Name: Author Spotlight: Investigating Bacteriophage-Induced Immune Responses in Gnotobiotic Mice
Uploaded: 2024-01-26T13:55:00
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लेखक स्वीकार करते हैं कि जिस भूमि पर उन्होंने यह शोध किया है, वह xwməθkwəy̓əm (Musqueam) राष्ट्र का पारंपरिक, पैतृक और अविभाजित क्षेत्र है। यह जिस भूमि पर स्थित है, वह हमेशा मुस्कम लोगों के लिए सीखने का स्थान रहा है, जो सहस्राब्दियों से अपनी संस्कृति, इतिहास और परंपराओं में इस साइट पर एक पीढ़ी से दूसरी पीढ़ी तक चले गए हैं। हम दूसरों को उन मूल भूमि के बारे में अधिक जानने के लिए प्रोत्साहित करते हैं जिनमें वे रहते हैं और https://native-land.ca पर काम करते हैं। लेखक कनाडा के प्राकृतिक विज्ञान और इंजीनियरिंग परिषद (एनएसईआरसी) कनाडाई स्नातक छात्रवृत्ति - मास्टर (एनपी), माइकल स्मिथ हेल्थ रिसर्च बीसी ट्रेनी अवार्ड (आरटी-2023-3174, एमएच को), प्राकृतिक विज्ञान और इंजीनियरिंग रिसर्च काउंसिल ऑफ कनाडा (एनएसईआरसी) डिस्कवरी अनुदान कार्यक्रम (आरजीपिन-2019-04591 से सीटी, आरजीपीआईएन-2016-04282 से एलसीओ), कैनेडियन इंस्टीट्यूट फॉर एडवांस्ड रिसर्च/ह्यूमन एंड द माइक्रोबायोम (FL-001253 Appt 3362, सीटी), माइकल स्मिथ फाउंडेशन फॉर हेल्थ रिसर्च स्कॉलर अवार्ड (18239, सीटी को), कैनेडियन इंस्टीट्यूट फॉर हेल्थ रिसर्च (पीजेटी -159458 से एलसीओ) और कैनेडियन फाउंडेशन फॉर इनोवेशन (34673 से एलसीओ और 38277 से सीटी)। हम रोग मॉडलिंग और ubcFLOW के लिए UBC केंद्र से तकनीकी सहायता के लिए आभारी हैं, जो UBC GREx जैविक लचीलापन पहल द्वारा समर्थित है, और पांडुलिपि की महत्वपूर्ण चर्चा और मूल्यांकन के लिए Osborne और Tropini प्रयोगशालाओं के सदस्यों के लिए। चित्रा 1 ए और चित्रा 2 ए Biorender.com का उपयोग करके बनाए गए थे।

सभी प्रयोगों यूबीसी पशु देखभाल समिति और जैव सुरक्षा समिति द्वारा अनुमोदित प्रोटोकॉल (A23-0113, B19-0038) द्वारा स्थापित दिशा निर्देशों के अनुसार आयोजित किए गए थे. चूहों को ब्रिटिश कोलंबिया विश्वविद्यालय में रो?...

Exploring Gut Phage-Bacteria Dynamics in Murine Models Using T4 Phage

माइक्रोबायोम में फेज का अध्ययन उनके जीवाणु समकक्षों की तुलना में एक महत्वपूर्ण चुनौती प्रस्तुत करता है। विशेष रूप से, फेज में 16S और 18S राइबोसोमल सबयूनिट्स के समान सभी फेज के लिए आम तौर पर एक संरक्षित फ़ा?...

