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Profiling of Pre-micro RNAs and microRNAs using Quantitative Real-time PCR (qPCR) Arrays

Quantitative real-time PCR (QPCR) has emerged as an accurate and valuable tool in profiling gene expression levels.  One of its many advantages is a lower ...

University of North Carolina at Chapel Hill

&#x8F6C;&#x5F55;&#x7684;&#x54FA;&#x4E73;&#x52A8;&#x7269;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x7531; A-&#x5230;-&#x6211; RNA &#x7F16;&#x8F91;&#x4FEE;&#x6539;&#x5DF2;&#x88AB;&#x516C;&#x8BA4;&#x4E3A;&#x4E00;&#x4EE3;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x591A;&#x6837;&#x6027;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x91CD;&#x8981;&#x673A;&#x5236;&#xFF0C;&#x8FD8;&#x89C4;&#x5B9A;&#x901A;&#x8FC7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4FE1;&#x606F;&#x7684;&#x91CD;&#x65B0;&#x7F16;&#x7801;&#x7684;&#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x529F;&#x80FD;&#x3002;&#x7F16;&#x8F91;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x8FD0;&#x52A8;&#x5458;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x662F;&#xFF0C;&#x8D8A;&#x6765;&#x8D8A;&#x591A;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x6210;&#x4E3A;&#x786E;&#x5B9A;&#x7684; A-&#x5230;-&#x6211;&#x4FEE;&#x6539;&#xFF0C;&#x5B9E;&#x73B0;&#x7F16;&#x8F91;&#x4E0A;&#x7684;&#x75C5;&#x56E0;&#x6216;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x8FDB;&#x5C55;&#x7684;&#x6F5C;&#x5728;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x68C0;&#x8BA8;&#x4E0A;&#x4F4D;&#x7F6E;&#x5DF2;&#x88AB; A-&#x5230;-&#x6211; RNA &#x7F16;&#x8F91;&#x7684;&#x52A8;&#x4E71;&#x4E0E;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x75BE;&#x75C5;&#x8868;&#x578B;&#x5173;&#x8054;&#x8D77;&#x6765;&#x7684;&#x65B0;&#x77E5;&#x8BC6;&#x3002;

A-&#x5230;-&#x6211; RNA &#x7F16;&#x8F91;&#x548C;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x75BE;&#x75C5;&#x3002;

The post-transcriptional modification of mammalian transcripts by A-to-I RNA editing has been recognized as an important mechanism for the generation of molecular diversity and also regulates protein function through recoding of genomic information. As the molecular players of editing are characterized and an increasing number of genes become identified that are subject to A-to-I modification, the potential impact of editing on the etiology or progression of human diseases is realized. Here we review the recent knowledge on where disturbances in A-to-I RNA editing have been correlated with human disease phenotypes.

A-to-I RNA editing and human disease.

La modification post-transcriptionnelle des mammif&egrave;res transcrits en &eacute;ditant des RNA A-&agrave;-I a &eacute;t&eacute; reconnue comme un m&eacute;canisme important pour la g&eacute;n&eacute;ration de la diversit&eacute; mol&eacute;culaire et r&eacute;glemente &eacute;galement la fonction des prot&eacute;ines par le biais de recodage de l&#39;information g&eacute;nomique. Comme les acteurs mol&eacute;culaires de l&#39;&eacute;dition sont caract&eacute;ris&eacute;s et un nombre croissant de g&egrave;nes devenus identifi&eacute; qui sont soumis &agrave; modification A-&agrave;-I, l&#39;impact potentiel de l&#39;&eacute;dition sur l&#39;&eacute;tiologie ou la progression des maladies humaines est r&eacute;alis&eacute;. Nous r&eacute;sumons ici les connaissances r&eacute;centes sur o&ugrave; les perturbations dans l&#39;&eacute;dition de A-&agrave;-I RNA ont &eacute;t&eacute; corr&eacute;l&eacute;es avec les ph&eacute;notypes de la maladie humaine.

A-&agrave;-I RNA &eacute;dition et humaine maladie.

Die Posttranskriptionale Modifikation der S&auml;ugetier-Transkripte bearbeite A-zu-I RNA als ein wichtiger Mechanismus f&uuml;r die Generation der molekularen Vielfalt erkannt wurde und regelt auch die Proteinfunktion durch Umkodierung der genomischen Informationen. Wie die molekulare Spieler der Bearbeitung gekennzeichnet sind und eine wachsende Zahl von Gene identifiziert werden, die A-zu-I vorbehalten sind, ist die potenzielle Auswirkungen der Bearbeitung auf der &Auml;tiologie oder Fortschreiten der Krankheiten des Menschen klar. Hier &uuml;berpr&uuml;fen wir die j&uuml;ngste Erkenntnisse &uuml;ber wo St&ouml;rungen im A-zu-I RNA Bearbeitung mit menschlichen Krankheit Ph&auml;notypen korreliert worden haben.

A-zu-I RNA Bearbeitungs- und menschliche Krankheit.

La modifica espresione di mammiferi trascrizioni da A-a-I RNA editing &egrave; stata riconosciuta come un importante meccanismo per la generazione della diversit&agrave; molecolare e regola anche la funzione della proteina attraverso la registrazione delle informazioni genomiche. Come i giocatori molecolari di editing sono caratterizzati e un numero crescente di geni diventata identificato che sono soggette a modifiche A-a-I, viene realizzato il potenziale impatto di editing sull&#39;eziologia o la progressione di malattie umane. Qui recensiamo le recenti conoscenze su dove dispersioni nell&#39;A-a-I RNA editing hanno stati correlati con fenotipi della malattia umana.

