وأيد هذا البحث من قبل الأموال من جامعة ييل المناخ ومعهد الطاقة ومؤسسة العلوم الوطنية الأمريكية.

1. تربية الجنادب تحت الضغط والإجهاد الشروط مجانا <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> استخدام 0،5 م 2 دائري، mesocosms مغلق لمنع الهجرة أو الهجرة من الأنواع الحيوانية (الشكل 1). بناء mesocosms باستخدام أطوال 2.4 م 1.5 م ارتفاع ¼ &quot;شبكة السياج الألمنيوم بمثابة السقالات. تغطية المبارزة جانب 1.75 م 2.5 م أطوال الألمنيوم عالي فحص الإطار مطوية عبر الجزء العلوي والسفلي من سياج وتدبيس معا جنبا إلى جنب أضعاف. التسجيل في المبارزة ينتهي لتشكيل دائرة مغلقة ومن ثم التيلة إطار تداخل فحص معا لخلق الختم. تعيين mesocosm في التربة في الميدان بحفر 10 سم من عمق 4 سم واسعة خندق حول قاعدة mesocosom، إغراق في mesocosm الخندق ثم احش في الهيئة العامة للسدود من الخندق حول الجزء الغارق من mesocosm. التيلة قطعة دائرية من فحص الإطار إلى أعلى mesocosm. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> mesocosms مجموعة تفلح في تكرار التجربة المقترنةن في هذا المجال. وينبغي اختيار المواقع لتتناسب مع مؤامرة هوية الأنواع النباتية والغطاء النباتي النسبية. تغرق أقفاص 10 سم في الأرض في موقع المؤامرة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> باستخدام شبكة الاجتياح، وجمع في وقت مبكر (2 ND) الطور حوريات الجراد والمخزون منها في مجال mesocosms بكثافة الطبيعية. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> باستخدام شبكة الاجتياح، والتقاط الأفراد من الصيد الجلوس والانتظار، المهيمن (وليس على شبكة الإنترنت النسيج) العنكبوت الأنواع المفترسة. اغلاق الغراء chelicerae العنكبوت (تستخدم فمها لإخضاع الفريسة) مع التجفيف السريع الاسمنت لآثار المخاطر المنفصلة من اختيار البقاء الفعلي لصالح الجنادب الفردية مع أفضل قدرات للتهرب من الافتراس العنكبوت. تخزين العناكب بكثافة مجال واحد من كل زوج mesocosm. وسوف يكون هذا العلاج الإجهاد. سوف Mesocosms دون العناكب يكون العلاج خالية من الإجهاد. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تسمح حوريات الجراد لتطوير مراحل الطور في وقت متأخر (4 عشر والخامس 5). جمع كل الأفراد من الأقفاص وراتعيين ndomly الأفراد من كل قفص لواحدة من ثلاث مجموعات الفحص اللاحق: (1) التحقق من حالة الإجهاد الفسيولوجية، (2) التحقق من التحول في رياضيات الكيمياء عنصري الجسم، (3) التحلل الميكروبي. </li></ol> 2. التحقق من صحة الجندب الدولة الإجهاد <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> قياس التمثيل الغذائي معيار معدل جندب (SMR)، ومعدل انبعاثات ثاني أكسيد الكربون ( <img src="/files/ftp_upload/50061/50061eq1.jpg" fo:src="/files/ftp_upload/50061/50061eq1highres.jpg"/> ) في التدفق من خلال نظام قياس التنفس incurrent مع معدل تدفق الهواء 200 مل / دقيقة. إزالة بخار الماء عن طريق تمرير الهواء المتدفق من خلال وكيل التجفيف. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> الحرمان من الطعام بعد 16 ساعة من (المياه يجب أن تكون متوفرة)، تزن الجنادب الفردية (± 0.1 ملغ)، ووضعها في 50 مل شفاف (L 9.2 سم X 2.0 سم D) غرف مقياس التنفس والسماح لهم للتعافي من التعامل مع ما لا يقل عن 10 دقيقة قبل بدء القياسات. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تحت المستمر تيم المحيطة المتوسط<html> perature (درجة الحرارة ± 1٪ تباين الخطأ المعياري) داخل غرفة مقياس التنفس وتحليل الهواء respired باستخدام الأشعة تحت الحمراء محلل CO 2 (على سبيل المثال القرار جزء في المليون و qubit S151-1). قياس متوسط ​​الحد الأدنى الحالة المستقرة <img src="/files/ftp_upload/50061/50061eq1.jpg" fo:src="/files/ftp_upload/50061/50061eq1highres.jpg"/> لمدة 10 دقيقة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> محلل يوفر CO 2 كسور تركيز (أجزاء لكل مليون)، ولكن ينبغي الإبلاغ عن SMR كنسبة، لذلك يجب على المرء أن تتحول التسجيلات كما <img src="/files/ftp_upload/50061/50061eq1.jpg" fo:src="/files/ftp_upload/50061/50061eq1highres.jpg"/> = FR ط ( <img src="/files/ftp_upload/50061/50061eq2.jpg" fo:src="/files/ftp_upload/50061/50061eq2highres.jpg"/> - <img src="/files/ftp_upload/50061/50061eq3.jpg" fo:src="/files/ftp_upload/50061/50061eq3highres.jpg"/> ) / {1 - <img src="/files/ftp_upload/50061/50061eq2.jpg" fo:src="/files/ftp_upload/50061/50061eq2highres.jpg"/> [1 - (1/RQ)]}، حيثiles/ftp_upload/50061/50061eq3.jpg &quot;FO: SRC =&quot; / files/ftp_upload/50061/50061eq3highres.jpg &quot;/&gt; = تركيز كسور incurrent من CO 2؛ <img src="/files/ftp_upload/50061/50061eq2.jpg" fo:src="/files/ftp_upload/50061/50061eq2highres.jpg"/> يفترض RQ = حاصل الجهاز التنفسي، وعلى قدم المساواة إلى 0.85 في الحيوانات العاشبة؛ = تركيز كسور إفراغي من CO 2، FR = معدل التدفق (مل دقيقة -1). </li></ol> 3. التحقق من صحة التحول في الاتحاد العنصري عنصري الجسم <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تقييم الكربون: النيتروجين (C: N) مضمون عينة من الجنادب التي تم جمعها من mesocosms المجال. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تقليل التفاوت في C: N بسبب استهلاك المواد الغذائية عن طريق إزالة محتويات الأخيرة الأمعاء جندب تحت المجهر تشريح. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تجميد تجفيف الأمعاء الفارغة والجسم لمدة 48 ساعة ثم تطحن الذبيحة الفردية والأمعاء إلى مسحوق متجانس. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> قياس C: N محتويات من مسحوق باستخدام المحلل التلقائي CNH. </li></ol> 4.الميكروبية التحلل <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> مكان منسوخة أزواج من الياقات PVC (15.4 سم ضياء.، إدراج ~ 4 سم في التربة) في موقع الميدان (الشكل 3C). إزالة جميع النباتات داخلها عبر لقطة على سطح التربة. وتستخدم هذه الياقات للتدابير التحلل. بالإضافة إلى ذلك، وضع مجموعة من الياقات PVC عبر الموقع للعمل الميداني إلى 13 الضوابط الطبيعية وفرة C (أنظر أدناه)، والتي تضاف لا الجنادب ولا العشب القمامة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> إلى واحد في كل زوج طوق إضافة 2 سليمة، وتجميد المجفف جثث الجنادب (تسجيل الكتلة الحيوية المضافة) تربى مع خطر الحيوانات المفترسة كما هو موضح أعلاه باستخدام الأقفاص الميداني. لذوي الياقات البيضاء في كل زوج الأخرى إضافة 2 سليمة تجميد المجفف جثث تربية الحيوانات المفترسة من دون مخاطر. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تغطية الياقات PVC مع شاشة لمنع إزالة جندب من الزبالين من المؤامرات، والسماح للجثث جندب تتحلل لمدة 40 يوما. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> بينما جثث متحللة والتسمية، القاعدة لىtter مع 13 C. <ol style=";text-align:right;direction:rtl"><li style=";text-align:right;direction:rtl"> بناء غرفة شبكي واضحة (60 سم × 60 سم × 1.5 م) مع مدخل ومخرج الصمام (الشكل 3B). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> غرق 60 سم مربع X 60 سم إطار خشبي مع ختم مطاط السيليكون المغلفة مع الشحوم 5 سم في الأرض (الشكل 3B). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> حرك الدائرة على قمة إطار خشبي بحيث يصبح غرفة مختومة من قبل المطاط (الشكل 3B). </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> وسيتم ربط مداخل وصفت الدائرة اسطوانات الغاز مضغوط يحتوي على 99٪ ذرة 13 CO 2. النباتات داخل غرفة مع 13 C، حيث يتم الاحتفاظ CO 2 عند مستويات تركيزات المحيطة (لأن النبات يغير تركيزات الكربون رفع التقسيم). يتم الاحتفاظ من قبل المستويات المحيطة ينبض فقط CO المسمى (2) لفترات قصيرة من الوقت. أيضا، يتم رصد درجات الحرارة وتتم إزالة غرفة الغرف إذا تصل درجة الحرارة إلى 5 درجات مئوية علىبوف المحيطة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> بعد أسبوع واحد وضع العلامات، قارن δ 13 C من القمامة على مستوى القاعدة مع القيم الوفرة من الموارد الطبيعية التي جمعت من عينة عشوائية من أنواع العشب متطابقة باستخدام نسبة النظائر DeltaPlus الحرارية مطياف الكتلة (الحرارية، سان خوسيه، CA، الولايات المتحدة الأمريكية). </li></ol></li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> بعد 40 يوما، إضافة 10 غرام من الهواء المجفف 13 C-صفت القمامة العشب إلى كل ذوي الياقات البيضاء التي سبق تعديلها مع جثث جندب. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> رصد معدل تمعدن من القمامة-العشب في الموقع عبر 75 يوما بتطويق كل طوق وتتبع كل من تنفس التربة الكلي والتنفس من 13 CO 2. ويتم إنجاز هذا باستخدام التدفق من خلال تقنية الدائرة حيث يتم مراقبة عينات من الغاز كل ذوي الياقات البيضاء، في الوقت الحقيقي، لمدة 8 دقائق لكل حلقة تجويف باستخدام التحليل الطيفي إلى أسفل (أقسام المطبوعات؛ Picarro شركة، سانتا كلارا، كاليفورنيا، الولايات المتحدة الأمريكية؛ الموديل: G1101 -I). أقسام المطبوعات تمكن واحد في وقت واحد لتعقب كل من الكلية وδ 13 Cللتنفس التربة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> تقدير مساهمة 13 C-صفت القمامة العشب لتنفس التربة باستخدام معادلات مجموع النظائر الاختلاط. يتم حساب كمية القمامة العشب المستمدة CO 2 على النحو التالي: (. δ 13 C التنفس - δ 13 C nat.abn) C القاعدة المستمدة القمامة = C × مجموع / (δ 13 C القاعدة القمامة - δ 13 C نات . ABN)، حيث يبلغ إجمالي C المبلغ الإجمالي للC respired خلال قياس معين، التنفس δ C 13 هو δ 13 C من C-respired لتعديل الياقات مع القمامة العشب المسمى، δ 13 C nat.abn. هو يعني δ C 13 C من respired في الياقات 3 الوفرة من الموارد الطبيعية (أي تلك التي لم تعدل مع القمامة)، وδ 13 C القاعدة القمامة هو δ 13 C من القمامة العشب إضافة إلى التعاونllars. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> رصد كل درجة حرارة التربة والرطوبة عبر التجربة باستخدام باليد تحقيقات لتصحيح الاختلافات في التنفس التربة بسبب الاختلافات في درجة الحرارة والرطوبة. </li><li style=";text-align:right;direction:rtl"> على الرغم من المعدة للاستخدام الميداني، الصك تجويف الطيفي أسفل الدائري (Picarro شركة، سانتا كلارا، كاليفورنيا، الولايات المتحدة الأمريكية؛ الموديل: G1101-I) قراءات حساسة للحركة. ولذلك، ينبغي للمرء أن إقامة محطة قياس قاعدة مركزية لجميع المؤامرات التي تحتوي على الياقات PVC، وربط أداة لالياقات مع أطوال أنابيب PVC. </li></ol>

