Estimating Virus Production Rates in Aquatic Systems

Viruses are pervasive components of marine and freshwater systems, and are known to be significant agents of microbial mortality. Developing quantitative ...

Integrated Field Lysimetry and Porewater Sampling for Evaluation of Chemical Mobility in Soils and Established Vegetation

Potentially toxic chemicals are routinely applied to land to meet growing demands on waste management and food production, but the fate of these chemicals ...

University of Tennessee

North Carolina State University

&#x5FAE;&#x751F;&#x7269; rhodopsins &#x662F;&#x5229;&#x7528;&#x89C6;&#x7F51;&#x819C;&#x7684;&#x53D1;&#x8272;&#x56E2;&#x6536;&#x83B7;&#x9633;&#x5149;&#x7684;&#x819C;&#x86CB;&#x767D;&#x7CBE;&#x529B;&#x5145;&#x6C9B;&#x548C; photosensory &#x51FD;&#x6570;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#xFF0C;&#x4E00;&#x7EC4;&#x540D;&#x4E3A; actinorhodopsins (ActRs) &#x7684;&#x65B0;&#x578B;&#x89C6;&#x7D2B;&#x7EA2;&#x8D28;&#x5E8F;&#x5217;&#x88AB;&#x5047;&#x8BBE;&#x5B58;&#x5728;&#x4E4B;&#x95F4;&#x8BED;&#x4F53;&#x6587;&#x6D6E;&#x6E38;&#x653E;&#x7EBF;&#x83CC;&#x3002;ActRs &#x53D1;&#x73B0;&#x4E86;&#x6587;&#x7279;&#x5C14;&#x7814;&#x7A76;&#x6240;&#x5168;&#x7403;&#x6D77;&#x6D0B;&#x53D6;&#x6837;&#x8FDC;&#x5F81;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x542B;&#x76D0;&#x73AF;&#x7901;&#x6E56;&#x3001; &#x4E24;&#x6CB3;&#x53E3;&#x548C;&#x6DE1;&#x6C34;&#x6E56;&#x6CCA;&#x671F;&#x95F4;&#x83B7;&#x5F97;&#x7684;&#x6316;&#x6398;&#x5B8F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6570;&#x636E;&#x3002;&#x6839;&#x636E;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x8C03;&#x67E5;&#x7ED3;&#x679C;&#x548C;&#x5F88;&#x591A;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#x653E;&#x7EBF;&#x83CC;&#x662F;&#x666E;&#x901A;&#x5C45;&#x6C11;&#x7684;&#x6E56;&#x6CCA;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x9884;&#x6D4B;&#x5728;&#x5176;&#x4ED6;&#x6DE1;&#x6C34;&#x751F;&#x5883;&#x548C;&#x8015;&#x5730;&#x653E;&#x7EBF;&#x83CC;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E4B;&#x95F4;&#x53EF;&#x80FD;&#x4F1A;&#x5B58;&#x5728; ActR &#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F7F;&#x7528;&#x9000;&#x5316;&#x7684;&#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x94FE;&#x53CD;&#x5E94;&#x5F15;&#x7269;&#xFF0C;&#x53D1;&#x73B0; ActR &#x57FA;&#x56E0;&#x5B58;&#x5728;&#x4E8E;&#x5BB6;&#x5EAD; Microbacteriaceae actinobacterial &#x5206;&#x79BB;&#x3002;&#x9694;&#x79BB; MWH Uga1 &#x662F;&#x8015;&#x5730;&#x4E4B;&#x524D;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x4ECE;&#x4E4C;&#x5E72;&#x8FBE;&#x6DE1;&#x6C34;&#x6C60;&#x5858;&#x548C;&#x6240;&#x5C5E;&#x7684;&#x7EC4;&#x7684;&#x5148;&#x524D;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;&#x6DE1;&#x6C34;&#x751F;&#x6001;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4E2D;&#x7684;&#x653E;&#x7EBF;&#x83CC;&#x3002;ActR &#x57FA;&#x56E0;&#x8FD8;&#x53D1;&#x73B0;&#x4E86;&#x76EE;&#x524D;&#x5728;&#x8BB8;&#x591A;&#x542B;&#x6DE1;&#x6C34;&#x653E;&#x7EBF;&#x83CC;&#x7684;&#x6DF7;&#x5408;&#x6587;&#x5316;&#x548C;&#x73AF;&#x5883; DNA &#x6837;&#x672C;&#x53D6;&#x81EA;&#x4E09;&#x4E2A;&#x6DE1;&#x6C34;&#x6765;&#x6E90; &#xFF1B;&#x5C0F;&#x6797;&#x5730;&#x6C60;&#x5858;&#x91CC;&#x548C;&#x52B3;&#x4F26;&#x7434;&#x5927;&#x6E56;&#x4E0A;&#x7EA7;&#x548C;&#x4F0A;&#x5229;&#x6E56;&#x3002;&#x5C0F;&#x4E9A;&#x57FA;&#x6838;&#x7CD6;&#x4F53; RNA &#x57FA;&#x56E0;&#x4ECE;&#x7A9D;&#x85CF; ActR &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x5B8F;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; DNA &#x6837;&#x672C;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x8868;&#x660E;&#x5C5E;&#x4E8E; acI &#x6CBF;&#x88AD;&#x7684;&#x6709;&#x673A;&#x4F53;&#xFF0C;&#x653E;&#x7EBF;&#x83CC;&#x8BED;&#x4F53;&#x6587;&#x7684;&#x7EC4;&#x5E38;&#x7528;&#x65B0;&#x9C9C;&#x6C34;&#x57DF;&#xFF0C;&#x53EF;&#x5229;&#x7528; rhodopsins&#x3002;AcI &#x673A;&#x4F53;&#x7279;&#x5B9A; ActR &#x53D8;&#x4F53;&#xFF0C;&#x5728;&#x6DF7;&#x5408;&#x6587;&#x5316;&#x7684;&#x5171;&#x751F;&#x652F;&#x6301;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x5047;&#x8BBE;&#x3002;

Actinorhodopsin &#x57FA;&#x56E0;&#x53D1;&#x73B0;&#x7684;&#x591A;&#x79CD;&#x6DE1;&#x6C34;&#x751F;&#x5883;&#xFF0C;&#x9664;&#x8015;&#x5730;&#x6DE1;&#x6C34;&#x653E;&#x7EBF;&#x83CC;&#x3002;

Microbial rhodopsins are membrane proteins that utilize a retinal chromophore to harvest sunlight for energetic and photosensory functions. Recently, a group of novel rhodopsin sequences named 'actinorhodopsins' (ActRs) was hypothesized to exist among uncultured planktonic Actinobacteria. ActRs were discovered by mining metagenomic data obtained during the Venter Institute's Global Ocean Sampling expedition, from a hypersaline lagoon, two estuaries and a freshwater lake. On the basis of these findings, and many studies that show Actinobacteria are common inhabitants of lakes, we predicted that ActR genes would likely be present in other freshwater habitats and among the genomes of cultivated Actinobacteria. Using degenerate polymerase chain reaction primers, we discovered an ActR gene present in an actinobacterial isolate of the family Microbacteriaceae. Isolate MWH-Uga1 was cultivated prior to this study from a freshwater pond in Uganda and belongs to a group of Actinobacteria previously identified in freshwater ecosystems. ActR genes were also discovered present in numerous mixed cultures containing freshwater Actinobacteria and among environmental DNA samples obtained from three freshwater sources; a small woodland pond and the Laurentian Great Lakes Superior and Erie. An analysis of small subunit ribosomal RNA genes from metagenomic DNA samples harboring ActR genes suggests that organisms belonging to the acI lineage, an uncultured group of Actinobacteria commonly present in fresh waters, may utilize rhodopsins. The co-occurrence of an acI organism with a specific ActR variant in a mixed culture supports our hypothesis.

Actinorhodopsin genes discovered in diverse freshwater habitats and among cultivated freshwater Actinobacteria.

Rhodopsins microbiens sont des prot&#xE9;ines membranaires qui utilisent un chromophore r&#xE9;tinal &#xE0; r&#xE9;colter la lumi&#xE8;re du soleil pour les fonctions &#xE9;nerg&#xE9;tiques et photosensory. R&#xE9;cemment, un groupe de s&#xE9;quences rhodopsine nouveaux nomm&#xE9;s &#xAB;actinorhodopsins &#x26;#39;(ActRs) a &#xE9;mis l&#x26;#39;hypoth&#xE8;se d&#x26;#39;exister parmi les planctoniques inculte Actinobacteria. ActRs ont &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;couverts par des donn&#xE9;es m&#xE9;tag&#xE9;nomiques mini&#xE8;res obtenus au cours de l&#x26;#39;Institut Venter de l&#x26;#39;exp&#xE9;dition d&#x26;#39;&#xE9;chantillonnage oc&#xE9;an mondial, &#xE0; partir d&#x26;#39;un lagon hypersalin, deux estuaires et un lac d&#x26;#39;eau douce. Sur la base de ces constatations, et de nombreuses &#xE9;tudes qui montrent Actinobacteria sont des habitants communs des lacs, nous avons pr&#xE9;dit que les g&#xE8;nes ARTC serait probablement pr&#xE9;sent dans d&#x26;#39;autres habitats d&#x26;#39;eau douce et entre les g&#xE9;nomes de Actinobacteria cultiv&#xE9;e. En utilisant des amorces d&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;r&#xE9;es en cha&#xEE;ne par polym&#xE9;rase, nous avons d&#xE9;couvert un g&#xE8;ne pr&#xE9;sent dans un ACTR actinobacterial isoler de l&#x26;#39;Microbacteriaceae famille. Isoler MWH-Uga1 a &#xE9;t&#xE9; cultiv&#xE9; avant cette &#xE9;tude &#xE0; partir d&#x26;#39;un &#xE9;tang d&#x26;#39;eau douce en Ouganda et appartient &#xE0; un groupe de Actinobacteria pr&#xE9;c&#xE9;demment identifi&#xE9;s dans les &#xE9;cosyst&#xE8;mes d&#x26;#39;eau douce. G&#xE8;nes ARTC ont &#xE9;galement &#xE9;t&#xE9; d&#xE9;couverts pr&#xE9;sents dans de nombreux cultures mixtes contenant d&#x26;#39;eau douce Actinobacteria et parmi des &#xE9;chantillons d&#x26;#39;ADN de l&#x26;#39;environnement obtenus &#xE0; partir de trois sources d&#x26;#39;eau douce; un petit &#xE9;tang bois et des Laurentides Grands Lacs Sup&#xE9;rieur et &#xC9;ri&#xE9;. Une analyse de sous-unit&#xE9;s de petites g&#xE8;nes de l&#x26;#39;ARN ribosomal des &#xE9;chantillons d&#x26;#39;ADN m&#xE9;tag&#xE9;nomique portant des g&#xE8;nes ARTC sugg&#xE8;re que les organismes appartenant &#xE0; la lign&#xE9;e aci, un groupe inculte des Actinobact&#xE9;ries commun&#xE9;ment pr&#xE9;sents dans les eaux douces, peuvent utiliser rhodopsins. La co-occurrence d&#x26;#39;un organisme aci avec une variante de l &#x26;#39;ARTC sp&#xE9;cifique dans une culture mixte confirme notre hypoth&#xE8;se.

