Name: standardized identification of compound structure in tibetan medicine using ion trap mass spectrometry and multiple-stage fragmentation analysis
Uploaded: 2023-03-17T14:10:00
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Ce travail a été financé par le Xinglin Talent Program de l’Université de TCM de Chengdu (n ° 030058191), la Fondation des sciences de la nature du Sichuan (2022NSFSC1470) et la Fondation nationale des sciences naturelles de Chine (82204765).

1. Préparation de l’échantillon
<ol><li>Peser avec précision 1 g de l’échantillon d’AMS et le placer dans une fiole conique contenant 30 ml de méthanol à 80 %. Transférer le mélange dans un soniateur à bain à ultrasons pendant 30 min d’extraction à 25 °C. Centrifuger l’échantillon à 14 000 x g pendant 5 min. REMARQUE: La fréquence du sonicateur à bain à ultrasons est de 40 KHz.</li>
	<li>Préparez une seringue d’injection et un filtre à membrane microporeuse (...

<ol>
	<li>Chen, X. -. F., Wu, H. -. T., Tan, G. -. G., Zhu, Z. -. Y., Chai, Y. -. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Liquid+chromatography+coupled+with+time-of-flight+and+ion+trap+mass+spectrometry+for+qualitative+analysis+of+herbal+medicines.">Liquid chromatography coupled with time-of-flight and ion trap mass spectrometry for qualitative analysis of herbal medicines.</a> Journal of Pharmaceutical Analysis. 1 (4), 235-245 (2011).</li><li>Ou, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Systematically+investigating+the+pharmacological+mechanism+of+Dazhu+Hongjingtian+in+the+prevention+and+treatment+of+acute+mountain+sickness+by+integrating+UPLC/Q-TOF-MS/MS+analysis+and+network+pharmacology.">Systematically investigating the pharmacological mechanism of Dazhu Hongjingtian in the prevention and treatment of acute mountain sickness by integrating UPLC/Q-TOF-MS/MS analysis and network pharmacology.</a> Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 179, 113028 (2020).</li><li>Kind, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+of+small+molecules+using+accurate+mass+MS/MS+search.">Identification of small molecules using accurate mass MS/MS search.</a> Mass Spectrometry Reviews. 37 (4), 513-532 (2018).</li><li>Phetsanthad, A., Vu, N. Q., Li, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Multi-faceted+mass+spectrometric+investigation+of+neuropeptides+in+Callinectes+sapidus.">Multi-faceted mass spectrometric investigation of neuropeptides in Callinectes sapidus.</a> Journal of Visualized Experiments. (183), e63322 (2022).</li><li>Seetaloo, N., Phillips, J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Millisecond+hydrogen/deuterium-exchange+mass+spectrometry+for+the+study+of+alpha-synuclein+structural+dynamics+under+physiological+conditions.">Millisecond hydrogen/deuterium-exchange mass spectrometry for the study of alpha-synuclein structural dynamics under physiological conditions.</a> Journal of Visualized Experiments. (184), e64050 (2022).</li><li>Karas, B. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dose+uptake+of+platinum-and+ruthenium-based+compound+exposure+in+zebrafish+by+inductively+coupled+plasma+mass+spectrometry+with+broader+applications.">Dose uptake of platinum-and ruthenium-based compound exposure in zebrafish by inductively coupled plasma mass spectrometry with broader applications.</a> Journal of Visualized Experiments. (182), e6358 (2022).</li><li>Chang, H. -. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Uracil-DNA+glycosylase+assay+by+matrix-assisted+laser+desorption/ionization+time-of-flight+mass+spectrometry+analysis.">Uracil-DNA glycosylase assay by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry analysis.</a> Journal of Visualized Experiments. (182), e63089 (2022).</li><li>Wang, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Structural+characterization+and+identification+of+major+constituents+in+Jitai+tablets+by+high-performance+liquid+chromatography/diode-array+detection+coupled+with+electrospray+ionization+tandem+mass+spectrometry.">Structural characterization and identification of major constituents in Jitai tablets by high-performance liquid chromatography/diode-array detection coupled with electrospray ionization tandem mass spectrometry.</a> Molecules. 17 (9), 10470-10493 (2012).</li><li>Pang, B., Zhu, Y., Lu, L., Gu, F., Chen, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+applications+and+features+of+liquid+chromatography-mass+spectrometry+in+the+analysis+of+traditional+Chinese+medicine.">The applications and features of liquid chromatography-mass spectrometry in the analysis of traditional Chinese medicine.