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	<tbody>
		<tr>
			<td>1-octanol (99%)</td>
			<td>Thermofisher</td>
			<td>CAAAA15977-AP</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50 ml PES Steriflip Sterile Disposable Vacuum Filter Units</td>
			<td>Millipore Sigma&#160;</td>
			<td>SCGP00525</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agarose (Low-EEO/Multi-Purpose/Molecular Biology Grade)</td>
			<td>Fisher BioReagents&#160;</td>
			<td>BP160-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Amicon&#174; 100kDa Ultra-15 centrifugal filter device, Ultracel-100</td>
			<td>Millipore Sigma</td>
			<td>UFC910008</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>BD Microtainer&#174; Tubes, SST</td>
			<td>BD Medical</td>
			<td>365967</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bioexclusion airtight cages (ISO cages)&#160;</td>
			<td>Techiplast</td>
			<td>1245ISOCAGE</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>C1000 Touch&#8482; Thermal Cycler with 96-Well Fast Reaction Module</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>1851196</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Calcium Chloride Dihydrate (White Crystals to Powder)</td>
			<td>Fisher BioReagents</td>
			<td>BP510-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cap Locks For 1.5ML Tube 100/pk</td>
			<td>Andwin Scientific&#160;</td>
			<td>16812612</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Chloroform (Ethanol as Preservative/Certified ACS)</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>C298-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Copper coated steel beads (4.5 mm)</td>
			<td>Crosman Corporation</td>
			<td>0767</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DNeasy Blood &#38; Tissue Kit (50)</td>
			<td>Thermo Scientific&#160;</td>
			<td>69504</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>DreamTaq Green PCR Master Mix (2X)</td>
			<td>Thermo Scientific&#160;</td>
			<td>K1081</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) disodium salt solution, for molecular biology, 0.5 M in H2O</td>
			<td>Sigma Aldrich</td>
			<td>E7889</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fisher BioReagents&#8482; Agar, Powder / Flakes, Fisher BioReagents&#8482;&#160;</td>
			<td>Fisher Bioreagents</td>
			<td>BP1423-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Fisher BioReagents&#8482; Microbiology Media: LB Broth (Powder) - Lennox&#160;</td>
			<td>Fisher Bioreagents</td>
			<td>BP1427-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>GeneRuler 100 bp DNA Ladder</td>
			<td>Thermo Scientific&#160;</td>
			<td>SM0241</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Green FastMix&#174; qPCR mix, 1250 rxns</td>
			<td>QuantaBio</td>
			<td>95072-012</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>HEPA filters for isocage lids, AUTOCLAVABLE H14 FILTERS FOR ISO LINE- IRRADIATED</td>
			<td>Techiplast</td>
			<td>UISOHEPAXTBOX-300</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Magnesium sulfate heptahydrate</td>
			<td>Fisher BioReagents</td>
			<td>BP213-1</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>MaxQ 6000 Incubated Shaker</td>
			<td>Thermo Scientific&#160;</td>
			<td>8354-30-0009</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microbiology Media: LB Broth (Powder) - Lennox</td>
			<td>Fisher BioReagents</td>
			<td>BP1427-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Microcentrifuge Tubes with Locking Snap Cap, 2ml</td>
			<td>Fisher</td>
			<td>14-666-315</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Parafilm sealing film</td>
			<td>Bemis</td>
			<td>PM-996</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Phage stocks</td>
			<td>Carolina Biological Supply&#160;</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>PicoLab&#174; Mouse Diet 20 EXT</td>
			<td>LabDiet</td>
			<td>5R58</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pierce&#8482; Chromogenic Endotoxin Quant Kit</td>
			<td>Thermo Scientific&#160;</td>
			<td>A39552S</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNase A (17,500 U)</td>
			<td>Qiagen</td>
			<td>19101</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>RNase-free DNase Set</td>
			<td>Qiagen&#160;</td>
			<td>79254</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Bicarbonate (Fine White Powder)</td>
			<td>Fisher Chemical</td>
			<td>BP328-500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium Chloride (Crystalline/Certified ACS)</td>
			<td>Fisher Chemical</td>
			<td>S271</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sonicator (probe model CL-18; power source model FB50)</td>
			<td>Fisher scentific&#160;</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sterile flexible film isolator&#160;</td>
			<td>Class Biologically Clean&#160;</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>SYBR&#8482; Safe DNA Gel Stain</td>
			<td>Invitrogen</td>
			<td>S33102</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>T100 Thermal Cycler&#160;</td>
			<td>BioRad</td>
			<td>1861096</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>T4 phage primer, forward (CCACACATAGCGCGAGTATAA)</td>
			<td>IDT</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>T4 phage primer, forward (GAAACTCGGTCAGGCTATCAA)</td>
			<td>IDT</td>
			<td>n/a</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TissueLyser II&#160;</td>
			<td>Qiagen&#160;</td>
			<td>85300</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tris-HCl, 1M Solution, pH 8.0, Molecular Biology Grade, Ultrapure</td>
			<td>Thermo Scientific&#160;</td>
			<td>AAJ22638AE</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Water, (DNASE, RNASE free)</td>
			<td>Fisher BioReagents</td>
			<td>BP2484100</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

t4 bacteriophage and e. coli interaction in the murine intestine: a prototypical model for studying host-bacteriophage dynamics in vivo

