用于定量小 RNA 的 AQRNA-seq

AQRNA 测序可定量绘制几乎任何细胞或组织样本中的小 RNA，如 microRNA、tRNA 和 tRNA 片段。它可用于绘制 170 种已知 tRNA 修饰中的一些，但还有其他方法对定位更具体。您可以使用 AQRNA-seq 发现 RNome 中的疾病生物标志物，并在系统水平上探索蛋白质翻译机制。

大多数 RNA-seq 方法无法准确定量样品中单个 RNA 分子的丰度。这是由 RNA 的结构特性（例如二级结构、转录后修饰）以及文库制备的生物化学（例如由 RNA 上的末端核苷酸诱导的 1000 倍的连接偏差）引起的。AQRNA-seq 的开发是为了克服一些技术和生物学挑战，这些挑战限制了样品中 RNA 丰度的准确定量。

与其他物质相比，它实现了 RNA 分子的重新计数和拷贝数之间的线性，准确地量化了 75% 的参比文库，以两倍的准确度压缩了 963 个 microRNA。AQRNA-seq 在提供小 RNA 的绝对定量方面是独一无二的。这将测序重新计数直接与样品中 RNA 分子的拷贝数联系起来。

这种准确度对于比较样品中的数十到数百种 tRNA 至关重要，它与常规的小 RNA-seq 不同，后者只允许跨条件和样品进行相对定量。我们设计了 AQRNA-seq，以满足理解蛋白质翻译方面未满足的需求。我们发现，细胞在修饰的 tRNA 的拷贝数中重新编程了数十种 tRNA 修饰，以允许选择性翻译富含与这些 tRNA 匹配的密码子的信使 RNA。

AQRNA-seq 使我们能够量化 tRNA 库的变化，作为该机制的一部分。我们已经广泛使用它来验证这种新的蛋白质翻译模型。