Les g&#xE8;nes Actinorhodopsin D&#xE9;couvert dans les habitats d&#x26;#39;eau douce et diverses Parmi d&#x26;#39;eau douce cultiv&#xE9;es Actinobacteria

Mikrobielle Rhodopsin sind Membranproteine, die eine retinale Chromophor um Sonnenlicht f&uuml;r Ernte nutzen energetische und lichtempfindlichen Funktionen. Vor kurzem wurde eine Gruppe von Roman Rhodopsin-Sequenzen, die mit dem Namen &#39;Actinorhodopsins&#39; (ActRs) Hypothese, um zwischen den ungebildeten Plankton Actinobacteria. ActRs entdeckte Mining durchgef&uuml;hrte metagenomische Daten w&auml;hrend die Venter Institute Global Ocean-Sampling-Expedition, von einer Lagune hypersaliner, zwei M&uuml;ndungen und ein S&uuml;&szlig;wassersee. Auf der Grundlage dieser Ergebnisse und viele Studien, die zeigen Actinobacteria sind h&auml;ufige Bewohner von Seen, prognostizierten wir, dass ActR Gene wahrscheinlich vorhanden in anderen S&Uuml;SSWASSERLEBENSR&Auml;UME und unter den Genomen von kultivierten Actinobacteria w&auml;re. Mit degenerierten Polymerase Kettenreaktion Z&uuml;ndkapseln, entdeckten wir ein ActR gen in Actinobacterial isoliert von der Familie Microbacteriaceae vorhanden. Eingreiftruppe MWH-Uga1 wurde vor dieser Studie aus einem S&uuml;&szlig;wasser Teich in Uganda angebaut und geh&ouml;rt zu einer Gruppe von Actinobacteria, die vorher in der S&uuml;&szlig;wasser-&Ouml;kosysteme identifiziert. ActR Gene wurden auch in zahlreichen Mischkulturen mit S&uuml;&szlig;wasser Actinobacteria und unter Umwelt DNA Proben aus drei S&uuml;&szlig;wasser-Quellen entdeckt; ein kleiner Wald-Teich und der Laurentian Great Lakes Superior und Erie. Eine Analyse der kleine Untereinheit Ribosomale RNA Gene aus durchgef&uuml;hrte metagenomische DNA-Proben beherbergen ActR Gene legt nahe, dass Organismen geh&ouml;ren die AcI-Linie, eine ungebildeten Gruppe von Actinobacteria h&auml;ufig stellen in S&uuml;&szlig;wasser, Rhodopsin nutzen kann. Das gleichzeitige Auftreten eines AcI-Organismus mit einer speziellen ActR-Variante in einer gemischten Kultur unterst&uuml;tzt unsere Hypothese.

Actinorhodopsin Gene entdeckt diverse S&Uuml;SSWASSERLEBENSR&Auml;UME und unter den kultivierten S&uuml;&szlig;wasser Actinobacteria.

Rhodopsins microbica sono proteine di membrana che si avvalgono di un cromoforo retina per raccogliere la luce solare per energico e funzioni photosensory. Recentemente, un gruppo di sequenze di rodopsina romanzo denominato &#39;actinorhodopsins&#39; (ActRs) &egrave; stato ipotizzato per esistere tra incolto Actinobacteria planctonica. ActRs sono stati scoperti da dati metagenomica estrazione ottenuti durante la spedizione di Global Ocean campionamento di Venter Institute, da una laguna ipersalina, due estuari e un lago d&#39;acqua dolce. Sulla base di questi risultati e molti studi che mostrano Actinobacteria sono comuni abitanti di laghi, avevamo previsto che geni ActR sarebbe probabilmente presente in altri habitat d&#39;acqua dolce e tra i genomi di Actinobacteria coltivata. Utilizzando primer di reazione a catena della polimerasi degenerato, abbiamo scoperto un gene ActR presente in un isolato del actinobacterial della famiglia Microbacteriaceae. Isolare MWH-Uga1 &egrave; stato coltivato prima di questo studio da un laghetto d&#39;acqua dolce in Uganda e appartiene a un gruppo di Actinobacteria precedentemente identificato negli ecosistemi d&#39;acqua dolci. ActR geni sono stati scoperti anche presente in numerose culture miste contenenti acqua dolce Actinobacteria e tra i campioni di DNA ambientali ottenuti da tre sorgenti di acqua dolce; un piccolo stagno nei boschi e la Laurentian Great Lakes Superior ed Erie. Un&#39;analisi dei geni RNA ribosomiale piccole subunit&agrave; da campioni di DNA metagenomica harboring ActR geni suggerisce che organismi appartenenti alla stirpe di acI, un gruppo di Actinobacteria incolto comunemente presenti nelle acque fresche, pu&ograve; utilizzare rhodopsins. La concomitanza di un organismo di acI con una variante specifica ActR in una coltura mista sostiene la nostra ipotesi.

Actinorhodopsin geni scoperti in diversi habitat d&#39;acqua dolce e tra coltivata d&#39;acqua dolce Actinobacteria.

&#x5FAE;&#x751F;&#x7269;&#x30ED;&#x30C9;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3;&#x306F;&#x30A8;&#x30CD;&#x30EB;&#x30AE;&#x30C3;&#x30B7;&#x30E5;&#x3067;photosensory&#x6A5F;&#x80FD;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x65E5;&#x5149;&#x3092;&#x53CE;&#x7A6B;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x30EC;&#x30C1;&#x30CA;&#x30FC;&#x30EB;&#x767A;&#x8272;&#x56E3;&#x3092;&#x5229;&#x7528;&#x3057;&#x305F;&#x819C;&#x86CB;&#x767D;&#x8CEA;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x6700;&#x8FD1;&#x3001; &#x26;quot;actinorhodopsins &#x26;#39;&#xFF08;ActRs&#xFF09;&#x3068;&#x3044;&#x3046;&#x5C0F;&#x8AAC;&#x30ED;&#x30C9;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306F;&#x3001;&#x653E;&#x7DDA;&#x83CC;&#x6559;&#x990A;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x6D6E;&#x904A;&#x9593;&#x306B;&#x5B58;&#x5728;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x4EEE;&#x5B9A;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; ActRs&#x306F;&#x3001;&#x30D9;&#x30F3;&#x30BF;&#x30FC;&#x7814;&#x7A76;&#x6240;&#x306E;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#xB7;&#x30AA;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E3;&#x30F3;&#xB7;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x821F;&#x30E9;&#x30B0;&#x30FC;&#x30F3;&#x304B;&#x3089;&#x9060;&#x5F81;&#x3001;&#x4E8C;&#x3064;&#x306E;&#x6CB3;&#x53E3;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x6DE1;&#x6C34;&#x6E56;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x30DE;&#x30A4;&#x30CB;&#x30F3;&#x30B0;&#x30E1;&#x30BF;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x304C;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x77E5;&#x898B;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x3001;&#x653E;&#x7DDA;&#x83CC;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x6E56;&#x306E;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306A;&#x4F4F;&#x6C11;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;ACTR&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x304A;&#x305D;&#x3089;&#x304F;&#x4ED6;&#x306E;&#x6DE1;&#x6C34;&#x306E;&#x751F;&#x606F;&#x5730;&#x3084;&#x683D;&#x57F9;&#x653E;&#x7DDA;&#x83CC;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x5B58;&#x5728;&#x3059;&#x308B;&#x3060;&#x308D;&#x3046;&#x3068;&#x4E88;&#x6E2C;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30DD;&#x30EA;&#x30E1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x9023;&#x9396;&#x53CD;&#x5FDC;&#x306E;&#x7E2E;&#x91CD;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30FC;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x5BB6;&#x65CF;&#x306E;Microbacteriaceae&#x306E;&#x5206;&#x96E2;actinobacterial&#x3067;ACTR&#x5B58;&#x5728;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5206;&#x96E2;MWH-Uga1&#x306F;&#x30A6;&#x30AC;&#x30F3;&#x30C0;&#x306E;&#x6DE1;&#x6C34;&#x6C60;&#x304B;&#x3089;&#x3001;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x306B;&#x5148;&#x7ACB;&#x3063;&#x3066;&#x683D;&#x57F9;&#x3057;&#x3001;&#x4EE5;&#x524D;&#x306E;&#x6DE1;&#x6C34;&#x751F;&#x614B;&#x7CFB;&#x3067;&#x8B58;&#x5225;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x653E;&#x7DDA;&#x83CC;&#x306E;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306B;&#x5C5E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x5C0F;&#x3055;&#x306A;&#x68EE;&#x306E;&#x6C60;&#x3068;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B7;&#x30E3;&#x30F3;&#x4E94;&#x5927;&#x6E56;&#x3001;&#x30B9;&#x30FC;&#x30DA;&#x30EA;&#x30A2;&#x3001;&#x30A8;&#x30EA;&#x30FC;&#x3001;ACTR&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x653E;&#x7DDA;&#x83CC;&#x3001;&#x4E09;&#x6DE1;&#x6C34;&#x6E90;&#x304B;&#x3089;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x74B0;&#x5883;DNA&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x9593;&#x306E;&#x6DE1;&#x6C34;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x6DF7;&#x5408;&#x57F9;&#x990A;&#x306B;&#x5B58;&#x5728;&#x3057;&#x3066;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; ACTR&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x4FDD;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x30E1;&#x30BF;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;DNA&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x304B;&#x3089;&#x5C0F;&#x30B5;&#x30D6;&#x30E6;&#x30CB;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EA;&#x30DC;&#x30BD;&#x30FC;&#x30E0;RNA&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x306F;&#x3001;ACI&#x7CFB;&#x7D71;&#x3001;&#x6DE1;&#x6C34;&#x3067;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306B;&#x5B58;&#x5728;&#x3059;&#x308B;&#x653E;&#x7DDA;&#x83CC;&#x306E;&#x6559;&#x990A;&#x306E;&#x306A;&#x3044;&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306B;&#x5C5E;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x751F;&#x7269;&#x306F;&#x3001;&#x30ED;&#x30C9;&#x30D7;&#x30B7;&#x30F3;&#x3092;&#x5229;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x6DF7;&#x5408;&#x57F9;&#x990A;&#x3067;&#x7279;&#x5B9A;&#x306E;ACTR&#x30D0;&#x30EA;&#x30A2;&#x30F3;&#x30C8;&#x3068;ACI&#x306E;&#x751F;&#x7269;&#x306E;&#x5171;&#x8D77;&#x306F;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x4EEE;&#x8AAC;&#x3092;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x591A;&#x69D8;&#x306A;&#x6DE1;&#x6C34;&#x751F;&#x606F;&#x5730;&#x3084;&#x653E;&#x7DDA;&#x83CC;&#x683D;&#x57F9;&#x6DE1;&#x6C34;&#x4E2D;&#x3067;&#x767A;&#x898B;&#x3055;&#x308C;&#x305F;Actinorhodopsin&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;

