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High Throughput MicroRNA Profiling: Optimized Multiplex qRT-PCR at Nanoliter Scale on the Fluidigm Dynamic ArrayTM IFCs

The broad involvement of miRNAs in critical processes underlying development, tissue homoeostasis and disease has led to a surging interest among the ...

Fluidigm Corporation 

&#x6211;&#x4EEC;&#x7814;&#x7A76;&#x4E86;&#x8F7D;&#x6709;&#x5171;&#x8BC6; CRE &#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x53CC;&#x94FE; DNA &#x7684; CREB B ZIP &#x86CB;&#x767D;&#x57DF;&#x7ED1;&#x5B9A; &#xFF08;5&#39;-TGACGTCA-3&#39;&#xFF09;&#x3001; &#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x9762;&#x503C;&#x3001; C/EBP &#x548C; AP 1 &#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x65E0;&#x5173;&#x7684; SP1 &#x5E8F;&#x5217;&#x3002;&#x4E2D;&#x5B58;&#x5728;&#x6216;&#x7F3A;&#x5C11;&#x7684; MgCl2 &#x548C; &#xFF08;&#x6216;&#xFF09; &#x6C2F;&#x5316;&#x94BE;&#x4F7F;&#x7528;&#x4E24;&#x79CD;&#x65B9;&#x6CD5;&#x6D4B;&#x5B9A; DNA &#x7ED1;&#x5B9A;&#xFF1A; &#x5706;&#x4E8C;&#x8272; (CD) &#x5149;&#x8C31;&#x548C;&#x7535;&#x6CF3;&#x8FC1;&#x79FB;&#x7387;&#x6539;&#x53D8;&#x5206;&#x6790;&#x6CD5; (EMSA)&#x3002;&#x88C1;&#x8C08;&#x4F1A;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5141;&#x8BB8;&#x6211;&#x4EEC;&#x8861;&#x91CF;&#x5E73;&#x8861;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x89E3;&#x51B3;&#x65B9;&#x6848;&#x4E2D;&#x3002;&#x5728; 150 &#x6BEB;&#x7C73;&#x6C2F;&#x5316;&#x94BE;&#x7684;&#x70ED;&#x53D8;&#x6027;&#x6307;&#x793A; CREB B ZIP &#x57DF;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x4E0E; CRE &#x7F51;&#x7AD9;&#xFF0C;&#x5176;&#x6B21;&#x662F;&#x9762;&#x503C;&#x6700;&#x9AD8;&#x4EB2;&#x548C;&#x6027;&#x7684; DNA &#x5E8F;&#x5217; (5&#39;-TAACGTTA-3&#39;)&#x3001; C/EBP &#xFF08;5&#39;-TTGCGCAA-3&#39;) &#x548C; AP-1 (5&#39;-TGAGTCA-3&#39;) &#x7F51;&#x7AD9;&#x3002;&#x52A0; 10 &#x6BEB;&#x7C73; MgCl2 &#x51CF;&#x5C11;&#x5230; CRE &#x548C; PAR DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x7684; DNA &#x7ED1;&#x5B9A;&#x548C;&#x53D6;&#x6D88;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230; C/EBP &#x548C; AP 1 DNA &#x5E8F;&#x5217;&#xFF0C;&#x9020;&#x6210;&#x4E86;&#x66F4;&#x591A;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684; DNA &#x5177;&#x6709;&#x7EA6;&#x675F;&#x529B;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528; &#39;&#x6807;&#x51C6;&#39; &#x5730;&#x9AD8;&#x8F9B;&#x6761;&#x4EF6; &#xFF08;0.25 x &#x8282;&#x6BB5;)&#x3001; CREB &#x7684;&#x7EA6;&#x675F;&#x68C0;&#x67E5;&#x7684;&#x6240;&#x6709; DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x3002;CREB CRE &#x590D;&#x6742;&#x4E86;&#x5927;&#x7EA6; 300 &#x660E;&#x663E; Kd &#x4E0B;&#x5348;&#xFF0C;&#x5927;&#x7EA6; 1 PAR nM&#xFF0C;C/EBP &#x548C; AP 1 &#x7684;&#x5927;&#x7EA6; 3 nM &#x548C; SP1 &#x7684;&#x7EA6; 30 nM&#x3002;10 &#x6BEB;&#x7C73; MgCl2 &#x7684;&#x805A;&#x4E19;&#x70EF;&#x9170;&#x80FA;&#x51DD;&#x80F6;&#x52A0;&#x5927;&#x5E45;&#x5EA6;&#x6539;&#x53D8;&#x7279;&#x5B9A;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684; DNA &#x5177;&#x6709;&#x7EA6;&#x675F;&#x529B;&#x3002;CRE DNA 3-fold&#xFF0C;&#x4E0B;&#x8DCC;&#x4F46;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x5230;&#x5176;&#x4ED6;&#x4E24;&#x4E2A; DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x4E0B;&#x8DCC; CREB &#x7ED1;&#x5B9A;&#x4EB2;&#x548C;&#x529B; &gt; 1000-fold&#x3002;&#x5730;&#x9AD8;&#x8F9B;&#x5728; 150 &#x6BEB;&#x7C73;&#x6C2F;&#x5316;&#x94BE;&#x81F3;&#x51DD;&#x80F6;&#x52A0;&#x4E86;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x4E8E; MgCl2 &#x7684;&#x6548;&#x679C;&#x3002;&#x9700;&#x8981;&#x9632;&#x6B62;&#x975E;&#x7279;&#x5B9A;&#x7684;&#x9759;&#x7535;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528; CREB &#x548C; DNA &#x6EB6;&#x6DB2;&#x4E2D;&#x7684;&#x9541;&#x6D53;&#x5EA6;&#x662F;&#x5728;&#x751F;&#x7406;&#x8303;&#x56F4;&#x5185;&#xFF0C;&#x56E0;&#x6B64;&#x9541;&#x6D53;&#x5EA6;&#x7684;&#x53D8;&#x5316;&#x53EF;&#x80FD;&#x662F;&#x8C03;&#x8282;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4FE1;&#x53F7;&#x3002;

&#x9541;&#x662F;&#x5FC5;&#x9700;&#x7684; CREB B ZIP &#x57DF;&#x7684;&#x7279;&#x5B9A; DNA &#x7ED1;&#x5B9A;&#x3002;

