线虫是真正的动物,生活在自然界中。收集野生线虫,使我们能够在自然环境中研究基因和基因组,揭示可能被实验室的人工条件所掩盖的功能。这种技术从田间富含细菌的有机底物中提取蠕虫,并在培养皿上创建干净的培养物,捕获收集时每个种群的快照。
这些群体非常适合生态学,群体遗传学或元遗传学问题。野生菌株培养物对于定量遗传研究也很有价值。这种技术很简单,而且易于执行,即使对于实地研究新手也是如此。
但是,一次成功的收集之旅,需要在旅行前仔细准备材料。识别田间中富含细菌的基质,例如腐烂的水果,花朵,真菌,草本植物的茎,土壤或落叶。将少量基材放入贴有标签的塑料袋中。
如果腐烂的物质在感兴趣的田地一侧很少见,请放置一些水果作为诱饵。让它去岩石,然后取回它,以及任何已经殖民它的蠕虫。记录样品ID,纬度,经度,日期和底物的描述。
记录与实验相关的任何其他局部环境测量值,例如环境和底物温度,底物状况,收集时间以及与底物相关的大型无脊椎动物的存在。使用剪刀从每个漏斗中切割一段三厘米长的橡胶管。将管道安装在塑料漏斗的末端。
将卡套管夹滑过橡胶管,然后将其夹紧。要制作漏斗架,请在展开的纸板苍蝇卑鄙托盘的中心切开圆孔。倒置纸板,将侧面折叠一次,然后用胶带粘在一起。
这将产生腿,将孔抬高到长凳上方。确保卡套管夹处于关闭位置,并将漏斗放置在孔中。将无菌水倒入每个漏斗中,将其填充到边缘以下约三厘米处。
点击漏斗,释放管道中任何被困的气泡。将不起毛的湿巾对折,做成一个正方形,然后将其放在漏斗上。然后,按下擦拭布,将其浸入水中。
手动分解天然基质的任何大固体碎片。轻轻地将一些样品放在漏斗中的擦拭物上。确保不要刺穿湿巾,或将任何样品突出在边缘上方。
小心地将擦拭布的角落折叠在样品上,以防止水在漏斗边缘流出。使用样本 ID 标记漏斗,对应于字段收集注释。挑选出任何可能传播并交叉污染样本的活跃昆虫或其他动物。
向每个漏斗中加入更多的水,以淹没整个样品。在室温下孵育过夜时,活跃的线虫会通过组织摆动,并沉入漏斗的底部。在六厘米NGM蜗杆板的底部写下漏斗的样品ID,上面有OP50大肠杆菌。
从板中取出盖子,从漏斗支架中取出包含样品的漏斗,并用一只手将其竖直放在打开的蜗杆板上方。用另一只手释放管夹上的压力,让一两滴水从管子上掉落到细菌草坪旁边的蜗杆板上。一旦水从漏斗中滴落,迅速将其再次夹紧,以防止淹没NGM板。
要清理,请扔掉漏斗的内容物,并用热水清洗,以便随后重复使用。在体视显微镜下观察分离的线虫。除了线虫外,偶尔还会有小型的寡核苷酸、缓步动物、轮虫和小型甲壳类动物。
要建立ISO雌雄同体或ISO母系,请将每个L4雌雄同体或交配的成年雌性转移到单独的3.5厘米NGM板上,与OP50一起安装。在每次转移之前和之后对蠕虫拾取进行消毒。最后,用石蜡膜彻底包裹板以进行旅行。
在巴拿马的巴罗科罗拉多岛上,2018年,通过这种方法处理了131个底物。其中99%产生线虫。34%产的线虫Caenorhabditis。
在乌克兰切尔诺贝利禁区,2019年,通过这种方法加工了170个基质。其中56%产生线虫,其中没有一个是Caenorhabditis。这种方法有效,因为线虫游过擦拭物。
但基质和其他动物留在顶部。协议的许多方面都可以修改,以利用现场可用的任何资源。使用这种方法收集的样本使研究人员能够将广泛的群体生物学问题解决到已建立的培养物中,以便随后进行实验室研究。