우리는 항생제 내성의 기저에 있는 진화, 전달 및 분자 메커니즘에 관심이 있습니다. 구체적으로 말하자면, 이 논문에 담긴 작업은 환경 저항에 대한 우리의 관심에서 비롯된 것입니다. 현재 우리는 1년 분량의 데이터를 사용하여 항생제 내성의 공간적 변화를 추적하기 위한 로컬 데이터베이스를 구축하려고 합니다.
배양 기반 기술과 유전체학의 조합은 항생제 내성을 검출하고 모니터링하는 데 사용됩니다. 샘플의 DNA는 PCR 또는 샷건 염기서열 분석을 거쳐 미생물 다양성을 프로파일링하고 내성 유전자를 검출합니다. 또한 메타바코딩 및 유전자 기반 AMR 패널은 고급 AMR 검출에 사용됩니다.
단편화된 저분자량 DNA는 AMR 유전자의 저장소로 알려져 있지만, 선형 및 저분자량 DNA의 고수율 추출에 특화된 방법 개발에 대한 연구는 거의 이루어지지 않았습니다. 우리의 업무는 이 격차를 해소하는 데 중점을 둡니다. 당사의 프로토콜은 폐수에서 추출한 저분자량 DNA의 비율을 강화하기 위한 간단한 전처리 단계를 도입합니다.
그 결과, 유리 DNA 분획을 배제하지 않고 환경 AMR을 전체적으로 포획할 수 있습니다. 이 프로토콜은 약간의 작업으로 키트가 없는 방법으로 개발할 수 있습니다. 결과적으로 이는 환경 AMR을 포집하기 위한 비용 효율적인 기술을 개발할 수 있는 길을 열어줍니다.
우리는 돌연변이 내성을 넘어 비유전적 메커니즘이 항생제 내성에 미치는 영향을 탐구하고자 합니다. 우리는 특히 수평적 유전자 전달과 게놈 돌연변이가 다양한 환경에서 항생제에 대한 적응에 미치는 상대적 기여도를 비교하는 데 관심이 있습니다.