Name: non-invasive 3d-visualization with sub-micron resolution using synchrotron-x-ray-tomography
Uploaded: 2008-05-27T00:00:00
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Ringraziamo Paavo Bergmann, Michael Laumann, e Sebastian Schmelzle per il loro aiuto presso l&#39;ESRF. Questo lavoro è stato supportato dal progetto europeo delle radiazioni al sincrotrone SC-2127 attraverso l&#39;assegnazione di tempo del fascio.

Animali utilizzati in questo studio I campioni dell&#39;acaro partenogenetica oribatid Archegozetes longisetosus (Acari, Oribatida) sono state prese dalla nostra cultura di laboratorio. La cultura si sviluppa su un intonaco di Parigi / mix carbone (9:1) in vasi di plastica, nel buio costante a 20-23 ° C con circa il 90% di umidità dell&#39;aria. Preparazione del campione <ol><li> I campioni sono stati prelevati dalla cultura, pulita con un pennello fine e collo...

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	<li>Betz, O., Wegst, U., Weide, D., Heethoff, M., Helfen, L., Lee, W. -. K., Cloetens, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+applications+of+synchrotron+X-ray+phase-contrast+microtomography+in+biological+morphology+and+biomaterial+science.+I.+General+aspects+of+the+technique+and+its+advantages+in+the+analysis+of+millimetre-sized+arthropod+structure.">Imaging applications of synchrotron X-ray phase-contrast microtomography in biological morphology and biomaterial science. I. General aspects of the technique and its advantages in the analysis of millimetre-sized arthropod structure.</a> J. Microscopy. 22, 51-71 (2007).</li><li>Cloetens, P., Barrett, R., Baruchel, J., Guigay, J. P., Schlenker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phase+objects+in+synchrotron+radiation+hard+X-ray+imaging.">Phase objects in synchrotron radiation hard X-ray imaging.</a> J. Phys. D: Appl. Phys. 29, 133-146 (1996).</li><li>Cloetens, P., Pateyron-Salome, M., Buffiere, J. Y., Peix, G., Baruchel, J., Peyrin, V., Schlenker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Observation+in+microstructure+and+damage+in+materials+by+phase+sensitive+radiography+and+tomography.">Observation in microstructure and damage in materials by phase sensitive radiography and tomography.</a> J. Apll. Phys. 81, 5878-5886 (1997).</li><li>Clotens, P., Ludwig, W., Baruchel, J., van Dyck, D., van Landyut, J., Guigay, J. P., Schlenker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Holotomography:+quantitative+phase+tomography+with+micrometer+resolution+using+hard+synchrotron+radiation+X-rays.">Holotomography: quantitative phase tomography with micrometer resolution using hard synchrotron radiation X-rays.</a> Appl. Phys. Lett. 75, 2912-2914 (1999).</li><li>Heethoff, M., Cloetens, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Comparison+of+aynchrotron+X-ray+phase+contrast+tomography+and+holotomography+for+non-invasive+investigations+of+the+internal+anatomy+of+mites.">A Comparison of aynchrotron X-ray phase contrast tomography and holotomography for non-invasive investigations of the internal anatomy of mites.</a> Soil Organisms. , (2008).</li></ol>

In questa presentazione, ci siamo concentrati sulla visualizzazione 3D dell&#39;anatomia interna di un chelicerate micro-artropodi. I raggi X di sincrotrone misurazioni permettono un pixel di risoluzione fino a 0.3μm, a seconda delle dimensioni del campione. Qui, abbiamo dimostrato con dati 0.7μm pixel di risoluzione. In generale, sincrotrone tomografia a raggi X può essere utile per analizzare piccoli materiali biologici (o tessuti) a basso raggi X attenuazione. La risoluzione raggiunge quasi quella della microscopia ottica convenzional...

non-invasive 3d-visualization with sub-micron resolution using synchrotron-x-ray-tomography

Poco si sa circa l&#39;organizzazione interna di molte micro-artropodi corpo con dimensioni inferiori a 1 mm. Le ragioni di che sono le dimensioni ridotte e la cuticola dura che rende difficile utilizzare protocolli di istologia classica. Inoltre, sezionamento istologici distrugge il campione e non può quindi essere utilizzato per materiale unico. Quindi, un metodo non distruttivo è auspicabile che consente di visualizzare all&#39;interno di piccoli campioni, senza la necessità di sezionamento. Abbiamo usato sincrotrone tomografia a raggi X alla European Synchrotron Radiation Facility (ESRF) a Grenoble (Francia) per non invasivo produrre set di dati 3D tomografiche con un pixel-risoluzione di 0.7μm. Utilizzando il software di rendering del volume, questo ci permette di ricostruire l&#39;organizzazione interna nel suo stato naturale, senza gli artefatti prodotti dal sezionamento istologico. Queste data può essere utilizzato per la morfologia quantitativa, punti di riferimento, o per la visualizzazione di film d&#39;animazione per capire la struttura delle parti del corpo nascoste ed a seguire sistemi di organi o tessuti completi attraverso i campioni.