<ol>
	<li>Wardle, D. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ecological+linkages+between+aboveground+and+belowground+biota.">Ecological linkages between aboveground and belowground biota.</a> Science. 304, 1629-1633 (2004).</li><li>Hattenschwiler, S., Tiunov, A. V., Scheu, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Biodiversity+and+litter+decomposition+in+terrestrial+ecosystems.">Biodiversity and litter decomposition in terrestrial ecosystems.</a> Annu. Rev. Ecol. Syst. 36, 191-218 (2005).</li><li>Cebrian, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Role+of+first-order+consumers+in+ecosystem+carbon+flow.">Role of first-order consumers in ecosystem carbon flow.</a> Ecol. Lett. 7, 232-240 (2004).</li><li>Bardgett, R. D., Wardle, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=.">.</a> Aboveground-Belowground Linkages. , (2010).</li><li>Schmitz, O. J., Hawlena, D., Trussell, G. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Predator+control+of+ecosystem+nutrient+dynamics.">Predator control of ecosystem nutrient dynamics.</a> Ecol. Lett. 13, 1199-1209 (2010).</li><li>Hawlena, D., Strickland, M. S., Bradford, M. A., Schmitz, O. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fear+of+predation+slows+plant+litter+decomposition.">Fear of predation slows plant litter decomposition.</a> Science. 336, 1434-1438 (2012).</li><li>Hawlena, D., Schmitz, O. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Physiological+stress+as+a+fundamental+mechanism+linking+predation+to+ecosystem+functioning.">Physiological stress as a fundamental mechanism linking predation to ecosystem functioning.</a> Am. Nat. 176, 537-556 (2010).</li><li>Stoks, R. D. e. B. l. o. c. k., M, M. A., McPeek, <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Alternative+growth+and+energy+storage+responses+to+mortality+threats+in+damselflies.">Alternative growth and energy storage responses to mortality threats in damselflies.</a> Ecol. Lett. 8, 1307-1316 (2005).</li><li>Hawlena, D., Schmitz, O. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Herbivore+physiological+response+to+predation+risk+and+implications+for+ecosystem+nutrient+dynamics.">Herbivore physiological response to predation risk and implications for ecosystem nutrient dynamics.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107, 15503-15507 (2010).</li><li>Schimel, J. P., Weintraub, M. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+implications+of+exoenzyme+activity+on+microbial+carbon+and+nitrogen+limitation+in+soil:+a+theoretical+model.">The implications of exoenzyme activity on microbial carbon and nitrogen limitation in soil: a theoretical model.</a> Soil Biol. Biochem. 35, 1-15 (2003).</li><li>Allison, S. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Low+levels+of+nitrogen+addition+stimulate+decomposition+by+boreal+forest+fungi.">Low levels of nitrogen addition stimulate decomposition by boreal forest fungi.</a> Soil Biol. Biochem. 41, 293-302 (2009).</li><li>Bump, J. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Ungulate+carcasses+perforate+ecological+filters+and+create+biogeochemical+hotspots+in+forest+herbaceous+layers+allowing+trees+a+competitive+advantage.">Ungulate carcasses perforate ecological filters and create biogeochemical hotspots in forest herbaceous layers allowing trees a competitive advantage.</a> Ecosystems. 12, 996-1007 (2009).</li><li>Yang, L. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Periodical+cicadas+and+resource+pulses+in+North+American+forests.">Periodical cicadas and resource pulses in North American forests.</a> Science. 306, 1565 (2004).</li><li>Belovsky, G. E., Slade, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Insect+herbivory+accelerates+nutrient+cycling+and+increases+plant+production.">Insect herbivory accelerates nutrient cycling and increases plant production.</a> Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 97, 14412 (2000).</li><li>Frost, C. J., Hunter, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Recycling+of+nitrogen+in+herbivore+feces:+plant+recovery,+herbivore+assimilation,+soil+retention,+and+leaching+losses.">Recycling of nitrogen in herbivore feces: plant recovery, herbivore assimilation, soil retention, and leaching losses.</a> Oecologia. 151, 42 (2007).</li></ol>

ليس لدينا شيء في الكشف عنها.

