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Method Article
一种用于基于使用所述相应的前体的烷基改性胍的合成方案被呈现。
胍组是在药物化学中最重要的药效基团之一。携带胍基的唯一的氨基酸是精氨酸。在本文中,提供了一种用于在肽配体的胍基的修饰的简单方法,用RGD结合整联配体的一个例子。据最近表明,胍基团在这些配位体的不同修改允许亚型的选择性调节( 例如,αV亚型和α5之间)。此外,通过胍基的功能化以前未知的策略被证明,而合成的方法在本文件中审查。这里所描述的修改涉及末端(Nω)烷基化和乙酰化胍基。用于合成,量身定做的前体分子被合成,然后将其进行反应与正交脱保护的胺来传送预修饰胍组。对于烷基化胍的合成中,基于N-前体,N' -二叔丁氧羰甲基-1H-吡唑-1-甲脒用于合成酰化化合物,选择为N -Boc- S的相应的酰化衍生物的前体-甲基异硫脲,其可以在一个和两个步骤的反应来获得。
其中在天然配体中最丰富的药效基团是胍基,其参与多种相互作用1,2。例如,它可作为在氢键相互作用的电位四倍氢供体并参与静电相互作用,例如盐桥或阳离子-π相互作用。在药物化学,该组中的药物和药物候选4,经常发现,虽然很常作为胍模拟物5,6。其原因胍模拟物的开发是去除普遍存在的,带正电荷的胍基团,以及作为配体的亲脂性的调整。在肽配体,唯一的胍基的氨基酸是精氨酸,其因此通常在肽配体的生物活性区域中发现。
一个非常PR用于含精氨酸的配体家族ominent例子是RGD结合整联亚家族。通常,整联是一类细胞粘附受体,它们接管重要的功能在所有高等生物的。其中的一些功能,包括细胞粘附,迁移和细胞存活。因此,它们也参与病理指示,诸如癌症和纤维化。整合素是选自由α-和β亚单位构成24个目前已知的整联亚型的异源二聚体跨膜蛋白;其中8识别的三肽序列精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸(RGD =)在它们的配体7。所述结合区域位于在细胞外部分,即所谓的整头组8这两个亚型之间的接口。 RGD由两个共同相互作用确认:金属离子依赖性的粘附位点(MIDAS)区域,该区域位于β亚基和结合在配体的羧酸(侧茶在ASP的);和胍组中的配体,其位于α亚基。大多数整联亚型是混杂和共享至少它们的天然细胞外基质(ECM)配体9的一部分。因此,人工整合素配体的发展,主要的焦点是,除了具有高结合亲和力的亚型选择性。最近,我们能够出台针对亚型选择性配体的产生的关键因素:胍组。通过不同的修饰,所述αv-和双选择性配体α5含整亚型可以通过简单的修改的胍基团,然后它可以区分不同的α亚基10变成选择性的化合物。
在αV的口袋,所述胍基经由二齿盐桥与Asp218 11,12相互作用侧面上 。这种相互作用Ç一个也α5β1可以观察到(在此,用Asp227在α5),但是另外,端部上有Gln残基(Gln221)的胍基团的相互作用,观察到有13。因此,我们修改了胍组中的两个相对的方式:在一种情况下,通过与胍基的Nδ的甲基化阻止侧上相互作用,而在其他情况下,与胍Nω的甲基化,阻断端上的相互作用。出人意料的是,这个小的修改导致了配体完整的选择性转变。除了烷基化,新功能化方法本出版物中介绍。对于这种类型的配体pentapeptidic的经典官能的方法是通过不参与结合的氨基酸的侧链共轭( 例如,K在C(RGDfK))14,15。这里,我们表明,官能化也可以通过修改胍 - 这对于结合至关重要 - 与酰基或烷基化连接基。上的正电荷,对于结合是必需被保留,并且模型表明,长链分出来的结合口袋的,因此提供进一步的接头的附接的理想可能性和标记单元( 例如,荧光标记物或分子螯合剂成像)。
在这项工作中,我们集中在对于胍基的含精氨酸的配体的变形例的制备步骤。这涉及Nω甲基化的物质的合成,以及与较长的接头单元胍。不同的修饰包括酰基和烷基。
注:从供应商处获得的所有试剂和溶剂,无需进一步纯化即可使用。
注意:使用前请咨询所有相关材料安全数据表(MSDS)。进行化学合成( 例如,通风柜,护目镜,手套,实验室外套,全长裤,不露脚趾的鞋子)时,请利用一切适当的安全设备。
1.胍基化的前体的合成
2.环肽前体的合成
3.胍基化和脱保护解决方案
4.分析数据和用于纯化参数
环肽前体合成的线性肽,环化,和正交DDE脱保护。在沉淀后,所述化合物的纯度用HPLC-MS( 图1)进行分析。以监测反应的进展,2小时的反应时间( 图2)之后进行的HPLC分析。
有关胍基残基较大,在2小时反应时间通常是不够的。在这种情况下,继续反应,并用LC-MS监测。进行反应和最终的脱保护后,使...