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Non-invasive 3D-Visualization with Sub-micron Resolution Using Synchrotron-X-ray-tomography

Abbiamo usato sincrotrone tomografia a raggi X alla European Synchrotron Radiation Facility (ESRF) a non invasivo produrre set di dati 3D tomografiche con un pixel-risoluzione di 0.7μm. Utilizzando il software di rendering del volume, questo permette la ricostruzione di strutture interne allo stato naturale, senza gli artefatti prodotti dal sezionamento istologico.

Non invasive di visualizzazione 3D con sub-micron Risoluzione Utilizzando sincrotrone a raggi-X, la tomografia

Little is known about the internal organization of many micro-arthropods with body sizes below 1 mm. The reasons for that are the small size and the hard ...

Research

JoVE Journal

Biology

Labeling hESCs and hMSCs with Iron Oxide Nanoparticles for Non-Invasive in vivo Tracking with MR Imaging

Etichettatura hESC e hMSCs con nanoparticelle di ossido di ferro per i non-invasiva in vivo inseguimento con la RM

In recent years, stem cell research has led to a better understanding of developmental biology, various diseases and its potential impact on regenerative ...

Ricerca

Biologia

Labeling Stem Cells with Fluorescent Dyes for non-invasive Detection with Optical Imaging

Etichettatura Cellule staminali con le tinture fluorescenti per la rilevazione non invasiva con Optical Imaging

Optical imaging (OI) is an easy, fast and inexpensive tool for in vivo monitoring of new stem cell based therapies. The technique is based on ex vivo ...

A Reversible, Non-invasive Method for Airway Resistance Measurements and Bronchoalveolar Lavage Fluid Sampling in Mice

Un reversibile, metodo non invasivo per le misure di resistenza delle vie aeree e liquido di lavaggio broncoalveolare di campionamento nei topi

Airway hyperreactivity (AHR) measurements and bronchoalveolar lavage (BAL) fluid sampling are essential to experimental asthma models, but repeated ...

iCLIP - Transcriptome-wide Mapping of Protein-RNA Interactions with Individual Nucleotide Resolution

iClip - trascrittoma livello Mappatura delle interazioni proteina-RNA con risoluzione individuale Nucleotide

The unique composition and spatial arrangement of RNA-binding proteins (RBPs) on a transcript guide the diverse aspects of post-transcriptional ...

Rapid and Efficient Zebrafish Genotyping Using PCR with High-resolution Melt Analysis

Rapido ed efficiente Zebrafish genotipizzazione Uso PCR con ad alta risoluzione Melt Analysis

Zebrafish is a powerful vertebrate model system for studying development, modeling disease, and performing drug screening. Recently a variety of genetic ...

Who is Who? Non-invasive Methods to Individually Sex and Mark Altricial Chicks

Chi è Chi? Metodi non invasivi per Sex autonomamente e Mark altricial Chicks

Many experiments require early determination of offspring's sex as well as early marking of newborns for individual recognition. According to animal ...

Fecal Glucocorticoid Analysis: Non-invasive Adrenal Monitoring in Equids

Fecale Analisi glucocorticoidi: non invasivo di monitoraggio surrenale in equidi

Adrenal activity can be assessed in the equine species by analysis of feces for corticosterone metabolites. During a potentially aversive situation, ...

Open-source Single-particle Analysis for Super-resolution Microscopy with VirusMapper

Analisi singola particella open-source per Super-risoluzione Microscopia con VirusMapper

Super-resolution fluorescence microscopy is currently revolutionizing cell biology research. Its capacity to break the resolution limit of around 300 nm ...

Analysis of Beta-cell Function Using Single-cell Resolution Calcium Imaging in Zebrafish Islets

Analisi della funzione Beta-cellulare usando la formazione immagine del calcio cella singola risoluzione in Zebrafish isolotti

Pancreatic beta-cells respond to increasing blood glucose concentrations by secreting the hormone insulin. The dysfunction of beta-cells leads to ...

Isolating Myofibrils from Skeletal Muscle Biopsies and Determining Contractile Function with a Nano-Newton Resolution Force Transducer

Isolamento di Myofibrils da biopsie muscolari scheletriche e determinazione della funzione Contractile con un trasduttore della forza di risoluzione Nano-Newton

Striated muscle cells are indispensable for the activity of humans and animals. Single muscle fibers are comprised of myofibrils, which consist of ...