A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Method Article
توضح هذه الدراسة تشخيص أنفلونزا الطيور في الطيور البرية المحمولة باستخدام RRT - PCR النظام. الأسلوب يستفيد من تجميد المجفف الكواشف لفحص الطيور البرية في وضع غير مختبر ، نموذجية من سيناريو الفاشية. استخدام الأدوات الجزيئية يوفر بدائل دقيقة وحساسة للتشخيص السريع.
وقد تسببت الطيور البرية في انتشار أنفلونزا الطيور عالية الإمراض (HPAI) من سلالة H5N1 ، مما دفع المراقبة على طول مسارات طيران المهاجرة. غالبا ما يجري أخذ عينات من الطيور البرية لفيروس انفلونزا الطيور (AIV) في المناطق النائية ، ولكن النتائج غالبا ما تتأخر بسبب الحاجة لنقل العينات الى مختبر مجهز لاختبار الجزيئية. في الوقت الحقيقي تفاعل البلمرة العكسية الناسخ (RRT - PCR) هي تقنية الجزيئية التي يقدم واحدة من الأساليب الأكثر دقة وحساسية لتشخيص AIV. هي الآن بروتوكولات صارمة من قبل المختبر اللازمة لRRT - PCR يجري تكييفها للحقل. وأدى تطوير كواشف تجميد المجفف (مجفف بالتجميد) التي لا تتطلب سلسلة التبريد ، مع حساسية على مستوى الكواشف الرطب على موقع الاختبار بعيد إلى هدف عملي.
هنا نقدم طريقة للتشخيص السريع للAIV في الطيور البرية باستخدام وحدة RRT - PCR (جهاز صدمات القوية المتقدمة تحديد مسببات الأمراض أو السريع ، وايداهو تكنولوجيز ، سولت لايك سيتي ، UT) التي توظف الكواشف مجفف بالتجميد (الأنفلونزا من الهدف 1 Taqman ؛ الاساي ASY - 0109 - ، ايداهو تكنولوجيز). الكواشف تحتوي على كافة المكونات الضرورية لاختبار بتركيزات مناسبة في أنبوب واحد : الاشعال ، وتحقيقات ، والإنزيمات ، ومخازن والضوابط الإيجابية الداخلية ، والقضاء على الأخطاء المرتبطة التخزين غير لائق أو التعامل مع الكواشف الرطب. وحدة محمولة ينفذ الشاشة لمكافحة الأنفلونزا من خلال استهداف الجينات مصفوفة وتعطي نتائج في غضون 2-3 ساعات. التصنيف الفرعي الوراثية من الممكن أيضا مع التمهيدي H5 و H7 مجموعات التي تستهدف الجين راصة دموية.
هذا النظام هو مناسب للاستخدام على عينات جمعت المذرقية والفم والبلعوم من الطيور البرية ، كما يتضح هنا على الأنواع المهاجرة shorebird ، والطيطوي الغربية (Calidrus ماوري) اعتقل في ولاية كاليفورنيا الشمالية. ثم التعامل مع الحيوانات البروتوكولات التي وافقت عليها لجنة رعاية الحيوان واستخدام الولايات المتحدة للمسح الجيولوجي الغربية مركز البحوث البيئية وتصاريح من الهيئة الامريكية للمسح الجيولوجي الطيور مختبر التطويق. الميزة الرئيسية لهذه التقنية هو تسريع التشخيص من الطيور البرية ، وزيادة فرص احتواء تفشي هذا المرض في مكان بعيد. وعلى موقع التشخيص يكون مفيدا أيضا لتحديد ودراسة الأشخاص المصابين في الأنواع البرية. سيكون فرصة لجمع المعلومات عن الأحياء المضيف (الاستجابة المناعية والفسيولوجية للإصابة) ، والبيئة المكانية (أداء المهاجرة من الطيور المصابة) توفير نظرة ثاقبة على مدى الطيور البرية يمكن أن تكون بمثابة موجهات لAIV لمسافات طويلة.
1. الطيور البرية التقاط باستخدام الشباك الضباب
2. المسحة المذرقية أخذ العينات
3. البلعوم مسحة أخذ العينات
4. تداول الطيور والإفراج
5. مرافق الاختبار
6. استخراج الحمض النووي الريبي
7. إعداد الضوابط السلبية
8. إعداد عينات الاختبار
9. إعداد الضوابط الإيجابية
10. أنابيب الطرد المركزي الشعرية
11. التشغيل السريع
12. ممثل النتائج :
> النتائج المحتملة تشمل ما يلي :
الحاضر : أحمر 'الحاضر' دعوة لاختبار / عينة مجهولة تشير إلى أنه تم تحديد الهدف في تلك العينة والضوابط كانت ناجحة.
لم يتم الكشف عن : A الخضراء "لم يتم الكشف عن" دعوة لاختبار / عينة مجهولة لا تشير إلى أنه تم تحديد الهدف في تلك العينة واختبار الضوابط كانت ناجحة.
يرجى أكرر : A 'الرجاء تكرار" يشير إلى أن السيطرة إيجابية أو سلبية فاشلة.
