首先，将3D打印的细胞放在桌子上，标准具坑朝上。将 O 形圈插入标准具凹坑，然后将其轻轻压入指定的凹槽中。将反射面朝上的分束器放在标准具坑中的 O 形圈上。
使用镊子，小心地将两个垫片放在分束器上，为气体和激发激光器产生清晰的孔径，气体和激发激光器通过从电池一侧到另一侧的通孔进入气腔。将垫片顶部的反射镜对齐，反射面朝下，使分束器、垫片和反射镜同心对齐。取下3D打印的标准具帽，将O形圈放入指定的凹槽中。
将盖子对准电池的矩形凹槽，提起电池，并在盖子上施加压力以将垫片固定到位，同时从背面将四个 M4 螺钉插入指定的孔中。在正面安装带有四个 M4 螺母的螺钉并拧紧它们，直到盖子的压力足以将垫片固定到位并且 O 形圈得到充分压缩。对于纤维-标准具对准，使用套圈夹安装尾纤套圈和 GRIN 透镜系统，并确保 Z 方向上的平移平台移动到其最大高度。
将3D打印的细胞对准该系统下方，将其位置固定在GRIN透镜略低于的高度，直接指向开口的中心。用移液管在GRIN镜头的前端涂上一两滴粘合剂。在Z方向上降低平移台，直到与分束器的增透膜表面接触。
继续降低GRIN镜片，直到施加足够的压力并且弹簧处于足够的张力下。打开调制激光器和示波器。确保示波器在开始对准过程时具有尽可能高的分辨率。
然后，设置时间分辨率，使调制的两到三个周期可见。要开始对准过程，请确保GRIN透镜正常指向分束器表面。一步一步地，稍微偏转第一个测角载物台，然后将另一个测角载物台移动到零位置。
如果在示波器上没有观察到变化，请稍微偏转第一个测角级并重复此迭代过程，直到三角调制在示波器上可见。一旦观察到强烈的背反射，调整示波器的分辨率，并确保标准具反射函数的峰值位于三角形调制斜率的中心。通过改变激光的温度来调整标准具的峰值，直到峰值以斜率为中心。
通过测角级的轻微移动，尝试最大化峰值强度，同时最大化三角调制的峰峰值比。对准完成后，将紫外灯以 45 度角安装在靠近安装的 GRIN 透镜的位置。接下来，固化涂在GRIN镜片前端的粘合剂。
5 到 10 分钟后，关闭紫外线灯，并在 GRIN 镜片周围涂上更多粘合剂，不要触摸它。将粘合剂暴露在紫外线下再暴露 5 到 10 分钟。重复此步骤，直到细胞的开口完全充满均匀的粘合剂层，并进行至少一小时的最终固化。
代表性图像显示了良好和更差的对齐方式。对齐越好，三角调制的峰峰值比越高，反射率峰值越接近零。