</a> Evidence-Based Complementary and Alternative Medicine. 2016, 3837270 (2016).</li><li>Ichou, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Comparison+of+the+activation+time+effects+and+the+internal+energy+distributions+for+the+CID,+PQD+and+HCD+excitation+modes.">Comparison of the activation time effects and the internal energy distributions for the CID, PQD and HCD excitation modes.</a> Journal of Mass Spectrometry. 49 (6), 498-508 (2014).</li><li>Fu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Suppression+of+oligomer+formation+in+glucose+dehydration+by+CO2+and+tetrahydrofuran.">Suppression of oligomer formation in glucose dehydration by CO2 and tetrahydrofuran.</a> Green Chemistry. 19 (14), 3334-3343 (2017).</li><li>Fu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Solvent+effects+on+degradative+condensation+side+reactions+of+fructose+in+its+initial+conversion+to+5-Hydroxymethylfurfural.">Solvent effects on degradative condensation side reactions of fructose in its initial conversion to 5-Hydroxymethylfurfural.</a> ChemSusChem. 13 (3), 501-512 (2020).</li><li>Yang, S., Wang, Z., Zhao, H., Ren, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Modern+research+of+Tibetan+medicine.">Modern research of Tibetan medicine.</a> World Journal of Traditional Chinese Medicine. 5 (2), 131-138 (2019).</li><li>Shang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ethno-veterinary+survey+of+medicinal+plants+in+Ruoergai+region,+Sichuan+province,+China.">Ethno-veterinary survey of medicinal plants in Ruoergai region, Sichuan province, China.</a> Journal of Ethnopharmacology. 142 (2), 390-400 (2012).</li><li>Su, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Chalcone+derivatives+from+Abelmoschus+manihot+seeds+restrain+NLRP3+inflammasome+assembly+by+inhibiting+ASC+oligomerization.">Chalcone derivatives from Abelmoschus manihot seeds restrain NLRP3 inflammasome assembly by inhibiting ASC oligomerization.</a> Frontiers in Pharmacology. 13, 932198 (2022).</li><li>Fu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mapping+out+the+reaction+network+of+humin+formation+at+the+initial+stage+of+fructose+dehydration+in+water.">Mapping out the reaction network of humin formation at the initial stage of fructose dehydration in water.</a> Green Energy &amp; Environment. , (2022).</li><li>Hua, Y., Jenke, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Increasing+the+sensitivity+of+an+LC-MS+method+for+screening+material+extracts+for+organic+extractables+via+mobile+phase+optimization.">Increasing the sensitivity of an LC-MS method for screening material extracts for organic extractables via mobile phase optimization.</a> Journal of Chromatographic Science. 50 (3), 213-227 (2012).</li><li>Kumar, S., Singh, A., Bajpai, V., Kumar, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Identification+characterization+and+distribution+of+monoterpene+indole+alkaloids+in+Rauwolfia+species+by+Orbitrap+Velos+Pro+mass+spectrometer.">Identification characterization and distribution of monoterpene indole alkaloids in Rauwolfia species by Orbitrap Velos Pro mass spectrometer.</a> Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 118, 183-194 (2016).</li><li>Bayat, P., Lesage, D., Cole, R. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Tutorial:+Ion+activation+in+tandem+mass+spectrometry+using+ultra-high+resolution+instrumentation.">Tutorial: Ion activation in tandem mass spectrometry using ultra-high resolution instrumentation.</a> Mass Spectrometry Reviews. 39 (5-6), 680-702 (2020).</li><li>Wu, S. -. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Mass+spectrometric+determination+of+disulfide+linkages+in+recombinant+therapeutic+proteins+using+online+LC&#8722;MS+with+electron-transfer+dissociation.">Mass spectrometric determination of disulfide linkages in recombinant therapeutic proteins using online LC&#8722;MS with electron-transfer dissociation.</a> Analytical Chemistry. 81 (1), 112-122 (2009).</li><li>Echterbille, J., Quinton, L., Gilles, N., De Pauw, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ion+mobility+mass+spectrometry+as+a+potential+tool+to+assign+disulfide+bonds+arrangements+in+peptides+with+multiple+disulfide+bridges.">Ion mobility mass spectrometry as a potential tool to assign disulfide bonds arrangements in peptides with multiple disulfide bridges.</a> Analytical Chemistry. 85 (9), 4405-4413 (2013).</li></ol>