يجب تسلسل الأساليب المعروضة هنا يتيح قياس الإجهاد المنتظم للطريقة التي تضم الأنواع الشبكات الغذائية فوق الأرض يمكن أن المجتمعات الميكروبية رئيس التربة بطرق تؤدي إلى تغيير التحلل اللاحقة من القمامة النبات. الطرق مثالية لدراسة النظم الإيكولوجية تتألف من المستهلكين المفصلية والنباتات العشبية لأنه يمكن الشبكات الغذائية سليمة مقيدة مكانيا والواردة في mesocosms. التغير المكاني قد تكون موجودة بسبب تدرجات في رطوبة التربة الخلفية، درجة حرارة التربة والمحتوى مغذيات النباتات، إلخ. تصميم الدراسة يسمح احد لمجموعة mescosms والياقات PVC لمنع امتداد التدرجات البيئية المكانية وبالتالي لحساب التباين البيئية عند تحليل هذه الآثار ل. على الرغم من المعدة للاستخدام الميداني، الصك تجويف الطيفي أسفل الدائري (Picarro شركة، سانتا كلارا، كاليفورنيا، الولايات المتحدة الأمريكية؛ الموديل: G1101-I) هي ذاتها قراءاتnsitive إلى الحركة. ولذلك، ينبغي للمرء أن إقامة محطة قياس قاعدة مركزية لجميع المؤامرات التي تحتوي على الياقات PVC، وربط أداة لالياقات مع أطوال أنابيب PVC. وقد جرت العادة على التربة التحلل القمامة تقاس تضم كميات معروفة من القمامة في أكياس شبكة الألياف الزجاجية، وإيداع الحقائب على سطح التربة في الميدان وبشكل دوري إعادة قياس أكياس القمامة لتحديد معدل اختفاء (التحلل). الحد من هذه الطريقة هو أن واحدا غير قادر على تتبع مصير هذه المسألة متحللة أو تحديد مساهمة في CO 2 تمعدن التعديل التربة (القمامة المضافة) من تمعدن التربة الخلفية 2 CO. أسلوب التتبع باستخدام المسمى CO 2 المقدمة هنا يساعد على تخفيف هذا القيد لوجستية. عملت النظم الإيكولوجية والبيئة البيوجيوكيميائية تحت نموذج عمل ذلك لأن النبات غير مأكول-القمامة تضم غالبية المخلفات، وأثرت بشكل هامشي فقط من عمليات النظم الإيكولوجية belowground المدخلات الكتلة الحيوية من مستويات تغذوية أعلى في شبكات الغذاء فوق الأرض، مثل الحيوانات العاشبة أنفسهم 6. ومع ذلك، هناك أدلة متزايدة على أن الأنواع في مستويات تغذوية أعلى من النظم الإيكولوجية يمكن أن يكون لها تأثير عميق على عمليات belowground 1،4،5. طريقة المقدمة هنا تقف لتعزيز الكمي للمساهمة مستويات تغذوية أعلى، إما مباشرة من خلال الكتلة الحيوية من ترسب الذبيحة (على سبيل المثال 12، 13) أو إفراز وابتراز (على سبيل المثال 14، 15) أو بشكل غير مباشر من خلال تغيير تركيبة المجتمع النباتات (مثل 9 ) في سباق الدراجات النظام الإيكولوجي المغذيات. يمكن القياس الكمي مثل هذه تساعد في الكشف عن الآليات التي تحكم الديناميات الحيوانات النظام البيئي كجزء من جهد منسق لتعزيز وتنقيح نموذج العمل الحالي من السيطرة على أداء النظم الإيكولوجية الحيوية.

<table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td> اسم كاشف أو المعدات </td><td> شركة </td><td> كتالوج رقم </td><td> التعليقات (اختياري) </td></tr><tr><td> خاتم تجويف أسفل المطياف </td><td> Picarro شركة، سانتا كلارا، كاليفورنيا، الولايات المتحدة الأمريكية </td><td> # نموذج I-G1101 </td><td></td></tr><tr><td> CO2 مقياس التنفس </td><td> و qubit أنظمة، كينغستون، ON، كندا </td><td> نموذج # S151 </td><td></td></tr><tr><td> 13C </td><td> سيغما الدريخ </td><td> 372382 </td><td></td></tr><tr><td> الطيف </td><td> الحرارية، سان خوسيه CA، الولايات المتحدة الأمريكية </td><td> الموديل: دلتا V زائد النظائر الطيف الجماهيري نسبة </td><td></td></tr></tbody></table>

linking predation risk, herbivore physiological stress and microbial decomposition of plant litter

كمية ونوعية المخلفات التي تدخل في التربة يحدد معدل التحلل من المجتمعات الميكروبية وكذلك معدلات إعادة تدوير النيتروجين (N) والكربون 1،2 عزل (C). مصنع القمامة تضم غالبية المخلفات 3، وهكذا يفترض أن يتم إلا بشكل هامشي أثرت التحلل من المدخلات الكتلة الحيوية من الحيوانات مثل الحيوانات العاشبة واللاحمة 4،5. ومع ذلك، قد تؤثر التحلل الميكروبي الحيوانات آكلة اللحوم من مصنع القمامة عن طريق سلسلة من التفاعلات التي الافتراس خطر يغير علم وظائف الأعضاء من أكلة الأعشاب فريسة لها وهذا بدوره يغير سير التربة الميكروبية عندما تتحلل جثث النبات 6. ويمكن لاستجابة الضغط من قبل الحيوانات العاشبة الفسيولوجية لخطر الافتراس تغيير C: N التركيب العنصري للكتلة الحيوية النبات 7،8،9 بسبب الإجهاد من خطر الافتراس يزيد المطالب النبات الطاقة القاعدية التي في النبات بالمغذيات محدودة قوات نظمليالي لتحويل استهلاكها من N-الغنية الموارد اللازمة لدعم النمو والتكاثر على الموارد الكربوهيدرات الغنية C لدعم عملية التمثيل الغذائي المتزايد 6. الحيوانات العاشبة لها قدرة محدودة على تخزين المواد الغذائية الزائدة، وأكد ذلك الحيوانات العاشبة تفرز N لأنها تزيد الكربوهيدرات-C استهلاك 7. في نهاية المطاف، فريسة شدد خطر الافتراس زيادة C جسمها: N نسبة 7،10، مما يجعلها أقل جودة الموارد للتربة تجمع الجراثيم على الأرجح بسبب انخفاض توافر N عطوب لإنتاج إنزيم الميكروبية 6. وهكذا، تحلل جثث الحيوانات العاشبة وشدد له تأثير على سير فتيلة من المجتمعات الميكروبية التي ينخفض ​​بعد قدرة الميكروبات لتتحلل القمامة مصنع 6،10،11. نقدم منهجية لتقييم المخاطر الروابط بين الافتراس والتحلل من القمامة ميكروبات التربة. ونحن تصف كيفية: حمل التوتر في الحيوانات العاشبة من خطر الافتراس؛ الشرق الأوسط وأفريقياتأكد تلك الردود الإجهاد، وقياس النتائج على التحلل الميكروبي. نستخدم رؤى من نموذج النظام الإيكولوجي الأراضي العشبية التي تتألف منها العنكبوت الصيد المفترس (Pisuarina ميرا)، والنبات جندب المهيمنة (Melanoplus femurrubrum)، ومجموعة متنوعة من النباتات والحشائش forb 9.

