Name: non-invasive 3d-visualization with sub-micron resolution using synchrotron-x-ray-tomography
Uploaded: 2008-05-27T00:00:00
Description: Watch this Scientific Journal Video about Non-invasive 3D-Visualization with Sub-micron Resolution Using Synchrotron-X-ray-tomography at JoVE.com

Vi tackar Paavo Bergmann, Michael Laumann, och Sebastian Schmelzle för deras hjälp vid ESRF. Detta arbete stöddes av European Synchrotron Radiation Facility projekt SC-2127 genom tilldelning av balken tid.

Djur som används i denna studie Exemplar av partenogenetiska oribatid kvalster Archegozetes longisetosus (Acari, Oribatida) togs från vårt laboratorium kultur. Kulturen växer på en gips / kol blandning (9:1) i plast burkar, i konstant mörker vid 20-23 ° C med ca 90% av luftfuktighet. Provberedning <ol><li> Prover togs från kulturen, rengöras med en fin pensel och placeras i en 06:03:01 blandning av 80% etanol, 35% formaldehyd och 100% ättiksyra i 24 tim...

<ol>
	<li>Betz, O., Wegst, U., Weide, D., Heethoff, M., Helfen, L., Lee, W. -. K., Cloetens, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Imaging+applications+of+synchrotron+X-ray+phase-contrast+microtomography+in+biological+morphology+and+biomaterial+science.+I.+General+aspects+of+the+technique+and+its+advantages+in+the+analysis+of+millimetre-sized+arthropod+structure.">Imaging applications of synchrotron X-ray phase-contrast microtomography in biological morphology and biomaterial science. I. General aspects of the technique and its advantages in the analysis of millimetre-sized arthropod structure.</a> J. Microscopy. 22, 51-71 (2007).</li><li>Cloetens, P., Barrett, R., Baruchel, J., Guigay, J. P., Schlenker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Phase+objects+in+synchrotron+radiation+hard+X-ray+imaging.">Phase objects in synchrotron radiation hard X-ray imaging.</a> J. Phys. D: Appl. Phys. 29, 133-146 (1996).</li><li>Cloetens, P., Pateyron-Salome, M., Buffiere, J. Y., Peix, G., Baruchel, J., Peyrin, V., Schlenker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Observation+in+microstructure+and+damage+in+materials+by+phase+sensitive+radiography+and+tomography.">Observation in microstructure and damage in materials by phase sensitive radiography and tomography.</a> J. Apll. Phys. 81, 5878-5886 (1997).</li><li>Clotens, P., Ludwig, W., Baruchel, J., van Dyck, D., van Landyut, J., Guigay, J. P., Schlenker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Holotomography:+quantitative+phase+tomography+with+micrometer+resolution+using+hard+synchrotron+radiation+X-rays.">Holotomography: quantitative phase tomography with micrometer resolution using hard synchrotron radiation X-rays.</a> Appl. Phys. Lett. 75, 2912-2914 (1999).</li><li>Heethoff, M., Cloetens, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+Comparison+of+aynchrotron+X-ray+phase+contrast+tomography+and+holotomography+for+non-invasive+investigations+of+the+internal+anatomy+of+mites.">A Comparison of aynchrotron X-ray phase contrast tomography and holotomography for non-invasive investigations of the internal anatomy of mites.</a> Soil Organisms. , (2008).</li></ol>

I denna presentation har vi fokuserat på 3D-visualisering av interna anatomi en chelicerate mikro-leddjur. Den synkrotron röntgen mätningar möjliggör en pixel-upplösning ner till 0.3μm, beroende på storleken av provet. Här har vi visat data med 0.7μm pixlars upplösning. Generellt kan synkrotron Röntgenstrålstomografi vara användbart för att analysera små biologiskt material (eller vävnader) med låg röntgen dämpning. Den pixlar når nästan som på vanliga ljusmikroskop. Tekniken kan tillämpas på alla typer av material ...

non-invasive 3d-visualization with sub-micron resolution using synchrotron-x-ray-tomography

Lite är känt om den interna organisationen för många mikro-leddjur med kroppen storlekar under 1 mm. Skälen till detta är den lilla storleken och den hårda nagelband, vilket gör det svårt att använda protokoll av klassisk histologi. Dessutom förstör histologisk snittning provet och kan därför inte användas för unika material. Därför är en icke-förstörande metod önskvärt vilket gör det möjligt att se insidan små prover utan behov av snittning. Vi använde synkrotron Röntgenstrålstomografi på europeisk Synchrotron (ESRF) i Grenoble (Frankrike) till icke-invasivt producera 3D tomografiska dataset med en pixel-upplösning på 0.7μm. Använda programvara volym rendering, ger detta oss att rekonstruera den interna organisationen i sitt naturliga tillstånd utan artefakter som produceras av histologisk snittning. Dessa datum kan användas för kvantitativa morfologi, landmärken, eller för visualisering av animerade filmer för att förstå strukturen av dolda kroppsdelar och följa kompletta organsystem eller vävnader genom prover.

Watch this Scientific Journal Video about Non-invasive 3D-Visualization with Sub-micron Resolution Using Synchrotron-X-ray-tomography at JoVE.com

Non-invasive 3D-Visualization with Sub-micron Resolution Using Synchrotron-X-ray-tomography

Vi använde synkrotron Röntgenstrålstomografi på europeisk Synchrotron (ESRF) till icke-invasivt producera 3D tomografiska dataset med en pixel-upplösning på 0.7μm. Använda programvara volym rendering ger detta återuppbyggnaden av interna strukturer i sitt naturliga tillstånd utan artefakter som produceras av histologisk snittning.

Icke-invasiv 3D-visualisering med submikrona upplösning Använda Synchrotron-röntgen-tomografi

Little is known about the internal organization of many micro-arthropods with body sizes below 1 mm. The reasons for that are the small size and the hard ...

Research

JoVE Journal

Biology

Labeling hESCs and hMSCs with Iron Oxide Nanoparticles for Non-Invasive in vivo Tracking with MR Imaging

Märkning hESCs och hMSCs med nanopartiklar av järnoxid för icke-invasiv in vivo-spårning med MR

In recent years, stem cell research has led to a better understanding of developmental biology, various diseases and its potential impact on regenerative ...

Labeling Stem Cells with Fluorescent Dyes for non-invasive Detection with Optical Imaging

Märkning stamceller med fluorescerande färger för icke-invasiv Detection med optisk avbildning

Optical imaging (OI) is an easy, fast and inexpensive tool for in vivo monitoring of new stem cell based therapies. The technique is based on ex vivo ...

A Reversible, Non-invasive Method for Airway Resistance Measurements and Bronchoalveolar Lavage Fluid Sampling in Mice

En reversibel, icke-invasiv metod för mätningar luftvägsmotståndet och lungsköljning Fluid Provtagning i Möss

Airway hyperreactivity (AHR) measurements and bronchoalveolar lavage (BAL) fluid sampling are essential to experimental asthma models, but repeated ...

iCLIP - Transcriptome-wide Mapping of Protein-RNA Interactions with Individual Nucleotide Resolution

iCLIP - transkriptom hela Kartläggning av protein-RNA interaktioner med individuella Nukleotid Upplösning

The unique composition and spatial arrangement of RNA-binding proteins (RBPs) on a transcript guide the diverse aspects of post-transcriptional ...

Rapid and Efficient Zebrafish Genotyping Using PCR with High-resolution Melt Analysis

Snabb och effektiv Zebrafish Genotyping Använda PCR med hög upplösning Smält Analysis

Zebrafish is a powerful vertebrate model system for studying development, modeling disease, and performing drug screening. Recently a variety of genetic ...

Who is Who? Non-invasive Methods to Individually Sex and Mark Altricial Chicks

Vem är vem? Icke-invasiva metoder för att individuellt Sex och Mark altricial Chicks

Many experiments require early determination of offspring's sex as well as early marking of newborns for individual recognition. According to animal ...

Fecal Glucocorticoid Analysis: Non-invasive Adrenal Monitoring in Equids

Fekal Glukokortikoid Analys: Icke-invasiv Adrenal Övervakning av equids

Adrenal activity can be assessed in the equine species by analysis of feces for corticosterone metabolites. During a potentially aversive situation, ...

Open-source Single-particle Analysis for Super-resolution Microscopy with VirusMapper

Öppen källkod Single-partikelanalys för Super högupplösande mikroskopering med VirusMapper

Super-resolution fluorescence microscopy is currently revolutionizing cell biology research. Its capacity to break the resolution limit of around 300 nm ...

Analysis of Beta-cell Function Using Single-cell Resolution Calcium Imaging in Zebrafish Islets

Analys av Beta-cell-funktion som använder Single-cell Resolution kalcium Imaging i zebrafiskar holmar

Pancreatic beta-cells respond to increasing blood glucose concentrations by secreting the hormone insulin. The dysfunction of beta-cells leads to ...

Isolating Myofibrils from Skeletal Muscle Biopsies and Determining Contractile Function with a Nano-Newton Resolution Force Transducer

Isolera Myofibrils från skelettmuskulatur tarmbiopsier och bestämma Contractile funktion med en Nano-Newton Resolution Force Transducer

Striated muscle cells are indispensable for the activity of humans and animals. Single muscle fibers are comprised of myofibrils, which consist of ...