IT-MS et sa technologie MSn offrent une nouvelle approche pour identifier la structure des composés de MTC à l’état de traces. Contrairement à Q-TOF-MS, qui ne pouvait pas identifier en profondeur les ions fragments, IT-MS avec la technologie MSn excelle en raison de sa capacité à isoler et à accumuler des ions. Cet article décrit une méthode d’identification des composés traces dans la médecine tibétaine en utilisant la technique IT-MS et MSn . La méthode utilise la vale...

L’analyse qualitative des composants traces en médecine traditionnelle chinoise (MTC) est devenue un sujet crucial dans la recherche. En raison du nombre élevé de composés en MTC, il est difficile de les isoler pour l’analyse par spectromètre par résonance magnétique nucléaire (RMN) ou diffractomètre à rayons X (XRD), ce qui rend de plus en plus populaires les méthodes basées sur la spectrométrie de masse (MS) qui ne nécessitent que de faibles volumes d’échantillons. De plus, la chromatographie liquide (CL) couplée à la SM a été largement utilisée dans la recherche sur la MTC ces dernières années pour améliorer la séparation d’échantillons complexes et l’analyse qualitative des composés chimiques1. Une méthode courante est la chromatographie liquide-spectrométrie de masse à temps de vol par ionisation électrospray (LC-ESI-TOF-MS), qui est largement utilisée dans la recherche qualitative sur la médecine tibétaine2. Avec cette méthode, les composants complexes sont enrichis et séparés dans une colonne LC, et le rapport masse / charge (m / z) des ions adduits est observé à l’aide d’un détecteur MS. La recherche dans les bases de données en tandem MS (MS/MS ou MS2) est actuellement l’approche la plus rapide pour des annotations de composés fiables dans l’analyse de petites molécules à l’aide du temps de vol quadripolaire (Q-TOF) MS et Orbitrap MS3. Cependant, la mauvaise qualité des bases de données et la présence de divers isomères empêchent l’identification de composés inconnus. En outre, les informations fournies par la base de données MS/MS sont limitées 4,5,6,7. Il est important d’étudier les composés chimiques de chaque MTC en utilisant un protocole général qui peut être largement appliqué à d’autres MTC.
IT-MS capture une large gamme d’ions en appliquant différentes tensions de radiofréquence (RF) aux électrodes annulaires8. IT-MS peut effectuer des séries chronologiques d’analyses MS à plusieurs étapes dans divers ordres chronologiques, fournissant une fragmentation MS à plusieurs stades (MS n) des ingrédients, oùn est le nombre d’étapes ioniques du produit9. L’IT-MS linéaire est considéré comme le meilleur pour l’identification de la structure car il peut être utilisé pour des expériences séquentielles MSn 10. Les ions ciblés peuvent être isolés et accumulés dans IT-MSlinéaire 1. Le MS n (n ≥ 3) dans IT-MS fournit plus d’informations fragmentaires que MS/MS dans Q-TOF-MS. Étant donné que l’IT-MS ne peut pas verrouiller l’ion cible et ses ions fragments, c’est un outil puissant pour l’élucidation de la structure de composés inconnus, y compris les isomères1. La technologie MSn a été largement appliquée à l’analyse structurelle de protéines, peptides et polysaccharides inconnus11,12. Le niveau d’abondance des ions fragments dans MSn fournit plus d’informations sur les fragments moléculaires sur les composés ciblés dans les échantillons complexes que MS/MS dans le Q-TOF-MS. Par conséquent, l’application de la technologie MSn à l’identification structurelle en MTC est essentielle.
La médecine tibétaine est une composante importante de la MTC13, et ces médicaments sont principalement dérivés d’animaux, de plantes et de minéraux trouvés dans la zone du plateau14. La médecine tibétaine Abelmoschus manihot seeds (AMS) est la graine d’Abelmoschus manihot (linn.) medicus. AMS est un médicament traditionnel à base de plantes utilisé pour traiter des conditions telles que la dermatite atopique, les rhumatismes et la lèpre. Il contient de la chalcone, qui possède des effets antibactériens, antifongiques, anticancéreux, antioxydants et anti-inflammatoires15. Dans la présente étude, les procédures de MS n ont été améliorées et une méthode détaillée a été développée pour identifier les structures composées dans la médecine tibétaine AMS en utilisant IT-MS et MSn. Certains paramètres MS, y compris le mode ionique, la portée de balayage et le mode collision, ont été optimisés pour surmonter les problèmes d’identification des composés traces. Cette étude vise à promouvoir l’identification normalisée de la structure des composés traces dans la MTC.

