脑类器官中单细胞和单核转录组的生成和下游分析

我们正在开发和优化类器官模型，以便将其应用于疾病建模。我们的目标是了解疾病发展和进展的分子机制，我们正在与Nikolaus Rajewsky实验室密切合作，该实验室正在开发和应用单细胞和空间技术，以了解RNA如何在健康和疾病中调节基因表达。近年来，脑类器官已成为研究患者特定疾病的实验和转化平台。

因此，最近的发展旨在提高大脑类器官模型的复杂性也就不足为奇了。例如，我们现在能够生成大脑区域特异性类器官，并且还可以使用大脑类器官进行多类器官组装。此外，已经实施了各种方法将血管形成和免疫细胞引入大脑类器官。

目前，我们在这个实验室中使用的最具研究进展的技术之一是空间转录组学，它可以评估完整组织内的基因表达。这对于理解不同细胞类型的基因表达谱在一个组织内的不同区域如何变化至关重要。最近取得的另一项进展是单细胞多组学，它允许分析单细胞的多个模块，从而为分析这些细胞提供了一种更全面的方法。

我们采用脑类器官以及单细胞和空间转录组学方法来了解人类疾病的潜在机制，例如 Leigh 综合征和单纯疱疹性脑炎。此外，我们还开发了高分辨率且具有成本效益的空间转录组学方法，称为 Open-ST。我们比较并优化了单细胞和单核 RNA 测序方法，以了解它们在脑类器官组织中细胞类型恢复方面的表现。