وتعرض مؤامرة سبيل المثال معدلات التمثيل الغذائي جندب القياسية في ظروف التوتر وخالية من الإجهاد في الشكل 2. بسبب وجود خلافات بين كتلة الجسم الجنادب الفردية، وحقيقة أن معدل التمثيل الغذائي يختلف مع كتلة الجسم، يجب تقديم المخططات معدلات التمثيل الغذائي فيما يتعلق كتلة الجسم جندب. الاتجاهات الموازية لعلاجات مختلفة تشير إلى أن معدل الأيض يرتفع كمضاعف المستمر لمعدل الأيض القياسية (أي عدم وجود كتلة الجسم X التفاعل معدل الأيض) لجميع الأفراد وشدد. وتعرض جندب الجسم C وعنصر في محتويات N المخاطر وظروف خالية في الجدول 1. من الجدير بالذكر أن هناك صغيرة جدا (4٪) الفرق في الجسم C: N نسب بين العلاجات. ومع ذلك، يمكن لهذه الاختلافات الصغيرة تترجم إلى اختلافات كبيرة في التحلل من القمامة العشب التربة تجمع الجراثيم (الشكل 3). </p&gt; مضيفا القمامة العشب لالياقات PVC المعدلة سابقا مع الجنادب بالتوتر أو خالية من الإجهاد يؤدي إلى درجات مختلفة من التحلل القمامة، كما هو مبين في المنحنيات التي تصف بالجمع CO 2 بيان من التربة بسبب التنفس الجرثومية (الشكل 3). وينبغي رصد التجارب حتى تتراكم منحنيات تبدأ تشبع. <table border="1" style=";text-align:right;direction:rtl"><tbody><tr><td></td><td> إجهاد </td><td> مجاني الإجهاد </td></tr><tr><td> الكربون (٪) </td><td> 48،44 ± 0.32 </td><td> 44،73 ± 0.46 </td></tr><tr><td> النيتروجين (٪) </td><td> 12،11 ± 0.08 </td><td> 11،62 ± 0.12 </td></tr><tr><td> الكربون: النيتروجين </td><td> 4.00 ± 0.03 </td><td> 3.85 ± 0.04 </td></tr></tbody></table> الجدول 1. مقارنة بين المحتوى الكيميائي للسيارة النبات جندبcasses من الظروف التي تواجه خطر الافتراس (الإجهاد) والذي خطر الافتراس كان غائبا (خالية من الإجهاد). القيم يعني ± 1 الخطأ المعياري. <img src="/files/ftp_upload/50061/50061fig1.jpg" alt="الشكل 1"/> الشكل 1. شكل توضيحي لتصميم مجال mesocosms المستخدمة في التجربة والخطة الشاملة للتقييم التجريبي لآثار المخاطر على التحلل القمامة. <img src="/files/ftp_upload/50061/50061fig2.jpg" alt="الشكل 2"/> الشكل 2. قطعة معدل الأيض النبات القياسية فيما يتعلق كتلة الجسم النبات. وتنقسم البيانات إلى فئتين وفقا لعلاج تجريبي: الجنادب من الحيوانات المفترسة التي تحتوي على mesocosms (الافتراس) للحث على الإجهاد، ودون mesocosms الحيوانات المفترسة (التحكم) وبالتالي لا الاجهاد الناجم. البيانات هي من Halwena D.وOJ شميتز 2010، غير منشورة. <img src="/files/ftp_upload/50061/50061fig3.jpg" alt="الشكل 3" fo:content-width="6in" fo:src="/files/ftp_upload/50061/50061fig3highres.jpg"/> الشكل 3. المنحنيات التي تصف التراكمي CO 2 الافراج عن تجمع الجراثيم في حين متحللة التجريبية المدخلات القمامة العشب في الياقات PVC. هي القيم المرسومة يعني ± 1 الخطأ المعياري. الرسم البياني يوضح أن تستعد التربة مع جثث جندب شدد (المفترس) يؤدي إلى 19٪ أقل (ANOVA F = 1،6 9،06، P &lt;0.05) أسعار مصنع القمامة التحلل من التربة معبي مع جثث الإجهاد جندب مجانا (التحكم). وأقحم يظهر جهاز طوق PVC في الميدان. الرقم مستنسخة من Hawlena وآخرون .. 6 <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/50061/50061fig3large.jpg" target="_blank">Cick هنا لمشاهدتها بشكل اكبر شخصية</a> .

Watch this Scientific Journal Video about Linking Predation Risk, Herbivore Physiological Stress and Microbial Decomposition of Plant Litter at JoVE.com

Linking Predation Risk, Herbivore Physiological Stress and Microbial Decomposition of Plant Litter

نقدم أساليب لتقييم مدى خطر الافتراس يمكن أن يغير نوعية الكيميائية الجارحة النبات عن طريق حفز التغييرات الغذائية لتلبية مطالب الإجهاد الشديد، وكيف تحلل جثث الحيوانات العاشبة من هذه يؤدي إلى إبطاء وشدد اللاحقة التحلل بواسطة الميكروبات القمامة مصنع التربة.

ربط المخاطر الافتراس، والإجهاد الفسيولوجي آكل النبات والتحلل الميكروبي للنباتات القمامة

The quantity and quality of detritus entering the soil  determines the rate of decomposition by microbial communities as well as  recycle rates of ...

linking-predation-risk-herbivore-physiological-stress-microbial

Research

JoVE Journal

Biology

13.0K Views.  Yale University. نقدم أساليب لتقييم مدى خطر الافتراس يمكن أن يغير نوعية الكيميائية الجارحة النبات عن طريق حفز التغييرات الغذائية لتلبية مطالب الإجهاد الشديد، وكيف تحلل جثث الحيوانات العاشبة من هذه يؤدي إلى إبطاء وشدد اللاحقة التحلل بواسطة الميكروبات القمامة مصنع التربة.

Video: Linking Predation Risk, Herbivore Physiological Stress and Microbial Decomposition of Plant Litter

Testing the Physiological Barriers to Viral Transmission in Aphids Using Microinjection

Potato loafroll virus (PLRV), from the family Luteoviridae infects solanaceous plants. It is transmitted by aphids, primarily, the green peach aphid. When an uninfected aphid feeds on an infected plant it contracts the virus through the plant phloem. Once ingested, the virus must pass from the insect gut to the hemolymph (the insect  blood ) and then must pass through the salivary gland, in order to be transmitted back to a new plant. An aphid may take up different viruses when munching on a plant, however only a small fraction will pass through the gut and salivary gland, the two main barriers for transmission to infect more plants. In the lab, we use physalis plants to study PLRV transmission. In this host, symptoms are characterized by stunting and interveinal chlorosis (yellowing of the leaves between the veins with the veins remaining green). The video that we present demonstrates a method for performing aphid microinjection on insects that do not vector PLVR viruses and tests whether the gut is preventing viral transmission.
The video that we present demonstrates a method for performing Aphid microinjection on insects that do not vector PLVR viruses and tests whether the gut or salivary gland is preventing viral transmission.