<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Acetonitrile</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>CAS 75-05-8</td>
			<td>LC-MS grade</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Formic Acid</td>
			<td>Knowles</td>
			<td>CAS 64-18-6</td>
			<td>HPLC grade</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Linear ion trap mass spectrometer</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>LTQ XL</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>liquid chromatograph</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>U3000</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>LTQ Tune</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>version 2.8.0</td>
			<td>MS control software</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Methanol</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>CAS 67-56-1</td>
			<td>LC-MS grade</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pure water</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>CAS 7732-18-5</td>
			<td>LC-MS grade</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Xcalibur</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>version 2.0</td>
			<td>LC-IT-MS operational software</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

standardized identification of compound structure in tibetan medicine using ion trap mass spectrometry and multiple-stage fragmentation analysis

Les médicaments tibétains sont complexes et contiennent de nombreux composés inconnus, ce qui rend cruciale la recherche approfondie sur leurs structures moléculaires. La chromatographie liquide-spectrométrie de masse à temps de vol par ionisation par électrospray (LC-ESI-TOF-MS) est couramment utilisée pour extraire la médecine tibétaine; Cependant, de nombreux composés inconnus imprévisibles subsistent après l’utilisation de la base de données Spectrum. Le présent article a développé une méthode universelle pour identifier les composants de la médecine tibétaine en utilisant la spectrométrie de masse par piège ionique (IT-MS). La méthode comprend des protocoles normalisés et programmés pour la préparation des échantillons, le réglage de la SM, la préexécution LC, l’établissement de la méthode, l’acquisition de la SM, le fonctionnement de la SM en plusieurs étapes et l’analyse manuelle des données. Deux composés représentatifs de la médecine tibétaine Abelmoschus manihot seeds ont été identifiés en utilisant une fragmentation en plusieurs étapes, avec une analyse détaillée des structures composées typiques. En outre, l’article aborde des aspects tels que la sélection du mode ionique, le réglage de phase mobile, l’optimisation de la portée de balayage, le contrôle de l’énergie de collision, le basculement en mode de collision, les facteurs de fragmentation et les limites de la méthode. La méthode d’analyse standardisée développée est universelle et peut être appliquée à des composés inconnus dans la médecine tibétaine.