为胍基化的前体是正交脱保护的环肽衍生物,(C(OrnD(OT丁基)GF(N Me)的V)),这是通过固相肽合成(SPPS)的标准Fmoc方案合成。鸟氨酸被用作正交保护的衍生物,羰基(Fmoc-ORN(DDE)-OH),其可以与肼在DMF中的肽支架的环化反应后进行脱保护。该肽的前体是由化合物沉淀,并通过随后的冷冻干燥纯化。
为胍基烷基化的前体可以在在一步反应良好的产?...
作者什么都没有透露。
TGK承认国际研究生院慕尼黑工业大学的科学与工程(IGGSE)提供的财政支持。香港承认的鼎力支持中心综合蛋白质科学慕尼黑(CIPSM)。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
N,N′-Di-Boc-1H-pyrazole-1-carboxamidine, 98% | Sigma Aldrich | 434167 ALDRICH | |
Triphenylphosphine, 99% | Sigma Aldrich | T84409 SIGMA-ALDRICH | |
Tetrahydrofuran, >99.5% | Carl Roth | 4745 | |
Tetrahydrofuran anhydrous, 99.8% | Carl Roth | 5182 | |
Methanol anhydrous, 99.8% | Sigma Aldrich | 322415 SIGMA-ALDRICH | |
Diisopropyl azodicarboxylate, 98% | Sigma Aldrich | 225541 ALDRICH | |
Dichlormethan, for synthesis, 99.5% | Carl Roth | 8424 | |
Silica gel for flash chromtaography | Sigma Aldrich | 60738 SIGMA-ALDRICH | |
n-Pentane, 99% | Carl Roth | 8720 | |
n-Hexane, 99% | Carl Roth | CP47 | |
Ethylacetate, 99.5% | Carl Roth | 7338 | |
Aminohexanol, 95% | Sigma Aldrich | A56353 ALDRICH | |
S-Methylisothiourea hemisulfate, 98% | Sigma Aldrich | M84445 ALDRICH | |
Di-tert-butyl dicarbonate, 99% | Sigma Aldrich | 205249 ALDRICH | |
N,N-Dimethylformamid, 99.8% | Carl Roth | A529 | |
N,N-Diisopropylethylamin, 99.5% | Carl Roth | 2474 | |
Acetic anhydrid, 99% | Carl Roth | 4483 | |
Chlortrityl resin | Carbolution | CC11006 | |
Fmoc-Gly-OH, 98% | Carbolution | CC05014 | |
Piperidin, 99% | Sigma Aldrich | 104094 SIGMA-ALDRICH | |
Fmoc-Orn(Dde)-OH | Iris-Biotech | FAA1502 | |
HATU, 99% | Carbolution | CC01011 | |
HOAt, 99% | Carbolution | CC01004 | |
Fmoc-Val-OH | Carbolution | CC05028 | |
2-Nitrobenzenesulfonyl chloride, 97% | Sigma Aldrich | N11507 ALDRICH | |
2,4,6-Collidine, 99% | Sigma Aldrich | 27690 SIGMA-ALDRICH | |
Mercaptoethanol, 99% | Sigma Aldrich | M6250 ALDRICH | |
Diazabicycloundecen, 98% | Sigma Aldrich | 139009 ALDRICH | |
Fmoc-D-Phe-OH, 98% | Sigma Aldrich | 47378 ALDRICH | |
Fmoc-Asp(OtBu)-OH, 98% | Carbolution | CC05008 | |
Hexafluoroisopropanol | Carbolution | CC03056 | |
Diphenylphosphoryl azide, 97% | Sigma Aldrich | 178756 ALDRICH | |
TFA, 99.9% | Carl Roth | P088 | |
Triisopropylsilan, 98% | Sigma Aldrich | 233781 ALDRICH | |
Acetonitrile, HPLC grade | Carl Roth | HN44 |
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