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邻位配体检测,用于定位 DNA 损伤位点的蛋白质

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DNA 损伤反应是一种维持基因组稳定性和完整性的细胞系统。这个过程中的功能障碍会导致多种疾病,例如癌症、与年龄相关的疾病和慢性炎症。我们的目标是确定在此过程中合作的蛋白质,从而确定治疗整合的替代靶点。

为了表征蛋白质参与 DNA 损伤反应的情况,通常使用 H2AX 组蛋白(DNA 损伤的标志物)的磷酸化形式进行免疫荧光研究。此外,可以在 DNA 损伤后进行蛋白质收集测定,例如免疫共沉淀,以确定蛋白质在信号传导中的作用。相互作用研究通常基于免疫沉淀测定,但这些是在体外进行的,不能提供有关相互作用位置的信息。

免疫荧光可以提供有关蛋白质细胞定位的信息,但证明相互作用可能很困难,并且取决于显微镜的分辨率。我们在这里表明,将邻位配体测定与 Gamma-H2AX 染色相结合的简单方案可以对 DNA 损伤背景下蛋白质相互作用的空间和时间表征。此外,我们还提供了一个用户友好的宏用于数据分析。

在这里,我们提出了一种简单快速的方案,用于检测 DNA 损伤位点的蛋白质相互作用。

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