Le cellobiose a été utilisé comme modèle pour vérifier la faisabilité de MSn en mode ion positif. Comme le montre la figure 2A, l’ESI-MS (mode ion positif) du cellobiose [C 12 H22O11]+ a produit la molécule protonée [M+H]+ à m/z 365. Le balayage ionique du produit (CID-MS/MS) de [M+H]+ à m/z 365 a donné le deuxième fragment ionique à m/z 305 (figure 2B), qui a été analysé plus en détail à l’aid...

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Standardized Identification of Compound Structure in Tibetan Medicine Using Ion Trap Mass Spectrometry and Multiple-Stage Fragmentation Analysis

Ici, nous décrivons un protocole général et une conception qui pourraient être appliqués pour identifier des traces et des constituants mineurs dans les formulations complexes de produits naturels (matrices) de la médecine tibétaine.

Identification standardisée de la structure des composés en médecine tibétaine à l’aide de la spectrométrie de masse à piège ionique et de l’analyse de fragmentation en plusieurs étapes

Tibetan medicines are complex and contain numerous unknown compounds, making in-depth research on their molecular structures crucial. Liquid ...

Cette méthode peut aider les chercheurs à analyser les structures des composés de la médecine tibétaine, en particulier les composants de l’arbre. Il peut fournir un aperçu de l’étude qualitative de la teneur en composé en médecine naturelle. Le principal avantage de cette technique est que la précision de la structure composée obtenue dans ce cas est supérieure à celle de la base de données.Cette technique peut être utilisée dans l’analyse de la structure des intermédiaires métaboliques dans la vessie ou l’urine. Pour commencer, la préparation de l’échantillon de graines de la médecine tibétaine Abelmoschus manihot. Peser avec précision un gramme d’AMS et le placer dans une fiole conique contenant 30 millilitres de 80% de méthanol.À l’aide d’un sonicateur à bain à ultrasons à 40 kilohertz, effectuez une extraction sur le mélange pendant 30 minutes à 25 degrés Celsius. Ensuite, centrifuger l’échantillon à 14 000 g pendant cinq minutes. Préparez une seringue d’injection et un filtre à membrane microporeuse organique de 0,22 micron, et filtrez le surnageant dans un flacon d’échantillon de deux millilitres.Après avoir allumé l’interrupteur de la pompe à vide, ouvrez la vanne principale du cylindre d’argon avec la soupape de pression partielle et ajustez la pression à environ 0,3 mégapascal. Ensuite, ouvrez la valve d’azote. Lancez le logiciel de contrôle de spectrométrie de masse, ou MS.Cliquez sur Heated ESI Source dans le panneau logiciel et définissez les paramètres MS, y compris la température du chauffage, les débits de gaz, la tension de pulvérisation pour les modes positif et négatif et la température capillaire. Cliquez sur le bouton Appliquer pour activer la source d’ions pour la chromatographie liquide ou LC.Préparez les phases mobiles A et B en utilisant de l’acide formique à 0,1% dans une solution aqueuse dans de l’acétonitrile pur respectivement. Dégazez-les dans un sonicateur à bain à ultrasons à 40 kilohertz pendant au moins 15 minutes avant de connecter les solutions aux passages de fluide A et B respectivement.Préparez une solution d’eau de méthanol volume par volume de 1:9, puis remplissez-la manuellement dans les bouteilles de liquide de nettoyage de la pompe et de l’injecteur. Après avoir lancé le logiciel de contrôle LC-MS, cliquez sur Contrôle direct pour ouvrir le panneau de commande LC. Ouvrez la vanne de purge dans le sens inverse des aiguilles d’une montre sur le module de pompe.Cliquez sur Plus d’option pour ouvrir le réglage de la pompe et régler les paramètres de purge à cinq millilitres par minute pendant trois minutes. Cliquez sur Purger pour commencer la suppression des bulles. Une fois cela fait, fermez la vanne de purge.Ensuite, cliquez sur Prime Seringue pour rincer la seringue pendant trois cycles, Wash Buffer Loop pour rincer la boucle pendant un cycle et Wash Needle Externally pour laver l’aiguille pendant un cycle. Placez le flacon d’échantillon dans l’échantillonneur. Cliquez sur Configuration de l’instrument pour ouvrir la fenêtre Édition de méthode et cliquez sur Nouveau pour créer une nouvelle méthode d’instrument LC-MS.