 mL centrifuge tube</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>CS&#38;T IVD Beads</td>
			<td>BD</td>
			<td>662414</td>
			<td>standard beads to setup cytometer settings in different flow cytometer</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lysing Solution 10x Concentrate</td>
			<td>BD</td>
			<td>349202</td>
			<td>lysing red blood cells</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phosphate-buffered Saline (PBS)</td>
			<td>Gibco</td>
			<td>10010-023</td>
			<td>PBS</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Round-bottom test tube</td>
			<td>BD Falcon</td>
			<td>352235</td>
			<td>5 mL test tube</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

standardization of transfer across labs between flow cytometers for detection of lymphocytes in japanese encephalitis vaccinated children

점점 더 많은 실험실이 여러 유세포 분석기에서 데이터를 수집해야 하며, 특히 여러 센터에서 수행되는 연구 프로젝트의 경우 더욱 그렇습니다. 서로 다른 실험실에서 두 개의 유세포 분석기를 사용할 때의 문제에는 표준화된 재료의 부족, 소프트웨어 호환성 문제, 기기 설정의 불일치, 서로 다른 유세포 분석기에 대한 다른 구성 사용 등이 포함됩니다. 여러 센터에서 실험 결과의 일관성과 비교 가능성을 달성하기 위해 표준화된 유세포 분석 실험을 확립하기 위해 서로 다른 유세포 분석기에 매개변수를 전송하기 위한 신속하고 실현 가능한 표준화 방법이 수립되었습니다. 
이 연구에서 개발된 방법을 통해 일본 뇌염(JE) 예방 접종을 받은 어린이의 림프구 검출을 위해 서로 다른 실험실에 있는 두 개의 유세포 분석기 간에 실험 설정 및 분석 템플릿을 전송할 수 있었습니다. 형광 표준 비드를 사용하여 두 세포분석기 사이에서 일관된 형광 강도를 얻어 세포분석기 설정을 설정하였다. 서로 다른 유형의 기기를 사용하는 두 실험실에서 비슷한 결과를 얻었습니다. 이 방법을 사용하여 우리는 서로 다른 실험실에서 서로 다른 기기를 사용하여 JE 백신 접종 어린이의 면역 기능을 평가하기 위한 분석을 표준화하고, 여러 센터의 유세포 분석기 간의 데이터 및 결과의 차이를 줄이고, 실험실 결과의 상호 인증을 위한 실행 가능한 접근 방식을 제공할 수 있습니다. 유세포 분석기 실험의 표준화 방법은 여러 센터에서 연구 프로젝트의 효과적인 수행을 보장합니다.

그림 1은 CST 브라이트 비드에 대한 목표 값 템플릿의 전역 워크시트를 보여줍니다. FSC/SSC 플롯을 사용하여 CST 브라이트 비드를 선택하기 위해 다각형 게이트를 그립니다. CST 브라이트 비드에 대해 10개의 형광 채널의 히스토그램 플롯을 얻었다: FITC, PE, BB700, PE-Cy7, APC, R718, APC-H7, BV421, V500 및 BV605. 각 파라미터에 대한 목표값은 히스토그램 게이트 내의 중앙값을 표 2</strong...

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Standardization of Transfer across Labs between Flow Cytometers for Detection of Lymphocytes in Japanese Encephalitis Vaccinated Children

이 연구에서는 일본 뇌염 예방 접종을 받은 어린이의 림프구 검출을 위해 두 실험실에서 두 개의 유세포 분석기 간에 실험 설정 및 분석 템플릿의 이동을 용이하게 하는 방법을 개발했습니다. 유세포 분석기 실험의 표준화 방법을 통해 여러 센터에서 연구 프로젝트를 효과적으로 수행할 수 있습니다.

일본 뇌염 예방 접종 아동의 림프구 검출을 위한 유세포 분석기 간 실험실 간 이동 표준화

An increasing number of laboratories need to collect data from multiple flow cytometers, especially for research projects performed across multiple ...