&#xBBF8;&#xC0DD;&#xBB3C; rhodopsins&#xC740; &#xB9DD;&#xB9C9; &#xBC1C; &#xD587;&#xBE5B;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC218;&#xD655;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xBA64;&#xBE0C;&#xB808;&#xC778; &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC815;&#xB825; &#xBC0F; photosensory &#xD568;&#xC218;. &#xCD5C;&#xADFC;, &#39;actinorhodopsins&#39; (ActRs) &#xB77C;&#xB294; &#xC18C;&#xC124; rhodopsin &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; &#xADF8;&#xB8F9;&#xC740; &#xBC40;&#xACFC; planktonic Actinobacteria &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xC874;&#xC7AC; &#xD558; &#xAC00;&#xC124;&#xC744; &#xC138;&#xC6E0;&#xB2E4;. ActRs hypersaline &#xB77C;&#xAD70;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBCA4; &#xD130; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC18C;&#xC758; &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xC624;&#xC158; &#xC0D8;&#xD50C;&#xB9C1; &#xC6D0;&#xC815;&#xB300;, &#xB450; &#xD558; &#xAD6C; &#xBC0F; &#xB2F4; &#xC218; &#xD638;&#xC218; &#xC911; metagenomic &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB410;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; Actinobacteria&#xC740; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC778; &#xD638;&#xC218; &#xBCF4;&#xAE30; &#xB9CE;&#xC740; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; &#xADFC;&#xAC70; &#xD558; &#xC5EC; &#xC6B0;&#xB9AC; ActR &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC788;&#xC744; &#xAC83; &#xC608;&#xC0C1; &#xAC00;&#xB2A5;&#xC131;&#xC774; &#xD604;&#xC7AC; &#xB2E4;&#xB978; &#xB2F4; &#xC218; &#xC11C;&#xC2DD; &#xC9C0;&#xC640; &#xC7AC;&#xBC30; Actinobacteria&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC911;&#xC5D0;&#xC11C;. &#xD0C0;&#xB77D; &#xD55C; &#xC911; &#xD569; &#xD6A8;&#xC18C; &#xC5F0;&#xC1C4; &#xBC18;&#xC751; &#xD504;&#xB77C;&#xC774; &#xBA38;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xAC00;&#xC871; Microbacteriaceae&#xC758; actinobacterial &#xBD84;&#xB9AC;&#xC5D0; ActR &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xACA9;&#xB9AC; MWH uga1&#xB294; &#xC6B0;&#xAC04;&#xB2E4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2F4; &#xC218; &#xC5F0;&#xBABB;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC7AC;&#xBC30; &#xD558; &#xACE0; &#xB2F4; &#xC218; &#xC0DD;&#xD0DC;&#xACC4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xD655;&#xC778; &#xB41C; Actinobacteria &#xADF8;&#xB8F9;&#xC5D0; &#xC18D;&#xD55C;&#xB2E4;. ActR &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB610;&#xD55C; &#xB2F4; &#xC218; Actinobacteria&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xC218;&#xB9CE;&#xC740; &#xD63C;&#xD569;&#xB41C; &#xBB38;&#xD654; &#xBC0F; &#xD658;&#xACBD; DNA &#xC0D8;&#xD50C; 3 &#xAC1C; &#xB2F4; &#xC218; &#xC18C;&#xC2A4;;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5BB;&#xC740; &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xC874;&#xC7AC; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4; &#xC791;&#xC740; &#xC232; &#xC5F0;&#xBABB; Laurentian &#xC624;&#xB300;&#xD638; &#xC288;&#xD37C;&#xC640;&#xC774; &#xB9AC;. Metagenomic DNA &#xC0D8;&#xD50C; ActR &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC740;&#xB2C9;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC791;&#xC740; &#xC18C; &#xB2E8;&#xC704; &#xB9AC;&#xBCF4;&#xC19C; RNA &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xBD84;&#xC11D; &#xC81C;&#xC548;&#xB294; acI &#xACC4;&#xBCF4;&#xC5D0; &#xC18D;&#xD558;&#xB294; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xBBF8; &#xADF8;&#xB8F9; Actinobacteria&#xC758; &#xC77C;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC2E0;&#xC120;&#xD55C; &#xBB3C;&#xC5D0;, rhodopsins&#xB97C; &#xC774;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD63C;&#xD569; &#xBB38;&#xD654;&#xC5D0;&#xC11C; &#xD2B9;&#xC815; ActR &#xBCC0;&#xC885; acI &#xAE30;&#xCCB4;&#xC758; &#x8D77; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xAC00;&#xC124;&#xC744; &#xC9C0;&#xC6D0;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Actinorhodopsin &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xB2F4; &#xC218; &#xC11C;&#xC2DD; &#xC9C0;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xB41C;&#xC640; &#xC911;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB2F4; &#xC218; Actinobacteria&#xB97C; &#xC7AC;&#xBC30;.

Rodopsinas microbianos son prote&#xED;nas de membrana que utilizan un crom&#xF3;foro retinal para cosechar la luz del sol para las funciones energ&#xE9;ticas y photosensory. Recientemente, un grupo de nuevas secuencias de rodopsina llamado &#x26;#39;actinorhodopsins&#x26;#39; (ActRs) plante&#xF3; la hip&#xF3;tesis de que existe entre los planct&#xF3;nicos Actinobacteria inculto. ActRs fueron descubiertos por los datos obtenidos durante la metagen&#xF3;mica mineras Global del Instituto Venter expedici&#xF3;n de muestreo al Mar, a partir de una laguna hipersalina, dos estuarios y un lago de agua dulce. Sobre la base de estos resultados contradictorios y muchos estudios que muestran Actinobacteria son habitantes comunes de los lagos, predijo que los genes ACTR es probable que est&#xE9; presente en otros h&#xE1;bitats de agua dulce y entre los genomas de Actinobacteria cultivada. Utilizando cebadores degenerados reacci&#xF3;n en cadena de la polimerasa, hemos descubierto un gen presente en un ACTR actinobacterial aislado del Microbacteriaceae familia. Aislar MWH-Uga1 se cultivaba antes de este estudio a partir de un estanque de agua dulce en Uganda y pertenece a un grupo de Actinobacteria previamente identificados en los ecosistemas de agua dulce. ACTR genes fueron descubiertos tambi&#xE9;n est&#xE1; presente en numerosos cultivos mixtos que contienen agua dulce Actinobacteria y entre las muestras de ADN obtenidas del medio ambiente a partir de tres fuentes de agua dulce, un peque&#xF1;o estanque de los bosques y la Laurentian Great Lakes Superior y Erie. Un an&#xE1;lisis de los genes de la subunidad peque&#xF1;a ribosomal RNA de muestras de ADN metagen&#xF3;micas albergan genes ACTR sugiere que los organismos que pertenecen al linaje de ACI, un grupo de incultos de Actinobacteria com&#xFA;nmente presentes en las aguas dulces, puede utilizar la rodopsina. La co-ocurrencia de un organismo aci con una variante espec&#xED;fica ACTR en un cultivo mixto apoya nuestra hip&#xF3;tesis.

Los genes Actinorhodopsin Descubierto en los h&#xE1;bitats de agua dulce diversos y entre agua dulce cultivada Actinobacteria