Aphids are effective transmitters of plant viruses. Aphid microinjection of virus, the procedure we will show you today, is a technique allowing researchers to inject virus directly into the hemocoel of the aphid, bypassing the gut, one of the 2 major barriers for virus transmission in a circulative manner. The same technique is also used to inject dsRNA for RNAi.

اختبار الحواجز الفسيولوجية لانتقال الفيروس عن طريق Microinjection في المن

Potato loafroll virus (PLRV), from the family Luteoviridae infects solanaceous plants. It is transmitted by aphids, primarily, the green peach aphid. When ...

Monitoring Plant Hormones During Stress Responses

Plant hormones and related signaling compounds play an important role in the regulation of plant responses to various environmental stimuli and stresses. Among the most severe stresses are insect herbivory, pathogen infection, and drought stress. For each of these stresses a specific set of hormones and/or combinations thereof are known to fine-tune the responses, thereby ensuring the plant's survival. The major hormones involved in the regulation of these responses are jasmonic acid (JA), salicylic acid (SA), and abscisic acid (ABA). To better understand the role of individual hormones as well as their potential interaction during these responses it is necessary to monitor changes in their abundance in a temporal as well as in a spatial fashion. For the easy, sensitive, and reproducible quantification of these and other signaling compounds we developed a method based on vapor phase extraction and gas chromatography/mass spectrometry (GC/MS) analysis (1, 2, 3, 4). After extracting these compounds from the plant tissue by acidic aqueous 1-propanol mixed with dichloromethane the carboxylic acid-containing compounds are methylated, volatilized under heat, and collected on a polymeric absorbent. After elution into a sample vial the analytes are separated by gas chromatography and detected by chemical ionization mass spectrometry. The use of appropriate internal standards then allows for the simple quantification by relating the peak areas of analyte and internal standard.

A simple method is provided that allows for the rapid extraction and analysis of multiple plant hormones from small tissue samples. The procedure uses vapor phase extraction as the solemn purification step. Samples are analyzed by GC/MS with chemical ionization that produces mainly (M+1)+ ions.

الهرمونات النباتية خلال رصد استجابات التوتر

Plant hormones and related signaling compounds play an important role in the regulation of plant responses to various environmental stimuli and stresses. ...

OLIgo Mass Profiling (OLIMP) of Extracellular Polysaccharides

The direct contact of cells to the environment is mediated in many organisms by an extracellular matrix. One common aspect of extracellular matrices is that they contain complex sugar moieties in form of glycoproteins, proteoglycans, and/or polysaccharides. Examples include the extracellular matrix of humans and animal cells consisting mainly of fibrillar proteins and proteoglycans or the polysaccharide based cell walls of plants and fungi, and the proteoglycan/glycolipid based cell walls of bacteria. All these glycostructures play vital roles in cell-to-cell and cell-to-environment communication and signalling.
An extraordinary complex example of an extracellular matrix is present in the walls of higher plant cells. Their wall is made almost entirely of sugars, up to 75% dry weight, and consists of the most abundant biopolymers present on this planet. Therefore, research is conducted how to utilize these materials best as a carbon-neutral renewable resource to replace petrochemicals derived from fossil fuel. The main challenge for fuel conversion remains the recalcitrance of walls to enzymatic or chemical degradation due to the unique glycostructures present in this unique biocomposite.
Here, we present a method for the rapid and sensitive analysis of plant cell wall glycostructures. This method OLIgo Mass Profiling (OLIMP) is based the enzymatic release of oligosaccharides from wall materials facilitating specific glycosylhydrolases and subsequent analysis of the solubilized oligosaccharide mixtures using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF/MS)1 (Figure 1). OLIMP requires walls of only 5000 cells for a complete analysis, can be performed on the tissue itself2, and is amenable to high-throughput analyses3. While the absolute amount of the solubilized oligosaccharides cannot be determined by OLIMP the relative abundance of the various oligosaccharide ions can be delineated from the mass spectra giving insights about the substitution-pattern of the native polysaccharide present in the wall.
OLIMP can be used to analyze a wide variety of wall polymers, limited only by the availability of specific enzymes4. For example, for the analysis of polymers present in the plant cell wall enzymes are available to analyse the hemicelluloses xyloglucan using a xyloglucanase5, 11, 12, 13, xylan using an endo-&beta;-(1-4)-xylanase 6,7, or for pectic polysaccharides using a combination of a polygalacturonase and a methylesterase 8. Furthermore, using the same principles of OLIMP glycosylhydrolase and even glycosyltransferase activities can be monitored and determined 9.

OLIgo Mass Profiling OLIMP of Extracellular Polysaccharides

A rapid way is described to gain insights into the structure of polysaccharides in an extracellular matrix. The method takes advantage of the specificity of glycosylhydrolases and the sensitivity of mass spectrometry allowing minute amounts of materials to be analyzed. This technique is adaptable to be used directly on tissue itself.

أليغو التنميط قداس (OLIMP) من السكريات خارج الخلية

The direct contact of cells to the environment is mediated in many organisms by an extracellular matrix. One common aspect of extracellular matrices is ...

