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Hier präsentieren wir ein Schritt-für-Schritt-Protokoll für einen halbautomatischen Ansatz zur Analyse von Daten der murinen Langzeitelektrokardiographie (EKG) für grundlegende EKG-Parameter und häufige Arrhythmien. Die Daten werden von implantierbaren Telemetriesendern in lebenden und wachen Mäusen gewonnen und mit Ponemah und seinen Analysemodulen analysiert.
Arrhythmien sind häufig und betreffen Millionen von Patienten weltweit. Aktuelle Behandlungsstrategien sind mit erheblichen Nebenwirkungen verbunden und bleiben bei vielen Patienten wirkungslos. Um die Patientenversorgung zu verbessern, sind neuartige und innovative Therapiekonzepte erforderlich, die ursächlich auf Arrhythmiemechanismen abzielen. Um die komplexe Pathophysiologie von Arrhythmien zu untersuchen, sind geeignete Tiermodelle notwendig, und Mäuse haben sich als ideale Modellspezies erwiesen, um den genetischen Einfluss auf Arrhythmien zu bewerten, grundlegende molekulare und zelluläre Mechanismen zu untersuchen und potenzielle therapeutische Ziele zu identifizieren.
Implantierbare Telemetriegeräte gehören zu den leistungsfähigsten Werkzeugen zur Untersuchung der Elektrophysiologie bei Mäusen und ermöglichen eine kontinuierliche EKG-Aufzeichnung über einen Zeitraum von mehreren Monaten bei frei beweglichen, wachen Mäusen. Aufgrund der großen Anzahl von Datenpunkten (>1 Million QRS-Komplexe pro Tag) bleibt die Analyse von Telemetriedaten jedoch eine Herausforderung. Dieser Artikel beschreibt einen schrittweisen Ansatz zur Analyse von EKGs und zur Erkennung von Arrhythmien in langfristigen Telemetrieaufzeichnungen mit der Software Ponemah mit ihren Analysemodulen ECG Pro und Data Insights, die von Data Sciences International (DSI) entwickelt wurde. Um grundlegende EKG-Parameter wie Herzfrequenz, P-Wellendauer, PR-Intervall, QRS-Intervall oder QT-Dauer zu analysieren, wurde eine automatisierte Attributanalyse mit Ponemah durchgeführt, um P-, Q- und T-Wellen innerhalb individuell angepasster Fenster um detektierte R-Wellen zu identifizieren.
Die Ergebnisse wurden dann manuell überprüft, so dass einzelne Anmerkungen angepasst werden konnten. Die Ergebnisse der attributbasierten Analyse und der Mustererkennungsanalyse wurden dann vom Data Insights-Modul verwendet, um Arrhythmien zu erkennen. Dieses Modul ermöglicht ein automatisches Screening auf individuell definierte Arrhythmien innerhalb der Aufzeichnung, gefolgt von einer manuellen Überprüfung von vermuteten Arrhythmie-Episoden. Der Artikel diskutiert kurz Herausforderungen bei der Aufzeichnung und Detektion von EKG-Signalen, schlägt Strategien zur Verbesserung der Datenqualität vor und bietet repräsentative Aufzeichnungen von Arrhythmien, die bei Mäusen mit dem oben beschriebenen Ansatz erkannt wurden.
Herzrhythmusstörungen sind weit verbreitet und betreffen Millionen von Patienten weltweit1. Die Alterung der Bevölkerung weist eine zunehmende Inzidenz und damit eine erhebliche Belastung für die öffentliche Gesundheit auf, die sich aus Herzrhythmusstörungen und deren Morbidität und Mortalität ergibt2. Aktuelle Behandlungsstrategien sind begrenzt und oft mit erheblichen Nebenwirkungen verbunden und bleiben bei vielen Patienten unwirksam 3,4,5,6. Neue und innovative therapeutische Strategien, die ursächlich auf Arrhythmiemechanismen abzielen, sind dringend erforderlich. Um die komplexe Pathophysiologie von Arrhythmien zu untersuchen, sind geeignete Tiermodelle notwendig; Mäuse haben sich als ideale Modellspezies erwiesen, um den genetischen Einfluss auf Arrhythmien zu bewerten, grundlegende molekulare und zelluläre Mechanismen zu untersuchen und potenzielle therapeutische Ziele zu identifizieren 7,8,9. Die kontinuierliche EKG-Aufzeichnung ist ein etabliertes Konzept in der klinischen Routine der Arrhythmieerkennung10.