A-a-I RNA editing e umana malattia.

A &#x306B;&#x306F; RNA &#x7DE8;&#x96C6;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x54FA;&#x4E73;&#x985E;&#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3; &#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x5F8C;&#x4FEE;&#x98FE;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x591A;&#x69D8;&#x6027;&#x306E;&#x4E16;&#x4EE3;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x8A8D;&#x8B58;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3057;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x60C5;&#x5831;&#x306E;&#x518D;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x6A5F;&#x80FD;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7DE8;&#x96C6;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x30D7;&#x30EC;&#x30A4;&#x30E4;&#x30FC;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x3068;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x3059;&#x308B;&#x6570; A &#x306B;&#x306F;&#x4E88;&#x544A;&#x306A;&#x3057;&#x306B;&#x5909;&#x66F4;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x8B58;&#x5225;&#x306B;&#x306A;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x3001;&#x7DE8;&#x96C6;&#x75C5;&#x56E0;&#x3084;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x4E0A;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x5F71;&#x97FF;&#x3092;&#x5B9F;&#x73FE;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x5834;&#x6240; A-&#x79C1; RNA &#x7DE8;&#x96C6;&#x3067;&#x64FE;&#x4E71;&#x3072;&#x3068;&#x75BE;&#x60A3;&#x8868;&#x73FE;&#x578B;&#x3068;&#x76F8;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x4E0A;&#x306E;&#x77E5;&#x8B58;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

A &#x306B;&#x306F; RNA &#x7DE8;&#x96C6;&#x3068;&#x4EBA;&#x9593;&#x75C5;&#x6C17;&#x3002;

A-&#xD558;-&#xB098; RNA &#xD3B8;&#xC9D1; &#xD3EC;&#xC720;&#xB958; &#xB179;&#xCDE8; &#xB85D;&#xC758; post-transcriptional &#xC218;&#xC815; &#xBD84;&#xC790; &#xB2E4;&#xC591;&#xC131;&#xC758; &#xC138;&#xB300;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC73C;&#xB85C; &#xC778;&#xC815;&#xC744; &#xBC1B;&#xACE0; &#xC788;&#xB2E4; &#xACE0; &#xB610;&#xD55C; &#xB808;&#xCF54;&#xB529;&#xC758; &#xAC8C;&#xB188; &#xC815;&#xBCF4;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xAE30;&#xB2A5;&#xC744; &#xC870;&#xC808;. &#xD3B8;&#xC9D1;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xC120;&#xC218; &#xD2B9;&#xC9D5;&#xC73C;&#xB85C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC218;&#xAC00; &#xC99D;&#xAC00; &#xD55C;-&#xC5D0;-&#xB09C; &#xC218;&#xC815; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB420; &#xBCD1; &#xC778; &#xB610;&#xB294; &#xC778;&#xAC04; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC758; &#xC9C4;&#xD589;&#xC5D0; &#xD3B8;&#xC9D1;&#xC758; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xC601;&#xD5A5; &#xC2E4;&#xD604;. &#xC5EC;&#xAE30;&#xC5D0; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xACE0;&#xAE30;&#xC640; A-&#xC5D0;-&#xB09C; RNA &#xD3B8;&#xC9D1; &#xBC29;&#xD574;&#xB97C; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4;&#xAC00; &#xB418;&#xC5B4; &#xCD5C;&#xADFC; &#xAE30;&#xC220; &#xAC80;&#xD1A0;.

A-&#xD558;-&#xB098; RNA &#xD3B8;&#xC9D1; &#xBC0F; &#xC778;&#xAC04; &#xC9C8;&#xBCD1;.

La modificaci&oacute;n postranscripcional de mam&iacute;feros transcritos de RNA A-a-I edici&oacute;n ha sido reconocida como un mecanismo importante para la generaci&oacute;n de diversidad molecular y tambi&eacute;n regula la funci&oacute;n de la prote&iacute;na a trav&eacute;s de la recodificaci&oacute;n de informaci&oacute;n gen&oacute;mica. Como se caracterizan los jugadores moleculares de edici&oacute;n y un creciente n&uacute;mero de genes que est&aacute;n sujetos a modificaciones A-a-I se identifican, se observa el impacto potencial de la edici&oacute;n en la etiolog&iacute;a o la progresi&oacute;n de enfermedades humanas. Aqu&iacute; repasamos los conocimientos recientes en donde los disturbios en la edici&oacute;n de A-a-I RNA se han correlacionado con fenotipos de enfermedad humana.

Kristen Tamburro

Department of Microbiology and Immunology,
Lineberger Comprehensive Cancer Center,
Center for AIDS Research,
Department of Microbiology and Immunology, Lineberger Comprehensive Cancer Center, Center for AIDS Research

University of North Carolina at Chapel Hill

Profiling of Pre-micro RNAs and microRNAs using Quantitative Real-time PCR (qPCR) Arrays

Kristen Tamburro

Department of Microbiology and Immunology,Lineberger Comprehensive Cancer Center,Center for AIDS Research,Department of Microbiology and Immunology, Lineberger Comprehensive Cancer Center, Center for AIDS Research

University of North Carolina at Chapel Hill

Profiling of Pre-micro RNAs and microRNAs using Quantitative Real-time PCR (qPCR) Arrays

Department of Microbiology and Immunology,
Lineberger Comprehensive Cancer Center,
Center for AIDS Research,
Department of Microbiology and Immunology, Lineberger Comprehensive Cancer Center, Center for AIDS Research