&#x76F8;&#x5F53;&#x591A;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x660E;&#x84DD;&#x85FB;&#x548C;&#x4ED6;&#x4EEC; (&#x566C;&#x85FB;&#x4F53;&#xFF09; &#x611F;&#x67D3;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x662F;&#x666E;&#x904D;&#x548C;&#x5168;&#x7403;&#x6E56;&#x4EBA;&#x53E3;&#x4E2D;&#x4E0D;&#x540C;&#x3002;&#x51E0;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x6709;&#x5B63;&#x8282;&#x6027;&#x5206;&#x6790;&#x6DE1;&#x6C34;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x548C;&#x7EA6;&#x7684;&#x7EC6;&#x83CC;&#x548C;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x793E;&#x533A;&#xFF0C;&#x5728;&#x4E25;&#x9177;&#x7684;&#x5BD2;&#x51AC;&#x7684;&#x52B3;&#x4F26;&#x7434;&#x5927;&#x6E56;&#x533A;&#x5171;&#x5B58;&#x6240;&#x77E5;&#x751A;&#x5C11;&#x3002;&#x5728;&#x8FD9;&#x91CC;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x91C7;&#x7528;&#x8367;&#x5149;&#x5B9A;&#x91CF; PCR &#x6765;&#x4F30;&#x8BA1;&#x5728;&#x6B64;&#x7CFB;&#x7EDF;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x4F7F;&#x7528;&#x95E8;&#x6237;&#x9876;&#x70B9; g20 &#x57FA;&#x56E0;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x4EE3;&#x7406;&#x566C;&#x85FB;&#x4F53;&#x4E30;&#x5EA6;&#x7684;&#x4E30;&#x5EA6;&#x7684; cyanomyoviruses&#xFF0C;&#x5E76;&#x786E;&#x5B9A;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x6F5C;&#x5728;&#x751F;&#x6001;&#x76F8;&#x5173;&#x6027;&#x3002;Cyanomyoviruses &#x5728;&#x4E30;&#x5BCC;&#x590F;&#x5B63;&#x548C;&#x51AC;&#x5B63;&#x7684;&#x610F;&#x89C1;&#xFF0C;&#x4E0E; g20 &#x57FA;&#x56E0; ml(-1) &#x5728;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x5B63;&#x8282;&#xFF0C;&#x53D1;&#x73B0;&#x5728;&#x51E0;&#x4E2A;&#x5730;&#x70B9;&#x548C;&#x6DF1;&#x5EA6;&#x8FBE; 3.1 &times; 10(6) &#x526F;&#x672C;&#x5360;&#x603B;&#x75C5;&#x6BD2;&#x793E;&#x533A;&#x8FBE; 4.6%&#x3002;&#x4F0A;&#x5229;&#x6E56;&#x662F;&#x751F;&#x4EA7;&#x671F;&#x95F4;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x89C2;&#x5BDF;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x9AD8;&#x53F6;&#x7EFF;&#x7D20; a &#x6D53;&#x5EA6;&#x5728;&#x590F;&#x5929; (&#x8FBE; 10.3 &mu; liter(-1)) &#x548C;&#x51AC;&#x5B63; (&#x8FBE; 5.2 &mu; liter(-1))&#x3002;&#x7EC6;&#x83CC;&#x548C;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x4E30;&#x5EA6;&#x5728;&#x51AC;&#x5B63;&#x6BD4;&#x590F;&#x5B63;&#x671F;&#x95F4;&#x88AB;&#x663E;&#x8457;&#x8F83;&#x9AD8; (P &lt; 0.05&#xFF09;&#x3002;&#x590F;&#x5B63;&#x7EC6;&#x83CC;&#x4E30;&#x5EA6;&#x4ECB;&#x4E4E; 3.3 &times; 10(6) &#x81F3; 1.6 &times; 10(7) ml(-1) &#x867D;&#x7136;&#x51AC;&#x5929;&#x4E30;&#x5EA6; &sim;3.4 &times; 10(5) &#x548C; 1.2 &times; 10(6) ml(-1) &#x4E4B;&#x95F4;&#x4E0D;&#x7B49;&#x3002;&#x603B;&#x75C5;&#x6BD2;&#x4E30;&#x5EA6;&#x9AD8;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x6708;&#x671F;&#x95F4;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x590F;&#x5B63;&#x4E30;&#x5EA6;&#x660E;&#x663E;&#x9AD8;&#x4E8E;&#x6700;&#x7AD9;&#x3001; 8.8 &times; 10(7) ml(-1)&#xFF0C;&#x5E76;&#x4ECE; 3.4 &times; 10(7) &#x5230; 6.6 &times; 10(7) ml(-1) &#x51AC;&#x5B63;&#x4E30;&#x5EA6;&#x4E0E;&#x4ECE; 6.5 &times; 10(7)&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x5DE5;&#x4F5C;&#x786E;&#x8BA4;&#x5047;&#x5B9A; cyanomyoviruses &#x662F;&#x65E0;&#x5904;&#x4E0D;&#x5728;&#x7684;&#x8FD9;&#x4E24;&#x4E2A;&#x590F;&#x5B63;&#xFF0C;&#x51AC;&#x5B63;&#x51E0;&#x4E2A;&#x6708;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E2A;&#x5927;&#x578B;&#x6DE1;&#x6C34;&#x6E56;&#x6CCA;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x800C;&#x4E14;&#x5B83;&#x4EEC;&#x662F;&#x4E30;&#x5BCC;&#x7684;&#x6D6E;&#x6E38;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7EC4;&#x7EC4;&#x4EF6;&#x3002;

&#x52B3;&#x4F26;&#x7434;&#x5927;&#x6E56;&#x7684;&#x6E56;&#x4E2D;&#x5177;&#x91CD;&#x8981;&#x751F;&#x6001;&#x4EF7;&#x503C;&#x566C;&#x85FB;&#x4F53;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x679A;&#x4E3E;&#x3002;

Considerable research has shown that cyanobacteria and the viruses that infect them (cyanophage) are pervasive and diverse in global lake populations. Few studies have seasonally analyzed freshwater systems, and little is known about the bacterial and viral communities that coexist during the harsh winters of the Laurentian Great Lakes. Here, we employed quantitative PCR to estimate the abundance of cyanomyoviruses in this system, using the portal vertex g20 gene as a proxy for cyanophage abundance and to determine the potential ecological relevance of these viruses. Cyanomyoviruses were abundant in both the summer and the winter observations, with up to 3.1 Ã— 10(6) copies of g20 genes ml(-1) found at several stations and depths in both seasons, representing up to 4.6% of the total virus community. Lake Erie was productive during both our observations, with high chlorophyll a concentrations in the summer (up to 10.3 Î¼g liter(-1)) and winter (up to 5.2 Î¼g liter(-1)). Both bacterial and viral abundances were significantly higher during the summer than during the winter (P < 0.05). Summer bacterial abundances ranged from 3.3 Ã— 10(6) to 1.6 Ã— 10(7) ml(-1) while winter abundances ranged between âˆ¼3.4 Ã— 10(5) and 1.2 Ã— 10(6) ml(-1). Total virus abundances were high during both months, with summer abundances significantly higher at most stations, ranging from 6.5 Ã— 10(7) to 8.8 Ã— 10(7) ml(-1), and with winter abundances ranging from 3.4 Ã— 10(7) to 6.6 Ã— 10(7) ml(-1). This work confirms that putative cyanomyoviruses are ubiquitous in both summer and winter months in this large freshwater lake system and that they are an abundant component of the virioplankton group.

Molecular enumeration of an ecologically important cyanophage in a Laurentian Great Lake.

Beaucoup de recherches ont montr&#xE9; que les cyanobact&#xE9;ries et les virus qui infectent les (cyanophage) sont omnipr&#xE9;sents et la diversit&#xE9; dans les populations des lacs internationaux. Peu d&#x26;#39;&#xE9;tudes ont analys&#xE9; des variations saisonni&#xE8;res des syst&#xE8;mes d&#x26;#39;eau douce, et peu est connu sur les communaut&#xE9;s bact&#xE9;riennes et virales qui coexistent durant les rudes hivers des Grands Lacs laurentiens. Ici, nous avons utilis&#xE9; la PCR quantitative pour estimer l&#x26;#39;abondance des cyanomyoviruses dans ce syst&#xE8;me, en utilisant le portail sommet du g20 g&#xE8;ne comme un proxy pour l&#x26;#39;abondance et cyanophage pour d&#xE9;terminer la pertinence &#xE9;cologique potentiel de ces virus. Cyanomyoviruses &#xE9;taient abondants dans l&#x26;#39;&#xE9;t&#xE9; et les observations d&#x26;#39;hiver, avec un maximum de 3,1 x 10 (6) exemplaires du G20 g&#xE8;nes ml (-1) trouv&#xE9; &#xE0; plusieurs stations et les profondeurs dans les deux saisons, ce qui repr&#xE9;sente jusqu&#x26;#39;&#xE0; 4,6% de la communaut&#xE9; totale des virus . Le lac &#xC9;ri&#xE9; a &#xE9;t&#xE9; productive au cours de nos deux observations, avec quelques concentrations de chlorophylle &#xE9;lev&#xE9;e en &#xE9;t&#xE9; (jusqu&#x26;#39;&#xE0; 10,3 litres ug (-1)) et en hiver (jusqu&#x26;#39;&#xE0; 5,2 litre mg (-1)). Les deux abondances bact&#xE9;riennes et virales &#xE9;taient significativement plus &#xE9;lev&#xE9;s pendant l&#x26;#39;&#xE9;t&#xE9; que pendant l&#x26;#39;hiver (P &#x26;lt;0,05). Abondances bact&#xE9;riennes &#xE9;t&#xE9; variait de 3,3 &#xD7; 10 (6) &#xE0; 1,6 &#xD7; 10 (7) ml (-1) tandis que l&#x26;#39;abondance d&#x26;#39;hiver se situaient entre ~ 3,4 &#xD7; 10 (5) et 1,2 &#xD7; 10 (6) ml (-1). Abondances de virus &#xE9;taient &#xE9;lev&#xE9;s au total au cours des deux mois, avec des abondances d&#x26;#39;&#xE9;t&#xE9; significativement plus &#xE9;lev&#xE9;s dans la plupart des stations, allant de 6,5 &#xD7; 10 (7) &#xE0; 8,8 &#xD7; 10 (7) ml (-1), et avec l&#x26;#39;abondance d&#x26;#39;hiver allant de 3,4 &#xD7; 10 (7 ) &#xE0; 6,6 x 10 (7) ml (-1). Ce travail confirme que cyanomyoviruses putatifs sont omnipr&#xE9;sents dans les mois d&#x26;#39;&#xE9;t&#xE9; et d&#x26;#39;hiver dans ce syst&#xE8;me lac d&#x26;#39;eau douce et qu&#x26;#39;ils sont une composante abondante du groupe virioplankton.

&#xC9;num&#xE9;ration mol&#xE9;culaire d&#x26;#39;un cyanophage &#xE9;cologique important dans un lac des Laurentides Grande

Betr&auml;chtliche Forschung hat gezeigt, dass Cyanobakterien und die Viren, die sie (Cyanophage) infizieren allgegenw&auml;rtig und vielf&auml;ltig in globalen See Populationen. Nur wenige Studien haben saisonal S&uuml;&szlig;wasser Systeme analysiert und &uuml;ber die bakteriellen und viralen Gemeinschaften, die in den strengen Wintern der Laurentian Great Lakes koexistieren ist wenig bekannt. Hier haben wir quantitativen PCR, die F&uuml;lle der Cyanomyoviruses in diesem System, mit das Portal Vertex-g20-gen als Proxy f&uuml;r Cyanophage H&auml;ufigkeit zu sch&auml;tzen und die m&ouml;gliche &ouml;kologische Relevanz dieser Viren bestimmen. Cyanomyoviruses waren reichlich im Sommer und der Winter-Ausf&uuml;hrungen, mit bis zu 3,1 &times; 10 6 Kopien der g20 Gene ml(-1) in beiden Jahreszeiten, an mehreren Stationen und tiefen gefunden, die bis zu 4,6 % der Gesamtzahl der Viren-Gemeinschaft darstellt. Lake Erie war produktiv, w&auml;hrend beide unsere Beobachtungen, mit hohen Chlorophyll A-Konzentrationen im Sommer (bis zu 10,3 &mu;g liter(-1)) und Winter (bis zu 5,2 &mu;g liter(-1)). Sowohl bakterielle und virale H&auml;ufigkeiten wurden im Sommer als im Winter deutlich h&ouml;her (P &lt; 0,05). Sommer bakterielle H&auml;ufigkeiten reichten von 3,3 &times; 10 6 bis 1,6 &times; Haushaltsjahre ab ml(-1), w&auml;hrend Winter H&auml;ufigkeiten zwischen &sim;3.4 &times; 10 Absatz 5 und 1,2 &times; 10 6 ml(-1) reichten. Total Virus H&auml;ufigkeiten waren in beiden Monaten hoch, mit Sommer H&auml;ufigkeiten signifikant h&ouml;her bei den meisten Bahnh&ouml;fen, reicht von 6,5 &times; 7 bis 8.8 &times; Haushaltsjahre ab ml(-1) und mit Winter-H&auml;ufigkeiten von 3,4 &times; Haushaltsjahre ab bis 6,6 &times; Haushaltsjahre ab ml(-1). Diese Arbeit best&auml;tigt, dass die vermeintliche Cyanomyoviruses sind allgegenw&auml;rtig in beiden Sommer und Wintermonaten in diesem gro&szlig;en S&uuml;&szlig;wassersee-System und dass sie sind reichlich Bestandteil der Virioplankton-Gruppe.