Implantierbare Telemetriegeräte gehören zu den leistungsfähigsten verfügbaren Werkzeugen zur Untersuchung der Elektrophysiologie bei Mäusen, da sie eine kontinuierliche Aufzeichnung des EKGs (ein üblicher Ansatz besteht darin, die Elektroden in eine Blei-II-Position zu implantieren) über einen Zeitraum von mehreren Monaten in frei beweglichen, wachen Mäusenermöglichen 11,12. Aufgrund der großen Anzahl von Datenpunkten (bis zu mehr als 1 Million QRS-Komplexe pro Tag) und der begrenzten Kenntnis der murinen Standardwerte bleibt die Analyse von Telemetriedaten jedoch eine Herausforderung. Handelsübliche Telemetriesender für Mäuse halten bis zu 3 Monate, was zur Aufzeichnung von bis zu 100 Millionen QRS-Komplexen führt. Dies bedeutet, dass pragmatische Analyseprotokolle dringend benötigt werden, um die Zeit für jeden einzelnen Datensatz zu reduzieren und es den Forschern zu ermöglichen, diese riesige Datenmenge zu verarbeiten und zu interpretieren. Um bei der Aufzeichnung ein sauberes EKG-Signal zu erhalten, muss die Implantation des Senders optimal sein - die Leitungspositionen sollten so weit wie möglich voneinander entfernt sein, um höhere Signalamplituden zu ermöglichen.
Der interessierte Leser kann auf ein Protokoll von McCauley et al.12 verwiesen werden, um weitere Informationen zu erhalten. Um Lärm zu minimieren, müssen Käfige und Messumformer in einer stillen Umgebung aufgestellt werden, die nicht anfällig für Störungen ist, z. B. in einem belüfteten Schrank mit kontrollierten Umgebungsfaktoren (Temperatur, Licht und Feuchtigkeit). Während des Versuchszeitraums muss die Bleipositionierung regelmäßig überprüft werden, um einen Signalverlust aufgrund von Bleiperforation oder Wundheilungsproblemen zu vermeiden. Physiologisch gibt es eine zirkadiane Veränderung der EKG-Parameter bei Nagetieren wie beim Menschen, was die Notwendigkeit eines standardisierten Ansatzes zur Gewinnung von EKG-Basiswerten aus einer kontinuierlichen Aufzeichnung hervorruft. Anstatt Mittelwerte von EKG-Parametern über einen langen Zeitraum zu berechnen, sollte eine Analyse eines Ruhe-EKGs ähnlich dem beim Menschen durchgeführt werden, um grundlegende Parameter wie Ruheherzfrequenz, P-Wellendauer, PR-Intervall, QRS-Dauer oder QT / QTc-Intervall zu erhalten. Beim Menschen wird ein Ruhe-EKG über 10 s bei einer normalen Herzfrequenz von 50-100/min aufgezeichnet. Dieses EKG umfasst 8 bis 17 QRS-Komplexe. Eine Analyse von 20 aufeinanderfolgenden QRS-Komplexen wird in der Maus als "Ruhe-EKG-Äquivalent" empfohlen. Aufgrund der oben erwähnten circadianen Veränderung besteht ein einfacher Ansatz darin, zwei Ruhe-EKGs pro Tag zu analysieren, eines tagsüber und eines nachts. Abhängig vom Licht-Ein-/Ausschaltzyklus in der Tierhaltung werden geeignete Zeiten ausgewählt (z.B. 12:00 Uhr) und Eckwerte ermittelt.
Als nächstes wird ein Herzfrequenzdiagramm im Laufe der Zeit verwendet, um relevante Tachy- und Bradykardie zu erkennen, mit aufeinanderfolgender manueller Untersuchung dieser Episoden, um einen ersten Eindruck zu erhalten. Dieses Herzfrequenzdiagramm führt dann zu den wichtigen Parametern der maximalen und minimalen Herzfrequenz über den aufgezeichneten Zeitraum sowie der Herzfrequenzvariabilität über die Zeit. Danach wird der Datensatz auf Arrhythmien analysiert. Dieser Artikel beschreibt einen schrittweisen Ansatz, um diese Basis-EKG-Daten aus Langzeit-Telemetrieaufzeichnungen von wachen Mäusen über einen Aufzeichnungszeitraum von bis zu drei Monaten zu erhalten. Darüber hinaus wird beschrieben, wie Arrhythmien mit der von Data Sciences International (DSI) entwickelten Software Ponemah Version 6.42 mit ihren Analysemodulen EKG Pro und Data Insights erkannt werden können. Diese Version ist sowohl mit Windows 7 (SP1, 64 Bit) als auch mit Windows 10 (64 Bit) kompatibel.