Agar-Block Microcosms for Controlled Plant Tissue Decomposition by Aerobic Fungi

The two principal methods for studying fungal biodegradation of lignocellulosic plant tissues were developed for wood preservative testing (soil-block; agar-block). It is well-accepted that soil-block microcosms yield higher decay rates, fewer moisture issues, lower variability among studies, and higher thresholds of preservative toxicity. Soil-block testing is thus the more utilized technique and has been standardized by American Society for Testing and Materials (ASTM) (method D 1413-07). The soil-block design has drawbacks, however, using locally-variable soil sources and in limiting the control of nutrients external (exogenous) to the decaying tissues. These drawbacks have emerged as a problem in applying this method to other, increasingly popular research aims. These modern aims include degrading lignocellulosics for bioenergy research, testing bioremediation of co-metabolized toxics, evaluating oxidative mechanisms, and tracking translocated elements along hyphal networks. Soil-blocks do not lend enough control in these applications. A refined agar-block approach is necessary.
Here, we use the brown rot wood-degrading fungus Serpula lacrymans to degrade wood in agar-block microcosms, using deep Petri dishes with low-calcium agar. We test the role of exogenous gypsum on decay in a time-series, to demonstrate the utility and expected variability. Blocks from a single board rip (longitudinal cut) are conditioned, weighed, autoclaved, and introduced aseptically atop plastic mesh. Fungal inoculations are at each block face, with exogenous gypsum added at interfaces. Harvests are aseptic until the final destructive harvest. These microcosms are designed to avoid block contact with agar or Petri dish walls. Condensation is minimized during plate pours and during incubation. Finally, inoculum/gypsum/wood spacing is minimized but without allowing contact. These less technical aspects of agar-block design are also the most common causes of failure and the key source of variability among studies. Video publication is therefore useful in this case, and we demonstrate low-variability, high-quality results.

This video demonstrates a controlled environment approach to study degradation of lignocellulosic plant tissues by aerobic fungi. The ability to control nutrient sources and moisture is a key advantage of agar-block microcosms, but the approach often yields mixed success. We address critical pitfalls to yield reproducible, low-variability results.

آغار بلوك عوالم مصغرة لتحليل الأنسجة النباتية الخاضعة للرقابة من قبل الفطريات الهوائية

The two principal methods for studying fungal biodegradation of lignocellulosic plant tissues were developed for wood preservative testing (soil-block; ...

Herbivore-induced Blueberry Volatiles and Intra-plant Signaling

Herbivore-induced plant volatiles (HIPVs) are commonly emitted from plants after herbivore attack1,2. These HIPVs are mainly regulated by the defensive plant hormone jasmonic acid (JA) and its volatile derivative methyl jasmonate (MeJA)3,4,5. Over the past 3 decades researchers have documented that HIPVs can repel or attract herbivores, attract the natural enemies of herbivores, and in some cases they can induce or prime plant defenses prior to herbivore attack. In a recent paper6, I reported that feeding by gypsy moth caterpillars, exogenous MeJA application, and mechanical damage induce the emissions of volatiles from blueberry plants, albeit differently. In addition, blueberry branches respond to HIPVs emitted from neighboring branches of the same plant by increasing the levels of JA and resistance to herbivores (i.e., direct plant defenses), and by priming volatile emissions (i.e., indirect plant defenses). Similar findings have been reported recently for sagebrush7, poplar8, and lima beans9..
Here, I describe a push-pull method for collecting blueberry volatiles induced by herbivore (gypsy moth) feeding, exogenous MeJA application, and mechanical damage. The volatile collection unit consists of a 4 L volatile collection chamber, a 2-piece guillotine, an air delivery system that purifies incoming air, and a vacuum system connected to a trap filled with Super-Q adsorbent to collect volatiles5,6,10. Volatiles collected in Super-Q traps are eluted with dichloromethane and then separated and quantified using Gas Chromatography (GC). This volatile collection method was used n my study6 to investigate the volatile response of undamaged branches to exposure to volatiles from herbivore-damaged branches within blueberry plants. These methods are described here. Briefly, undamaged blueberry branches are exposed to HIPVs from neighboring branches within the same plant. Using the same techniques described above, volatiles emitted from branches after exposure to HIPVs are collected and analyzed.

A push-pull method for collecting plant volatiles is described. The method allows for a comparison of volatiles induced by herbivore feeding, exogenous methyl jasmonate, and mechanical damage. This technique is also used to investigate the volatile response of undamaged branches to exposure to volatiles from herbivore-damaged branches within blueberry plants.

عاشب متطايرة بفعل العنبية واشارة الى داخل المصنع

Herbivore-induced plant volatiles (HIPVs) are commonly emitted from plants after herbivore attack1,2.  These HIPVs are mainly regulated by the defensive ...

Physiological Recordings and RNA Sequencing of the Gustatory Appendages of the Yellow-fever Mosquito Aedes aegypti

Electrophysiological recording of action potentials from sensory neurons of mosquitoes provides investigators a glimpse into the chemical perception of these disease vectors. We have recently identified a bitter sensing neuron in the labellum of female Aedes aegypti that responds to DEET and other repellents, as well as bitter quinine, through direct electrophysiological investigation. These gustatory receptor neuron responses prompted our sequencing of total mRNA from both male and female labella and tarsi samples to elucidate the putative chemoreception genes expressed in these contact chemoreception tissues. Samples of tarsi were divided into pro-, meso- and metathoracic subtypes for both sexes. We then validated our dataset by conducting qRT-PCR on the same tissue samples and used statistical methods to compare results between the two methods. Studies addressing molecular function may now target specific genes to determine those involved in repellent perception by mosquitoes. These receptor pathways may be used to screen novel repellents towards disruption of host-seeking behavior to curb the spread of harmful viruses.

Physiological Recordings and RNA Sequencing of the Gustatory Appendages of the Yellow-fever Mosquito Aedes aegypti

Using two methods to estimate gene expression in the major gustatory appendages of Aedes aegypti, we have identified the set of genes putatively underlying the neuronal responses to bitter and repulsive compounds, as determined by electrophysiological examination.

الفسيولوجية تسجيلات وRNA تسلسل الزوائد ذوقي من البعوض الحمى الصفراء<em&gt; الزاعجة المصرية</em

Electrophysiological recording of action potentials from sensory neurons of mosquitoes provides investigators a glimpse into the chemical perception of ...