Molekulare Enumeration einen &ouml;kologisch wichtigen Cyanophage in einem Laurentian gro&szlig;er See.

Ricerca considerevole ha dimostrato che i cianobatteri e i virus che infettano i loro (cyanophage) sono pervasivi e diversificata nelle popolazioni di lago globale. Pochi studi hanno analizzato stagionalmente sistemi d&#39;acqua dolci, e poco si sa circa le comunit&agrave; batteriche e virali che coesistono durante gli inverni di Laurentian Great Lakes. Qui, abbiamo impiegato PCR quantitativa per stimare l&#39;abbondanza di cyanomyoviruses in questo sistema, usando il gene del g20 vertice portale come un proxy per cyanophage abbondanza e per determinare la potenziale rilevanza ecologica di questi virus. Cyanomyoviruses erano abbondanti in estate e le osservazioni di inverno, con fino a 3,1 &times; 10 copie del g20 geni ml(-1) trovati nelle varie stazioni e profondit&agrave; in entrambe le stagioni, che rappresentano fino al 4,6% della Comunit&agrave; di virus total. Lago Erie era produttivo durante entrambe le nostre osservazioni, con concentrazioni di clorofilla a alta in estate (fino a 10,3 &mu;g liter(-1)) e inverno (fino a 5,2 &mu;g liter(-1)). Batteriche e virali abbondanze erano significativamente pi&ugrave; alte durante l&#39;estate che durante l&#39;inverno (P &lt; 0,05). Estate batteriche abbondanze variava da 3,3 &times; 10 a 1,6 &times; 10 ml(-1) mentre abbondanze inverno variavano tra 5 &times; &sim;3.4 e 1,2 &times; 10 ml(-1). Abbondanza totale virus era alti durante i due mesi, con l&#39;estate abbondanze significativamente superiore a pi&ugrave; stazioni, che vanno da 6,5 &times; 10 &times; 8,8 10 ml(-1) e con abbondanza di inverno che vanno da 3,4 &times; 10 a 6.6 &times; 10 ml(-1). Questo lavoro conferma che cyanomyoviruses putativo sono onnipresenti in entrambi estate e mesi invernali in questo sistema di grande lago d&#39;acqua dolce e che sono una componente abbondante del gruppo virioplankton.

Enumerazione molecolare di un cyanophage ecologicamente importanti in un grande lago Laurenziano.

&#x304B;&#x306A;&#x308A;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x3001;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CE;&#x30D0;&#x30AF;&#x30C6;&#x30EA;&#x30A2;&#x3068;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#xFF08;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CE;&#x30D5;&#x30A1;&#x30FC;&#x30B8;&#xFF09;&#x3092;&#x611F;&#x67D3;&#x3055;&#x305B;&#x308B;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x304C;&#x666E;&#x53CA;&#x3057;&#x3001;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x306A;&#x6E56;&#x96C6;&#x56E3;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x591A;&#x69D8;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5B63;&#x7BC0;&#x6DE1;&#x6C34;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3092;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x3001;&#x5C11;&#x3057;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EC;&#x30F3;&#x4E94;&#x5927;&#x6E56;&#x306E;&#x53B3;&#x3057;&#x3044;&#x51AC;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x5171;&#x5B58;&#x3059;&#x308B;&#x7D30;&#x83CC;&#x3084;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x30B3;&#x30DF;&#x30E5;&#x30CB;&#x30C6;&#x30A3;&#x306B;&#x3064;&#x3044;&#x3066;&#x77E5;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x3053;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CE;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x3055;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30AD;&#x30B7;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30EB;&#x9802;&#x70B9;G20&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3067;cyanomyoviruses&#x306E;&#x8C4A;&#x304B;&#x3055;&#x3092;&#x63A8;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x751F;&#x614B;&#x5B66;&#x7684;&#x95A2;&#x9023;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;PCR&#x3092;&#x63A1;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; Cyanomyoviruses&#x306F;&#x3001;&#x7DCF;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x30B3;&#x30DF;&#x30E5;&#x30CB;&#x30C6;&#x30A3;&#x306E;4.6&#xFF05;&#x307E;&#x3067;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x5C40;&#x3068;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x5B63;&#x7BC0;&#x306E;&#x6DF1;&#x3055;&#x3067;&#x898B;&#x3064;&#x304B;&#x3063;&#x305F;G20&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;ML&#xFF08;-1&#xFF09;&#x3001;&#x6700;&#x5927;3.1&#xD7;10&#xFF08;6&#xFF09;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x3067;&#x3001;&#x590F;&#x3068;&#x51AC;&#x306E;&#x89B3;&#x6E2C;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x200B;&#x200B;&#x306B;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x30A8;&#x30EA;&#x30FC;&#x6E56;&#x306F;&#x3001;&#x9AD8;&#x30AF;&#x30ED;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x590F;&#x306E;&#x6FC3;&#x5EA6;&#xFF08;&#x6700;&#x5927;10.3&#x3BC;g&#x306E;&#x30EA;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EB;&#xFF08;-1&#xFF09;&#xFF09;&#x3068;&#x51AC;&#xFF08;&#x6700;&#x5927;5.2&#x3BC;g&#x306E;&#x30EA;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EB;&#xFF08;-1&#xFF09;&#xFF09;&#x3067;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x89B3;&#x5BDF;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x3067;&#x751F;&#x7523;&#x7684;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x7D30;&#x83CC;&#x3068;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x91CF;&#x306F;&#x51AC;&#xFF08;P &#x26;lt;0.05&#xFF09;&#x6642;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x590F;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x306B;&#x9AD8;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x51AC;&#x306E;&#x30A2;&#x30D0;&#x30F3;&#x30C0;&#x30F3;&#x30B9;&#x306F;&#x301C;3.4&#xD7;10&#xFF08;5&#xFF09;&#x53CA;&#x3073;1.2&#xD7;10&#xFF08;6&#xFF09;ML&#xFF08;-1&#xFF09;&#x306E;&#x7BC4;&#x56F2;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x9593;&#x3001;&#x590F;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x91CF;&#x306F;3.3&#xD7;10&#xFF08;6&#xFF09;&#x304B;&#x3089;1.6&#xD7;10&#xFF08;7&#xFF09;ML&#xFF08;-1&#xFF09;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x5408;&#x8A08;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x91CF;&#x306F;&#x3001;6.5&#x306B;&#x81F3;&#x308B;&#x307E;&#x3067;&#x3001;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306E;&#x99C5;&#x3067;&#x6709;&#x610F;&#x306B;&#x9AD8;&#x304F;&#x3001;&#x590F;&#x306E;&#x30A2;&#x30D0;&#x30F3;&#x30C0;&#x30F3;&#x30B9;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x6708;&#x306E;&#x9593;&#x306B;&#x9AD8;&#x304F;&#x306A;&#x3063;&#x3066;&#xD7;8.8&#xD7;10&#xFF08;7&#xFF09;ML&#xFF08;-1&#xFF09;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;3.4&#x200B;&#x200B;&#x306B;&#x81F3;&#x308B;&#x307E;&#x3067;&#x3001;&#x51AC;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x91CF;&#x3068;&#xD7;10&#xFF08;7&#x301C;10&#xFF08;7&#xFF09; &#xFF09;6.6&#xD7;10&#xFF08;7&#xFF09;ML&#xFF08;-1&#xFF09;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x4F5C;&#x54C1;&#x306F;&#x3001;&#x63A8;&#x5B9A;cyanomyoviruses&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x5927;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x6DE1;&#x6C34;&#x6E56;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306E;&#x590F;&#x3068;&#x51AC;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306B;&#x904D;&#x5728;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3068;&#x3001;&#x5F7C;&#x3089;&#x306F;virioplankton&#x30B0;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x306E;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#x30B3;&#x30F3;&#x30DD;&#x30FC;&#x30CD;&#x30F3;&#x30C8;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30ED;&#x30FC;&#x30EC;&#x30F3;&#x4E94;&#x5927;&#x6E56;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x751F;&#x614B;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x306A;&#x30B7;&#x30A2;&#x30CE;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x306E;&#x5217;&#x6319;