CREB B-&#xC6B0;&#xD3B8; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xD569;&#xC758; CRE &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xC774;&#xC911; &#xAC00;&#xB2E5; DNA&#xC758; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC0B4;&#xD3B4;&#xBCF4;&#xC558;&#xB2E4; (5&#39;-TGACGTCA-3&#39;), &#xD30C;, C/EBP &#xBC0F; AP-1 &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB418;&#xC9C0; &#xC54A;&#xC740; s p 1 &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xAD00;&#xB828;. DNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; MgCl2 &#xBC0F;/&#xB610;&#xB294; &#xB450; &#xAC00;&#xC9C0; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; Kcl&#xC758; &#xC874;&#xC7AC; &#xC720;&#xBB34;&#xC5D0; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;: &#xC6D0;&#xD615; &#xC591;&#xC0C9;&#xC131; (CD) &#xBD84;&#xAD11;&#xD559; &#xBC0F; &#xC804;&#xAE30; &#xC774;&#xB3D9; &#xAE30;&#xB3D9;&#xC131; &#xAD50;&#xB300; &#xBD84;&#xC11D; &#xC2E4;&#xD5D8; (EMSA). CD &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC; &#xC194;&#xB8E8;&#xC158;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xD3C9;&#xD615; &#xCE21;&#xC815;&#xC744; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. 150Mm KCl &#xC5F4; &#xBCC0;&#xC131; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4; CREB B-&#xC6B0;&#xD3B8; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778; &#xB4A4;&#xC5D0; &#xD30C; CRE &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xB192;&#xC740; &#xC120;&#xD638;&#xB3C4;&#xC640; &#xBAA8;&#xB4E0; DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4; (5&#39;-TAACGTTA-3&#39;), C/EBP (5&#39;-TTGCGCAA-3&#39;) &#xBC0F; AP-1 (5&#39;-TGAGTCA-3&#39;) &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;. 10Mm MgCl2 &#xCD94;&#xAC00; &#xAC10;&#xC18C; &#xB41C; CRE &#xBC0F; &#xD30C; DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB97C; DNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xBC0F; C/EBP &#xBC0F; AP 1 DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;, &#xB354; &#xB9CE;&#xC740; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD2B9;&#xC815; DNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xACB0;&#xACFC; &#xD3D0;&#xC9C0;. &#39;&#xD45C;&#xC900;&#39; EMSA &#xC870;&#xAC74;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; (0.25 x TBE), CREB &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xB41C; &#xBAA8;&#xB4E0; DNA &#xC21C;&#xC11C;&#xB97C; &#xC870;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4;. CREB CRE &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD588;&#xB2E4; &#xC57D; 300&#xC758; &#xBA85;&#xBC31;&#xD55C; Kd &#xC624;&#xD6C4;, &#xD30C; &#xC57D; 1 nM, C/EBP&#xC640; &#xC57D; 3 Nm&#xC758; AP-1&#xC640; s p 1&#xC758; &#xC57D; 30 nM. 10 M m MgCl2 polyacrylamide &#xC824;&#xC744; &#xCD94;&#xAC00; &#xADF9;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD2B9;&#xC815; DNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xBCC0;&#xACBD;. CREB CRE DNA 3-fold, &#xAC10;&#xC18C; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xAC10;&#xC18C; &#xB2E4;&#xB978; DNA &#xC21C;&#xC11C;&#xC5D0; &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC120;&#xD638;&#xB3C4; &amp;gt; 1000-fold. EMSA&#xC5D0;&#xB294; &#xC824; 150 m m Kcl&#xC758; &#xCD94;&#xAC00; Mgcl2&#xC640; &#xBE44;&#xC2B7;&#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC;&#xAC00; &#xC788;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC194;&#xB8E8;&#xC158;&#xC5D0;&#xC11C; CREB DNA &#xAC04;&#xC758; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xC815;&#xC804;&#xAE30; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC744; &#xBC29;&#xC9C0; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xD544;&#xC694;&#xD55C; &#xB9C8;&#xADF8;&#xB124;&#xC298; &#xB18D;&#xB3C4; &#xC0DD;&#xB9AC; &#xC801; &#xBC94;&#xC704;&#xC5D0;&#xC11C; &#xACE0; &#xB9C8;&#xADF8;&#xB124;&#xC298; &#xB18D;&#xB3C4; &#xBCC0;&#xD654; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xC870;&#xC808; &#xD558;&#xB294; &#xC138;&#xD3EC; &#xC2E0;&#xD638; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xB9C8;&#xADF8;&#xB124;&#xC298;&#xC740; CREB B-&#xC6B0;&#xD3B8; &#xB3C4;&#xBA54;&#xC778;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; DNA &#xBC14;&#xC778;&#xB529;&#xC774; &#xD544;&#xC694; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Hemos examinado vinculante del dominio de la prote&iacute;na CREB B-ZIP al ADN bicatenario que contienen un consenso secuencia CRE (5&#39;-TGACGTCA-3&#39;), las secuencias PAR, C/EBP y AP-1 y la secuencia de SP1 sin relaci&oacute;n. Uni&oacute;n de ADN se evaluaron en la presencia o ausencia de MgCl2 y/o KCl usando dos m&eacute;todos: Espectroscopia de dicro&iacute;smo circular (CD) y el an&aacute;lisis del cambio de movilidad electrofor&eacute;tica (EMSA). El ensayo de CD permite medir vinculante de equilibrio en soluci&oacute;n. Desnaturalizaci&oacute;n t&eacute;rmica en 150 mM KCl indica que el dominio de CREB B-ZIP une todas las secuencias de ADN, con mayor afinidad por el sitio de la CRE, seguido de la RFA (5&#39;-TAACGTTA-3&#39;), C/EBP (5&#39;-TTGCGCAA-3&#39;) y AP-1 (5&#39;-TGAGTCA-3&#39;) sitios. La adici&oacute;n de 10 mM MgCl2 disminuido DNA que atan a las secuencias CRE y ADN de PAR y suprimida atar a las secuencias C/EBP y AP-1 DNA, dando por resultado m&aacute;s Uni&oacute;n de ADN de secuencia espec&iacute;fica. Usando condiciones EMSA &#39;est&aacute;ndar&#39; (0.25 x TBE), CREB obligado de todas las secuencias de ADN examinadas. El complejo de CREB-CRE ten&iacute;a una aparente Kd de aproximadamente 300 pM, PAR de aproximadamente 1 nM, C/EBP y AP-1 de aproximadamente 3 nM y SP1 de aproximadamente 30 nM. La adici&oacute;n de 10 mM MgCl2 el gel de poliacrilamida dram&aacute;ticamente hab&iacute;a alterado Uni&oacute;n de ADN de secuencia espec&iacute;fica. Afinidad de uni&oacute;n de CREB para ADN CRE 3-fold disminuido, pero vinculante a las otras secuencias de ADN disminuido &gt; Acmo. En la EMSA, adem&aacute;s de 150 mM KCl a los geles tuvieron un efecto similar a MgCl2. La concentraci&oacute;n de magnesio para evitar interacciones electrost&aacute;ticas inespec&iacute;fica entre CREB y ADN en soluci&oacute;n est&aacute; en el rango fisiol&oacute;gico y as&iacute; los cambios en la concentraci&oacute;n de magnesio pueden ser una se&ntilde;al celular que regula la expresi&oacute;n g&eacute;nica.

El magnesio es necesario para la Uni&oacute;n de ADN espec&iacute;fica del dominio de CREB B-ZIP.

We have examined binding of the CREB B-ZIP protein domain to double-stranded DNA containing a consensus CRE sequence (5'-TGACGTCA-3'), the related PAR, C/EBP and AP-1 sequences and the unrelated SP1 sequence. DNA binding was assayed in the presence or absence of MgCl2 and/or KCl using two methods: circular dichroism (CD) spectroscopy and electrophoretic mobility shift assay (EMSA). The CD assay allows us to measure equilibrium binding in solution. Thermal denaturation in 150 mM KCl indicates that the CREB B-ZIP domain binds all the DNA sequences, with highest affinity for the CRE site, followed by the PAR (5'-TAACGTTA-3'), C/EBP (5'-TTGCGCAA-3') and AP-1 (5'-TGAGTCA-3') sites. The addition of 10 mM MgCl2 diminished DNA binding to the CRE and PAR DNA sequences and abolished binding to the C/EBP and AP-1 DNA sequences, resulting in more sequence-specific DNA binding. Using 'standard' EMSA conditions (0.25x TBE), CREB bound all the DNA sequences examined. The CREB-CRE complex had an apparent Kd of approximately 300 pM, PAR of approximately 1 nM, C/EBP and AP-1 of approximately 3 nM and SP1 of approximately 30 nM. The addition of 10 mM MgCl2 to the polyacrylamide gel dramatically altered sequence-specific DNA binding. CREB binding affinity for CRE DNA decreased 3-fold, but binding to the other DNA sequences decreased >1000-fold. In the EMSA, addition of 150 mM KCl to the gels had an effect similar to MgCl2. The magnesium concentration needed to prevent non-specific electrostatic interactions between CREB and DNA in solution is in the physiological range and thus changes in magnesium concentration may be a cellular signal that regulates gene expression.

Magnesium is required for specific DNA binding of the CREB B-ZIP domain.

Nous avons &eacute;tudi&eacute; la liaison du domaine prot&eacute;ine CREB B-ZIP &agrave; l&#39;ADN bicat&eacute;naire contenant un consensus s&eacute;quence CRE (5&#39;-TGACGTCA-3&#39;), les associ&eacute;s des s&eacute;quences PAR, C/EBP et AP-1 et la s&eacute;quence de SP1 sans rapport. L&#39;attache d&#39;ADN a &eacute;t&eacute; test&eacute;e en pr&eacute;sence ou en absence de MgCl2 ou KCl en utilisant deux m&eacute;thodes : spectroscopie de dichro&iuml;sme circulaire (CD) et analyse de d&eacute;calage de mobilit&eacute; &eacute;lectrophor&eacute;tique (EMSA). Le CD de test permet de mesurer la liaison d&#39;&eacute;quilibre en solution. La d&eacute;naturation thermique en 150 mM KCl indique que le domaine de CREB B-ZIP lie toutes les s&eacute;quences d&#39;ADN, avec une affinit&eacute; plus &eacute;lev&eacute;e pour le site de la CRE, suivi par le fer (5&#39;-TAACGTTA-3&#39;), C/EBP (5&#39;-TTGCGCAA-3&#39;) et AP-1 (5&#39;-TGAGTCA-3&#39;) sites. L&#39;ajout de 10 mM de MgCl2 diminu&eacute; l&#39;attache aux CRE et l&#39;ADN PAR des s&eacute;quences d&#39;ADN et abolit la liaison aux s&eacute;quences d&#39;ADN de l&#39;AP-1 et les C/EBP, ayant pour r&eacute;sultat plus contraignante de l&#39;ADN de s&eacute;quence-sp&eacute;cifique. En utilisant les conditions de l&#39;AESM &laquo; standards &raquo; (0,25 x TBE), CREB li&eacute; toutes les s&eacute;quences d&#39;ADN examin&eacute;es. Le complexe de CREB-CRE avait un Kd apparent d&#39;environ 300 h, nominale d&#39;environ 1 nM, C/EBP et AP-1 d&#39;environ 3 nM et SP1 d&#39;environ 30 nM. L&#39;ajout de 10 mM de MgCl2 au gel de polyacrylamide modifi&eacute; radicalement la liaison ADN de s&eacute;quence-sp&eacute;cifique. CREB affinit&eacute; pour l&#39;ADN CRE a diminu&eacute; de 3 fois, mais obligatoire pour les autres s&eacute;quences d&#39;ADN a diminu&eacute; &gt; 1000 fois. Dans l&#39;AESM, addition de 150 mM de KCl pour les gels a eu un effet semblable au MgCl2. La concentration de magn&eacute;sium pour pr&eacute;venir non sp&eacute;cifique des interactions &eacute;lectrostatiques entre CREB et l&#39;ADN dans la solution est dans les limites physiologiques et les changements dans la concentration de magn&eacute;sium peuvent donc un signal cellulaire qui r&eacute;gule l&#39;expression des g&egrave;nes.

Le magn&eacute;sium est n&eacute;cessaire pour la fixation d&#39;ADN sp&eacute;cifique du domaine CREB B-ZIP.

Magnesium wird f&#xFC;r spezifische DNA-Bindung von CREB B-ZIP-Dom&#xE4;ne erforderlich.

Abbiamo esaminato associazione del dominio della proteina CREB B-ZIP per DNA double-stranded contenente un consenso sequenza CRE (5 &#39;-TGACGTCA - 3&#39;), le sequenze relative PAR, C/EBP e AP-1 e la sequenza di SP1 non correlata. Grippaggio del DNA &egrave; stato dosato in presenza o assenza di MgCl2 e/o KCl utilizzando due metodi: Spettroscopia di Dicroismo circolare (CD) e analisi di spostamento di mobilit&agrave; elettroforetica (EMSA). Il dosaggio di CD permette di misurare associazione equilibrio in soluzione. Denaturazione termica in 150 mM KCl indica che il dominio di CREB B-ZIP associa tutte le sequenze di DNA, con alta affinit&agrave; per il sito CRE, seguito dal PAR (5 &#39;-TAACGTTA - 3&#39;), C/EBP (5 &#39;-TTGCGCAA - 3&#39;) e siti di AP-1 (5 &#39;-TGAGTCA - 3&#39;). L&#39;aggiunta di 10 mM MgCl2 diminuito legame del DNA a sequenze di DNA PAR e CRE e abolito vincolante per le sequenze di DNA di AP-1 e C/EBP, con conseguente pi&ugrave; specifica sequenza DNA binding. Utilizzando condizioni EMSA &#39;standard&#39; (0.25 x TBE), CREB associato tutte le sequenze di DNA esaminate. Il complesso di CREB-CRE aveva un Kd apparente di circa 300 pM, PAR di circa 1 nM, C/EBP e AP-1 di circa 3 nM e SP1 di circa 30 nM. L&#39;aggiunta di 10 mM MgCl2 al gel di poliacrilammide drasticamente alterato legame sequenza-specifico del DNA. Affinit&agrave; di legame di CREB per DNA CRE diminuito 3 volte, ma vincolante per le altre sequenze di DNA &egrave; diminuito &amp;gt; di. Nell&#39;EMSA, aggiunta di 150 mM KCl per il gel ha avuto un effetto simile a quello di MgCl2. La concentrazione di magnesio necessaria per prevenire non specifiche interazioni elettrostatiche CREB e DNA in soluzione &egrave; nel range fisiologico e quindi cambiamenti nella concentrazione di magnesio possono essere un segnale cellulare che regola l&#39;espressione genica.

Il magnesio &egrave; necessario per il legame del DNA specifico del dominio CREB B-ZIP.

CREB B-ZIP &#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3; &#x30B3;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B5;&#x30B9; CRE &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9; (5 &#39;-TGACGTCA - 3&#39;)&#x3001;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x30D1;&#x30FC;&#x3001;C/EBP &#x304A;&#x3088;&#x3073; AP 1 &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3068;&#x7121;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306A; SP1 &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x4E8C;&#x672C;&#x9396; DNA &#x3078;&#x306E;&#x7D50;&#x5408;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;DNA &#x7D50;&#x5408;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x8A66;&#x91D1; MgCl2 &#x304A;&#x3088;&#x3073;/&#x307E;&#x305F;&#x306F; 2 &#x3064;&#x306E;&#x30E1;&#x30BD;&#x30C3;&#x30C9;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066; KCl &#x306E;&#x6709;&#x7121;: &#x5186;&#x4E8C;&#x8272;&#x6027; (CD) &#x5206;&#x5149;&#x3068;&#x96FB;&#x6C17;&#x6CF3;&#x52D5;&#x306E;&#x79FB;&#x52D5;&#x6027;&#x30B7;&#x30D5;&#x30C8;&#x8A66;&#x91D1; (EMSA)&#x3002;CD &#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x5E73;&#x8861;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x30BD;&#x30EA;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x6E2C;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x71B1;&#x5909;&#x6027; 150 mM KCl &#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B; CREB B-ZIP &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3001;&#x30D1;&#x30FC; &#xFF08;5 &#39;-TAACGTTA - 3&#39;), C/EBP (5 &#39;-TTGCGCAA - 3&#39;) AP-1 &#xFF08;5 &#39;-TGAGTCA - 3&#39;) &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x9806;&#x3001;CRE &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x306E;&#x9AD8;&#x3044;&#x89AA;&#x548C;&#x6027;&#x3092;&#x7D50;&#x5408;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;10 MM MgCl2 &#x306E;&#x6DFB;&#x52A0;&#x306F; DNA &#x7D50;&#x5408; CRE &#x3068;&#x30D1;&#x30FC; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306B;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3001;&#x5EC3;&#x6B62; C/EBP &#x3068; AP 1 DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3088;&#x308A;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x56FA;&#x6709;&#x306E; DNA &#x7D50;&#x5408;&#x306B;&#x8D77;&#x56E0;&#x3002;&#39;&#x6A19;&#x6E96;&#39; EMSA &#x306E;&#x6761;&#x4EF6;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066; (0.25 x TBE)&#x3001;CREB &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3002;CREB &#x306E; CRE &#x30B3;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EC;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x898B;&#x304B;&#x3051;&#x306E; Kd &#x306E;&#x304A;&#x3088;&#x305D; 300 &#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x5348;&#x5F8C;&#x3001;&#x7D04; 1 &#x30D1;&#x30FC; nM&#x3001;C/EBP &#x3068; AP-1 &#x7D04; 3 nM &#x306E; SP1 &#x306E;&#x7D04; 30 nM&#x3002;10 MM MgCl2 &#x30DD;&#x30EA;&#x30A2;&#x30AF;&#x30EA;&#x30EB;&#x30A2;&#x30DF;&#x30C9;&#x306E;&#x30B2;&#x30EB;&#x306E;&#x8FFD;&#x52A0;&#x5287;&#x7684;&#x306B;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x56FA;&#x6709;&#x306E; DNA &#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x304C;&#x5909;&#x66F4;&#x3002;CREB &#x7D50;&#x5408;&#x89AA;&#x548C;&#x6027;&#x306E; CRE DNA &#x4E09;&#x679A;&#x958B;&#x304D;&#x3001;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3057;&#x305F;&#x4ED6;&#x306E; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x76EE; 1000-fold&#x3002;EMSA &#x306E; 150 &#x30DF;&#x30EA;&#x30E1;&#x30FC;&#x30C8;&#x30EB; KCl &#x3092;&#x30B2;&#x30EB;&#x3078;&#x306E;&#x6DFB;&#x52A0; MgCl2 &#x306B;&#x4F3C;&#x305F;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x52B9;&#x679C;&#x304C;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x975E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x9759;&#x96FB;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528; CREB &#x3068; DNA &#x9593;&#x30BD;&#x30EA;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x9632;&#x3050;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x306A;&#x30DE;&#x30B0;&#x30CD;&#x30B7;&#x30A6;&#x30E0;&#x6FC3;&#x5EA6;&#x751F;&#x7406;&#x7684;&#x7BC4;&#x56F2;&#x5185;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x30DE;&#x30B0;&#x30CD;&#x30B7;&#x30A6;&#x30E0;&#x6FC3;&#x5EA6;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x3059;&#x308B;&#x643A;&#x5E2F;&#x96FB;&#x8A71;&#x306E;&#x4FE1;&#x53F7;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30DE;&#x30B0;&#x30CD;&#x30B7;&#x30A6;&#x30E0;&#x306F; CREB B-ZIP &#x30C9;&#x30E1;&#x30A4;&#x30F3;&#x306E;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E; DNA &#x306E;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x306B;&#x5FC5;&#x8981;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x57FA;&#x4E8E;&#x4E8C;&#x805A;&#x5C5E;&#x6027;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B; B ZIP &#x86CB;&#x767D;&#x8D28;&#x7684;&#x5206;&#x7C7B;&#x3002;

Classification of human B-ZIP proteins based on dimerization properties.

Classification des prot&eacute;ines humaines de B-ZIP bas&eacute;e sur les propri&eacute;t&eacute;s de dim&eacute;risation.

Klassifizierung von humanen B-ZIP-Proteinen auf Dimerisierung Eigenschaften.

Classificazione delle proteine umane B-ZIP basato sulle propriet&agrave; di dimerizzazione.

&#x30C0;&#x30A4;&#x30DE;&#x30FC;&#x5316;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D1;&#x30C6;&#x30A3;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E; B-ZIP &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x5206;&#x985E;&#x3002;

Dimerization &#xC18D;&#xC131;&#xC744; &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; B-&#xC6B0;&#xD3B8; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xBD84;&#xB958;.

Clasificaci&oacute;n de prote&iacute;nas humanas de B-ZIP basado en las propiedades de dimerizaci&oacute;n.

&#x54FA;&#x4E73;&#x52A8;&#x7269;&#x7684;&#x5927;&#x8111;&#x662F;&#x7531;&#x5185;&#x5728;&#x7684;&#x9057;&#x4F20;&#x673A;&#x5236;&#x4E0E;&#x5916;&#x5728;&#x7684;&#x63D0;&#x793A;&#xFF0C;&#x4F8B;&#x5982;&#x751F;&#x957F;&#x56E0;&#x7D20;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x51B3;&#x5B9A;&#x7684;&#x3002;&#x8FD9;&#x91CC;&#x6211;&#x4EEC;&#x5B9A;&#x4E49;&#x4E86;&#x4FE1;&#x53F7;&#x7684;&#x7EA7;&#x8054;&#xFF0C;&#x7532;&#x4E59;&#x916E;-C/EBP &#x901A;&#x8DEF;&#xFF0C;&#x5373;&#x76AE;&#x8D28;&#x7956;&#x7EC6;&#x80DE;&#x6210;&#x4E3A; postmitotic &#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x7684;&#x5FC5;&#x8981;&#x6761;&#x4EF6;&#x3002;&#x7532;&#x4E59;&#x916E;&#x6216; C/EBP &#x5BB6;&#x65CF;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x6291;&#x5236;&#x5927;&#x8111;&#x540C;&#x65F6;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x662F;&#x7532;&#x4E59;&#x916E;&#x516C;&#x53F8;&#x7F51;&#x7AD9;&#x5728;&#x78F7;&#x9178;&#x5316;&#x6A21;&#x4EFF;&#x63D0;&#x9AD8;&#x795E;&#x7ECF;&#x53D1;&#x751F;&#x7684; C/EBPbeta &#x7A81;&#x53D8;&#x4F53;&#x3002;C/EBP &#x76F4;&#x63A5;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6D3B;&#x5316;&#x7684;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x5982; Talpha1 &alpha;-&#x5FAE;&#x7BA1;&#x86CB;&#x767D;&#x4ECB;&#x5BFC;&#x8FD9;&#x4E00;&#x79EF;&#x6781;&#x6548;&#x679C;&#x3002;&#x76F8;&#x53CD;&#xFF0C;&#x4F9D;&#x8D56;&#x4E8E; EBP &#x7684; C &#x8F6C;&#x5F55;&#x7684;&#x6291;&#x5236;&#x4F5C;&#x7528;&#x589E;&#x5F3A;&#x661F;&#x5F62;&#x80F6;&#x8D28;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECE;&#x540C;&#x4E00;&#x7956;&#x7EC6;&#x80DE;&#x4ECB;&#x5BFC; CNTF &#x4EE3;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x7532;&#x4E59;&#x916E;-C/EBP &#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x6FC0;&#x6D3B;&#x589E;&#x5F3A;&#x795E;&#x7ECF;&#x53D1;&#x751F;&#x548C;&#x6291;&#x5236; gliogenesis&#xFF0C;&#x4ECE;&#x800C;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E00;&#x79CD;&#x673A;&#x5236;&#x5373;&#x751F;&#x957F;&#x56E0;&#x5B50;&#x53EF;&#x4EE5;&#x6709;&#x9009;&#x62E9;&#x6027;&#x5730;&#x504F;&#x7956;&#x7EC6;&#x80DE;&#x53D1;&#x80B2;&#x6210;&#x4E3A;&#x795E;&#x7ECF;&#x7EC6;&#x80DE;&#x3002;

&#x7532;&#x4E59;&#x916E;-C/EBP &#x9014;&#x5F84;&#x5728;&#x751F;&#x957F;&#x56E0;&#x5B50;&#x8C03;&#x8282;&#x76AE;&#x5C42;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x518D;&#x751F;&#x7684;&#x91CD;&#x8981;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

Mammalian neurogenesis is determined by an interplay between intrinsic genetic mechanisms and extrinsic cues such as growth factors. Here we have defined a signaling cascade, a MEK-C/EBP pathway, that is essential for cortical progenitor cells to become postmitotic neurons. Inhibition of MEK or of the C/EBP family of transcription factors inhibits neurogenesis while expression of a C/EBPbeta mutant that is a phosphorylation-mimic at a MEK-Rsk site enhances neurogenesis. C/EBP mediates this positive effect by direct transcriptional activation of neuron-specific genes such as Talpha1 alpha-tubulin. Conversely, inhibition of C/EBP-dependent transcription enhances CNTF-mediated generation of astrocytes from the same progenitor cells. Thus, activation of a MEK-C/EBP pathway enhances neurogenesis and inhibits gliogenesis, thereby providing a mechanism whereby growth factors can selectively bias progenitors to become neurons during development.

An essential role for a MEK-C/EBP pathway during growth factor-regulated cortical neurogenesis.

La neurogen&egrave;se chez les mammif&egrave;res est d&eacute;termin&eacute;e par une interaction entre les m&eacute;canismes g&eacute;n&eacute;tiques intrins&egrave;ques et extrins&egrave;ques rep&egrave;res comme facteurs de croissance. Ici, nous avons d&eacute;fini une cascade de signalisation, une voie MEK-C/EBP, qui est essentielle pour les prog&eacute;niteurs corticale devenir des neurones mitotiques. Inhibition de MEK ou de la famille des facteurs de transcription C/EBP inhibe la neurogen&egrave;se tandis que l&#39;expression d&#39;un mutant de C/EBPbeta qui est qu&#39;un imitateur de la phosphorylation sur un site de MEK-Rsk am&eacute;liore la neurogen&egrave;se. C/EBP m&eacute;die cet effet positif de l&#39;activation transcriptionnelle directe de neurone-sp&eacute;cifique de g&egrave;nes tels que Talpha1 alpha-tubuline. &Agrave; l&#39;inverse, l&#39;inhibition de C/EBP-d&eacute;pendants de transcription am&eacute;liore induite par le CNTF g&eacute;n&eacute;ration des astrocytes, des cellules prog&eacute;nitrices m&ecirc;me. Ainsi, l&#39;activation d&#39;une voie MEK-C/EBP am&eacute;liore la neurogen&egrave;se et inhibe la gliogenesis, fournissant ainsi un m&eacute;canisme par lequel les facteurs de croissance peuvent biaiser s&eacute;lectivement prog&eacute;niteurs de devenir des neurones au cours du d&eacute;veloppement.

Un r&ocirc;le essentiel pour une voie MEK-C/EBP au cours de la neurogen&egrave;se corticale r&eacute;glement&eacute;s de facteur de croissance.

Eine wesentliche Rolle f&#xFC;r eine MEK-C/EBP-Weg w&#xE4;hrend Wachstumsfaktor-regulierten kortikale Neurogenese.

Neurogenesi nei mammiferi &egrave; determinata da un&#39;interazione tra meccanismi genetici intrinseci ed estrinseci spunti come fattori di crescita. Qui abbiamo definito una cascata di segnalazione, un percorso di MEK-C/EBP, che &egrave; essenziale per le cellule progenitrici corticale di diventare neuroni postmitotic. Inibizione di MEK o della famiglia di fattori di trascrizione C/EBP inibisce la neurogenesi durante l&#39;espressione di un mutante di C/EBPbeta che &egrave; che un mimic fosforilazione presso un sito MEK-Rsk migliora la neurogenesi. C/EBP media questo effetto positivo di diretta attivazione trascrizionale dei geni specifici del neurone come Talpha1 alfa-tubulina. Al contrario, l&#39;inibizione della trascrizione C/EBP-dipendente migliora la generazione CNTF-mediata degli astrociti dalle stesse cellule progenitrici. Cos&igrave;, attivazione di un percorso di MEK-C/EBP migliora la neurogenesi e inibisce la gliogenesis, fornendo in tal modo un meccanismo per cui fattori di crescita possono selettivamente bias progenitori di diventare neuroni durante lo sviluppo.

Un ruolo essenziale per un percorso di MEK-C/EBP durante la neurogenesi corticale regolato dal fattore di crescita.

&#x54FA;&#x4E73;&#x52D5;&#x7269;&#x306E;&#x795E;&#x7D4C;&#x65B0;&#x751F;&#x306F;&#x7D44;&#x307F;&#x8FBC;&#x307F;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x6A5F;&#x69CB;&#x3068;&#x6210;&#x9577;&#x56E0;&#x5B50;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x5916;&#x56E0;&#x6027;&#x30AD;&#x30E5;&#x30FC;&#x9593;&#x306E;&#x76F8;&#x4E92;&#x4F5C;&#x7528;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x4F1D;&#x9054;&#x30AB;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30C9;&#x3001;&#x76AE;&#x8CEA;&#x524D;&#x99C6;&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x5206;&#x88C2;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x306B;&#x306A;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x4E0D;&#x53EF;&#x6B20;&#x3067;&#x3059; MEK-C/EBP &#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6291;&#x5236;&#x3084; C/EBP &#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30EA;&#x30FC;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E; MEK &#x306E;&#x5F0F;&#x30EA;&#x30F3;&#x9178;&#x5316;&#x30DF;&#x30DF;&#x30C3;&#x30AF; MEK Rsk &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3067;&#x65B0;&#x751F;&#x5F37;&#x5316;&#x3067;&#x3059; C/ebp &#x5909;&#x7570;&#x4F53;&#x306E;&#x4E2D;&#x306E;&#x795E;&#x7D4C;&#x65B0;&#x751F;&#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;C/EBP &#x306F;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50; Talpha1 &#x30C1;&#x30E5;&#x30FC;&#x30D6;&#x30EA;&#x30F3;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x76F4;&#x63A5;&#x8EE2;&#x5199;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306B;&#x3088;&#x308B;&#x3053;&#x306E;&#x80AF;&#x5B9A;&#x7684;&#x306A;&#x52B9;&#x679C;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x9006;&#x306B;&#x3001;C/EBP &#x4F9D;&#x5B58;&#x578B;&#x8EE2;&#x5199;&#x306E;&#x963B;&#x5BB3;&#x4E16;&#x4EE3;&#x306E; CNTF &#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x305F;&#x540C;&#x3058;&#x524D;&#x99C6;&#x7D30;&#x80DE;&#x304B;&#x3089;&#x30A2;&#x30B9;&#x30C8;&#x30ED; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x306E;&#x5411;&#x4E0A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;MEK-C/EBP &#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306F;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x65B0;&#x751F;&#x3092;&#x9AD8;&#x3081;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066; whereby &#x6210;&#x9577;&#x56E0;&#x5B50;&#x306F;&#x9078;&#x629E;&#x7684;&#x306B;&#x524D;&#x99C6;&#x7D30;&#x80DE;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x4E2D;&#x306B;&#x958B;&#x767A;&#x306B;&#x306A;&#x308B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30A2;&#x30B9;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B; gliogenesis &#x3092;&#x963B;&#x5BB3;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x5FC5;&#x9808;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x3059;&#x308B; MEK-C/EBP &#x7D4C;&#x8DEF;&#x76AE;&#x8CEA;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x65B0;&#x751F;&#x5897;&#x6B96;&#x56E0;&#x5B50;&#x898F;&#x5236;&#x4E2D;&#x3002;

&#xD3EC;&#xC720;&#xB958; &#xC131;&#xCCB4; &#xB0B4;&#xC7A5; &#xC720;&#xC804; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xBC0F; &#xC131;&#xC7A5; &#xC778;&#xC790; &#xB4F1; &#xC678;&#xBD80; &#xC2E0;&#xD638; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xC0C1;&#xD638; &#xC791;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xACB0;&#xC815; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30; MEK-C/EBP &#xD1B5;&#xB85C;, &#xB300;&#xB1CC; &#xD53C; &#xC9C8;&#xC758; &#xC2DC; &#xC870; &#xC140; postmitotic &#xC2E0;&#xACBD; &#xB420; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xC2E0;&#xD638; &#xD3ED;&#xD3EC;&#xB97C; &#xC815;&#xC758; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC800;&#xD574; MEK &#xB610;&#xB294; &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790; C/EBP &#xC81C;&#xD488;&#xAD70;&#xC758; MEK-Rsk &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xC778; &#xC0B0;&#xD654; &#xBAA8;&#xBC29; &#xAC15;&#xD654; &#xC2E0;&#xC0DD;&#xC740; C/EBPbeta &#xB3CC;&#xC5F0;&#xBCC0;&#xC774;&#xC758; &#xD45C;&#xD604; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC2E0;&#xC0DD;&#xC744; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD55C;&#xB2E4;. C/EBP Talpha1 &#xC54C;&#xD30C; tubulin &#xB4F1; &#xC2E0;&#xACBD; &#xAD00;&#xB828; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC9C1;&#xC811; transcriptional &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD558; &#xC5EC;&#xC774; &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xD6A8;&#xACFC; mediates. &#xBC18;&#xB300;&#xB85C;, C/EBP &#xC885;&#xC18D; &#xC804;&#xC0AC;&#xC758; &#xC5B5;&#xC81C; &#xC774;&#xB2E4; &#xB3D9;&#xC77C;&#xD55C; &#xC870;&#xC0C1; &#xC138;&#xD3EC;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; CNTF &#xC911;&#xC7AC; &#xC0DD;&#xC131;&#xC744; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xC2DC;&#xD0B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, MEK-C/EBP &#xACBD;&#xB85C;&#xC758; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xC131;&#xCCB4;&#xB97C; &#xAC15;&#xD654; &#xD558; &#xACE0; &#xC5B5;&#xC81C; &#xD568;&#xC73C;&#xB85C;&#xC368; &#xC120;&#xD0DD;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; progenitors &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC2E0;&#xACBD; &#xC138;&#xD3EC;&#xB97C; &#xB418; &#xD3B8;&#xACAC;&#xC744; &#xBA74; &#xC131;&#xC7A5; &#xC778;&#xC790; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; gliogenesis.

&#xB300;&#xB1CC; &#xD53C; &#xC9C8;&#xC758; &#xC2E0;&#xACBD; &#xC2E0;&#xC0DD; &#xC131;&#xC7A5; &#xC778;&#xC790; &#xADDC;&#xC81C; &#xC911; MEK-C/EBP &#xD1B5;&#xB85C; &#xB300; &#xD55C; &#xD544;&#xC218;&#xC801;&#xC778; &#xC5ED;&#xD560;.

Neurog&eacute;nesis mam&iacute;fera est&aacute; determinada por una interacci&oacute;n entre los mecanismos gen&eacute;ticos intr&iacute;nsecos y extr&iacute;nsecos se&ntilde;ales como factores de crecimiento. Aqu&iacute; hemos definido una cascada de se&ntilde;alizaci&oacute;n, una v&iacute;a de MEK-C/EBP, que es esencial para que las c&eacute;lulas progenitoras cortical convertirse en neuronas postmitotic. Inhibici&oacute;n de MEK o de la familia C/EBP de factores de transcripci&oacute;n inhibe la neurog&eacute;nesis mientras la expresi&oacute;n de un mutante de C/EBPbeta que es que un imitador de fosforilaci&oacute;n en un sitio de MEK-Rsk realza la neurog&eacute;nesis. C/EBP media este efecto positivo por directa activaci&oacute;n transcripcional de genes enolase tales como Talpha1 alfa-tubulina. Por el contrario, la inhibici&oacute;n de la transcripci&oacute;n C/EBP-dependiente mejora CNTF mediada por la generaci&oacute;n de astrocitos de las mismas c&eacute;lulas progenitoras. As&iacute;, la activaci&oacute;n de una v&iacute;a de MEK-C/EBP mejora la neurog&eacute;nesis e inhibe la gliogenesis, proporcionando as&iacute; un mecanismo por el que los factores de crecimiento puede sesgar selectivamente progenitores a convertirse en neuronas durante el desarrollo.

Un papel esencial para un camino de MEK-C/EBP durante neurog&eacute;nesis cortical regulados por el factor de crecimiento.

&#x7CD6;&#x5C3F;&#x75C5;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x626B;&#x63CF;&#x53D1;&#x73B0;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E0E;&#x75BE;&#x75C5;&#x72B6;&#x6001;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x8BB8;&#x591A;&#x7684;&#x5730;&#x533A;&#x3002;&#x82E5;&#x8981;&#x6807;&#x8BC6;&#x4E3A; 2 &#x578B;&#x7CD6;&#x5C3F;&#x75C5;&#x5019;&#x9009;&#x57FA;&#x56E0;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5BA1;&#x67E5;&#x4E86;&#x8F6C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684; A-ZIP/F-1 &#x9F20;&#x6807;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x9F20;&#x6807;&#x6A21;&#x5F0F;&#x6709;&#x6CA1;&#x6709;&#x767D;&#x8272;&#x7684;&#x8102;&#x80AA;&#xFF0C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x5F02;&#x5E38;&#x7684;&#x8461;&#x8404;&#x7CD6;&#x3001; &#x80F0;&#x5C9B;&#x7D20;&#x3001; &#x7626;&#x7D20;&#x3001; &#x8102;&#x4EE3;&#x8C22;&#x5F02;&#x5E38;&#x4E0E;&#x80F0;&#x5C9B;&#x7D20;&#x62B5;&#x6297;&#x7684;&#x597D;&#x6A21;&#x578B;&#x5236;&#x4F5C; A-ZIP/F-1 &#x5C0F;&#x9F20;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7528;&#x57FA;&#x4E8E; cDNA &#x82AF;&#x7247;&#x6765;&#x67E5;&#x627E;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x8001;&#x9F20;&#x7684;&#x56DB;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x4E2D;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5BA1;&#x67E5;&#x4E86;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x7ED3;&#x679C;&#x5728;&#x8303;&#x56F4;&#x5185;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x8054;&#x7CFB;&#x626B;&#x63CF;&#x7684;&#x8102;&#x4EE3;&#x8C22;&#x5F02;&#x5E38;&#x3001; &#x80A5;&#x80D6;&#x3001; 2 &#x578B;&#x7CD6;&#x5C3F;&#x75C5;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8054;&#x5408; 199 &#x5DF2;&#x77E5;&#x4EBA;&#x7C7B; orthologs misregulated &#x7684;&#x9F20;&#x6807;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x56FE;&#x4E0A; 33 &#x516C;&#x5E03;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x626B;&#x63CF;&#x3002;&#x8868;&#x8FBE;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#x6210;&#x4E0E;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x8054;&#x7CFB;&#x7ED3;&#x679C;&#x5141;&#x8BB8;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x5E76;&#x786E;&#x5B9A;&#x5176;&#x4F18;&#x5148;&#x7EA7;&#x7684;&#x8102;&#x4EE3;&#x8C22;&#x5F02;&#x5E38;&#x53CA;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x75BE;&#x75C5;&#x7684;&#x5019;&#x9009;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x57FA;&#x56E0;&#x5305;&#x62EC; 3 S100A &#x57FA;&#x56E0;&#x7684; 1 &#x53F7;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4E0A;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x7FA4;&#x96C6;&#x548C; 20 &#x53F7;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4E0A;&#x7684; SLPI1&#x3002;

&#x641C;&#x7D22;&#x7684;&#x8102;&#x4EE3;&#x8C22;&#x5F02;&#x5E38;&#x3001; &#x80A5;&#x80D6;&#x548C;&#x7CD6;&#x5C3F;&#x75C5; A-ZIP/F-1 &#x5C0F;&#x9F20;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x5206;&#x6790;&#x901A;&#x8FC7;&#x5019;&#x9009;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;

Genome scans for diabetes have identified many regions of the human genome that correlate with the disease state. To identify candidate genes for type 2 diabetes, we examined the transgenic A-ZIP/F-1 mouse. This mouse model has no white fat, resulting in abnormal levels of glucose, insulin, and leptin, making the A-ZIP/F-1 mice a good model for lipodystrophy and insulin resistance. We used cDNA-based microarrays to find differentially expressed genes in four tissues of these mice. We examined these results in the context of human linkage scans for lipodystrophy, obesity, and type 2 diabetes. We combined 199 known human orthologs of the misregulated mouse genes with 33 published human genome scans on a genome map. Integrating expression data with human linkage results permitted us to suggest and prioritize candidate genes for lipodystrophy and related disorders. These genes include a cluster of 3 S100A genes on chromosome 1 and SLPI1 on chromosome 20.

A search for candidate genes for lipodystrophy, obesity and diabetes via gene expression analysis of A-ZIP/F-1 mice.

Analyses du g&eacute;nome du diab&egrave;te ont identifi&eacute; plusieurs r&eacute;gions du g&eacute;nome humain qui sont corr&eacute;l&eacute;s avec l&#39;&eacute;tat de la maladie. Pour identifier les g&egrave;nes candidats pour le diab&egrave;te de type 2, nous avons examin&eacute; la souris transg&eacute;nique de la A-ZIP/F-1. Ce mod&egrave;le de souris a sans gras blanc, entra&icirc;nant des taux anormaux de glucose, l&#39;insuline et la leptine, rendant les souris A-ZIP/F-1 un bon mod&egrave;le pour la lipodystrophie et insulino-r&eacute;sistance. Ax&eacute;e sur le cDNA microarrays nous permettant de trouver des g&egrave;nes diff&eacute;rentiellement exprim&eacute;s dans des quatre tissus de ces souris. Nous avons examin&eacute; ces r&eacute;sultats dans le cadre d&#39;analyses de g&eacute;n&eacute;tique humaine pour la lipodystrophie, ob&eacute;sit&eacute; et diab&egrave;te de type 2. Nous combinons 199 orthologues humains connus des g&egrave;nes de r&eacute;gulation de la souris avec 33 analyses publi&eacute;es du g&eacute;nome humain sur une carte du g&eacute;nome. Int&eacute;gration de donn&eacute;es de l&#39;expression avec les r&eacute;sultats de la g&eacute;n&eacute;tique humaine ont permis &agrave; proposer et &agrave; prioriser les g&egrave;nes candidats pour la lipodystrophie et les troubles connexes. Ces g&egrave;nes sont un groupe de 3 S100A g&egrave;nes sur le chromosome 1 et SLPI1 sur le chromosome 20.

Une recherche de g&egrave;nes candidats pour la lipodystrophie, l&#39;ob&eacute;sit&eacute; et le diab&egrave;te par analyse d&#39;expression de g&egrave;ne de souris A-ZIP/F-1.

Eine Suche nach Kandidatengenen f&#xFC;r Lipodystrophie, Adipositas und Diabetes &#xFC;ber Genexpressionsanalyse A-ZIP/F-1 M&#xE4;usen.

Analisi del genoma per diabete hanno identificato molte regioni del genoma umano che correlano con lo stato di malattia. Per identificare geni candidati per il diabete di tipo 2, abbiamo esaminato il mouse transgenico A-ZIP/F-1. Questo modello di mouse non ha nessun grasso bianco, con conseguente livelli anomali di glucosio, insulina e leptina, rendendo i topi A-ZIP/F-1 un buon modello per lipodistrofia e insulino-resistenza. Abbiamo usato i microarrays del cDNA di trovare geni differenzialmente espressi in quattro tessuti di questi topi. Abbiamo esaminato questi risultati nel contesto del collegamento umano scansioni per lipodistrofia, obesit&agrave; e diabete di tipo 2. Abbiamo combinato 199 orthologs umano conosciuto dei geni misregulated mouse con 33 scansioni di genoma umano pubblicato sulla mappa del genoma. Integrazione di dati di espressione con risultati di collegamento umano ci permesso di suggerire e definire le priorit&agrave; di geni candidati per lipodistrofia e disturbi correlati. Questi geni includono un cluster di 3 geni S100A sul cromosoma 1 e SLPI1 sul cromosoma 20.

Una ricerca di geni candidati per lipodistrofia, l&#39;obesit&agrave; e il diabete attraverso l&#39;analisi di espressione genica di topi A-ZIP/F-1.

&#x7CD6;&#x5C3F;&#x75C5;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x30B9;&#x30AD;&#x30E3;&#x30F3;&#x306F;&#x75C5;&#x6C17;&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x3068;&#x306E;&#x76F8;&#x95A2;&#x306F;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x5730;&#x57DF;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;2 &#x578B;&#x7CD6;&#x5C3F;&#x75C5;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5019;&#x88DC;&#x8005;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x306B;&#x306F;&#x3001;A ZIP/F 1 &#x306E;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30B8;&#x30A7;&#x30CB;&#x30C3;&#x30AF; &#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9; &#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306B;&#x306F;&#x3001;&#x30B0;&#x30EB;&#x30B3;&#x30FC;&#x30B9;&#x3001;&#x30A4;&#x30F3;&#x30B9;&#x30EA;&#x30F3;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073; A ZIP/F 1 &#x30DE;&#x30A6;&#x30B9; &#x30EA;&#x30DD;&#x30B8;&#x30B9; &#x30C8;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x3068;&#x30A4;&#x30F3;&#x30B9;&#x30EA;&#x30F3;&#x62B5;&#x6297;&#x6027;&#x306E;&#x3088;&#x3044;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x3068;&#x306A;&#x3063;&#x3066;&#x3001;&#x30EC;&#x30D7;&#x30C1;&#x30F3;&#x306E;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x7570;&#x5E38;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3001;&#x767D;&#x3044;&#x8102;&#x80AA;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;CDNA &#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED; &#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3092;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x306E; 4 &#x3064;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x306B;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x306B;&#x767A;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x3002;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B8; &#x30B9;&#x30AD;&#x30E3;&#x30F3; &#x30EA;&#x30DD;&#x30B8;&#x30B9; &#x30C8;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x3001;&#x80A5;&#x6E80;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7; 2 &#x306E;&#x7CD6;&#x5C3F;&#x75C5;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30AD;&#x30B9;&#x30C8;&#x3067;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x691C;&#x8A0E;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;33 &#x306E;&#x516C;&#x958B;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; &#x30B9;&#x30AD;&#x30E3;&#x30F3; &#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5730;&#x56F3;&#x4E0A;&#x3067; 199 &#x306E;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x4EBA;&#x9593;&#x30AA;&#x30EB;&#x30BD;&#x30ED;&#x30B0; misregulated &#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3002;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B8;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3092;&#x5F0F;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;&#x3068;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x3092;&#x304A;&#x52E7;&#x3081;&#x3057;&#x3001;&#x5019;&#x88DC;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30EA;&#x30DD;&#x30B8;&#x30B9; &#x30C8;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x3068;&#x95A2;&#x9023;&#x75BE;&#x60A3;&#x306E;&#x512A;&#x5148;&#x9806;&#x4F4D;&#x3092;&#x8A31;&#x53EF;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E; 3 S100A &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 1 &#x3068; SLPI1 &#x67D3;&#x8272;&#x4F53; 20 &#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30EA;&#x30DD;&#x30B8;&#x30B9; &#x30C8;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30FC;&#x3001;&#x80A5;&#x6E80;&#x3068;&#x7CD6;&#x5C3F;&#x75C5;&#x3092;&#x4ECB;&#x3057;&#x3066; A ZIP/F 1 &#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5019;&#x88DC;&#x8005;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x691C;&#x7D22;&#x3002;

&#xB2F9;&#xB1E8;&#xBCD1;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xAC8C;&#xB188; &#xAC80;&#xC0AC; &#xC9C8;&#xBCD1; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xC640; &#xC5F0;&#xACB0; &#xD558;&#xB294; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xB9CE;&#xC740; &#xC601;&#xC5ED;&#xC744; &#xD655;&#xC778; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC81C; 2 &#xD615; &#xB2F9;&#xB1E8;&#xBCD1;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD6C4;&#xBCF4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xB824;&#xBA74; A-&#xC6B0;&#xD3B8;/F-1&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBCC0;&#xD615; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xAC80;&#xC0AC; &#xD558; &#xACE0;. &#xC774; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xBAA8;&#xB378;&#xC5D0; &#xC544;&#xBB34; &#xBC31;&#xC0C9; &#xC9C0;&#xBC29;, &#xD3EC;&#xB3C4; &#xB2F9;, &#xC778;&#xC290;&#xB9B0;, leptin, A-&#xC6B0;&#xD3B8;/F-1 &#xC950; lipodystrophy &#xBC0F; &#xC778;&#xC290;&#xB9B0; &#xC800;&#xD56D;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC88B;&#xC740; &#xBAA8;&#xB378;&#xC744; &#xB9CC;&#xB4E4;&#xAE30;&#xC758; &#xBE44;&#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC950;&#xC758; 4 &#xAC1C;&#xC758; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0; &#xCC28;&#xB3D9; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xCC3E;&#xC744; microarrays Cdna&#xB97C; &#xAE30;&#xBC18;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; lipodystrophy, &#xBE44;&#xB9CC; &#xBC0F; &#xC81C; 2 &#xD615; &#xB2F9;&#xB1E8;&#xBCD1;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC5F0;&#xACB0; &#xAC80;&#xC0AC;&#xC758; &#xB9E5;&#xB77D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xACB0;&#xACFC;&#xB97C; &#xC870;&#xC0AC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC; &#xAC8C;&#xB188; &#xC9C0;&#xB3C4; 33 &#xAC8C;&#xC2DC; &#xB41C; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2A4;&#xCE94; 199 &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xC778;&#xAC04; orthologs misregulated &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xACB0;&#xD569;. &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xACB0;&#xD569; &#xACB0;&#xACFC; &#xC2DD;&#xC758; &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD569; &#xD558; &#xC81C;&#xC548; &#xACE0; lipodystrophy &#xBC0F; &#xAD00;&#xB828;&#xB41C; &#xC9C8;&#xD658;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD6C4;&#xBCF4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC6B0;&#xC120; &#xC21C;&#xC704;&#xB97C; &#xD5C8;&#xC6A9;. &#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 1 3 S100A &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; &#xB4F1; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; 20&#xC5D0; SLPI1.

Lipodystrophy, &#xBE44;&#xB9CC; &#xBC0F; A-&#xC6B0;&#xD3B8;/F-1 &#xC950;&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD45C;&#xC815; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xD1B5;&#xD574; &#xB2F9;&#xB1E8;&#xBCD1;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD6C4;&#xBCF4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAC80;&#xC0C9;.

An&aacute;lisis del genoma para la diabetes han identificado muchas regiones del genoma humano que se correlacionan con el estado de la enfermedad. Para identificar los genes candidatos para la diabetes tipo 2, examinamos el rat&oacute;n transg&eacute;nico de A-ZIP/F-1. Este modelo de rat&oacute;n no tiene grasa blanca, dando por resultado niveles anormales de glucosa, insulina y leptina, haciendo los ratones A-ZIP/F-1 un buen modelo para la lipodistrofia e insulina resistencia. Utilizamos microarrays de cDNA para encontrar genes expresados diferencialmente en cuatro tejidos de estos ratones. Examinamos estos resultados en el contexto de vinculaci&oacute;n humana exploraciones para la lipodistrofia, obesidad y diabetes tipo 2. Combinamos 199 ort&oacute;logos humanas conocidas de los genes de rat&oacute;n misregulated con 33 an&aacute;lisis del genoma humano publicado un mapa del genoma. Integraci&oacute;n de datos de expresi&oacute;n con resultados de acoplamiento humano permitido sugerir y priorizar los genes candidatos para lipodistrofia y trastornos relacionados. Estos genes son un grupo de 3 S100A genes en el cromosoma 1 y SLPI1 en el cromosoma 20.

Una b&uacute;squeda de genes candidatos para lipodistrofia, la obesidad y la diabetes mediante an&aacute;lisis de expresi&oacute;n g&eacute;nica de ratones A-ZIP/F-1.

&#x6211;&#x4EEC;&#x5DF2;&#x786E;&#x5B9A; 8 65,536 DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x5206;&#x5E03;&#x5728;&#x4E00;&#x5957; 13,010 &#x5BF9;&#x9F50;&#x6307;&#x8BA4;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8D77;&#x59CB;&#x7AD9;&#x70B9; &#xFF08;TSS&#xFF09; &#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x57FA;&#x5730;&#x957F; &#xFF08;8-mer)&#x3002;&#x4E3A;&#x6570;&#x6709;&#x9650;&#x7684; 8 &#x5E02;&#x573A;&#x6C47;&#x7387; &#xFF08;&#x7FA4;&#x96C6;&#xFF09;&#xFF0C;&#x5176;&#x5206;&#x5E03;&#x6709;&#x9AD8;&#x5CF0;&#x548C;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x7FA4;&#x96C6;&#x5185; 100 bp TSS&#x3002;&#x53C2;&#x5C55;&#x805A;&#x9644;&#x8FD1; TSS &#x6700;&#x5927;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x5B66;&#x7684; 156 DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x53EF;&#x4EE5;&#x653E;&#x5165;&#x4E5D;&#x4E2A;&#x76F8;&#x5173;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x7FA4;&#x4F53;&#x4E2D;&#x3002;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x7EC4;&#x5B9A;&#x4E49;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5171;&#x8BC6;&#x5E8F;&#x5217;&#x548C;&#x5E8F;&#x5217;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7ED1;&#x5B9A;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5171;&#x8BC6;&#x7684;&#x4E03;&#x4E2A;&#x7F51;&#x7AD9;&#x8F6C;&#x5F55;&#x56E0;&#x5B50; SP1 &#xFF08;TFs&#xFF09;&#xFF0C;NF-Y&#x3001; ETS&#x3001; CREB&#x3001; TBP&#x3001; &#x6218;&#x6CD5;&#x548C;&#x6551;&#x56FD;&#x9635;&#x7EBF;-1&#x3002;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5E8F;&#x5217;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x547D;&#x540D;&#x4E3A; Clus1&#xFF0C;&#x4E0D;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x5DF2;&#x77E5;&#x7684; TF &#x7ED1;&#x5B9A;&#x7AD9;&#x70B9;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E5D;&#x5C4A;&#x5E8F;&#x5217;&#x7EC4;&#x7531;&#x7EC4;&#x6210;&#x7684;&#x94A2;&#x7EDE;&#x7EBF;&#x7279;&#x5B9A;&#x624E;&#x514B;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x4E0B;&#x6E38;&#x4EA7;&#x4E1A;&#x96C6;&#x7FA4;&#x7684;&#x6280;&#x672F;&#x652F;&#x52A9;&#x670D;&#x52A1;&#x3002;&#x540C;&#x73B0;&#x8FD9;&#x4E9B; TF &#x5171;&#x8BC6;&#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x8003;&#x8BD5;&#x5BF9;&#x4E8E;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x4EBA;&#x9664;&#x4E86; TBP &#xFF08;TATA &#x6846;&#xFF09; &#x53D7;&#x7EA6;&#x675F;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6307;&#x793A;&#x5B58;&#x5728;&#x6B63;&#x76F8;&#x5173;&#x5173;&#x7CFB;&#x3002;29 &#x7EC4;&#x7EC7;&#x4EBA;&#x7C7B; mRNA &#x8868;&#x8FBE;&#x6570;&#x636E;&#x8868;&#x660E;&#x7535;&#x5B50;&#x6295;&#x6807;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x3001; &#x6551;&#x56FD;&#x9635;&#x7EBF;-1 &#x548C; Clus1 &#x5E8F;&#x5217;&#x8BE5;&#x7FA4;&#x96C6;&#x4E3B;&#x8981;&#x53D1;&#x73B0;&#x7BA1;&#x5BB6;&#x57FA;&#x56E0; &#xFF08;&#x5982;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53;&#x57FA;&#x56E0;) &#x7684;&#x521B;&#x529E;&#x4EBA;&#x3002;&#x4E0E;&#x6B64;&#x76F8;&#x53CD;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x5854;&#x5854;&#x662F;&#x66F4;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x542F;&#x52A8;&#x5B50;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x5206;&#x6790;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x516B;&#x4E2A; DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x4E2D;&#x6211;&#x4EEC;&#x5EFA;&#x8BAE;&#x662F;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684; 5082 &#x5BA3;&#x4F20;&#x5458;&#x3002;

&#x5728;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x53D1;&#x8D77;&#x4EBA;&#x7684; DNA &#x5E8F;&#x5217;&#x7684;&#x805A;&#x7C7B;&#x3002;

We have determined the distribution of each of the 65,536 DNA sequences that are eight bases long (8-mer) in a set of 13,010 human genomic promoter sequences aligned relative to the putative transcription start site (TSS). A limited number of 8-mers have peaks in their distribution (cluster), and most cluster within 100 bp of the TSS. The 156 DNA sequences exhibiting the greatest statistically significant clustering near the TSS can be placed into nine groups of related sequences. Each group is defined by a consensus sequence, and seven of these consensus sequences are known binding sites for the transcription factors (TFs) SP1, NF-Y, ETS, CREB, TBP, USF, and NRF-1. One sequence, which we named Clus1, is not a known TF binding site. The ninth sequence group is composed of the strand-specific Kozak sequence that clusters downstream of the TSS. An examination of the co-occurrence of these TF consensus sequences indicates a positive correlation for most of them except for sequences bound by TBP (the TATA box). Human mRNA expression data from 29 tissues indicate that the ETS, NRF-1, and Clus1 sequences that cluster are predominantly found in the promoters of housekeeping genes (e.g., ribosomal genes). In contrast, TATA is more abundant in the promoters of tissue-specific genes. This analysis identified eight DNA sequences in 5082 promoters that we suggest are important for regulating gene expression.

Clustering of DNA sequences in human promoters.

Nous avons d&eacute;termin&eacute; la distribution de chacune des s&eacute;quences ADN 65 536 qui sont huit bases de long (8-mer) dans un ensemble de s&eacute;quences de promoteur g&eacute;nomique humain 13 010 align&eacute; par rapport au site d&#39;initiation de la transcription putatifs (TSS). Un nombre limit&eacute; de 8-mers ont des sommets dans leur distribution (cluster), et la plupart de cluster au sein de 100 bp du TSS. Les s&eacute;quences d&#39;ADN 156 pr&eacute;sentant le plus grand regroupement statistiquement significative pr&egrave;s le TSS peuvent &ecirc;tre plac&eacute;s en neuf groupes de s&eacute;quences apparent&eacute;es. Chaque groupe est d&eacute;fini par une s&eacute;quence consensus et sept ces consensus s&eacute;quences sont connues de liaison de sites pour les facteurs de transcription SP1 (TFs), NF-Y, ETS, CREB, TBP, USF et NRF-1. Une seule s&eacute;quence, que nous avons nomm&eacute;e Clus1, n&#39;est pas un site de liaison de TF connu. Le neuvi&egrave;me groupe de s&eacute;quence se compose de la s&eacute;quence de Kozak sp&eacute;cifique que les grappes en aval du TSS. L&#39;examen de la pr&eacute;sence simultan&eacute;e de ces s&eacute;quences de consensus TF indique une corr&eacute;lation positive pour la plupart d&#39;entre eux &agrave; l&#39;exception des s&eacute;quences li&eacute;es par TBP (la bo&icirc;te TATA). Humaines donn&eacute;es d&#39;expression de l&#39;ARNm de 29 tissus indiquent que l&#39;ETS, NRF-1 et des s&eacute;quences de Clus1 ce cluster se trouvent principalement dans les promoteurs de g&egrave;nes domestiques (par exemple, les g&egrave;nes ribosomiques). En revanche, TATA est plus abondante dans les promoteurs de g&egrave;nes sp&eacute;cifiques aux tissus. Cette analyse a identifi&eacute; huit s&eacute;quences de l&#39;ADN en 5082 porteurs de projet que nous proposons sont importants pour la r&eacute;gulation de l&#39;expression des g&egrave;nes.

Regroupement des s&eacute;quences d&#39;ADN dans les promoteurs de l&#39;humains.

Clustering von DNA-Sequenzen im menschlichen Promotoren.

Abbiamo determinato la distribuzione di ciascuna delle sequenze del DNA 65.536 che sono otto le basi lunghe (8-mer) in un insieme di sequenze di promotore genomic umano 13.010 allineato rispetto al sito di inizio trascrizione putativo (TSS). Un numero limitato di 8-mers hanno picchi nella loro distribuzione (cluster), e la maggior parte del cluster all&#39;interno di 100 bp del TSS. Le sequenze di DNA 156 esibendo il pi&ugrave; grande raggruppamento statisticamente significativo vicino il TSS possono essere posizionate in nove gruppi di sequenze correlate. Ogni gruppo &egrave; definito da una sequenza di consenso, e sette di queste sequenze sono noti vincolante di consenso siti per i fattori di trascrizione SP1 (TFs), NF-Y, ETS, CREB, TBP, USF e NRF-1. Una sequenza, che abbiamo chiamato Clus1, non &egrave; un noto sito di legame di TF. Il nono gruppo sequenza &egrave; composta dalla sequenza di Kozak strand-specifici che a valle dei cluster del TSS. Un esame della concomitanza di queste sequenze consenso TF indica una correlazione positiva per la maggior parte di loro ad eccezione di sequenze vincolati da TBP (TATA box). Dati di espressione mRNA umani da 29 tessuti indicano che l&#39;ETS, NRF-1 e Clus1 sequenze cluster si trovano principalmente nei promotori dei geni housekeeping (ad esempio, geni ribosomiali). Al contrario, TATA &egrave; pi&ugrave; abbondante nei promotori dei geni tessuto-specifici. Questa analisi identificato otto sequenze di DNA in 5082 promotori che consigliamo sono importanti per la regolazione della espressione genica.

Clustering delle sequenze di DNA in umani promotori.

&#x6211;&#x3005; &#x306F; 8 65,536 &#x306E; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x306E;&#x914D;&#x5E03;&#x30ED;&#x30F3;&#x30B0; &#xFF08;8-mer) &#x63A8;&#x5B9A;&#x8EE2;&#x5199;&#x958B;&#x59CB;&#x90E8;&#x4F4D; &#xFF08;TSS&#xFF09; &#x3092;&#x57FA;&#x6E96;&#x3092;&#x63C3;&#x3048; 13,010 &#x306E;&#x4EBA;&#x9593;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0; &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x306B;&#x57FA;&#x5730;&#x3092;&#x5224;&#x65AD;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;8 Mers &#x306E;&#x9650;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x6570;&#x30D4;&#x30FC;&#x30AF;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5206;&#x5E03; &#xFF08;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#xFF09;&#x3001;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x5185; 100 bp TSS &#x306E;&#x3002;TSS &#x306B;&#x8FD1;&#x3044;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF; &#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x6700;&#x5927;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x306A;&#x51FA;&#x5C55; 156 &#x306E; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E; 9 &#x3064;&#x306E;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306B;&#x914D;&#x7F6E;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5404;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7; &#x30B3;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B5;&#x30B9;&#x30B7;&#x30FC;&#x30AF;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B9;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x304C;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30B3;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B5;&#x30B9;&#x306E;&#x4E03; (TFs) &#x306E; SP1 &#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5199;&#x56E0;&#x5B50;&#x306E;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8; NF Y&#x3001;ETS&#x3001;CREB, TBP&#x3001;USF &#x3068; NRF 1&#x3002;Clus1 &#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x540D;&#x524D;&#x306E; 1 &#x3064;&#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x304C;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E; TF &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0; &#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3067;&#x306F;&#x306A;&#x3044;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x7B2C; 9 &#x306E;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9; &#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x304C;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x4E0B;&#x6D41;&#x30B9;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9;&#x56FA;&#x6709;&#x30B3;&#x30B6;&#x30C3;&#x30AF; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x3067;&#x69CB;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3001;TSS &#x306E;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089; TF &#x30B3;&#x30F3;&#x30BB;&#x30F3;&#x30B5;&#x30B9;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x5171;&#x8D77;&#x306E;&#x691C;&#x8A0E; TBP (TATA &#x30DC;&#x30C3;&#x30AF;&#x30B9;) &#x30D0;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C9; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x3092;&#x9664;&#x3044;&#x3066;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x6B63;&#x306E;&#x76F8;&#x95A2;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4EBA;&#x9593; mRNA &#x767A;&#x73FE;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF; 29 &#x7D44;&#x7E54;&#x304B;&#x3089; ETS&#x3001;NRF 1 &#x3068; Clus1 &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x305D;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x3067;&#x3059;&#x4E3B;&#x306B;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x30CF;&#x30A6;&#x30B9;&#x30AD;&#x30FC;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50; &#xFF08;&#x4F8B;&#x3048;&#x3070;&#x3001;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#xFF09; &#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x5BFE;&#x7167;&#x7684;&#x306B;&#x3001;&#x30BF;&#x30BF;&#x306F;&#x7D44;&#x7E54;&#x7279;&#x7570;&#x7684;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3067;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;8 &#x3064;&#x306E; DNA &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x6211;&#x3005; &#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8ABF;&#x6574;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x793A;&#x5506; 5082 &#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x8B58;&#x5225;&#x3002;

&#x4EBA;&#x9593;&#x30D7;&#x30ED;&#x30E2;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E; DNA &#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF; &#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3002;

&#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xAC01; 8 65536 DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xBC30;&#xD3EC; 13,010 &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; putative &#xC804;&#xC0AC; &#xC2DC;&#xC791; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; (TSS)&#xC744; &#xAE30;&#xC900;&#xC73C;&#xB85C; &#xC815;&#xB82C; &#xB41C; &#xC9D1;&#xD569;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB871; (8 &#xBA54; &#xB974;) &#xAE30;&#xC9C0; &#xACB0;&#xC815;. 8 &#xBA54; &#xB974;&#xC758; &#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; &#xC218;&#xC758; &#xBD84;&#xD3EC; (&#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;)&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD09;&#xC6B0;&#xB9AC; &#xC788;&#xACE0; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84; 100 &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; TSS&#xC758; &#xD608;&#xC555;. TSS &#xADFC;&#xCC98; &#xAC00;&#xC7A5; &#xD070; &#xD1B5;&#xACC4;&#xC801; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xB9C1; &#xC804;&#xC2DC; 156 DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xAD00;&#xB828;&#xB41C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; 9 &#xAC1C;&#xC758; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC73C;&#xB85C; &#xBC30;&#xCE58;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xAC01; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC774; &#xC77C;&#xCE58; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC815;&#xC758; &#xB41C; &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD569;&#xC758;&#xC758; 7 &#xC804;&#xC0AC; &#xC778;&#xC790;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; (TFs) SP1 &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xBC0F; NF Y, ETS, CREB, TBP&#xC640; USF, NRF-1. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; Clus1 &#xB77C;&#xB294;, &#xD558;&#xB098;&#xC758; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; TF &#xBC14;&#xC778;&#xB529; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xC544;&#xB2C8;&#xB2E4;. 9 &#xBC88;&#xC9F8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC740; &#xD558;&#xB958; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; &#xAC00;&#xB2E5; &#xD2B9;&#xC815; Kozak &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC774;&#xB8E8;&#xC5B4;&#xC838; TSS&#xC758;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; TF &#xC77C;&#xCE58; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; &#x8D77;&#xC758; &#xC2DC;&#xD5D8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; TBP (&#xD0C0; &#xD0C0; &#xBC15;&#xC2A4;)&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xAD6C;&#xC18D;&#xC744; &#xC81C;&#xC678; &#xD558; &#xACE0; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xAE0D;&#xC815;&#xC801;&#xC778; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. 29 &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC778;&#xAC04; mRNA &#xC2DD; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xAE30; ETS, NRF 1 &#xBC0F; Clus1 &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xB294; &#xC8FC;&#xB85C; &#xD558;&#xC6B0;&#xC2A4;&#xD0A4;&#xD551; &#xC720;&#xC804;&#xC790; (&#xC608;&#xB97C; &#xB4E4;&#xC5B4;, ribosomal &#xC720;&#xC804;&#xC790;)&#xC758; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC5D0;. &#xBC18;&#xBA74;, &#xD0C0; &#xD0C0; &#xC870;&#xC9C1;&#xC758; &#xD2B9;&#xC815; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778;&#xC5D0; &#xB354; &#xD48D;&#xBD80; &#xD558;&#xB2E4;. &#xC774; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xC870;&#xC808; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xC88B;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; 5082 &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; 8 &#xAC1C;&#xC758; DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xC2DD;&#xBCC4;.

&#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xBC1C;&#xAE30;&#xC778; DNA &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xB9C1;.

Hemos determinado la distribuci&oacute;n de cada una de las secuencias de ADN 65.536 que son ocho bases larga (8-mer) en un conjunto de secuencias de promotor gen&oacute;mica humana 13.010 alineados en relaci&oacute;n con el sitio de inicio de transcripci&oacute;n putativo (TSS). Un n&uacute;mero limitado de 8-mers tiene picos en su distribuci&oacute;n (racimo), y la mayor&iacute;a se agrupan dentro de 100 bp del TSS. Las 156 secuencias de ADN que exhibe la mayor agrupaci&oacute;n estad&iacute;sticamente significativa cerca el TSS pueden colocarse en nueve grupos de secuencias relacionadas. Cada grupo est&aacute; definido por una secuencia de consenso, y siete de estas secuencias se conocen vinculante de consenso sitios para los factores de transcripci&oacute;n SP1 (TFs), NF-Y, ETS, CREB, TBP, USF y NRF-1. Una secuencia, que nombrado Clus1, no es un conocido sitio de uni&oacute;n de TF. El noveno grupo de secuencia se compone de la secuencia de Kozak filamento espec&iacute;ficos que grupos de aguas abajo del TSS. Un examen de la co-ocurrencia de estas secuencias de consenso TF indica una correlaci&oacute;n positiva para la mayor&iacute;a de ellos excepto secuencias acatar TBP (la caja TATA). Datos de expresi&oacute;n de mRNA humanos de 29 tejidos indican que la ETS, NRF-1 y secuencias Clus1 eso racimo se encuentran predominante en los promotores de genes de limpieza (por ejemplo, genes ribos&oacute;micos). Por el contrario, TATA es m&aacute;s abundante en los promotores de genes espec&iacute;ficos de tejido. Este an&aacute;lisis identific&oacute; ocho secuencias de ADN en 5082 promotores que proponemos son importantes para la regulaci&oacute;n de la expresi&oacute;n g&eacute;nica.

Alain A. Mir

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