1. Vorabsprachen
2. Analyse grundlegender EKG-Parameter
HINWEIS: Zusätzlich zu den Validierungs-/fehlerhaften Datenmarkierungen misst und berechnet die Software automatisch eine Vielzahl von abgeleiteten Parametern, die dann in der Liste der abgeleiteten Parameter gemeldet werden.
3. Arrhythmieerkennung mittels Mustererkennung (EKG PRO Modul)
HINWEIS: Das EKG-PRO-Modul von Ponemah verwendet ausgewählte QRS-Komplexe als Vorlagen für die weitere Analyse. Die EKG-Muster der Vorlagen werden mit allen QRS-Komplexen innerhalb der Aufzeichnung verglichen, um den Prozentsatz der Ähnlichkeit ("Match") zu berechnen und Arrhythmien (z.B. atriale oder ventrikuläre vorzeitige Capture-Beats) zu erkennen. Die Anzahl der QRS-Komplexe, die markiert werden müssen, hängt von der Variabilität der QRS-Amplitude innerhalb der Aufzeichnung ab. In bestimmten Fällen ergibt die Auswahl und Markierung eines QRS-Komplexes eine Ähnlichkeit von 80 Prozent mit der jeweiligen Aufzeichnung, was die Mehrheit der QRS-Zyklen markiert. Dies ist jedoch ein Idealfall und während der Analyse ist die Anzahl der QRS-Komplexe, die als Vorlagen markiert werden müssen, in der Regel höher.
4. Arrhythmie-Erkennung: ein vereinfachter manueller Ansatz mit Data Insights
HINWEIS: Für die Arrhythmieanalyse ist eine korrekte Annotation von P- und R-Wellen erforderlich. Doch selbst wenn innerhalb der EKG-Spur klare P-Wellen sichtbar sind, werden diese P-Wellen manchmal auch nach Anpassung der Attributeinstellungen nicht ausreichend identifiziert. Da R-Wellen in der Regel ausreichend erkannt und annotiert werden, wird im Folgenden ein praktischer Ansatz für die weitere Arrhythmieanalyse mit Data Insights vorgeschlagen. Für einen allgemeinen Überblick über die Arrhythmieerkennung mit Data Insights und seinen vordefinierten artspezifischen Suchen kann der interessierte Leser auf Mehendale et al.13 verwiesen werden.
Die Aufzeichnung von Langzeit-EKGs führt zu riesigen Datensätzen. Die Möglichkeiten für weitere Analysen sind vielfältig und hängen vom jeweiligen Forschungsprojekt ab. Dieses Protokoll bietet eine Beschreibung einiger sehr grundlegender Messwerte, die von den meisten Forschern verwendet werden können, insbesondere für Screening-Experimente, z. B. bei der Charakterisierung einer transgenen Mauslinie oder bei der Untersuchung der Auswirkungen einer bestimmten Behandlung in einem Krankheitsmodell. Ein frü...
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Diese Arbeiten wurden gefördert durch die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG; Clinician Scientist Program In Vascular Medicine (PRIME), MA 2186/14-1 an P. Tomsits und D. Schüttler), Deutsches Zentrum für Herz-Kreislauf-Forschung (DZHK; 81X2600255 an S. Clauss), die Corona Foundation (S199/10079/2019 an S. Clauss), das ERA-NET on Cardiovascular Diseases (ERA-CVD; 01KL1910 to S. Clauss), die Heinrich-and-Lotte-Mühlfenzl Stiftung (an S. Clauss) und das China Scholarship Council (CSC, an R. Xia). Die Geldgeber spielten keine Rolle bei der Vorbereitung des Manuskripts.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Ponemah Software | Data Science international | ECG Analysis Software |
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