Visualizing Stromule Frequency with Fluorescence Microscopy

Stromules, or "stroma-filled tubules", are narrow, tubular extensions from the surface of the chloroplast that are universally observed in plant cells but whose functions remain mysterious. Alongside growing attention on the role of chloroplasts in coordinating plant responses to stress, interest in stromules and their relationship to chloroplast signaling dynamics has increased in recent years, aided by advances in fluorescence microscopy and protein fluorophores that allow for rapid, accurate visualization of stromule dynamics. Here, we provide detailed protocols to assay stromule frequency in the epidermal chloroplasts of Nicotiana benthamiana, an excellent model system for investigating chloroplast stromule biology. We also provide methods for visualizing chloroplast stromules in vitro by extracting chloroplasts from leaves. Finally, we outline sampling strategies and statistical approaches to analyze differences in stromule frequencies in response to stimuli, such as environmental stress, chemical treatments, or gene silencing. Researchers can use these protocols as a starting point to develop new methods for innovative experiments to explore how and why chloroplasts make stromules.

Protocols to investigate the dynamics of chloroplast stromules, the stroma-filled tubules that extend from the surface of chloroplasts, are described.

تصور التردد Stromule مع مضان المجهر

Stromules, or "stroma-filled tubules", are narrow, tubular extensions from the surface of the chloroplast that are universally observed in plant cells but ...

Measurements of Physiological Stress Responses in C. Elegans

Organisms are often exposed to fluctuating environments and changes in intracellular homeostasis, which can have detrimental effects on their proteome and physiology. Thus, organisms have evolved targeted and specific stress responses dedicated to repair damage and maintain homeostasis. These mechanisms include the unfolded protein response of the endoplasmic reticulum (UPRER), the unfolded protein response of the mitochondria (UPRMT), the heat shock response (HSR), and the oxidative stress response (OxSR). The protocols presented here describe methods to detect and characterize the activation of these pathways and their physiological consequences in the nematode, C. elegans. First, the use of pathway-specific fluorescent transcriptional reporters is described for rapid cellular characterization, drug screening, or large-scale genetic screening (e.g., RNAi or mutant libraries). In addition, complementary, robust physiological assays are described, which can be used to directly assess sensitivity of animals to specific stressors, serving as functional validation of the transcriptional reporters. Together, these methods allow for rapid characterization of the cellular and physiological effects of internal and external proteotoxic perturbations.

Measurements of Physiological Stress Responses in C. Elegans

Here, we characterize cellular proteotoxic stress responses in the nematode C. elegans by measuring the activation of fluorescent transcriptional reporters and assaying sensitivity to physiological stress.

قياسات استجابات الإجهاد الفسيولوجي في C. Elegans

Organisms are often exposed to fluctuating environments and changes in intracellular homeostasis, which can have detrimental effects on their proteome and ...

Combining Clearing and Fluorescence Microscopy for Visualising Changes in Gene Expression and Physiological Responses to Plasmodiophora brassicae

Infection of Brassica crops by the soilborne protist Plasmodiophora brassicae leads to gall formation on the underground organs. The formation of galls requires cellular reprogramming and changes in the metabolism of the infected plant. This is necessary to establish a pathogen-oriented physiological sink toward which the host nutrients are redirected. For a complete understanding of this particular plant-pathogen interaction and the mechanisms by which host growth and development are subverted and repatterned, it is essential to track and observe the internal changes accompanying gall formation with cellular resolution. Methods combining fluorescent stains and fluorescent proteins are often employed to study anatomical and physiological responses in plants. Unfortunately, the large size of galls and their low transparency act as major hurdles in performing whole-mount observations under the microscope. Moreover, low transparency limits the employment of fluorescence microscopy to study clubroot disease progression and gall formation. This article presents an optimized method for fixing and clearing galls to facilitate epifluorescence and confocal microscopy for inspecting P. brassicae-infected galls. A tissue-clearing protocol for rapid optical clearing was used followed by vibratome sectioning to detect anatomical changes and localize gene expression with promoter fusions and reporter lines tagged with fluorescent proteins. This method will prove useful for studying cellular and physiological responses in other pathogen-triggered structures in plants, such as nematode-induced syncytia and root knots, as well as leaf galls and deformations caused by insects.

Combining Clearing and Fluorescence Microscopy for Visualising Changes in Gene Expression and Physiological Responses to Plasmodiophora brassicae

The present protocol describes an optimized method for the histological observation of galls induced by Plasmodiophora brassicae. Vibratome sections of hypocotyls are cleared before fluorescence imaging to study the involvement of transcription factors and phytohormones during disease progression. This protocol overcomes resin embedding limitations, enabling in planta visualization of fluorescent proteins.

الجمع بين مجهر المقاصة والتألق لتصور التغيرات في التعبير الجيني والاستجابات الفسيولوجية للبلازموديوفورا براسيكاي

Infection of Brassica crops by the soilborne protist Plasmodiophora brassicae leads to gall formation on the underground organs. The formation of galls ...

Scalable, Flexible, and Cost-Effective Seedling Grafting

Early-stage seedling grafting has become a popular tool in molecular genetics to study root-shoot relationships within plants. Grafting early-stage seedlings of the small model plant, Arabidopsis thaliana, is technically challenging and time consuming due to the size and fragility of its seedlings. A growing collection of published methods describe this technique with varying success rates, difficulty, and associated costs. This paper describes a simple procedure to make an in-house reusable grafting device using silicone elastomer mix, and how to use this device for seedling grafting. At the time of this publication, each reusable grafting device costs only $0.47 in consumable materials to produce. Using this method, beginners can have their first successfully grafted seedlings in less than 3 weeks from start to finish. This highly accessible procedure will allow plant molecular genetics labs to establish seedling grafting as a normal part of their experimental process. Due to the full control users have in the creation and design of these grafting devices, this technique could be easily adjusted for use in larger plants, such as tomato or tobacco, if desired.

This protocol describes a robust seedling grafting method that requires no prior experience or training and can be executed at a very low cost using materials easily accessible in most molecular biology labs.

تطعيم الشتلات القابل للتطوير والمرن والفعال من حيث التكلفة

Early-stage seedling grafting has become a popular tool in molecular genetics to study root-shoot relationships within plants. Grafting early-stage ...