ويرد مثال لتحليل الناجحة التي قام بها في 7200 RAPID في الشكل 4. يتم تضخيمه لسيطرة الإيجابية ويولد مضان كشفها (المحور الصادي) في حوالي 25 دورة (محور س). عتبة دورة (CT)> 35 هو وقف انتاج المواد الانشطارية وافقت على معظم المختبرات المرجعية AIV. لذلك ، أنتجت الضوابط الإيجابية لهذا الأسلوب إشارة الفلورسنت ضمن عدد من الدورات قبلت (0-35) للكشف عن AIV. في المقابل ، فإن السيطرة السلبية لا تولد إشارة الفلورسنت حتى بعد 45 دورات. وبالمثل ، فإن العينات التي تم جمعها من twelve الطيطوي الغربية لم تولد إشارة الفلورسنت مشيرا الى ان الطيور كانت سلبية للAIV. ومما يشجع متابعة اختبار جميع العينات الايجابية في المختبر التقليدية لضمان أن يتم إنتاج أي خطأ ايجابيات كاذبة.
التقاط Shorebird الرقم 1. استخدام شبكات الضباب.
الشكل 2. المذرقية جمع العينات والفم والبلعوم من أقل الطيطوي.
الشكل 3. برمجة 7200 RAPID لتضخيم الحمض النووي الريبي.
الشكل 4. Fluorogram التي تم إنشاؤها بواسطة RAPID 7200 المحمولة RRT - PCR تبين كيف الضوابط الإيجابية والسلبية يجب أن تظهر في الفحص بنجاح. انقر هنا لعرض صورة كاملة الحجم
طريقة التشخيص السريع المطروحة هنا يسهل اختبار الزمن كفاءة ودقة من عينات الطيور البرية لمراقبة AIV. تخزين العينات أقل صرامة بكثير من متطلبات المحمولة RRT - PCR هي مناسبة للحالات النائية حيث الحفاظ على سلسلة التبريد قد يكون غير عملي إذا الشاحنين النتروجين السائل أو الثلج ا...
الإعلان عن أي تضارب في المصالح.
نود أن نشكر M. R. كريسب Scullion وتكنولوجيات ايداهو للحصول على الدعم التقني والأبحاث البيئية الغربية مركز المسح الجيولوجي الأميركية للحصول على تمويل (S. Schwarzbach) والمساعدة (K. Spragens ، T. غراهام). وقد أجريت هذه الدراسة تحت رعاية مركز للتكنولوجيا المبتكرة -- معهد الدفاع والأمن الداخلي (www.idhs.org) ، وبدعم من وزارة الدفاع والطيران مختبر أبحاث سلاح. ثم التعامل مع الحيوانات البروتوكولات التي وافقت عليها لجنة رعاية الحيوان واستخدام الولايات المتحدة للمسح الجيولوجي الغربية مركز البحوث البيئية وتصاريح من الهيئة الامريكية للمسح الجيولوجي الطيور مختبر التطويق. أي استخدام الأسماء التجارية ، والمنتج ، أو شركة في هذا المنشور هو لأغراض وصفية فقط ولا تعبر عن تأييد من قبل الحكومة الامريكية.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
اسم كاشف | شركة | رقم كتالوج | تعليقات (اختياري) |
---|---|---|---|
RNeasy العمود صغيرة تدور | Qiagen | 74106 | المدرجة في مجموعة صغيرة RNeasy |
أنابيب جمع (1.5 و 2 مل) | Qiagen | 74106 | المدرجة في مجموعة صغيرة RNeasy |
العازلة RLT | Qiagen | 74106 | المدرجة في مجموعة صغيرة RNeasy |
العازلة RW1 | Qiagen | 74106 | المدرجة في مجموعة صغيرة RNeasy |
العازلة RPE | Qiagen | 74106 | المدرجة في مجموعة صغيرة RNeasy |
ريبونوكلياز خالية من المياه | Qiagen | 74106 | المدرجة في مجموعة صغيرة RNeasy |
14.3 M - β المركابتويثانول الحل | فيشر العلمية | BP176100 | |
100 ٪ من الإيثانول | فيشر العلمية | NC9602322 | |
دوامة الجني 2 ، 120V | الصناعات العلمية | SI - 0236 | |
Taqman الأنفلونزا من الهدف 1 (دقق الحلمأة) | ايداهو تكنولوجيز | الاساي - ASY - 0109 | |
الأنابيب الشعرية Lightcycler 20ml | روش العلوم التطبيقية | 04929292001 | |
الصغيرة المدورة مع الطرد المركزي لأنابيب 2 مل | ايداهو تكنولوجيز | تدرج في عدة RAPID | |
صدمات القوية متقدمة جهاز تحديد العوامل الممرضة (RAPID) 7200 | ايداهو تكنولوجيز | تدرج في عدة RAPID | |
بنتيوم القائمة على الكمبيوتر المحمول مع Windows XP Professional | ايداهو تكنولوجيز | تدرج في عدة RAPID | |
Lightcycler برامج تحليل البيانات | ايداهو تكنولوجيز | تدرج في عدة RAPID |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved