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Substrate Generation for Endonucleases of CRISPR/Cas Systems

The  interaction of viruses and their prokaryotic hosts shaped the evolution of  bacterial and archaeal life. Prokaryotes developed several strategies to ...

Max-Planck-Institute for terrestrial Microbiology

&#xC591;&#xBC30;&#xCD94; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xD30C;&#xB9AC;&#xC758; &#xC560;&#xBC8C;&#xB808; &#xAC00;&#xC871; &#xC2ED;&#xC790;&#xD654;&#xACFC;&#xC758; &#xC7AC;&#xBC30; &#xC791;&#xBB3C;&#xC5D0; &#xC2EC;&#xAC01;&#xD55C; &#xD53C;&#xD574;&#xB97C; &#xC720;&#xBC1C;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xC5EC;&#xAE30; &#xC911;&#xC559; &#xC2E0; &#xACBD;&#xACC4;&#xC640; neurohemal &#xC7A5;&#xAE30; neuropeptides &#xC591;&#xBC30;&#xCD94; &#xAD6C; &#xB354; &#xAE30;&#xC758; enteroendocrine midgut &#xC140;&#xC5D0;&#xC11C; &#xADDC;&#xC81C; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;&#xC758; &#xC0DD; &#xD654; &#xD559;&#xC801; &#xD2B9;&#xC131;&#xC744; &#xBCF4;&#xACE0;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. LC-MALDI-TOF/TOF &#xD568;&#xC73C;&#xB85C;&#xC368; &#xD654;&#xD559; 4 sulfophenyl isothiocyanate&#xC640; &#xB77C;&#xBCA8;, 38 &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xC218; &#xC2DD;&#xBCC4;, &#xC8FC;&#xC694; &#xACE4;&#xCDA9; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xAC00;&#xC871; &#xB300;&#xD45C;: allatostatin A allatostatin C, Fmrfamide&#xC640; &#xAC19;&#xC740; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;, kinin, &#xCE74;&#xD30C; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;, pyrokinins, sNPF, myosuppressin, corazonin, SIFamide, sulfakinins, tachykinins, NPLP1-&#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC;, adipokinetic &#xD638;&#xB974;&#xBAAC; &#xBC0F; CCHamide 1. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xC5EC;&#xB7EC; Drosophila &#xC885;&#xC5D0;&#xC11C; amidated &#xC77C;&#xC218;&#xB85C; &#xD638;&#xB974;&#xBAAC; &#xAD00;&#xB828; &#xD3A9;&#xD0C0;&#xC774;&#xB4DC;&#xB294; &#xD558; &#xCCB4; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0A9;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xD3A9;&#xD0C0;&#xC774;&#xB4DC; (Yamide)&#xB97C; &#xBCF4;&#xACE0; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. Drosophila &#xC2E0;&#xACBD; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; immunoreactive &#xBC0F; enteroendocrine &#xC140;&#xC758; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xD074;&#xB798;&#xC2A4;&#xC758; &#xBD84;&#xD3EC;&#xC758; Immunocytochemical &#xD2B9;&#xC131; &#xB9E4;&#xC6B0; &#xC720;&#xC0AC; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xB3D9;&#xC77C; &#xD558;&#xC9C0;&#xB294; &#xC54A;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xBA54;&#xC77C; &#xD45C;&#xC2DC; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD3A9; &#xD2F0; &#xB4DC; &#xD138; &#xAC08;&#xC774; &#xB610;&#xB294; &#xBA39;&#xC774; &#xB4F1; &#xB9CE;&#xC740; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xC0DD;&#xB9AC; &#xBC0F; &#xD589;&#xB3D9; &#xACFC;&#xC815;&#xC744; &#xC870;&#xC808;, &#xC774;&#xD6C4; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC57D;&#xB9AC; &#xC2DC;&#xD5D8; &#xBC0F; &#xC591;&#xBC30;&#xCD94; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xD30C;&#xB9AC;&#xC758; &#xC720; &#xCDA9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xD2B9;&#xC815; &#xD3A9;&#xD0C0;&#xC774;&#xB4DC; &#xAE30;&#xBC18; &#xBCF4;&#xD638; &#xBC29;&#xBC95;&#xC758; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC744; &#xC2DC;&#xC791;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xB18D;&#xC5C5; &#xD53C;&#xD574; &#xC560;&#xBC8C;&#xB808;&#xC758; &#xB2E8;&#xACC4;&#xC758; &#xC591;&#xBC30;&#xCD94; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xBE44;&#xD589; &#xB378;&#xB9AC; &#xC544; radicum Peptidomics (Diptera: Anthomyiidae).

&#x767D;&#x83DC;&#x6839;&#x8747;&#x7684;&#x5E7C;&#x866B;&#x8BF1;&#x4F7F;&#x679C;&#x5BB6;&#x5EAD;&#x79CD;&#x690D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7269;&#x4E25;&#x91CD;&#x635F;&#x574F;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#x62A5;&#x544A;&#x7684;&#x4E2D;&#x67A2;&#x795E;&#x7ECF;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x548C; neurohemal &#x673A;&#x5173;&#x4ECE;&#x795E;&#x7ECF;&#x80BD;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x4ECE;&#x7BA1;&#x7684;&#x5185;&#x5206;&#x6CCC;&#x4E2D;&#x80A0;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x767D;&#x83DC;&#x86C6;&#x8C03;&#x8282;&#x80BD;&#x751F;&#x5316;&#x7279;&#x6027;&#x3002;LC-&#x9A6C;&#x5C14;&#x8FEA;-TOF/TOF &#x548C;&#x5316;&#x5B66;&#x54C1;&#x6807;&#x7B7E;&#x4E0E; 4 &#x78FA;&#x5F02;&#x786B;&#x6C30;&#x9178;&#x916F;&#xFF0C;&#x7531; 38 &#x80BD;&#x53EF;&#x4EE5;&#x786E;&#x5B9A;&#xFF0C;&#x4EE3;&#x8868;&#x4E3B;&#x8981;&#x6606;&#x866B;&#x80BD;&#x5BB6;&#x5EAD;&#xFF1A; allatostatin A&#x3001; allatostatin C&#x3001; FMRFamide &#x6837;&#x80BD;&#x3001; &#x6FC0;&#x80BD;&#x3001; CAPA &#x80BD;&#x3001; pyrokinins&#x3001; &#x2476;&#x3001; myosuppressin&#x3001; corazonin&#x3001; SIFamide&#x3001; sulfakinins&#x3001; tachykinins&#x3001; NPLP1 &#x591A;&#x80BD;&#x3001; adipokinetic &#x6FC0;&#x7D20;&#x548C; CCHamide 1&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x8FD8;&#x62A5;&#x544A;&#x770B;&#x6765;&#x662F;&#x540C;&#x6E90;&#x5230;&#x51E0;&#x79CD;&#x679C;&#x8747;&#x7269;&#x79CD;&#x9170;&#x80FA;&#x7FBD;&#x5316;&#x6FC0;&#x7D20;&#x76F8;&#x5173;&#x80BD;&#x65B0;&#x80BD; (Yamide)&#x3002;&#x5206;&#x5E03;&#x7684;&#x51E0;&#x4E2A;&#x7C7B;&#x80BD;&#x80FD;&#x795E;&#x7ECF;&#x5143;&#x548C;&#x7BA1;&#x7684;&#x5185;&#x5206;&#x6CCC;&#x7EC6;&#x80DE;&#x7684;&#x514D;&#x75AB;&#x7EC6;&#x80DE;&#x5316;&#x5B66;&#x7279;&#x6027;&#x663E;&#x793A;&#x975E;&#x5E38;&#x76F8;&#x4F3C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x5B8C;&#x5168;&#x76F8;&#x540C;&#x7684;&#x80BD;&#x5206;&#x5E03;&#x5230;&#x679C;&#x8747;&#x3002;&#x591A;&#x80BD;&#x8C03;&#x8282;&#x8715;&#x76AE;&#x6216;&#x5582;&#x517B;&#x7B49;&#x8BB8;&#x591A;&#x91CD;&#x8981;&#x751F;&#x7406;&#x548C;&#x884C;&#x4E3A;&#x8FC7;&#x7A0B;&#xFF0C;&#x56E0;&#x4E3A;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x542F;&#x52A8;&#x836F;&#x7406;&#x8BD5;&#x9A8C;&#x548C;&#x53D1;&#x5C55;&#x7684;&#x65B0;&#x591A;&#x80BD;&#x4E3A;&#x57FA;&#x7840;&#x7684;&#x5177;&#x4F53;&#x4FDD;&#x62A4;&#x65B9;&#x6CD5;&#x5BF9;&#x767D;&#x83DC;&#x6839;&#x98DE;&#x548C;&#x5176;&#x5E7C;&#x866B;&#x3002;

&#x4EE5;&#x519C;&#x4E1A;&#x7834;&#x574F;&#x5E7C;&#x866B;&#x9636;&#x6BB5;&#x7684;&#x767D;&#x83DC;&#x6839;&#x98DE;&#x8FEA;&#x5229;&#x4E9A; radicum Peptidomics (&#x53CC;&#x7FC5;&#x76EE;&#xFF1A; &#x82B1;&#x8747;&#x79D1;&#xFF09;&#x3002;

The larvae of the cabbage root fly induce serious damage to cultivated crops of the family Brassicaceae. We here report the biochemical characterisation of neuropeptides from the central nervous system and neurohemal organs, as well as regulatory peptides from enteroendocrine midgut cells of the cabbage maggot. By LC-MALDI-TOF/TOF and chemical labelling with 4-sulfophenyl isothiocyanate, 38 peptides could be identified, representing major insect peptide families: allatostatin A, allatostatin C, FMRFamide-like peptides, kinin, CAPA peptides, pyrokinins, sNPF, myosuppressin, corazonin, SIFamide, sulfakinins, tachykinins, NPLP1-peptides, adipokinetic hormone and CCHamide 1. We also report a new peptide (Yamide) which appears to be homolog to an amidated eclosion hormone-associated peptide in several Drosophila species. Immunocytochemical characterisation of the distribution of several classes of peptide-immunoreactive neurons and enteroendocrine cells shows a very similar but not identical peptide distribution to Drosophila. Since peptides regulate many vital physiological and behavioural processes such as moulting or feeding, our data may initiate the pharmacological testing and development of new specific peptide-based protection methods against the cabbage root fly and its larva.

Peptidomics of the Agriculturally Damaging Larval Stage of the Cabbage Root Fly Delia radicum (Diptera: Anthomyiidae).

Las larvas de la mosca de la ra&iacute;z de col inducen graves da&ntilde;os a los cultivos de la familia Brassicaceae. Aqu&iacute; divulgamos la caracterizaci&oacute;n bioqu&iacute;mica de neurop&eacute;ptidos del sistema nervioso central y &oacute;rganos de Neuroh&eacute;mico, as&iacute; como p&eacute;ptidos reguladores de c&eacute;lulas enteroendocrinas midgut el gusano del repollo. Por LC-MALDI-TOF/TOF y etiquetado de productos qu&iacute;micos con 4-sulfophenyl isotiocianato, 38 p&eacute;ptidos podr&iacute;an ser identificados, que representa a las familias principales insectos p&eacute;ptido: allatostatin A, allatostatin C, FMRFamide-como p&eacute;ptidos, quinina, CAPA p&eacute;ptidos, pyrokinins, sNPF, myosuppressin, corazonin, SIFamide, sulfakinins, taquicininas, NPLP1-p&eacute;ptidos, hormona de adipokinetic y CCHamide 1. Tambi&eacute;n Divulgamos un nuevo p&eacute;ptido (Yamide) que parece ser hom&oacute;logo a un p&eacute;ptido amidated eclosi&oacute;n hormonal asociada en varias especies de Drosophila. Caracterizaci&oacute;n de immunocytochemical de la distribuci&oacute;n de varias clases de p&eacute;ptido-immunoreactive neuronas y c&eacute;lulas enteroendocrinas muestra una muy similar pero la distribuci&oacute;n de p&eacute;ptido no id&eacute;ntico a Drosophila. Puesto que p&eacute;ptidos regulan muchos procesos fisiol&oacute;gicos y de comportamiento vitales como muda o alimentaci&oacute;n, nuestros datos pueden iniciar las pruebas farmacol&oacute;gicas y el desarrollo de nuevos m&eacute;todos de protecci&oacute;n basadas en p&eacute;ptidos espec&iacute;ficos contra la mosca de la ra&iacute;z de col y su larva.

Peptidomics de la agr&iacute;cola da&ntilde;ar etapa Larval de la col ra&iacute;z volar Delia tractatu (Diptera: Anthomyiidae).

Les larves de la mouche de racine du chou induisent de graves dommages aux cultures de la famille des brassicac&eacute;es. Nous rapportons ici la caract&eacute;risation biochimique des neuropeptides du syst&egrave;me nerveux central et organes neuroh&eacute;maux, ainsi que des peptides r&eacute;gulateurs de cellules ent&eacute;roendocrines l&#39;intestin moyen de la mouche du chou. Par LC-MALDI-TOF/TOF et &eacute;tiquetage des produits chimiques &agrave; l&#39;isothiocyanate de 4-sulfoph&eacute;nyl, 38 peptides pouvaient &ecirc;tre identifi&eacute;s, repr&eacute;sentant peptide insectes grandes familles : allatostatin A, allatostatin C, FMRFamide-like peptides, kinines, CAPA peptides, pyrokinins, sNPF, myosuppressin, corazonin, SIFamide, sulfakinins, tachykinines, NPLP1-peptides, hormone adipocin&eacute;tique et CCHamide 1. Nous rapportons &eacute;galement un nouveau peptide (Yamide) qui semble &ecirc;tre l&#39;homologue &agrave; un peptide d&#39;hormone associ&eacute;e d&#39;eclosion amid&eacute; chez plusieurs esp&egrave;ces de drosophile. Caract&eacute;risation d&#39;immunocytochimique de la distribution de plusieurs classes de peptides immunor&eacute;actives neurones et les cellules ent&eacute;roendocrines montre une tr&egrave;s semblables mais distribution de peptide non identiques de drosophile. &Eacute;tant donn&eacute; que les peptides r&eacute;glementent beaucoup de processus vitaux physiologiques et comportementales telles que la mue ou l&#39;alimentation, nos donn&eacute;es peuvent engager les tests pharmacologiques et la mise au point de nouvelles m&eacute;thodes de protection &agrave; base de peptides sp&eacute;cifique contre la mouche de racine de chou et sa larve.

Peptidomique d&#39;agricolement endommageant stade larvaire de la radicum chou racine Fly Delia (Diptera : Anthomyiidae).

Die Larven der Fliege Stamm Kohl induzieren schweren Schaden f&uuml;r kultivierte Pflanzen aus der Familie der Kreuzbl&uuml;tengew&auml;chse (Brassicaceae). Wir berichten hier die biochemische Charakterisierung der Neuropeptide aus dem zentralen Nervensystem und Neurohemal Organe, sowie regulatorische Peptide aus Mitteldarm enteroendokrinen Zellen die Kohl-Maden. Von LC-MALDI-TOF/TOF und chemischen Kennzeichnung mit 4-Sulfophenyl Isothiocyanat, konnten 38 Peptide identifiziert werden, gro&szlig;e Insekt Peptid-Familien darstellt: Allatostatin A, Allatostatin C, FMRFamide-wie Peptide, Kinine, CAPA Peptide, Pyrokinins, sNPF, Myosuppressin, Corazonin, SIFamide, Sulfakinins, Tachykinins, NPLP1-Peptide, Adipokinetic Hormon und CCHamide 1. Wir berichten auch ein neues Peptid (Yamide) was Homolog zu einem niedrigmethylierte Eclosion Hormon-assoziierte Peptid in mehreren Drosophila-Arten zu sein scheint. Des Prozesses Immunocytochemical Charakterisierung der Verteilung von mehreren Klassen von Peptid-immunreaktivem Neuronen und enteroendokrinen Zellen zeigt eine sehr &auml;hnliche, aber nicht identische Peptid Verteilung Drosophila. Da Peptide viele lebenswichtige physiologische und Verhaltensst&ouml;rungen Prozesse wie Mauser- oder F&uuml;tterung regulieren, k&ouml;nnen unsere Daten der pharmakologischen Tests und Entwicklung von neuen spezifischen Peptid-basierte Schutzmethoden gegen die Kraut-Wurzel-Fliege und seine Larve einleiten.

Peptidomics von landwirtschaftlich Besch&auml;digung Larvenstadium des der Kohl Root fliegen Delia Radicum (Diptera: Blumenfliegen).

Le larve della Mosca radice cavolo inducono gravi danni alle colture coltivate della famiglia Brassicaceae. Riportiamo qui la caratterizzazione biochimica di neuropeptidi dal sistema nervoso centrale e gli organi neurohemal, come pure la regolamentazione peptidi dalle cellule intestino intestinale di maggot il cavolo. LC-MALDI-TOF/TOF ed etichettatura chimica con 4-sulfofenil isotiocianato, 38 peptidi potrebbero essere identificati, che rappresentano le famiglie pi&ugrave; importanti del peptide dell&#39;insetto: allatostatin A, allatostatin C, FMRFamide-come peptidi, chinine, CAPA peptidi, pyrokinins, sNPF, myosuppressin, corazonin, SIFamide, sulfakinins, tachykinins, NPLP1-peptidi, ormone adipokinetic e CCHamide 1. Segnaliamo anche un nuovo peptide (Yamide) che sembra essere omologo di un peptide ormone-associated eclosion amidati in diverse specie di Drosophila. Caratterizzazione immunocitochimica della distribuzione delle diverse classi di neuroni immunoreattivi del peptide e intestinale delle cellule indica una molto simile ma distribuzione del peptide non identici di Drosophila. Poich&eacute; i peptidi regolano numerosi processi vitali fisiologici e comportamentali come la muta o alimentazione, i nostri dati possono avviare la sperimentazione farmacologica e lo sviluppo di nuovi metodi di protezione del peptide specifico contro la Mosca della radice cavolo e sua larva.

Peptidomics del piano agricolo danneggiando larvale del cavolo radice volare Delia radicum (Diptera: Anthomyiidae).

&#x30AD;&#x30E3;&#x30D9;&#x30C4;&#x306E;&#x6839;&#x306E;&#x30CF;&#x30A8;&#x306E;&#x5E7C;&#x866B;&#x306F;&#x3001;&#x30A2;&#x30D6;&#x30E9;&#x30CA;&#x79D1;&#x306E;&#x683D;&#x57F9;&#x4F5C;&#x7269;&#x306B;&#x6DF1;&#x523B;&#x306A;&#x88AB;&#x5BB3;&#x3092;&#x8A98;&#x767A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; &#x306F;&#x3053;&#x3053;&#x304B;&#x3089;&#x4E2D;&#x67A2;&#x795E;&#x7D4C;&#x7CFB;&#x3068; neurohemal &#x306E;&#x81D3;&#x5668;&#x3001;&#x795E;&#x7D4C;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x30AD;&#x30E3;&#x30D9;&#x30C4;&#x3046;&#x3058;&#x866B;&#x306E; enteroendocrine &#x4E2D;&#x8178;&#x7D30;&#x80DE;&#x304B;&#x3089;&#x898F;&#x5236;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x306E;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x6027;&#x683C;&#x63CF;&#x5199;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;LC MALDI-TOF/TOF &#x3057;&#x5316;&#x5B66; 4 &#x30B9;&#x30EB;&#x30DB;&#x30D5;&#x30A7;&#x30CB;&#x30EB; &#x30A4;&#x30BD;&#x30C1;&#x30AA;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3068;&#x30E9;&#x30D9;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;38 &#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x3001;&#x4E3B;&#x8981;&#x306A;&#x6606;&#x866B;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C3;&#x30C9; &#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x8B58;&#x5225;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3067;&#x3057;&#x305F;: allatostatin A&#x3001;allatostatin C&#x3001;&#x30D5;&#x30DE;&#x30D5;&#x30A1;&#x30DF;&#x30C9;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x3001;&#x30AD;&#x30CB;&#x30F3;&#x3001;&#x30AD;&#x30E3;&#x30D1; &#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x3001;pyrokinins&#x3001;sNPF&#x3001;myosuppressin&#x3001;&#x30B3;&#x30E9;&#x30BE;&#x30CB;&#x30F3;&#x3001;SIFamide&#x3001;sulfakinins&#x3001;&#x30BF;&#x30D2;&#x30AD;&#x30CB;&#x30F3;&#x3001;NPLP1 &#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;, adipokinetic &#x30DB;&#x30EB;&#x30E2;&#x30F3;&#x3068; CCHamide 1&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x5316;&#x7FBD;&#x5316;&#x30DB;&#x30EB;&#x30E2;&#x30F3;&#x95A2;&#x9023;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x6570;&#x7A2E;&#x306E;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x306E;&#x76F8;&#x540C;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x898B;&#x3048;&#x308B;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9; (Yamide) &#x5831;&#x544A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x306E;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x514D;&#x75AB;&#x967D;&#x6027;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30ED;&#x30F3;&#x3068; enteroendocrine &#x7D30;&#x80DE;&#x306E;&#x5206;&#x5E03;&#x306E;&#x514D;&#x75AB;&#x7D30;&#x80DE;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x30AD;&#x30E3;&#x30E9;&#x30AF;&#x30BF;&#x30EA;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3001;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;&#x985E;&#x4F3C;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x540C;&#x4E00;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x5206;&#x5E03;&#x3059;&#x308B;&#x30B7;&#x30E7;&#x30A6;&#x30B8;&#x30E7;&#x30A6;&#x30D0;&#x30A8;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x751F;&#x7406;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x884C;&#x52D5;&#x306E;&#x904E;&#x7A0B;&#x8131;&#x76AE;&#x3084;&#x990C;&#x306A;&#x3069;&#x3092;&#x8ABF;&#x6574;&#x3059;&#x308B;&#x306E;&#x3067;&#x3001;&#x6211;&#x3005; &#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x306F;&#x85AC;&#x7406;&#x5B66;&#x7684;&#x30C6;&#x30B9;&#x30C8;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30AD;&#x30E3;&#x30D9;&#x30C4; &#x30EB;&#x30FC;&#x30C8; &#x30D5;&#x30E9;&#x30A4;&#x3068;&#x305D;&#x306E;&#x5E7C;&#x866B;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;&#x30DA;&#x30D7;&#x30C1;&#x30C9; &#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x9632;&#x5FA1;&#x6CD5;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x3092;&#x958B;&#x59CB;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

Peptidomics &#x8FB2;&#x696D;&#x88AB;&#x5BB3;&#x5E7C;&#x866B;&#x306E;&#x6BB5;&#x968E;&#x306E;&#x30AD;&#x30E3;&#x30D9;&#x30C4; &#x30EB;&#x30FC;&#x30C8;&#x98DB;&#x3076;&#x30C7;&#x30EA;&#x30A2; radicum (&#x53CC;&#x7FC5;&#x76EE;: &#x30CF;&#x30CA;&#x30D0;&#x30A8;&#x79D1;)&#x3002;

CRISPR &#x9635;&#x5217;&#x5728;&#x8BB8;&#x591A;&#x7EC6;&#x83CC;&#x4E2D;&#x53D1;&#x73B0;&#xFF0C;&#x5927;&#x591A;&#x6570;&#x53E4;&#x751F;&#x83CC;&#x8F6C;&#x5F55;&#x6210;&#x52A0;&#x5DE5;&#x6210; RNAs &#x5C0F;&#x805A;&#x96C6;&#x5B9A;&#x671F;&#x7A7A;&#x9699;&#x77ED;&#x590D;&#x53D1;&#x6027;&#x91CD;&#x590D; &#xFF08;CRISPR&#xFF09; &#xFF08;crRNAs&#xFF09; &#x7684;&#x957F;&#x524D;&#x4F53; RNA&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B; RNA &#x5206;&#x5B50;&#x53EF;&#x4EE5;&#x5305;&#x542B;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7247;&#x6BB5;&#x548C;&#x6253;&#x5706;&#x573A;&#xFF0C;&#x8FD8;&#x6709;&#x4E00;&#x5957; CRISPR &#x5173;&#x8054; (Cas) &#x86CB;&#x767D;&#x7684;&#x539F;&#x6838;&#x514D;&#x75AB;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x653B;&#x51FB;&#x3002;CRISPR/Cas &#x7CFB;&#x7EDF;&#x591A;&#x79CD;&#x591A;&#x6837;&#xFF0C;&#x5E76;&#x5904;&#x7406; crRNAs &#x7684; Cas6 &#x9176;&#x4E0D;&#x540C;&#x4E9A;&#x578B;&#x4E4B;&#x95F4;&#x5404;&#x4E0D;&#x76F8;&#x540C;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x5206;&#x6790;&#x4E86; CRISPR/Ca &#x5B50;&#x7C7B;&#x578B;&#x6211;-B&#xFF0C;&#x76EE;&#x524D;&#x4ECE;&#x7EC6;&#x83CC;&#x548C;&#x53E4;&#x83CC;&#x6A21;&#x578B;&#x751F;&#x7269;&#x4F53;&#x68AD;&#x83CC; thermocellum &#x548C; Methanococcus maripaludis C5 &#x7684;&#x65B0;&#x578B; Cas6 &#x9176;&#x7684;&#x9274;&#x5B9A;&#x3002;Methanococcus maripaludis Cas6b &#x5728;&#x4F53;&#x5916;&#x6D3B;&#x6027;&#x548C;&#x7279;&#x5F02;&#x6027;&#x786E;&#x5B9A;&#x3002;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x4E24;&#x4E2A;&#x8865;&#x5145;&#x6027;&#x50AC;&#x5316;&#x7EC4;&#x6C28;&#x9178;&#x6B8B;&#x57FA;&#x3002;RNA Seq &#x5206;&#x6790;&#x63ED;&#x793A;&#x4F53;&#x5185; crRNA &#x5904;&#x7406;&#x7AD9;&#x70B9;&#x3001; crRNA &#x4E30;&#x5EA6;&#x548C; CRISPR &#x8F6C;&#x5F55;&#x5185;&#x8FD9;&#x4E24;&#x79CD;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x65B9;&#x5411;&#x3002;&#x4E2A;&#x522B;&#x57AB;&#x7247;&#x5E8F;&#x5217;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x8F6C;&#x5F55;&#x548C;&#x52A0;&#x5DE5;&#x6A21;&#x5F0F; CRISPR &#x7FA4;&#x96C6;&#x7684;&#x5F3A;&#x70C8;&#x5F71;&#x54CD;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5F71;&#x54CD;&#x5C06;&#x9700;&#x8981;&#x8003;&#x8651;&#x7684;&#x76EE;&#x7684;&#x662F;&#x4E3A;&#x4E86;&#x4EA7;&#x751F;&#x5408;&#x6210; crRNAs &#x7684; CRISPR &#x7FA4;&#x96C6;&#x5E94;&#x7528;&#x7A0B;&#x5E8F;&#x3002;

CRISPR RNA &#x52A0;&#x5DE5;&#x68AD;&#x83CC; thermocellum &#x548C; Methanococcus maripaludis &#x7684;&#x8868;&#x5F81;&#x3002;

The CRISPR arrays found in many bacteria and most archaea are transcribed into a long precursor RNA that is processed into small clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) RNAs (crRNAs). These RNA molecules can contain fragments of viral genomes and mediate, together with a set of CRISPR-associated (Cas) proteins, the prokaryotic immunity against viral attacks. CRISPR/Cas systems are diverse and the Cas6 enzymes that process crRNAs vary between different subtypes. We analysed CRISPR/Cas subtype I-B and present the identification of novel Cas6 enzymes from the bacterial and archaeal model organisms Clostridium thermocellum and Methanococcus maripaludis C5. Methanococcus maripaludis Cas6b in vitro activity and specificity was determined. Two complementary catalytic histidine residues were identified. RNA-Seq analyses revealed in vivo crRNA processing sites, crRNA abundance and orientation of CRISPR transcription within these two organisms. Individual spacer sequences were identified with strong effects on transcription and processing patterns of a CRISPR cluster. These effects will need to be considered for the application of CRISPR clusters that are designed to produce synthetic crRNAs.

Characterization of CRISPR RNA processing in Clostridium thermocellum and Methanococcus maripaludis.

Les baies CRISPR trouvent dans de nombreuses bact&eacute;ries et archaea plupart sont transcrits dans un long pr&eacute;curseur RNA qui est transform&eacute; en petit cluster r&eacute;guli&egrave;rement dois&#x2011;je courtes r&eacute;p&eacute;titions palindromique (CRISPR) RNAs (crRNAs). Ces mol&eacute;cules d&#39;ARN peuvent contenir des fragments de g&eacute;nomes viraux et m&eacute;diation, ainsi qu&#39;un ensemble de prot&eacute;ines associ&eacute;es aux CRISPR (Cas), la procaryote immunit&eacute; contre les attaques virales. Syst&egrave;mes CRISPR/AR sont diverses et les enzymes Cas6 qui traitent les crRNAs varient selon les diff&eacute;rents sous-types. Nous avons analys&eacute; CRISPR/AR sous-type I-B et pr&eacute;senter l&#39;identification de nouveaux Cas6 enzymes des bact&eacute;ries et arch&eacute;es mod&egrave;le organismes Clostridium thermocellum et Methanococcus maripaludis C5. Methanococcus maripaludis Cas6b dans l&#39;activit&eacute; in vitro et la sp&eacute;cificit&eacute; a &eacute;t&eacute; d&eacute;termin&eacute;e. Deux r&eacute;sidus d&#39;histidine catalytique compl&eacute;mentaires ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s. RNA-Seq analyses ont r&eacute;v&eacute;l&eacute; in vivo crRNA sites de traitement, l&#39;abondance de la crRNA et l&#39;orientation de la transcription CRISPR au sein de ces deux organismes. S&eacute;quences de l&#39;espaceur individuels ont &eacute;t&eacute; identifi&eacute;s avec des effets importants sur les habitudes de transcription et de la transformation d&#39;une grappe CRISPR. Ces effets devront &ecirc;tre consid&eacute;r&eacute;s pour l&#39;application de clusters CRISPR qui sont con&ccedil;us pour produire des crRNAs synth&eacute;tiques.

Caract&eacute;risation de l&#39;ARN CRISPR traitement Clostridium thermocellum et Methanococcus maripaludis.

Die CRISPR-Arrays in viele Bakterien und die meisten Archaeen sind transkribiert in langen Vorl&auml;ufer RNA, der zu kleinen gruppierten regelm&auml;&szlig;ig interspaced kurze palindromische Wiederholungen (CRISPR) RNAs (CrRNAs) verarbeitet wird. Diese RNA-Molek&uuml;le k&ouml;nnen enthalten Fragmente von viralen Genomen und vermitteln, zusammen mit einer Reihe von CRISPR-assoziierte (Cas) Proteine, die Prokaryoten Immunit&auml;t gegen die Viren-Attacken. CRISPR/Cas-Systeme sind vielf&auml;ltig und die Cas6 Enzyme, die CrRNAs verarbeiten variieren zwischen verschiedenen Subtypen. Wir analysierten CRISPR/Cas Subtyp-B und die Identifizierung von Roman Cas6 Enzyme der Bakterien und Archaea Modell Organismen Clostridium Thermocellum und Methanococcus Maripaludis C5 pr&auml;sentieren. Methanococcus Maripaludis Cas6b in Vitro Aktivit&auml;t und Spezifit&auml;t wurde ermittelt. Zwei erg&auml;nzende katalytische Histidin-R&uuml;ckst&auml;nde wurden identifiziert. RNA-Seq Analysen ergab in-vivo CrRNA Verarbeitung Websites, CrRNA F&uuml;lle und Ausrichtung der CRISPR-Transkription innerhalb dieser zwei Organismen. Individuelle Spacer-Sequenzen wurden mit starken Auswirkungen auf die Transkription und Verarbeitung Muster eines CRISPR-Clusters identifiziert. Diese Effekte m&uuml;ssen f&uuml;r die Anwendung der CRISPR-Cluster betrachtet werden, die entworfen sind, um synthetische CrRNAs zu produzieren.

Charakterisierung der CRISPR-RNA, die Verarbeitung in Clostridium Thermocellum und Methanococcus Maripaludis.

Le matrici CRISPR trovano in molti batteri e archaea la maggior parte sono trascritti in un lungo precursore RNA che viene trasformato in piccoli cluster regolarmente interspaced corto palindromo ripetizioni (CRISPR) RNAs (crRNAs). Queste molecole di RNA possono contenere frammenti del genoma virale e mediare, unitamente a un insieme di proteine associate CRISPR (Cas), la procariota immunit&agrave; contro gli attacchi virali. Sistemi CRISPR/Cas sono diversi e gli enzimi Cas6 che elaborano crRNAs variano tra diversi sottotipi. Abbiamo analizzato CRISPR/Cas sottotipo I-B e presentare l&#39;identificazione del romanzo Cas6 enzimi batterici e archaeal modello organismi Clostridium thermocellum e 3AB maripaludis C5. &Egrave; stato determinato 3AB maripaludis Cas6b in vitro attivit&agrave; e specificit&agrave;. Sono stati identificati due residui di istidina catalitico complementari. RNA-Seq analisi hanno evidenziato in vivo crRNA lavorazione siti, abbondanza di crRNA e l&#39;orientamento della trascrizione CRISPR all&#39;interno di questi due organismi. Sequenze distanziale individuali sono stati identificati con forti effetti sui modelli di elaborazione e trascrizione di un cluster di CRISPR. Questi effetti dovranno essere considerati per l&#39;applicazione del cluster CRISPR che sono progettati per produrre crRNAs sintetico.

Caratterizzazione di CRISPR RNA processing in Clostridium thermocellum e 3AB maripaludis.

&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E; CRISPR &#x914D;&#x5217;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3057;&#x3001;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x306F;&#x5C0F;&#x898F;&#x6A21;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x5316;&#x5B9A;&#x671F;&#x7684;&#x306B; interspaced &#x77ED;&#x3044;&#x56DE;&#x6587;&#x7E70;&#x308A;&#x8FD4;&#x3057; (CRISPR) Rna (crRNAs) &#x306B;&#x51E6;&#x7406;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x9577;&#x3044;&#x524D;&#x99C6;&#x4F53; RNA &#x306B;&#x8EE2;&#x5199;&#x3055;&#x308C;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E; RNA &#x5206;&#x5B50;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x3001;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x653B;&#x6483;&#x306B;&#x5BFE;&#x3059;&#x308B;&#x539F;&#x6838;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x514D;&#x75AB; CRISPR &#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B; (Cas) &#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x306E;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3068;&#x5171;&#x306B;&#x3092;&#x4EF2;&#x4ECB;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;CRISPR/Cas &#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x304C;&#x591A;&#x69D8;&#x3067;&#x3001;crRNAs &#x3092;&#x51E6;&#x7406; Cas6 &#x9175;&#x7D20;&#x9593;&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x30B5;&#x30D6;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x7570;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x6211;&#x3005; CRISPR/Cas &#x30B5;&#x30D6;&#x30BF;&#x30A4;&#x30D7; i-b &#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x3001;&#x65B0;&#x898F;&#x306E; Cas6 &#x9175;&#x7D20;&#x7D30;&#x83CC;&#x3068;&#x53E4;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x751F;&#x7269;&#x30AF;&#x30ED;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EA;&#x30B8;&#x30A6;&#x30E0;&#x682A;&#x3068; Methanococcus maripaludis C5 &#x304B;&#x3089;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3092;&#x63D0;&#x793A;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;Methanococcus maripaludis Cas6b &#x306E; in vitro &#x6D3B;&#x6027;&#x3068;&#x7279;&#x7570;&#x6027;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;2 &#x3064;&#x306E;&#x76F8;&#x88DC;&#x7684;&#x306A;&#x89E6;&#x5A92;&#x30D2;&#x30B9;&#x30C1;&#x30B8;&#x30F3;&#x6B8B;&#x57FA;&#x304C;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;RNA Seq &#x89E3;&#x6790;&#x3067;&#x306F;&#x3001;in vivo crRNA &#x51E6;&#x7406;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x3001;crRNA &#x306E;&#x8C4A;&#x304B;&#x3055;&#x3068; CRISPR &#x8EE2;&#x5199;&#x3053;&#x308C;&#x3089; 2 &#x3064;&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x5185;&#x306E;&#x65B9;&#x5411;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x500B;&#x3005; &#x306E;&#x30B9;&#x30DA;&#x30FC;&#x30B5;&#x30FC; &#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9; CRISPR &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x30FB;&#x51E6;&#x7406;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306B;&#x5F37;&#x3044;&#x5F71;&#x97FF;&#x3068;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x52B9;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x5408;&#x6210; crRNAs &#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x8A2D;&#x8A08;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B; CRISPR &#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x30FC;&#x306E;&#x30A2;&#x30D7;&#x30EA;&#x30B1;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x8003;&#x616E;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

CRISPR &#x51E6;&#x7406;&#x682A;&#x3068; Methanococcus maripaludis RNA &#x306E;&#x7279;&#x6027;&#x3002;

CRISPR &#xBC30;&#xC5F4; &#xB9CE;&#xC740; &#xBC15;&#xD14C;&#xB9AC;&#xC544;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD558; &#xACE0; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xACE0;&#xC138;&#xADE0; RNAs &#xC791;&#xC740; &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; &#xC815;&#xAE30;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; interspaced &#xC9E7;&#xC740; &#xD68C;&#xBB38; &#xBC18;&#xBCF5; (CRISPR) (crRNAs)&#xC73C;&#xB85C; &#xCC98;&#xB9AC; &#xB418;&#xB294; &#xAE34; &#xC804;&#xC870; RNA&#xB85C; &#xBCC0;&#xD558;&#xAC8C; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC774; RNA &#xBD84;&#xC790; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xD30C;&#xD3B8;&#xC744; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558; &#xACE0; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xACF5;&#xACA9;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; prokaryotic &#xBA74;&#xC5ED; CRISPR &#xAD00;&#xB828; (Cas) &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8;&#xC758; &#xC138;&#xD2B8;&#xB97C; &#xD568;&#xAED8; &#xC911;&#xC7AC; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. CRISPR/Ca &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC740; &#xB2E4;&#xC591; &#xD558; &#xACE0; Cas6 &#xD6A8;&#xC18C; Crrnas&#xB97C; &#xCC98;&#xB9AC; &#xD558;&#xB294; &#xB2E4;&#xB978; &#xD558;&#xC704; &#xC720;&#xD615;&#xC774; &#xB2EC;&#xB77C; &#xC9D1;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; CRISPR/Ca &#xD558;&#xC704; &#xD615;&#xC2DD; I-B&#xB97C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD558; &#xACE0; &#xC138;&#xADE0;&#xC131; &#xBC0F; archaeal &#xBAA8;&#xB378; &#xC0DD;&#xBB3C; Clostridium thermocellum &#xBC0F; Methanococcus maripaludis C5 &#xC18C;&#xC124; Cas6 &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xC2E0;&#xBD84;&#xC99D;. Methanococcus maripaludis Cas6b &#xCCB4; &#xC678; &#xD65C;&#xB3D9; &#xBC0F; &#xD2B9;&#xC774;&#xC131;&#xC744; &#xACB0;&#xC815; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB450; &#xAC1C;&#xC758; &#xC0C1;&#xD638; &#xBCF4;&#xC644;&#xC801;&#xC778; &#xCD09;&#xB9E4; &#xD788;&#xC2A4;&#xD2F0;&#xB518; &#xC794;&#xB958;&#xBB3C; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. RNA Seq &#xBD84;&#xC11D; vivo&#xC5D0;&#xC11C; crRNA &#xCC98;&#xB9AC; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;, crRNA &#xD48D;&#xC694;&#xB85C; &#xC6C0;&#xC774; &#xB450; &#xC720;&#xAE30; &#xCCB4; &#xB0B4;&#xC5D0;&#xC11C; CRISPR &#xC804;&#xC0AC;&#xC758; &#xBC29;&#xD5A5;&#xC744; &#xBC1D;&#xD614;&#xB2E4;. &#xAC1C;&#xBCC4; &#xACF5;&#xBC31; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; CRISPR &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xC758; &#xC804;&#xC0AC; &#xBC0F; &#xCC98;&#xB9AC; &#xD328;&#xD134;&#xC5D0; &#xAC15;&#xB825;&#xD55C; &#xC601;&#xD5A5;&#xC744; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xD6A8;&#xACFC; &#xD569;&#xC131; Crrnas&#xB97C; &#xC0DD;&#xC0B0; &#xD558;&#xB3C4;&#xB85D; &#xC124;&#xACC4; &#xB41C; CRISPR &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130;&#xC758; &#xC751;&#xC6A9; &#xD504;&#xB85C;&#xADF8;&#xB7A8;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xACE0;&#xB824;&#xD574; &#xC57C; &#xD560; &#xAC83; &#xC774;&#xB2E4;.

Clostridium thermocellum &#xBC0F; Methanococcus maripaludis&#xC5D0;&#xC11C; &#xCC98;&#xB9AC; &#xD558;&#xB294; CRISPR RNA&#xC758; &#xD2B9;&#xC131; &#xBD84;&#xC11D;.

Las matrices CRISPR encontraron en muchas bacterias y archaea mayor&iacute;a se transcriben en un precursor largo RNA que son transformado en RNAs peque&ntilde;os agrupado regularmente interspaced corto palindr&oacute;mico repeticiones (CRISPR) (crRNAs). Estas mol&eacute;culas de ARN pueden contener fragmentos de genomas virales y mediar, junto con un conjunto de prote&iacute;nas asociadas a CRISPR (Cas), las procariota inmunidad contra los ataques virales. Sistemas CRISPR/Cas son diversos y las enzimas Cas6 que procesan crRNAs var&iacute;an entre los diferentes subtipos. Se analizaron CRISPR/Cas subtipo B y presenta la identificaci&oacute;n de nuevas Cas6 enzimas de las bacterias y arqueobacterias modelo organismos Clostridium thermocellum y Methanococcus Jannaschii C5. Methanococcus Jannaschii Cas6b en vitro actividad y especificidad se determinan. Se identificaron dos residuos histidina catal&iacute;tica complementarios. RNA-Seq an&aacute;lisis revelaron sitios de procesamiento en vivo crRNA, abundancia de crRNA y orientaci&oacute;n de transcripci&oacute;n CRISPR dentro de estos dos organismos. Se identificaron secuencias del espaciador individuales con fuertes efectos en los patrones de transcripci&oacute;n y procesamiento de un cl&uacute;ster CRISPR. Estos efectos se deben considerarse para la aplicaci&oacute;n de racimos CRISPR que est&aacute;n dise&ntilde;ados para producir crRNAs sint&eacute;tico.

Judith Zoephel

Prokaryotic Small RNA Biology

Max-Planck-Institute for terrestrial Microbiology

Substrate Generation for Endonucleases of CRISPR/Cas Systems

Judith Zoephel

.css-o250i3{font-size:18px;font-family:Open Sans,sans-serif;line-height:21.6px;}Prokaryotic Small RNA Biology

Max-Planck-Institute for terrestrial Microbiology

Substrate Generation for Endonucleases of CRISPR/Cas Systems

Prokaryotic Small RNA Biology