&#xC0C1;&#xB2F9;&#xD55C; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xB0A8;&#xC870;&#xB958;&#xC640; &#xADF8;&#xB4E4; (cyanophage)&#xC744; &#xAC10;&#xC5FC; &#xD558;&#xB294; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xB294; &#xB9CC;&#xC5F0; &#xD558; &#xACE0; &#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; &#xD638;&#xC218; &#xC778;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xAC83;&#xC73C;&#xB85C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBA87; &#xAC00;&#xC9C0; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB294; &#xACC4;&#xC808; &#xB2F4; &#xC218; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C; &#xBD84;&#xC11D; &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC57D;&#xAC04; Laurentian &#xC624;&#xB300;&#xD638;&#xC758; &#xAC70;&#xCE5C; &#xACA8;&#xC6B8; &#xB3D9;&#xC548; &#xACF5;&#xC874; &#xD558;&#xB294; &#xC138;&#xADE0;&#xC131;&#xACFC; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xC0AC;&#xD68C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC54C;&#xB824;&#xC838; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xAE30;, &#xC6B0;&#xB9AC;&#xAC00; &#xC815;&#xB7C9;&#xC801; PCR cyanophage &#xD48D;&#xBD80;&#xC758; &#xD504;&#xB85D;&#xC2DC;&#xB85C; &#xD3EC;&#xD138; &#xAF2D;&#xC9C0;&#xC810; g 20&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC;&#xC774; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC5D0;&#xC11C; cyanomyoviruses&#xC758; &#xD48D;&#xBD80;&#xB97C; &#xCD94;&#xC815; &#xD558; &#xACE0; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xC758; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xC0DD;&#xD0DC; &#xAD00;&#xB828;&#xC131;&#xC744; &#xACB0;&#xC815;&#xC744; &#xACE0;&#xC6A9;. Cyanomyoviruses &#xD48D;&#xBD80; &#xD588;&#xB2E4; &#xC5EC;&#xB984; &#xBC0F; &#xACA8;&#xC6B8; &#xAD00;&#xCE21;&#xC758; &#xB450; &#xACC4;&#xC808;&#xC5D0; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xBC29;&#xC1A1;&#xAD6D; &#xBC0F; &#xAE4A;&#xC774;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC; &#xD558;&#xB294; g 20&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790; ml(-1)&#xC758; &#xCD5C;&#xB300; 3.1 &times; &#xC2DC;&#xBBFC;&#xAD8C;&#xC774; &#xBCF5;&#xC0AC;&#xBCF8;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804;&#xCCB4; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xCEE4;&#xBBA4;&#xB2C8;&#xD2F0;&#xC758; 4.6%&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294;. &#xB808;&#xC774;&#xD06C;&#xC5D0; &#xB9AC; (&#xCD5C;&#xB300; 10.3 &mu;g liter(-1))&#xACFC; &#xACA8;&#xC6B8; (&#xCD5C;&#xB300; 5.2 &mu;g liter(-1)) &#xC5EC;&#xB984;&#xC5D0; &#xB192;&#xC740; &#xC5FD;&#xB85D;&#xC18C; a &#xB18D;&#xB3C4;&#xAC00; &#xBAA8;&#xB450; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xAD00;&#xCC30; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xC0DD;&#xC0B0;&#xC801; &#xC774;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xC138;&#xADE0;&#xC131; &#xBC0F; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xC131; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB294;&#xB370; &#xC5EC;&#xB984; &#xBCF4;&#xB2E4;&#xB294; &#xACA8;&#xC6B8; &#xB3D9;&#xC548; &#xD558;&#xB294; &#xB3D9;&#xC548; &#xD6E8;&#xC52C; &#xB354; &#xB192;&#xC740; &#xD588;&#xB2E4; (P &lt; 0.05). &#xC5EC;&#xB984; &#xC138;&#xADE0; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB294;&#xB370; &#xACA8;&#xC6B8; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB294;&#xB370; ranged &sim;3.4 &times; 10(5)&#xC640; 1.2 &times; &#xC2DC;&#xBBFC;&#xAD8C;&#xC774; ml(-1) &#xC0AC;&#xC774; &#xB3D9;&#xC548; 1.6 &times; 10(7) ml(-1) 3.3 &times; &#xC2DC;&#xBBFC;&#xAD8C;&#xC774;&#xC5D0;&#xC11C; ranged. &#xB450; &#xB2EC; &#xB3D9;&#xC548; &#xCD1D; &#xBC14;&#xC774;&#xB7EC;&#xC2A4; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB294;&#xB370; &#xB192;&#xC558;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xC5EC;&#xB984;&#xC73C;&#xB85C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB294;&#xB370; &#xC0C1;&#xB2F9;&#xD788; &#xB192;&#xC740; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC758; &#xBC29;&#xC1A1;&#xAD6D;, 6.5 &times; 10(7)&#xC5D0;&#xC11C; 8.8 &times; 10(7) ml(-1) 3.4 &times; 10(7)&#xC5D0;&#xC11C; 6.6 &times; 10(7) ml(-1)&#xC5D0; &#xC774;&#xB974;&#xB294; &#xACA8;&#xC6B8; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0AC;&#xB294;&#xB370;&#xC640; &#xBC94;&#xC704;&#xC758;. &#xC774; &#xC791;&#xC5C5; &#xC0C1; cyanomyoviruses&#xC740; &#xBAA8;&#xB450; &#xC5EC;&#xB984;&#xC5D0; &#xC720;&#xBE44; &#xCFFC;&#xD130; &#xC2A4;&#xC774; &#xD070; &#xB2F4; &#xC218; &#xD638;&#xC218; &#xC2DC;&#xC2A4;&#xD15C;&#xC5D0; &#xACA8;&#xC6B8; &#xAC1C;&#xC6D4; &#xB3D9;&#xC548; &#xADF8;&#xB4E4;&#xC740; virioplankton &#xADF8;&#xB8F9;&#xC758; &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; &#xAD6C;&#xC131; &#xC694;&#xC18C;&#xB97C; &#xD655;&#xC778; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Laurentian &#xD070; &#xD638;&#xC218;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0DD;&#xD0DC; &#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; cyanophage&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xC5F4;&#xAC70; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Muchas investigaciones han demostrado que las cianobacterias y los virus que infectan a ellos (cyanophage) son generalizados y diversas en las poblaciones de los lagos a nivel mundial. Pocos estudios han analizado los sistemas de agua dulce estacionales, y poco se sabe acerca de las comunidades bacterianas y virales que conviven durante los duros inviernos de los Grandes Lagos Laurentian. En este caso, se emple&#xF3; la PCR cuantitativa para estimar la abundancia de cyanomyoviruses en este sistema, la utilizaci&#xF3;n del portal v&#xE9;rtice gen G-20 como un sustituto de la abundancia cyanophage y para determinar la posible importancia ecol&#xF3;gica de estos virus. Cyanomyoviruses eran abundantes en el verano y las observaciones de invierno, con un m&#xE1;ximo de 3,1 x 10 (6) copias de los genes del G-20 ml (-1) encontrado en varias estaciones y profundidades en ambas temporadas, lo que representa hasta un 4,6% de la comunidad total de virus . Lago Erie fue productiva durante los dos nuestras observaciones, con una concentraci&#xF3;n de clorofila en el verano (hasta 10,3 litros g (-1)) e invierno (hasta 5,2 litros g (-1)). Tanto la abundancia de bacterias y virus fueron significativamente m&#xE1;s altas durante el verano que durante el invierno (P &#x26;lt;0,05). Verano abundancias bacterianas vari&#xF3; de 3,3 x 10 (6) a 1,6 x 10 (7) ml (-1), mientras que la abundancia de invierno oscil&#xF3; entre ~ 3,4 x 10 (5) y 1,2 x 10 (6) ml (-1). Las abundancias totales de virus fueron altas durante dos meses, con abundancia de verano significativamente m&#xE1;s altas en la mayor&#xED;a de las estaciones, que van desde 6,5 x 10 (7) de 8,8 x 10 (7) ml (-1), y con abundancia de invierno que van desde 3,4 x 10 (7 ) a 6,6 x 10 (7) ml (-1). Este trabajo confirma que cyanomyoviruses supuestos son omnipresentes en los dos meses de verano y el invierno en este sistema de agua dulce del lago grande y que son un componente abundante del grupo virioplankton.

Enumeraci&#xF3;n molecular de un Cyanophage ecol&#xF3;gicamente importante en un lago de gran Laurentian

&#x5728;&#x6269;&#x5C55;&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x4E0A;&#x7684;&#x4E2D;&#x4E0A;&#x5C42;&#x73AF;&#x5883;&#x4E2D;&#x7684;&#x75C5;&#x6BD2;&#x6D3B;&#x52A8;&#x7684;&#x62C9;&#x683C;&#x6717;&#x65E5;&#x7814;&#x7A76;&#x90FD;&#x662F;&#x7F55;&#x89C1;&#x7684;&#x3002;&#x82E5;&#x8981;&#x89E3;&#x51B3;&#x6B64;&#x95EE;&#x9898;&#xFF0C;&#x75C5;&#x6BD2;&#x548C;&#x7EC6;&#x83CC;&#x5BA1;&#x67E5;&#x4E86;&#x5929;&#x7136;&#x6D6E;&#x6E38;&#x690D;&#x7269;&#x6C34;&#x534E;&#x4E2D;&#x4E0A;&#x5C42;&#x4EE5;&#x4E1C;&#x65B0;&#x897F;&#x5170;&#x5357;&#x592A;&#x5E73;&#x6D0B;&#x7684;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4E2D;&#x3002;&#x4ECE;&#x5E74;&#x5929; 263 278 &#x4E2D;&#x5C3A;&#x5EA6;&#x6DA1;&#x65CB;&#x4E2D;&#x6536;&#x96C6;&#x4E86;&#x65E5;&#x5E38;&#x6837;&#x672C; (9 &#x6708; 19 &#x81F3; 10 &#x6708; 4 &#x65E5;&#xFF0C;2008&#x5E74;&#xFF09;&#x3002;&#x751F;&#x4EA7;&#x6027;&#x7684;&#x7EFD;&#x653E;&#x8F6C;&#x6362;&#x4ECE;&#x7845;&#x85FB;&#x5230;&#x76AE;&#x548C;&#x6C34;&#x4F53;&#x5FAE;&#x578B;&#x751F;&#x7269;&#x4E3A;&#x4E3B;&#x7684;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x53F6;&#x7EFF;&#x7D20; a &#x6D53;&#x5EA6;&#x8FBE; 2.43 &mu; L(-1)&#x3002;&#x75C5;&#x6BD2;&#x4E30;&#x5EA6;&#x6CE2;&#x52A8; c.10 &#x500D; (1.8 &times; 10(10)-1.3 &times; 10(11) L(-1)) &#x8D85;&#x8FC7; 16 &#x5929;&#x3002;&#x76F8;&#x6BD4;&#x5176;&#x4ED6;&#x6D77;&#x6D0B;&#x7CFB;&#x7EDF;&#xFF0C;&#x4ECE; 1.4 &times; 10(10) &#x5230; 2.1 &times; 10(11) L(-1) day(-1) &#x62A5;&#xFF0C;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7C92;&#x5B50;&#x7684;&#x751F;&#x4EA7;&#x6BD4;&#x4F8B;&#x5F88;&#x9AD8;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x89C2;&#x5BDF;&#x75C5;&#x6BD2; 19-216%&#x6BCF;&#x5929;&#x6B63;&#x5728;&#x53D1;&#x751F;&#x88C2;&#x89E3;&#x7EC6;&#x83CC;&#x5E38;&#x5907;&#x5E93;&#x5B58;&#x7684;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x7684;&#x7EC6;&#x83CC;&#x5728;&#x5404;&#x5730;&#x5F00;&#x82B1;&#xFF0C;&#x4F5C;&#x51FA;&#x4E86;&#x91CD;&#x5927;&#x8D21;&#x732E;&#x3002;&#x8FD9;&#x79CD;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x91CA;&#x653E;&#x53EF;&#x80FD;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x7EF4;&#x6301;&#x901A;&#x8FC7;&#x91C7;&#x6837;&#x5468;&#x671F;&#x5F00;&#x82B1;&#x7684;&#x517B;&#x5206;&#x5143;&#x7D20; &#xFF08;N&#x3001; Fe&#xFF09;&#x3002;&#x53C2;&#x6570;&#x5316;&#x5206;&#x6790;&#x53D1;&#x73B0;&#x91CD;&#x5927;&#x76F8;&#x5173;&#x6027;&#x4E0E;&#x751F;&#x7269; &#xFF08;&#x5982;&#x6F5C;&#x5728;&#x4E3B;&#x673A;&#x4E30;&#x5EA6;&#xFF09; &#x548C;&#x975E;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x53C2;&#x6570; &#xFF08;&#x4F8B;&#x5982;&#x517B;&#x5206;&#x6D53;&#x5EA6;&#x3001; &#x6E29;&#x5EA6;&#xFF09;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x89C2;&#x5BDF;&#x8868;&#x660E;&#x75C5;&#x6BD2;&#x53EF;&#x80FD;&#x662F;&#x5728;&#x6269;&#x5C55;&#x7EF4;&#x62A4;&#x518D;&#x751F;&#x9A71;&#x52A8;&#x751F;&#x7269;&#x751F;&#x4EA7;&#x7684;&#x5173;&#x952E;&#x3002;