Établissez une durée d’exécution totale pour la méthode et définissez la limite de pression. Débit total, gradient d’écoulement, température de l’échantillon, température de la colonne et delta de la température prête dans la fenêtre Modification de méthode. Pour la méthode MS, sélectionnez le type d’expérience MS général ou MSn.Entrez les valeurs du temps d’acquisition, de la polarité, de la plage de masse, du nombre de valeurs de déviation et de la durée. Cliquez sur Enregistrer pour configurer les paramètres en tant que méthode instrumentale. Cliquez sur Configuration de la séquence pour ouvrir la table de séquences, dans laquelle entrez les informations sur le type d’échantillon, le fichier, le nom, le chemin, l’ID de l’échantillon, la méthode de l’instrument, la position et le volume d’injection.Enregistrez la table de séquences en cliquant sur Enregistrer, puis implémentez les paramètres et lancez l’acquisition MS. Pour charger les données MS dans le logiciel de traitement des données, double-cliquez sur le fichier brut dans l’Explorateur. Dans le chromatogramme de pointe de base BPI, sélectionnez la zone maximale sous la courbe ou l’ASC en cliquant et en faisant glisser la souris.Le spectre MS correspondant sera affiché dans la même fenêtre. Sélectionnez un ion ciblé pour la prochaine analyse MS/MS. Rouvrez la fenêtre Modification de méthode et, dans le tableau des paramètres MSn, définissez le m/z de l’ion ciblé sur une décimale dans la colonne Masse parente.Ensuite, sélectionnez le mode de collision et entrez l’énergie de collision ou la valeur CE. Définissez la plage d’analyse MS/MS. Cliquez sur Enregistrer pour enregistrer la méthode MS et entrez un nouveau nom de fichier dans la table de séquence.Cliquez sur le bouton Démarrer pour lancer l’acquisition MS/MS. Une fois l’acquisition terminée, double-cliquez sur le fichier brut dans l’Explorateur pour charger le fichier brut MS/MS dans le logiciel de traitement des données. Identifiez l’ion fragment le plus fort du spectre et entrez sa valeur m/z dans la liste des méthodes MSn.Dans le tableau des paramètres MSn, définissez les paramètres MS3, y compris le mode de collision, la valeur CE et la plage de balayage. Encore une fois, cliquez sur Enregistrer pour enregistrer la méthode MS et entrez un nouveau nom de fichier dans la table de séquence. Cliquez sur Démarrer pour lancer l’acquisition MS3.Comme démontré précédemment, double-cliquez sur le fichier brut dans l’Explorateur pour charger le fichier brut MS3 dans le logiciel de traitement des données et répétez les étapes pour obtenir le spectre MS4. Pour analyser les données, double-cliquez sur les fichiers bruts pour ouvrir tous les spectres de masse de MS à MSn. Calculez manuellement les valeurs de différence m/z entre l’ion et les ions fragments correspondants.Ensuite, dessinez manuellement la structure de base en fonction des résultats MS4 et dérivez la structure originale en utilisant des groupes fonctionnels ou des segments moléculaires basés sur la valeur de différence m / z. Dessinez manuellement les chemins de clivage moléculaire en fonction de chaque structure moléculaire dans MSn. L’ESI-MS du cellobiose glucidique modèle a produit la molécule protéinée M H à m/z 365 en mode positif.Le balayage ionique du produit, ou CID MS/MS, a donné un deuxième fragment ionique à m/z 305. De plus, l’analyse MS3 et MS4 a abouti séquentiellement aux troisième et quatrième ions fragments à m/z 254 et m/z 185, respectivement. L’analyse MS/MS a révélé la séquence des fragmentations ioniques, à savoir l’hydrolyse par ouverture du cycle, le clivage CC et la déshydratation.Ainsi, cette méthode s’est avérée appropriée pour les glucides. L’analyse qualitative préliminaire de l’AMS à l’aide de LC Q-TOF MS a révélé la présence de nombreux composés inconnus. L’analyse MSn négative de l’ion M H à m/z 617 a produit un deuxième ion fragment à m/z 571.L’analyse MS3 de cet ion fragment a produit un troisième ion fragment à m/z 525 par la perte d’hydroxyéthyle sous forme de méthanol correspondant à 32 dalton et d’hydroxyle sous forme d’eau, soit 18 daltons. L’analyse MS4 a produit des ions de quatrième fragment à m/z 344 et 273. L’identification manuelle de la structure du noyau a révélé la structure moléculaire du composé à m/z 617 et ses chemins de clivage dans MSn.Le balayage ionique produit de l’ion M H d’un autre composé inconnu a été effectué, et sa structure moléculaire et son mécanisme de clivage ont également été révélés. Une fois la pompe à vide allumée, attendez au moins cinq heures pour vous assurer d’un degré de vide suffisant pour les conditions expérimentales. L’analyse statistique peut être utilisée pour rassembler les fragments ayant le même rapport masse / charge ou similaire.Avec l’augmentation de la solution de spectrométrie de masse, cette technique pourrait aider les chercheurs à obtenir de nouveaux composés en médecine naturelle.

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Fire-derived, pyrogenic carbon (PyC), sometimes called black carbon (BC), is the carbonaceous solid residue of biomass and fossil fuel combustion, such as ...

Rapid High-throughput Species Identification of Botanical Material Using Direct Analysis in Real Time High Resolution Mass Spectrometry

Rapid à haut débit Identification des espèces de matériel botanique Utilisation de l&#39;analyse directe en temps réel Résolution Spectrométrie de Masse Haute

We demonstrate that direct analysis in real time-high resolution mass spectrometry can be used to produce mass spectral profiles of botanical material, ...

Real-time Breath Analysis by Using Secondary Nanoelectrospray Ionization Coupled to High Resolution Mass Spectrometry

Analyse de l’haleine en temps réel en utilisant l’ionisation secondaire SPECTROMETRIE couplée à la spectrométrie de masse haute résolution

Exhaled volatile organic compounds (VOCs) have aroused considerable interest, since they can serve as biomarkers for disease diagnosis and environmental ...

Synthesis and Mass Spectrometry Analysis of Oligo-peptoids

Synthèse et analyse de spectrométrie de masse des Oligo-peptoids

Peptoids are sequence-controlled peptide-mimicking oligomers consisting of N-alkylated glycine units. Among many potential applications, peptoids have ...

Imaging Corrosion at the Metal-Paint Interface Using Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry

Corrosion par imagerie à l’interface métal-peinture utilisant la spectrométrie de masse ionique secondaire à temps de vol

Corrosion developed at the paint and aluminum (Al) metal-paint interface of an aluminum alloy is analyzed using time-of-flight secondary ion mass ...

Ion Mobility-Mass Spectrometry Techniques for Determining the Structure and Mechanisms of Metal Ion Recognition and Redox Activity of Metal Binding Oligopeptides

Techniques de spectrométrie de mobilité-masse d'ion pour déterminer la structure et les mécanismes de la reconnaissance d'ion de métal et de l'activité de Redox des Oligopeptides de liaison de métal