Unser übergeordnetes Ziel ist es, zu untersuchen, wie Zellen des Immunsystems und Gliazellen innerhalb des zentralen Nervensystems zur Entstehung und zum Fortschreiten neurologischer Erkrankungen wie Multiple Sklerose beitragen. Die Immunfluoreszenzmikroskopie ist eine standardisierte und weit verbreitete Technik in allen biologischen Disziplinen und für die neurowissenschaftliche und immunologische Forschung unerlässlich. Eines der Hauptprobleme, das die Forscher plagt, ist, dass die Immunfluoreszenzmikroskopie aufgrund der Einschränkungen herkömmlicher Mikroskope in der Regel in der Anzahl der Sonden begrenzt ist, die gleichzeitig abgebildet werden können.
In diesem Protokoll beschreiben wir eine Methode, um die Anzahl der Sonden zu erhöhen, die viele Mikroskope gleichzeitig abbilden können, und stellen eine Analysepipeline zur Verarbeitung informationsdichter Bilder zur Verfügung. Der Vorteil dieses Protokolls besteht darin, dass es an viele weit verbreitete Mikroskope angepasst werden kann und einfach durchzuführen ist, was die Multiplex-Histologie-Analyse einer größeren Anzahl von Laboren zugänglich machen würde.