&#x5728;&#x5357;&#x592A;&#x5E73;&#x6D0B;&#x9644;&#x8FD1;&#x7684;&#x65B0;&#x897F;&#x5170;&#x7EFD;&#x653E;&#x5728;&#x6625;&#x5B63;&#x6D6E;&#x6E38;&#x690D;&#x7269;&#x75C5;&#x6BD2;&#x7684;&#x751F;&#x4EA7;&#x3002;

Lagrangian studies of virus activity in pelagic environments over extended temporal scales are rare. To address this, viruses and bacteria were examined during the course of a natural phytoplankton bloom in the pelagic South Pacific Ocean east of New Zealand. Daily samples were collected in a mesoscale eddy from year days 263-278 (September 19th-October 4th, 2008). The productive bloom transitioned from a diatom to a pico- and nanoplankton-dominated system, resulting in chlorophyll a concentrations up to 2.43Â Î¼gÂ L(-1) . Virus abundances fluctuated c.Â 10-fold (1.8Â Ã—Â 10(10) -1.3Â Ã—Â 10(11) Â L(-1) ) over 16Â days. The production rates of virus particles were high compared with those reported in other marine systems, ranging from 1.4Â Ã—Â 10(10) to 2.1Â Ã—Â 10(11) Â L(-1) Â day(-1) . Our observations suggest viruses contributed significantly to the mortality of bacteria throughout the bloom, with 19-216% of the bacterial standing stock being lysed daily. This mortality released nutrient elements (N, Fe) that likely helped sustain the bloom through the sampling period. Parametric analyses found significant correlations with both biotic (e.g. potential host abundances) and abiotic parameters (e.g. nutrient concentrations, temperature). These observations demonstrate that viruses may be critical in the extended maintenance of regeneration-driven biological production.

Production of viruses during a spring phytoplankton bloom in the South Pacific Ocean near of New Zealand.

Des &#xE9;tudes de Lagrange de l&#x26;#39;activit&#xE9; du virus dans des environnements p&#xE9;lagiques de plus de longues &#xE9;chelles temporelles sont rares. Pour r&#xE9;soudre ce probl&#xE8;me, les virus et les bact&#xE9;ries ont &#xE9;t&#xE9; examin&#xE9;s au cours d&#x26;#39;un bloom phytoplanctonique naturelle dans la zone p&#xE9;lagique du Pacifique Sud est Oc&#xE9;an de la Nouvelle-Z&#xE9;lande. &#xC9;chantillons quotidiens ont &#xE9;t&#xE9; recueillis dans un tourbillon de m&#xE9;so-&#xE9;chelle &#xE0; partir de 263-278 jours par an (Septembre 19th-Octobre 4th, 2008). La floraison de production est pass&#xE9;e d&#x26;#39;un diatom&#xE9;es &#xE0; un syst&#xE8;me de pico-nanoplancton et domin&#xE9;, ce qui entra&#xEE;ne des concentrations de chlorophylle a jusqu&#x26;#39;&#xE0; 2,43 L ug (-1). Abondances Virus fluctu&#xE9; c. 10-pliage (1,8 &#xD7; 10 (10) -1,3 &#xD7; 10 (11) L (-1)) de plus de 16 jours. Les taux de production de particules virales ont &#xE9;t&#xE9; &#xE9;lev&#xE9;s par rapport &#xE0; ceux rapport&#xE9;s dans les autres syst&#xE8;mes marins, allant de 1,4 &#xD7; 10 (10) &#xE0; 2,1 &#xD7; 10 (11) L (-1) jour (-1). Nos observations sugg&#xE8;rent virus contribu&#xE9; de mani&#xE8;re significative &#xE0; la mortalit&#xE9; des bact&#xE9;ries tout au long de la floraison, avec 19-216% du stock permanent bact&#xE9;rienne &#xE9;tant lys&#xE9;es quotidienne. Cette mortalit&#xE9; a publi&#xE9; des &#xE9;l&#xE9;ments nutritifs (N, Fe) qui ont probablement contribu&#xE9; &#xE0; soutenir la floraison &#xE0; travers la p&#xE9;riode d&#x26;#39;&#xE9;chantillonnage. Des analyses param&#xE9;triques ont trouv&#xE9; des corr&#xE9;lations significatives avec les deux param&#xE8;tres biotiques (par exemple, l&#x26;#39;abondance d&#x26;#39;accueil potentiels) et abiotiques (par exemple, les concentrations en &#xE9;l&#xE9;ments nutritifs, la temp&#xE9;rature). Ces observations d&#xE9;montrent que les virus peuvent &#xEA;tre critique dans le maintien prolong&#xE9; de la r&#xE9;g&#xE9;n&#xE9;ration ax&#xE9;e sur la production biologique.

La production de virus Au cours d&#x26;#39;une floraison printani&#xE8;re de phytoplancton dans l&#x26;#39;oc&#xE9;an Pacifique Sud Proche de la Nouvelle-Z&#xE9;lande

Lagrange Studien &uuml;ber Virenaktivit&auml;t im pelagischen Umgebungen in l&auml;ngeren zeitlichen Skalen sind selten. Um dies zu beheben, wurden im Laufe der eine nat&uuml;rliche Phytoplankton-Bl&uuml;te in pelagischen S&uuml;dpazifik &ouml;stlich von Neuseeland Viren und Bakterien untersucht. T&auml;gliche Proben wurden gesammelt in einem Mesoskalige Eddy vom Jahr Tage 263-278 (September 19th Oktober 4th, 2008). Die produktive Bl&uuml;te umgestellt von einer Kieselalgen zu einem Pico und Nanoplankton dominierten System, was zu Chlorophyll A-Konzentrationen bis 2,43 &mu;g L(-1). Virus H&auml;ufigkeiten schwankte c. 10-fache (1,8 &times; Jahresberichts 1,3 &times; 10(11) L(-1)) &uuml;ber 16 Tage. Die Produktionsraten der Viruspartikel waren hoch, verglichen mit denen in anderen marinen Systemen, von 1,4 &times; Jahresberichts bis 2,1 &times; 10(11) L(-1) day(-1) berichtet. Unsere Beobachtungen schlagen Viren trugen wesentlich zum die Sterblichkeit von Bakterien w&auml;hrend der Bl&uuml;te, mit 19-216 % der bakteriellen stehen t&auml;glich Tauwetterprotokoll aufgel&ouml;st wird. Diese Sterblichkeit ver&ouml;ffentlicht N&auml;hrstoff-Elemente (N, Fe), die wahrscheinlich dazu beigetragen, die Bl&uuml;te durch die Probenahmezeit aufrecht zu erhalten. Parametrische Analysen fanden signifikante Korrelationen mit biotischen (z.B. potenzielle Host H&auml;ufigkeiten) und abiotischen Parametern (z.B. N&auml;hrstoff-Konzentrationen, Temperatur). Diese Beobachtungen zeigen, dass Viren in die erweiterte Wartung der Regenerierung-gesteuerte biologische Produktion entscheidend sein k&ouml;nnen.

Produktion von Viren w&auml;hrend einer Fr&uuml;hling-Phytoplankton bl&uuml;hen im s&uuml;dlichen Pazifischen Ozean in der N&auml;he von Neuseeland.

Studi di lagrangiana di attivit&agrave; del virus in ambienti pelagici su scale temporali estesi sono rari. Per risolvere questo problema, virus e batteri sono stati esaminati nel corso di una fioritura di fitoplancton naturale nell&#39;Oceano Pacifico sud pelagico ad est della Nuova Zelanda. Sono stati raccolti campioni giornalieri in un gorgo di mesoscale da giorni anno 263-278 (settembre 19-ottobre 4, 2008). La fioritura produttiva la transizione da un diatomee ad un sistema dominato da pico e nanoplancton, con conseguente concentrazioni di clorofilla a fino a 2,43 &mu;g L(-1). Abbondanza di virus hanno oscillato c. 10 volte (1,8 &times; 10(10) -1,3 &times; 10(11) L(-1)) per 16 giorni. I tassi di produzione di particelle virali erano alti rispetto a quelli riportati in altri sistemi marini, che vanno da 1,4 &times; 10(10) a 2,1 &times; 10(11) L(-1) day(-1). Le nostre osservazioni suggeriscono virus contribuito in modo significativo la mortalit&agrave; dei batteri durante la fioritura, con 19-216% dello stock batterica permanente essere lisati quotidianamente. Questa mortalit&agrave; rilasciato gli elementi nutritivi (N, Fe) che probabilmente hanno contribuito a sostenere la fioritura attraverso il periodo di campionamento. Analisi parametriche trovano correlazioni significative con entrambi i parametri abiotici (ad esempio nutrienti concentrazioni, temperatura) e biotici (ad esempio potenziale abbondanza host). Queste osservazioni dimostrano che i virus possono essere critiche nel mantenimento prolungato della rigenerazione guidata da produzione biologica.