유세포 분석기의 표준화 방법은 실험실 결과의 상호 인증을 위한 실행 가능한 접근 방식을 제공하고 여러 센터의 연구 프로젝트와 결과의 일관성을 보장합니다. 시간 소비를 최소화하는 방법은 실행하기 쉽고, 자동화하고, 템플릿을 분석하고, 데이터 분석의 요구 사항을 획기적으로 줄일 수 있습니다. 이송 실험실에서 유세포분석기 버튼을 클릭하고 구성 보기를 선택하여 유세포분석기 A의 소프트웨어에서 새 구성을 생성하기 시작합니다.구성 목록에서 기본 구성 폴더를 마우스 오른쪽 단추로 클릭하고 새 폴더를 선택한 다음 이름을 바꿉니다. 그런 다음 기본 구성을 마우스 오른쪽 단추로 클릭하고 복사하여 새 구성을 만듭니다. 새 폴더를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 새 구성의 이름을 바꾸기 전에 기본 구성을 붙여넣고, 표준화된 방법 전송"매개변수 목록에서 FETC와 같은 매개변수 이름을 적절한 감지기 530/30으로 드래그하고 새 구성에 대한 추가 매개변수도 편집합니다.이송 실험실에서 실험을 표준화하려면 이 유세포분석기 A 설정을 사용하여 성능 검사를 실행하고 비드를 추적하여 유세포분석기 A가 잘 작동하는지 확인합니다. 소프트웨어 브라우저 창에서 유세포분석기 A 설정을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 응용 프로그램 설정을 선택하여 워크시트를 만듭니다. 그런 다음 염색되지 않은 샘플을 사용하여 전방 산란 영역(FSC)과 측면 산란 영역(SSC)의 광증배관(PMT) 전압과 모든 형광 파라미터를 조정합니다.실험 유세포분석기 설정을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 응용 프로그램 설정을 선택하여 응용 프로그램 설정을 저장합니다. 보정 컨트롤을 자동으로 추가하려면 실험 버튼을 클릭하고 보정 설정 메뉴를 선택한 후 보정 컨트롤 만들기를 선택합니다. 모든 보정 제어 비드에 대한 데이터를 기록합니다.완료되면 실험을 클릭하고 보정 설정을 선택하고 보정을 자동으로 계산한 후 단일 세포 염색 대조군에 대한 데이터를 기록합니다. CD45 RAA APC를 사용하여 R7-18의 보상 값을 15% APC로 수정하고, CD19 BB700을 사용하여 APC H7의 보상 값을 14% BB700으로 수정하고, CD8 R7-18을 사용하여 APC H7의 보상 값을 60%R7-18로 수정합니다. CST 비드에 대한 데이터를 기록한 후 CST 브라이트 비드에 대한 목표 값 템플릿의 글로벌 워크 시트를 만들고 완료되면 유세포 분석기 어레이에서 샘플을 실행하고 25, 000 개의 림프구를 수집합니다.샘플에 대한 분석 템플릿의 전역 워크시트를 만들고 실험 템플릿을 세포분석기 A.Export에 저장합니다. CD-ROM을 사용하여 실험 템플릿을 내보냅니다. 실험 템플릿을 테스트 랩의 유세포분석기 B로 옮기려면 CST 비드를 사용하여 성능 검사를 수행하여 유세포분석기 B가 잘 작동하는지 확인합니다. 세포분석기 A에서 실험 템플릿을 가져오고 템플릿을 사용하여 세포분석기 B에 대한 실험을 만듭니다.동일한 로트의 CST 비드를 사용하여 이전 MFI 기기와 일치하도록 각 형광 채널의 형광 매개변수 전압을 조정합니다. 필요한 경우 염색되지 않은 샘플을 사용하여 FSC 전압을 조정합니다. 실험용 유세포분석기 설정을 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 애플리케이션 설정을 선택하여 애플리케이션 설정을 저장합니다.다음으로, CD45 RA APC를 사용하여 R7-18의 보상 값을 15%APC로 수정한다. CD19 BB700을 사용하여 APC H7의 보상 값을 24%BB700으로 수정합니다. 그리고 CD8 R7-18을 사용하여 APC H7의 보상 값을 60%R7-18로 수정합니다.보상 값 수정 후 유세포 분석기 B에서 샘플을 실행하고 25, 000 개의 림프구를 수집하십시오. 세포계 설정 및 추적 또는 CST 브라이트 비드에 대한 목표값 템플릿의 글로벌 워크시트에서 10개의 형광 채널의 히스토그램 플롯을 얻었고, 각 매개변수에 대한 목표값은 히스토그램 게이트 내의 중앙값을 표시하여 표시했습니다. 기기 표준화 후 세포분석기 A와 B를 사용하여 얻은 샘플의 도트 플롯은 자동 분석 템플릿을 사용하여 서로 다른 기기 간의 데이터 일관성을 입증했습니다.6개 샘플의 결과를 두 개의 서로 다른 기기 모델에서 비교했을 때 유의미한 차이가 관찰되지 않았습니다. 표준화된 방법을 사용하여 서로 다른 기구에서 얻은 15개의 림프 하위 집합의 결과는 매우 유사한 데이터를 얻었습니다. 동일한 구성 이름, 템플릿 생성 및 다른 기기에서 안전 비드의 에코테크 값을 만드는 것은 이 프로토콜의 중요한 단계입니다.

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