बैक्टीरियोफेज (फेज) वायरस हैं जो प्रजातियों के साथ बैक्टीरिया को संक्रमित करते हैं- और तनाव-स्तर की विशिष्टता और सभी ज्ञात पारिस्थितिक तंत्रों में सबसे प्रचुर मात्रा में जैविक संस्थाएं हैं। जीवाणु समुदायों के भीतर, जैसे कि आंत माइक्रोबायोटा में पाए जाते हैं, फेज को माइक्रोबायोटा जनसंख्या गतिशीलता को विनियमित करने और बैक्टीरिया के विकास को चलाने में फंसाया जाता है। पिछले दशक में फेज अनुसंधान में नए सिरे से रुचि रही है, आंशिक रूप से लिटिक फेज की मेजबान-विशिष्ट हत्या क्षमताओं के कारण, जो रोगाणुरोधी प्रतिरोधी बैक्टीरिया के बढ़ते खतरे का मुकाबला करने के लिए एक आशाजनक उपकरण प्रदान करते हैं। इसके अलावा, हाल के अध्ययनों से पता चलता है कि फेज आंतों के बलगम का पालन करते हैं, सुझाव देते हैं कि अंतर्निहित उपकला में बैक्टीरिया के आक्रमण को रोकने में उनकी सुरक्षात्मक भूमिका हो सकती है। महत्वपूर्ण रूप से, बैक्टीरियल माइक्रोबायोम की तरह, बाधित फेजोम सूजन आंत्र रोग जैसी बीमारियों में खराब परिणामों से जुड़े हुए हैं। पिछले अध्ययनों से पता चला है कि फेज फेकल फिल्ट्रेट प्रत्यारोपण के माध्यम से जानवरों और मनुष्यों के माइक्रोबायोम को संशोधित कर सकते हैं, जिससे मेजबान के स्वास्थ्य को लाभ होता है। अनुसंधान की इस हालिया लहर के साथ आंत माइक्रोबायोम के संदर्भ में फेज का अध्ययन करने के लिए प्रोटोकॉल स्थापित करने और मानकीकृत करने की आवश्यकता आती है। यह प्रोटोकॉल murine जठरांत्र संबंधी मार्ग के संदर्भ में पृथक T4 फेज और उनके जीवाणु मेजबान, Escherichia कोलाई का अध्ययन करने के लिए प्रक्रियाओं का एक सेट प्रदान करता है। यहां वर्णित विधियां बताती हैं कि फेज लाइसेट से कैसे शुरू किया जाए, इसे चूहों को प्रशासित किया जाए और बैक्टीरिया के मेजबान और फेज के स्तर पर प्रभाव का आकलन किया जाए। इस प्रोटोकॉल को संशोधित किया जा सकता है और अन्य फेज-बैक्टीरियल जोड़े पर लागू किया जा सकता है और विवो में मेजबान-फेज गतिशीलता का अध्ययन करने के लिए एक प्रारंभिक बिंदु प्रदान करता है।

T4 Bacteriophage and E. coli Interaction in the Murine Intestine: A Prototypical Model for Studying Host-Bacteriophage Dynamics In Vivo

मूत्र आंत में टी 4 फेज / ई कोलाई डाईड के बीच बातचीत की जांच करने के लिए, टी 4 फेज और वाहन lysates तैयार, साफ और शुद्ध (चित्रा 1 ए) थे। T4 फेज lysates पट्टिका परख द्वारा titered थे और एसएम बफर में 2 x 107 pfu/mL (2 x 106 pfu...

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Author Spotlight: Investigating Bacteriophage-Induced Immune Responses in Gnotobiotic Mice

बैक्टीरियोफेज (फेज), वायरस जो बैक्टीरिया को संक्रमित करते हैं, आंत माइक्रोबायोम का एक अभिन्न अंग हैं। हालांकि ये सहजीवी निवासी बैक्टीरियल फिटनेस और जनसंख्या की गतिशीलता को चलाते हैं, लेकिन इस बारे में बहुत कम समझा जाता है कि वे आंत होमियोस्टेसिस और बीमारी को कैसे प्रभावित करते हैं। यह प्रोटोकॉल एक माउस मॉडल के भीतर अलग-थलग टी 4 फेज का अध्ययन करता है, जो अन्य फेज-बैक्टीरियल जोड़े के अनुकूल है।

T4 बैक्टीरियोफेज और ई. murine आंत में कोलाई बातचीत: विवो में मेजबान-बैक्टीरियोफेज गतिशीलता का अध्ययन करने के लिए एक प्रोटोटाइप मॉडल

Bacteriophages (phages) are viruses that infect bacteria with species- and strain-level specificity and are the most abundant biological entities across ...

हमारे शोध का उद्देश्य बैक्टीरियोफेज बैक्टीरिया और स्तनधारी प्रतिरक्षा प्रणाली के बीच आंत, ग्नोटोबायोटिक माउस आंत के संदर्भ में त्रिपक्षीय बातचीत को समझना है। हम आंत माइक्रोबायोम के महत्व को बेहतर ढंग से समझने के लिए स्वास्थ्य और रोग की स्थिति के तहत इन इंटरैक्शन में अंतर्दृष्टि प्राप्त करने की उम्मीद करते हैं। हाल के घटनाक्रमों में पाया गया है कि स्तनधारी प्रतिरक्षा प्रणाली द्वारा बैक्टीरियोफेज का पता लगाया जा सकता है।यह सुझाव दिया गया है कि मानव आंत के फाजोम को सूजन आंत्र विकार जैसी रोग स्थितियों में अनियंत्रित किया जा सकता है, और फेज द्वारा प्रतिरक्षा उत्तेजना रोग फेनोटाइप को बढ़ा सकती है। हमारा लक्ष्य ग्नोटोबायोटिक माउस मॉडल में टीकाकरण और गणना के लिए एक T4 फेज लाइसेट के उत्पादन के लिए एक मानकीकृत प्रोटोकॉल के साथ दूसरों को प्रदान करना है। इन प्रोटोकॉल पर बनाया जा सकता है और अन्य बैक्टीरियोफेज बैक्टीरिया जोड़े के साथ उपयोग के लिए संशोधित.