Produzione di virus durante un fitoplancton primavera fioriscono del sud dell&#39;Oceano Pacifico nei pressi della Nuova Zelanda.

&#x62E1;&#x5F35;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x6642;&#x9593;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30EB;&#x4E0A;&#x306E;&#x9060;&#x6D0B;&#x74B0;&#x5883;&#x3067;&#x306E;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x6D3B;&#x52D5;&#x306E;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B8;&#x30E5;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x306F;&#x7A00;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x554F;&#x984C;&#x306B;&#x5BFE;&#x51E6;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x3001;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x3084;&#x7D30;&#x83CC;&#x306F;&#x3001;&#x30CB;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B8;&#x30FC;&#x30E9;&#x30F3;&#x30C9;&#x306E;&#x9060;&#x6D0B;&#x5357;&#x592A;&#x5E73;&#x6D0B;&#x6771;&#x90E8;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x5929;&#x7136;&#x690D;&#x7269;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x30C8;&#x30F3;&#x30D6;&#x30EB;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x904E;&#x7A0B;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;&#x3002;&#x6BCE;&#x65E5;&#x306E;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x5E74;&#x9593;263&#x304B;&#x3089;278&#x65E5;&#xFF08;2008&#x5E74;9&#x6708;19&#x65E5;&#x304B;&#x3089;10&#x6708;4&#x65E5;&#x307E;&#x3067;&#x200B;&#x200B;&#xFF09;&#x304B;&#x3089;&#x30E1;&#x30BD;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30EB;&#x6E26;&#x306B;&#x53CE;&#x96C6;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x751F;&#x7523;&#x6027;&#x306E;&#x958B;&#x82B1;&#x306F;&#x3001;2.43&#x3BC;g&#x306E;L&#xFF08;-1&#xFF09;&#x306B;&#x30AF;&#x30ED;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A3;&#x30EB;&#x306E;&#x6FC3;&#x5EA6;&#x3092;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x3001;&#x73EA;&#x85FB;&#x304B;&#x3089;&#x30D4;&#x30B3;&#x3068;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x30D7;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x30C8;&#x30F3;&#x304C;&#x652F;&#x914D;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x306B;&#x79FB;&#x884C;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x91CF;&#x306F;&#x3001;c&#x3092;&#x5909;&#x52D5;&#x3057;&#x305F;&#x3002; 16&#x65E5;&#x4EE5;&#x4E0A;&#xFF08;1.8&#xD7;10&#xFF08;10&#xFF09;-1.3&#xD7;10&#xFF08;11&#xFF09;L&#xFF08;-1&#xFF09;&#xFF09;&#x306E;10&#x500D;&#x3002;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x7C92;&#x5B50;&#x306E;&#x751F;&#x7523;&#x7387;&#x304C;&#x9AD8;&#x3044;2.1&#xD7;10&#xFF08;11&#xFF09;L&#xFF08;-1&#xFF09;&#x65E5;&#xFF08;-1&#xFF09;&#x306B;1.4&#xD7;10&#xFF08;10&#xFF09;&#x306B;&#x81F3;&#x308B;&#x307E;&#x3067;&#x3001;&#x4ED6;&#x306E;&#x6D77;&#x6D0B;&#x30B7;&#x30B9;&#x30C6;&#x30E0;&#x3067;&#x5831;&#x544A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3082;&#x306E;&#x3001;&#x3068;&#x6BD4;&#x8F03;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x7ACB;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x682A;&#x5F0F;&#x306E;19&#x304B;&#x3089;216&#x30D1;&#x30FC;&#x30BB;&#x30F3;&#x30C8;&#x6BCE;&#x65E5;&#x6EB6;&#x89E3;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3068;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x304C;&#x3001;&#x82B1;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x7D30;&#x83CC;&#x306E;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x306B;&#x5927;&#x304D;&#x304F;&#x8CA2;&#x732E;&#x3057;&#x3066;&#x304A;&#x52E7;&#x3081;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x306F;&#x9AD8;&#x3044;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x5468;&#x671F;&#x3092;&#x901A;&#x3057;&#x3066;&#x82B1;&#x3092;&#x7DAD;&#x6301;&#x3059;&#x308B;&#x52A9;&#x3051;&#x6804;&#x990A;&#x5143;&#x7D20;&#xFF08;N&#x3001;&#x9244;&#xFF09;&#x3092;&#x30EA;&#x30EA;&#x30FC;&#x30B9;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30D1;&#x30E9;&#x30E1;&#x30C8;&#x30EA;&#x30C3;&#x30AF;&#x89E3;&#x6790;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x751F;&#x7269;&#xFF08;&#x4F8B;&#x3048;&#x3070;&#x3001;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x5BBF;&#x4E3B;&#x306E;&#x5B58;&#x5728;&#x91CF;&#xFF09;&#x3068;&#x975E;&#x751F;&#x7269;&#x7684;&#x30D1;&#x30E9;&#x30E1;&#x30FC;&#x30BF;&#xFF08;&#x4F8B;&#x3048;&#x3070;&#x3001;&#x6804;&#x990A;&#x7D20;&#x306E;&#x6FC3;&#x5EA6;&#x3001;&#x6E29;&#x5EA6;&#xFF09;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x3068;&#x6709;&#x610F;&#x306A;&#x76F8;&#x95A2;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x89B3;&#x200B;&#x200B;&#x5BDF;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x30A6;&#x30A4;&#x30EB;&#x30B9;&#x304C;&#x518D;&#x751F;&#x4E3B;&#x5C0E;&#x578B;&#x751F;&#x7269;&#x751F;&#x7523;&#x306E;&#x62E1;&#x5F35;&#x7DAD;&#x6301;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

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Los estudios de Lagrange de la actividad del virus en ambientes pel&#xE1;gicos de m&#xE1;s extendidas escalas temporales son poco frecuentes. Para solucionar esto, los virus y las bacterias fueron examinados durante el transcurso de un florecimiento de fitoplancton natural en la zona pel&#xE1;gica del Oc&#xE9;ano Pac&#xED;fico Sur al este de Nueva Zelanda. Muestras diarias fueron recogidos en un remolino de mesoescala de 263-278 d&#xED;as al a&#xF1;o (septiembre 19 a octubre 4, 2008). La floraci&#xF3;n productiva transici&#xF3;n de una diatomea a un sistema de pico-y nanoplancton dominada, resultando en clorofila a concentraciones de hasta 2,43 g L (-1). La abundancia de virus fluctuado c. De 10 veces (1,8 &#xD7; 10 (10) -1,3 &#xD7; 10 (11) L (-1)) de m&#xE1;s de 16 d&#xED;as. Las tasas de producci&#xF3;n de part&#xED;culas virales eran elevados en comparaci&#xF3;n con los reportados en otros sistemas marinos, que van desde 1,4 x 10 (10) a 2,1 x 10 (11) L (-1) d&#xED;a (-1). Nuestras observaciones sugieren virus contribuido significativamente a la mortalidad de las bacterias a lo largo de la floraci&#xF3;n, con 19-216% de la poblaci&#xF3;n permanente de bacterias se lisan al d&#xED;a. Esta mortalidad libera los elementos nutrientes (N, Fe), que probablemente ayudaron a mantener la floraci&#xF3;n durante todo el per&#xED;odo de muestreo. Los an&#xE1;lisis param&#xE9;tricos encontraron correlaciones significativas con ambos par&#xE1;metros bi&#xF3;ticos (por ejemplo, la abundancia de receptores potenciales) y abi&#xF3;ticos (por ejemplo, las concentraciones de nutrientes, temperatura). Estas observaciones demuestran que los virus pueden ser cr&#xED;ticos en el mantenimiento prolongado de la regeneraci&#xF3;n impulsada por la producci&#xF3;n biol&#xF3;gica.

La producci&#xF3;n de virus durante un florecimiento de fitoplancton de primavera en el sur del Oc&#xE9;ano Pac&#xED;fico cerca de Nueva Zelanda

The distribution of cyanomyoviruses was estimated using a quantitative PCR (qPCR) approach that targeted the g20 gene as a proxy for phage. Samples were collected spatially during a > 3000 km transect through the Sargasso Sea and temporally during a gyre-constrained phytoplankton bloom within the southern Pacific Ocean. Cyanomyovirus abundances were lower in the Sargasso Sea than in the southern Pacific Ocean, ranging from 2.75 × 10(3) to 5.15 × 10(4) mL(-1) and correlating with the abundance of their potential hosts (Prochlorococcus and Synechococcus). Cyanomyovirus abundance in the southern Pacific Ocean (east of New Zealand) followed Synechococcus host populations in the system: this included a decrease in g20 gene copies (from 4.3 × 10(5) to 9.6 × 10(3) mL(-1) ) following the demise of a Synechococcus bloom. When compared with direct counts of viruses, observations suggest that the cyanomyoviruses comprised 0.5 to >25% of the total virus community. We estimated daily lysis rates of 0.2-46% of the standing stock of Synechococcus in the Pacific Ocean compared with c. < 1.0% in the Sargasso Sea. In total, our observations confirm this family of viruses is abundant in marine systems and that they are an important source of cyanobacterial mortality.

High abundances of cyanomyoviruses in marine ecosystems demonstrate ecological relevance.

Experiments were conducted to analyze processes impacting arsenic transport in irrigation water flowing over bare rice-field soils in Bangladesh. Dissolved concentrations of As, Fe, P, and Si varied over space and time, according to whether irrigation water was flowing or static. Initially, under flowing conditions, arsenic concentrations in irrigation water were below well-water levels and showed little spatial variability across fields. As flowing-water levels rose, arsenic concentrations were elevated at field inlets and decreased with distance across fields, but under subsequent static conditions, concentrations dropped and were less variable. Laboratory experiments revealed that over half of the initial well-water arsenic was removed from solution by oxidative interaction with other water-column components. Introduction of small quantities of soil further decreased arsenic concentrations in solution. At higher soil-solution ratios, however, soil contributed arsenic to solution via abiotic and biotic desorption. Collectively, these results suggest careful design is required for land-based arsenic-removal schemes.

Audrey R. Matteson

Department of Microbiology

University of Tennessee

Estimating Virus Production Rates in Aquatic Systems

Integrated Field Lysimetry and Porewater Sampling for Evaluation of Chemical Mobility in Soils and Established Vegetation

Audrey R. Matteson

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University of Tennessee

Estimating Virus Production Rates in Aquatic Systems

Integrated Field Lysimetry and Porewater Sampling for Evaluation of Chemical Mobility in Soils and Established Vegetation

Department of Microbiology